Datasets:

enoriega

/

GENIA-Term-Corpus

like 0

[ "Expression", "of", "the", "human", "RAR-alpha", "in", "receptor-negative", "erythroblasts", "conferred", "RA", "-induced", "regulation", "of", "differentiation", "to", "the", "otherwise", "unresponsive", "cells", ",", "thus", "showing", "that", "the", "RAR-alpha", "is", "essential", "for", "the", "RA", "effect", "." ]

[ "expression", "of", "the", "human", "rar-alpha", "in", "receptor-negative", "erythroblasts", "conferred", "ra", "-induced", "regulation", "of", "differentiation", "to", "the", "otherwise", "unresponsive", "cells", ",", "thus", "showing", "that", "the", "rar-alpha", "is", "essential", "for", "the", "ra", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Likewise", ",", "enhanced", "expression", "of", "exogenous", "c-erbA/TR-alpha", "in", "erythroblasts", "rendered", "them", "susceptible", "to", "modulation", "of", "differentiation", "by", "T3", ",", "suggesting", "a", "similar", "function", "of", "both", "receptors", "." ]

[ "likewise", ",", "enhanced", "expression", "of", "exogenous", "c-erba/tr-alpha", "in", "erythroblasts", "rendered", "them", "susceptible", "to", "modulation", "of", "differentiation", "by", "t3", ",", "suggesting", "a", "similar", "function", "of", "both", "receptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regulation", "of", "the", "vitellogenin", "gene", "B1", "promoter", "after", "transfer", "into", "hepatocytes", "in", "primary", "cultures", "." ]

[ "regulation", "of", "the", "vitellogenin", "gene", "b1", "promoter", "after", "transfer", "into", "hepatocytes", "in", "primary", "cultures", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "estrogen-dependent", "and", "tissue-specific", "regulation", "of", "the", "Xenopus", "laevis", "vitellogenin", "gene", "B1", "promoter", "has", "been", "studied", "by", "lipid-mediated", "DNA", "transfer", "into", "Xenopus", "hepatocytes", "in", "primary", "culture", "." ]

[ "the", "estrogen-dependent", "and", "tissue-specific", "regulation", "of", "the", "xenopus", "laevis", "vitellogenin", "gene", "b1", "promoter", "has", "been", "studied", "by", "lipid-mediated", "dna", "transfer", "into", "xenopus", "hepatocytes", "in", "primary", "culture", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hepatocytes", "achieve", "an", "efficient", "hormonal", "control", "of", "this", "promoter", "through", "a", "functional", "interaction", "between", "the", "estrogen", "responsive", "elements", "and", "a", "promoter", "proximal", "region", "upstream", "of", "the", "TATA", "box", ",", "which", "is", "characterized", "by", "a", "high", "density", "of", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "CTF/NF-1", ",", "C/EBP", "and", "HNF3", "." ]

[ "hepatocytes", "achieve", "an", "efficient", "hormonal", "control", "of", "this", "promoter", "through", "a", "functional", "interaction", "between", "the", "estrogen", "responsive", "elements", "and", "a", "promoter", "proximal", "region", "upstream", "of", "the", "tata", "box", ",", "which", "is", "characterized", "by", "a", "high", "density", "of", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "ctf/nf-1", ",", "c/ebp", "and", "hnf3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "DNA", "accessibility", "to", "restriction", "enzymes", "within", "the", "chromosomal", "copy", "of", "the", "vitellogenin", "gene", "B1", "promoter", "shows", "that", "the", "estrogen", "responsive", "unit", "and", "the", "promoter", "proximal", "region", "are", "sensitive", "to", "digestion", "in", "uninduced", "and", "estrogen", "-induced", "hepatocytes", "but", "not", "in", "erythrocyte", "nuclei", "." ]

[ "dna", "accessibility", "to", "restriction", "enzymes", "within", "the", "chromosomal", "copy", "of", "the", "vitellogenin", "gene", "b1", "promoter", "shows", "that", "the", "estrogen", "responsive", "unit", "and", "the", "promoter", "proximal", "region", "are", "sensitive", "to", "digestion", "in", "uninduced", "and", "estrogen", "-induced", "hepatocytes", "but", "not", "in", "erythrocyte", "nuclei", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "Together", ",", "these", "findings", "support", "the", "notion", "that", "chromatin", "configuration", "as", "well", "as", "the", "interplay", "of", "promoter", "elements", "mediate", "proper", "hormone-dependent", "and", "tissue-specific", "expression", "of", "the", "B1", "vitellogenin", "gene", "." ]

[ "together", ",", "these", "findings", "support", "the", "notion", "that", "chromatin", "configuration", "as", "well", "as", "the", "interplay", "of", "promoter", "elements", "mediate", "proper", "hormone-dependent", "and", "tissue-specific", "expression", "of", "the", "b1", "vitellogenin", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Stable", "expression", "of", "transdominant", "Rev", "protein", "in", "human", "T", "cells", "inhibits", "human", "immunodeficiency", "virus", "replication", "." ]

