惠州交投巴士有限公司

早期发展

1971年3月，该公司前身惠州市汽车站成立，隶属惠州市交通局管理，经营客、货运业务，由廖伟忠、康景禄、骆汉全等人分任正副站长。汽车站成立之初借用西湖管委会的用地办公。彼时汽车站经营“惠阳汽车站—桥东西门口”“惠阳汽车站—平湖门”“桥东西门口—下角小中堂”等3条公共汽车路线。
1973年-1977年间，公共汽车站陆续增开由惠州至横沥、汤泉、平潭等三地的外线。
1974年，惠州市汽车站更名为惠州市汽车公司。次年，汽车公司分离客、货运业务，其中客运部分（即公共汽车）成为惠州市公共汽车站。
1977年7月，位于麦地路6号的办公大楼投入使用。
1980年-1984年，公共汽车站在重点经营“内线”的同时，加开多条“外线”，以求扭转因社会上公私车辆争客而导致的亏损局面。但由于亏损原因，“内线”经营困难，于1983年，除“惠阳汽车站—平湖门”线仍可正常行走外，其余多条线路均停运。
1984年2月20日，惠州市公共汽车站改制为惠州市公共汽车公司，由骆汉全、钟振强分任正、副总经理。同年，该司转隶惠州市公用事业局管理。
1987年，各条“外线”均停止运营。

1990年代

1990年，惠州市政府投入96万元，恢复了多条于1983-1985年间停运的公交线路，并增设“汽车站—云山”“汽车站—市人民医院”等两条线路，分别为今天的2路、3路。
1994年6月，惠州市公共汽车公司升格为惠州市公共汽车总公司，升格后由黄文程出任总经理，钟振强、罗月林、姚燕培出任副总经理。总公司下设办公室、安全科、保安科、材料供应科，及辖有两个车队、两个修理车间、汽车零部件门市部、停车场等单位。
1998年，公交总公司陆续开通多条线路，并利用社会资金更新15个候车亭及150个灯箱式站牌。同年，该司向社会作出了8点公交服务承诺。10月，该司对原机关科室、营运车队、修理车间及保障单位实施改制，包括将原下辖的两个车队改制为两个运营分公司（即现今的第一、二分公司），两间修理车间改组为一个大修厂，及对下设的行政部室进行调整，并可实施经济独立核算及自负盈亏。

2000年代

2001年5月，惠州市公共汽车总公司党总支委员会获准筹建，第一、二分公司党支部及总公司行政机关党支部亦成立。该司亦获评当年度市“先进基层党组织”。同年，该司聘请10位市民为公交服务质量社会监督员。此外，该司亦开始推行股份制经营，以集资入股方式筹资100余万元购入10台客车开通28路。次年，19路实行股份制经营。
2003年，公交总公司开始在旗下车队安装南平三方电子报站系统，及增设91个电子站牌。同年，该司启用新版绿色主题涂装，应用于新购置车辆及翻新后的旧车。此外又斥资2万余元解决近100台车辆存在的车内灯光暗淡问题。
2004年，公交总公司收回29路的经营权，并实施股份制改造。同年，该司对旗下的10路、26路系列路线进行拆分。
2005年1月20日，该司与保源电子共同组建的IC卡收费系统启用，发行普通不记名卡、学生卡等卡种，初期于18条无人售票线路安装非接触式IC卡阅读器，及后向所有运营线路推行。
2006年3月，公交总公司对旗下线路收费方式进行调整。其中，一票制空调车辆票价由1元调整为2元，分段收费空调车辆票价调整为起步1.5元/9千米，9千米后为0.5元/3千米。非空调车辆则维持原有票价。同年，该司针对旗下部分车辆“喷黑烟”严重的情况，成立尾气专项治理领导小组，全面检测旗下车队尾气排放状况，对100余台车辆的高压泵进行更换或维修，并维修150余台车辆的发动机，使车队尾气排放基本达到环保部门要求。此外，该司亦购入首批厦门金龙XMQ6891G型大型环保客车，投入5路运营，并启用新版奥运主题涂装。这亦是公交总公司首次购买国内主流品牌车辆；而该涂装也成为后续大部分车队的标准涂装。
2007年，该司将其办公室电话用于对外公开的投诉电话使用。同年，配合惠州市创建全国文明城市的工作，公交总公司对旗下车队的硬件设施进行完善，包括设置车内导向图、乘车规则、投诉电话等多张宣传纸，增设垃圾篓、遮阳帘等设施。车身及车内报站机、移动电视等设施也有进行创建文明城市之相关宣传。
2008年，公交总公司自筹资金建成GPS智能调度管理系统。同年，该司对旗下场站及候车设施进行维护，新建130余个候车亭，更换、维修简易站牌400余个，并启用电子站牌系统，方便市民获取下一班车预计到站时间。
2009年5月27日，公交总公司与中国联通惠州分公司合作的公交服务热线+86-752-96020000开通运营，方便市民在工作日非上班时间及节假日进行公交服务投诉。这一电话号码已于2017年起弃用。

