台灣教授協會

陈水扁政府任内

陈水扁当选总统，台湾遭遇第一次的政党轮替，于会刊内可见，许多成员皆表示欢喜，且在其创会十周年会员大会声明中表示，彼时总统大选，台湾教授协会将关注焦点置于“两岸关系”上，陈吕配主张两岸为互不隶属的国与国关系，所有改变皆需要台湾人民的同意。协会认为，三组候选人的立场皆与中国所主张的“一个中国三段论”有差距，最后又以距离最远的陈吕配当选，此为大大拉开了两岸关系的空间。此时协会对“一中政策”的讨论，认为：一、中华民国若是主权独立的国家就不能导向“一中”；二、“宪法一中”是开历史的倒车；三、接受“一中”主张无助于挽救经济衰退。
协会此时期也时常拜会政府官员，例如陈水扁、杜正胜、吴钊燮等等。协会会员也受政府延揽，进入体制，使得台湾教授协会在此时期中，与政府关系较为密切。但进入政府执政团队的会员，无法再如以往参与会内事务，加上许多成员对于陈水扁政府的高度期待，甚至认为协会已达成阶段性任务，须重新摸索定位。但在2006年后，协会会员对本土政权的心情，从先前的热烈期待转为失望，因此，由执政团队退下来的、时任会长蔡丁贵也将台教会定位为重新回归实践、执行台湾独立建国的核心理念。
教育改革运动上，协会于2001年6月16日发表〈立即撤换教育部长曾志朗〉声明，主张新政府在教育改革方面不进反退，认为应撤换曾志朗部长，因其删除“认识台湾”课程，忽视本土教育，且拥有双重国籍、教改推动不力等。2002年9月，协会与台湾北社、台湾笔会、台湾东社、台湾中社共同发表〈请为台湾学教育留活路〉声明，主张政府应积极推动台湾学教育、规划正规课程师资，并在大专院校设立“台湾学”相关系所。2003年7月，协会发表〈他们要欢迎教育恶势力班师回朝〉声明，试图抵抗当时保守派学者为打击教改所提出的“教育重建宣言”，台湾教授协会认为教改本质上是正确的，虽说在技术执行层面不甚满意，但仍希望保守派学者能够以学理来进行探讨、辩论，以求国家教育改革之事能够更加完善。
宪政改革上，协会与其他团体共同成立了“全民公投立委减半联盟”，主张政府应制定公投相关法律，且应废除现行的“复数选区”制度，改行“单一选区”制度，而立委的人数也应降低。协会也透过发行〈立委减半 赞！赞！赞！〉问答小手册来宣传理念，也试图游说国、民两党，并发表声明要求时任国会最大党，中国国民党主席连战尽速启动立委减半修法。2002年5月，协会与其他团体共同成立了“台湾正名运动联盟”，发出声明并举办游行，向政府施压，要求政府进行台湾正名改革。
环保运动上，协会积极参与停建核四运动，每年会员参与游行、与其他团体共同举办记者会以外，也参与林义雄所发起的“核四公投、千里苦行”。
在陈水扁连任第二任总统之时，协会也向陈水扁发表声明〈对于阿扁总统520就职演说的期许－我们坚拒四不一没有〉，认为在陈水扁第一任时，提及四不一没有，协会虽不满意，但受限于当时时空背景，仍勉强接受。但四年后，面对升温的国际压力，应向人民、国际主张：一、持续进行“民主深化”工程；二、完成制宪。三、根据民进党台湾前途决议文推动住民自决，并更改国号，同时废除象征统一意涵的国统会与国统纲领。四、加强建立台湾本土意识的教育政策。
2004年，时任秘书长刘聪德认为，此一时期的协会在台湾独立运动中扮演的角色可以是：它本身具有论述公共议题、传播建国理念的能量，可以和民进党执政团队沟通，可以和岛外台湾人团体连系，可以在校园鼓吹学生运动，还可以和本土草根性的组织合作发动抗争行动，可以为建国运动担当有效的宣传、沟通、协调的角色。

