明鄭時期

名称

明郑时期又被称为明郑王朝、明郑政权，或以其建国者，称其为延平王国、郑氏王国、郑氏王朝、东宁王国、东宁王朝等。后世多以明郑台湾、郑氏治台时期、郑氏时代（时期）、南明郑氏治台时期、南明郑氏治理时期等。
现今欧美主要使用东宁王国，如英文Kingdom of Tungning、西班牙文Reino de Tungning等，此用法未知由华文世界或者西方率先使用。此外当时西方人也有称郑氏政权为福尔摩沙王国（英语：Kingdom of Formosa）、台湾王国（Kingdom of Taiwan）、国姓爷王朝（Koxinga dynasty）等。
清代官书对郑氏在台湾的政权称为之“伪郑”、“逆郑”、“海逆”，以“东宁国”为伪号，记载郑经是将东都改为“东宁省”，民间私撰为“东宁国”，现代多称为“明郑”。
在朝鲜王朝的史料《李朝实录》中，称呼郑经主政时期（1670年）的郑氏王朝为“大樊国”或大樊。

郑氏家族的兴起

1644年（明崇祯十七年，清顺治元年），李自成攻陷明朝首都北京，建立大顺政权；不久，吴三桂引清兵入关，满族建立的清朝八旗军又击败李自成，定都北京，并继续向南方进攻。
与此同时，明朝遗臣在南京拥立明宗室福王朱由崧，建立了史称南明的偏安政权；在清廷欲取代明朝入主中原的态势明朗后，南明转而联合各地的汉族武力抗清，但军事不利，弘光、隆武、绍武、永历诸朝廷先后遭清军消灭。郑芝龙所部原是隆武朝的主力，主要在福建境内活动；郑芝龙降清后，郑成功陆续接收其势力，继续在东南沿海武装抗清。
1658年－1659年间，郑成功大举攻打清江宁府（原名南京）失败，实力大损；迫于形势，决定夺取由荷兰东印度公司支配的大员以供部队给养。

征服台湾

明永历十五年正月（1661年），郑成功在金门誓师；他亲率将士25000名、战船数百艘，自金门料罗湾出发，次月抵达澎湖，四月初二日（4月30日）抵达鹿耳门。并利用涨潮出敌不意地在鹿耳门及禾寮港登陆。以优势兵力包围荷军防守薄弱的“普罗民遮城”，并切断荷军水陆交通，不久，普罗民遮城守将猫难实叮（Jacobus Valentijn）献城投降。
同年四月初七日，郑成功亲率大军，对防御坚固的荷军首府“热兰遮城”进行攻打。经派杨朝栋谕揆一投降无效后，即调集火炮朝城堡炮轰，然而在从大员市镇朝城堡进攻时，却遭荷军居高临下击退。之后郑军即采取长期围困，同时将多数部队派往各地囤垦以解决粮食不足的问题。五月二十八日，“荷兰东印度公司”得知台湾战况后，决定派七百人、战舰十艘赴台，于七月初五日抵达。之后双方稍有接触，但均无较大战事。至八月二十三日（9月16日），双方再度海战，郑军经一小时激战，击毁荷舰二艘、俘小艇三艘、杀敌百余人，其余荷舰逃往远海。
闰十月，荷军发动作最后一次攻击，但仍寡不敌众，之后又有日尔曼籍佣兵逃脱，向郑成功说明堡内荷军士气低落，并指出欲取热兰遮城，必先取其卫星碉堡“乌得勒支碉堡”（位在今安平第一公墓），夺取该碉堡则可居高临下，炮击热兰遮城最脆弱的“四角附城”。郑成功遂于当月，着手准备攻城计划。
十二月初六日（1662年1月25日）郑军于鲲鯓半岛发动总攻击，以大炮不停轰炸，当日即发出2500发炮弹，其中1700发左右打向乌得勒支碉堡，几乎将之夷为平地，荷兰守军被迫自行炸毁碉堡残余部分后撤退。此役彻底瓦解了热兰遮城内守军的士气，两天后大员评议会决定议和谈判。
大员长官揆一于同年十二月十三日（1662年2月1日）于缔和条约签署投降。至此，台湾台江领地，尽落郑成功之手。

开国立家

永历十五年五月十八日（1661年6月14日)，郑成功来台后，将台湾的赤崁地方定为“东都明京”，并设立了承天府，和天兴、万年二县。自此依然优礼明朝宗室，为他们建立王府官邸，并供岁禄。每次拜封官员，都请诸位大明皇族遗脉和其他宗室在旁观礼，以示尊重体制。
为解决兵粮问题和反清之需要，实施“寓兵于农”政策，还下令屯垦台湾，令诸将士寓兵于农，最北有噶玛兰地区、最南有琅峤一带，以点状分部。按镇分地、按地开垦。而期间也侵害到原住民族的活动空间，导致明郑政权与原住民政权的武装冲突，如明郑政权对大肚王国领土的侵犯，则造成数次战争。因于大肚王国与琅峤等在地政权的抵御，郑成功实际的统治范围，仅约北至二林（今彰化县二林镇），南达茄藤（今屏东县佳冬乡）。
南明昭宗永历十六年五月初八（1662年6月23日），郑成功薨逝，时年38岁。从其抵达台湾至逝世，仅仅4个月。
同年十一月，郑成功之世子郑经继位。此后郑经采用陈永华之议，建立完整的中央政府体制，使体制层次分明。
永历三十五年四月（1681年），郑克塽追谥其祖父为谥号“潮武王”。

