樂高旋風忍者：旋風術大師

前導季 Pilot Season (2 集)

旋風忍者的故事中，講述著一個名為 "Ninjago" 的土地上，在過去，曾有一位大師，他是最初的「旋風術」大師，用四把黃金神器來創造世界。這位大師膝下有兩個兒子，兩個兒子一起學習旋風術。然而，哥哥變得邪惡，想要藉由四把神器來統治世界，並與弟弟大戰起來。最後，弟弟打贏了這場戰鬥，並把哥哥打入一個叫做 "Underworld" 的地下世界。為了防止哥哥回到 Ninjago 並搶走神器，這個弟弟把四把武器藏在各地，並各自安排一個「守衛」看守這些寶物。
　在 Pilot Season 的一開始，就講述在一個祥和的鄉下，一日，一對經營打鐵舖的兄妹：赤地 (Kai) 與 赤蘭 (Nya)，遇到一名神秘的鬍鬚老人「胡大師」(Sensei Wu)，只留下摸不著頭緒的對話就分道揚鑣。接著，風雲變色，一群駕駛重機、裝甲車的骷髏兵忽然入侵村莊，找到打鐵舖裡一張被藏起來的古地圖，並把赤蘭給綁架走。胡大師再度現身，表示那是黑暗君王「伽瑪當」(Lord Garmadon) 的手下，他們搶走的是四把神器的地圖，那是數年前，胡大師交到赤地父母手上，由他們代為保管的地圖。伽瑪當準備把四樣武器蒐集到手。如果要把赤蘭救回來，赤地一定要離開打鐵舖，跟著胡大師回到山上的道場，學習「旋風術」，成為一名「忍者」。
本來對於成為忍者，或學習超強武術絲毫不感興趣，但為了救出相依為命的妹妹，赤地努力接受武術訓練。本以為這間道場只有他一個學徒，卻在一日夜裡，遇到三名蒙面忍者。經過打鬥後才發現，這三位也是胡大師在旅途中相中其潛力，帶回來接受訓練的學徒，分別為個性相當木訥、帶點孤僻的白衣忍者「冰忍」(Zane)；喋喋不休，很快就戀上赤蘭的急躁藍衣忍者「阿光」(Jay)；以及擁有大力與穩定性的沉穩黑衣忍者「阿剛」(Cole)。
　　隨著劇情發展才得知，原來黑暗君王「伽瑪當」就是傳說中第一代旋風術大師的長子，而胡大師則是次子。伽瑪當隱居在地下世界多年後，集結骷髏兵，尋找四樣黃金神器，準備統治這個世界。現在，四位忍者一定要搶先奪回胡大師藏起來的四把神器，學習旋風術，擊退伽瑪當。
　尋找神器的過程中，四位忍者逐漸熟悉彼此的個性，尤其只想要救出妹妹，不想跟另外三位忍者慢慢想計畫的赤地，漸漸學會與其他忍者合作，最後終於找到一把又一把被「龍」所保護的神器，並在與骷髏兵的戰鬥過程中，學會了「旋風術」。
當分別找到了四把神器後，一行人準備進入藏著最後一把神器的位置：「火焰神廟」(Fire Temple)，卻不知伽瑪當早就設下圈套。急著救出赤蘭的赤地，在忍者與師父睡著時，隻身前往火焰神廟，拔出了火焰劍，但遭到埋伏。正當赤地快撐不住時，還好胡大師現身解圍，只是當赤地、胡大師一起對付敵人時，外頭的三名忍者也遭到骷髏兵襲擊，全部的神器通通被帶到地下世界。知道已經沒有希望的胡大師，就自己帶著最後一把「火焰劍」，順著岩漿到地下世界，要跟伽瑪當一對一大戰。
胡大師來到了地下世界，再次與伽瑪當見面。但伽瑪當並沒有親自出馬，是派出擁有四條手臂的骷髏將軍 Samukai，拿著已經搶到的三把神器跟胡大師打。在此同時，在外頭的忍者們也找到方法，馴服了原先守護神器的神龍，並駕馭前來地下世界，救援胡大師。
當忍者們趕到時，Samukai 已打敗了胡大師，拿到最後一把神器。但四把神器力量過於強大，沒有人可以一口器駕馭四把神器，即使是伽瑪當也不行，骷髏成了他的棋子！神器開啟了一個通道，通往哪裡沒人知道，只見伽瑪當笑笑地走進去，一切都在他的計畫中，未來他會再與忍者們見面的。

Mini-movie(6 集)(每集長度2分鐘)

當伽瑪當掉入地下世界深淵後，本來即將遭遇骷髏大軍襲擊，但當眾狠狠打倒 Samukai，成為骷髏大軍的新領導者。

主要劇情發展

伽瑪當君王離開之後，生活暫時恢復平靜。忍者們繼續在山上的道場修行時，不小心看到胡大師的預言卷軸，得知：未來會再出現能同時駕馭四把神器的「綠忍者」，而且將與伽瑪當君王進行命運決鬥，讓四人興奮不已，每人都好奇這個超強的綠忍者會是他們之中的誰？這時，赤蘭忽然告知，在村落中，伽瑪當出現了！戰鬥才剛結束，伽瑪當竟然又回來！
結果才發現在搗蛋的竟然是「勞埃德．伽瑪當」(Lloyd Garmadon)，這是伽瑪當君王在壞小孩學校就讀的兒子！小伽瑪當不像父親一樣是魔鬼外型，沒有任何法力，更不會武術，僅只是穿著骷髏圖樣的黑色服裝，在村莊狐假虎威，當然馬上就被忍者們修理一頓。
對於被當小屁孩看待，勞埃德．伽馬當覺得很生氣，當他在荒野漫步時，不小心掉入一座蛇族古墓，在裡面遇到藍色的眼鏡蛇族「Hypnobrai」。蛇族大將軍本來想施以催眠術，降伏勞埃德，結果誤打誤撞，催眠了自己，變成自己降伏於勞埃德。意外獲得蛇族大軍的勞埃德，決定率領牠們來打倒忍者們。
雖然擁有蛇族大軍，勞埃德的個性還是相當幼稚，蛇族全被指揮來做些幼稚事 (例如蓋巨大樹屋)。請記得，整個蛇族只有大將軍被催眠而已，其他蛇族全是聽從大將軍指揮。屬於副將軍的 Skales 受不了大將軍對這屁孩唯命是從，因此透過傳統的蛇族決鬥，取得指揮權，成為新的藍蛇族首領，並且造反，讓勞埃德落跑。
對於眼鏡蛇大軍叛變一事，勞埃德覺得很難受，因此遵循蛇族部落地圖，再解放另一支紅蛇族「Fangpyre」，發現紅蛇族跟藍蛇族有不共戴天之仇，再指揮牠們去跟藍蛇族交戰。兩族相遇時才發現......紅蛇族首領竟然跟藍蛇族新首領 Skales 是好朋友。「是呀，兩族本來是仇敵，但我們跟 Skales 卻是好友」。意外促成紅蛇與藍蛇組成聯軍，勞埃德只得再落跑。
不小心釋放了兩個蛇族的勞埃德，繼續遵循古地圖，想再找到可以指揮的蛇族大軍，接著找到了以長脖子為主的紫蛇族「Anacondrai」的古墓位置。但打開古墓大門才發現，整個古墓只剩下一副副骨骸，僅剩該族首領「Pythor」存活。看到隻身前來的小屁孩勞埃德，Pythor 釋出善意，一起玩樂、搗蛋。但實際上，Pythor 只有一個目的：奪取勞埃德身上的蛇族地圖、再找出剩下兩支蛇族，把五族結成聯盟，召喚傳說中的大蛇王「巨蛇魔王 (The Great Devourer)」。
最後 Pythor 還真的把勞埃德拋棄，搶走了地圖，而勞埃德就跟著忍者回去，由叔叔：胡大師的照顧。
　從勞埃德手上騙走古地圖的 Pythor，就是本季中忍者們的最大對手。除了稍早被勞埃德釋放的藍蛇族和紅蛇族外，Pythor 再依照古地圖，又釋放另外兩個「綠蛇族」與「黑蛇族」的位置，並把五族集合起來，找到被遺忘的古代蛇族城市。只要再蒐集到四把蛇牙刀「 Fangblades」，就可以重新召喚巨蛇魔王。忍者們要防止蛇族召喚巨蛇魔王的計畫。

忍者們的新家：使命號

忍者這邊也有著相當大的變化。當勞埃德一開始率領紫蛇族時，曾把胡大師在山上的道場給燒了，忍者們只得帶著四條龍另尋落腳處，最後在沙漠中發現一艘破損的古船：「使命號」，而四條龍無法適應沙漠中的氣候，忍者們就讓龍離去。在整頓之下，發現使命號竟然搭配高科技設備，可以在空中飛行，也有電子地圖，跟掃描系統，成為忍者的戰鬥基地。只是在第一季最後，整艘船又被巨蛇魔王咬斷，讓忍者再度失去住所。

用神器召喚全新的載具

在沒有龍的情況下，忍者們沒有可以快速移動的方式，這時胡大師說，他們在Pilot Season中找到的四把神器，可以召喚出專屬他們的載具。阿光的雙截棍能變出一台噴射機；阿剛的鐮刀可以變出黑色的戰車；冰忍可以變出雪地摩托車；而赤地則可變出重型機車。

神秘機甲「武士X」登場

除了四名忍者之外，主角方在稍後也加入了一名新戰力。戰鬥的過程中，忍者們遇到一名神秘的「武士X」(Samurai X)。這名武士X會駕駛著一具巨大機甲，給予支援，有時甚至能在忍者抵達蛇族搗亂的現場前，就先把那些蛇給收拾掉。這名武士究竟是誰？為什麼當忍者接獲有蛇族搗亂的消息前，武士卻能捷足先登？
其實武士的身分不久之後就揭曉，正是在船艦上給予情報後援的「赤蘭」。是的，赤蘭就是神祕的武士X，當忍者在接受訓練的過程中，赤蘭也不斷想向大家展現她也能上場戰鬥，但一直被保護在後頭。因此她偷偷弄來這具機甲，戴上武士頭盔，一起上場作戰。一開始忍者們對武士有著敵意，赤蘭身分揭曉後，武士就成了戰力之一。

勞埃德就是預言中的綠忍者！

當然，在與蛇族對抗的同時，四位忍者不斷幻想自己就是預言中的「綠忍者」，甚至做了許多蠢事，尤其某一集赤地更是心急到讓人很火大。胡大師也很想找出綠忍者的身分，發現四把黃金神器可以同時對小屁孩勞埃德產生反應，這才發覺勞埃德就是預言中的綠忍者。這也代表......勞埃德未來將與父親進行宿命中的對決。

蛇族也能製造自己的載具！

蛇族也不是省油的燈，他們也能夠過毒液，把人變成蛇族一員，甚至把機械變成半生命的蛇載具。當他們來到阿光爸媽的回收場時，更是把大量廢鐵變成載具，有摩托車，有四輪戰車，甚至還有鐵球，真的有夠猛。更猛的是，這些不只是載具而已，他們甚至有自己意識，已是半生命體。

巨蛇魔王再次降臨

當蛇族被釋放到地面上，重現光明之後，對於人類把他們關在陰暗的古墓，蛇族認為該是報仇的時候了，因此 Pythor 就遵循蛇族的古地圖，找到古代的都市，蒐集四把「毒牙刀」，以及匯集五族蛇王的手杖，最終完成召喚儀式，釋放出巨蛇魔王。但 Pythor 沒預料到的是，在魔王眼中全都是獵物，因此完成召喚後，魔王就直接把眼前的 Pythor 與胡大師吞進肚子，而且每吃一樣東西就會增長體積，最後大到忍者無法傷害的地步，邁向 Ninjago 世界的首都：Ninjago City 前進。
在 Pilot Season 中，揭曉了胡大師是伽瑪當君王的弟弟，當時有提到兄弟倆同是第一代旋風術大師的兒子，但伽瑪當卻變得邪惡。現在揭曉，原來當初是兄弟兩小時在比武，胡大師的武器不小心被打到門外，伽瑪當翻牆出去撿，卻在草叢中被還是小蛇的蛇魔王咬了一口，蛇魔王的毒液在伽瑪當體內注射了邪惡，讓伽瑪當個性大轉變，最終變成邪惡的君王。

伽瑪當君王再次回到 Ninjago 世界！

胡大師意識到蛇族將越來越強大，這場戰鬥只會越來越吃力，他必須尋求額外支援，因此暫別忍者們，隻身尋求支援。他來到了黑暗次元，他尋求協助的對象，竟然是在 Pilot Season 中離開的「伽瑪當君王」！
看到胡大師過來，伽瑪當覺得可笑，但一聽到勞埃德也將陷入困難，就讓伽瑪當立即心軟。雖然伽瑪當是個邪惡君王，甚至為了取得武器，在黑暗次元中又多長出了一對手臂，但愛子心切的他，同意一起加入忍者行列，對抗蛇族。更不用說當初就是巨蛇魔王咬了他一口，害他變得如此邪惡，他也要來報仇。