马英九政府任内

在此一时间，台湾教授协会从体制内转回体制外，重新回到街头上，尽力扮演监督政府的角色，包括反对美牛进口、抗议国共密会协商，拒绝ECFA等等，且举办许多活动，以确保台湾主权，重申台湾价值的重要性。
首先是2008年10月25日，由民进党主办，台湾团结联盟及多个台湾本土派民间社团协力筹办“1025反黑心顾台湾大游行”。主要诉求是对马英九政府在两岸事务上快速“亲中”、且对于全球金融风暴及2008年中国毒奶粉事件等方面应变不力的质疑与不满，以及中国海协会会长陈云林即将来台举行两会会谈。协会由蔡丁贵、刘重义教授带队参与“反一中教育大队”，刘重义教授表示，中国很多假学历可用金钱买到，但又无法认定，将影响台湾整体教育品质，降低了学生的素质，也将影响社会的道德价值。2009年5月17日，马英九就任一周年的前夕，协会与民进党及许多本土社团发动“517呛马保台大游行”，其主要诉求是“保台湾，ECFA要公投”、“顾主权，唾弃卖台权贵”、“救失业，反对无能政府”、以及“护弱势，反对一中市场”，由协会前会长蔡丁贵带领“独立、建国、挺扁”大队。2012年总统马英九上任第二任期的前夕，民进党、台湾团结联盟以及本土社团于5月19日以及5月20日马英九总统连任就职日发动呛马踹共大游行，游行的诉求是反对马英九倾中卖台政策、反对油电双涨、反对瘦肉精美牛等，台湾教授协会亦参与此次游行。
宪政问题上，协会于2013年7月27日举行“反黑箱协议要生存权利”全民大会，认为“两岸服务贸易协议”贸然地与中国完成签署，引发诸多行业批判，甚至质疑马政府“加速卖台”。时任会长吕忠津指出，马政府这种离谱行径不仅违背民主体制沟通与民主审议原则、漠视广大基层服务业的生存福祉，甚至更严重地危及台湾国家安全。因此要求立法院退回此黑箱协议，重启谈判以保障台湾人民的生存权利。2013年10月13日召开“16趴江内阁已不适任行政院长”记者会，会中公开支持民进党党团于同月10日所提出的倒阁案，认为行政院长仍应有一定程度民意支持，方能顺利推动政务，根据最新民调结果，行政院长江宜桦的满意度仅有15.8趴，时任台湾教授协会会长吕忠津呼吁执政党立委作为民意代表，应勇敢挣脱党纪束缚，站在民意的一方共同支持倒阁，俾使纷扰的政治早日回归宪政常轨。2015年4月14日，台湾教授协会发表“反对台湾加入亚投行”声明，声明中透过经济面、政治面、国际面的角度，反对台湾加入中国主导之亚投行，因为台湾若加入亚投行，将招致无穷尽的政治与国格灾难。协会强调，中共中央总书记习近平推动亚投行和一带一路，就是要实现中国梦，成为世界霸权，台湾应思考，加入亚投行的价值立足点在哪里？台湾的国际责任究竟是什么？台湾希望对于区域政治与经济有何正面与积极贡献？这些因素都必须严正思考。2015年11月7日，发表“谴责一中框架下的马习会”声明，认为两国领导人的首次会面，既不对等又无尊严、也不公开透明，又被设下“一中框架”的政治前提，马英九只求一己历史定位，而不顾国家尊严，呼吁国人要密切注意马习会的两个重点：一、马英九是否只求私利，出卖台湾？他搭的到底是什么样的桥？二、马英九是否成为中国棋子，背弃美日等友邦，让台湾孤立于亚洲？
另外，2014年12月24日，协会提出“台湾宪法草案”全文，由于“318学生与公民运动”期间呼应召开公民宪政会议主张，召集会员成立公民宪政会议工作小组，制定一部能展现台湾做为一个21世纪现代民主法治国家的宪法草案，包含国家定位、基本人权、国家体制、地方自治以及原住民族保障与自治五部分。
教育改革上，协会于2012年2月12日，召开“反对控制语文促统”记者会，质疑马政府破坏台湾语文的主体性，不应该为拼经济去接受中国用语或简体字。此由时任会长张炎宪主持，邀请中山医学大学台语系副教授张德麟、彰化师范大学台文所教授周益忠和长荣大学台湾所名誉讲座教授庄万寿一同针对此议题讨论。2012年6月19日召开“马英九黑手介入历史教科书”记者会，认为马英九政府及教育部将黑手伸进历史教科书之审查与修订，例如将“中国文化基本教材”列为必修、要求教科书内容不讲“中国”而讲“大陆”、主张“中华文化”为主体，放弃好不容易建立的“多元文化”共识等等。2014年1月27日，协会发表反对“高中教科书去台湾化”声明稿，其中提出三点声明，表达严正抗议：一、现行高中历史课纲颁布不到三年，新课本施用不到二年，何以草率进行课纲调整？二、停止不合程序、粗暴之课纲“微调”。三、停止使用充满意识形态偏见且非历史专业之用词。四、应明确认定中华人民共和国即为“中国”。
2009年野草莓运动过后，台湾教授协会尝试深化与年轻学子的合作。时任会长吕忠津也于318运动时期，与学生一同进入立法院抗议，并发表“支持青年学生占领立法院行动诉求 号召各界代表召开〈公民制宪会议〉”声明，呼吁时任总统马英九应立刻辞职下台，启动宪政备位机制，并秉持民主原则号召各界代表召开〈公民制宪会议〉，重新办理总统选举，俾使国家重回民主自由正轨。2014年3月24日凌晨，学生占领行政院遭镇压后，协会亦发表“谴责324国家暴力血腥镇压和平学生运动- 全民捍卫民主价值”声明，主张马英九、江宜桦为求通过黑箱服贸协议，不惜破坏宪政，血腥镇压和平的青年学生，两人应对社会道歉并立即引咎下台。呼吁全国人民和青年学生站在一起，捍卫台湾民主，防止马政府将全民驱往独裁之境。除了318运动以外，从前会长陈仪深所述，协会透过陈仪深的接线，与“二二八关怀总会”一同协助创办共生音乐节，其目的是为了以年轻人的方式纪念二二八。陈仪深认为，二二八在新一代年轻人中竟有那么热烈的回响，是台湾社会的新生事物。2015反课纲运动时，协助反课纲运动的年轻人募集保释金。另外协会也与独立青年阵线共同办理许多讲座。
2009年，由于莫拉克风灾重创台湾，协会也针对风灾议题，协助莫拉克风灾募款，执行“台东县八八水灾社区主体性建构暨公民种子培育计划”，并透过莫拉克台风赈灾专案对灾民进行口述历史的访谈、协助出版“八八水灾口述史’新书暨纪录片等等。
协会亦积极支持民主进步党候选人蔡英文，透过成立“学术界支持蔡英文后援会”，支持蔡英文投入2012年总统大选。蔡英文于2011年8月23日参访台湾教授协会。

