惠州慈云图书馆

豐湖書藏、私立豐湖圖書館時期

慈雲圖書館的前身應追溯至1886年（清光緒十二年）建立的「豐湖書藏」。該年，時任豐湖書院山長的梁鼎芬認為書院當時以四書五經為主體的藏書不敷應用，遂寫「捐書啟事」以號召惠州當地民眾捐書。梁後來又寫《豐湖書藏四約》求助於天下，並規定所捐之書籍不受版本、數量及書院是否已藏的限制，允許捐贈者在書中「刻印爵里、蓋印姓氏」，及承諾向其開具收條。此舉得到時任兩廣總督張之洞大力支持，梁鼎芬亦很快收穫四萬六千餘冊來自各地的書籍。梁隨後在書院西側「建樓三楹」，用於收藏這些書籍，稱「豐湖書藏」，是為中國最早的校園圖書館之一。而為了妥善管理書籍，梁鼎芬僱請專人管理書藏，又將《豐湖書藏四約》用於書藏管理。《四約》是清朝條目最多、內容最詳細的藏書規章，亦被認為是近代圖書館理念、制度的體現。
民國初期，惠州遭受猛烈的炮火轟擊，書藏亦在戰火中遭受嚴重損失。1921年，當地人士將剩餘藏書轉移至小西門義倉（位於今惠州九小附近）保管。1931年春，在李岱青、黃樹棠及張友仁等地方名士倡議之下，私立豐湖圖書館成立，並由黃樹棠任館長，建館舍於中山公園梌山原育嬰堂舊址，並向公眾開放。該館的圖書是由小西門義倉內藏書轉移而來。
1948年，圖書館進行擴建，具體為在原建築前後各加建一棟磚木結構瓦房。至惠州解放之前，私立豐湖圖書館共有藏書10035冊。

軍占時期

1949年10月18日，中國人民解放軍進駐惠州後，惠州軍事管制委員會文教接管委員會社教接管組接管了私立豐湖圖書館，但駐軍在當時占領了大部分館舍。1950年6月，惠州鎮人民政府將私立豐湖圖書館改制為東江豐湖圖書館，並在平湖門建立新館舍，為兩層磚木結構樓房，是為惠州的第一個公共圖書館。1951年5月，東江豐湖圖書館更名為東江人民圖書館，隸屬於東江專區專員公署文教科。
1953年5月15日，圖書館再改名為惠陽縣圖書館。同年，圖書館開始提供書籍外借服務。1958年，惠陽縣圖書館被劃給縣級惠州市，並更名為惠州市圖書館。同年，因修繕需要，圖書館暫時遷至百花洲。此外，圖書館又在中山紀念堂、橋東第三辦事處及數間遠離圖書館的學校設置閱覽點。
1959年下半年，時任廣州軍區政治委員陶鑄電令駐惠州部隊撤出原豐湖私立圖書館館舍，並將其歸還至地方政府，圖書館軍占時期由此結束。

惠州市圖書館時期

1960年11月，惠州市圖書館回遷至原私立豐湖圖書館館址。該年，圖書館擁有60444冊藏書，每年購書經費為人民幣1萬元。「文化大革命」時期，紅衛兵占領館舍，設「紅衛兵惠州學生總部」。1968年下半年之後，圖書館幹部、職工被分別下放至五七幹校及工廠，圖書館停止開放。紅衛兵占領期間，圖書館遭到嚴重破壞，累計有古字畫兩千餘幅、唱片數千張及各類圖書一萬餘冊被偷、被毀。1972年以後，圖書館逐漸恢復開放。1979年，原國家文化部下撥人民幣3萬元至惠州市圖書館，用於古籍圖書保護。1984年，圖書館北面舊樓被鑑定為危樓。之後，該樓被拆除，改建為占地1100平方米的四層園林式樓房。1987年，該館首次對職工進行專業技術職稱評定考核，最終有7人獲評中、初級職稱。至該年年底，圖書館有藏書204954冊。
1988年6月1日，圖書館轉隸惠州市文化局。1989年5月28日，惠州市圖書館參與全國首屆圖書館宣傳周活動，此後每年舉辦一次該活動。1995年，該館籌集人民幣15萬元，用於搶救遭蟲蛀的古籍，及對館內古籍進行全面的修補、整理。次年，圖書館在室內安裝數台空調，並安裝窗簾以遮光，從而改善藏書條件。

