中華民國與印度尼西亞關係

外交

1912年中华民国建立后，在时为荷兰殖民地的印尼的巴达维亚、泗水等地设置领事馆。
1930年，赴印尼华校任教的女教师萧信庵，遭荷兰船“渣华号”船员性侵的事件，引发反荷兰的骚动，是为反荷运动。
1949年12月24日，特派吴铁城为中华民国庆贺荷兰王国向印尼联邦移交主权及印尼共和国独立典礼特使；派蒋家栋为副使。
1950年4月13日，印尼苏卡诺政府与中华人民共和国建交，中华民国关闭于印尼各城市开设的领事馆，结束领事关系。
1962年8月24日，印尼拒绝中华民国代表团参加于雅加达举行的亚洲运动会（另一被拒绝的是以色列）。
1967年10月27日，反共的苏哈托政府与中华人民共和国断交。
1971年10月25日，印尼对于中华民国是否续留联合国的投票采弃权方式，即《联合国大会2758号决议》。
1981年，行政院长孙运璿访问印尼，并会晤苏哈托总统。
1994年2月春节期间，总统李登辉访问印尼，会晤总统苏哈托与科技部长哈比比等。11月，行政院经济建设委员会主任委员萧万长前往印尼雅加达，代表总统李登辉参与亚太经济合作组织领导人非正式会议。
1998年1月，行政院长萧万长访问印尼。
1998年5月，在印尼排华事件中，中华民国政府多次紧急指派专机飞往印尼疏散受难者，另一方面外交部长胡志强于同年7月29日公开召见印尼驻华代表，当面向印尼提出了“最严正抗议”。
2002年8月，副总统吕秀莲访问印尼。
2006年5月，总统陈水扁访问印尼。
2006年10月，印尼前总统哈比比预定抵台出席“亚太商工总会40周年庆祝大会暨21届大会”，但在中华人民共和国的施压下取消行程。
2013年5月9日，在广大兴28号事件中，虽然中华民国与印尼没有正式的外交关系，但印尼官方支持中华民国政府向国际法庭申诉。

代表机构

1971年6月1日，印尼于中华民国首都设立驻台北印尼商会。1995年1月，更名为具大使馆性质的驻台北印尼经济贸易代表处（印尼语：Kantor Dagang dan Ekonomi Indonesia di Taipei）。
1972年7月4日，中华民国于印尼首都设立驻雅加达中华商会。1990年1月19日，更名为同等性质的驻印尼台北经济贸易代表处（印尼语：Kantor Dagang dan Ekonomi Taipei, Jakarta, Indonesia）。此后，杨进添与林永乐两任外交部长均曾驻节印尼；2015年12月，于第2大城设立具领事馆性质的驻泗水台北经济贸易办事处。

侨民

台湾在印尼之侨民有20万9,000人（2012年底），知名人士包括白嘉莉。印尼在台湾的侨民则有18万2,597人（2013年5月）。出身印尼而已归化为中华民国国民的知名人物包括：王宇婕与莫爱芳等。

跨国移工

在台湾工作的东南亚移工，印尼人是人数最多的，截至2017年12月，共有25万8,048人；职业类别上大多数是属于“医疗保健及社会工作服务业、其他服务业”。
2014年10月就任印尼总统佐科威表示他知道在台印尼劳工获得良好对待，他很感谢台湾善待这些印尼劳工，印尼将继续维持这种合作关系，并呼吁印尼劳工应遵守台湾的法律并尊重台湾习俗。他确信台湾给予这些印尼劳工好的薪水，如果台湾还需要更多的印尼劳工，他们也会推荐亲友到台湾工作，“这是我们（台湾和印尼）关系的基础”。佐科威也感谢多数在台印尼劳工在总统大选中支持他，“我希望我们能够在台湾见面”。印尼国会副议长帕利约也表示，“台湾善待印尼劳工的经验足以成为中东及世界其他国家对待印尼劳工的最佳范例”。台湾雇主与印尼帮佣互动融洽的真实案例也曾登上社会新闻，让印尼官员深受感动。印尼国家通讯社安塔拉社长赛佛亦称“台湾对印佣好大家都知道”。

教育

至2017年，印尼留台学生总数为6,453人。在印尼并成立9个留台同学组织暨总会。
国立台湾师范大学于首都雅加达及华人城市泗水分别设立雅加达台湾学校、泗水台湾学校；国立台湾科技大学亦于泗水设立台湾高等教育中心。并举办多届台湾印尼高等教育论坛、台湾高等教育展。

