丙子戰爭

背景

1619年的萨尔浒之战后，明朝对原来辽东地区以及朝鲜的影响力大为下降，女真族的后金政权开始强大起来。1627年，后金君主皇太极遣兵入侵朝鲜，朝鲜被迫与后金议和，与后金结盟。但当时朝鲜由亲明的西人派执掌政权，依然保持与明朝的关系，收留明朝战败逃至朝鲜的将领，对后金持敌对态度。
1628年，朝鲜依据与后金的协议，开市于中江。同年，因毛文龙被袁崇焕处决导致明军陷入混乱，皇太极计划趁机进攻明朝，向朝鲜征调兵船。朝鲜仁祖故意拖延三日后才接见后金的使臣，并对他说：“明国犹吾父也。助人攻吾父之国，可乎？船殆不可藉也。”
1632年，皇太极派巴都礼、察哈喇等人前往朝鲜颁定贡额。仁祖仅同意贡献贡额的十分之一，推托说金银、牛角不是朝鲜的特产，拒绝献出。皇太极大为光火，于次年致书仁祖，责其减岁币额，并窃参畜、匿逃人之罪，欲罢遣使，专互市。朝鲜索性拒绝同后金在会宁城的互市，此后又多次拒绝互市，并在京畿、黄海、平安三道加筑白马等十二城，以加强对后金的防备。
1635年，皇太极攻察哈尔，林丹汗之子额哲献传国玉玺投降。各贝勒与蒙古王公皆建议皇太极称帝，皇太极遣英俄尔岱通报朝鲜，朝鲜群臣皆言不可。朝鲜仁祖将英俄尔岱囚禁在议政府，英俄尔岱等人夺民间之马，破门北逃。仁祖派人追上，宣布不承认1627年的城下之盟。英俄尔岱逃回后金并报告皇太极，皇太极大为光火。

攻入朝鲜

1636年四月，皇太极称帝，改国号为大清。当时朝鲜的春信使罗德宪、回答使李廓正在盛京，参加了登基大典。罗德宪、李廓二人坚决认为明朝是朝鲜的宗主国，拒绝向皇太极行三跪九叩之礼，而当其是朝鲜一国上下也是群情汹涌，掌令洪翼汉就上斥和疏言“臣堕地之初，只闻有大明天子耳...今乃服事胡虏，偸安仅存，纵延晷刻，其于祖宗何，其于天下何，其于后世何？...臣愚以为，戮其使而取其书、函其首，奏闻于皇朝。”另外还有一百三十八名太学生联名以及诸多官员上疏，请斩使焚书，这使皇太极非常愤怒。
同年十一月，皇太极以朝鲜违背盟约为由，准备入侵朝鲜，先遣回朝鲜使臣李廓，通报仁祖。腊月初二日，派济尔哈朗守盛京（今沈阳），阿济格、阿巴泰守辽河入海口以遏明军，皇太极亲自率领清军十二万入侵朝鲜。皇太极令多尔衮、豪格分统左翼满洲、蒙古兵，从宽甸入长山口；户部承政马福塔、英俄尔岱等率兵三百人，装扮成商人，突袭朝鲜王都汉阳城；多铎、岳讬等人率数千兵马接应。皇太极与代善率其他各路军马进攻朝鲜。