慈雲圖書館時期

2002年，香港慈雲閣董事會向惠州市捐建了圖書館，該館由慈雲閣與惠州市人民政府共同出資建設。5月29日，該館開工建設。2004年9月30日，新圖書館啟用，為惠州市規模最大的圖書館。惠州市圖書館亦正式遷入新館，並更名為「惠州慈雲圖書館」。
2007年9月，該館開通了參考諮詢服務，市民可透過直接向圖書館職員反映、於圖書館官網留言及發送電子郵件反饋等方式查詢專業資料。2011年11月，該館啟用了新版網絡圖書管理系統，當中包括以手機簡訊形式告知讀者按時還書。2014年12月28日，該館古籍文獻修復室揭牌成立，成為惠州首間古籍修復機構。2015年4月14日，慈雲圖書館理事會成立，是為該館的決策管理機構。2017年3月1日，該館正式將中華人民共和國第二代居民身份證作為借閱證使用，同時對不持有二代身份證的讀者推出條碼卡讀者證；該館亦宣布在該日期之前發行的舊版讀者證於該年8月1日停止使用，並開放市民退還舊版讀者證押金的服務。2019年7月6日，該館開始試行延時服務，逢周末（不含法定節假日）開館時間由上午9時提前至上午8時半。9月中旬，該館在御景花園小區啟用惠城區首個「通借通還」社區服務點，具體運營工作由御景花園物業管理部門及業主委員會負責。

豐湖書院藏書樓

豐湖書藏（豐湖書院藏書樓）位於豐湖書院西面，含有3棟藏書樓。書藏在最高峰時擁有約十萬冊藏書。
目前的藏書樓門口懸有「收藏勝似崑岡富，書卷長留天地間」之聯句，由趙朴初題寫。樓內現時仍保有1603冊藏書，另有部分捐贈圖書，惟目前未有向公眾開放，但藏書樓旁邊設有閱覽室供公眾使用。

中山公園館址

中山公園館址是原私立豐湖圖書館的館舍，亦是原惠州市圖書館於1960年11月至2004年9月期間使用的館舍，位於惠城區中山公園2號。該處館舍始建於1931年，為二層鋼筋混凝土結構樓房，總面積為800平方米。1948年，當時的九龍環山學校校長周醒南捐贈磚木結構瓦房兩間，分布於既有館舍前後。1960年，該處館舍完成修繕，修繕後占地面積為5000平方千米，總建築面積為1200平方千米，設採編室、外借處、兒童閱覽室、書庫、特藏室、辦公室等機構。
該處館舍在「文化大革命」期間一度被劃給其他部門使用，直至1976年才完全恢復向公眾開放。1984年，圖書館北面舊樓因被鑑定為危房而被拆除，隨後建立一棟4層園林式樓房，占地面積為1100平方米。在惠州市圖書館遷入現時慈雲圖書館館址之前，中山公園館址設期刊報紙閱覽室、兒童閱覽室、參考諮詢部、工具書室及地方文獻室等部門。
目前，中山公園館址是惠州少兒圖書館及惠城區圖書館現時使用的館舍；而「惠州私立豐湖圖書館」之石碑亦立於該處。

平湖門及百花洲館址

平湖門館址是原東江豐湖圖書館、原東江人民圖書館及原惠陽縣圖書館的館址，為兩層磚木結構木樓，占地面積800餘平方米，建築面積1200平方米。1953年時，該館設一間60平方米的報章閱覽室、一間50平方米的期刊閱覽室及一間100平方米的少兒閱覽室，另有借書處、藏書庫等機構。
百花洲館址是原惠州市圖書館在1958-1960年期間的臨時館址，僅設借書處、報章閱覽室及兒童閱覽室。

現館址

慈雲圖書館現時館址位於惠城區三新南路15號，占地面積為19266平方米。館內現時有6間閱覽室及1間自修室，共提供1090個座位；此外，該館還設有一間360座位的學術報告廳、一間展覽廳及19間功能廳。該館為地上四層建築，主入口設於二層；館體整體呈「丙」字型結構，樓頂正中則有一部分被設計為一本翻開的書。

借閱

現時，持有中華人民共和國居民身份證的14歲及以上人士在圖書館的自助辦證機登記後，即可將身份證作為讀者證使用。14歲以下小童則需在監護人陪同之下憑戶口簿辦理備具少兒文獻借閱權限的條碼卡讀者證，非中國大陸籍人士則憑護照辦理條碼卡讀者證。
每張讀者證或身份證每次可借閱不超過3本書籍，且所借書籍總價不超過人民幣200元。每次借閱的借閱期限為30天，期滿之前讀者可辦理一次時長為30天的續藉手續。如超期歸還，圖書館會按人民幣1角/天的費率收取超時費用，上限為10元。長期不歸還外借書籍的讀者則會留下不良記錄，對個人徵信造成影響。
除傳統的線下及線上借閱方式外，該館還於2018年8月在2018南國書香節暨第八屆惠州書展上推出「雲書快借」服務。公眾可透過該館微信公眾號進行線上借書，圖書館則以快遞形式向借閱者寄出所借書籍。圖書館在該服務上又與京東合作，使借閱範圍擴大至該網站已上架的全部書籍，圖書館則負責即時採購尚無館藏的書籍。

