2011年O104:H4型大腸桿菌疫情

致病菌株

导致这次疫情的致病菌株为大肠杆菌O104:H4型，这种大肠杆菌虽属肠出血性（enterohemorrhagic），但仍携带部分肠聚集性（enteroaggregative）大肠杆菌的基因，并携带许多抗药基因，对至少八种主要抗生素有抗药性。肠出血性大肠杆菌的主要毒素：志贺样毒素（Shiga-like toxin）可损伤肠道黏膜，甚至进入血液中破坏红血球，导致溶血性病变，这种症状在肾中最为明显，常导致急性肾功能衰竭，并发溶血性尿毒综合征。大部分出血性肠炎均是由O104:H7型大肠杆菌引起，这次疫情则是肇因于较罕见的O104:H4型。
6月5日，中国深圳的华大基因研究院（BGI）首先完成大肠杆菌O104:H4型的基因定序，经过资料比对，研究人员判断2001年德国从腹泻病人分离的01-09591菌株应为这次O104:H4型大肠杆菌的直接祖先，其毒性基因与本次菌株大致吻合，但本次菌株经过十年演化后，携带了许多以前没有的抗药性基因。

 德国

德国是这波感染中受害最严重的国家，已有18名患者死亡，并有其他1700人感染，其中520人并发了溶血性尿毒综合征并可能有肾脏病变的危险。5月26日德国卫生官员表示汉堡市一家商店的四个送检的小黄瓜（三个来自西班牙，另一个来源不明）被检出肠聚集型大肠杆菌（enterohemorrhagic E. coli），这种菌株是当时认为造成感染的病菌。从那天起德国专家开始将西班牙进口的小黄瓜从商店下架。
根据德国的“Stern”杂志，6月1日，汉堡市卫生局长普鲁佛　史托克斯（Cornelia Prüfer-Storcks）拒绝对其之前警告西班牙小黄瓜为疫情源头的言论的批评，虽然最后这样的言论没有被证实，但他不认为自己太早发出警告。该杂志也表示西班牙正要求赔偿其农民上百万欧元的损失。
5月30日，德国卫生官员针对这次疫情开了一次会议，欧盟卫生官员随后表示这次疫情是德国有史以来爆发最大的一次感染。
这次疫情中，有12名死者是女性。这些案例中有11例都发生在德国北部，其中汉堡附近地区受害最严重。但位于德国北莱茵-威斯特法伦州的一名91岁妇女的死亡病例让人担心疫情已经开始扩散。现在医生将希望寄托在一种称为Eculizumab的药物上，这种药物可以有效治疗感染并发的溶血性尿毒综合征。
在德国，约有100名并发溶血性尿毒综合征的患者的肾受到严重损害，可能需要进行器官移植。

 西班牙

西班牙唯一受感染的病例是一名40多岁的男子，并已被送至圣塞瓦斯蒂安的一家医院。一名在德国的西班牙籍运动员Elena Espeso也受到了感染，她为了参加汉堡马拉松而前往德国，在进行马拉松途中即出现症状，并在结束后马上到汉堡的一家医院就诊。她声称在德国期间没有食用小黄瓜，但有食用其他生菜、水果。

 瑞典

5月31日瑞典出现了第一宗死亡病例，一名50多岁的妇人在布罗斯的一处医院死亡，她是在前往德国旅游时遭到感染。在这波疫情中，到5月31日为止瑞典已有41起病例，其中有15例特别严重。

 奥地利

5月27日，卫生当局通报有两名从德国北部骑脚踏车到奥地利的德国游客遭到感染，并住进当地医院中。

 捷克

唯一确认感染病例是一位美国女性游客，她不久前刚从德国离开，随后来到捷克。

 丹麦

丹麦官方表示截至5月30日为止已经确定14起病例，另有26宗疑似病例。其中已有14名患者出现肾衰竭的症状。5月30日时，丹麦兽医与食物总署（Denmark's Veterinary and Food Administration，DVFA）开始检察丹麦境内的小黄瓜是否遭受污染，并同时建议停止食用西班牙的小黄瓜与德国的生菜和番茄。

 芬兰

芬兰卫生与福利国家机构（THL）于6月4日记录当地的首宗证实病例。

 法国

截至6月3日，法国卫生管制研究所（Institut de veille sanitaire）通报了10宗病例，这些患者遭到感染时，人正好都在德国境内。6月24日，该研究所通告亚奎丹有10宗病例，包括贝格尔市的7宗关联病例，其中6宗是6月8日举办的庆典中吃了豆芽菜。有1位受感染的患者则出现与德国疫情类似的症状。

 荷兰

6月6日荷兰国家公卫与环境中心（Netherlands National Institute for Public Health and the Environment，RIVM）表示已有六人确认遭到感染，其中有四人已经并发溶血性尿毒综合征，另外两人则没有出现肾脏问题，这六宗病例在得病前不久都去过德国。其他病例现在正在调查中。

