港鐵車廠

港铁营运7条重型铁路线、2条中型铁路线、1个轻铁网络和1个缆车系统，因此设立了多个车厂，以供存放列车及对列车进行维修、清洗等工作。港铁目前共设有9个铁路车厂及2个缆车车厂，并隶属车务处管理，为港铁市区线、机场快线、轻铁和昂坪360提供服务。其中何东楼车厂、八乡车厂、大围车厂和屯门车厂原由九广铁路公司兴建及营运，于两铁合并后租予香港铁路有限公司（港铁公司）继续营运。
除了铁路服务外，港铁也提供巴士服务，包括4条港铁接驳巴士线（由九巴营运）及13条港铁巴士线，所以也设立了数间巴士车厂及停泊处。

何东楼车厂

何东楼车厂是港铁东铁线车厂，位于新界沙田区火炭，邻近火炭铁路大楼（原九铁总部）以及东铁线火炭站和马场站，上盖为住宅银禧花园、骏景园及御龙山。
何东楼车厂原址为称为何东楼的著名建筑，是香港富豪何东旗下物业，约于1970年代拆卸，并兴建九广铁路英段车厂，即现今港铁何东楼车厂。

九龙湾车厂

九龙湾车厂是观塘线的车厂，位于德福花园平台之下、旁边是九龙湾站和港铁公司总部。
车厂除了为列车提供停车、测试、洗车、预防及纠正性维修设施外，亦会为所有都城嘉慕电动列车（直流电）（包括3辆迪士尼线列车）、在将军澳线服役的13列Rotem电动列车和在观塘线服役的北车长客电动列车进行大型维修。安排此车厂担任此工作是由于九龙湾车厂为前地铁的第一个车厂，有最齐全的维修机器。
在当初建造的时候，车厂亦预留部分空间供东九龙线使用。

荃湾车厂

荃湾车厂是荃湾线的车厂，位于新界荃湾区荃湾北部一带，1982年5月10日启用。车厂旁边是荃湾站，上盖为大型屋苑绿杨新邨。
车厂可容纳40多辆港铁列车，为列车提供停车、测试、洗车、预防及纠正性维修设施，包括更换重型设备时用的起重及顶升设备。荃湾车厂内设有港铁员工康体中心，供港铁职员作消闲联谊之用。
1998年至2001年，荃湾车厂曾经为所有都城嘉慕电动列车（直流电）进行全面性的翻新工作。2011年，荃湾车厂为第一编组的中国制列车进行车门、座位及地板重装工程。2016-2018年，荃湾车厂曾经为部分都城嘉慕电动列车（直流电）进行新讯号系统安装工程。

柴湾车厂

柴湾车厂是港岛线的车厂，位于香港岛东区柴湾北部，车厂上盖为大型屋苑杏花邨第1至18座（统称上杏花），旁边为杏花邨站，由青木建设和飞鸟建设合营的公司承建。此厂是港铁所有使用三菱制牵引系统的现代化列车专属定修厂（大修仍由九龙湾车厂担当）。车厂内设有8个维修车坑及14条泊位轨道，为列车提供定修及停泊空间，并设有试车线。另外，厂内亦设港铁员工康体中心，供港铁职员作消闲联谊之用。
2008年至2011年，柴湾车厂为所有都城嘉慕电动列车（直流电）进行多用途空间改造工程。

小蚝湾车厂

小蚝湾车厂是东涌线、机场快线和迪士尼线的车厂，位于大屿山东北部的小蚝湾填海地，机场快线和东涌线主线北侧，行政上属于离岛区，但亦接近荃湾区。该车厂由梁蝰涛建筑师楼设计，承建商是瑞安建业和亚太建设。此地并非与迪士尼线路轨连接，迪士尼线列车来往车厂，须途经机场快线和东涌线欣澳站至小蚝湾的一段共用路轨。本厂除用作机场铁路列车日常维修外，亦是置放4卡港铁现代化列车及轻铁列车封存车卡（其中轻铁曾严重受损的封存车卡1112已经改用新车架完成复修，并于2016年重新投入服务）的地方，供海运到港的新直流电列车上岸。另外，车厂亦设有一个大型机务段，供所有在港铁市区线使用的机车停泊及进行定修、大修之用。
由于位置偏远，港铁因此安排了员工巴士，接载员工和承办商来往车厂至东涌站。

将军澳车厂

将军澳车厂是将军澳线的车厂，位于新界将军澳南部小赤沙，旁边为港铁物业日出康城和康城站。此车厂拥有前地铁系统各厂中最多的泊车位数目，共设有31个泊位，以及4条定修车坑。由于车厂并不位于将军澳线主线附近，所以康城站兴建前是以一段支线接驳至将军澳站附近，该段支线现成为来往康城站的列车行驶路线。