2010年代

2010年2月26日，公交总公司投放第一批20台珠海广通GTQ6857NGJ型液化天然气客车于17路、18路首航，成为该司首批投入服务的清洁能源车辆。及后，另外80台同型号车辆于5月23日前全数投入服务，以迎接省运会的召开，及贯彻惠州市委、市政府关于建设“双宜”（宜居宜业）城市的战略部署。同年，惠州市公共汽车总公司出租车分公司成立，并获惠州市政府特许授权经营CNG、汽油两用出租车。7月1日，该司正式投入丰田花冠EX及大众桑塔纳志俊各50台，合共100台CNG、汽油两用出租车运营。此外，该司于大水塘停车场建设LNG撬装加气站，及于河南岸停车场建设L-CNG加气站，供清洁能源车辆使用。
2011年3月，公交总公司与中海石油气电集团有限责任公司合资成立的中海油惠州新能源有限公司正式挂牌营业。同年，江北西L-CNG加气站启动建设。8月，该司开始为旗下无人售票车队更换新式IC卡阅读器，型号为雄帝JC-5200。该款阅读器也应用于后续车队上。12月20日，公交总公司开始为旗下车队安装岭南通阅读器，并于12月31日正式支援以岭南通支付车费。次年1月，该司启动公交IC卡补换岭南通卡业务。
2012年5月31日，公交总公司参与于中国人民银行广州分行举行的金融IC卡进入惠州公交领域签约仪式。6月，惠州市公共汽车总公司第三分公司成立，接管原第一、二分公司多条由市区南部片区始发的公交线路。同年，该司建成、启动建设六个公交总站及保养设施，并于2013年初完成。8月，该司与中国电信惠州分公司合作，于7路、8路、18路测试免费Wi-fi，及后该无线网络也应用于新开线路42路上。
2013年1月25日，该司与中国人民银行惠州市中心支行及中国银行惠州分行举办金融IC卡刷卡乘车体验活动，意味着公交总公司旗下车队正式支援以金融IC卡支付车费，支付时使用公交IC卡阅读器。5月8-13日，该司在为旗下车队的公交IC卡阅读器完成升级后，开始分批拆除岭南通专用阅读器。原公交IC卡阅读器在升级后可支援岭南通卡，原岭南通阅读器则被调入惠州市其余区县的公交业者使用。5月16日，该司在18路、29路试行以惠民自行车卡支付车费，并于6月9日全面开通惠民自行车卡支付。同年，江北西停车场建成使用，配置L-CNG加气站及维修车间。
2014年4月28日，公交总公司开通首条观光公交线路观光1号线，并首次投放低地台双层客车提供服务。7月12日，该司投放第一批25台厦门金旅XML6115JHEV75CN型气电混合动力客车于7路、18路首航，成为该司首批投入服务的混合动力车辆。但由于技术原因，该批车辆上线初期常因动力不足而难以爬上惠州大桥，严重时还易引致后方交通堵塞，故而饱受乘客诟病。9月5日，第一批25台郑州宇通ZK6105CHEVNPG4型气电插电式混合动力客车首航29路。12月1日，该司与惠州市易达文化传播有限公司合作，于观光1号线、6路、7路、11路、15路、18路、29路提供免费Wi-fi，乘客需使用“小九”应用程序登录后才可使用此无线网络。3日，该司于2路、6路、10路、13路、14路、18路、29路的运营车辆安装的导盲系统启用，方便携有导盲终端的视力障碍人士乘车。同年，公交总公司及其出租车分公司通过安全生产标准化（三级）认证。
2015年9月24日，该司最后一批仍在运营的柴油客车于5路退役。次日，该线投放24台深圳五洲龙FDG6103EVG1型纯电动客车运营，成为该司首批投入运营的纯电动客车。该批车辆为公交总公司向深圳市民富沃能新能源汽车有限公司以零首付租赁模式购置而来。12月，公交总公司再以相同方式向民富沃能购置40台南京东宇NJL6129BEV6型低地台纯电动客车，并于12月23日出牌。因不明原因，该批车直至2016年8月16日才首航29路。同月，惠州亿纬锂能股份有限公司以能源合同管理模式向公交总公司赠送10台深圳五洲龙FDG6103SHEVNG5型气电增程式电动客车。该批车辆先于恺旋交通运营的仲恺企业交通专线进行测试，其后于2016年3月24日正式首航33路。
2016年，该司出租车队全面更换为大众新桑塔纳。置换下来的车辆则于12月底前被拍卖完成。同年，该司亦推进公司制改造工作，精简机关部室，实行大部制、扁平化管理及“三定”（定人、定岗、定责）管理，明确责任。12月12日，公交总公司旗下线路开始模拟TC模式运营。2017年1月1日，上述线路正式按照TC模式运营。同日，原有人售票路线也改制为无人售票，但仍维持分段收费模式，乘务员则被以通过培训实现再就业及协商解除劳动合同等方式妥善安置。因TC模式实施后，票务、乘客服务等事项均统一交由惠州市公共交通管理有限公司（TC公司）负责，该司的点钞、押钞、守库、稽查、投诉处理等岗位从业员则被以内部转岗、TC公司接受聘用及协商解除劳动合同等方式妥善安置。
2017年3月，公交总公司再次调整旗下分公司结构，成立第六、第九分公司。5月，公交总公司以零首付分期付款（5年60期）方式购置的55台厦门金旅XML6105JHEVG5CN6到货，并于7月20日首航20路、25路、26路、27路及35路。此为惠城公交TC模式实施后首批投入运营的车辆，及全球第一批量产版厦门金旅“川流”造型车辆。12月29日，惠州市公共汽车总公司更名为惠州交投巴士有限公司，脱离惠州市国有资产监督管理委员会，成为惠州市交通投资集团有限公司全资子公司。虽该司已完成证照层面更名，但目前仍为新旧司名混用状态。
2018年5月1日，交投巴士旗下车队全面执行新版票价方案及岭南通换乘优惠政策，并于同日起停止原公交总公司发行的公交IC卡充值业务，及宣布该种卡片将于2019年1月1日正式退市。10日，该司与公交管理公司共同推出学生公交IC卡置换为岭南通·惠州通学生卡之业务。6月1日，首三款采用城区公交统一涂装及使用交投巴士标识的公交车辆于3路、7路、8路等16条路线首航，该批车辆同时为惠州市首批设有乘客动态资讯系统及安装新能源车牌的公交车，其中部分车辆于车厢内设置了USB快充接口。

