馬英九政府

馬英九政府，通稱馬政府，是指馬英九擔任中華民國第12、13任總統期間的中華民國政府。馬英九自2008年5月20日起就任中華民國第12任總統，其任期在2012年5月20日結束。在2012年1月14日的第十三任中華民國總統副總統選舉中，馬英九以689萬票連任成功，於同年5月20日就任第13任總統，兩次任期於2016年5月20日結束，共歷時8年。
中華民國總統領導中華民國中央政府各機關，除掌握行政院院長的任命權之外，並監督行政院各部會首長官員（內閣）的組成。馬英九政府首任內閣為劉兆玄內閣，第二任內閣為吳敦義內閣，第三任內閣為陳冲內閣，第四任內閣為江宜樺內閣，第五任內閣為毛治國內閣。第六任內閣為張善政內閣。內閣主要成員之中，除少數官員外，均為中國國民黨從政黨員。

633政見

馬英九在2008年2月24日總統大選辯論會上公開答覆「若達不到目標（使勞工收入提高至GDP一定佔比）是否願捐出未來四年總統任期一半的薪水」之提問時表示，「捐款沒有問題，我這幾年來已經捐了六千多萬了！」。他在2011年坦承633沒達成，有媒體和網友卻抨擊這樣是不守承諾。
2018年，媒體報導，633計畫乃效仿韓國前總統李明博提出747政策，然而最後與747政策皆以跳票收場。

第一次任期

馬英九政府的政策，初期以振興國內經濟、改善兩岸關係為方針。內政方面，推行「愛臺十二建設」，實施擴大內需方案，並積極推動行政區重劃與合併。兩岸關係方面，以舉行江陳會談、簽訂ECFA等方式以加強兩岸合作；對於兩岸的政治地位，不同於李登輝時代以來的「特殊國與國關係」，改為主張「一個中國各自表述」，並且認同所謂的九二共識。
外交政策上，不同於陳水扁政府時期的「烽火外交」，國民黨政府宣稱改推行所謂外交休兵的「活路外交」措施，以參加聯合國所屬的功能組織、與各國維繫實質關係為優先考慮，並大力推動與其他國家的落地簽證，中華民國護照於2008年有58國免簽或可落地簽，2016年則有161國免簽或落地簽。
而由於兩岸外交休兵，2013年11月14日，甘比亞總統賈梅，宣布與中華民國斷交。甘比亞與中華人民共和國已於1995年7月25日斷交。中華人民共和國外交部表示事先不知情，且基於兩岸和平原則，不會與該國建交。中國大陸直至2016年3月17日，蔡英文總統當選後，才與甘比亞復交，中華民國政府表示「遺憾」。
兩岸關係方面，著名爭議事件包括張銘清訪臺爭議與衝突、陳雲林訪臺爭議與衝突，及後續引發的野草莓運動等。
內政方面，2009年8月6日至8月10日間發生的莫拉克風災，由於馬政府救災不力，中央官員假期怠惰，引發廣大民怨。此次事件被認為是馬政府民望下滑的開始。風災最終導致681人死亡、18人失蹤。（詳見八八水災）
另外，925白玫瑰運動集會是馬政府第一任期內的重大集會抗議事件之一，民間強力要求馬政府進行司法改革。
2009年 大專畢業生就業22K方案爭議。
2009年 苗栗發生大埔事件。
2009年9月，教育部完成「二二八國家紀念館」的修復工程後，點交予內政部，並隨即移交給財團法人二二八事件紀念基金會。
2011年2月28日，「二二八國家紀念館」全館開館營運。
2012年 正式開放美國瘦肉精牛肉進口。
2012年 年中行政院秘書長林益世爆發貪污索賄案。
2013年 總統與立法院長的馬王政爭事件。
2013年 國民黨籍台北市議員兼馬英九辦公室主任賴素如涉臺北雙子星弊案。

大林電廠更新改建計畫

2009年6月5日，行政院環保署召開審查台電大林電廠更新4座燃煤機組的環評專案會議，計畫將當時的1至5號舊燃煤發電機組更新為新一代的4座燃煤機組，目的是為了增加南電北送的發電量。
新新聞批評環保署：「在政黨輪替後，馬英九上台二十天就推翻專案小組結論」、「做出讓高市空氣更骯髒的結論」、「在沒有地球暖化問題時，北部的電廠就規劃使用天然氣，卻要南部人忍受煤炭污染；國民黨的北部菁英將南部當作是廁所廚房，才會準備增加大林的汙染。」及「支持台電的兩位專案小組委員，完全不理會高雄市府『祇希望不增加污染量』的卑微要求」。
環保署隨後發布新聞稿澄清：「台電請大會維持四座，是承諾依據空氣污染防制法第九條，洗掃街道得供抵換污染物的規定，比照九十六年十月前政府時環評大會通過台中龍風電廠的作法，以洗掃街去除粒狀物三百四十五公噸/年，抵換超出的三百四十一公噸/年。上述過程，是各方嚴肅認真地尋求兼顧環保與國家電力需求的雙贏方案。 」、「地方政府就其轄境內電廠改建，不適合以增加的CO2排放，做為抗爭與責難中央的議題。 」環保團體批評：「馬政府的節能減碳是一場騙局」。

