药师兜

名字

“药师”一词源自佛教中的药师如来，传说中的药师如来能为信徒消除烦恼，免其于受苦，消灾延寿，灭除一切灾劫病苦。カブト是“兜”，一种日本古代武士的头盔。
剧中药师兜精湛掌握使用各种药物以及高级的医疗忍术、禁术。除了有优越的战斗实力（如一人可打败数名暗部忍者），一方面也善于谋略。
在其回忆中，当他刚进入孤儿院时，一名调皮的孤儿乌鲁西将兜盖在他的头顶上，院长药师野乃宇以此取名为“兜”，之后大蛇丸在为他假造身份时定为医疗部队长（与院长是同一人）的养子，因此连带使用这个姓氏。

身世

第四次忍者大战透露身世，兜在年幼时因为不知道父母及自己名字的状况，被孤儿院院长收留。由于视力不佳，刚好院长与自己度数相符，因此院长将自己的眼镜让给兜，并传授兜医疗忍术。在一次帮助木叶忍者疗伤时初次遇见了当时还是木叶忍者的大蛇丸，并且被大蛇丸赏识。不久志村团藏连同大蛇丸和一名油女一族突然出现在孤儿院，要胁曾在谍报部有“行走的巫女”之称、旧名药师野乃宇的院长前去长期侦察岩忍者村是否有拟定大规模作战计划。在对话中团藏查觉窗外的兜偷听后，宣称同时需要一名孩童代替他殉职的部下；并以孤儿院的补助金作为交换条件，促使兜自荐纳入自己麾下并培训成间谍忍者，在云、雾、砂、岩等其余五大国忍者村搜集情报。
五年后，在岩忍者村待命的兜因为失误遭遇袭击，与他交战重伤的敌方忍者竟然就是院长，试着呼叫她，但濒临死亡的院长不认得他，随后兜被其他敌方援军逼退，迷惘的兜独自一人走到了河边思考着自己为何会被最重要的母亲遗忘，就在这时遇见大蛇丸，随后被带到他的基地作为第一位访客。后从大蛇丸口中得知，团藏在兜一离开孤儿院不久，就向院长说出兜是为了他们的补助金才会牺牲自己加入“根”，在院长的请求下，团藏宣称只要暗杀某个人就会解放兜，但那个暗杀对象却是兜，原来团藏一开始就打算让他们同归于尽，为了避免两人相遇把他们分配到不同地方执行任务，院长只能借由照片了解兜的成长过程和安全与否，而照片在中途被团藏换成别人的照片，最终导致不知情的院长去攻击被她误认成双重间谍却又试图解救的兜本人，而大蛇丸原本是奉命解决掉兜和院长之中存活的那一方，但因为看上兜的才能而无意动手。得知一切真相的兜决定接受大蛇丸邀请，加入不隶属任何国家的音忍者村，为了拔去扎于木叶的根，使用大蛇丸赋予了他的全新身份重返木叶，后在大蛇丸的授意下，为了取得“晓”的情报刻意接触蝎。
多年来在大蛇丸身边学会以人体基因的实验体开发出各种禁术，直到大蛇丸死后完成了相关研究，并将长期以来收集的基因移植入体内。