26路、29路车长因抢道发生争执事件

2012年5月13日，有微博网友向惠州市交通运输局投诉称，其当日乘坐26路粤L05646车途经东平市场站至东湖西路站路段时，该车连续急刹两次。随后该车逼停一台29路公交车，车长随后下车冲入29路车内殴打29路车车长，并于十几秒后返回26路车继续驾驶。
其后，市交运局即派员走访当事者、目击者，及调取相关车辆监控，并于5月17日向社会发布调查结果。调查结果指出，5月13日下午2时10分许，两台涉事车辆通过东湖西路东平大道路口时，因车道数减少，两车发生抢道行为，至26路车车站李某紧急刹车。李某认为对方未作礼让而心中有气，遂在停靠东平市场站时登上29路车与该车车长郑某理论，期间有互相拉扯行为。两车车长随后被各自车辆的乘务员拉开，随后各自回到驾驶岗位。交运局同时表示，两位车长服务意识、安全意识淡薄，在驾驶过程中开斗气车，互相谩骂，李某更不顾乘客跑到29路车上吵闹，两人行为均严重影响公交正常运营及行车安全，影响恶劣。此外，公交总公司则表示已判两位涉事车长深刻检讨，并作全司通报批评及停班、取消当月奖金等处理。
调查报告公布后，有网友质疑交运局描述两车长之间行为为“互相谩骂”而非投诉者所指的“殴打”是避重就轻。对此，交运局方面回应，工作人员在与涉事车长谈话期间未发现打架痕迹，而网友将互相拉扯行为误认为是打架“也很正常”。

“被搁置”车长“跳楼讨说法”事件

2015年2月12日早上7时许，公交总公司一名付姓车长登上该司办公大楼楼顶，手举红底黑字横幅，向公司讨要说法，引发民众围观。随后，公安、消防及急救部门均出动，消防方面更在大楼前方设置气垫。该名车长在其家属及公安、消防等部门劝解下，于当日下午3时30分许离开大楼楼顶，转而在办公室与公司领导交谈。
据知情人士透露，该名车长在2014年驾驶公交车时发生过交通事故，及后，法院判付性车长并非事故责任人，且车长与公司之间的劳动合同仍然有效。但由于该次事故致他人受伤，公交总公司与保险公司合共赔偿伤者20余万元。事后，公交总公司按照其规章制度对车长作解聘处理，引起该车长提出劳动仲裁，并获胜。但公交总公司仍未对其安排具体工作，而是仅仅让他按时打卡上下班。该车长的儿子在接受惠州广播电视台记者采访时透露，在劳动仲裁胜诉前，其父亲更未领到任何工资；胜诉之后，公司也仅仅是“每个月敷衍地给几百块工资”。其后，2015年2月，该司发出通知，指该付姓车长严重违反公司规章制度，需被解聘，并告知其于2月10日上午办理相关手续。
对此，公交总公司一名负责人表示，不赞同该位车长以跳楼等极端手段讨要说法的方式，认为该做法“浪费公共资源”，但拒绝透露更多细节。另有知情人士指出，公交总公司对不同等级的交通事故有相关处理规定，但对于劳动仲裁结果与公司规章制度不一致的情形，“公司也很为难”。