嗣位之争

1662年（永历十六年）6月，延平王郑成功薨逝。黄昭、萧拱宸等人以郑经得罪先王不得继位为由，于安平拥立郑袭（郑成功之五弟）为监国，将军马信、黄安不从，马信于不久后逝世。赏勋司蔡政奉郑成功之衮龙袍入厦门晋见世子郑经，洪旭等人遂拥郑经为王。同年11月，郑经命周全斌为五军戎政，亲率陈永华、冯锡范等人攻入鹿耳门。右虎卫黄安闻讯后，率师前来会合，与黄昭会战并杀之，胜利后领兵进王城诛杀萧拱宸、张骥与曹从龙等人，流放其族人。事后，郑袭的家臣蔡云自缢，郑袭本人则遭郑经押回厦门软禁，不久惧死而投清。

郑泰事件

嗣位之争结束后，郑经继位。1663年初，郑经以洪旭守厦门、郑泰守金门。郑经听说郑泰与之前拥立郑袭为王的黄昭有书信往来，便怀疑他亦参与逆谋，因此欲召见他，郑泰却称病不见。参军陈永华以郑经将回东都为由，委任郑泰为“居守户官”，铸印送至金门并邀郑泰入厦门饯行。7月10日，郑泰率兵船赴宴，被郑经扣留软禁，船舰皆为周全斌所并，只有蔡璋逃回金门。郑泰之弟郑鸣骏与子郑缵绪率部属及家眷入泉州投降清朝。郑泰闻讯后自缢。郑泰死后，郑经巩固了自己的王权。

清廷和荷兰殖民者勾结

1663年10月，清荷联军部队围攻金门、厦门，郑军节节败退。1663年11月18日（永历十七年十月十九日），清朝与荷兰组成联军进攻厦门、金门，郑军不敌，退往铜山。战后军心不稳，大将周全斌降清，郑经只好退回台湾,并将「东都」改为东宁。1664年3月，郑经放弃闽南沿海诸岛，全面撤守台、澎，于初十日抵达台湾。这次退守湾，是郑氏所代表的南明抗清势力的总撤退，不仅郑经所辖的军队、官员都撤入台湾，明朝的缙绅遗老，也随郑经来台，此批入台总人数约有7000人。1665年，清荷联军继续进攻澎湖，遭遇台风、无功而返，清朝于是放弃了攻占台湾的企图，转而与郑经谈判。清朝的立即威胁解除后，郑经开始强化对台湾的统治力，郑经于1666年率兵进攻驻守鸡笼的荷兰军队，虽未成功占领，但荷兰方面认为鸡笼难以防守，1668年弃守鸡笼，亦从此放弃台湾。

别立乾坤

郑经退守台湾后，虽然仍奉南明的永历正朔，使用永历年号和“招讨大将军”的印信。但政权本质，与郑成功时代显然不同，而俨然以独立王国的姿态出现。诚如学者陈春生所说的，郑氏政府虽是明朝的延续，但其在台湾实际上已成为一个独立自主的国家。1664年8月，郑经表示乃谨守藩封，废东都称号，以“东宁”称全台湾，并以“东宁国王”自称。
面对清军和荷兰军队咄咄逼人的态势，1667年7月，郑经与清朝展开第一次谈判，郑经声称台湾“非属版图之中”、“东连日本，南蹴吕宋，人民辐辏，商贾流通。王侯之贵，固吾所自有，万世之基已立于不拔”；于1669年的和谈中，派遣柯平、叶亨赴泉州与清廷议和。郑经再度强调郑氏占领台湾是“建国东宁”、“于版图疆域之外，别立乾坤”，然而两次的谈判郑经皆以不接受薙发拒绝清朝，并用箕子朝鲜作比喻，谈判最终破局。
对台湾的统治能力日渐巩固后，郑经还任用陈永华为谘议参军，拓展实业，整饬吏治，强固治安，以官田、私田、屯田三田并用，使得饱经战乱的台湾得到休养生息的机会，也得到了发展的机会，一时间称为乐土。1668年，郑经还派军收复了荷兰人在台湾北部最后的据点—基隆，在台湾南北路和澎湖设置三个安抚司，在福建泉州一带建筑了19个具有军事性质的寨子，巩固了台湾内外围的防御。期间清军虽然两次进攻澎湖，都因郑军防守的当使得清军无功而返。此后十年间，台海维持了相对的稳定局面。
郑经试图以贸易来提升东宁的国力。除了与清朝进行走私贸易外，日本的德川幕府也是东宁国的重要贸易伙伴，东宁大量进口日本的银、铜等金属与盔甲，以武装自己的军队，双方贸易于1665至1672年达到高峰，郑经更允许日本商人居于鸡笼，以促进东宁与日本的贸易交流。日人以“东宁国王”称呼。郑经亦于1672年邀请英国东印度公司来到东宁国，并与之签订通商条约，出口糖与鹿皮并进口西洋枪炮以增强东宁军队的战斗力，另外更请求英国人训练炮兵，战争时更借用英国炮兵手作战。