數字服務

慈雲圖書館的數字圖書館服務於2007年11月試運行，至2008年1月18日結束；隨後，該館於2008年4月正式向公眾開放數字圖書館服務。至今，該館已購買包括超星數字圖書館、維普科技期刊、讀秀知識庫、方正apabi電子書庫、複印報刊資料資料庫等多個數字資源庫，亦自行建設了惠州古籍資料庫、惠州地方文獻資料庫及惠州古籍文獻全文資料庫。
2015年8月，該館的數字圖書終端機於2015南國書香節暨第五屆惠州書展上展出，並開放予參展民眾試用，民眾可利用手機掃描電子圖書上的二維碼免費下載對應電子書。有關設備則在書展結束後於圖書館內正式啟用。2019年7月底，該館的微信小程序上線，為該館的數字閱讀平台，提供大量正版書籍供民眾閱讀、收聽或存儲，亦設置了包含看書打卡、「學習之星」榜在內的多項互動功能。

無障礙服務

2008年7月1日，該館的視障人閱覽室啟用，供視力障礙人士免費讀書及上網。該閱覽室提供的書籍主要為針灸、推拿、按摩等方面的專門書籍。此外，該閱覽室配備了兩台啟用了語音提示功能的電腦供使用者上網學習，館方亦有安排專門嚮導為視力障礙人士提供必要協助。
2018年10月15日，該館啟動盲人數字閱讀推廣活動，並開始提供智能聽書機外借服務，視障人士可透過該設備搜索、更新、下載及聽讀大量有聲讀物。當日，該館為68位有視力障礙的讀者辦理了該種設備的借用手續。

古籍保護

1995-1996年間，原惠州市圖書館對館內的古籍進行了全面的修補、整理，及改善古籍藏書環境。但《惠州日報》於2009年發布的一篇報導中稱，慈雲圖書館彼時藏有20032冊古籍，當中僅有13種163冊善本，餘下古籍皆不同程度地存在蟲蛀、酸化、絮化等問題。對此，圖書館館長李志鴻指出，該館無修補古籍的專門人才，因而難以開展古籍修復工作，又表示該館有對職員進行古籍保護常識培訓的計劃。
2014年12月28日，惠州市慈雲圖書館成立古籍文獻修復室，負責該館的古籍修復工作，亦接受市民自藏古籍的修復請求。2019年7月31日，該館首次獨立舉辦古籍修復知識普及、成果展示及印刷術「古法今用」體驗活動。8月，該館在2019南國書香節暨第九屆惠州書展上首度公開展出《杜詩集說》《人天共寶》《史通削繁》《羅浮山志會編》等館藏珍稀古籍、後三者的翻印本及「惠州古籍文獻全文資料庫」，並設立有關展區展示古籍普查成果。

舉辦活動

慈雲圖書館現時舉辦的主要活動為與惠州新華書店合辦的「你選書，我買單」活動。公眾可在惠州購書中心或會展中心（僅惠州書展期間）選購符合該館文獻入藏要求但尚未購入的書籍，之後憑有效借閱憑證在上述選購場合完成登記，即可帶走圖書，借閱期滿後歸還至圖書館；該類活動的購書費用由圖書館承擔，而公眾需接受該館借閱規則之約束。該活動於2016年4月23日首次舉辦，其後通常在特定公眾假期、世界讀書日前後及惠州書展期間開辦。

版權保護

2009年9月，該館制定了館藏文獻複製制度，旨在保護該館所藏書刊的版權。該制度要求任何人士在複印該館藏書時，不得複印書本版權頁，同一本書籍最多只可複印三分之一的內容。此外，該館亦規定複印者不准複印內部資料及非書刊論文資料，而複印善本、拓片及書畫時須經審核批准。
2010年11月17日，有市民向惠州市文化廣電新聞出版局投訴，稱其在慈雲圖書館借到盜版書籍。文廣新局隨即派員至圖書館進行檢查，確認該館借閱處確有盜版書籍，並即時下架有關書本。圖書館方面則稱會考慮追究書商的法律責任。