冰忍

上一季中，忍者們就意識到冰忍個性非常木訥，像根大木頭，對大家的笑話一點反應都沒有，某些層面來說他真的不太像「正常人」。曾有幾次，冰忍跟一隻神秘的隼鳥有某種感應，某一集他決定追尋這隻神秘的隼鳥，來到遙遠的雪地，打開了一間荒廢已久的地下室，看到了裡面放置的設計圖，才驚覺自己其實是「機器人」。當他打開身上的「記憶開關」，才想起父親在死前，關閉了其記憶，也讓他忘了自己是機器人的事情。至於為什麼對笑話沒什麼反應？原來是他的「幽默開關」也被關了。

阿光的父母，阿剛的父親

第一季中也介紹了阿光的父母，阿剛的父親。阿光出身於一個廢鐵廠，父親跟母親的嗜好是用廢鐵廠的零件發明東西，及四處旅行，講話跟阿光一樣喋喋不休，但阿光真的很怕他父母講太多話。
黑忍者阿剛的爸爸，則是一名崇尚音樂、舞蹈、藝術的舞者，一直期盼自己的兒子也能像他一樣，走上優秀舞者的路，但不知兒子其實是去學習當忍者。
與阿剛父親見面那一集的故事，是講說他們發現其中一把毒牙刀已被人類挖掘出來，做成獎盃，設為城中才藝競賽的獎品，本來他們決定要用偷的方式取走，還是決定用參賽的方式把獎盃贏下來，讓阿剛父親感到驕傲。當他們在比賽當下，遇到蛇族也過來參賽時，一度決定改回去用偷的，但阿剛父親氣到轉身就走，才不管他們是否為正義而偷，總之一旦偷了東西就不是他兒子了。

勞埃德與伽瑪當君王

雖然伽瑪當君王內心仍是邪惡，仍希望剷除忍者，拿走神器，統治世界，但他依然愛著自己的兒子。某一集是當忍者全數前去與蛇族對戰，只留下勞埃德和伽瑪當在使命號上，當忍者們遭遇困難，尋求支援時，勞埃德發現伽瑪當竟然是趁機偷竊忍者的資料，讓勞埃德很生氣，直接對老爸大吼，叫他滾開，再也不想見到他。

團結合作

四個忍者團結合作。團結會成為強大的力量，相同的，當敵人團結起來時，也會成為強悍的對手。原先五蛇族彼此獨立，甚至有些敵對，但隨著 Pythor 用「巨蛇魔王」的神話來蠱惑大家，讓蛇族團結起來，成為強大的敵人。
為了對抗團結起來的蛇族，忍者們也被迫與伽瑪當君王合作。事實上，這一季的最後，忍者們造出超狂載具，帶出了四頭神龍，還是得靠著伽瑪當的助力，同時拿著四項神器，才終於打死暴走的巨蛇魔王。

主線劇情

上一季的最後大頭目：巨蛇魔王 (The Great Devourer) 被打爆了之後，Ninjago City 暫時恢復和平，但忍者們卻仍有事情要擔心。當時為了打敗巨蛇魔王，忍者們把四把黃金神器，交給有四條手臂的 伽瑪當君王 (Lord Garmadon)，但在巨蛇魔王死亡後，伽瑪當帶走四把神器，消失得無影無蹤，讓忍者們相當緊張。
忍者們的基地：使命號，在第一季最後被巨蛇魔王咬碎，使得他們無家可歸，在身無分文的情況下，重新在 Ninjago City 裡尋找住所跟道場，最後終於找到一間破爛的公寓，也在市內找到一名自稱身手不凡 (但實際上是個弱雞) 的道場師傅：Dareth，一起共用他的道場。忍者們必須全力訓練還是小孩的勞埃德 (Lloyd Garmadon)，要讓他成為預言中的「綠忍者」，實現與父親的「最終之戰」。
當忍者們在進行相關準備時，伽瑪當君王帶著四把黃金神器，集結剩下的蛇族士兵，成為他的勢力，並利用神器的力量，將破損的「使命號」重建起來，變成他的新船「Black Bounty」，並前往當初鍛造出四把神器的金山峰 (Golden Peaks)，將四把神器融合成一把「巨大兵器」。
儘管打造出「巨大兵器」，起初伽瑪當還不知道怎麼使用其神力，被蛇族部下質疑，最後發現「巨大兵器」不能製造毀滅力量，卻能帶來「創造力量」。伽瑪當可以用「巨大兵器」創造出任何他心中所想之物，因此用這把兵器繼續找忍者們麻煩。例如不小心把「使命號 / Black Bounty」數百年前的主人：以 Captain Soto 為首的一幫海盜給死而復生，或是製造四隻忍者的複製體，或是不小心復活博物館中遠古時期的肉食猛獸，或是不小心把四隻忍者變成小孩......等。
在第五集 "Child's Play" 中，伽瑪當君王意外逆轉了時間，復活了陳列在博物館的遠古猛獸 "Grundle"，同時也不小心把四名忍者變成跟勞埃德一樣年紀的小孩。為了對付跑到街上的 Grundle，胡大師找到具有再逆轉時間的魔茶，潑灑在四名忍者身上，雖然讓忍者們再變回到原本的年紀，卻不小心讓勞埃德一起長大了。長大了以後的勞埃德，學習的速度變得更快、力量也越來越強，距離與伽瑪當一戰的「最終之戰」不遠矣。
除了是敵對關係外，伽瑪當處處阻止忍者們繼續訓練勞埃德，是希望避免勞埃德真的成為綠忍者，他很害怕必須與兒子決一死戰的那一天到來。巨大兵器是有強大的力量，但伽瑪當還是想不出該如何阻止勞埃德的訓練，終於想出新計畫，利用「巨大兵器」製造出時間蟲洞，回到 Pilot Season 的時間點上，只要阻止當時的赤地跟隨胡大師當紅忍者，就不會有未來的忍者們，勞埃德也就不會被訓練成忍者了。
伽瑪當君王回到過去，忍者們也跟著回到過去，要阻止伽瑪當君王打亂歷史。他們就想到：只要破壞掉伽瑪當君王手上的「巨大兵器」，就可以阻止伽瑪當的計謀，而要破壞「巨大兵器」，就是拿起那個時間點的四把黃金神器，與之對抗，畢竟巨大兵器就是從四把神器融合起來，其力量是相同的。
最後四位忍者也拿到了四把神器，並與「巨大兵器」一打：誰料想得到，兵器之間的力量，卻導致巨大兵器直接往宇宙飛去。
因為巨大兵器被破壞掉，忍者們與伽瑪當君王回到「現在」。伽瑪當君王想到，先前復活使命號的原船主，也就是那幫海盜船員時，曾經在船上的航海日誌讀到關於「黑暗之島」(The Dark Island) 的描述，上面一定有他用來對付忍者的黑暗力量，因此指揮蛇族，駕駛直升機到海上尋找。但在海上徘徊許久，始終沒看到島的蹤跡，加上先前對付忍者的計畫全數失敗，「巨大兵器」也早已消失不見，蛇族決定叛變手無寸鐵的伽瑪當，把他踢進海裡，改由藍蛇族首領 Skales 繼續指揮蛇族大軍。
在此同時，忍者們接收到來自市內博物館的通知，需要忍者們出手相救，原來博物館從地底下挖掘出來自古代的「石頭兵」雕像復活了，正在大鬧博物館。在上一季的最後，伽瑪當君王雖然打爆巨蛇魔王，但蛇王體內的毒液滲透整座城市的土壤與下水道，有些毒液從博物館的地下滲出，沾到這些石頭兵，就給予了生命，讓他們復活。小小的石頭兵四處大鬧，還是被忍者們全數砸爛。
當忍者們在好奇這些石頭兵的來歷，忽然一名有點年紀的眼鏡女子走了進來，似乎與胡大師是老交情。胡大師才介紹，她是一名考古學家，石頭兵的挖掘者，而且更重要的是，她就是勞埃德的媽媽：美沙子 (Misako)。
美沙子這回出來，講述了初代旋風術大師，也就是胡大師跟伽瑪當君王的爸爸，過去的故事。以前 Ninjago 這個世界，除了有代表光明的初代旋風術大師外，還有一個代表黑暗的魔王：「Overlord」。Overlord 與初代旋風術大師交戰無數次，最後是旋風術大師用四把黃金神器，把整塊大地分裂成兩半，變成兩座獨立的島嶼，Overlord 被留在另一座島，取名為「黑暗之島」，隨著日子過去，Overlord 與黑暗之島消失在海洋中，消失在地圖上，也消失在世人的記憶中。今日挖掘出來的石頭兵，就是當時 Overlord 當初創造的士兵，用來與初代旋風術大師對戰。隨著時間久遠，這些士兵也成為普通的石像，沉睡在地底下。
被蛇族踢進海裡的伽瑪當君王，漂流到一座他所沒見過的島嶼上，遇見了已變成類似氣體 / 靈體形式的 Overlord，才發現自己終於來到他在尋找的「黑暗之島」。Overlord 提議，兩人聯手將能重新讓黑暗壟罩大地，現在他們要做的，就是啟動預言中「最後之戰」的倒數鐘，等倒數完畢後，就能擊敗忍者們，並重新統治世界。原來黑暗之島已沉入海中，只留下一點點還在海面上，看到有了一個強大的盟友，Overlord 便利用其力量，將整座島重新拉出海面，準備向 Ninjago City 突擊。
蛇族在背叛伽瑪當君王後，回到 Ninjago City 的地下，打算再進攻城市，但挖隧道到一半，忽然挖出一整間的墓穴，裡面全是石頭兵雕像，就像兵馬俑一樣。這時，墓穴的上方滲出巨蛇魔王殘存的毒液，滴到每一隻石頭兵身上，這些石頭兵就全部活過來，把蛇族關在墓穴中，並一隻隻爬出地面，大鬧街道。
在此同時，伽瑪當君王也找到了倒數鐘，並將黑暗頭盔戴到頭上，從此得到率領石頭兵的能力。當倒數鐘時間到時，預言中的「最終之戰」就會來到，而到時就是 Overlord 統治世界的時候。
在 Ninjago City 這邊，忽然竄出大量石頭兵在街道上製造混亂，這些石頭兵又因為是用堅硬材質製造，而牢不可破，加上黃金神器被奪走後，忍者們無法使出元素之力，無法抵擋石頭兵，只得趕緊帶著鎮民逃離城市。逃出城市後，他們看到遠方海面上忽然跑出原本不存在的島嶼，上頭還有黑暗壟罩，令他們非常不安。已研究舊文獻很久的美沙子，找出更多預言，在黑暗島嶼上有一座「光之神廟」(Temple of Light)，只要進入神廟，忍者們不但能取得元素之力，綠忍者也將獲得初代旋風術大師的武術，成為新一代的「終極旋風術大師」，只有這樣才有可能進行預言中的最終之戰，實現與父親的對決，並打倒重新崛起的 Overlord。忍者們全數前往黑暗之島。
來到黑暗之島，忍者也遵循古老地圖，找到了位於山峰上的「光之神廟」，四色忍者在裡頭重新取得自己的元素之力，找到了全新的元素刀，並將元素刀的力量灌輸到勞埃德身上，讓勞埃德終於成為傳說中能駕馭全部元素之力的「綠忍者」。現在，忍者們準備好了，現在要做的事情，就是阻止倒數鐘，防止最後之戰的到來。
忍者們來到黑暗之島，發現在伽瑪當指揮下，石頭兵正在努力開採島上一種叫「暗物質」的礦物，正在打造某種兵器。當被發現之後，雙方進行交鋒，並發現伽瑪當與 Overlord 打造的兵器也終於完成：將投擲暗物質飛彈的巨型坦克「Garmatron」。在這過程中，赤蘭就被感染，轉變成黑暗版人格，與忍者們為敵。
Garmatron 是能投擲由暗物質製成的飛彈的坦克，飛彈一旦爆開，會釋放黑暗力量，讓四周的人全部變的邪惡、憤怒、失控，在投擲幾顆飛彈到 Ninjago City 市中央後，Overlord 也附身到伽瑪當身上，取得伽瑪當的身體，將忍者們打倒，就連取得駕馭元素之力的綠忍者勞埃德也被打趴。接著，Overlord 駕駛坦克，率領石頭兵大軍，往 Ninjago City 前進。
雖然在光之神廟取得了元素之力，但五位忍者無法對付重新取得肉身，也集結大軍跟巨型冰器的 Overlord，他們失敗了，只得看著整座城市陷入混亂。
坐在黑暗之島的海灘，看著離去的 Overlord 大軍，忍者們陷入低潮，明明取得了元素之力，卻完全不敵對手，當大家以為失去一切希望時，冰忍的機械老鷹卻把他們指引回去光之神廟，在裡面他們尚未發掘的秘密。在神廟內探索一下後，忍者們啟動了先前沒有注意到的開關，一具塵封在廟宇底部的金色機甲升了出來：這是過去第一代旋風術大師用來大戰 Overlord 的兵器，也將是忍者們最後的希望。勞埃德駕駛起黃金機甲，其他忍者駕馭著前來的四頭神龍，全數回到 Ninjago City，真正的最後一戰才正要開始。
回到 Ninjago City，發現整座城市已經被黑暗壟罩，彷彿黑夜一般，幾乎所有市民都被黑暗感染，轉變成邪惡、憤怒的暴民。Overlord 已經占據城市中的高塔，這將是他們進行最後一戰的戰場。在登上高樓的過程中，忍者們一個個被黑暗彈丸擊中，失去意識，轉變成邪惡的一方，最後只剩下勞埃德一人來到頂樓，最後的希望全都落在勞埃德身上。儘管趕到的時候，Overlord 又再進化成黑暗之龍型態，勞埃德隻身面對 Overlord，現在才「最終之戰」的開始，原來所謂最終之戰，不是真的面對伽瑪當君王，而是奪走伽瑪當君王身體的 Overlord。對戰的時候，勞埃德體內的潛能被激發出來，忽然耀眼的金色光芒包覆著他，勞埃德轉變成「金忍者」，成為真正的「終極旋風術大師」，召喚出一隻金龍與 Overlord 面對。面對變成金忍者的勞埃德，以及召喚出來的金龍，Overlord 覺得可笑，只要有光的地方就一定會有影子的存在，勞埃德是永遠無法消滅黑暗的，並將一股黑暗罩住勞埃德與金龍，並在暗影中將金龍一口吞下。勞埃德只說「那我的光將強到讓影子無所遁形」，就在 Overlord 嘴裡釋放出光的力量，徹底打倒了 Overlord，並讓 Ninjago City 重新被陽光照射，讓所有黑暗與邪惡消逝而去。

