Master of Puppets

Battery

Kappale alkaa samalla tavalla kuin Ride The Lightningin avauskappale ”Fight Fire With Fire”. Hidas, akustinen intro muuttuu noin minuutin kohdalla nopeatempoiseksi, koukeroiseksi thrash metaliksi. Battery on myös tunnettu hyvin vaikeasta bassokuviosta. Kappale on yhtyeen yksi tunnetuimmista ja säilynyt pitkään esiintymisten ohjelmistossa. Kappaleen sanat kertovat siitä, kuinka raivo saa yliotteen ihmisestä ja peittää hänen todellisen persoonansa. Kappaleen nimi viittaa San Franciscossa sijaitsevaan Battery Street-katuun, jonka klubeilla Metallica soitti suuren osan alkuajan keikoistaan.

The Thing That Should Not Be

Kappale on Kirk Hammettin, James Hetfieldin ja Lars Ulrichin käsialaa. Kappale on albumin ja yksi yhtyeen raskaimmista kappaleista.
Kappaleen sanoitus on saanut vaikutteita kauhukirjailija H. P. Lovecraftin teoksesta Varjo Innsmouthin yllä (The Shadow Over Innsmouth), kuten yhtyeen toisen albumin ”The Call of Ktulu” -raitakin

Welcome Home (Sanitarium)

Kappale on albumin ja myös yhtyeen tunnetuimpia, sillä se on albumin ainoa balladi. Kappale on saanut vaikutteita sanoituksiin elokuvasta Yksi lensi yli käenpesän.
Alkuperäisissä demoversioissa kappale oli paljon pitempi ja se sisälsi paljon kitarasoolo-osuuksia, jotka poistettiin lopullisesta studioversiosta ja niitä päätettiin käyttää eräällä instrumentaaliraidalla, jonka nimeksi tuli Orion.
Kuten kappaleen nimessäkin, kappale kertoo mielisairaasta ja henkilöstä mielisairaalassa. Mielisairaala tunnetaan englannin kielessä sanalla sanitarium.

Disposable Heroes

Kappale on yksi albumin pisimmistä ja samalla Metallican nopeimpia ja raskaimpia.
Kappale kertoo sotilaista, jotka ovat sodassa. Kappaleen lyriikoissa viitataankin kenraaliin, joka käskyttää sotilaitaan.

Leper Messiah

Kappale kertoo ns. valepapeista, jotka käyttävät kristinuskoa hyväksi, jotta saisi hyväuskoisilta lahjoituksia, jotka päätyisivätkin heille. Raita myös kuuluu osittain albuminsa teemaan, joka on ihmisten manipulointi.
Kappale aiheutti ilmestymisensä aikoihin jonkin verran polemiikkia, sillä entinen soolokitaristi, tuolloin jo oman Megadeth -yhtyeensä perustanut Dave Mustaine väitti julkisesti Leper Messiahin perustuvan hänen vanhaan sävellykseensä The Hills Ran Red. Metallica kiisti väitteet myöntäen, että kappale perustui vanhoihin riffeihin, muttei Mustainen tekemiin.

Orion

Kappale on instrumentaalikappale, jonka ovat kirjoittaneet yhtyeen silloinen basisti Cliff Burton, kitaristi James Hetfield ja rumpali Lars Ulrich. Vaikka albumilla kappaleen tekijöiksi on merkitty myös Ulrich ja Hetfield, on raita suurimmilta osin Burtonin käsialaa. Raidalla on paljon Cliff Burtonin monimutkaisia bassosoolo-osuuksia, jotka usein sekoitetaan kitaraan. Kappale sisältää kaksi bassosooloa ja lead-basso-osuuden, ja myös kappaleen intro on soitettu bassolla. Kappaleessa on myös neljä kitarasooloa, joista yksi on James Hetfieldin soittama.
Osa Orionin kitarasoolo-osuuksista on otettu ”Welcome Home (Sanitarium)” -kappaleen varhaisista versioista.
Cliff Burtonin kuoltua liikenneonnettomuudessa kappale soitettiin hänen hautajaistensa päätteeksi. Metallica ei soittanut kappaletta konserteissaan Burtonin kuoleman jälkeen moneen vuoteen. Kappale, tai ainakin puolet siitä, teki paluun vasta vuonna 2005, jolloin Metallican basisti oli Robert Trujillo. Kappale esitettiin ensimmäistä kertaa kokonaisuudessaan vasta vuonna 2006.

Damage, Inc.

Kappale on hyvin nopeatempoinen, mutta alkaa Cliff Burtonin rauhallisella ja melodisella bassolla. Kappale on myös yksi harvoja, jossa Burton laulaa taustoja. Kappale sisältää James Hetfieldin klassiseksi muodostuneen "fuck it all and fucking no regrets" -tylytyksen, jota yhtye käytti myös vuoden 2003 St. Anger -levyllä kappaleessa St. Anger. Kappale kertoo jonkinlaisesta "tuhoamispalvelusta", joka tekee selvää kaikesta ja kaikista mitä ihmiset pyytävät.