Half-Life 2: Episode Two

עלילה

הפרק השני בסדרה, מתחיל בכך שהשחקנים מגלים כי השניים בסדר. לאחר שיחה קצרה נוצרת סופת פורטל (תופעת לוואי של "הסופר פורטל" שנוצר עקב פיצוץ הכור של המצודה, ומורכב "מאנרגיה אפלה"), אשר לא גורמת נזק לגורדון או לאלכס, אך מקריסה את גשר המסילה.
השניים נכנסים למכרה נטוש, אך כאשר הם מגיעים ליציאה ונכנסים לקבוצה של ביקתות נטושות, מותקפים השניים על ידי "האנטר" (צייד) יצור סינת' של הקומביין (יצורי סינת' הם יצורים ששולבו עם אמצעים טכנולוגיים עד למצב שבו לא ניתן לזהות הבדל בין היצור הביולוגי לתוספות הטכנולוגיות).
לאחר מאבק קצר ביותר, ההאנטר מכניע את אלכס, ומעלף אותה. פרימן חוזר להכרה, ופוגש וורטיגונט אשר מסביר כי למרות מצבה הקשה של אלכס, עדיין ניתן להציל אותה. הוא יוצר קשר עם וורטיגונים אחרים, באמצעות הוורטיסנס.
גורדון נאלץ לעבור דרך מכרה נטוש, אשר עכשיו משמש את האנטליונים כמושבה, ובדרך מגיע לבסיס קטן של ההתנגדות, שם הוא נאלץ להגן על אלכס ועל הוורטיגונים אשר מנסים להציל אותו מהאנטליונים, ביחד עם גריג ושקלי, שני חברי התנגדות אשר שמו את ביתם במכרה. כעבור כמה דקות לחימה, מגיע תגבורת של שלושה וורטיגונים, אשר עוזרים לגורדון, גריג ושקלי להביס את האנטליונים.
השניים יוצאים מהמכרה, אך פוגשים שני אנטליונים שומרים, ולאחר שהם מביסים אותם, מספר הוורטיגון על כלי רכב אנושי הנמצא לא רחוק. גורדון נאלץ לעבור דרך בסיס נטוש של ההתנגדות, תוך כדי זומבים תוקפים את המקום. אחרי שהם מוצאים את המכונית, אלכס וגורדון מגיעים לתחנת רדיו, שם הם מנסים להזהיר את הבסיס ביער לבן על מתקפה של הקומביין, אך הם לא מצליחים, והם מותקפים על ידי האנטרים. לאחר כן מגיעים השניים לחווה נטושה, שם הם מותקפים על ידי יצור חייזרי בשם אדוויזור (ניתן לראות שכתוב עליו 314 URB-LOC 0017 - מספר סידורי), יצור דמוי תולעת או גולם בעל יכולות טלפתיות, שכנראה זהו הקומביין האמיתי (חיילי הקומביין הם אנשים שנמחק להם הזיכרון, ובמקום זה הוכנס להם תוכנית אימונים מיוחדת של הקומביין). לפני שהיצור בורח הוא קורא לתגבורת, והמקום מותקף על ידי הקומביין. הם מגיעים לבסיס קטן של המחתרת אך הם מגלים שהמנוע של המכונית נשרף. לאחר לוחמה במסוק המסוק מתפרק. אלכס מבקשת מחבר המחתרת לתקן את מכוניתם כדי שיכלו להתקדם אל White Forest (בסיס המחתרת).חבר המחתרת מסכים אך הוא אומר שיש בחוץ המון זומבים ומתקן מיוחד של הקומביין שיורה טילים קטנים מפריעים להתקדמות. לאחר לוחמה במתקן ובזומבים שנישארו חיים המכונית תוקנה. חבר המחתרת הוסיף בונוס למכונית: רדאר המחפש מין דברים קטנים הדומים למצבר שהם שולחים אות לקומביין. לאחר לוחמה רבה אלכס וגורדון נוסעים בכפר קטן ומגלים שהכפר הקטן הוא בעצם מלכודת. לאחר עוד לוחמה גורדון מבטל את הכור ושניהם נוסעים. הם ממשיכים עד שהם פוגשים בדוג המנצח סטריידר. דוג מוביל אותם לבסיס המחתרת.
במבצר המחתרת הגרעיני, ההכנות לקראת שיגור הטיל לסגירת הפורטל בעיצומן. לאחר לחימה במספר של האנטרים וסטריידרים, הטיל מושגר ומתפוצץ בהצלחה. אלכס, אביה וגורדון מתכוונים לצאת בחיפוש אחר הספינה האבודה - ה"בוראליס". כאשר הם עומדים לעלות אל המסוק, זוג אדבייזורים פורץ אל מנחת המסוקים. אחד מן האדבייזורים משתק את אלכס וגורדון, בעוד שהשני רוצח את איליי על ידי מציצת מוחו. דוג (הכלב הרובטוי הענקי של אלכס) תוקף ומבריח את האדבייזורים, ומציל את השניים. בסוף המשחק גורדון שוכב על הרצפה ורואה את אלכס מבכה על גופתה של אביה.
גורלם של השניים נותר לא ידוע, כיוון שהפרק השלישי מעולם לא הוכרז על ידי Valve.

הבוריאלס

הבוריאלס היא ספינה ששייכת ל-Aperture Science, המתחרה של Black Mesa. מסופר שהספינה נעלמה ואיש לא יודע מה עלה בגורלם של צוות הספינה. הבוריאלס נמצאה בקוטב הצפוני, קרוב למיקום השידור של ג'ודית במשחק הקודם. אייזק קליינר אומר שבבוריאלס יש טכנולוגיה אשר מסוגלת להביא ניצחון לאנושות (ככל הנראה, טכנולוגיית הפורטל הנייד - ה-ASHPD), ושהקומביין עדיין לא הצליחו להגיע אליה. לעומת זאת, אילי וונס, מתנגד לרעיונו של קליינר וטוען שיש להשמיד את הספינה.

דוקטור ארן מגנוסון

עבד עם גורדון בבלאק מסה ואף הוזכר בסצנה קצרה מאוד בתחילת המשחק הראשון, כאשר גורדון "בטעות" הרס את הארוחה שלו במיקרוגל. דוקטור מגנסון מקבל תפקיד משמעותי בפרק השני כיוון שהוא המציא את מכשיר המגנסון - מכשיר אשר נדבק לסטריידרים על ידי זריקתו מהגרביטי גאן והריגתו במכה על ידי ירייה מהאקדח ה 9 מ"מ ישירות למכשיר. המכשיר היווה חלק בלתי נפרד מתקפת הסטריידרים והאנטרים לפני שיגור הטיל, שכן לא ניתן לעבור את השלב ללא המכשיר.