「棕忍者」：Dareth

第一季最後，雖然擊敗了巨蛇魔王，拯救了整個 Ninjago，但因為當時打敗巨蛇魔王的是持有四把神器的伽瑪當君王，所以其他忍者並沒有被當成英雄對待。也因為使命號在第一季最後被巨蛇魔王咬爛，使得忍者們再度無家可歸，連訓練場地都沒有，只好在城中四處打工，好不容易才找到一間品質很差的小公寓，七個人擠一擠，住在一起。在城中，忍者們找到了一間名為「Grand Sensei Dareth Mojo Dojo」的道場，希望能跟道場主人：自稱武術大師，擅長各種動物拳法的 Dareth 共用道場。
Dareth 就是一個身上掛著金項鍊，講話有點臭屁又有點慵懶的樣子，道場內還擺滿獎盃，弄得好像很厲害，後來才發現原來那些都是招搖撞騙出來的，其實不太能打。基本上日後 Dareth 跟忍者們也成為好朋友，變成崇拜者的角色，還自稱起「棕忍者」。

Captain Soto 與使命號

在第一季中，忍者們曾在沙漠中找到一艘破髓的船骸，重新整理之後發覺是搭配飛行系統、雷達掃描系統的使命號。當初第一季中，當忍者們找到船時，動畫並沒有交代這艘船為什麼會躺在沙漠，也沒有交代過這艘船是什麼用途，直到這一季中才給了暗示。本來在第一季最後被巨蛇魔王整個咬爛，但被伽瑪當君王用「巨大兵器」重建起來，一日當伽瑪當在船上亂晃時，忽然找到一本藏在暗櫃中的船長日誌，才發覺這艘船原本是屬於一名叫 Captain Soto 的海盜，因為在暴風雨中發生船難，船員全數罹難，船也因此破損。
伽瑪當就是在閱讀這本日誌時，才發現原來海上有一處被稱為「黑暗之島」的神祕島嶼。當時還不太會控制「巨大兵器」，不小心把過去的這些船員給復活，所以 Captain Soto 與其他海盜水手們全都來到現代。
另外，在第一季最後被巨蛇魔王咬碎的使命號，被伽瑪當用「巨大兵器」還原，被取名為「Black Bounty」，後來又被忍者們搶奪回來。

勞埃德的媽媽 Misako

當伽瑪當尚未完全變成後來的黑骷髏模樣前，就已經與美沙子交往，兩人生下勞埃德。為了研究「預言」，連美沙子都離開了勞埃德，直到第二季中才回來，而且與胡大師有點曖昧。原來在過去，美沙子曾無法選擇要與胡大師或伽瑪當在一起。雖然胡大師是說「我們不應該在一起」，但美沙子卻說「當初真的應該選擇你的」、「過去已成過去，但我們還有未來」。

冰忍的父親

上一季中介紹了每個忍者的背景故事，包括每個人的父母 (除了赤地、赤蘭兄妹外，他們的身世依然是團謎)，其中提到冰忍其實是一隻機器人，由「父親」 The Tinkerer 創造，但在冰忍的記憶最後，父親臥病在床，過世前關掉了冰忍的記憶，讓他一直不記得自己是機器人，也不記得曾有一個父親。看到父親還活著，冰忍是很開心，也感到無比困惑，父親才解釋，他原先是真的要死了，但在關掉冰忍記憶之後，忽然一批骷髏兵闖進來，用魔茶將他起死回生，也被骷髏兵綁走，囚禁在燈塔中，為他們製造各種車輛、載具，雖然現在骷髏兵已經沒再回來叫他繼續設計武器，但一隻被骷髏綁在海中的巨大海怪仍在監視他，讓他不敢逃跑。骷髏兵，就是 Pilot Season 中，伽瑪當君王手下那些骷髏兵。
在忍者們放走了海怪守衛後，Tinkerer 也跟著忍者們離開，前往黑暗之島，擔任後勤維修人員，隨時跟著赤蘭維修忍者們所使用的載具跟飛船。

伽瑪當君王可憐的一面

雖然大部分時間，伽瑪當君王一直給人一種「耶~我是壞蛋，我要征服世界」的感覺，但也漸漸帶出他內心深處並不想當壞人，他是身不由己 。因為毒液的影響，伽瑪當內心變得很想做壞事，也造成他與哥哥 胡大師、與妻子 美沙子、與兒子 勞埃德之間的疏離。因為這樣，使得他更想完成 Overlord 的計畫，也就是將世界變得黑暗、邪惡。既然他無法恢復正常，與家人團聚，那就讓他所愛的人墜入黑暗面，與他團聚吧。
雖然一直與忍者為敵，一直知道勞埃德將實現與伽瑪當進行最終之戰，但伽瑪當不想與兒子戰鬥。每當看到兒子站在他面前，他都會心軟。

敵人很強

從黑暗之島上的設備，再到黑暗逐漸壟罩大地，再到奪取伽瑪當的身體，再到率領坦克大軍進攻城市，再到最後的黑暗之龍完全體，隨著時間過去，Overlord 變得越來越強大，要打敗他變得越來越不可能。他開始投擲暗物質，把人轉變得邪惡之後，更給人一種絕望感。Overlord 不怕自己被打敗，因為光明與黑暗是一體兩面，有光的地方必定有陰影，只要光還存在，他就永遠不會消失。

主線劇情

在上一季的最後，當綠忍者 勞埃德 消滅了 Overlord，並把自己的父親：伽瑪當洗白後，忍者沒有了對手，世界來到和平時代，Ninjago City 如今發展成一個充滿科技的大都會：「New Ninjago City」，一切科技由一個坐著輪椅的科學家 賽勒斯·博格 ( Cyrus Borg ) 提供。為了方便管理，博格甚至創造了一個電子網路「數位宇宙」(Digiverse)，串聯起整座城市的網路與電子迴路。四色忍者到學校教書，成天面對一堆屁孩；勞埃德則與父親伽瑪當還有美沙子四處旅行。
正當忍者們在懷念以前大冒險的日子時，博格忽然邀請忍者們到他的科學大樓「博格大廈」(Borg Tower) 參觀。忍者們起初感到不解，但才發現博格是利用這個機會，偷偷塞給他們全新的服裝與武器「Techo-Blades」，並表示 Overlord 還活著，只是換成數位形式，存在一隻硬碟裡。現在 Overlord 操控起博格大廈的科技，大量製造機器忍者，甚至控制了博格的數位網路，控制了整座城市，準備東山再起。現在需要忍者們重新出動，對抗復活的大魔王。
面對大量出現的機器忍者，甚至還有一隻被製造出來的機械巨龍，忍者們幾乎招架不住，只得使用打帶跑策略。在戰鬥的過程中，為了掩護忍者，胡大師也遭到機器忍者挾持，被帶去改造成邪惡機器人，博格也被控制心靈，變成邪惡蜘蛛型機器人。忍者們必須想辦法來對付這些機器人。既然整個城市的電子網絡都被控制，忍者們的策略，就是先關閉城市內的發電廠，當失去能源後，就能大幅度削弱 Overlord 的能力。
經過一翻努力，忍者們終於突破發電廠，衝回科學大樓，準備要把藏有 Overlord 數位資料的硬碟破壞掉。正當計畫都進行地相當順利時，竟出現一個穿白衣服、沒有露臉的神秘人，拿走硬碟並逃跑，並在現場留下一片白色的鱗片。
Overlord 的硬碟被白袍神秘人士帶到一個秘密實驗室，雖然發電廠被破壞，整座城市都是屬於無電狀態，讓 Overlord 無法輕易操控網路，機器忍者也無法啟動，但神秘人卻用一種特殊的電鰻製造電力，為機器忍者大軍充電。對於為什麼被神秘人拯救，Overlord 也感到困惑，僅知這兩人從此結盟。
只差一點就能徹底把 Overlord 消滅掉，但這個留下白鱗片的人究竟是誰？除了它可以隨時隱身外，對它實在沒有概念。但看到鱗片，忍者們直覺就是「又是蛇族搞的鬼」，所以來到城市的下方，要對質過去曾與他們大戰的蛇族，發覺蛇族如今很享受當個平民的生活，無意再發起任何戰爭，看來兇手並不是牠們。
但跟蛇族對談的過程中，忍者得知了另一個預言。在蛇族的預言中，除了人類之外，將會有一個「黃金大師」的降臨。這黃金大師是個邪惡的存在，他將會掌握初代旋風術大師的能力，並將世界上的人類與蛇族全數消滅。
如果預言是真的，那忍者們感到很害怕。「黃金大師」？掌握初代旋風術大師的能力？難道......是指勞埃德會成為一個惡魔，消滅這個世界？畢竟，在上回，勞埃德最後是激發出體內的力量，成為「黃金忍者」，打敗惡魔！
本來與父親一邊躲藏、一邊受訓的勞埃德，卻遭到機器忍者大軍，以及生化版胡大師與白袍神秘人突擊。在突擊過程中，神秘人才終於揭曉身分，竟然是 Pythor！
在第二季率領全部蛇族團結，並召喚出巨蛇魔王的紫蛇族最後成員：Pythor，當時雖然一起被巨蛇魔王吞下去，但很明顯當巨蛇魔王被打爆後，他也倖存下來，只是因為毒液關係，使皮膚被漂白。今日他決定與 Overlord 聯手，一起重新掌握這世界，並向忍者們復仇。他們就把勞埃德帶上機械巨龍，飛回到 Overlord 的大樓。
原來，上一次忍者攻擊行動後，Pythor 要打造一具身體，讓 Overlord 可以擺脫數位形式，再次來到世界上。除此之外，他們準備奪取勞埃德的黃金之力，並用來統治世界。原來蛇族預言中的「黃金大師」，就是指東山再起的 Overlord！
　在此同時，在博格的數位助理 P.I.X.A.L. 幫助下，忍者們進入數位宇宙，與數位形式的 Overlord 大戰一場。若能在數位世界中徹底消滅 Overlord，就能阻止他的計畫。但在戰鬥過程中，因為身體已經製造完成，Overlord 就來到現實，離開了數位宇宙。最後在冰忍爆發下，讓 New Ninjago City 中被駭入的機器與載具，連同生化版胡大師都恢復正常，Overlord 的機械巨龍也瞬間變一團廢鐵。在此同時，雖然 Overlord 的新身體已經打造完畢，勞埃德也趁機逃出敵人的掌握，在機械巨龍墜入海底時，趕快逃出。
既然已經讓對方的戰力大幅削弱，Overlord 與其新身體也跟著失去動力的機械巨龍沉入海底，暫時可以喘口氣。但 Pythor 還是把 Overlord 從海底打撈了出來，準備執行一個「Project: Arcturus」的計畫。看對方還有些動作，赤地進行跟監活動，跟著 Pythor 前進牠們的秘密基地，發現這個「Project: Arcturus」，是打造一隻太空火箭：牠們準備飛到太空中，帶回「巨大兵器」( Mega Weapon )，完成獲得黃金之力的最後一步！
巨大兵器！就是在前導季中，忍者們最一開始使用的四把黃金神器，在第二季裡，因為伽瑪當君王的關係，把四把黃金神器融在一起，變成這把「巨大兵器」，當時在不當使用之下，巨大兵器飛往宇宙，卡在一顆彗星之上。本來以為這把神器就這麼從這齣劇裡退場，沒想到又在這季中出現。Pythor 等人查到了這把巨大兵器的所在位置，製造火箭，前往太空來尋找，這就是 Overlord 獲得強大力量的最後一步。
忍者們躲在火箭上，跟著機器忍者們飛上彗星，並在上頭開戰，但最後還是被機器忍者們找到了黃金神器並帶回 New Ninjago City，打造出全新的黃金裝甲，給 Overlord 穿戴，最終讓 Overlord 掌握強大的力量，並正式成為預言中將消滅世人的「黃金大師」。
忍者們回到地球上，與掌握全新力量的 Overlord 大戰一場。現在，Overlord 拿到了由巨大兵器打造而成的武器，掌握了初代旋風術大師的力量後，能夠呼風喚雨，甚至讓自己巨大化。當忍者靠近 Overlord 時，全部都被擒拿住。冰忍卻利用最後的機會，將自己的冰元素能力開到最大，將 Overlord 摧毀，但也因此犧牲掉了自己，離其他忍者們而去。