西征大陆

1673年，清朝平西王吴三桂起兵反清，史称三藩之乱。1674年4月21日，清朝靖南王耿精忠起兵响应，隔海邀请郑经加入，郑经允之西征。但是只是联合发出讨伐满清檄文，并未联合出兵北伐，双方都是借此机会扩大地盘。郑经渡海后，要求耿精忠将漳州与泉州交给自己，但占领整个福建的耿精忠却拒绝之，郑经遂出兵占领海澄与同安，双方开始交恶。然而，泉州、漳州以及潮州陆续投靠郑经，耿精忠见情势不对便出兵进攻泉州，但却被东宁将军刘国轩击退，双方接着又持续相互进攻、战斗。1675年，耿精忠与郑经谈判，双方以枫亭为界，北属耿氏、南属郑氏，平息战斗。1676年，郑经击败平南王尚之信，迫使尚之信加入反清行列，郑经随后占领惠州。由于郑经于拥有漳州、泉州、潮州、惠州等四座首府后，又攻下汀州，因此与耿精忠的联盟再度破裂，腹背受敌的耿精忠只好降清。耿精忠降清后，独自面对清朝军队的郑经节节败退，明郑所得闽粤各地全部得而复失，前功尽弃，最后只好退回厦门，从此一蹶不振。。
1677年退回厦门后，清朝再度与郑经展开和谈，清朝康亲王杰书向郑经许诺郑经若从中国沿海的岛屿撤退，就答应比照朝鲜，成为清朝藩属并通商、永无猜嫌。1678年的和谈中，清朝将领赖塔给郑经的书信中声称，如果郑军肯退守台湾，则“本朝何惜海外一弹丸之地”，郑氏可永据台湾，清廷把台湾当成朝鲜、日本一样的外国，不必剃发易服、称臣纳贡也可以不必。郑经予以拒绝。

郑经去世

1680年，郑经从厦门撤守台湾。回台湾后，郑经曾专心治台，但是面对抗清局面不断恶化，意志开始消沉，移居北园别馆，终日饮酒赋诗、棋艺书画、出外狩猎，将东宁国政全权交予监国世子郑克𡒉与咨议参军陈永华。
1681年3月17日，郑经因狩猎摔伤不治，薨于北园别馆，得年40，统治东宁国近20年。1681年（永历三十五年）四月刚登基的元子郑克塽追谥其父王为“潮文王”。

东宁之变

1679年，郑经西征清朝之际，听陈永华之请将王子郑克𡒉立为世子，并授职为监国，号监国世子。由于其办事英明果断，颇有其祖郑成功之风范，因此人称东宁贤主，但也因此得罪了王叔郑聪等人。1680年，郑经西征无功而返，监国世子继续执政，并深得父亲郑经之信任，但后来总制陈永华去世，因此监国渐渐在政治上孤立无援。1681年（永历三十五年），延平王郑经薨逝。逝世前，于北园别馆将监国郑克𡒉托付给刘国轩。
郑氏宗亲郑聪等人眼见郑经已薨，便与冯锡范、刘国轩等人联手向董太妃进谗言，污陷郑克𡒉乃李氏之螟蛉子，董太妃一时不察便下令收回郑克𡒉之监国印玺。得到董太妃允许后，刘国轩与冯锡范便领兵进入延平王府捉拿监国、囚禁于北园别馆，并于当夜遭郑聪等人谋杀。监国遭谋杀后，原意仅是罢免郑克𡒉的董太妃亦无力挽回，遂命监国夫人陈氏将郑克𡒉之遗体送返延平王府、收敛守丧。丧毕，陈氏自缢。世子郑克𡒉遭弑杀后，自责的董太妃也于同年6月去世。明郑的实权落入外戚冯锡范与刘国轩手中，冯锡范拥立年仅12岁的女婿郑克塽（元子）为王，台湾民心渐渐涣散，东宁国亦从此一蹶不振。

清军攻台

1682年9月，郑氏降将施琅上书康熙帝请求征台，康熙允之。翌年6月，施琅奉康熙诏，进攻澎湖。经过澎湖海战后，7月中旬，施琅顺利击溃刘国轩所率领的东宁海军，攻占澎湖。
澎湖海战后，刘国轩大败而回，台湾面临灭顶之灾，郑克塽于廷上征众臣议，朝臣分成死守台湾、迁吕宋岛再战与降清三派。在战和降之间郑克塽犹豫不决时，建威中镇黄良骥说：“今日澎湖失守，台湾危在旦夕，不如将大小战船和洋船，分配来运载家属和士兵，从这个山边直下，夺取吕宋为基业。”提督中镇洪邦柱说：“建威中镇所言取吕宋十分有道理，我和良骥愿当先锋。”冯锡范却说：“以全部军队攻取吕宋也不是难事，但不知道那里的实际情况如何？”中书舍人郑德潇说道：“议取吕宋来避开清军锋芒，这个计策很好，有详细地图在这里。”大家都围过来看吕宋地图。而刘国轩却对冯锡范说“欲攻吕宋，虽是良策，可行于澎湖围失之前。今澎湖已失，人心怀疑，苟辎重在船，一旦兵弁利所有而反目，尊公之前车之鉴也。”冯锡范的父亲冯澄世在1644年，从铜山过台湾的途中，遭到其仆人暗中串通船员暗算，卷走其财物，向满清投降，大家听到这个事例后，打消了攻取吕宋为基业的念头，郑克塽选择了刘国轩的建议，最终决定降清。

降清灭亡

1683年（永历三十七年）9月，与众臣商议后，郑克塽呈降表予清。明朝降清不久，鲁王世朱子桓、泸溪王朱慈旷、巴东王朱江、乐安王朱俊、舒城王朱著、奉南王朱熺等其他明朝宗室随郑克爽降清，而宁靖王朱术桂身着大明衣冠而自杀，同时施琅入台纳降。自此，东宁亡国。从1661年（永历十五年）4月郑成功入台到郑克塽1683年（永历三十七年）9月降清为止，郑氏计在南台湾经营共23年。
清将领施琅受郑克塽投降后，台湾正式进入清治时期。清朝消灭东宁后，除了大举毁灭东宁王朝的文化，更将东宁朝臣们与其亲属大举迁往清国。其中，郑氏王族纳入上三旗管束；文武官员与士兵则分别迁至在山东、山西及河南诸省垦荒，使台湾失去可能领导反清的人物。至于东宁的大量遗民，清廷则采取以汉治汉的策略，长期以攻台将领担任台湾军事首长。如福建水师一职从1684年至1721年计37年间共历施琅、张旺、吴英、施世骠四任提督，除张旺之外，其他皆是攻台将领，尤其是施琅、施世骠父子共任职达25年之久。在陆路提督方面由万正色、吴英、蓝理皆为攻台将领。

