裁判員制度

裁判員選聘程序

首先，地方法院會在每年9月1日之前，將下一年所需的候補裁判員人數按其管轄區內的市、鎮、村進行分配，並通知該市鎮村的選舉管理委員會（法第20條）。
收到通知的市鎮村的選舉管理委員會會從登記在選舉人名冊上的眾議院議員選民中，以「抽籤」的方式選出候補裁判員的預定人選，並製成《候補裁判員預定名冊》。市鎮村的選舉管理委員會需要在收到通知當年有10月15日前將製成的《候補裁判員預定名冊》寄往地方法院（法第21條、第22條）。
每年，地方法院會根據候補裁判員預定名冊製做出《候補裁判員名冊》，並在12月底前將相應結果通知登記在該名冊上的候補裁判員（法第23條、第25條）。
接著，地方法院會針對每件適用案件，再次通過「抽籤」從《候補裁判員名冊》中選出應傳喚的候補裁判員。在「抽籤」過程中，檢察官及辯護人可在旁觀看（法第26條）。被選為「應傳喚的候補裁判員」者將在自家收到《詢問狀》及《傳喚書》（法第27條、第30條）。
候補裁判員需回答《詢問狀》中的內容，並送交或寄回法院。該詢問狀將詢問候補裁判員是否存在不合格事由（未完成義務教育者、被判處監禁以上的刑罰者等。法第14條）·禁止擔任事由（特定的公務員、司法界人士等法律相關人員、警察等。法第15條）·與案件相關的不適任事由（被告人·被害人的關係者、案件相關人員等。法第17條）·辭退事由（70歲以上、學生、有重要工作在身、最近已擔任過裁判員等。法第16條）等情況。
根據詢問狀的回答，有明顯不合格事由、禁止擔任事由、與案件相關的不適任事由及本人希望推辭且辭退事由得到認可者，可取消傳喚。
此外，若在詢問狀上填寫虛假信息，將被處以50萬日元以下的罰金或是30萬日元以下的過失罰款（法第110條、第111條）。另外，無視被傳喚的事實、拒不報到並無正當理由者，將被處以10萬日元以下的過失罰款（法第112條）。
裁判員及補充裁判員由受到法院傳喚並報到的候補裁判員中以非公開的方式選出（法第33條）。被傳喚的候補裁判員人數需多於裁判員·補充裁判員的所需人數（每個案件的所需人數由受理訴訟的法院（負責該案件的法庭·法官）決定。）（法第26條第1款）。
審判長將對候補裁判員進行必要的詢問，以判斷其是否有不合格事由或辭退理由，以及是否有做出不公正判決的可能。陪同的法官、檢察官、被告人或辯護人所認為的做出判斷所需的問題，可要求裁判長向候補裁判員進行詢問（法第34條）。
法院根據對問題的回答決定不選聘人選（法第34條第4款）。並且，檢察官及被告人可分別無理由對至多4名（若設置補充裁判員，則更多）候補裁判員提出不選聘請求（法第36條）。在此一系列手續之後，法院再通過「抽籤」等手段從未被認定為不選聘人選的候補裁判員中選出必要數量的裁判員及補充裁判員（法第37條）。
裁判員·補充裁判員的選拔手續結束後，即進入公審準備及公審手續。裁判員與法官共同對證據文件、證物進行檢討，並進行詢問證人、驗證、詢問被告人等調查取證，而後進行評議·決議，參與判決的確定。在公審開始後，若裁判員有做出不公正判決的可能性或不應參與審判的情況，檢察官、被告人或辯護人可向法院請求解除該裁判員職務（法第41條）。此外，法律問題應通過僅由法官進行的合議來決定。
此外，《候補裁判員名冊》的登記在冊者每年約有29.5萬人，全國人均概率為1/352。而實際成為裁判員的概率，假設為全國人均1/5000。

合議庭的結構

原則上，由3名法官、6名裁判員共計9名人員構成（法第2條第2款）。
不過，公審事實確鑿無爭議的案件（自白案件），也可由1名法官、4名裁判員共5人組成合議庭進行審判（法第2條第3款）。