蔡英文政府任内

2016年政党再度轮替后，协会依旧扮演监督的角色，希望给立场相近的蔡英文总统一定的支持，做为推动社会向前的力量。在“同婚”和“劳动法修恶”这两点上，协会于2016年12月2日发表“扬弃婚姻平权、丢了政治诚信”，声明表示：婚姻平权承诺的是全体国民的平等权利，我们必须殚精竭虑穷尽法律的可能达致这个理想，而非被现有法律圈限认知与想像，这才是文明的进展，也是政治存在的意义，实践的过程也将成为我们共同体的历史。作为领导者，当选之后必须负起阐明价值与排除障碍的责任。 然蔡总统却让此选前承诺，再次成为“开放选项”不仅没负起实现政见的责任，且任由特定群体散播恐惧言词，挑起社会恐慌，致大众意见分歧越深，终致分裂为不能对话的双方。如此导致的“无共识”的现象，不能作为违背承诺的借口。谴责蔡英文总统对于同志婚姻议题的逃避。
关于劳动法修恶，时任会长林秀幸认为，蔡英文政权不愿意讨论，而越搞越难看，利用议会政治里用多数暴力的方式来面对议题，其表示民进党已经离开民心，不愿意面对民意，呼吁蔡英文总统拿出魄力进行院际协调，不要让重大政策协商变成多数暴力粗野的呈现。
原住民传统领域争议，协会于2017年3月19日发表“完整划设原住民传统领域是本土政权应有的气魄与价值”声明，认为做为一个本土政权的最大正当性来自于对岛上的历史正义的回复，不应以后设的公有/私有产权形式而割裂原住民族传统领域之空间完整性；政府不仅不该维护不正义现况，更应该主动对台湾社会进行沟通，促成更多公共讨论，厘清传统领域权之内涵，并积极进行立法、修法，落实原住民族传统领域权利。
教育改革上，台湾教授协会2019年1月21日，对于台湾大学校长遴选风波，发表“勿让台大蒙羞管中闵应立即辞去台大校长一职”声明，文中表示针对监察院的弹劾案，管中闵的违法事实很清楚。部分人士为其开脱指出为媒体撰稿并非兼职，刻意忽略管中闵为媒体长期匿名为文，并非具名投稿，不能混为一谈，而身为校长不论在法令上及伦理上都必须要有最严格的要求，否则无法带领台大成为国际一流的大学。台协会呼吁管中闵勿让台大蒙羞、贻笑国际，应立即辞去台大校长一职。协会也于2019年2月27日召开“不顾北京反对，紧抱教学自由”记者会，会中副会长陈俐甫爆料，中共上海主委会跳过中华民国教育部，把台湾的教育单位视为下属单位，随意下达“点召令”要求台校回应，还要求最后通牒、限期答复，已明显在干预台湾的教育单位。协会表示严正抗议，呼吁教育部，应坚定宣示，不容许中共侵犯台湾学术自由。
2019年3月18日，台湾教授协会与其他学者、公民运动者共同组成“台湾公民阵线”。
台湾教授协会经历过第一次政党轮替的挫败后，于第二次政党轮替时坚决担任监督的角色，希望在面对台湾本土政权上，能够在站稳台湾独立、进步议题的理念立场上，持续给与强力的抗衡、监督力量，以求台湾走向一个进步且独立的共和国。