中忍考试篇

兜初次出现于中忍选拔试会场内，以木叶下忍的表面身份前来参加考试，并称连续七次、共花了四年也没考上中忍（至少两次中途放弃），他的队友是赤铜铠及剑美澄，实际上三人均是音忍者村的卧底。甫出场他便遇上了鸣人等九位新毕业的新人，并以热情的态度，利用忍识卡为他们详细解释前来参加考试的考生类型、能力、原属隐村及人数等。但当他谈及音隐村时，似乎说了些轻视音隐村的说话，随即遭到音忍托斯的攻击。他自以为已避开托斯的攻击，但谁不知托斯使用的是音波攻击，使他耳水不平衡、呕吐及眼镜碎裂（事后对大蛇丸透露自己先前不知道会有这些代表音隐村的忍者参赛，因此才会刻意隐藏实力试探他们）。后来第一场考试的考官森乃伊比基的出现，中止了音忍、药师兜及鸣人他们间的八啦给给。
到了第二场中忍考试──“死亡森林”临近结束时，他遇上了有“地之卷轴”、但没有“天之卷轴”（通过考试所需之两卷轴）的鸣人他们。佐助得知兜已取得了“天之卷轴”及“地之卷轴”，就提出跟兜交战的要求，但却被兜点出并没有彻底下定决心，并建议他们想取得“天之卷轴”，应该到终点塔之附近埋伏，因为那里有比较多的考生正赶赴终点。不过，兜亦指出那里也有其他跟他们相同想法、并在那里埋伏的考生，所以为了自身安全要和他们一同前往终点之塔。
就在差不多到了塔附近之时，遇上了来自雨隐村的下忍篝、梦多及胧。因这三名雨忍不擅长近身攻击，所以他们使用了自己擅长的幻术及分身术，并把自己的真身隐藏起来。他们的目的就是想利用分身大量消耗鸣人、兜他们的体力，等鸣人他们的查克拉用尽后，便现身解决他们。兜在与分身的战斗中，为了保护鸣人他们而被偷袭受伤。后雨忍三人的真身被发现，并被漩涡鸣人以连踢击败，成功取得“天之卷轴”。兜及鸣人四人顺利到下一场考试的试场。
中忍预赛考试前夕，兜与队友私下跟预谋夺取佐助的大蛇丸会面，并汇报了佐助的情况及表现。之后兜以负伤为由先行退出第三场考试的预赛，鸣人为他感到遗憾；但实际上兜在稍早与大蛇丸会面时便已治好负伤，且拥有上忍实力的他在该届考生中可能只有我爱罗能匹敌。

木叶崩溃篇

退出中忍选拔后，兜就一直活跃于大蛇丸身边，并跟砂之上忍叶鬼保持联络，作好音忍、砂忍联手合攻木叶隐村的准备，大蛇丸曾警告他不要做出违背目的的事，否则会杀死他（但后来戏说只是玩笑话）。在佐助因中了大蛇丸的天之咒印于医院休息时，兜看着大蛇丸的未来容器──拥有写轮眼的宇智波佐助就想到了自己而表示“太过优秀其实是很悲哀的”，他解决了旗木卡卡西派来看守病房的四名暗部忍者，之后看似要将刀刺落在佐助身上，实际上是把刀往后瞄准抛向已经前来病房的旗木卡卡西，然而在卡卡西眼前的“兜”是使用了死魂之术令一位已故暗部暂时复活并整型而成的替身，此时又操纵了另一名已故暗部转移了卡卡西的注意力，真正的兜扮成倒在地上的暗部，并把握住适当时机跳窗而逃，卡卡西亦自言就算真的对上兜未必能够击倒他。
在第三场正式考试开始时，兜再度扮成暗部并出现于会场，他顺道医治了身有内伤的日向雏田，但被犬冢牙的忍犬——赤丸识破了身份，因此立即把牙及赤丸击晕。及后当大蛇丸开始行动时，他便以幻术·涅盘精舍之术使会场所有人陷入沉睡，然后跟观众席内隐藏的音忍及砂忍一起行动。但他的身份很快就被在场的卡卡西揭穿，当大蛇丸的行动失败、双手被三代目火影废去后，兜跟砂隐村的叶鬼一同离去。