裁判員的權限

裁判員參與事關有罪判決或無罪判決的下達，以及需要在保護處分得到認可的少年案件中下達將被告人移送家庭法院之判決的審判，並有權與法官共同組成合議庭，就事實的認定、法令的適用、刑期的裁定做出審判（法第6條第1款）。
決議必須獲得包括法官及裁判員在內的雙方半數以上人員贊成（法第67條第1款）。
另外，當無法獲得法官與裁判員雙方半數以上的贊成時，應做出對負有舉證責任的一方不利的判決。舉例而言，假設某個案件中有3名法官與1名裁判員認為被告有罪，而其餘5名裁判員認為被告無罪。由於與犯罪的成立與否相關的事實（其中一部分除外）的舉證責任乃是由檢察官承擔，因而在此種情況下，應判斷為犯罪事實無法得到證明，被告無罪。這與美英等國將這種情況視為「無法決議（hung jury）」而重新審判的處理方法是完全不同的。
不過，若在刑期的裁定問題上無法取得共識，無法取得包括法官及裁判員在內的雙方半數以上的一致意見時，則按照所有意見對被告人的不利程度從重到輕進行疊加，直到其數量達到包括法官及裁判員在內的雙方的半數以上為止。此時所得的對被告人最有利的意見即成為該合議庭的判斷（法第67條第2款）。
此外，與法律解釋、訴訟手續相關的判斷（保護處分得到認可、決定將被告人移送家庭法院的場合除外），以及其他裁判員所不能參與的判斷僅由法官進行合議（法第6條第2款）。
在法院所進行的其他審理若不是為做出裁判員所參與的判斷以外的判斷而進行，則裁判員及補充裁判員也有權列席該審理（法第60條），裁判員有權旁聽其決議，而該審理中的判斷也可諮詢裁判員的意見（法第68條）。

裁判員的日津貼

對於裁判員、補充裁判員及在裁判員選聘手續實行日報到的候補裁判員，國家將支付旅費、日津貼及住宿費（法第11條、第29條第2款）。
旅費分為列車費、船費、汽車費及飛機費，分別按照裁判員所參與的刑事審判的規則中所規定的計算方法進行計算。
日津貼按照報到或覆行職務以及為此所進行出差的天數進行支付，裁判員及補充裁判員的支付標準為每日1萬日元以內，在裁判員選聘手續實行日報到的候補裁判員的支付標準為每日8,000日元以內，具體金額由法院規定（關於裁判員參與刑事審判的規則第7條）。
住宿費按報到等必要的夜數進行支付，支付標準為每夜7,800日元到8,700日元不等（同規則第8條）。
另外，考慮到裁判員的精神壓力及經濟損失，日津貼過少這一點也常常遭人詬病。

區分審理

連續殺人案及無差別大量殺人案等由1名被告人犯下多起案件的場合，審理通常可能需要較長的時間，而讓裁判員參與長期審理又較為困難。因此，對於合併案件（多起案件合併審理的案件），法院可將其加以區分，在每個區分案件中設立合議庭，按順序進行審理。但是，若犯罪的證明有可能面臨障礙，或是不利於被告人申辯等情況時，不得決定進行區分審理（法第71條）。
此情形下，可預先為二審之後進行的區分審理審判或是合併案件審判選聘預定裁判員或預選補充裁判員。
決定進行區分審理之後，每個被區分案件中犯罪的成立與否將得到判斷，並形成部分判決。部分判決僅判斷犯罪的成立與否，並不觸及量刑部分。但是，在判決有罪的場合，可在部分判決中昭示情況事實。這一手續稱為區分審理審判。
接著，在所有的區分審理審判結束後，再對未進行區分審理的案件中犯罪的成立與否以及合併案件整體加以審判。即是在這個合議庭中，以殘餘案件中犯罪是否成立及已經成立的部分判決為依據，決定具體量刑。這一審判稱為合併案件審判。
如此一來，裁判員便只須參加各自所負責的1場區分審理審判或是合併案件審判，因而無需受到長時間的約束，負擔也就得以減輕。不過也有質疑之聲認為，法官在原則上會參與所有案件的審判，因此法官與裁判員之間的信息不對稱可能會對審理造成影響。

法律穩定性受損

過去的審判中，同種類型的犯罪幾乎都會被判以同等刑罰的市場量刑普遍存在。出於裁判員制度將會打破這種舊習的預期，最高法院將量刑資料庫向裁判員開放，以便於裁判員參考過去的同類案件。但律師五十嵐二葉卻指出，青森縣的裁判員第3號案件（十和田市2女搶劫強姦案）給出了市場量刑兩倍以上的重判，暗示刑期的裁定可能會受到被害者的心情或是裁判員個人感情的左右。