腊月初六日，朝鲜边境望见清军，举二把烽火示警，朝鲜都元帅金自点不予理会。腊月初十日，清军主力迅速渡镇江。十二日，兵至郭山城，定州、安州投降。不过在另一路，义州府尹林庆业死守白马山城抗击清军，清军始终无法攻陷义州。林庆业向都元帅金自点、副元帅申景瑗请求增援，但金自点等人希望独吞战功，未派兵往增援。又因金自点漠视烽火、太晚递送状启，导致朝鲜朝廷直到十二日才得知清军急袭。
腊月十三日，朝鲜仁祖得到清军入侵的消息；都元帅金自点派人向仁祖告急，奏称清军攻至安州。仁祖大惊，令沈器远负责京城汉阳的防卫，同时还命令老弱之臣可以前往江华岛避难。翌日，仁祖得知清军已过松都（今开城）的消息，派人将宫眷、神主、王族迁往江华岛，自己则退往南汉山城。仁祖车驾过崇礼门时，马福塔所率的突袭部队突然出现在城外。仁祖一面令申景禛率兵出城防御，一面派崔鸣吉前去劳军，希望拖延时间。马福塔给出的答复是，要求仁祖派一名王弟、一名大臣为人质前来。乘和谈之机，仁祖自己向南汉山城逃去，当夜初更逃到该城。翌日，仁祖听从金瑬的建议，准备逃到江华岛去，但由于暴雪大降、路途难行，只得固守南汉山城。又派遣绫峰守李偁号称王弟，以刑曹判书沈諿加大臣衔出使清军求和。皇太极斥责朝鲜在丁卯年派出假王子为人质，又诘问沈諿，李偁是否是假王弟，沈諿不能答，并自己承认“我既不是大臣，绫峯君也不是王子。”皇太极诘问投靠清人的朴兰英，朴兰英却坚称李偁是真王弟、沈諿为真大臣。皇太极大怒，杀朴兰英，驱逐朝鲜使者，并坚持要求朝鲜送王世子李溰为人质。
为了笼络人心，仁祖亲自登上南汉山城城楼鼓舞士气，又赦免都元帅金自点、副元帅申景瑗、平安兵使柳琳、义州府尹林庆业互相倾轧之罪，谕以急速进兵抗敌。又发檄各道，要求入兵增援。虽然如此，仁祖和群臣都对时势持悲观态度。他召集群臣，问是否因答应清方要求。群臣或主战或主和，莫衷一是。十九日，清军前驱部队到达南汉山城下。仁祖亲自登城，朝鲜军用火炮击退了清军的进攻。崔鸣吉等主和派大臣建议与清讲和，清朝要求送出世子方可议和，震惊朝鲜上下。