传说三忍篇

木叶之战后，参战的三个忍者村都蒙受损失，砂隐村亦向木叶隐村投降。此时大蛇丸的双手被三代的尸鬼封尽废去，不但要面对难以忍受的痛楚，而且也使不出忍术；兜作为大蛇丸身边的心腹及医疗忍者，他特制各种药物，但只能稍减大蛇丸的痛楚。最后决定一起前往寻找“传说三忍”之一、拥有高超医疗忍术的纲手，让她治疗大蛇丸的双手。后来他们在短册街的城堡处找到了纲手，大蛇丸向纲手提出条件，只要她肯答应医治，就可以把她已死、心爱的人──断及绳树复活，以及不会摧毁木叶村为条件。尽管纲手很想见到亲友，但她知道大蛇丸是不会轻易放过摧毁木叶村的机会，后来她便假装肯医治大蛇丸，然后趁机偷袭，此时兜看出纲手的偷袭，立即掷出手里剑支开大蛇丸及纲手，纲手跟大蛇丸、药师兜之战瞬间展开。
兜认为在城堡的地方不利于跟具有怪力的纲手对战，于是便把纲手诱至山丘处，跟纲手且战且走至山丘后，他服下兵粮丸，并使出具攻击力的医疗忍术，把查克拉注入纲手手及腹的肌肉中并加以损伤，及后更对纲手胸口施以一掌，使其难于呼吸，纲手对于兜的高超医疗忍术及身手，纲手也感吃力，但以其绝技──乱身冲将查克拉化成电力注入兜体内，麻痹其神经系统，令兜不能自由活动，但凭兜的医疗知识很快就突破麻痹状态，当他正想进行反击时被刚好赶到的自来也、静音及鸣人击退。
同时面对两名传说三忍－自来也及纲手，兜决定先麻痹纲手的攻击，向她展示她最恐惧的血液，顿时纲手全身颤抖、动也不能动，只能任人攻击。兜也向鸣人揭露自己的真实身份，并嘲笑鸣人只是个无能的小伙子，没有当忍者的才能，被兜挑衅的鸣人以多重影分身术攻击兜，但就如自来也所说鸣人的实力和兜相差太远，完全起不到作用，因此自来也决定自己来对付大蛇丸，让静音与兜对战；另一方面，兜也协助大蛇丸召唤巨蛇，巨蛇袭向自来也他们，而兜袭击带着纲手逃离的静音，躲过静音的毒雾，然后从地中抓着并打断静音的脚筋使她重摔在地上，并虐打大腿骨受伤、小腿伸直肌又被打断的纲手，鸣人前来阻止，兜要鸣人放弃成为火影的梦想、舍弃同伴逃走。尽管如此，鸣人依旧强硬地站在纲手面前保护她，鸣人矢志要赢得纲手身上的项链、成为火影，奇迹地接下了兜的致命攻击，并以完成的螺旋丸给兜重创一击，伤及其内脏，连兜的医疗忍术也无法完全自愈。但兜在与鸣人接触的一瞬间已用查克拉手术刀把鸣人的心肌切断，使鸣人在攻击后亦不支倒地，兜以为鸣人死定了，但纲手为鸣人流的眼泪唤醒了其体内的九尾，鸣人亦逃过死门关，纲手的精神亦被唤醒了、对血已不再害怕，并为鸣人赌上性命。纲手利用创造再生自愈又召唤出通灵兽蛞蝓，自来也也召唤出蛞蟆文太，兜见状立即协助大蛇丸召唤通灵兽──万蛇。一场混战后，大蛇丸及万蛇均被纲手、自来也联手击败，兜立即救醒大蛇丸，并与大蛇丸一同撤退。

佐助营救篇

自三忍一战后，兜正式退居幕后，在大蛇丸身边服侍及为其医疗。因为大蛇丸双手的痛楚日增，所以在宇智波佐助还未来到音隐村前，决定为大蛇丸挑选暂时的容器。他从牢中释放了许多被囚禁的忍者，以放胜利者离开为理由，让他们互相残杀，最后只剩下一名忍者──幻幽丸。幻幽丸答应奉献自己给大蛇丸作容器，以换取释放其他被囚禁的伙伴，终亦成为大蛇丸的新容器。
除此之外，兜亦为“五音忍”之一、拥有血继限界──尸骨脉的君麻吕治疗。君麻吕本是大蛇丸容器的选择之一，在身负重症后被大蛇丸所放弃，之后一直在兜的治疗下生存着，后来被兜怂恿，在协助把佐助带到音隐村的途中丧命。

