בית אם

בריאה

ונדה מקסימוף, שידועה בזהות מכשפת השני, חיה על האי ג'נושה המוחרב תחת השגחתם של צ'ארלס אקסבייר ואביה מגנטו. אקסבייר מיידע את מגנטו שכוחות הטלפתיה שלו לא יספיקו להדוף את יכולות שינוי המציאות של ונדה וכי חייב להימצא פתרון קבוע יותר. מגנטו מאשים את עצמו בעיוותם של ילדיו דרך חלומותיו ושאיפותיו האישיים.
בינתיים, אקסבייר מארגן מפגש בין קבוצת האוונג'רס, אקס-מן וכמה מגיבורי-העל במגדל האוונג'רס כדי להחליט על גורלה של ונדה. אמה פרוסט מגיעה למסקנה כי הדרך היחידה למנוע מהקסם ההרסני של ונדה להתפשט הוא הריגתה. קפטן אמריקה, לעומת זאת, מציע שעל הקבוצה למצוא דרכים אחרות להתמודד עם ונדה, כמו לדכא את כוחה ואת אי-שפיותה. האקס-מן מעלים טענה לפיה אם השמועה תתפשט שמוטאנט בעל כוחות לשינוי מציאות השתגע, מה שישלח את היחסים בין האנושות למוטאנטים חזרה לתקופת האבן. במהלך המפגש מתגלה כי פרופסור אקס ביקש מדוקטור סטריינג' לעזור בסיטואציה, אך שניהם גם יחד לא היו חזקים דיים להילחם בקסם שלה. וולברין אומר שלא נותרה ברירה אלא להרוג אותה. אולם, השאר מסכימים לדבר עם ונדה באופן אישי בטרם יחליטו.
בחזרה בג'נושה, קוויקסילבר המוטרד מגלה למגנטו שהיה בניו יורק ושמע על אודות פגישתם של האוונג'רס והאקס-מן ועל כוונתם להרוג את ונדה. מגנטו עונה בכעס כי אינו יודע מה לעשות. כאשר אקסבייר לוקח את שתי הקבוצות לג'נושה, הוא מוצא שונדה נעדרת. לפתע, חברי הקבוצות מתחילים להיעלם אחד אחרי השני. ספיידרמן הוא היחיד שנותר, והוא נאגף באור לבן.

עולם חדש

כאשר האורות מתפוגגים, העולם השתנה: ספיידרמן הוא שחקן ואתלט סלבריטאי שנשוי לאהובתו הראשונה גוון סטייסי, סייקלופס ואמה פרוסט נשואים, דוקטור סטריינג' הוא פסיכולוג, קרול דנברס היא כעת קפטן מארוול, גמביט הוא פושע, וסטיב רוג'רס הוא יוצא מלחמה מזדקן. כאשר הקורא עוקב אחר מהלך חייהם מתגלה כי אין הם מודעים לכך שמשהו השתנה. אולם, וולברין נזכר בעברו ומכיר בעובדה שעולם זה הוא שקרי. הוא מוצא שגזע המוטאנטים הפך לגזע השליט בכדור הארץ במקום האנושות. מוטאנטים שולטים בבני האדם, ומגנטו ובית אם שלו שולט במוטאנטים.
וולברין מחפש אחר עזרתם של חבריו לקבוצת אקס-מן והאוונג'רס. כשהוא לא מוצא את פרופסור אקס, הוא יוצא לחפש אחר ספיידרמן וטוני סטארק. עד מהרה, הוא נכנס לעימות עם "חבריו" במשמר האדום, יחידה עילית של סוכנות S.H.I.E.L.D. המורכבת מחיילים מוטאנטים. וולברין נמלט מידיהם ומוצא את תנועת המחתרת האנושית אותה מנהיג לוק קייג'. קייג' אסף את כל אותם אלה שאינם מוטאנטים על מנת להגן על בני האדם מפני שחיתותו של בית מגנוס. וולברין נדהם לגלות שאחד מחברי המחתרת הוא קלינט בארטון, שמת לא מזמן בעולם האמיתי.
וולברין מסביר מדוע הוא יודע שעולם זה נוצר בידי מכשפת השני. התאוריה שלו אומרת שמגנטו השתמש בה כדי ליצור עולם שבו המשאלה הגדולה ביותר של כולם התמלאה - מגנטו קיבל את העליונות המוטאנטית לה תמיד שאף; ספיידרמן קיבל חיי אושר וקבלה עצמית; ווולברין קיבל חזרה את זיכרונותיו האבודים. קייג' מגלה לו שילדה קטנה בשם ליילה מילר אמרה לו בדיוק אותו דבר לפני מספר ימים. לאחר מכן, הגיבורים מתחילים לעבור בין קבוצות האקס-מן והאוונג'רס, כאשר ליילה מעירה את זיכרונותיהם האמיתיים.