疆域

1662年之前，郑氏的军政中枢都是在中国大陆东南沿海一带的厦门，在攻下台湾和郑成功去世后，明郑政权实际领导人郑经才将政经中心从厦门移往台湾，统治辖域仍包含福建的金、厦两岛。
明郑有效统治区域只有今台南市西部以及嘉义县与高雄市之沿海地区。明郑灭亡时其疆域人口仍未达到20万，由此，台湾绝大部分地区依然由如大肚王国等原住民政权所掌握和统治。1664年4月，明郑于多次战役后，丧失金厦，明郑势力于中国大陆消失，转以台湾为最后根据地。同年，荷兰人出兵占领鸡笼（今基隆），郑军随后也于1665年进驻淡水，与荷军对峙。由于补给困难，贸易也始终无进展，1667年东印度议会以损失荷兰盾八万元为由，裁决撤出基隆，翌年7月将所有公司职员接回巴达维亚，自此荷兰人彻底放弃夺回台湾。
明郑除了拥有台湾地区部分领地外，也于1673年－1680年三藩之乱期间，以军力占拥有对岸大陆闽南地区的漳州、泉州、兴化，和广东的潮州、惠州等部分领土，可惜后来逐步沦丧。

行政区划

地方行政方面，可分为两个阶段：郑成功时期与郑经时期。1661年，郑成功击败荷兰东印度公司，五月占普罗民遮城，改赤崁地方为东都明京，台湾总地号为“东都”。还实施郡县制度，设置了“一府二县”，承天府、天兴县以及万年县，并以承天府安平镇为京畿。其中，天兴县县治设于佳里兴（今台南市佳里区），而万年县县治则设于二赞行（今台南市仁德区二行里）。此外，明郑还先后设置了思明州、思明县，管辖厦门、金门等岛屿。
1662年，郑成功逝世，世子郑经经历政争后掌权，对行政区划进行变革。全面实施并沿用郑成功设置的郡县制度，但稍稍做出变革。保留承天府，京畿承天府主事官为承天府府尹，改二县为二州，即地方的天兴与万年两州主事官则为知州（郑成功在位时期则为两县知县），于天兴州以及万年州之下，设有“二十四里”。为了安抚原住民族，于原住民居住地区，设置澎湖、北路以及南路等三个安抚司，其主事官为安抚使，形成“一府二州三司”平行的体系。承天府京畿地区又设有东安坊、西定坊、镇北坊以及宁南坊四坊，坊设签首。承天府以及两州的里级行政区则设有总理。签首及总理两职负责的职务如：户籍、迁徙、婚嫁、出生、死亡等基层民事，并规定按时汇呈州府。

政治

在行政上，延平王拥有至高的权力。延平王之下，设有咨议参军又称为幕府，总理国政。参军府辖下又设立六官（吏、户、礼、刑、兵、工），六官皆设有主事，其下又设都事，品秩分别比照侍郎与郎中。另外，又设立察言司、承宣司、审理司、赏勋司、中书科、储贤馆、育胄馆等官僚机构。1674年，郑经西征清朝，命陈永华为东宁总制，于六官之上；然而，郑经诸弟骄横难制，郑经因此于1679年立长子郑克𡒉为世子，并授职监国，于总制与六官之上，总理东宁国政。东宁之变后，冯锡范掌权，并以侍卫镇掌政，并身兼咨议参军之职，而六官则继续实行。东宁官员在郑成功时自称为“卑职”，在郑经时则改为“臣”，制度已趋成熟。

明朝宗室

明郑以中国明朝之封国自居，奉南明永历帝为国家元首，始终以“永历”为年号。郑成功尚未攻台开国前，曾获永历帝特准设置六官方便施政，并可委任官职，武官最高许达一品，文职可达六部主事。郑成功每次拜封官员，都请宁靖王朱术桂等明朝宗室在旁观礼，以示尊重体制。郑成功来台后，依然优礼明朝宗室，接待鲁王世子朱弘桓、泸溪王朱慈爌、巴东王朱尊江、乐安王朱俊、舒城王朱慈著、奉南王朱熺、益王朱怡镐、鲁王公主朱氏姊妹等多名宗室到台湾。永历十七年（1663年），继位延平王的郑经也迎宁靖王到东宁，于承天府府署（今台南市赤崁楼）旁的西定坊建立宁靖王府邸，并供岁禄。
相对于郑氏家族的核心权力，流寓东宁的明朝宗室却无政治权力；且郑氏在永历帝驾崩之后，并未拥立其他亲王为帝，政权决策圈亦未纳入领有岁禄的宁靖王朱术桂、鲁王世子朱弘桓等人；郑氏还曾自行与英国东印度公司签订通商条约，条约中尊称郑经为“国王（King）”、东宁人民为其“臣民（King's person）”，展显出郑氏事实上对内对外的宰制权。

反清复明

明郑以台湾为抗清根据地，以反清复明为号召，使得一大批仁人志士跟随明郑东渡台湾，形成了一个明朝遗民群体。他们坚持汉族“华夷之辨”的儒家正统观。在明郑在同清朝斗争中，又产生分据台湾对抗清朝的本土意识。这种现象的实质是明朝遗民对抗满族统治的民族精神，在避居台湾后转化成热爱台湾这块不受清朝统治土地的本土意识。这种民族精神与本土意识的并存与互动，构成台湾汉族民众反抗清朝统治的两个思想层面。

