台灣團結聯盟

背景

2000年总统大选，民主进步党取得执政权，长期执政的中国国民党首度在野，在大批国民党支持者的抗议下，李登辉辞去党主席职务并离开国民党核心。中华民国首次政党轮替后，当年十月初民进党政府宣布核四停工一事激起朝野严重对立，国民党、亲民党、新党组成在野联盟，提出总统罢免案。另外国民党提出两周八十四小时的工时案也引起中小企业主的不满，政局动乱国政大受影响。本已退休的前总统李登辉透过全国工业区厂商联合会理事长黄宗源与新光集团吴东昇等子弟兵筹组新政党，希望能借此协助执政党稳定政局。黄宗源曾表示，自己的党证编号是三号，一号和二号则是分别预留给李登辉以及萧万长。
创党初期因为李登辉的本土色彩，号召若干国民党内的本土派出走，以及吸引部分偏绿人士组成新政党。台湾团结联盟在2001年8月12日正式成立，首任党主席为李登辉政府时代的内政部长黄主文。

黄主文时期（2001年-2005年）

台联创党初期，因为卸任的李登辉总统仍受媒体关注，全台吹起李登辉旋风。三个半月的时间台联便在2001年的第五届立法院改选中一举斩获十三席立委取代新党成为台湾第四大党。
因当时民进党政府主张新中间路线，台联便与本土社团发起台湾正名运动。由前总统李登辉出任总召集人，于2002年5月11日发起大游行，诉求国家正常化争取深绿支持者的选票。
2004年中华民国总统选举中，李登辉担任召集人发起228百万人手牵手护台湾活动，尽全力辅选民进党陈吕配连任。2004年立法委员选举，台联党当选12席。然而，在选举过程中，当时台联党主席黄主文一再遭批评利用全党资源为其子黄适卓辅选，引发台联内部反弹，加上因提名策略错误造成多达七位台联党的候选人成为“落选头”高票落选，选举结果不如预期，黄主文最后辞去党主席一职，改由台联首任秘书长苏进强接任。

苏进强时期（2005年-2007年）

2005年4月4日苏进强前往日本进行访问并参拜靖国神社，参拜一事引起高金素梅与新党、爱国同心会等统派人士的叫骂与抨击，对此苏进强强调，到靖国神社不是要对哪一个特定的阵亡者参拜，而是要对在神社中三万名台湾英魂的“忠义精神”致敬，与军国主义、战争主义毫不相干，苏进强是台湾第一位正式参拜靖国神社的政党领袖。
在苏进强的带领下，2005年中华民国任务型国代选举中，席次超越亲民党成为台湾的第三大党，台联党趁势要求民进党在2005年中华民国地方公职人员选举中释出提名空间，试图派出刘一德在嘉义市参选嘉义市长，以围魏救赵的策略，在基隆市成功整合换得陈建铭代表泛绿参选市长，不过台南市的部分整合失败台联提名钱林慧君参选。
2006年陈水扁爆发国务机要费案，施明德带领红衫军发起百万人民倒扁运动，蓝营分别在六月与十月于立法院两度提出罢免总统案，台联当时选择“停、看、听”不表态，党籍立委集体进场投下“废票”。
11月3日，国务机要费案遭起诉后，李登辉指示苏进强走“清廉本土路线”台联明确表态将要支持发动第三次罢免，但时任立院党团要职的廖本烟与黄适卓、黄宗源等挺扁派立委进府会见陈水扁后在立法院党团会议上达成共识相信陈水扁；台联不分区立委赖幸媛则提出质疑“陈总统的话能信吗？”要求党中央支持三罢形成两派意见，但最后中执会还是通过“不支持三罢”的决议。
2006年中华民国直辖市市长暨市议员选举中，台联第一次提名直辖市市长候选人分别让周玉蔻参选台北市长、罗志明参选高雄市长,选举主筹订调“刺客兵团”希望能以母鸡带小鸡的方式顺利让直辖市议员上垒。
只是选战中周玉蔻不断地攻击民进党的台北市长候选人谢长廷，并公开支持三罢强调李登辉跟她站在同一阵线；民进党立委要求开除周玉蔻，最后苏进强宣布开除周玉蔻的党籍并停止对其辅选。最后开票结果台北市选情亮眼，提前停止与周玉蔻合作关系的陈建铭、简余晏让台联第一次在台北市议会夺得席次；但高雄市的部分却因为台联提名罗志明参选市长，造成支持者的不谅解而冲击选情，议员从五席滑落至一席，陈菊也差点因为罗志明落选。
苏进强请辞为败选负责，但他强调败选不是路线问题而是选举策略问题，党的未来路线不会改变。