天地桥之会

正如赤砂蝎临终前对小樱所说，他在大蛇丸身边安置了一名卧底，而兜就是他口中的那名卧底。事前大和、鸣人他们不知此事，策划由大和变身成“蝎”，前往天地桥跟卧底会面，当他们知道兜原来亦是蝎派去的卧底深感惊讶，随后兜跟化成“蝎”的大和展开谈话。然而，大蛇丸却突然在兜身边出现，而兜瞬身走到“蝎”的身边，表面上是要与“蝎”一起对付大蛇丸，但兜这一着反而是冲着“蝎”而来，并向“蝎”施以突袭，大和伪装成“蝎”的身份被识破，兜跟大蛇丸联手对付他，以及隐藏着的鸣人、佐井及樱三人。兜向他们透露，自己本来确实是中了蝎的忍术作为卧底，但在大蛇丸的帮助下解除忍术。面对大蛇丸，鸣人无比的愤怒使他现出了其中三尾，兜见状欲对鸣人施以偷袭，然而单凭鸣人强大的查克拉便把兜击得飞开，不过兜的伤并不重，只消一刻时间便自我治愈了，亦了解到真正的蝎是不会再来，因为已经被眼前的这些人干掉了。他在一旁目睹进化成四尾的鸣人，跟拥有蛇身的大蛇丸对战，并称这是“怪兽间的战斗”。一场大战过后，大蛇丸体力不支而退；而兜在救治被四尾鸣人所伤的小樱后（为了利用他们干掉更多“晓”的成员），便前往照顾大蛇丸。

大蛇丸之死

三年期限已到，大蛇丸的容器面临极限，兜加紧为大蛇丸配制各种药物。却不知佐助就在大蛇丸处于最不适时，破了其不尸转生之术，杀死大蛇丸并夺去其一切力量。当佐助从大蛇丸房间走出来的一刻，兜明白到经过他面前的已经不是大蛇丸，而是实力比大蛇丸更厉害的佐助。对从小当过不同国家的间谍、无所归依的兜来说，顿感再次失去人生目标及身份。然而他想起了鸣人既然能借由超越自身的力量、找到自己的真正身份，自己同样也可以做到。于是他便把大蛇丸剩下的躯壳移植到自己的左半身，意图得到大蛇丸的力量，甚至超越他。但他却不擅于操控从大蛇丸移植过来的躯壳，因此却反给大蛇丸慢慢侵蚀。此外他也私下跟正追踪佐助的鸣人、雏田和大和会面，把详细介绍“晓”成员的资料本（但没有记载阿飞的资料）送给鸣人，以作为鸣人令自己有所“领悟”、及重新寻找身份的“礼物”。鸣人他们欲逮捕兜回木叶，但兜却以替身术避开，并且表示只要他能熟练运用大蛇丸的力量，便会和鸣人认真一战。但他表示要先对付佐助，鸣人想问兜要对佐助做什么，但他却消失在众人面前。

第四次忍界大战篇

487话时兜逐渐能够掌控与大蛇丸形式相似的力量，身躯似乎已经和蛇的形态产生融合。他在泷忍者村杀人取尸后和阿飞对峙时，自称已经超越二代火影和大蛇丸，以“秽土转生”召唤迪达拉、蝎、宇智波鼬、角都、长门。并且以提供阿飞目前缺乏的战力来换取佐助（据他说法为希望得到佐助为研究对象）交涉条件，对阿飞提议携手合作。阿飞本来因他以佐助为目标而想拒绝他。但兜手上握有秽土重生的宇智波斑，最后这个提议获得采纳。交换条件是战争结果出炉前不能与佐助碰面，以及必须接受阿飞的监视。由于兜对转生者的束缚力不够，于是绑架前来侦查御手洗红豆，并吸收她身上咒印的大蛇丸查克拉。
其后药师兜与宇智波佐助及用别天神摆脱秽土转生的宇智波鼬交战，兜在交战后不敌伊邪那美，同时被宇智波鼬用幻术控制解除秽土转生，除了宇智波斑之外，所有被秽土转生的灵魂都已解除秽土转生，但宇智波斑知道如何脱离秽土转生的控制，在秽土转生即将解除之际，终止了与转生者之间的通灵契约而得以继续留在战场，随后以解邪法印重生的大蛇丸解除了兜的仙人模式，取回自己的查克拉后与鹰小队同行。
兜在伊邪那美的幻术中待了一阵子后找回自我并改变初衷，于佐助濒临死亡之际（被宇智波斑刺穿），用自己的医疗忍术以及研究有成的初代火影细胞保住佐助的性命。

大战后

大战过后，兜回到木叶重建孤儿院，成为孤儿院的院长。其后接收鸣人带回来的一众宇智波进克隆人，负责教育他们。