亲军镇

提督之下设“卫”与“镇”。卫为亲军，镇则非亲军。郑成功尚未占领台湾之前，亲军为镇，称为“亲丁镇”。1650年增设“戎旗镇”。1652年亲丁镇全镇覆没，而未再设置之。1656年扩编戎旗镇为左右二镇，1658年则改名为左右武卫。同年，又增设仿日本武士的亲军部队－左右虎卫。1662年，郑经为国主，升左虎卫黄安为勇卫，其位于武卫与虎卫之上；黄安殁，咨议参军陈永华继之。又设置侍卫，由冯锡范统领，位于勇卫与武卫之后。郑经死后，外戚冯锡范发动政变，杀监国克𡒉，改立元子郑克塽为王，并开始以侍卫掌政、统领六官，直至东宁灭亡。

特种镇营

特种镇营中，马兵有北镇以及铁骑镇；火器有神器镇。郑成功攻台成功后，建立护卫镇，由荷兰时期的尼格罗人种裔佣兵“乌鬼”（Oo-kuí）组成，手持步枪，专门守卫延平王府。

农业经济

在经济方面，明郑于台湾经济史仍占有一定比例。其中，以经贸与农业为主。于农业经济方面，为了解决军队兵粮问题，不论郑成功或郑经基本上都贯彻“寓兵于农”的策略，也是诸将士平日分散各耕地，按镇分地、按地开垦。这种具有营盘田、文武官田的土地私有制，于定则征赋的经济模式下，大量提供经济产能。根据统计，包含承袭荷据已开垦的“王田”、后续开发的营盘田、官田、私田等，明郑时期拓垦的田地超过一万八千四百五十四甲以上。此等经济开发，虽造就农耕文化盛行的汉人，但郑氏王朝扩张领土的行动，却也同时让台湾原住民面临比荷据时期更严重的生存危机，导致与大肚王国发生冲突，并对平埔族展开屠杀。为了军需民食，台湾农产重心由糖转米，这个农业经济的性格转变直至今日仍影响台湾。公元1665年，陈永华的农业水利更促使汉人移民至今高雄的方向发展。除此，陈永华引进同安制盐法至台湾来发展盐业经济，除此尚有鹿皮、鹿角、鹿脯等土产的外销，因此多鹿的台湾，来自原住民团体的捕鹿业，也是早期台湾的重要经济产业活动。明郑时期，只对16岁以上男子课“人丁银”；有别于荷兰统治台湾课以七岁以上台湾居民须缴“人头税”（以鹿皮缴交）。

山海五商

郑成功在和满清的多次较量中，控制了“上自舟山，下至南澳”的东南沿海一带，清军为了对付郑成功的海军，采取海禁政策，1661年下令山东、江苏、浙江、福建、广东等地迁界禁海，企图通过坚壁清野和经济封锁来扼杀郑氏。为了突破封锁和敛聚财富，郑成功创立山海五商。山海五商分为山五商与海五商。山五商分别以五行“金、木、水、火、土”为商团名，分布于北京、苏州、杭州、山东，采购丝绸等大陆货物商品并运销外洋。海五商则掌管贩运东西两洋之船舶，分别以五常“仁、义、礼、智、信”为其商团名，皆设立于厦门。山海五商下又设有分支行号，遍布中国东南各大城港。
“山海商批货，海五商销货”为山海五商之分工模式。山五商向利民库领取公款，于苏、杭等地收购丝绸、瓷器等货品，并交予海五商后，再至利民库结账并提领下一批公款。海五商交接获物后，交予船队。船队交易结束后，再至利民库结账。山海五商各司其职。船队方面则以航线作为区分。东洋船队以日本、台湾、吕宋为主要航线；西洋船队则是航行于南洋、波斯，战争时转调战船使用。山海五商与东西两洋船队皆隶属于中央的户官管辖之下，财务各自独立，无从属关系。另外，“领本独立贩运个商”则是向郑成功借贷资本、缴交利息并受监督的商团。将苏杭货品运至海外销售，回航时采购海外货物并售予厦门之海五商。无论山五商、海五商或者是个体户商团，除了商业活动外，亦从事情报工作。
郑经主政后，承继之。1664年（永历十八年）退守台湾后，清朝实施迁界令，山五商受尽挫折。后采取陈永华之议，以贿赂、秘密交易之手段突破封锁。郑经西征清朝时，厦门岛之商业再度兴盛，而舟山群岛则利用行贿，伪装渔船、猎船出海贸易，并派出海军巡逻保护海上贸易之安全与顺畅。