黄昆辉时期（2007年-2016年）

2007年1月，由群策会秘书长黄昆辉出任第三届党主席。在就职典礼上宣示了台联党定位及新方向，“台联是唯一以台湾为主体的在野党，同时为伸张社会正义，要扩大照顾中产阶级及弱势族群。因此，未来除了秉持原本台湾主体的立场，监督执政党是否走台湾主体路线，更将在政策主张上发挥关怀社会正义、弱势族群的精神，为中产、工农及基层民众争取权益。”
台联党进一步在四月的“新党纲、新党章”宣示大会上，提出五项基本主张，包括：坚持主权在民，确立台湾是主权国家的定位，维护台海现状，建构以台湾为主体的国家发展战略；以民主、自由、人权普世价值的“新时代台湾人”团结台湾；在确保社会正义下，促进公平竞争；根除金权勾结、建立廉能政府。
黄昆辉就职后开始贯彻李登辉的理念“清党”；2007年10月29日台联中执会以违背党的核心价值、不服党的领导为由开除亲近民进党的廖本烟与黄宗源党籍，随后爆发“新旧台联路线之争”。党职立委黄适卓、尹伶瑛马上跳出来声援并质疑党中央有红衫军涉入，要求开除赖幸媛等人，何敏豪也跟随出走希望能争取民进党立委提名，但2008年立委选举时这些人都并未当选。
11月起，台联部分党籍县市议员自认走“旧台联路线”纷纷退党加入民进党党团运作。
清党之后台联党与陈水扁主导的民进党决裂，新台联党在单一选区两票制的新选制压力下也逐渐转型为“非蓝非绿、中间偏左”的政党，希望能借此与民进党、国民党切割成为第三势力政党。但包括立院总召等核心党公职人员仍以“绿营”号召选民支持，因此媒体与公众也仍以绿营视之。2008年立委选举，台联未能在单一选区两票制下跨过5%门槛无法取得立委席次。。
对此台联党主席黄昆辉表示，新台联的转型是一个相当艰辛的过程，在这过程中不断遭受两党的夹杀与阻碍，他坦言台联的起步太慢、转型太慢，尽管台联的政策理念确确实实是台湾人民所需、台湾未来所需，但是选民来不及深入了解台联，加上单一选区两票制首度实施，是第一次有政党票的选举，他说，中选会没有善尽宣导的责任，很多选民对于政党票的意义并不了解，以为政党票必须和选区域立委的票同一个政党，导致台联以及其他小党的表现都不如预期。
面对台联泡沫化的处境，黄昆辉认为，虽然选举结果不如预期，但他们倡导回归经济民生、照顾弱势、重视社会公义等议题，已引领风潮，成为各政党跟进的诉求，证明这条转型路正确，也是未来继续奋斗的基础，即使不能在立法院扮演这种角色，仍会在各地为终结乱象而努力。
2008年总统选举，李登辉一直没有表态支持哪一组候选人，因为精神领袖的语带保留，中执会虽然做出支持长昌配的决议，但台联并未像2004年总统选举时全党皆支持陈吕配；台联南部要角包括前秘书长钱橙山、前立委钱林慧君、前立委罗志明、台南市党部主委褚显明更在选前公开支持马英九。
总统选举前两天，李登辉才表态支持民进党总统候选人谢长廷。李登辉说他推动民主化就是希望台湾人民当家作主，他关心并非蓝绿的问题，而是台湾要如何走出去，以及深化台湾民主。他的一票将投给谢长廷，至于选举结果如何，他尊重台湾人民的选择。
开票结果国民党马萧配在台南市的得票小赢6,219票，就连在谢长廷曾经主政的高雄市都赢了28,885票。选后支持马萧配的台联党要角都纷纷被注销党籍；传南市党部主委褚显明因写悔过书表明歉意遭口头警告，然而褚显明则否认悔过书之事，而褚在2010年中华民国直辖市长暨市议员选举中支持国民党提名的郭添财而离开台联。
2008年4月23日，台联举行党部乔迁茶会，会中台联表示将解散原有中执会，并将进行党员重新登记；未来将定位为柔性政党，广招“台联之友”监督政策，台联表示要从3.5%开始，重新出发，在完成党内重组改革相关程序后，甚至不惜更改党名，以吸纳更多在野的进步力量，以全新的姿态和作为，完全转型成以理性对话与进步国家为核心价值的平民化、优质政党。
2008年总统选举后，马英九拜访李登辉与黄昆辉希望能向台联借将让赖幸媛去当两岸政策的“刹车皮”，马英九与黄昆辉密谈七十分钟后在“维护国家尊严、照顾全民利益、彰显台湾主体性”等三大前提原则之下，黄昆辉与马英九达成共识让赖幸媛加入刘兆玄内阁，5月20日就任行政院大陆委员会任委员主掌两岸事务，同日台联撤销赖幸媛中执委身份与停止其党务参与。李登辉曾言，他并不赞成赖前往担任该主委因为欠缺团队，但木已成舟，她是已答应任职后才去向他回报。
赖幸媛就任不久就因太常提及九二共识引来台联党关切，2008年6月9日台联党主席黄昆辉拜会陆委会，黄昆辉当面提及：“没有九二共识，若要提九二共识就别忘了一中各表。”
2008年10月14日，因台联党无法认同马英九的两岸政策，并认为海峡两岸经济合作架构协议应该付诸公民投票。中执会做出决议希望赖幸媛在三天内辞去陆委会主委职务否则将开除党籍，三个小时后赖幸媛主动退出台湾团结联盟。对此，台联党主席黄昆辉表达失望，并重申台联仍会将赖幸媛移送中执会开除。三天后，赖幸媛正式被台联开除党籍。
2010年，台联开始推动海峡两岸经济合作架构协议(ECFA)公投连署；2010年6月3日，台联将连署书送赴行政院公投审议委员会开会审查，最后以4比12的票数认为此案“不合规定”为由驳回。2010年8月12日，再以2比10的票数以“非重大政策复决”再次驳回。2010年11月22日，第三次将连署书送往中选会；2011年1月5日三度被驳回。马英九政府称ECFA包含“租税”及“投资”事项，不得作为公投的提案，但台联质疑为何同样涉及“租税”及“投资”的2009年澎湖县博弈公民投票就可以成案。
2010年中华民国直辖市长暨市议员选举台联党共提名十五席市议员以反对ECFA为选举主轴。在选举过程中台联与蔡英文主导的民进党采取竞合关系，李登辉为民进党五都市长候选人站台；蔡英文、陈菊、赖清德等五都候选人也分别为台联市议员候选人站台。
2010年11月27日，选举结果显示台联败选，只连任台北市的陈建铭、台中市的高基赞两席，其他现任四席议员高票落选，而所提名的新人都未能进入议会。对此黄昆辉呼吁台湾应该修改选制，鼓励小党发展，否则人民将永远被两大党绑架，蓝绿对峙永远无法打破。

