آزار مسلمانان

صدر اسلام

در اولین روزهای اسلام در مکه، مسلمانان اغلب در معرض توهین و آزار از جانب پاگان‌های مکه‌ای قرار می‌گرفتند (که اغلب آن افراد مشرکین خوانده می‌شدند: کافران یا چندخداییان). بعضی به قتل رسیدند، مانند سمیه بنت خیاط، هفتمین گرویده به اسلام که گفته می‌شود ابتدا توسط عمرو ابن هشام شکنجه شد. حتی محمد پیامبر اسلام هم در معرض توهین و بدرفتاری واقع شد. عقبه بن ابی معیط به روی او رودهٔ شترِ قربانی شده می‌ریخت. اُمّ جَمیل بنت حرب همسر ابولهب نیز معمولاً زباله‌های کثیف جلوی درِ او قرار می‌داد و خار در مسیر خانه‌اش می‌گذاشت.
هنگامی که مسلمانان آزاد اینطور مورد حمله قرار می‌گرفتند، بردگان نوکیش شرایط بسیار بدتری داشتند. برای مثال، ارباب بِلال بن ریاح حبشی با گرویدن وی به اسلام او را شکنجه کرد؛ بدین صورت که در گرمای ظهر او را به بیابان برد و به روی سینه‌اش سنگ داغ گذاشت، و خواستار انکار دین خود و پرستش دین چندخدایی شد. او این کار را تا زمانی ادامه داد که عبدالله بن ابی قحافهٔ قرشی، ملقب به ابوبکر، او را خریده و آزاد کرد.