人口

根据《台湾通史》的推断，明郑晚期的台湾人口，已经近趋二十万人。

教育

1662年，郑成功抵台湾，开中华制度之始，未致力于推行汉文化教育。郑经继承王位后，初期亦因忙于对抗清荷联军而无暇文教；直至1664年败退东宁才开始建设并推行台湾文教。郑经鲜少亲理国政，多委由宰辅陈永华掌理。1665年9月，陈永华认为开辟屯垦略显成果，启奏郑经请求兴建圣庙、普设学校；起初，郑经以“荒服新创，不但地方局促，而且人民稀少，姑暂待之将来”等语推辞，但在听完陈永华以下言论之后，郑经立刻下令择地兴建圣庙。
昔成汤以百里而王、文王以七十里而兴，岂关地方广阔？实在国君好贤，能求人材以相佐理耳。今台湾沃野数千里，远滨海外，且其俗醇；使国君能举贤以助理，则十年生长、十年教养、十年成聚，三十年真可与中原相甲乙。何愁局促稀少哉？今既足食，则当教之。使逸居无教，何异禽兽？须择地建立圣庙、设学校，以收人材。庶国有广士，邦本自固；而世运日昌矣。
 — 《台湾外纪 · 卷十三》
陈永华选定于承天府宁南坊鬼仔埔兴建圣庙，命名为“先师圣庙”，并采行“庙学制”于旁设立明伦堂作为国子监。明伦堂为平时之教学场域，此外亦作为饮射、读法、宾贤学习礼仪之处。圣庙落成之日，郑经率领文武百官，亲诣圣庙举行祭祀至圣先师释菜礼，圣庙四周围绕上千东宁士庶，已深具儒家风气。圣庙落成后，郑经又再度下令设立社学，由中土儒士前往民间教导东宁子弟。当时东宁之社学可分为“汉庄社学”以及“土著社学”，学童年满八岁即进入社学学习经史和写作，定期实施考课。1666年（永历二十年）2月，陈永华订定“两州三年两试，照科、岁例开试儒童。州试有名送府，府试有名送院，院试取中，准充入太学”的取材模式。太学教育上，则“仍按月月课，三年取中式者，补六官内都事，擢用陞转”。
由陈永华所建的台南孔庙，被视为引进汉文化教育典章之初始；日后清国历代知府修建文庙时，缮造东大成坊的“全台首学”门额更闻名全国。但早在中国汉文传入前，荷兰联合东印度公司入主赤崁时便引进西方的教科文制度。属喀尔文教派的欧洲传教士在大台南地区传播福音、编撰字典，让大量的平埔族人（尤以本地的西拉雅族人）学习罗马拼音文字的圣经、主祷文、十诫等典籍，并进而进行语文系统的沟通。被列为国家重要古物的西拉雅波多诺伏文书便是台湾古代教育史上的珍贵见证。

衣冠制度

1650年代后，清朝多次尝试与明郑政权和谈，但从郑成功以至郑经，服制问题始终是明郑与满清双方谈判时，所重视的条件之一。
清康熙二十二年（公元1683年）明郑降清，台湾汉人的衣冠服仪制度也有所转变，根据文献的记载：“十九日（1683年7月），施琅遣侍卫吴启爵至台晓喻薙发…。二十日，克塽令兵民悉遵制削发。是日，福建总督姚启圣亦遣…至台招抚，见兵民已薙发，知功归于琅，…。十八日，克塽率文武官佐悉薙发易服”。

道教、佛教与民间信仰

祭祀官方性质的有“明朝护国之神”称号的真武玄天上帝的真武庙、郑氏另外又祭祀教人忠义，保佑商业的关帝；关帝庙数量更是当时之冠。设民庙者寥寥无几，有守护水师之妈祖庙，有慈悲送子，广渡众生的观音亭；保身康健的医神大道公庙；以及主祀地府主宰，五岳山神之首东岳大帝的东岳庙。

儒教

至圣先师的孔子庙，素为文人所重。明郑东宁总制陈永华建了台南孔庙，附设学堂，人称“全台首学”。

真武与妈祖

由于明王朝极重视代表众星拱辰的真武玄天大帝，奉玄天上帝（上帝公）为护国之神。故东宁亦将明朝“护国家神”真武大帝奉为王朝守护神；香火传入大员后大力兴建真武庙，促成来台汉人热切信仰真武大帝；其中位阶最高的台南北极殿享有“大上帝庙”美誉，为官阶最高之大庙，敬以春秋两大祭。当时中国渡来汉民、兵士、商船航行海上需依靠北极星以进行船舶导航，因此来台汉人亦多数信奉上帝公。但女神妈祖早已名震闽南，水师官兵有相对少数的妈祖信徒，故明郑官方亦偶祭祀之。
清王朝攻台是利用当时相对少数的妈祖信仰，对明郑官兵发动心理攻势，因此东宁王国灭亡后，清廷便大肆在台宣扬妈祖神迹，贬低原有的真武信仰与庙宇位阶。故东宁王国盛行的玄天上帝延至清治时代中叶后逐渐不及于妈祖。日后清王朝遂利用妈祖信仰之宣传战对付各种抗清运动，历经日治时期民间对传统信仰的凝聚力，最终使妈祖成为信仰主流。

基督教

台湾北部本为西班牙殖民，有许多天主教信徒，在西班牙败于荷兰后多已离去。至于基督新教方面，在荷兰统治时期与基督教密不可分，研判当时已有不少汉人新教徒及波多诺伏社原住民新教徒。代表人物为郑成功在台通事何斌。随着荷兰东印度公司败退离台后，基督新教也与荷兰人一起退出台湾，在台湾传播首度中断。

清帝国

郑经曾派柯平、叶亨与清廷议和，并要求礼遇同等于李氏朝鲜的国与国地位，但不被慕天颜接受。

日本

由于清帝国对明郑势力的封锁，郑经便开启对外贸易，其中包含与日本的往来。当时对日本主要输出品为稻米、鹿皮、蔗糖及来自中国的丝织品，输入银、铜、铅、盔甲、棉布、瓷器等，双方的贸易量在1665年到1672年达到高峰，为了加强双边的贸易关系，郑经允许日本商人住在基隆。也因为通商频繁，东宁亦流通当时日本的货币－宽永通宝。