第二次任期

大體上延續第一次任期任的施政方針。執行了電價調漲案與調升臺灣基本工資。
經濟政策方面，ECFA及兩岸經貿交流被部分民眾認為缺乏國民黨政府聲稱的效益，懷疑將使臺灣主權陷入危機，因此引發全國性抗爭運動，以太陽花學運為代表。（詳見海峽兩岸服務貿易協議）。(需要索引參考資料)
內政方面，洪仲丘事件引發白衫軍運動，數萬人抗議政府罔顧軍中人權。本案也促成軍事審判法的修正，在承平（非經總統宣戰）時期，將軍人審判從軍法體系全面移至民間司法單位。
民生方面，馬政府任內臺灣爆發一連串食品安全爭議事件，有關單位被民眾認為執法不力、消極作為，懷疑政府無法提供有效因應對策對抗黑心食品，因此民怨四起。（詳見：2011年臺灣塑化劑事件、2013年臺灣食品安全問題事件、2013年臺灣毒澱粉事件、2013年臺灣食用油油品事件、2014年台灣劣質油品事件、2014年臺灣黑心油品列表、毒豆乾事件等等）
2012年4月，馬英九政府因宣布油電雙漲導致物價飛漲。
2012年10月，民間保釣行動，海巡署為維護漁民安全、保障漁民權益，共出動和星艦、連江艦、南投艦、花蓮艦、金門艦、三艘巡護船、四艘巡防艇，共12艘艦艇全程護航；巡護艦隊並配置必要醫護及16名武裝特勤隊精英特戰人力，全力保護漁船航行與漁民安全。
2012年，台北文林苑都市更新爭議。
2014年，內政部營建署署長、桃園縣副縣長葉世文，爆發合宜住宅弊案。
2015年8月31日，南投縣長李朝卿因涉及南投莫拉克風災重建索賄弊案。
2016年1月，台灣海巡署證實月初確有海巡艇射水柱驅離兩艘越南漁船，原因是「已侵入台灣領海內」。今次是台灣巡防艇，首次對越界漁船發射水炮。
郭台銘受前總統馬英九於2008年中華民國總統選舉後要求而在高雄軟體園區興建的「鴻海高雄軟體研發大樓」。該大樓當前主要用於放置雲端機房與機櫃和辦公室出租。，引起高雄市政府置疑。

高雄自由貿易及生態港跳票

高雄自由貿易及生態港，也有人稱之為高雄港市再造，為馬英九2008年在參選中華民國第十二屆總統時，愛台十二建設政見之子項目，預定投資金額為新台幣577億元。
此計畫中的許多子計畫後來又被馬英九政府納入高雄海空經貿城及「黃金十年」計畫中，作為2012年中華民國總統選舉的政見。
2017年高雄市立委劉世芳說，前總統馬英九提出的「愛台12項建設」中預計對於高雄的建設，都沒有實踐，淪為空話。然而馬英九政府在2011年馬英九就職三周年記者會上宣布「其政見就職3週年落實率到達90%」，也在2015年表示，愛台12建設的達成率已經到98.6%。高雄立委李昆澤批評愛台12建設用在高雄的實際預算從馬英九2008年執政到2015年累計只有原先2008年承諾577億元的三分之一不到（僅編列高雄港洲際貨櫃中心預算），明顯重北輕南。

計畫成果

2017年高雄市立委劉世芳說，前總統馬英九提出的「愛台12項建設」中預計對於高雄的建設，都沒有實踐，淪為空話。然而馬英九政府在2011年馬英九就職三周年記者會上宣布「其政見就職3週年落實率到達90%」，也在2015年表示，愛台12建設的達成率已經到98.6%。高雄立委李昆澤批評愛台12建設用在高雄的實際預算從馬英九2008年執政到2015年累計只有原先2008年承諾577億元的三分之一不到（僅編列高雄港洲際貨櫃中心預算），明顯重北輕南。
2011年年終之際，李昆澤與許智傑及高雄市政府曾反映，當高雄市政府依據馬英九的政見向中央政府機關爭取相關預算補助時，卻只見各部會互踢皮球不認帳。
然而當時正在競選總統連任的馬英九競選總部發言人回應：「部分未及於本屆任內實現的政見，馬吳會繼續努力。」
截至馬英九政府卸任時，曾在2009年行政院新聞局編印的【中華民國年鑑-中華民國97年】一書中被列為擴大內需方案，包括「高雄自由貿易及生態港」在內的四項優先基礎公共建設，僅桃園國際航空城稍有進度。

高雄港洲際貨櫃中心

2011年馬英九政府表示已經核定洲際貨櫃中心計畫。然而該計畫僅是延續陳水扁政府的政策。

高雄聖淘沙

2011年12月，高雄在地立委李昆澤、邱志偉與許智傑批評馬英九政府上任前提出「改造旗津成為高雄聖淘沙海洋遊樂園區」，數年過去，卻毫無規劃也沒編任何預算。反倒是當高雄市政府為了防止旗津海岸線持續推縮百公尺而向馬英九政府爭取經費要作「旗津海岸線保護工程」進行國土復育時，中央的營建署與水利署卻不給任何補助，導致高雄市政府只好在增加自身財政負擔的情況下編列7億元進行國土復育。
後來民進黨立法院黨團披露，高雄自由貿易及生態港中「改造旗津地區成為高雄國際海洋遊樂區」的計畫已被取消。

海洋科技文化中心、港區生態園區

民進黨立法院黨團披露，高雄自由貿易及生態港裡「設立海洋科技文化中心」、「港區生態園區」等計畫已被取消。

高雄國際機場擴建倉儲物流設施，並改造周邊交通

由於未見馬英九政府後續的政策規劃落實，高雄市政府已經於2015年自行對外洽商開發小港機場的特倉區。

改造哈瑪星、鼓山、苓雅等舊港區

馬英九政府上任後到卸任前，行政院曾編列300萬元的規劃費用於規劃舊港區周邊地區與旗津地區的再開發計畫。