伽瑪當師傅

在第二季的最後，勞埃德打敗了黑暗龍型態的 Overlord 後，除了讓世界恢復光明，也讓伽瑪當君王徹底洗白。因為巨蛇魔王毒液影響，伽瑪當君王體內被灌輸了邪惡意識，最終變成全身黑、又有四條手臂的大反派，但最後還是變回凡人，體內的毒液也被徹底清空，變成凡人樣貌，並被改稱為伽瑪當師傅 (Sensei Garmadon)。
在這一季中，雖然暫時沒有完全展現伽瑪當恢復正常後的身手，但他在傳授武術，改成「防守」：不主動攻擊，藉由引導對手的進攻，轉過去攻擊對手，跟過去的黑暗帝王有非常大的落差。

冰忍的戀情史

從第一季就揭曉是一名機器人，冰忍不只是帥氣機器人者而已。前面看到對自己的迷惘，還有與父親的親情，這一季則是往戀愛這一塊發展。在忍者們一開始來到科學大樓時，遇到了博格的個人助理：素素，這就展開了冰忍與素素的戀愛史。當然，兩人畢竟是機器人，所以無法理解「愛」為何物，更不熟悉那種喜歡上對方的感覺，但就是彼此吸引。

冰忍戰死

冰忍最後犧牲了自己，才打敗了 Overlord，拯救忍者夥伴們，與整個城市。他將自己的冰元素之力開到最大，才終於消滅掉 Overlord 的形體，卻也因為身體負荷不了而全部摧毀。為了感謝冰忍的犧牲，在博格主持下，於市中立了一座冰忍的金屬像。
原來這冰忍只是身體被摧毀，但心靈與意志還是以數位形式存在著。事實上，劇中最後就演到冰忍的聲音出現，與 P.I.X.A.L 對談，接著就看到當初製造機器忍者大軍的工廠自己動了起來，暗示冰忍又將製造新的身體，重新回到世界上。

阿光與阿剛開始為追赤蘭而開戰

從前導季開始，阿光就迷戀上赤蘭，甚至從第一季開始，就能感受到這小兩口吸引彼此，但從這一季開始，「三角戀」戲碼挑撥阿光、阿剛、赤蘭之間的感情。原先阿剛與赤蘭兩人之間並無特別好感，但當忍者們拜訪博格大樓，P.I.X.A.L. 看見了他們，立即計算出「阿剛與赤蘭是最佳的配對」，就這麼開啟了這兩人的曖昧關係。就從這時候開始，阿剛與阿光無時不為吸引赤蘭注意，而彼此競爭，兩人也越來越水火不容。

胡大師變成邪惡機器人！

在劇中，胡大師曾被 Overlord 改造成一隻邪惡機器人，並一起對抗忍者與伽瑪當師父。不過，劇中變成邪惡版的機器人，並沒有因此成為忍者的極大威脅。

這一季中使用的武器：Techno Blades

雖然先前已經失去黃金神器，但這回忍者們還是有武器可以使用，這是由博格發明的『Techno Blades』。當 Overlord 控制程式內的機械時，只要被這把刀具碰觸，就可以重新設定，解除 Overlord 的控制權。

主線劇情

雖然上一季的最後，有暗示冰忍的意識已經藏在網路世界，並利用博格的工廠，打造新的身體。不過上一季也只演到工廠動起來，並沒有看到冰忍新身體。
在上一季的最後，為了擊敗 Overlord，冰忍壯烈犧牲，在科學家賽勒斯博格主持下，大家為冰忍辦了一場喪禮，並立了一座金屬像在城市中間。對於冰忍的死，讓忍者們意志消沉，加上現在沒有任何敵人要打，赤地、阿剛、阿光都沒有繼續當忍者的理由，各自離開忍者團隊，從事其他職業。但勞埃德想再把大家集合起來，一一拜訪了其他忍者們。阿光當一名藝人；阿剛利用他的力氣，來當伐木工；赤地則在地下格鬥場當蒙面格鬥選手。
在勞埃德號召下，四個人重新在市內一家知名連鎖麵店「陳大師的麵店」聚集在一起。四人在談話時，一幫小混混進來鬧事，引起忍者們注意。當忍者們追著小混混來到店家後方時，忽然看到現場有一個供桌，上頭有一張畫像。那是冰忍的畫像！
畫像上頭寫著，冰忍還活著！
但想見到他，就來參加一場由「陳大師」所主辦的錦標賽。
也就是這家連鎖麵店的老闆。對方到底是何許人也？
雖然那張畫像上指示忍者們不要把錦標賽的事情告訴任何人，但勞埃德的父親：伽瑪當師父，還是察覺到忍者們似乎要瞞著大家去某個地方，因此偷偷跟在忍者們身後。
當忍者們在指定的時間，來到碼頭時，發現現場已經聚集了一票人。全都是受到陳大師邀請，來參加這場神祕的「錦標賽」的參賽者。這時，一艘渡輪來到岸邊，在一個名為克勞斯的人的邀請下，大家上了船，前往陳大師的島嶼。伽瑪當也跟著上去。
在船上與其他人碰頭之後，才發現一件事忍者們並不是世界上唯一擁有「元素之力」的人。除此之外，也是在船上，讓赤地遇到了一名名叫「凱樂亅(Skylor) 的女元素大師，很快就對她產生好感。
伽瑪當師父表示，原來當初當初代旋風術大師創造世界時，身旁有非常多具有元素之力的護衛，跟他一起保衛這世界，元素之力絕對不止火、冰、雷、地，這四種而已。船上這些人，有的是握有「元素之力」的護衛的後代，元素之力是會遺傳給下一代的。
忍者們才發現，陳大師把世界上所有握有元素之力的人召集起來，要進行一場神秘的錦標賽。但伽瑪當卻很擔憂，因為陳大師是伽瑪當的師父，而他並不信任他的師父。
原來，當初被巨蛇魔王的毒液影響後，伽瑪當離開了父親的道場，離開了胡大師，到外頭去拜師陳大師。他是個陰險狡詐之人，絕對需要當心。今天忽然舉辦這場錦標賽，事情絕對不單純。這也讓忍者們憂心起來，這場錦標賽的目的是什麼？而冰忍真的還活著？真的就在陳大師手上？
來到島嶼之後，克勞斯帶著大家，到了島上的大廳堂，並遇見了陳大師。在克勞斯帶領下，大家住進了代表各自元素的豪華套房，感到非常舒適。但競賽很快就開始，第一回合就是要搶在其他人之前，搶到「翡翠武器」，但翡翠武器的數量算的很剛好，每人一把之後，會有一人拿不到，這人就是淘汰者。最後在搶奪之下，具有「金屬元素能力」的卡洛夫成為第一個被淘汰的人。陳大師打開一個暗道，讓卡洛夫掉落其中。他去哪了？沒人知道，只知陳大師一直強調一句：「最後有一人會留到最後」(Only one can remain)。
　晚上在房間中，忍者們感覺很不自在。他們來這邊除了參加比賽外，最重要的目的是找出冰忍的下落，他們決定在晚上出去闖盪，尋找任何蛛絲馬跡。結果，他們不小心找到暗道，還不小心撞見一個神祕空間，看到陳大師手上拿著一把神祕的魔杖，將卡洛夫的能力吸走。忍者們才發現，陳大師的目的，是把每一個人的元素之力都偷走！
接下來的每一天，都會隨機抽籤，抽出下一個回合的對戰組合。每一回合的獲勝方式都不太一樣，但輸家一定會掉進陳大師的暗道，所以每個人都咬緊牙關。所幸忍者們都能順利晉級。然而，當發覺忍者們已經查到陳大師的計畫時，陳大師故意安排阿光跟阿剛對戰。
在上一季中，為了搶赤蘭，阿光跟阿剛整個鬧翻。但這回被迫面對彼此，兩個忍者還是不忍餘地。最後在陳大師的干涉之下，讓阿剛掉入暗道，成為忍者中第一個被淘汰的人。
除了讓忍者在比賽中對上彼此，陳大師也故意挑撥忍者與其他元素大師們，讓其他人團結起來，一起想辦法把忍者從比賽中淘汰掉。
在此同時，因為忍者們與伽瑪當師父在沒留下任何話就失蹤，讓還在本島上的赤蘭與胡大師等人相當緊張。在仔細追蹤之後，赤蘭開著新的移動式指揮部，與德瑞冒充陳大師的麵店卡車，一起來到島上，尋找忍者們的下落，並且偷走克勞斯的咒語書。
在比賽繼續進行的同時，越來越多從比賽中淘汰出去的元素大師掉入暗道，能力被吸收走，並被囚禁在陳大師的地下工廠，幫忙製作麵條。其元素之力也被奪去的阿剛，在前往工廠的路上，赫然發現被關在牢房的冰忍。冰忍是真的還活著！
冰忍的身體已跟以前不同，完全由鈦金屬組成，這回他是真的「鈦忍者」了。此外，在上一季與冰忍相遇的女機器人：P.I.X.A.L. 身體也被毀壞，一起被帶到島上囚禁。冰忍就將 P.I.X.A.L. 的硬碟資料灌輸到自己身上，讓 P.I.X.A.L. 從此活在冰忍的作業系統內。
發現冰忍還活著真的很令人開心，後來阿剛也想辦法把冰忍從牢房放出來。當上面還在作戰時，下方也不能嫌著，底下這些失去元素之力的元素大師，準備聯手起來，殺出一條活路出去。
還在競賽中的忍者們，逐漸拉攏越來越多元素大師加入他們陣營，說服他們這整場競賽都是騙局，陳大師是為了把元素之力全部拿走。部分元素大師相信忍者的話，並一起質疑陳大師。結果這時，陳大師才跟大家坦承他手上的魔杖，確實會把所有戰敗的元素大師的能力吸走，但他這麼做的原因是：要把這把魔杖當成最後的獎勵，送給在下一場競賽中勝出的大師。赤蘭已經偷走他與克勞斯的咒語書，在島上逃竄。誰能先把赤蘭獵下，就直接成為這次大會的優勝者。
當然，忍者們必須搶在其他元素大師前，先找出赤蘭的下落。在尋找赤蘭的同時，伽瑪當師父才對勞埃德講出一段過去的故事，並提到自己曾經犯下嚴重的錯誤，但他沒有勇氣把錯誤公開出來，因為這一定會破壞他與美沙子，以及與胡大師之間的關係。他也提到，當年曾經有一場人蛇大戰 (這部分在第一季就提到過)，雖然人類與蛇族之間一度休戰，但後來因為蛇族先破壞休戰條約，才又讓戰爭繼續打下最。最後是因為找到一種能擾亂蛇族思想的蛇笛，才讓人類打贏這場人蛇戰爭。其中五族全都被關在古墓中，永不得再回到地面上。其中，紫蛇族的大將軍則受到特別嚴重的懲罰：被流放到另一個名叫「詛咒魔域」(Cursed Realm) 的次元中。
陳大師之所以努力吸收全部的元素之力，是為了完成咒語，再次開啟人蛇大戰。

在進行赤蘭的爭奪戰時，被赤地所戀上的女元素大師「凱樂」，才揭曉她其實是陳大師的女兒。她加入進來是為了協助父親將全部的元素蒐集起來。而她本身則是「琥珀」的能力者，也就是「能將其他人的元素之力複製到自己身上來使用」。雖然背叛了其他人，但跟著赤地他們一起行動，凱樂也開始猶豫了起來。
當陳大師將剩下的元素大師一網打盡，並用魔杖將剩下的元素之力一口氣吸收起來時，稍早被困在麵條工廠的阿剛與冰忍等人，偷偷打造了一台戰鬥機，衝破工廠大門，打亂了陳大師的計畫。在慌亂中，赤地把陳大師的魔杖打碎，並將全部的元素之力還給每一個元素大師。看似計畫被中斷，但克勞斯說「先前凱樂已經將全部的元素之力儲存在她身上」，並退而求其次，綁走自己的女兒，全部落跑。
在逃跑的過程中，克勞斯也與伽瑪當師父相遇，並進行交戰。克勞斯用他的咒語書，開通了「被遺忘的魔域」(Forgotten Realm)，要把伽瑪當送進去。結果反被伽瑪當送入，克勞斯從此消失在這個魔域裡。
雖然魔杖沒了，但陳大師還是利用自己女兒身上所儲存的其他元素之力，開啟蛇族的咒語，導致陳大師及其手下們全都轉換成「紫蛇族」。底下的小囉嘍們全都變成紫蛇族，而陳大師、凱樂，甚至伽瑪當師父，身上都長出鱗片，皮膚變成紫色，變成半人半蛇的狀態。是的，因為伽瑪當曾是陳大師的弟子，他也連帶受到詛咒影響。陳大師就是計劃率領這些變成紫蛇族的大軍，把本島全部拿下。
忍者們與其他元素大師，召喚出屬於自己的元素之龍，回到 Ninjago 本島上，與胡大師還有美沙子會合，ˋ準備擊退陳大師與他的大軍。當敵方勢力越來越難以抵擋時，忍者們取得到了克勞斯的咒語書，利用其中一個能開啟「詛咒魔域」的咒語，將當年那些被流放到異次元的紫蛇族將軍放出來，把陳大師與其大軍全部帶走。但條件是必須有一人被犧牲掉，才能開啟這扇次元門。一想到自己過去犯下種種錯誤，甚至重傷胡大師與美沙子，最後是伽瑪當師父自願犧牲，來結束這場戰爭。

