惠州交投巴士有限公司

早期發展

1971年3月，該公司前身惠州市汽車站成立，隸屬惠州市交通局管理，經營客、貨運業務，由廖偉忠、康景祿、駱漢全等人分任正副站長。汽車站成立之初借用西湖管委會的用地辦公。彼時汽車站經營「惠陽汽車站—橋東西門口」「惠陽汽車站—平湖門」「橋東西門口—下角小中堂」等3條公共汽車路線。
1973年-1977年間，公共汽車站陸續增開由惠州至橫瀝、湯泉、平潭等三地的外線。
1974年，惠州市汽車站更名為惠州市汽車公司。次年，汽車公司分離客、貨運業務，其中客運部分（即公共汽車）成為惠州市公共汽車站。
1977年7月，位於麥地路6號的辦公大樓投入使用。
1980年-1984年，公共汽車站在重點經營「內線」的同時，加開多條「外線」，以求扭轉因社會上公私車輛爭客而導致的虧損局面。但由於虧損原因，「內線」經營困難，於1983年，除「惠陽汽車站—平湖門」線仍可正常行走外，其餘多條線路均停運。
1984年2月20日，惠州市公共汽車站改制為惠州市公共汽車公司，由駱漢全、鍾振強分任正、副總經理。同年，該司轉隸惠州市公用事業局管理。
1987年，各條「外線」均停止運營。

1990年代

1990年，惠州市政府投入96萬元，恢復了多條於1983-1985年間停運的公交線路，並增設「汽車站—雲山」「汽車站—市人民醫院」等兩條線路，分別為今天的2路、3路。
1994年6月，惠州市公共汽車公司升格為惠州市公共汽車總公司，升格後由黃文程出任總經理，鍾振強、羅月林、姚燕培出任副總經理。總公司下設辦公室、安全科、保安科、材料供應科，及轄有兩個車隊、兩個修理車間、汽車零部件門市部、停車場等單位。
1998年，公交總公司陸續開通多條線路，並利用社會資金更新15個候車亭及150個燈箱式站牌。同年，該司向社會作出了8點公交服務承諾。10月，該司對原機關科室、營運車隊、修理車間及保障單位實施改制，包括將原下轄的兩個車隊改制為兩個運營分公司（即現今的第一、二分公司），兩間修理車間改組為一個大修廠，及對下設的行政部室進行調整，並可實施經濟獨立核算及自負盈虧。

2000年代

2001年5月，惠州市公共汽車總公司黨總支委員會獲准籌建，第一、二分公司黨支部及總公司行政機關黨支部亦成立。該司亦獲評當年度市「先進基層黨組織」。同年，該司聘請10位市民為公交服務質量社會監督員。此外，該司亦開始推行股份制經營，以集資入股方式籌資100餘萬元購入10台客車開通28路。次年，19路實行股份制經營。
2003年，公交總公司開始在旗下車隊安裝南平三方電子報站系統，及增設91個電子站牌。同年，該司啟用新版綠色主題塗裝，應用於新購置車輛及翻新後的舊車。此外又斥資2萬餘元解決近100台車輛存在的車內燈光暗淡問題。
2004年，公交總公司收回29路的經營權，並實施股份制改造。同年，該司對旗下的10路、26路系列路線進行拆分。
2005年1月20日，該司與保源電子共同組建的IC卡收費系統啟用，發行普通不記名卡、學生卡等卡種，初期於18條無人售票線路安裝非接觸式IC卡閱讀器，及後向所有運營線路推行。
2006年3月，公交總公司對旗下線路收費方式進行調整。其中，一票制空調車輛票價由1元調整為2元，分段收費空調車輛票價調整為起步1.5元/9千米，9千米後為0.5元/3千米。非空調車輛則維持原有票價。同年，該司針對旗下部分車輛「噴黑煙」嚴重的情況，成立尾氣專項治理領導小組，全面檢測旗下車隊尾氣排放狀況，對100餘台車輛的高壓泵進行更換或維修，並維修150餘台車輛的發動機，使車隊尾氣排放基本達到環保部門要求。此外，該司亦購入首批廈門金龍XMQ6891G型大型環保客車，投入5路運營，並啟用新版奧運主題塗裝。這亦是公交總公司首次購買國內主流品牌車輛；而該塗裝也成為後續大部分車隊的標準塗裝。
2007年，該司將其辦公室電話用於對外公開的投訴電話使用。同年，配合惠州市創建全國文明城市的工作，公交總公司對旗下車隊的硬體設施進行完善，包括設置車內導向圖、乘車規則、投訴電話等多張宣傳紙，增設垃圾簍、遮陽簾等設施。車身及車內報站機、移動電視等設施也有進行創建文明城市之相關宣傳。
2008年，公交總公司自籌資金建成GPS智能調度管理系統。同年，該司對旗下場站及候車設施進行維護，新建130餘個候車亭，更換、維修簡易站牌400餘個，並啟用電子站牌系統，方便市民獲取下一班車預計到站時間。
2009年5月27日，公交總公司與中國聯通惠州分公司合作的公交服務熱線+86-752-96020000開通運營，方便市民在工作日非上班時間及節假日進行公交服務投訴。這一電話號碼已於2017年起棄用。