工作方向

持续推展台湾独立运动，推动台湾政治民主，建立三权分立之责任政治体制，并视社会脉动，不定期举办政情评论、学术性研讨会、巡回演讲等活动，略分为：理念传播、主权运动、政治民主、社会正义、教育改造、环境保护、媒体改造等。

主张

政治民主、学术自由、社会正义、经济公平、文化提升、环境保护、世界和平。

学术研讨会

1991：台湾历史与文化研讨会。
1992：制宪运动研讨会、教育权与宪政改造、解剖国大临时会议、宪政改造与劳工权益、国土规划学术研讨会。
1993：从二二八的历史经验谈族群关系的重建、二二八疼台湾重建再生、媒体改造与自由民主。
1994：‘迷惘与追寻─“外省人”在台湾’研讨会、“台湾宪草讨论会”、台湾民族主义研讨会。
1995：“海岸地区保护”研讨会、“原住民座谈会”、“国中课程标准座谈会”、“语言政治与政策学术”研讨会。
1996：“废弃物处理研讨会”。
1997：“修宪与当前台湾政治发展的方向”讨论会、“地方自治与国家发展”研讨会、“公投入宪”研讨会、“科技政策”研讨会、“媒体结构问题座谈会”。
1998：台语科技讲座“internet与资讯发展趋势”、“声援东帝汶公投独立”座谈会、台语科技讲座“按怎教电脑走象棋？”。
1999：“海内外台湾人国是会议”、“感动与感伤－历史学者看美丽岛事件”座谈会
2000：台语科技讲座“精密陶瓷材料的技术与应用”、台语科技讲座“台湾半导体产业简介”、与台湾环保联盟合办“第四波能源革命—为何二十一世纪是永续能源的天下”研讨会、台语科技讲座“未来运输e智慧化”。
2001：“立委减半”研讨会、“大学教育之台湾主体性”学术研讨会
2002：“台湾独立理论与历史”研讨会
2003：“台湾汉文化之本土化”学术研讨会
2004：
2005：举办‘台湾与西洋国家观’研讨会
2006：“观念转型—从基础教育到社会教育”学术研讨会
2007：“新台湾运动”全国乡镇及校园巡回演讲
2008：“高中课程九五暂纲教科书评议”学术研讨会
2009： “戒严时期白色恐怖与转型正义研讨会”、“中华民国流亡台湾60年暨战后台湾国际处境”学术研讨会
2010：回顾台湾社运二十年(1990-2010)研讨会
2011：终止动员戡乱二十周年纪念研讨会、“台湾地位与中华民国体制”学术研讨会
2012：“司法正义与人权- 从扁案谈起”学术研讨会
2013：“2013台湾社会力分析-阅读世代关贱字”研讨会
2014：【台湾政治主体性与认同的建立-杨基铨先生逝世十周年纪念】研讨会、“从特侦组滥诉现象谈检察官之究责”学术研讨会
2015：【318太阳花运动一周年学术研讨会:“重构台湾─太阳花的振幅与纵深”】学术研讨会、“台湾的国家与宪法想像”学术研讨会、“军事占领下的台湾，1945 – 1952 ” —张炎宪教授逝世周年纪念学术研讨会、“殖民‧再殖民‧独立自主”研讨会
2016：“政治与社会共构：重建以人为本的台湾经济”学术研讨会、“转型正义与法律”学术研讨会、“更新主权的想像/实践当代的主ㄉㄨˊ体ㄌㄧˋ”学术研讨会
2017：“战后处理与台湾”学术研讨会、“终结历史错误：废省、废两岸条例运动”研讨会
2018：台日韩跨世代交锋论坛
2019：【威权象征处理与空间景观再造】论坛

极光电子报

于2008年2月开始，每周邀集学者、专家撰文，持续于网络平台上发表论述，文章内容以建立台湾主体性，并对台湾的历史和文化发展、政治和社会现况以及涉及台湾的国际事务做分析和评论，另外对台湾的未来提出愿景和论述。

政治评论

2013年9月17日，台湾教授协会会长吕忠津在“宪政危机，宪改契机”记者会上批马英九的行为是独裁。

批评

被反对者评时常伐异党同塑造舆论，故也被傅云钦、冯光远谑称为“抬轿会”。