朝鲜

1667年农历五月初十日，林寅观、曾胜与陈得等人率领4艘货船从台湾东宁国起程，前往日本贸易，以及请求日本出兵帮助台湾反攻大陆。途中遇风，1艘货船于五月二十三日漂到朝鲜，二十五日在朝鲜王朝济州岛大静县猊来里浦浦口东边歧头处，被当地政府发现，自称“大明福建省官商人”。船上95人，被称为“漂海人”，引起朝鲜兴趣，随即他们被带往汉城。朝鲜自身以“小中华”自居，崇明反清，同情汉族被满清帝国统治不得已剃发易服，所有如何处置该船及人员就在朝廷上引发争执，很多朝鲜士大夫听说“明朝”还存在，异常激动。但由于怕得罪清帝国，朝鲜显宗最终还是力排众议，决定把他们送交清国。结果清廷将95人全部杀害。此后朝鲜对台湾东宁漂来船舶改变办法，不准其登陆，就地遣返，以避免再次发生此类悲剧。

大肚王国

大肚王国为台湾原住民族所建立的部落王国，国王自称为白昼之王，统治著中台湾。1661年，明郑政权开启了对台湾的统治后，大肚与郑氏的关系就处于敌对对立的关系中。

荷兰

早在郑芝龙时期，明郑势力就开始和荷兰人接触，并且通商。料罗湾战役，荷兰人被郑芝龙打败，此后荷兰人据守台湾，直到郑成功攻下热兰遮城，荷兰人才开始逐渐退出台湾。

英国

1670年7月，与英国东印度公司签立十三条通商约款，并且在安平设立台湾商馆，主要内容为英人可在台湾自由贸易、关税为百分之三，公司可得视需要随时提出条款，台湾国王（郑经）应尽量承认。为台湾史上第一份国际通商条约。1675年两方再增补充条款十条。

西班牙

嘉靖四十四年（1565年），西班牙开始殖民统治菲律宾群岛；万历三十一年（1603年）和崇祯十二年（1639年），西班牙殖民当局两次屠杀在最大岛吕宋的华侨华商，死亡人数高达五万余人。
郑成功于攻下台湾不久后，听闻在被西班牙人在菲律宾有杀戮与掠夺华侨的罪行，勃然大怒。永历十一年（1657年），郑成功曾经致函给爪哇岛巴达维亚的一位华侨甲必丹，要求他停止与菲律宾的西班牙殖民者进行贸易往来。郑成功曾多次对菲律宾华侨表示关切，并提出要率兵攻取菲律宾，以惩罚西班牙人。
永历十六年（1662年）四月，通过意大利籍神父李科罗向菲律宾的西班牙总督递交国书，谴责其杀戮掠夺华侨的罪行，令其“改邪归正，俯首纳贡”，但西班牙人反因此在马尼拉进行了第三次对华侨的屠杀。郑成功闻讯大怒，决定挥师征讨，为华侨报仇。他一面抚恤安置从菲律宾逃到台湾的华侨，一方面组织筹备军队，派人暗中与在菲律宾的华侨联络，以便到时可里应外合。但尚未出兵，当他又听闻其子郑经在厦门居然跟其幼弟的乳母陈氏私通，郑成功勃然大怒，命自己的堂兄郑泰斩杀郑经，郑泰因不忍与辈分关系而抗命。

吕宋

吕宋现为东南亚的菲律宾，乃中国近邻，漳泉之外集，距离台湾很近。与台湾相比，吕宋更辽阔，更富有。况且西班牙人占领以后，视吕宋为禁脔，对待华人最无礼，郑氏也对此耿耿于怀。攻取吕宋以外外府，掌握马尼拉方便采购，这一战略构想早在郑成功脑海里构成。因此，郑成功想效法林凤，远征菲律宾。但是不久郑成功身死而功败垂成；郑经时，本来已经调集了部队南下，因接到大陆耿精忠联合讨伐满清，遂将部队派往厦门，攻取吕宋之事半途而废。郑克臧末期，清军进攻台湾，明郑诸臣建议攻取吕宋，以保存大明遗脉，但是早到了刘国轩和冯锡范等人的反对，打消了攻取吕宋的念头，转头降清。郑氏政权曾有三次机会可以间质吕宋，把制海权推进菲律宾群岛，却因为第一次不能，第二次不想，第三次不敢，永远的失去了机会。

越南南部明乡人始祖

郑经在三藩起事时出兵大陆，后因战事不利撤退，若干将领四散海外，礼武镇总兵杨彦迪率兵眷三千余人投奔广南国，二镇总兵周云隆率一队船在舟山，房锡鹏也有一支船队在浙江乌洋，黄进在琉球。
杨彦迪被广南国安置在今越南南部同奈省、巴地头顿省一带，他本人对此不满，率兵移居今前江省美湫市一带，他的部将陈上川则按照广南国的安排，定居同奈省、巴地头顿省一带。这只华人的后裔以明乡人之名传后世。明清之际移居越南的明国遗民，通常怀有强烈的民族情节，着明服装、戴明儒巾，保持着明朝特色，标榜自身的“明朝人”身份，以中华正统文化的继承者自居。朱姓的明帝国灭亡，而“海上明朝”不灭。