2010年代

2010年2月26日，公交總公司投放第一批20台珠海廣通GTQ6857NGJ型液化天然氣客車於17路、18路首航，成為該司首批投入服務的清潔能源車輛。及後，另外80台同型號車輛於5月23日前全數投入服務，以迎接省運會的召開，及貫徹惠州市委、市政府關於建設「雙宜」（宜居宜業）城市的戰略部署。同年，惠州市公共汽車總公司計程車分公司成立，並獲惠州市政府特許授權經營CNG、汽油兩用計程車。7月1日，該司正式投入豐田花冠EX及大眾桑塔納志俊各50台，合共100台CNG、汽油兩用計程車運營。此外，該司於大水塘停車場建設LNG撬裝加氣站，及於河南岸停車場建設L-CNG加氣站，供清潔能源車輛使用。
2011年3月，公交總公司與中海石油氣電集團有限責任公司合資成立的中海油惠州新能源有限公司正式掛牌營業。同年，江北西L-CNG加氣站啟動建設。8月，該司開始為旗下無人售票車隊更換新式IC卡閱讀器，型號為雄帝JC-5200。該款閱讀器也應用於後續車隊上。12月20日，公交總公司開始為旗下車隊安裝嶺南通閱讀器，並於12月31日正式支援以嶺南通支付車費。次年1月，該司啟動公交IC卡補換嶺南通卡業務。
2012年5月31日，公交總公司參與於中國人民銀行廣州分行舉行的金融IC卡進入惠州公交領域簽約儀式。6月，惠州市公共汽車總公司第三分公司成立，接管原第一、二分公司多條由市區南部片區始發的公交線路。同年，該司建成、啟動建設六個公交總站及保養設施，並於2013年初完成。8月，該司與中國電信惠州分公司合作，於7路、8路、18路測試免費Wi-fi，及後該無線網絡也應用於新開線路42路上。
2013年1月25日，該司與中國人民銀行惠州市中心支行及中國銀行惠州分行舉辦金融IC卡刷卡乘車體驗活動，意味著公交總公司旗下車隊正式支援以金融IC卡支付車費，支付時使用公交IC卡閱讀器。5月8-13日，該司在為旗下車隊的公交IC卡閱讀器完成升級後，開始分批拆除嶺南通專用閱讀器。原公交IC卡閱讀器在升級後可支援嶺南通卡，原嶺南通閱讀器則被調入惠州市其餘區縣的公交業者使用。5月16日，該司在18路、29路試行以惠民自行車卡支付車費，並於6月9日全面開通惠民自行車卡支付。同年，江北西停車場建成使用，配置L-CNG加氣站及維修車間。
2014年4月28日，公交總公司開通首條觀光公交線路觀光1號線，並首次投放低地台雙層客車提供服務。7月12日，該司投放第一批25台廈門金旅XML6115JHEV75CN型氣電混合動力客車於7路、18路首航，成為該司首批投入服務的混合動力車輛。但由於技術原因，該批車輛上線初期常因動力不足而難以爬上惠州大橋，嚴重時還易引致後方交通堵塞，故而飽受乘客詬病。9月5日，第一批25台鄭州宇通ZK6105CHEVNPG4型氣電插電式混合動力客車首航29路。12月1日，該司與惠州市易達文化傳播有限公司合作，於觀光1號線、6路、7路、11路、15路、18路、29路提供免費Wi-fi，乘客需使用「小九」應用程式登錄後才可使用此無線網絡。3日，該司於2路、6路、10路、13路、14路、18路、29路的運營車輛安裝的導盲系統啟用，方便攜有導盲終端的視力障礙人士乘車。同年，公交總公司及其計程車分公司通過安全生產標準化（三級）認證。
2015年9月24日，該司最後一批仍在運營的柴油客車於5路退役。次日，該線投放24台深圳五洲龍FDG6103EVG1型純電動客車運營，成為該司首批投入運營的純電動客車。該批車輛為公交總公司向深圳市民富沃能新能源汽車有限公司以零首付租賃模式購置而來。12月，公交總公司再以相同方式向民富沃能購置40台南京東宇NJL6129BEV6型低地台純電動客車，並於12月23日出牌。因不明原因，該批車直至2016年8月16日才首航29路。同月，惠州億緯鋰能股份有限公司以能源合同管理模式向公交總公司贈送10台深圳五洲龍FDG6103SHEVNG5型氣電增程式電動客車。該批車輛先於愷旋交通運營的仲愷企業交通專線進行測試，其後於2016年3月24日正式首航33路。
2016年，該司計程車隊全面更換為大眾新桑塔納。置換下來的車輛則於12月底前被拍賣完成。同年，該司亦推進公司制改造工作，精簡機關部室，實行大部制、扁平化管理及「三定」（定人、定崗、定責）管理，明確責任。12月12日，公交總公司旗下線路開始模擬TC模式運營。2017年1月1日，上述線路正式按照TC模式運營。同日，原有人售票路線也改制為無人售票，但仍維持分段收費模式，乘務員則被以通過培訓實現再就業及協商解除勞動合同等方式妥善安置。因TC模式實施後，票務、乘客服務等事項均統一交由惠州市公共運輸管理有限公司（TC公司）負責，該司的點鈔、押鈔、守庫、稽查、投訴處理等崗位從業員則被以內部轉崗、TC公司接受聘用及協商解除勞動合同等方式妥善安置。
2017年3月，公交總公司再次調整旗下分公司結構，成立第六、第九分公司。5月，公交總公司以零首付分期付款（5年60期）方式購置的55台廈門金旅XML6105JHEVG5CN6到貨，並於7月20日首航20路、25路、26路、27路及35路。此為惠城公交TC模式實施後首批投入運營的車輛，及全球第一批量產版廈門金旅「川流」造型車輛。12月29日，惠州市公共汽車總公司更名為惠州交投巴士有限公司，脫離惠州市國有資產監督管理委員會，成為惠州市交通投資集團有限公司全資子公司。雖該司已完成證照層面更名，但目前仍為新舊司名混用狀態。
2018年5月1日，交投巴士旗下車隊全面執行新版票價方案及嶺南通換乘優惠政策，並於同日起停止原公交總公司發行的公交IC卡充值業務，及宣布該種卡片將於2019年1月1日正式退市。10日，該司與公交管理公司共同推出學生公交IC卡置換為嶺南通·惠州通學生卡之業務。6月1日，首三款採用城區公交統一塗裝及使用交投巴士標識的公交車輛於3路、7路、8路等16條路線首航，該批車輛同時為惠州市首批設有乘客動態資訊系統及安裝新能源車牌的公交車，其中部分車輛於車廂內設置了USB快充接口。