忍者們並不是唯一能操縱元素之力的人

這一季的第一集揭曉，世界上擁有元素之力的還有很多人。其他包括有「重力」、「影子」、「聲音」、「金屬」、「煙霧」、「毒」......
連同五名忍者在內，另外新登場的元素大師還有 11 位。

冰忍轉變成「鈦忍者」

在上一季，冰忍為了擊敗 Overlord 而壯烈犧牲，但在最後一集的最後，有暗示他的意識尚存在於電腦網路中，並以工廠開始打造全新機器人身體來做結尾。但復活的冰忍，卻要到這一季才真正公布出來。使用全新身體的冰忍，身上全都是直接以鈦金屬製成，變成名副其實的「鈦忍者」(Titanium Ninja)，而不像上一季中，還有露出黃皮膚的外殼。
打造全新身體的冰忍，一開始並沒有前面身為忍者的記憶，甚至對於自己竟握有某種冰的元素能力而感到懼怕。但最後還是發覺了自己，重新掌握住冰的能力。
另外，在上一季中，冰忍曾遇到的女機器人：P.I.X.A.L.，也跟著冰忍一起被帶到島上。只是在被帶來的過程中，P.I.X.A.L. 的身體毀壞，只留下存在於硬碟中的意識。在冰忍掙脫鐵鍊後，就把硬碟中的資料灌入體內，讓 P.I.X.A.L. 從此活在冰忍意識中。

忍者們與元素大師，都能召喚自己的元素之龍

在這一季中，忍者們沒有帥氣載具可以坐，在第一二季中乘坐的龍也早就飛走了，但在這一季中，當陳大師把所有人留在島上，獨自回到 Ninjago City 的時候，為了追趕上對方，大夥忽然激發出自己的元素之力，召喚出屬於自己的元素之龍。每一種能力都能召喚出一隻專屬自己的龍出來。

赤蘭與赤地兄妹的父母的故事

赤地與赤蘭的父母，一直沒有被碰及到，就連在前導季的一開始，也只是講述這對兄妹經營著父母留下來的打鐵舖而已。
在這一季伽瑪當的回憶中，赤地的父母也是能操縱元素之力的能力者。父親能操縱「火」元素，就如赤地一樣；而母親則是能操縱目前為止還沒看過的「水」元素。當年當人蛇戰爭開打時，他們的父母就是重要戰力之一，一起對抗陳大師與蛇族。

人蛇大戰，伽瑪當的過去

在前面幾季中，我們知道伽瑪當因為巨蛇魔王的毒液，性情大變，變成「伽瑪當君王」，失去理智的他犯下非常多錯誤，最後在勞埃德的黃金之力下，讓伽瑪當得以洗白，變回正常人，並成為一名與胡大師有所不同的睿智師父。
在伽瑪當被毒液影響心智後，他曾前往陳大師的道場，拜師學藝，當時就有遇到同是學徒的克勞斯。當時人蛇大戰剛爆發，但雙方寫下休戰條例，陳大師知道這消息時，表示休戰的話就不好玩了。不久之後，人蛇大戰又再度爆發，消息指出是蛇族先違反條例，所以當時的元素大師們又不得不集結起來，對付蛇族。
已經受到毒液的影響的伽瑪當，本來對戰爭沒有太大興趣。這時陳大師就故意提到「美沙子」，是伽瑪當與弟弟胡一起追求的女子，陳大師這時拿起一封信，是胡大師寫給美沙子的情書，用字遣詞非常優美，肯定會讓美沙子選擇胡。陳大師故意拿給伽瑪當看，並說「你不怕她被你弟弟搶走嗎？」害怕失去美沙子的伽瑪當，就拿起墨水，把胡的署名改成自己，再寄給美沙子。而自己也回去幫助其他人，打擊蛇族大軍。
後來大家發現，那場休戰其實是陳大師打破的，他在人類與蛇族兩邊挑撥離間，重新點燃這場戰爭。最後在蛇笛影響之下，把每一個蛇族都關進古墓 (然後在第一季被勞埃德打開，重新放出來)。其中，紫蛇族的將軍是最有野心跟戰力，他們則被流放到讓人生不如死的「詛咒魔域」。而陳大師與其弟子克勞斯，則被流放到離島上，也就是他今天用來舉辦錦標賽的地點。

主線劇情

在第四季的事件結束後，當一切都平穩下來，胡大師準備要展開他的「退休」生活，在郊區開一間茶店，美沙子、赤蘭，以及其他忍者們都幫忙準備店鋪。但在這時，市內的博物館傳出有竊賊闖入，勞埃德隻身一人前往調查，卻遇到一隻「鬼」，這隻鬼可以附身並操控任何人甚至物。
在此同時，正當其他忍者們在市內，利用自己的元素能力來宣傳胡大師的茶店時，忽然之間能力全數消失。感到奇異的忍者們，趕緊回到茶店，想要從胡大師身上搞清楚究竟發生什麼事情，看到勞埃德也回到店內，但表情看起來相當怪異，並且一開口就說要搶走胡大師手上的竹拐杖。一看到怪異的勞埃德，胡大師馬上就搞清楚發生什麼事：勞埃德已經被附身了，而附身他的是一隻從 詛咒魔域 ( Cursed Realm )，也就是上一季中，伽瑪當被送往的地方，逃出來的鬼，而這個鬼正是胡大師第一個弟子：能操縱「風」的元素大師「魔洛」(Morro)。
在經過一陣打鬥後，使命號墜毀森林中，胡大師也趕緊把藏有秘密訊息的枴杖丟去，藉此引走魔洛，胡大師才講出過去的事情。原來赤地等人並不是胡大師的第一個弟子們。當年，當伽瑪當離去，拜師陳大師後，一日，胡大師在山上的道場，遇到了一個窮困的孩子，因此被收留下來。他發現這個孩子天生具有操縱「風」的能力，因此認定他或許就是預言中的「綠忍者」，所以就早早跟魔洛講這件事。
當胡大師用四把神器來判斷魔洛時，才發現神器沒有反應：魔洛並不是傳說中的綠忍者。但魔洛早已把胡大師的話當真，接著就為了成為綠忍者，要求更多訓練，甚至到了一種狂熱、過頭的地步。接著，魔洛就表示，他一定要找到初代旋風術大師，也就是胡大師的父親，被埋葬的墳墓，就離開道場。但即使是胡大師也不曉得他父親的墓在哪，因為他父親並沒有留下任何訊息。
回到現在，胡大師才意識到，原來初代旋風術大師所埋葬之地，這個訊息一直藏在他每天不離身的拐杖上。雖然為了引走魔洛，已經把枴杖丟掉，但他已從上頭解讀出三個圖樣訊息。第一個圖樣，就是要忍者們學習一項已失傳的武術：由已死去多年的「陽大師」(Sensei Yang)創造，能夠飛上天空的「飛天術」(Airjitzu)。忍者們必須搶在魔洛找到飛天術卷軸前，先搶到手。
原先飛天術卷軸是存放在楊大師的廟宇中，但這時，忍者們得知，卷軸早在數日前就遭到一名竊賊偷取。仔細觀看監視器，忍者們馬上就認出，偷竊者竟然是羅南 (Ronin)。忍者們馬上就前往羅南的住處，試圖取得飛天術卷軸。
就在忍者前往目的地時，胡大師找了赤蘭說話，提起了赤蘭與赤地的父母。他表示，他們兄妹都知道他們的父親，是能操縱火的元素大師，但他們不曉得的是，他們的母親，也是操作水的元素大師。就如同火的能力遺傳給了赤地，水的能力也遺傳給赤蘭。接下來，時間到了，該是讓赤蘭卸下武士身分，成為「忍者」。
當忍者們來到羅南的住處時，發現魔洛也帶著他召喚出來的鬼弓箭手現身，經過打鬥之後，魔洛順利取得卷軸，馬上習得失傳已久的「飛天術」。看到這樣的狀況，忍者們感到失落，但還是從羅南口中得知：還是有機會學到飛天術的，只要前往楊大師生前住的「鬧鬼寺」，就有機會習得飛天術。
為了習得飛天術，忍者們在夜晚潛入鬧鬼寺，但鬧鬼寺有一個傳說：如果無法在日出前離開寺院，就會永生變成鬼魂。忍者們在寺內尋找，最終遇到楊大師的鬼魂，而且還遭遇楊大師的各種試煉，最終還是得到了飛天術的捲軸。但當他們要趕在日出前逃出寺院時，阿剛卻沒能在時間內逃出，變成了一隻鬼。
雖然阿剛也變成了一隻鬼，但忍者們還是習得了飛天術。他們下一個任務，就是取得放在「雲中王國」的寶物：「聖殿之劍 Sword of Sanctuary」，是一把能預知敵人下一步的神器。而為了登上雲中王國，忍者們來到 Ninjago 境內的最高山峰，在山頂上使用旋風術，利用一塊名為「盲人之眼」的風暴加速，進入雲中王國。雖然在路途中曾遭遇試圖走同樣路徑的魔洛，展開戰鬥，但忍者們還是順利抵達雲中王國，把魔洛留在地表上。
忍者們來到雲中王國，這是建立在雲上的世界，他們發現一個名叫 Fenwick 的男子早已在門口等待他們。Fenwick 引領忍者去尋找「聖殿之劍」，在過程中 Fenwick 解釋，這個宇宙分為 16 個「國度」 (Realm)，與 Ninjago 平行。在參觀雲中王國的同時，忍者們發現魔洛也已來到王國，並與忍者們展開戰鬥。在戰鬥的過程中，魔洛一方率先拿下了聖殿之劍，並回到地表上，忍者們緊追在後，試圖把劍拿回來。好在這時勞埃德試圖奪回身體，暫時擋掉魔洛的主導權，這才讓赤地最終把聖殿之劍搶回到手上。
回到地表上，忍者們重新檢視自己手上的線索。他們已經學會了「飛空術」，現在也有了神器「聖殿之劍」，接著就是要找到初代旋風術大師的墓地。正當忍者們在思索最後一到線索，卻發現羅南把聖殿之劍給偷走。原來羅南身上有著把柄，他不得不背叛忍者們，最後在調虎離山之計下，把劍帶往 Stiix，交到魔洛手上。當魔洛利用聖殿之劍的逆轉時空之力，把卷軸上的紀錄逆轉之後，終於鎖定了初代旋風術大師的墓地確切下落，接著再附身到魔洛身上，把忍者們騙往錯誤的地方。
雖然被錯誤的訊息給誤導，忍者們最終還是藉由羅南的 R.E.X. 飛行器，逃出陷阱。這時忍者們收到羅南本尊的道歉訊息，並得知了墓地的真確位置。這才發現，墓地之所以一直沒被找到，是因為並不在本島上，而是在深海中！
當忍者們終於進入到深海底的墓地入口，他們必須與時間競賽，因為魔洛早搶先他們一步，在墓中探索。由於守護者初代旋風術大師的遺體，以及最終的神器「國度水晶 Realm Crystal」，整個墓由三大考驗守護者。忍者們順利解開前兩大考驗，來到最後一個考驗：一座冰凍的迷宮，並在此地遭遇魔洛。經過一翻交戰後，忍者們將魔洛困在陷阱中，並解開最後一個考驗，最終找到了初代旋風術大師的遺體。
忍者們來到初代旋風術大師的遺骸旁，他不但是忍術「旋風術」的創始者，整個 Ninjago 這個世界都是由他創造出來，更不用說他就是胡大師與伽瑪當師父的父親。這時，忍者們拿起了大師手中守護著的最後一樣神器，這是魔洛一直在尋找的「國度水晶」，這顆水晶是連接先前提到的 16 個國度的橋樑，拿到這只水晶的人，可以自由前往任何地方。
看到忍者們已經搶先拿下水晶，魔洛威脅，如果還想看到勞埃德，就拿水晶來交換。雙方再次交手，雖然最後成功讓魔洛離開勞埃德身體，但水晶卻也被魔洛給帶走。
原來魔洛的目的，是將詛咒魔域的統治者：魔魂者 (The Preeminent) 釋放出來，由她來吞噬掉一切，並一口氣詛咒十六個國度。魔魂者的外型非常噁爛，是一顆場有觸鬚的眼球，由於已經和詛咒魔域連為一體，所以她自身就是整個詛咒魔域，還會從中不斷吐出鬼魂。
當然，雖然巨大的魔魂者非常難對付，但她自己本身就是鬼魂，若能將她打入海中，肯定能從此將她消滅掉。但這計畫非常難執行，除了模魂者體積過大外，忍者們也在各地與鬼魂還有魔洛交戰。
所幸就在最後，赤蘭終於找到了她體內的潛能，藉由自己的水之力，製造出巨大的海浪，消滅整個魔魂者，也將魔洛從此抹除。但隨著魔魂者的消滅，整個詛咒魔域也因此毀滅殆盡。