正朔内涵

根据史载，郑氏于对外之官方文书中，自始自终皆奉南明的永历帝为其正朔帝王；即使永历帝早在1662年遭吴三桂擒获后缢死，郑氏依然持续使用“永历”为年号直至1683年末代藩王郑克塽降清为止，前后共历21年。面对满清，郑氏始终以“大明中兴”、“反清复明”或“反满复汉”为其政治愿景，并在台湾推广认同明朝的儒学教育，一直保持着流亡政权的统治姿态。1683年，郑克塽便是以“延平王”的身份向施琅投降，其降表中载明缴纳“延平王金印”及“招讨大将军金印”各一。许多学者将1949年退守台湾的国民党政权类比为郑氏政权，因为他们都在大陆战败而转进台湾，同时也都宣称将以台湾作为复兴基地以便在未来“反攻大陆”。
不过，综观郑氏的作为，有许多方面并未遵守郡王家族应有的封建地位。按照法理，郑氏仅有郑成功本人接受过永历帝的册封而封王，其子郑经与其孙郑克塽则从未也无从得到任何明朝皇帝的册封；然而，郑经却在郑成功薨殂之后，擅自自称“世藩”继承王爵并统治东宁；中年后，郑经更要求东宁士庶向自己“称臣”，并册封长子郑克臧为摄政世子，此等举动被文人沈光文以“郑锦僭王”等字句批评。此外，郑经曾留下“建国东宁”、“别立乾坤”等语意不明确之语句，对此，当代学者各持有不一样的解读。郑经死后，郑克塽借由政变登基，不仅自行晋封“潮王”郑克塽亦擅行皇帝职权，分别以“武”、“文”二字追谥祖、父二辈。除追谥之外，王族郑聪、郑克壆等人及重臣刘国轩、冯锡范等人皆得到公爵、侯爵或伯爵等不同等级的爵位。

实质上为独立政权

明郑统治“南台湾”的时间虽然不长，对台湾之政治认同的发展，却有极重要的意涵。一方面，它不只是台湾历史上“第一个汉人政权”，也是一个事实上独立的政权。
郑成功在驱逐荷兰人以后，将“大员”改名为“东都”。为解决兵粮问题，令诸将士“寓兵于农”，按镇分地、按地开垦。到了郑经时，采陈永华之议，建立完整的中央政府体制，体制层次分明，俨然一独立国家。
英国、日本等国家，也将南台湾视为一个独立国家进行贸易往来；“英国东印度公司”曾与明郑政权签订通商条约，当时英国人直称其为“台湾王国”或“福尔摩莎王国”，英国东印度公司上书郑经时，则称呼其为“陛下（Your Majesty）”。
究其根本，实因奉明朝正朔永历年号的郑氏，如果正式称帝，将会有窜夺大明正统之虞。因而仅依郑成功于南明永历九年四月(1655年)敕封为延平王的郡王爵位，始终以“王”自居。

郑家为中国“收复”台湾的议论

为设立贸易据点，荷兰东印度公司占领不受明朝政府管辖的福尔摩沙（今台湾）大员（今台南市安平区），建立台湾史第一个近代政权。明帝国对于荷兰人占领台湾并无异议，因为台湾并非其所认为的领土。
根据中央研究院院士杜正胜与曹永和的研究：“明朝虽实施海禁，但台湾不只明朝不管，甚至也不属任何国家管辖，所以走私船早在当时就在基隆、安平与淡水会合明朝、日本与西班牙、葡萄牙与荷兰的商船。...根据荷兰史料，当时东印度公司指挥官莱尔森于1622年到福州谈判，明朝官员为了劝诱他们撤出澎湖，建议他们到澎湖以东，一座不属于明朝的岛屿，也就是台湾，间接同意明朝船只到大员（今安平）与之通商。...当时明朝官员向莱尔森说：“你不知道大员怎么去，我们派船带你去”。这段史料，显见明朝福建官员知道台湾，却不把台湾当作属地。而同样年代，明代的史料记载的是，官员软硬兼施，并请海商李旦居中协调，荷兰的新任长官宋克，才在1624年拆除澎湖城堡的建材，搭乘热兰遮城号商船，来到大员上岸，宋克也成为荷兰建立台湾政权的首任长官，他也在大员建立热兰遮城。”
此外，清朝雍正帝说：“台湾地方，自古未属中国，皇考（指康熙皇帝）圣略神威，拓入版图”，乾隆年间《重修福建台湾府志》序言：“台湾……然自宋元以前不登经传。至明季而后，始有荷兰屯聚……迨康熙癸未，始入版图，改隶郡邑。”，卷二又写道：“台湾府，古荒服地，先是，未隶中国版图。”。故由清朝皇帝的皇府的书籍以及官方的地方志而知，清人认知台湾在清朝之前不属于中国，而是1684年（康熙二十三年）才纳入中国版图。查继佐在《东山国语》说：“台湾，洋夷也，独用夏以变夷。”，也未将台湾当为中国领土。
而郑成功为中国收复台湾的说法，来自后来《台湾通史》所载一封郑成功致荷兰东印度公司末代大员长官揆一的劝降书：“...然台湾者，中国之土地也，久为贵国所踞。今余既来索，则地当归我，珍瑶不急之物悉听而归。……”，然而此段既与荷兰所载书信不同，又不见于任何明清文献，被认为是连横所杜撰，陈昭瑛认为是连横从江日昇《台湾外记》所记“此地非尔所有，乃前太师练兵之所。今藩主前来，是复其故土。”改写。
实际上郑成功在出征台湾之前，所发表的文告表示：“本藩矢志恢复，切念中兴，恐孤岛之难居，..冒波涛，欲辟不服之区，暂寄军旅，养晦待时，非为贪恋海外，茍延安乐。”，有“不服之区”、“海外”之说，儿子郑经则自己认为台湾是大明的反攻基地，而台湾不是大清的领土。

历史定位

对当今所谓“台湾问题”与台海现状持不同政治立场的学者，虽然立论的基础并不完全一样，却不约而同地对郑成功这个短暂的政权有着极高的评价。首先，中国学者盛赞郑成功是驱赶“红毛番”的民族英雄，包括中国国民党和中国共产党相关方面的学者；再者，中华民国在台湾的学者，则强调他“恢复中原”的志向、以及对明朝坚决效忠的国族情怀；第三，支持台独的学者人士，则认为郑氏政权是台湾历史上的第一个独立王国。2016年，多个台湾原住民团体于台南火车站前，称对原住民族来说，郑成功却是开启族人不断被外来政权殖民与压迫的历史命运。