宗教

2007年，在台湾的印尼穆斯林为凝聚向心力及争取经济、社会与宗教权益而成立台湾印尼穆斯林之家，会址设于台北文化清真寺。
2017年10月，伊斯兰宗教学者理事会主席阿明抵台访问，除会见副总统陈建仁，也在台北、高雄与台湾业者共同举办印尼清真认证说明会，拓展台印清真认证合作。

签证

持有中华民国护照的中华民国公民可以免签证的方式入境印尼，停留最多30天不得延长。落地签证停留30天可延长1次、商务签证停留最多60天。经印尼过境转机，也可以落地免签。
持有印尼护照的印尼公民符合特定要求者，可透过中华民国政府的东南亚七国网络申办入台许可申请免签证，停留最多30天；抵台参加团客旅游、国际会议、运动赛事、商展活动，则可以电子签证入境中华民国，停留最多30天并不得延期。
中华民国外交部的国外旅游警示分级表将印尼归类为黄色警示：特别注意旅游安全并检讨应否前往（2019年4月19日）；卫生福利部的国际旅游疫情建议等级表将印尼归类为第一级注意：提醒遵守当地的一般预防措施（2019年3月7日）。

事件

2011年3月，印尼外交部网页“可申办落地签证国家”的信息中，将台湾标注为“Taiwan, PRC”，中华民国外交部与驻印尼代表处向印尼外交部与驻台代表处表达严正关切。说明台湾与中国大陆互不隶属，网页所列名称与事实不符，并请迅速更正，后印尼外交部已修正其名称。

经济

2015年4月，成立印尼台湾经济交流协会（Indonesia Taiwan Business Council）。建立双边厂商及政府间之商务、投资交流平台，以及与印尼商工总会（KADIN）等机构建立正式沟通管道。此外，双边也举办“台湾印尼经济合作会议”，至2015年已举办20届。

贸易

中华民国对外贸易发展协会（外贸协会）于印尼首都设立雅加达台湾贸易中心。经济部国际贸易局也在雅加达设立驻印尼代表处经济组。
国际贸易局将印尼列为重点拓销市场，从2010年第2季开始委托外贸协会执行“台湾国际品牌整合行销传播及产业广宣专案”，以各种密集的B2C（business to customer）即零售活动介绍台湾的IT产品。
2014年，印尼是宏碁在东南亚最大的市场，个人电脑销售量过去6年居印尼之冠，2013年被华硕取代，市场第一、二名分别由华硕及宏碁占据；明基的投影机与友讯的无线路由器也是印尼第一品牌；BenQ电脑液晶萤幕居第3名，仅次于韩国的Samsung与LG；自行车与零配件是印尼第3大进口来源国，但仅占印尼该产业总进口额5%以下；塑料机械则占印尼该产业进口额的40%。
印尼政府常用贸易救济措施如反倾销及防卫措施来限制进口产品，至2013年，共5种产品遭印尼政府采行反倾销或防卫措施调查，产品涵盖不锈钢及纺织原物料等。
2017年11月，在印尼举辨首届台印钢铁对话会议。
2018年，印尼是中华民国第15大贸易伙伴、第10大进口伙伴、第16大出口伙伴。出口至印尼的金额为33亿3,113万7,501美元，年增4.314%；自印尼进口的金额为55亿0,089万1,046美元，年增12.290%。贸易呈现入超（赤字）21亿6,975万3,545美元，年增27.225%。2017年，印尼是中华民国第14大贸易伙伴、第10大进口伙伴、第15大出口伙伴。

投资

2017年，中华民国对印尼投资3.97亿美元，为印尼第14大外资来源国。在印尼的台商及技术人员约2万余人，估计台商家数在2,000家以上。2001－2017年，在印尼总投资件数共1,946件，总投资金额为48.69亿美元。台商投资最多的行业为造纸业、橡塑料业、运输机械及非金属矿业等；其他投资如家具业、纺织业、鞋业、金属制品业、贸易服务业及农业等。并在雅加达、万隆、井里汶、三宝垄、泗水、巴厘岛、巴淡、苏北、中爪哇等地设有“台湾工商联谊会”，为整合印尼各地台商会，于是成立“印尼台湾工商联谊会总会”，2014年总会长由泗水台湾工商联谊会理事长兼任。
除了传统制造业外，台商近几年亦开始于印尼投资服务业，以六角国际为例，该公司于2011年至印尼开设贩售珍珠奶茶等的台式茶饮店。另外，中华民国政府近几年亦与当地业者合作，时常举办台湾商品的展示会，并于2013年7月开设常驻型的展示中心：雅加达台湾精品形象店。台湾最大、亦是全球最大电子代工企业鸿海富士康集团于近期评估在印尼设厂，以生产电子通讯设备以及平板电脑等产品。中国信托商业银行在雅加达设有分行。