魔洛是胡大師的第一個弟子！

當魔洛出現，並附身在勞埃德身上後，胡大師這才坦言，忍者們並不是胡大師的第一批弟子。當年，當胡大師還年輕時，曾經在廟宇外面遇到一個在外流浪的孩子，也就是魔洛，胡大師將他留在道場，進行訓練。
當時預言中的「綠忍者」尚未出現，年輕的胡大師也尚缺乏往後的智慧，看到身手矯健的魔洛，學習速度很快，展現出相當的天分時，胡大師也一直跟他講「也許你就是預言中的綠忍者」。結果當把四把黃金神器，拿到魔洛身旁時，發現毫無反應，這才發覺魔洛並不是預言中的綠忍者。但因為胡大師一直在講這件事，讓魔洛一直相信自己就是那被選中的人，最後失望至極，憤怒之下，離開了道場。
當忍者們在尋找初代旋風術大師遺骸的下落時，曾把忍者們誤導到錯誤地點，這個地點就是 Caves of Despair，也就是前導季中，藏著第一把黃金神器「地裂鐮」的礦場。忍者們在其中尋找的過程中，就找到了魔洛的遺體。原來當年離開胡大師後，魔洛試圖靠自己找到初代旋風術大師的墓地，就在這座礦場中尋找，最後死在裡面。

赤蘭是第六個忍者，掌握「水」的元素之力

從第一季起，赤蘭就一直展現出希望能成為忍者們的助力的企圖心，因此自己開發出了「武士X」機甲，甚至還擁有一個藏在沙漠中的地下基地，裏頭放置許多載具。儘管並沒有與忍者們一起受訓，但赤蘭也有相當程度的武打實力，也能與忍者們一起飛簷走壁。在前一季中，劇情揭曉了赤蘭與赤地的父母，各是掌握有「火」與「水」元素之力的元素大師，這些能力是能遺傳到孩子身上，因此在這季中，揭曉了赤蘭實際上也有「水」的元素之力。
在這一季中，當忍者們在外頭冒險時，赤蘭也開始接受訓練，練習如何去控制水。個性急躁的她，不論怎麼練習都無法取得一點進展，對自己非常失望。但最終在羅南的一番話之下，有所頓悟，開啟控制水的能力，甚至在最後成為擊敗幽靈大軍的關鍵武器，正式穿上忍者服，成為忍者們的一員。

賞金獵人：羅南登場

除了魔洛之外，另一個在這一季中全新登場的，就是「羅南」(Ronin) 這個角色。身為顧傭兵的他，唯一聽命的只有「金錢」：誰願意付他前，他就幫誰做事。原來當初冰忍復活，卻落入陳大師手中，就是因為羅南的關係。
總之，雖然他經常與忍者們一起搶寶物，甚至還背叛過忍者，但他實際上也算是半好人，會偷走寶物也是身不由己 的，因為羅南有欠債於魔洛一名幽靈手下。

阿剛變成鬼忍者

為了把卷軸帶走，阿剛是唯一一個沒能趕在天亮前離開鬼廟的忍者，讓他變成幽靈的形式。對於這件事，讓阿剛陷入無比低潮，他沒辦法感覺到冷熱，不會肚子餓，更重要的是：只要一不小心碰到水，他就從此消失在這世界上了。雖然變成鬼有很多不方便，但他也得以在戰鬥中，運用身為鬼的優勢，突破許多困境。

十六個國度 (Sixteen Realms)

另一個在這一季中，帶來的超重大劇情重點，就是正式介紹了「十六個國度」，簡單來說就是「十六個平行宇宙」。
當忍者們來到雲中王國 (Cloud Kingdom)時，裡面的人告知說原來有十六個國度，彼此平行。這十六個國度，包括有前導季中，伽瑪當君王與骷髏大軍所在的「地下世界」(Underworld)；第一季中，伽瑪當長出四條手臂的黑暗世界 Realm of Madness；在上一季中，由克勞斯開啟的「被遺忘的國度」(The Departed Realm)；在上一季中，伽瑪當師父犧牲掉自己後，所進入的「詛咒魔域」(The Cursed Realm)。另外，在這邊看到的「雲中國度」，實際上也是十六個國度之一。
雖然進入每個國度的方法不同 (例如透過火焰神廟，可通往地下世界；或是藉由克勞斯的咒語，可前往詛咒魔域)，但這季中，被守護在初代旋風術大師之墓的「國度水晶」，卻可以任意開通任何前往任何國度的通道。

伽瑪當師父與勞埃德的最後一面

在前一季中，自願犧牲，來開啟詛咒魔域的伽瑪當師父，被困在魔魂者的體內。雖然說詛咒魔域本身是一個平行宇宙，但已與魔魂者融為一體。當與魔魂者交戰時，勞埃德曾進入到魔魂者體內，找到了被囚禁的伽瑪當師父，但不管怎麼拉扯，都無法弄斷伽瑪當傷上的鎖鏈；當稍後魔魂者被消滅，也將讓伽瑪當從此死去。
最後，勞埃德僅繼承了伽瑪當身上的道服，離開魔魂者身體。當魔魂者被赤蘭召喚的大浪給吞噬，最終被消滅時，也讓伽瑪當真正死去。

主線劇情

在結束了上一次的冒險後，忍者們瞬間成為忍者城的大英雄，讓他們所到之處無不被熱情的粉絲與記者包圍。德瑞也成為他們的經紀人，還不斷協助記者們追蹤忍者們的畫面。在此同時，忍者們發現，有一個他們再熟悉不過的身影，又出現在忍者城中。
原來是陳大師的手下：克勞斯 (Clouse)，原先被囚禁在詛咒魔域中的他，因為詛咒魔域的母體被摧毀，再次逃到忍者城中，他找到了一隻關有一隻精靈 (Djing) 的神燈，釋放出了裡頭的精靈「納達可汗」(Nadakhan)。這隻精靈具有實現別人願望的魔力，本來克勞斯打算利用這個願望的力量，來向忍者們復仇，卻反被納達可汗用話術來扭曲願望，最終反把克勞斯關在神燈中。
原來被釋放出來的納達可汗，在過往曾率領一支天空海盜在天底下作亂，但因為遭遇某些敵人，讓他反被關在神燈中，他的水手們也被傳送到其他領域中。他想要奪得忍者們先前找到的「國度水晶」(Realm Crystal)，重新組織他的天空海盜，重新征服這個世界。稍後，他又分別遇到吳大師與美沙子，並把這兩人一起關進神燈中，接著就是要對付會阻礙他的忍者們。
在此同時，雖然忍者們本被當英雄對待，但各地有人冒他們名義來搗亂，讓市民以為忍者們開始當壞人，而變成全民公敵。原來這是納達可汗的計畫。忍者們四處逃竄，卻被賞金獵人羅南 (Ronin) 一一抓起，最後全部忍者們被關進監獄，還被關在特殊的牢房，以免他們試圖用元素之力逃獄 。
就是在監獄中，他們突然得知，被復活的索托船長 (Captain Soto)，正巧就是當年把納達可汗關進神燈中的人。原來在數百年前，當索托船長還是使命號船長時，曾在海上與納達可汗和其天空海盜們交戰。面對具有強大魔力的納達可汗，只有一種方法，用一種「虎寡婦」(Tiger Widow) 的毒蜘蛛身上的致命劇毒，讓納達可汗陷入昏迷狀態，才能再用神燈把他關回去。索托本拒絕告訴忍者們去哪找這種毒蜘蛛，最後在忍者們逃獄之後，順便把索托給帶出去，才得知：只有一座島嶼找得道虎寡婦，但那座島嶼並沒有被記錄在任何地圖中，虎寡婦的所在地存在於納達可汗的海盜船上。
　當忍者們被關入監獄的期間，納達可汗偷竊到被藏起來的國度水晶，把他的天空海盜們全部釋放回來，並找回當年他的海盜船「闇黑堡壘號」(Misfortune's Keep)。全員團聚後，納達可汗決定利用領域水晶，回到他真正的老家：另一個領域「精靈國」(Djinjago) 去看看。一開通傳送門後，卻發現精靈國正在崩解中，納達可汗看到他的父親，同時是精靈國的統治者「精靈王」(Djing King)，坐在王座上。
原來十六個領域中，會兩兩連結在一起，成為姊妹國度，這姊妹國度的其中一個崩解時，另一個也會跟著崩解，而精靈國的姊妹國度正巧就是忍者們在前一季破壞掉的「詛咒魔域」(Cursed Realm)。精靈王拿了一把「靈魂之劍」給納達可汗，這把魔劍能禁錮任何生靈的靈魂，他要納達可汗回去忍者國，向忍者們報這筆仇，這就點燃了納達可汗心中的怒火。
回到忍者國後，納達可汗與天空海盜們要執行他們的計畫：他們將修復闇黑堡壘號，重新回到天空，向忍者城進攻，並利用這把魔刀的魔力，讓地上的土地飄向空中，他要在這邊重建精靈王國。
逃獄後，雖然仍在躲藏中，但看到天空海盜又飛到天空，攻擊忍者城，忍者們還是前往阻止對方，並順便潛到船上，偷走藏有虎寡婦島嶼所在地的資訊。雖然最後趕跑了天空海盜，但在攻擊行動中，納達可汗藉機接近了赤地，給他許願的機會，並利用話術來扭曲赤地的意思，把他整得很慘，最終把赤地的靈魂禁錮在靈魂之刀中。
發覺赤地已被帶走後，忍者們整理整理，按照拿到的資訊，前往外海，準備去取得虎寡婦的毒液，但在海上遭遇風暴。在風暴中，納達可汗又潛到海上，隻身與冰忍對質。已經知道對方會用話術來扭曲願望的冰忍，本來準備用機器人的邏輯迴路來防範話術，卻又不幸被扭曲意思，不但造成 P.I.X.A.L. 被移除掉，最後也不幸中招，成為第二個被囚禁在納達可汗刀中的忍者。最後船隻被風暴破壞，忍者們落入海中，不過還是飄到島上。
剩下的忍者們在島上冒險，也終於順利從虎寡婦身上取得毒液，準備用來對付納達可汗。但在這時候，納達可汗等人也來到島上，把阿光給綁走，留下赤蘭、阿剛與勞埃德在島上。
會特別綁走阿光是因為，在與忍者交手過程中，納達可汗知道了赤蘭這個人，發覺赤蘭與他過去的愛人：狄拉 (Dilara) 長得非常神似，懷疑赤蘭就是狄拉。原來，納達可汗有個計畫，他雖然能幫其他人實現任何願望，卻無法幫自己實現願望。但只要與愛人結婚，讓他順利成為下一任的精靈王，他就能從愛人身上得到「無限願望」，掌握無止盡的力量。
在測探忍者的時候，納達可汗得知阿光深愛著赤蘭，想從阿光這邊來接近赤蘭。阿光表示，赤蘭就是赤蘭，跟那個狄拉沒有任何關係，而且他質疑納達可汗只是著迷於那個狄拉能帶來的無限願望，根本不愛這個愛人。
當阿光被囚禁在船上時，試圖寫封訊息，告知他的夥伴們來救援他。在過程中，他也一度與納達可汗手下中的神槍手「火槍大副」(Flintlocke)：談到話，並告訴神槍手要小心納達可汗這個人，他是一個不值得信任的船長。雖然不把阿光的話當一回事，但也確實讓他想到，可以稍微再觀察一下納達可汗這個人。
底下被困在島上的忍者們，正巧遇到出海救援的警察局長，他們先前被當成全民公敵的嫌疑已被釐清，現在局長們將全力與忍者們聯手。在這過程中，忍者們決定要擬定策略，反過來運用願望來對付天空海盜們。
果然，在前去救援阿光的時候，忍者們也不斷利用自己的三個願望，化解掉一些難關，但造成的結果只是一團亂，最後連勞埃德與阿剛都被關入靈魂之劍，只剩下赤蘭和阿光逃離闇黑堡壘號。
現在只剩赤蘭跟阿光，兩人帶著旅者之茶與剩下一管毒液，逃到朱里安博士生前居住的燈塔，擬定最後的計畫。雖然在這邊遇到了冰忍的弟弟：回音冰忍 (Echo Zane)，在他的幫忙下，試圖抵擋侵入進來的天空海盜們。但在勢不可擋的情況下，赤蘭犧牲自己，遭到俘虜，而阿光則通過旅者之茶開啟的傳送門，逃到遠方。
如今只有手上握有虎寡婦毒液的阿光，是忍者們的最後希望，他重新集結了自己的隊友，包括羅南、索托船長、德瑞、回音冰忍，甚至找到過去在第四季登場的凱樂 (Skylor)。雖然先前被浪費掉兩個，但阿光目前仍有一個願望可以許，他已經想好怎麼使用了：先用毒液造成納達可汗行動遲緩，再趕緊許下「希望納達可汗只是個凡人」，讓他無法完成無限願望的計畫。計畫擬定好後，一行人重新回到天空海盜的基地。
在這時，納達可汗也正在準備與赤蘭的婚禮，雖然赤蘭與他的愛人狄拉是兩個不同的人，但納達可汗也藉由威脅手下許願，把逝去的狄拉的靈魂帶回來，附身在赤蘭身上，完成婚禮，進而得到無限願望。當然，阿光與一行人出面制止下，與天空海盜對抗，更自行被吸進靈魂之劍中，把吳大師、美沙子與其他夥伴們，全部帶回到世界上，眾人一起對付納達可汗。
由於察覺到納達可汗準備用無限願望重新組織自己的新大軍，火槍大副發覺納達可汗真如阿光所說，是個不能信任的船長，所以帶領其他天空海盜水手們，一起轉過來對付納達可汗。拿到虎寡婦毒液的火槍大副，瞄準納達可汗，卻誤擊了赤蘭。
看到毒液被灌輸到赤蘭身上，阿光的心都涼了，如果他許願就赤蘭，就會讓納達可汗逃脫；如果許願讓納達可汗變凡人，就將永遠失去赤蘭。面對這一連串的遭遇，面對自顧自的做決定，這時阿光順口說出「我真希望那隻神燈沒有被找到過」。
就這麼一句發自內心的願望，被納達可汗聽到，而願望之力就將時光往前倒回，一路回到起點，回到當時忍者們還在躲避記者與粉絲的時間點，回到克勞斯還在尋找神燈的時候。當克勞斯找到神燈，準備將之撿起來，就遭到民眾追趕，讓神燈被留在垃圾堆中，從此遺失下去。
雖然一切重新來過，但阿光與赤蘭卻保有一切的記憶。看到事情全部落幕，以及前面的冒險，兩人在鏡頭前熱吻起來，反倒是其他忍者們全都一頭霧水，不知道發生什麼事。