קריאת השכמה

וולברין ותנועת המחתרת האנושית מעירים רבים מהגיבורים והנבלים לאמת - ביניהם את סייקלופס, ספיידרמן, שאדוקאט, דוקטור סטריינג', איירון מן, הענקית הירוקה, דרדוויל, רוג, מיסטיק, נייטקרולר, טואד וספיידרוומן. הוקאיי מוטרד מעצם המחשבה שהוא מת בעולם האמיתי ועוזב את החבורה. השאר עוזבים לג'נושה לעימות אחרון עם מגנטו.
בחזרה בג'נושה, מגנטו מקבל את פניהם של נציגים מכל רחבי העולם כדי לחגוג את ניצחונם של המוטאנטים על האנושות. הגיבורים מתקיפים את מגנטו ואת משפחתו ישירות, בו בעת שהם גם מחפשים אחר אקסבייר. הם מוצאים מצבה הנושאת את שמו של אקסבייר, אולם ללא זכר לגופה.

קרב והשלכות גדולות

הקרב בין בית מגנוס לגיבורים הוא אכזרי. מכשפת השני נעלמת מהכאוס המתחולל, ודוקטור סטריינג' מגלה אותה ואת ילדיה במגדל. השניים מדברים ביניהם וסטריינג' מנסה להבין את הסיבה מדוע מתרחשים הדברים. ונדה מגלה לו את התשובה על ידי כך שהיא מראה לו פלאשבק שבו קוויקסילבר מתעמת מול מגנטו לגבי גורלה של ונדה. מתברר כי קוויקסילבר הוא האחראי הישיר ליצירתו של העולם החדש, שהציע לונדה להפוך את כולם למאושרים בעולם כמעט-מושלם זה. לאחר גילוי זה, אמה פרוסט אומרת לסטריינג' לגלות מה קרה בגורלו של אקסבייר. בטרם ונדה תוכל לענות, היא נורית בגבה על ידי חץ.
התוקף הוא הוקאיי, שמתמוטט נפשית בפני ונדה על כך שהוא מת בעולם האמיתי. הוא נהרג בידי אחד מילדיה של ונדה, שמשתמש בכוחותיו המוטאנטים כדי למחוק את האוונג'ר מהקיום. בינתיים בממוריאל פארק, מגנטו מתעמת מול אמה פרוסט וליילה מילר, שמגלות לו את האמת מאחורי רצף ההתרחשויות. כתוצאה מכך, מגנטו משחרר את זעמו על כולם, בעיקר על בנו קוויקסילבר, וכמעט הורג אותו. לפתע מכשפת השני מופיעה ומצילה את אחיה. היא אומרת לאביה כי הם פריקים, ושהוא בחר במוטאנטים מאשר במשפחתו ובכך הרס אותה. היא ממלמלת לעצמה "לא עוד מוטאנטים", והכל הופך ללבן פעם נוספת.

לא עוד מוטאנטים

בהבזק מסנוור, העולם משתנה חזרה לנורמלי. האוונג'רס מתאספים כדי להבין מה קרה באותו לילה, ודוקטור סטריינג' אומר להם שהאירוע אכן התרחש ושהתופעות שלו מתחילות להשפיע בסדר גודל כלל עולמי. חברי הקבוצה עונים להתרעה מאחוזת האוונג'רס ההרוסה, והם מגלים את חליפתו של הוקאיי מוצמדת לקיר בעזרת חיצים, כאשר הדבר מרמז על חזרתו לחיים של הוקאיי.
בבית הספר לתלמידים מחוננים של אקסבייר, רוב התלמידים מאבדים את כוחותיהם המוטאנטים. אמה פרוסט סורקת באמצעות סרברו, המתקן לגילוי מוטאנטים, לפעילות מוטאנטית ברחבי העולם. היא לומדת שמספרם צנח דרמטית ממאות מיליונים לכמה מאות. בינתיים, וולברין מתעורר כשהוא זוכר את עברו. האקס-מן טסים לג'נושה בחיפוש אחר מגנטו וילדיו. הם מוצאים את מגנטו ללא כוחות, והוא אינו יודע את מיקומם של ונדה וקוויקסילבר.
הגיבורים יכולים רק לשער מה גרם למרבית מאוכלוסיית המוטאנטים לאבד את כוחותיה. אקסבייר עדיין נעדר, וככל הנראה מכשפת השני הופשטה מכוחותיה משום שסרברו לא יכול היה לאתר אותה. לפי האנק פים, כוחות אלו לא יכולים להיעלם כך סתם, והם תחומים במקום כלשהו. בנוסף, לכל מעשה יש פעולה נגדית. לדבריו, כל שנותר לדעת כעת הוא מה תהיה הפעולה הנגדית.
כאילו כדי להדגיש את דבריו, סרט אנרגיה אדום עצום ממדים מופיע מעל למסלול כדור הארץ.