石油化学

2018年10月11日，印尼国营事业部长丽妮·苏马尔诺宣布，由台湾中油公司与印尼国营石油公司签署《印尼石化园区架构协定》，由双方董事长代表签署。将共同评估于印尼兴建年产100万公吨乙烯的轻油裂解厂及石化下游工厂，预估投资金额约65亿美元（约2,000亿新台币），台湾中油投资45%、印尼国营事业投资45%，剩下的10%由台湾和国际中下游厂商投资。

摩罗泰岛开发合作协议

驻印尼台北经济贸易代表处与驻台北印尼经济贸易代表处于2012年签署《摩罗泰岛共同开发计划谅解备忘录》，透过“指导委员会”对印尼北马鲁古省摩罗泰岛（距台湾约2,600公里）进行整体产业开发，包括渔产加工业、造船业、交通业、旅馆业以及观光业。摩罗泰地方建设局表示此一经济特区之开发会为摩罗泰岛带来十万名的劳力以及数千亿印尼盾的收入。印尼总统尤多约诺于2014年7月2日批准“摩罗泰岛经济特区”开发案，提升两国在经贸、观光、农业、渔业等领域的合作。

农业合作

自1996年起，两国每年轮流主办农业部部长级会议。
两国于2010年签署《一乡一特产合作协议》，透过台湾驻印尼农业技术团进行推广，在西爪哇省、中爪哇省、东爪哇省以及巴厘省从事推广事业，协助当地农民进行产业振兴。
2016年5月12日，驻印尼台北经济贸易代表处与驻台北印尼经济贸易代表处在台北签署了农业合作协定，强化农业合作伙伴关系，双方将基于平等互惠原则，致力粮食作物、园艺、畜牧及坡地作物改良、共同投资等合作。
驻印尼技术团“万隆地区强化农企业培育计划”于2016年完成建置智能环控温室及集货处理场。透过该计划示范效果，对于印尼万隆地区及台湾相关产业带来提升当地蔬果品质、促进当地农企业发展，以及增加台湾温室设备相关产业出口的优势与机会。

佐科威与中华民国

于2014年当选、就任印尼总统的佐科威于从政前经营家具公司，和中华民国、新加坡、韩国与日本都有往来，常前往台湾洽商业务的他对台湾熟悉且友善。木匠之子佐科威表示他以前常对友人说，假日时如果找不到他，他就是在台湾处理生意。他盛赞台湾消费力高、是很好的家具市场。他至今仍记得台湾的美食、人情和西门町的繁华景象，他还能凭记忆用精准的国语念出“西门町很热闹”的中文。佐科威表示，台湾的制造业、企业能力强，也有良好的管理制度和处理投资的优秀人才，基础建设良好，印尼和台湾一定要继续合作。他指出，2013年台湾投资印尼的金额为4亿美元，这是庞大的金额，他期盼台湾对印尼的投资能持续增加，“我想邀请你们造访印尼，来印尼投资”。时任雅加达省长的佐科威也是最终落实鸿海科技集团（Foxconn）印尼投资案的关键人物。

犯罪事件

2017年3月29日，中华民国警方和印尼警方联手破获诈骗集团，此行动由刑事警察局掌握线报并将相关情资提供给印尼，因此循线逮捕54名嫌犯，其中18名台湾人被遣返回台。
印尼总统佐科威自2014年上任后就宣誓要让国内的毒品问题被彻底解决，不仅对本国人严格，对外国籍贩毒者、涉案人士也一律“重刑”处分。2018年4月26日，南雅加达地区法院判处8名台湾男子因走私1公吨的甲基苯丙胺（俗称冰毒）死刑。截至2018年10月，已有21名台湾人因为在印尼贩毒遭判死刑，不包括在印尼警方行动中遭击毙者。

航空

两国有直航班机，双边航班来往的城市如下（截至2019年5月25日）：

中华航空与加鲁达印尼航空

台湾中华航空与印尼加鲁达印尼航空皆属国际航空联盟天合联盟之成员，两航于2011年签署合作备忘录以扩大进行双方哩程酬宾、加强客货运合营及前舱机组员训练等合作项目。不过，由于不敌中华航空及长荣航空的竞争，载客量不如预期。加鲁达印尼航空于2014年年底撤出台湾、结束在台分公司。