八乡车厂

八乡车厂是西铁线的车厂，位于新界元朗区八乡元岗附近，即港铁西铁线锦上路站东南面，为西铁线的列车提供维修服务，每日24小时运作。
车厂除了为列车提供清洗、测试、维修的地方外，亦会为所有SP1900/SP1950/KRS991/1151/1141A型列车进行大修。
每年12月均会举行圣诞儿童同乐日，供员工及其家属还有受邀的非港铁员工家属儿童参与。

大围车厂

大围车厂是马鞍山线的车厂，位于新界沙田区大围显径站与大围站（目前为马鞍山线南面终点站，未来大围站将会成为屯马线的中途站）间。每日24小时运作，为马鞍山线的列车提供维修服务。

屯门车厂

屯门车厂最初原称“轻铁车厂”，之后改名为“九广铁路屯门维修中心”，后因两铁合并再易名为“屯门车厂”，位于屯门散石湾龙门路，邻近轻铁车厂站；为轻铁的维修工场及控制中心所在地，亦有巴士维修中心（下详）。于运用库上方，建有九铁公司与新鸿基合作的住宅新屯门中心。

石岗列车停放处

此车厂为广深港高速铁路香港段的设施提供基本及紧急检修，及支援停放列车之用；至于大修及定修，则分别由中车四方，以及名义配属的广州南动车所担当（后者由港铁外站员工负责，而非广州局集团员工），与国铁列车维修安排看齐。而且，该处会设有高速铁路的紧急救援站。车厂位址为原菜园村及其周边位置。

机车行车室

机车行车室（Locomotive Running Shed）是原九铁维修柴油机车的地方，位于罗湖梧桐河和东铁线主线之间。原来的行车室位于红磡站旁边，因为沙中线工程拆卸。

屯门巴士厂

位于屯门（轻铁）车厂之内，是港铁巴士（新界西北）的维修中心。

大埔巴士厂

位于大埔区大埔工业邨大华街与大福街交界、九巴大埔车厂对面，原“大福街公共运输交汇处”（面积 4000平方米），供港铁接驳巴士停泊及进行各类型之维修。车厂包括一个可容纳9辆巴士的维修工场、两层高的办公室大楼、零件仓、巴士清洁、入油及污水处理设施，供港铁接驳巴士使用，毋须再驶入屯门车厂进行大修。港铁已于2012年7月为重置工程进行招标，于2012年底兴建，2015年6月28日落成开幕。
原来的车厂位沙田火炭新竹街和黄竹洋街交界，隔邻为前城巴车厂；政府为兴建公屋骏洋邨，于2014年收回该地皮。由于港铁接驳巴士现时只服务大埔区，接驳居民到东铁线大埔墟站，故新车厂选址偏向于该区重置。

洪水桥巴士厂

在洪天路紧急月台旁边。多辆港铁巴士会停泊在该处作紧急调动之用。

货场

东铁线在2010年6月15日前曾经兼营货运服务，因此东铁线沿线设有多个货场，供处理货运列车的始发、维修货运列车（及机车）等。

罗湖编组站

位于罗湖的编组站可调度及容纳约180个货卡，由该处发往不同目的站。货场配备了40吨楼底式集装箱吊机、叉式铲车、40吨前置式集装箱吊机、冷冻柜充电设备、货物储仓、集装箱堆场，还建有12个趸船停泊位，方便提供贯通海、陆的货物联运服务。自2010年6月15日港铁停止货运服务后，罗湖编组站现时就只用作停放机车和东铁线载客列车。

西湾河临时车厂

在港岛线1985年5月局部开通前，由于当时位于杏花邨的柴湾车厂尚未完工，当时的地铁公司在西湾河（今鲤景湾）建造了一座临时车厂，以供工程车辆及刚上岸的列车进行整备之用；同时，亦为此修筑了一条专用线接驳太古站。后来，柴湾车厂投用，此临时车厂即被拆卸，成为港铁唯一一座被拆卸的车厂；而原来的临时专用线及其隧道口则被回填，仅余一小段（即太古侧线）用作开出繁忙时间特别班次列车。

红磡列车停放处

列车停放处会用作停放18抽屯马线列车，以及设置维修保养设施，例如验车线、小型维修线，以及机房和供电分站，而这些设施不能由港铁公司现有车厂提供。
在此之前，九铁公司最终方案拟稿亦曾建议在启德站附近商业区地块兴建启德维修中心，但后来因该处地下水位过高，而被在钻石山设列车停放处的计划取代。遭区议会及居民反对下，最后港铁决定更改选址，改于红磡站附近的原红磡货运站设置列车停放处。红磡货运站本身有13条轨道可停泊列车，其中2条可用于清洁及检查列车，日后转作停放处毋须扩建，亦不须增设任何维修设施及额外建筑物，仅需重新装修、拆卸机车行车室、拆卸重建厂内轨道及与东铁线连接轨道。不过港铁同时要在未来启德站加建一条侧线路轨，以作紧急列车停放处；而八乡车厂亦要预留数条轨道，作为日后屯马线早上出车之用。