2012年立委大选

2012年立委选举，台联推出十位不分区立法委员，并提名反对ECFA的国立成功大学教授许忠信为第一名，竞选主轴为“终止ECFA、弃马保台、国家正常化”。台联在全国各乡镇举办超过一百场“弃马保台”巡回演讲会，并得到一些台独基本教义派选民的支持，而台湾基督长老教会也决议在政党票支持台联。另外，包括2008年总统选举支持马英九的艺人郭美珠、前国策顾问黄天麟、前国策顾问吴树民、黄越绥、前新闻局长谢志伟、考试院院长姚嘉文、国立台北教育大学教授李筱峰、台湾教授协会前会长蔡丁贵、陈仪深、前台南市市长张灿鍙、媒体人汪笨湖，与选前骤逝的台独联盟主席黄昭堂等人都公开表示这次政党票会投给台联，显示台联得到了部分独派与本土派的支持。
台联主席黄昆辉并向选民宣传，立法院要有两个本土党团，如果只有民进党一个党团，在政党协商将难以与泛蓝阵营对抗。其主张总统投民进党蔡英文，区域立法委员投民进党，政党票则投给台联党，让立委得票率能够突破5%，甚至超过7.5%夺得三席成立党团。
2012年立委选举，台联获得1,178,896票，得票数在“台湾女总统，本土顾两党（台语）”、“一户分一票，台联不能倒”等竞选主轴，以及“生死存亡、最后一战”的台联解散告急效应之下，最终激发不少具台湾主体意识选民的热情与危机感，家户自动配票，得票率达到8.9566%、第二阶段不分区立委得票率更高达9.5683%，较上届成长约三倍，总共赢得三席不分区立委，也让立法院成功保有两个“本土”政党。台联重回国会，并可在立法院组成一个“党团”（至少三席）运作议事。台联稳居为台湾第三大政党（依全国得票率排名），高于亲民党及绿党、新党等主要政党。
另外，台联曾于选前便承诺，若该党当选不分区立委，采“一个立委席次、两人轮替服务”的方式，个别立委任期仅两年，两年一到即辞任，由不分区名单成员依序递补，借此培养党内老将新秀、发挥最大效益，让更多人至立法院为民发声，并鼓励个别立委四年要做的事，用两年戮力完成。2014年2月7日台联兑现承诺，成功复制德国绿党的经验，完成三席不分区立委席次，两年一任先后共有六位来至各领域的成员依序递补立委，创台湾政治史先例。

2014年九合一大选

2014年11月29日，中华民国地方公职人员选举揭晓，台联在直辖市及县市议员共当选9席、拿下224,904票、得票率1.85%；席次较上届成长约一倍，维持全国第三大党地位。

2016年立法委员选举

立法委员选举，台联因时代力量崛起、民进党强力宣传政党票不要分票策略奏效，虽然与基进侧翼合作，但政党票仅得票30余万票、得票率2.51%，而未能突破5%门槛，区域立委部分，派出萧亚谭及刘国隆竞选台北及台中，但最后都竞选失利，萧亚谭输了七万票，刘国隆输了两万票。因此，黄昆辉正式请辞党主席。2016年1月20日，台联宣布1月31日资遣所有员工。

争议事件

2005年，时任台联党主席苏进强等一行人到日本，参拜即使在日本国内都备受争议的靖国神社。