 波兰

5月30日，一位女性从汉堡回来后，由于感染大肠杆菌导致病情严重而入院治疗。截至当天为止，波兰境内至少记录了467宗肠道感染的病例。

 英国

5月28日，英国通报3人确诊前曾去过德国，并遭到感染。5月29日，英国食品标准局表示，遭到大肠杆菌污染的小黄瓜并没有进口。在英国南格洛斯特，12名雷德费尔·埃奇小学（Redfield Edge Primary School）的学童于5月20日生病，学童双亲中有4人在6月2日之前的这段时间陆续生病。但遭到感染的是常见的大肠杆菌O157型，而非O104型。

 加拿大

截至6月8日，通报一宗确定病例，该名患者确诊前曾去过德国。

 挪威

6月5日，在挪威发现了几宗未公开的病例。

 瑞士

瑞士目前已确认三起病例，5月31日有一人感染，但没有其他细节传出，6月1日瑞士公共卫生局（Federal Office of Public Health）发布了第二起病例，第三起病例则出现在6月3日。

 美国

截至6月5日，通报四宗确定病例，这些患者确诊前都曾去过德国汉堡市区。

 芬兰

截至2011年6月1日，芬兰卫生与福利国家机构（THL）开始检测一位上周末进入赫尔辛基玛丽亚医院的人士是否为该疫情的患者，他疑似遭到肠道出血性大肠杆菌的菌株感染，并且承受折磨中。

 卢森堡

6月8日，卢森堡记录了第一宗疑似病例。

 葡萄牙

6月2日，葡萄牙当局报告有三位葡萄牙公民，其中一位是马德拉自治区人，他从德国汉堡回来后发生肠胃炎，因而被怀疑遭到细菌感染。另外两位从德国回来后做了检测，对大肠杆菌的菌株则是呈现阴性反应。

 斯洛伐克

6月8日，斯洛伐克出现第一宗疑似病例，受害者是一位25岁的男性，已在科希策路易·巴斯德医院（Louis Pasteur Hospital）接受治疗。

经济影响

到6月1日，奥地利、意大利及法国的小黄瓜销售量均大幅减少，但奥地利卫生部官员Pamela Rendi-Wagner表示奥地利的消费者仍是安全的。
6月3日，西班牙、葡萄牙和德国政府正式请求欧盟对受疫情影响的农民提供援助。当天俄罗斯亦开始计划改由乌克兰、土耳其、阿塞拜疆与埃及进口小黄瓜。
6月7日，欧盟国家的农民已损失了高达上百万美元的出口收入。西班牙蔬果生产及出口联盟Fepex也表示其农民已经损失高达256,000,000美元。法国、瑞士、保加利亚、德国、荷兰、比利时及葡萄牙的农民也受到了程度相当的冲击。
当天，欧盟提出将提供受影响的农民135,000,000英镑的补偿金。欧盟农业长官表示其农民可获得相当于其无法销售产品三成的补偿金。欧盟卫生长官约翰·达利并于同日正式批评德国对疫情来源太早下结论，造成民众与农民的恐慌，并导致欧盟农业部门的庞大损失。约翰·达利并向位于斯特拉斯堡的欧洲议会表示，如此重大的资讯应在有足够科学根据确人后才公开。
6月8日，西班牙以太少为理由，拒绝了欧盟提供的135,000,000英镑（相当于150,000,000欧元）赔偿金。法国农业部长勒梅尔（Bruno Le Maire）则表示法国支持欧盟对受影响的农民提供赔偿金。
同日，计算显示这波大肠杆菌的疫情在人事上（例如病假）已造成高达2,840,000,000美元的损失（尚不包括物质上的损失，如丢弃的小黄瓜）。
自德国于6月8日呼吁民众不要食用生鲜小黄瓜、番茄、生菜与豆芽菜后，欧洲许多民众都避免食用蔬菜水果。欧盟国家农民声称他们每周损失611,000,000美元，成熟的蔬菜在田野或商店中腐烂而无人购买。同日，欧盟主管农业事务专门委员丘洛斯（Dacian Ciolos）宣布欧盟将提高补偿金至306,000,000美元（相当于210,000,000欧元）。

后续

自俄罗斯宣布禁止从欧盟国家进口蔬菜后，即引发欧盟强力反弹，甚至暗示此举可能使俄罗斯于年底加入世界贸易组织的计划产生变数。因俄罗斯是欧盟蔬菜出口的第一大国，占其出口量近四分之一，此禁令估计可能使欧盟每年损失十亿欧元的收入。自六月下旬起，俄罗斯陆续恢复从荷兰、波兰、丹麦、比利时、西班牙、希腊及捷克进口蔬菜，据俄通社-塔斯社报导，至八月五日止仍有立陶宛、拉脱维亚、爱沙尼亚、斯洛文尼亚及德国五国被禁止向俄罗斯出口蔬菜，而因欧盟自7月26日起未再发现感染病例，若至8月8日都没有新病例出现，俄罗斯即将解除对欧洲蔬菜的所有进口限制。
8月5日，俄罗斯动植物卫生监督局滨海边疆区分局局长助理维塔利·萨连科透露，该局在海参崴截获了25余吨的德国猪肉，该批货物被查获后，已全部发回德国。
7月26日，德国罗伯特·科赫研究所宣布这波致命性大肠杆菌疫情已经结束。该研究所指出，过去三星期以来，没有再传出感染的新病例，总计这次疫情共造成52人死亡，其中50人来自德国，另外两人则分别来自美国与瑞典。