公審前整理手續

公審前整理手續並不公開，因此裁判員會在不知道哪個論點已經遭到排除的情況下判斷有罪無罪及刑期的多少。

背景事件

裁判員是由眾議院議員的公職選舉人名冊中通過抽選選出，選聘不受思想·信仰·能力的限制。如果在選聘時進行虛假申告，將被處以罰金的刑事處罰；被選聘為裁判員後無正當理由而不前往報到的，將被處以過失罰款的行政處罰。檢察審査會是它的類似制度。

適用範圍

裁判員的適用範圍限制在重大刑事案件中。
裁判員制度之所以與美國的陪審員制度有「不適用於民事案件」的不同點，有意見指出是為了處理為在美國資本進出日本時保護美國的利益而針對美國企業所展開的偶發性的殺人等刑事案件。在美國企業與外國企業對簿公堂的審判中，美國的陪審員常常做出對美國企業有利的判決，而許多日本企業則在特殊審判等美國的審判中被美國人民陪審員下達不利判決，從而被索以巨額賠償金，政府擔心在裁判員制度下，美國企業在日本有可能遭到相同的待遇，因而限制了裁判員制度的適用範圍。
在民意調查中，國民最為牴觸的事之一，是「由自己的判斷對被告人進行裁決」。從這個觀點來推測，比起參加刑事審判，民事審判更能減少國民的牴觸情緒，因此也可以說，將範圍限制在心理負擔最重的重大刑事案件中，將增加制度引進和運用的難度。而關於裁判員制度的適用範圍，法律本身也將其限定在「重大刑事案件」中，至於國民對於哪些種類的案件牴觸情緒較小則幾乎未進行過討論。起訴國家的審判也不適用裁判員制度。
尤其是在勞動審判中，職業法官常常傾向於下達對僱主有利的判決，而美國等國家的勞動審判也採用陪審制。在日本，從前就有專攻該方面的律師提出應將選擇陪審制引進勞動審判，但卻由於經濟界（僱主方）的強烈反對而未能實現。勞動審判是最為關乎民間感覺的，而在本次裁判員制度引進時，勞動審判依然未能獲得垂青。

關於引進吉祥物的爭議點

作為裁判員制度對國民的宣傳活動的一環，引進吉祥物進行宣傳的行為導致了以下問題。
裁判員制度並不存在官方吉祥物，而是鼓勵地方舉行有物色的宣傳活動，因此各法院都為宣傳裁判員制度而自行設計吉祥物，反而造成了混亂。不僅如此，之後日本律師連合會也引進了獨有的吉祥物「SAISAI」，而連連遭到「宣傳方沒有統一的步調」的批判。
此外，還有批評認為不應將預算花費在吉祥物上，而應該運用於裁判員制度的具體內容的普及。

公共活動中出席法官的變更

神戶地方法院在2009年10月31日舉辦了裁判員制度的宣傳活動。在該活動中，原本預定有兩位負責裁判員審判的法官出席，但就在活動即將舉辦的該月30日，神戶地方法院以「法官就判決之外的其他個別事件進行說明是不恰當行為」而以其他法官進行了替換。而該地方法院也因為採取了無視裁判員制度的目的——「審判的民意」的行動而招致了非議。

向候選人發送通知

2008年11月28日起開始向候選人發送通知。
但是，候選人將裝有通知書的郵品公開在網絡的SNS及博客上的事屢見不鮮，其中也有些案例可以鎖定候選人的姓名及頭像，這為裁判員制度未來的發展埋下了隱患。
11月29日播送的日本電視台的新聞節目《Raltime》曾對某位女性候選人進行過不公開容貌的採訪。
12月17日，和歌山地方法院發布聲明，宣稱和歌山縣高野鎮有2位居民收到了將當事人「被特別指名為」裁判員制度的「有識之士」等內容的偽造文書。
2010年裁判員候選人的抽選中，一部分縣的10個市鎮村的選舉管理委員會將本應從2009年9月和6月更新完畢的選舉人名冊中抽選的候選人，誤從2008年9月～2009年3月的舊選舉人名冊中進行抽選的錯誤浮出水面。