בריאה קטלנית

המהדורה המוגבלת X-Men: Deadly Genesis חגגה שלושים שנים לפרסומה של החוברת Giant-Size X-Men #1 ממאי 1975, והעלילה מביאה את חיפושם של חברי האקס-מן אחרי פרופסור אקסבייר לאחר שנעלם באירועי "בית אם", והם נתקלים באיום מוטאנטי חזק ביותר. בנוסף, גבריאל סאמרס - אחיהם של אלכס וסקוט סאמרס, חוזר לחיים לאחר תרדמת ארוכה ומחפש אחר נקמה. הוא הורג את באנשי, ומביס את האקס-מן בעזרת כוחותיו האומניפוטנטיים. סייקלופס מגלה את האמת מאחורי מעורבותו של אקסבייר באירועי "בית אם", ובכעס מגרש אותו מאחוזת אקס.

זן בסכנת הכחדה

במיני סדרה "אקס-מן: זן בסכנת הכחדה", ד"ר האנק מק'קוי מנסה למצוא פתרון כדי לבטל את השפעות "בית אם". לצורך כך הוא מבקש להיוועץ עם נבל-העל המסוכן הוד התפתחותו. הוד התפתחותו אינו מעוניין לעזור במקרה, בציינו כי המדע אינו יכול לבטל את השפעותיהם של מעשי קסם. בנוסף, הוא אומר להאנק שהוא אינו היחיד שהגיע לוונדאגור כדי למצוא פתרון למקרה. 
ד"ר קאביטה ראו אומרת למק'קוי שכעת כשגזע המוטאנטים הפך לזן בסכנת הכחדה, המחקר שלה בהפשטת כוחות המוטאנטים הוא חסר טעם. היא נותנת לו את רשימותיה וחוזרת להודו. מק'קוי מגלה את דארק ביסט במתקן ניסויים שנסגר בידי פרויקט אקס, וזה האחרון מציע את עזרתו. מסעם המשותף מביא אותם למתקן ניסוי גרעיני באלאמוגורדו, ניו מקסיקו ולאי ג'נושה. חיה מציע כי גן אקס מלאכותי יכול להיווצר מתרומת דם של המוטאנטים שנותרו בחיים ושל המתים אשר נותרו עם כוחותיהם. השניים בוחנים מוטאנטים מלפני אירועי "בית אם" ולאחריהם, כדי לעמוד על טיבה של המוטציה עצמה. בקנטקי, הם מבקשים לבודד כרומוזומים מהורי משפחת גאתרי, אך אם המשפחה מפחדת שבניה יהפכו למוטאנטים ויסבלו מאותו גורל כמו אחיהם. דארק ביסט משכנע אחד מהאחים לקחת את הנסיוב הנסיוני, אך הנער נופל לתרדמת, וחיה ודארק ביסט נלחמים ביניהם. לבסוף, גברת גאתרי יורה בדארק ביסט וחיה מציל את חייו של הנער.
מק'קוי נפגש עם דוקטור סטריינג', שמראה לו את חומרת מעשיה של מכשפת השני - הקסם שלה שזר את עצמו למיליוני אנשים ברחבי העולם ולרבים אחרים בממדים השונים. האנק שואל אם ניתן לבטל את השפעת הקסם, וסטריינג' עונה כי הדבר אפשרי עם עבודת הכנה נאותה, אך בשל מצבו הנוכחי הוא יכול לגרום למציאות להתפוצץ מבפנים. חיפושם בממדים אחרים אחר פתרון מעלה חרס. 
בסוף העלילה, מק'קוי פוגש בונדה מקסימוף כשהיא משוטטת ברחובות ואינה זוכרת דבר מחייה כמכשפת השני. הוא מנסה להסביר לה את אשר התרחש, אך היא מתייחסת אליו בביטול ועוזבת את המקום.