جنگ‌های صلیبی

شهر مقدس اورشلیم و سرزمین مقدس پیش‌تر، یعنی در سال ۶۳۸م از امپراطوری بیزانس به خاک امپراتوری‌های مسلمان ضمیمه شده بودند. پیش از این جنگ‌ها خلیفهٔ فاطمی مصر ملقب به "خلیفهٔ دیوانه"  بیش‌ترِ کلیساها و زیارتگاه‌های مسیحیان از جمله کلیسای مقبرهٔ مقدس را تخریب کرده‌بود. این، به علاوهٔ قطل‌عام زائران ژرمنی اورشلیم که از بیزانتیوم آمده بودند، خشم اروپا را برانگیخت و الهام‌بخش پاپ اوربان دوم در فراخوانی تمام حاکمان کاتولیک، شوالیه‌ها و مردان با هدف بازپس‌گیری سرزمین مقدس از سرزمین‌های تحت حاکمیت مسلمانان شد. بنابراین، اولین دورهٔ جنگ‌های صلیبی را پاپ در سال ۱۰۹۵م علیه مسلمانان به راه انداخت. موج اصلی این جنگ‌ها تا ۱۹۶ سال بعد ادامه یافت و موجب کشتارهای بی‌رحمانه‌ای در هر دو جبهه شد.
همچنین تا حدی می‌توان گفت که این واکنشی به مناقشهٔ اعطای مقام کلیسا بود؛ بطوری که از آن به عنوان بزرگ‌ترین درگیری بین قدرت‌های مذهبی و سکولار یاد می‌کنند. این جدال‌ها با اختلاف‌نظر امپراتور مقدس روم و پاپ گریگوری هفتم، و همچنین افزایش مفهوم جامعهٔ مسیحی به عنوان عامل اتحاد همهٔ مردم و حاکمان با هدایت پاپ بود؛ همانطور که هر دو جهت سعی می‌کردند تا افکار عمومی را به نفع خود تغییر دهند، مردم هم عیناً در یک جدال مذهبی نمایشی شرکت کردند. علاوه بر این، گفتنیست که یکی از مهم‌ترین دلایل این جنگ‌ها رشته پیروزی‌های ترکان سلجوقی بود که به حکومت اعراب در اورشلیم پایان داد. همهٔ این دلایل باعث شد که مسیحیان بتوانند اورشلیم را تسخیر کنند.
روایت واقعه: در تاریخ ۷ مِی ۱۰۹۹م مسیحیان به اورشلیم رسیدند. این در حالی بود که امپراتوری سلجوقی در سال قبلش این شهر را از خلافت فاطمی مصر بازپس گرفته بود. بدین ترتیب، در ۱۵ ژوئیه همان سال مسیحیان شهر را محاصره کردند، دیوار آن را تخریب کرده و وارد شهر شدند. آن‌ها در یک قطل‌عام تاریخی در بعد از ظهر، شب و روز بعد از فتح‌ِ شهر بیش‌تر ساکنان آن را کشتند؛ مانند مسلمانان و یهودیان. با این حال مسلمانان بسیاری در پناهگاهِ بالای کوه معبد در مسجدالاقصی پناه گرفتند؛ بنابراین مسیحیان از کشتن عدهٔ کمی چشم‌پوشی کردند. منبع ناشناس اسناد فرنکس، که برخی آن را یکی از با ارزش‌ترین منابع امروزی از اولین جنگ صلیبی می‌دانند، اینگونه می‌گوید: "… کشتار بسیار بزرگی بود، و خون تا مچ پای سربازانمان را گرفته بود…" تانکِرِد ادعا می‌کند که پرستشگاه اورشلیم برای او و مسلمانان آنجا محافظت شده بود، ولی نمی‌توانست از کشتار آن‌ها توسط یاران مسیحی‌اش جلوگیری کند. فالچر از شارتر، کشیش شرکت‌کننده در جنگ‌های صلیبی، می‌گوید: "به راستی، اگر آنجا (در جنگ) بودی پاهایمان را می‌دیدی که تا مچ با خون کشتگان رنگ‌آمیزی شده بودند. اما (دیگر) از چه باید بگویم؟ هیچ یک از ایشان زنده نماندند؛ نه از زنان نجات یافتند، و نه کودکان."
در طول اولین جنگ صلیبی و قطل‌عام اورشلیم گزارش شده است که: "صدای جیغ (اطراف را احاطه کرده بود)، شعله و شکنجه نوع بشر، آواز می‌خواندند که 'مسیح، ما تو را می‌پرستیم!' با صلیبیونشان صلیب‌ها را برمی‌افشاندند." مسلمانان یکسره کشته می‌شدند، و یهودیانی که در کنیسه‌هایشان پناه می‌گرفتند هنگامی کشته می‌شدند که صلیبیون آن‌ها را آتش می‌زدند.

امپراطوری عثمانی

در قرن ۱۷‌ام روند زوال دائمی عثمانی آغاز شد، و این امپراطوری درگیر یک مناقشهٔ ادامه‌دار گشت؛ بطوری که سرزمین‌هایی را هم در اروپا و هم در قفقاز از دست داد. متجاوزان، امپراطوری های قدیمی دودمان هابسبورگ و دودمان رومانوف و نیز دولت‌های ملل یونان، صربستان، رومانی و بلغارستان بودند. قدرت‌های اروپایی رقیب بر روحیهٔ ملی‌گرایی در میان مردم -غیرمسلمان- عثمانی افزودند؛ بطوری که مسلمانان را به‌عنوان گروه نژادی "دستگاه جاسوسی" بازمانده از دوران پیشین توصیف کردند، که نمی‌توان آن‌ها را در ایالات طراحی‌شدهٔ آینده گنجاند. کشاکش برای خلاصی از عثمانی عنصری مهم در خودشناسی مسیحیان بالکان شد.

بوسنی و هرزگوین

نسل‌کشی بوسنی به نسل‌کشی مرتکب شده در سربرنیتسا و زپا توسط نیروهای صرب بوسنی در ۱۹۹۵ میلادی، و یا کمپین‌های پاک‌سازی قومیتی آن در سراسر مناطق کنترل شده توسط ارتش جمهوری صرب بوسنی اشاره دارد، که در ۱۹۹۵-۱۹۹۲ میلادی به وقوع پیوست.