納達可汗

天空海盜船長納達可汗是一隻有四條手臂，可以飛行的精靈，是精靈王之子，因為一些原因，在數百年前被流放到忍者國當海盜。
納達可汗本身是精靈，可以替任何人實現三個願望，但他實現願望全都是不懷好意，經常藉由話術來扭曲對方的意思，所以許願時真的要想清楚自己要說什麼。雖然可以幫任何人，卻無法幫自己實現願望，但只要藉由與自己的愛人「狄拉」結婚，成為新一任精靈王，納達可汗就可以從狄拉身上取得「無限願望」。
除了納達可汗外，基本上過往忍者們遭遇到的對手，其手下都是雜魚兵，這回納達可汗手下也是絕大多數都很雜魚，但卻個個都很有個人特色，其中最不雜魚的肯定就是留著八字鬍，基本上是從來不失手的狙擊手：火槍大副 (Flintlocke)，雖然中間他曾因為被許願的關係，成為怎麼樣都打不中的狙擊手。

「精靈之劍」、「靈魂之劍」

忍者故事中，總是會設計一些不同的神器出來。這一季登場的是拿在精靈手上的「精靈之劍」(Djing Blade)，或稱「靈魂之劍」(Sword of Souls)，這是一把能把任何人的靈魂，永遠禁錮在劍柄上的水晶中的武器。在故事中，原本由上一任的精靈王持有，但在精靈國崩解時，把這把刀交到納達可汗手上，成為他用來完成計畫的武器。

十六個國度是兩兩連結

在前一季中增加了「十六個國度」的設定，也就是除了忍者們存在的這個世界外，還有另外十六個國度與之平行，基本上就很類似「平行宇宙」的概念，其中包含到一些忍者們先前歷險過的地區。
在這一季中，則又對這部分再增加一些描述，當看到精靈國正在崩解時，精靈王表示，十六個國度是兩兩連結成「姊妹國度」，當其中一個崩解掉，另一個也會跟著崩解。而精靈國的姊妹國度，正就是前一季中，被赤蘭用大海消滅的詛咒魔域。而這也成為納達可汗誓言要向忍者們復仇的動機。

這一季的真正主角是心急的阿光

雖然說忍者們是一起行動，但這一季的真正主角則是其中的雷忍者阿光，從最初登場起就一直迷戀赤蘭的他，一直很希望能得到赤蘭芳心。在前一季《Possessions》中，忍者們一度進入到初代旋風術大師的古墓，並藉由裡頭神秘的冰倒影，見到自己的未來。其中阿光就看到自己的未來是與赤蘭在一起，基於不確定的原因，自己臉上帶著獨眼面罩。
在這一季中，就是講述阿光過於急躁，想趕快實現那倒影。因此當他看到天空海盜鬧著他玩，丟給他一隻獨眼龍眼罩，他也急著把它戴起來。然後在冒險過程中，又不斷接近赤蘭，反而造成赤蘭非常不自在。
劇中，阿光曾經在喃喃自語中，講出「真希望我不是出生在那垃圾場家庭的小孩，這樣我就能買給赤蘭任何她想要的物品」。結果被納達可汗扭曲意思，讓他得知原來他那經營回收場的父母只是收養他，他實際上是一個剛過世的明星演員之子，繼承父親手上的豪宅與財富。從這邊就知道阿光個應太急躁，講話常常不經大腦。然而，養子這部分，應該也在最後被倒轉回去就是了。

赤蘭的心聲

面對阿光的追求，赤蘭表達心聲，她表示，阿光的追求讓她很不自在。雖然這兩人在第一二季曾有過曖昧關係，互相吸引，但中間曾因為阿剛的介入，讓赤蘭變得迷惘。
赤蘭坦言，長久以來，她一直被別人決定命運，從來沒有機會活出自己的路，而她不喜歡這感覺。這讓阿光感到很內疚，因為他一直相信當初看到的倒影，相信會與赤蘭成眷屬，但是否他也變成另一個決定赤蘭命運的人？或許阿光真的表現地太心急了。

陽大師的廟宇卻還飄在空中......預告下一次故事？

在劇中，為了重新建造精靈國，納達可汗將忍者城的土地都傳送到空中，飄浮在上頭，當時擷取的土地，就有包含到楊大師 (Master Yang) 的鬼屋 / 廟宇。是的，就是在前一季中，忍者們習得飛天術 (Airjitzu)，還害阿剛變成鬼魂的地方，連陽大師那一塊地都被送到空中去。
但是呢，當一切被阿光的最後一個願望逆轉後，本來所有飄在天空的土地都回到地面上，唯獨陽大師的廟宇仍在空中飄。整季最後的結尾，就是看陽大師奸詐的笑容，看來預告著：他就是下一次忍者們將遭遇的對手。

Ninjago: The Realm of Shadows(a play)

克洛斯以某種方式逃脫了被詛咒的領域，併計劃通過使用年輕的陰陽龍土匪將忍者投入黑暗。克洛斯還正在集合一個暗影小子的力量來幫助他奪取強盜。

《黑暗之島三部曲》Dark island trilogy(a novel)

故事是設定在 2016 的電視動畫系列：Skybound 之後，屬於外傳故事，結合了第六季動畫中登場的角色，與第二季登場的黑暗之島。故事描述會使用黑魔法的克勞斯 (Clouse) 帶領沒有頭子的天空海盜們，在黑暗之島中挖掘暗物質，而忍者們與賞金獵人羅南 (Ronin)，就一同前往島上，一探究竟。

萬聖節特別篇「亡靈紀念日」「Day of the departed」(1 集)

緬懷已逝之人、珍惜健在之人的開場劇情，說到萬聖節，那麼主角當然是鬼，本次主要反派由身為幽靈的楊大師擔綱，藉著僅數千年一見的陰陽月蝕，楊大師策劃計謀讓眾人遺忘阿剛、將已逝的反派們召回現世對付忍者們、更企圖讓自己重返世間，只要穿過由陰陽月蝕之魔力開啟的「歸來孔」，鬼魂就能變回人被暫時召喚回現世附身在博物館「反派大廳」雕像上的反派幽靈們。
「亡靈之境」（The Departed Realm），看來是詛咒之境的幽靈「死」後會去的地方。忍者國的神秘面紗又揭開了一道。
反派們的台配又洗牌了，眾反派各自挑了要算帳的對象，魔洛的目標理所當然是胡大師(一副準備要惡作劇的架勢)。但事情並不是你我想像的那樣，魔洛先前只是裝作要復仇，事實上是前來幫助忍者們的，被其他忍者當作敵人，而且他幫完忙之後就回博物館乖乖站好。
眾反派一一被忍者打敗了。這次大家終於拿了不同的武器。
彼拉又黑了，雖然上次暫時跟你們合作過，如今還是要找綠忍者尋仇
楊大師倒是白了，囚禁幽靈弟子們只因害怕被世人遺忘，阿剛點醒他已有龍捲風忍術傳世，楊大師良心發現，幫助阿剛抵達歸來孔，但自己仍是鬼魂
也就是說，就在我已經放棄阿剛不會永遠保持鬼魂之身的想法之後，他還是變回人類了，頓時不確定該不該高興？
楊大師的寺廟成了亡靈節聚會講鬼故事的好去處

第七季「時光之力」「The hands of time」(10 集)

錯咗？突竟胡大師估錯咗乜嘢搞到咁大件事？！
旋風忍者為拯救世界再次身陷險境。而且胡大師睇嚟面臨重大考驗添！新一季旋風忍者要應付咩敵人呢？

主線劇情

旋風忍者來到第七季，這季的標題為 "Hands of Time"，如你所見，這回遭遇到的對手，令胡大師相當恐懼。能控制時間流動，就等於是能控制任何事物。
除此之外，這一季將會放重點在赤地與赤蘭這對兄妹的感情上，因此你會發現外盒封面上，就是兩位忍者的大頭縮圖。
這回忍者們將要面對到全新的對手：意圖控制時間流動的蛇族戰士：Vermillion，跟著這季一起出現的，就是全新的武器: 逆天、度日、止水、寸陰，四把能控制時間流動的刀刃。以零件來說，都是手刀武器，但塗上不同顏色來做區別。
第七季劇情，講述一對曾是掌握「時間之力」的雙胞胎元素大師，跳脫時間漩渦，來到現代與忍者們還有吳大師打對臺。他們的最終目標，是要完成一台自由穿梭時空的「時光機器」，並藉由手上的時間之力，征服整個忍者城。
　　為了達到這目標，時間雙胞胎以當年曾大鬧忍者城的「吞食巨蟒」(The Great Devourer) 的蛇卵為對象，研發出一種新的突變蛇，這種蛇是一條一條的小蛇，卻能像細胞一樣，聚集在一起，變成強壯的個體。有時可以長成一個人的大小，有時甚至更大。時間雙胞胎，就試圖以這些小蛇為武力，再加上時光機器，完成他們的大業。
　　除了新的對手外，第七季的劇情還有另一個很大的特點，就是終於要認真跟觀眾，好好介紹火忍者赤地 (Kai)，與水忍者 赤蘭 (Nya) 的父母。是的，基本上這對兄妹是最早跟觀眾們見面的忍者，身世卻一直是最神秘。在前面六年的劇情發展中，漸漸得知他們父母各是火與水的元素大師，經營一間打鐵舖，還參戰過人蛇戰爭，但他們後來究竟去了哪？為什麼留下赤地與赤蘭就不見？直到這季才終於交代。

LEGO Ninjago: The Book of Spinjitzu(a book)

LEGO®Ninjago：Spinjitzu之書包含了吳大師在Ninjago奇觀中的智慧課程，讓讀者有機會掌握Spinjitzu並釋放這種神秘哲學的秘密。吳師傅記錄了他的父親，第一Spinjitzu大師的教訓，他教他為一個男孩，並在他的一生中添加了他們。
現在，吳師傅分享了他所學的全部內容，希望那些有潛力的人將成為忍者的偉大冠軍，並繼續練習Spinjitzu的藝術。

第八季「伽瑪當之子」「Sons of Garmadon」(10 集)

當旋風忍者繼續尋找胡大師下落時，旋風忍者又出現一群自詡為「伽瑪當之子」邪惡壞蛋。這群壞蛋聯結隊，四處駕駛戰車，到處搜查三個面具下落。
作為旋風忍者一份子，學習全新旋風攻擊模式，阻擋他們四處破壞及找出背後的目的！

主線劇情

這次的動畫將設定在吳大師落入時間漩渦之後一年，忍者們都略有成長，這回他們將遭遇一幫打著已逝之「伽瑪當」的名號，騎著重機在忍者城中四處搗蛋的重機幫派。
在新一季中，忍者們將遭遇一批自稱是「伽瑪當之子」的重機幫派。這些幫派成員是過去伽瑪當君王的狂熱信徒，試圖藉由竊取擁有魔力的「鬼面」(Oni Masks) 面具，利用「復活神廟」的法力，將伽瑪當君王復活起來。
第八季的劇情，講述一支名為「伽瑪當之子」的重機幫派，出沒在忍者城街頭上，在下水道或高速公路上狂奔。
第1集: 一個不知名的秘密組織，正逐步威脅皇室。旋風忍者被急召回皇室，除必須保護皇室及公主等各成員外，還必須保護一個神秘面具。
第2集: 皇室遭受到伽瑪當之子組織襲擊後，旋風忍者發現神秘面具被 伽瑪當之子偷走。旋風忍者邀請晴美公主加入他們的忍者家庭。
第3集: 晴美公主已慢慢適應旋風忍者的生活。勞埃德和阿光繼續尋找關於三個面具的秘密，而阿剛及冰忍就加入伽瑪當之子的組織。
第4集: 為了成功滲入伽瑪當之子組織，冰忍（又名美洲豹蛇）參加了一場致命機車街頭比賽。
第5集: 冰忍被襲後一直處於昏迷，易先生迫使各旋風忍者逃到命運賞金號。忍者們發現在冰忍的傳輸系統中，有可能會顯示安靜的隱藏位置。
第6集: 當勞埃德和晴美尋找第三個面具的下落時，其他旋風忍者亦試圖修復命運賞金號，並發現了驚人的事情。
第7集: 當勞埃德和晴美在復活神殿找尋最後一個面具時，旋風忍者不小心成為人質，而晴美公主亦揭露她的背後目的。
第8集: 旋風忍者呼籲旋風忍者城的警察，合力協助勞埃德阻止晴美公主的計劃 - 喚醒沉睡中的伽瑪當。
第9集: 正當旋風忍者以為他們又再一次拯救了旋風忍者城時，伽瑪當又再回來了！他釋放了晴美公主，而她鼓勵他必須征服「通往成功路上的絆腳石」… 他的兒子 - 勞埃德。
第10集: 伽瑪當君主創造了一個更大，更邪惡的巨人來協助他打敗旋風忍者以及統治旋風忍者城。

