حسام حسن

النادي المصري

فور اعتزاله اللعب اتجه حسام إلى مجال التدريب حيث قاد نادي المصري البورسعيدي في النصف الثاني من الدوري المصري موسم 2008/2007 وتمكن المصري بقيادة حسام بالبقاء في الدوري في ثماني مباريات بعد أن كان قد اقترب من الهبوط إلى الدرجة الثانية.
وفي عام 2008 تمت إقالة حسام من تدريب المصري بعد تعدي إبراهيم حسن توءم حسام، ومدير الكرة بالنادي على الحكم الرابع في مباراة شبيبة بجاية الجزائري بالجزائر.

المصرية للإتصالات

مع بداية عام 2009 شغل منصب المدير الفني لفريق المصرية للإتصالات بعد تأزم موقف الفريق في جدول الدوري، ظل ينافس على البقاء حتى الأسبوع الأخير إلا أن الفريق هبط في النهاية، فاستمر معهم في  منافسات دوري الدرجة الثانية حتى قدم استقالته.

نادي الزمالك

في 30 نوفمبر 2009 عُين مديراً فنياً لنادي الزمالك بعد تدهور نتائج الفريق في ظل قيادة الفرنسي هنري ميشيل، وقد حقق العميد مع القلعة البيضاء إنجازاً كبيراً حيث ارتفع ترتيب الزمالك في الدوري الممتاز من المركز الرابع عشر في آخر أسابيع الدور الأول إلى المركز الثاني في نهاية الدوري، وفي موسم 2011/2010 أنهي العميد مع الزمالك الدور الأول على قمة الترتيب بفارق 6 نقاط عن أقرب منافسيه.

نادي الإسماعيلي

وقع مع نادي الإسماعيلي في 8 أغسطس 2011، خاض مع الفريق مبارتان في كأس مصر، فاز في الأولى وخسر الثانية أمام المقاولون العرب، ولخلافات مع الإدارة أُقيل حسام من تدريب الفريق في 28 سبتمبر 2011.

النادي المصري

عاد حسام لتدريب فريق المصري، وخاض معه 3 مباريات، أولها أمام إنبي وفاز بنتيجة 1-0، والثانية أمام الإسماعيلي وانتهت بالتعادل السلبي، والأخيرة أمام الأهلي في المباراة التي انتهت بفوز المصري بنتيجة 3-1 وأعقبها أحداث ستاد بورسعيد الشهيرة التي أدت إلى مقتل (74) مشجع، ليستقيل بعدها من تدريب الفريق برفقة شقيقه التؤام إبراهيم.

مصر للمقاصة

بعد استئناف الدورى المصري بعد فاجعة ستاد بورسعيد الأليمة وفي فبراير 2013 أنهى نادي مصر للمقاصة برئاسة محمد عبد السلام اتفاقه مع التوأم حسام وإبراهيم حسن على قيادة الجهاز الفني للفريق حتى نهاية الموسم بعد أن استمرت المفاوضات على نحو أسبوع.

منتخب الأردن

في 25 يونيو 2013 عُين مديراً فنياً لمنتخب الأردن وساهم في تأهله إلى الملحق النهائي المؤهل إلى كأس العالم 2014 بعد الفوز على أوزبكستان إلا أن المنتخب الأردني واجه المنتخب الاوروغوياني وخسر المباراة الأولى على ملعبه بخماسية نظيفة، وفي مباراة العودة نجح في التعادل على ملعب الأوروغواي.
قاد حسام الأردن للصعود لكأس آسيا لعام 2015 للمرة الثالثة في تاريخها بدون أي هزيمة في التصفيات، وتحسن ترتيب الأردن بين المنتخبات على مستوى العالم.

نادي الزمالك

في 30 يوليو 2014 قرر المستشار مرتضى منصور رئيس نادي الزمالك تعيين حسام حسن مديراً فنياً للفريق خلفاً للمدرب أحمد حسام ميدو، إلا أنه وبسبب محاولات رئيس النادي التدخل في مهام المدير الفني واختصاصاته بالإضافة لسوء نتائج الفريق حيث حقق الزمالك فوزاً واحداً في ست مباريات رسمية تحت قيادته بجميع المسابقات فلم يستمر حسام مع الفريق إلا لفترة قصيرة.

النادي المصري

وفي 25 يوليو 2015 وبعد أن عُين مديراً فنياً للاتحاد السكندري قاده للتأهل لدور الثمانية في كأس مصر على حساب وادي دجلة إلا أنه قرر الاستقالة من تدريب الفريق بسبب الخلافات والاضطرابات بالنادي وعدم دفع رواتب اللاعبين والإدارة الفنية، ليعود لتدريب المصري لشعبيته الكبيرة بالمدينة الباسلة.

نادي بيراميدز

في 29 أكتوبر 2018 أعلن نادي بيراميدز تعيين حسام مديراً فنياً للفريق خلفاً للأرجنتيني ريكاردو لافولبي، بعد ساعات من إبلاغ التوئم إدارة المصري استقالتهما بسبب الخسارة أمام فيتا كلوب الكونغولي برباعية في قبل نهائى الكونفيدرالية وما عقبها من أحداث شغب من الجماهير نتج عنها إصابة حسام بالرأس ونقله للمستشفى.