26路、29路車長因搶道發生爭執事件

2012年5月13日，有微博網友向惠州市交通運輸局投訴稱，其當日乘坐26路粵L05646車途經東平市場站至東湖西路站路段時，該車連續急剎兩次。隨後該車逼停一台29路公交車，車長隨後下車沖入29路車內毆打29路車車長，並於十幾秒後返回26路車繼續駕駛。
其後，市交運局即派員走訪當事者、目擊者，及調取相關車輛監控，並於5月17日向社會發布調查結果。調查結果指出，5月13日下午2時10分許，兩台涉事車輛通過東湖西路東平大道路口時，因車道數減少，兩車發生搶道行為，至26路車車站李某緊急剎車。李某認為對方未作禮讓而心中有氣，遂在停靠東平市場站時登上29路車與該車車長鄭某理論，期間有互相拉扯行為。兩車車長隨後被各自車輛的乘務員拉開，隨後各自回到駕駛崗位。交運局同時表示，兩位車長服務意識、安全意識淡薄，在駕駛過程中開鬥氣車，互相謾罵，李某更不顧乘客跑到29路車上吵鬧，兩人行為均嚴重影響公交正常運營及行車安全，影響惡劣。此外，公交總公司則表示已判兩位涉事車長深刻檢討，並作全司通報批評及停班、取消當月獎金等處理。
調查報告公布後，有網友質疑交運局描述兩車長之間行為為「互相謾罵」而非投訴者所指的「毆打」是避重就輕。對此，交運局方面回應，工作人員在與涉事車長談話期間未發現打架痕跡，而網友將互相拉扯行為誤認為是打架「也很正常」。

「被擱置」車長「跳樓討說法」事件

2015年2月12日早上7時許，公交總公司一名付姓車長登上該司辦公大樓樓頂，手舉紅底黑字橫幅，向公司討要說法，引發民眾圍觀。隨後，公安、消防及急救部門均出動，消防方面更在大樓前方設置氣墊。該名車長在其家屬及公安、消防等部門勸解下，於當日下午3時30分許離開大樓樓頂，轉而在辦公室與公司領導交談。
據知情人士透露，該名車長在2014年駕駛公交車時發生過交通事故，及後，法院判付性車長並非事故責任人，且車長與公司之間的勞動合同仍然有效。但由於該次事故致他人受傷，公交總公司與保險公司合共賠償傷者20餘萬元。事後，公交總公司按照其規章制度對車長作解聘處理，引起該車長提出勞動仲裁，並獲勝。但公交總公司仍未對其安排具體工作，而是僅僅讓他按時打卡上下班。該車長的兒子在接受惠州廣播電視台記者採訪時透露，在勞動仲裁勝訴前，其父親更未領到任何工資；勝訴之後，公司也僅僅是「每個月敷衍地給幾百塊工資」。其後，2015年2月，該司發出通知，指該付姓車長嚴重違反公司規章制度，需被解聘，並告知其於2月10日上午辦理相關手續。
對此，公交總公司一名負責人表示，不贊同該位車長以跳樓等極端手段討要說法的方式，認為該做法「浪費公共資源」，但拒絕透露更多細節。另有知情人士指出，公交總公司對不同等級的交通事故有相關處理規定，但對於勞動仲裁結果與公司規章制度不一致的情形，「公司也很為難」。