劝降未成

二十日，皇太极率清军主力至松都，又遣使劝降。仁祖拒绝，并召都元帅金自点、副元帅申景瑗率军回援，令各地军队前来勤王，又令金庆征前去南部三道召集水师，准备与清军决战。留都大将沈器远派人送状启，在状启中，他故意夸大了自己的战功，群臣无不激愤。
二十四日，南汉山城内开始出现粮草不足的情况。朝鲜各处守军见国王被围，纷纷前来支援。公清兵使李义培畏惧清军，驻扎竹山不进兵。江原道营将权井吉领兵到俭丹山，遭清兵击败。公清监司郑世规领兵在险川，依山布阵，遭清兵击败，全军覆没，郑世规本人仅以身免。
二十七日，皇太极率清军主力至临津江北岸。此时南汉山城几乎断绝了外界的音信，二十八日，留都大将沈器远送来击退清军进攻的消息后，体察使金瑬派兵出北门而战，遭到清兵的偷袭，大败。都元帅金自点、副元帅申景瑗在黄海道的洞仙击败清兵，庆尚兵使闵栐亦率兵至忠州水桥。

攻破汉阳

崇德二年（1637年）正月初一，皇太极趁江面结冰之际渡江攻汉阳，沈器远弃城退驻光陵。此时多铎部也已攻破平壤，与皇太极会师。皇太极率兵驻扎炭川，俯瞰南汉山城中。仁祖听从吏曹判书崔鸣吉的建议，派洪瑞凤、金荩国、李景稷等前去求和。四日，清大军渡汉江。驻扎汉阳东二十里江岸。此时朝鲜各道的勤王之军陆续赶来。七日，清兵击败全罗监司李时昉部。南兵使徐佑申、咸镜监司闵圣徽合兵，屯兵杨根、薇原，号称二万三千；平安道别将领八百余骑至安峡；庆尚左兵使许完领兵到双岭，未及交锋，军败而死；右兵使闵栐力战良久，亦败死；忠淸监司郑世规进兵龙仁、险川，亦战败；平安道观察使洪命耉，与清兵大战于金化，兵败阵亡。另一路的清军多尔衮、豪格左翼军由长山口克昌州城，败安州、黄州兵五百，宁边城兵千，截杀援兵一万五千，七日与皇太极会师。贝勒杜度率兵送来大炮，清兵合力围攻南汉山城。
十三日，仁祖遣遣洪瑞凤、崔鸣吉、尹晖等出城议和，遭到拒绝。十九日，再遣李弘胄、崔鸣吉、尹晖求和。二十日，仁祖正式决定向清朝称臣；翌日，遣李弘胄出使清营，献书投降。皇太极要求仁祖下城亲自投降，仁祖怀疑是奸计，因此不接受。二十二日，皇太极遣多尔衮袭破江华岛，俘虏朝鲜王妃、王子、宗室、群臣家属等众。前右议政金尚容、前右承旨洪命亨、司仆寺主簿宋时荣、前司宪府掌令李时稷等人不愿成为清兵的俘虏，自杀身亡。
皇太极再次要求朝鲜仁祖亲自出城投降，并威胁若是不从，城破之后便要屠城。世子主动要求出城做人质，表示：“泰山既垂于鸟卵之上，国步谁措于盘石之坚，事已急矣！予既有弟二人，又有一子，亦可奉宗社。予虽死于贼，尚何憾焉？”二十三日，仁祖决定送世子李溰代他出城投降，称：“予为宗社、生灵，出不得已之计矣……渠为父出去，不害于义理，而人子之至情也”。但英俄尔岱传谕，一定要仁祖亲自出城，并威胁说皇太极准备回到盛京去，若不答应就不要再求和了。在此期间，清兵又发动了几次攻城，希望迫使朝鲜投降。仁祖只得在二十七日答应了这个要求。次日，皇太极同意了仁祖的求和，并要求他亲自出城。清朝提出“三田渡盟约”，要求朝鲜以“长子及再一子为质”。

战后

清朝将“六十万”（数字也许有夸张）朝鲜人押回沈阳市场贩卖，其中还不包括被清军中的蒙古人掠往蒙古的朝鲜人。还掠走朝鲜大量物资，后来朝鲜政府向清朝支付赎金赎回了一些人。根据协议，朝鲜被迫与明朝断交，接受清朝的册封，成为清朝的藩属国。根据规定，朝鲜使用的年号由明朝年号改为清朝年号。朝鲜朝廷要求斥和者自首，洪翼汉、尹集、吴达济三人自首，被清军抓往盛京杀害，号称“三学士”。
虽然朝鲜屈服于清朝的统治，但朝鲜人对清朝非常反感，称呼清朝为“胡虏”。这种敌对的称呼和态度，在《朝鲜王朝实录》中比比皆是。朝鲜方面仅仅在外交上使用清朝年号，在国内则不使用，称为“某某王某某年”，例如“仁祖大王十二年”等等。不少士人反满崇明，甚至使用“崇祯”、“后崇祯”等年号，致使“崇祯”这个年号被朝鲜两班士大夫沿用数百年。朝鲜孝宗可能因为在满洲担任过人质，余怒未消，其在位期间，朝鲜甚至密谋起兵，联合日本江户幕府、南明势力反对满清，后来又计划响应三藩之乱和东宁王国。但北伐计划最终因财政困难而计划搁浅。
将昭显世子扣为人质，既是清朝钳制朝鲜的手段，也是清朝要挟朝鲜攻打明朝等行动的筹码，同时又含有清朝扶植朝鲜亲清势力的意图。
在外交方面，朝鲜建立迎恩门以迎接清朝敕使，在1637年至1881年之间，朝鲜先后161次接待清朝敕使。朝鲜每年四次向清朝进贡（1644年后改为每年一次），直到甲午战争清朝战败为止。而在甲午战争清朝战败之后，迎恩门被拆毁，改建独立门。