第九季「Hunted」(10 集)

當勞埃德及赤蘭在旋風忍者城奮力抵抗伽瑪當時，另一邊廂小胡及其他忍者卻被鐵爵男及捕龍軍團捉拿到另一國度。
今次，真的要考驗忍者之間的信任，對抗伽瑪當！

主線劇情

第九季的劇情，將會接續在第八季後面，標題為「中文名待確認」(Hunted)，估計將會分成兩條支線來進行，在兩個支線中，忍者主角們，彷彿變成獵物一般，四處逃竄。
第一個要看到的支線，是忍者們與吳大師，一同掉落至「第一個國度」(First Realm)。總地來說，忍者們掉入異世界，這世界不但居住著元素之龍，而且還有全新的反派在裡頭。

整個異世界，架構在滾滾黃沙中，看似無盡的荒野，再加上各種用破銅爛鐵組裝起來的超誇張巨輪車輛，整個根本就是後啟示錄風格的路線，只是再混合樂高自家元素再裡頭。從預告中，各種大載具，有飛空型的飛行器，卻也有輪子很大顆的車輛。

在故事中，全新登場的反派被稱為「獵龍人」，專門狩獵這個世界中的元素之龍，並藉由牠們的元素之力來建造社會。最大的首領是一個身上有機械義肢，戴著禮貌與單邊眼鏡，好像是紳士的「鐵男爵」(Iron Baron)。當具有元素之力的忍者們掉入這世界，自然也成為獵龍人的目標。

而在這個世界中，獵龍人們使用一種名為「Vengestone」的石頭，類似航海王的海樓石那樣，這種石頭可以讓忍者們的元素之力失效，並限制具有元素之力的生物的動作。而更可怕的是，只要他拿起石刀，就能把忍者們元素之力吸收起來，相當可怕。就連阿光都苦笑：「真是太好了，我還以為我們跌到谷底了呢。原來狀況可竟是更糟糕呢。」

獵龍人專狩獵這世界存有的元素之龍，將之俘虜，利用牠們的力量來當資源，建造自己的社會。

就如前面所說，第九季劇情將分兩條支線進行。第八季的反派「晴美公主」(Harumi) 因憎惡當年忍者們與巨蛇魔王的戰鬥，害她失去父母，所以重新召喚伽瑪當君王，一同統治這世界。果然，在伽瑪當、晴美還有重機幫派的淫威下，整個忍者城已變得殘破不堪。
四名忍者+胡大師被傳送到第一個現實中，而勞埃德不但留在原本的世界，還失去了自己的元素之力，變成平凡人。在同樣留在這世界的赤蘭 (Nya)，以及母親美沙子 (Misako)，以及凱勒 (Skylor) 和德瑞大師 (Dareth) 的幫助下，勞埃德不但要逃避伽瑪當的視線，還要號召民眾組織起來，反抗晴美和伽瑪當。

除了伽瑪當等人外，勞埃德還要面對另一個強大的敵人。在第八季最後，在伽瑪當的召喚下，一隻「鬼巨人」(Oni Titan) 在這個世界大搞破壞。
第2集: 阿剛和小胡試圖在捕龍團隊中拯救他們的朋友。另一邊廂，在旋風忍者城，勞埃德與一些老朋友團聚，並認為他們是對抗伽瑪當的可靠盟友。
第3集: 勞埃德必須將他的訊息透過電視廣播傳遞給隊友。與此同時，另一國度中的鐵男爵繼續帶著忍者們追捕逃走了的巨龍。
第4集: 當勞埃德和反叛者慶祝他們成功打擊伽瑪當時，其他忍者們成功對抗鐵男爵，並於捕龍獵人的魔掌中逃脫了！
第5集: 總部遭受到破壞，勞埃德不斷躱避以免被捕。與此同時，忍者被重金屬抓住了，但找到了一個非一般的盟友。
第6集: 由於勞埃德掩護她的真實身份而暴露了蜜絲婆婆的神秘面紗，伽瑪當將晴美公主視為他黑暗中的女兒。與此同時，小胡堅持信念，帶領朋友進入危險領土，希望能找到火焰巨龍的巢穴。
第7集: 勞埃德得到晴美公主的幫助，消滅父親的力量，而忍者成功獲得到巨龍獵人所需要的東西。
第8集: 勞埃德和他的團隊計劃控制鬼巨人。與此同時，忍者再次落入鐵男爵的手中。
第9集: 當鐵男爵迫使小胡取回飛龍盔甲時，可幸地事情並沒有按計劃完成。在旋風忍者城，勞埃德只能一再等待忍者們的歸來。
第10集:旋風忍者最終聚集在一起並聯合起來阻止伽瑪當，為一心想消滅惡勢力，勞埃德做出一個改變忍者的重要決定。

Tales from the Monastery of Spinjitzu(6 集)(每集長度3分鐘)

The weekend drill: 阿剛坐著鑽土機面對2個巨獸敵人，他有能力應付嗎？
元素騎士: 冰忍和赤地分別地駕駛著雙刄機車和冰雪機車對抗青毒族，又一次成功保衛旋風忍者之城！
藍色閃電: 胡大師和阿光正在研究壁畫時，卻發現蛇族的出現破壞！阿光駕駛暴風戰機迎戰！
武士X: 原來阿光和赤蘭日常相處活動就練武? 他們還很喜歡研究如何改裝武士X機器人，令機器人變得更有型，又具攻擊性！
忍術課: 胡大師在旋風忍者修道院教導忍師克服恐懼，才可成為更強的旋風忍者！
綠色與金色: 勞埃德心愛的超特四頭巨龍出現 ,勢要擊敗蛇族!

第十一季「禁忌忍術的祕密」「Secrets of the forbidden spinjitzu」(30 集)(每集長度11分鐘)

一班旋風忍者今次深入沙漠中嘅金字塔，原本諗住鍛練下自己，點知遇上邪惡蛇族大法師，佢仲諗住利用禁忌忍術大肆破壞！一眾旋風忍者爭奪禁術，阻止大法師，戰鬥俄羅斯輪盤

主線劇情

第16集:終於來到「永不領地」，到底冰忍是否真的如傳聞所說的被關在這裡？
第17集:冰帝知道了旋風忍者來臨並派出暴雪武士戰隊 , 要將他們擊倒。但誰知道，村民提供地方，以避開暴雪武士的追捕。
第18集:勞埃德與冰帝的暴雪武士發生衝突，但是被一隻奇怪的狼救了出來......
第19集: 回到旋風忍者城，三名被困的壞蛋得悉忍者缺席是講座，突破監獄的困綁，講述了他們如何被捕獲的故事。
第20集:勞埃德和狼找到了一個機械的洞穴和來自冰忍的信息，為尋找冰忍之旋帶來了提供了線索......
第21集: 因為失去了旅行者之茶而感到內疚，阿剛開始對附近的山丘進行危險的探索，希望找到傳說中的旅行者之樹 - 據說是被一隻可怕的野獸守衛的樹......
第22集: 阿剛在傳說中的聚集很多的野獸的冰冷洞穴中醒來，試圖逃跑，只是為了發現一個令人驚訝的事實
第23集: 冰帝召喚巨大的冰巨獸攻擊勞埃德和他的白狼朋友......
第26集: 回到旋風忍者城，胡大師和碧素試圖找到Never-Realm，並意外地從無間道界釋放出一個可怕的生物......! 冰帝的可怕冰龍再次前來，給冰漁村帶來了麻煩，迫使旋風忍者去尋找勞埃德......
第27集: 故事講述冰忍到達Never-Realm的故事以及他是如何受到邪惡的Vex的影響。那麼冰忍是正或者邪?
第29集:終極一戰，赤蘭、阿光、阿剛和赤地終須面對冰帝的可怕冰龍，而勞埃德和他新盟友Kataru和Grimfax如何面對冰帝發出的戰書......？

迷你電影

Chen Mini-Movies
(Non-Canon)1. Chen's New Chair · 2. Chair Play Chen · 3. Chair Up Chen · 4. Chairful What You Wish For · 5. Bad Chair Day
Tall Tale Mini-Movies
(Non-Canon)1. The Tall Tale of Flintlocke · 2. The Tall Tale of Clancee · 3. The Tall Tale of Doubloon · 4. The Tall Tale of Dogshank · 5. The Tall Tale of Monkey Wretch · 6. The Tall Tale of Squiffy and Bucko
SpecialDay of the Departed
Wu's Teas Mini-Movies
(Non-Canon)Wu's Teas
Ninjago: Decoded(10 集)(每集長度10分鐘):
持續約11分鐘每部分，「Ninjago：解碼」是一個迷你係列使用剪輯從前幾集和季節7改變了配音。這個系列是為了向電影粉絲介紹七個賽季。

Chapter Books

Kai: Ninja of Fire · Zane: Ninja of Ice · Cole: Ninja of Earth · Jay: Ninja of Lightning · Snake Attack! · A Team Divided · The Search for Zane · Breakout · The New Ninja . Legend of the Brown Ninja .

Readers

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Graphic Novels

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2013 Sets:70500 Kai's Fire Mech · 70501 Warrior Bike · 70502 Cole's Earth Driller · 70503 The Golden Dragon · 70504 Garmatron · 70505 Temple of Light

2014 Sets:70720 Hover Hunter · 70721 Kai Fighter · 70722 OverBorg Attack · 70723 Thunder Raider · 70724 NinjaCopter · 70725 Nindroid MechDragon · 70726 Destructoid · 70727 X-1 Ninja Charger · 70728 Battle for Ninjago City · 5002144 Ninjago Battle Pack

Tournament of Element Sets:70745 Anacondrai Crusher · 70746 Condrai Copter Attack · 70747 Cole's Boulder Blaster · 70748 Titanium Dragon · 70749 Enter the Serpent · 70750 Ninja DBX · 70752 Jungle Trap · 70753 Lava Falls · 70754 Jay's ElectroMech · 70755 Jungle Raider · 70756 Dojo Showdown

Possession Sets:70730 Chain Cycle Ambush · 70731 Jay Walker One · 70732 City of Stiix · 70733 Blaster Bike · 70734 Master Wu Dragon · 70735 Ronin R.E.X. · 70736 Attack of the Morro Dragon · 70737 Titan Mech Battle · 70738 Final Flight of Destiny's Bounty · 70751 Temple of Airjitzu

Airjitzu Flyers:70739 Airjitzu Kai Flyer · 70740 Airjitzu Jay Flyer · 70741 Airjitzu Cole Flyer · 70742 Airjitzu Zane Flyer · 70743 Airjitzu Morro Flyer · 70744 Airjitzu Wrayth Flyer

Skybound Sets:70599 Cole's Dragon · 70600 Ninja Bike Chase · 70601 Sky Shark · 70602 Jay's Elemental Dragon · 70603 Raid Zeppelin · 70604 Tiger Widow Island · 70605 Misfortune's Keep

Day of the Departed Sets:70588 Titanium Ninja Tumbler · 70589 Rock Roader · 70590 Airjitzu Battle Grounds · 70592 Salvage M.E.C. · 70595 Ultra Stealth Raider · 70596 Samurai X Cave Chaos

Hands of Time Sets:70621 The Vermillion Attack · 70622 Desert Lightning · 70623 Destiny's Shadow · 70624 Vermillion Invader · 70625 Samurai VXL · 70626 Dawn of Iron Doom · 70627 Dragon's Forge

The LEGO Ninjago Movie sets:70606 Spinjitzu Training · 70607 Ninjago City Chase · 70608 Master Falls · 70609 Manta Ray Bomber · 70610 Flying Jelly Sub · 70611 Water Strider · 70612 Green Ninja Mech Dragon · 70613 Garma Mecha Man · 70614 Lightning Jet · 70615 Fire Mech · 70616 Ice Tank · 70617 Temple of the Ultimate Ultimate Weapon · 70618 Destiny's Bounty · 70620 Ninjago City · 70629 Piranha Attack · 70631 Garmadon's Volcano Lair · 70632 Quake Mech · 70656 garmadon, Garmadon, GARMADON! · 71019 The LEGO Ninjago Movie Series

Sons of Garmadon sets:70638 Katana V11 · 70639 Street Race of the Snake Jaguar · 70640 S.O.G. Headquarters · 70641 Ninja Nightcrawler · 70642 Killow vs. Samurai X · 70643 Temple of Resurrection · 10755 Zane's Ninja Boat Pursuit

Spinjitzu Masters Spinners:70628 Lloyd Spinjitzu Master · 70633 Kai Spinjitzu Master · 70634 Nya Spinjitzu Master · 70635 Jay Spinjitzu Master · 70636 Zane Spinjitzu Master · 70637 Cole Spinjitzu Master