[ "stable", "expression", "of", "transdominant", "rev", "protein", "in", "human", "t", "cells", "inhibits", "human", "immunodeficiency", "virus", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O" ]

[ "The", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "Rev", "protein", "is", "essential", "for", "viral", "structural", "protein", "expression", "(", "Gag", ",", "Pol", ",", "and", "Env", ")", "and", ",", "hence", ",", "for", "viral", "replication", "." ]

[ "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "hiv", ")", "rev", "protein", "is", "essential", "for", "viral", "structural", "protein", "expression", "(", "gag", ",", "pol", ",", "and", "env", ")", "and", ",", "hence", ",", "for", "viral", "replication", "." ]

[ "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "transient", "transfection", "assays", ",", "mutant", "forms", "of", "Rev", "have", "been", "identified", "that", "inhibit", "wild-type", "Rev", "activity", "and", "therefore", "suppress", "viral", "replication", "." ]

[ "in", "transient", "transfection", "assays", ",", "mutant", "forms", "of", "rev", "have", "been", "identified", "that", "inhibit", "wild-type", "rev", "activity", "and", "therefore", "suppress", "viral", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "To", "determine", "whether", "such", "transdominant", "Rev", "proteins", "could", "provide", "long-term", "protection", "against", "HIV", "infection", "without", "affecting", "T", "cell", "function", ",", "T", "leukemia", "cell", "lines", "were", "stably", "transduced", "with", "a", "retroviral", "vector", "encoding", "a", "transdominant", "mutant", "of", "the", "Rev", "protein", ",", "M10", "." ]

[ "to", "determine", "whether", "such", "transdominant", "rev", "proteins", "could", "provide", "long-term", "protection", "against", "hiv", "infection", "without", "affecting", "t", "cell", "function", ",", "t", "leukemia", "cell", "lines", "were", "stably", "transduced", "with", "a", "retroviral", "vector", "encoding", "a", "transdominant", "mutant", "of", "the", "rev", "protein", ",", "m10", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "While", "all", "the", "M10", "-expressing", "cell", "lines", "remained", "infectable", "by", "HIV-1", ",", "these", "same", "cells", "failed", "to", "support", "a", "productive", "replication", "cycle", "when", "infected", "with", "a", "cloned", "isolate", "of", "HIV-1", "." ]

[ "while", "all", "the", "m10", "-expressing", "cell", "lines", "remained", "infectable", "by", "hiv-1", ",", "these", "same", "cells", "failed", "to", "support", "a", "productive", "replication", "cycle", "when", "infected", "with", "a", "cloned", "isolate", "of", "hiv-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "two", "out", "of", "three", "M10", "-expressing", "CEM", "clones", "were", "also", "resistant", "to", "highly", "productive", "infection", "by", "a", "heterogeneous", "HIV-1", "pool", "." ]

[ "in", "addition", ",", "two", "out", "of", "three", "m10", "-expressing", "cem", "clones", "were", "also", "resistant", "to", "highly", "productive", "infection", "by", "a", "heterogeneous", "hiv-1", "pool", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "B-virus", "O", "O" ]

[ "Expression", "of", "M10", "did", "not", "affect", "induction", "of", "HIV", "transcription", "mediated", "by", "the", "kappa", "B", "regulatory", "element", "or", "Tat", "." ]

[ "expression", "of", "m10", "did", "not", "affect", "induction", "of", "hiv", "transcription", "mediated", "by", "the", "kappa", "b", "regulatory", "element", "or", "tat", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Importantly", ",", "constitutive", "expression", "of", "Rev", "M10", "did", "not", "alter", "the", "secretion", "of", "interleukin", "2", "in", "response", "to", "mitogen", "stimulation", "of", "EL-4", "and", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "importantly", ",", "constitutive", "expression", "of", "rev", "m10", "did", "not", "alter", "the", "secretion", "of", "interleukin", "2", "in", "response", "to", "mitogen", "stimulation", "of", "el-4", "and", "jurkat", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "The", "inhibition", "of", "HIV", "infection", "in", "cells", "stably", "expressing", "a", "transdominant", "Rev", "protein", ",", "in", "the", "absence", "of", "any", "deleterious", "effect", "on", "T", "cell", "function", ",", "suggests", "that", "such", "a", "strategy", "could", "provide", "a", "therapeutic", "effect", "in", "the", "T", "lymphocytes", "of", "acquired", "immunodeficiency", "syndrome", "patients", "." ]

[ "the", "inhibition", "of", "hiv", "infection", "in", "cells", "stably", "expressing", "a", "transdominant", "rev", "protein", ",", "in", "the", "absence", "of", "any", "deleterious", "effect", "on", "t", "cell", "function", ",", "suggests", "that", "such", "a", "strategy", "could", "provide", "a", "therapeutic", "effect", "in", "the", "t", "lymphocytes", "of", "acquired", "immunodeficiency", "syndrome", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "Reversal", "of", "apoptosis", "by", "the", "leukaemia-associated", "E2A-HLF", "chimaeric", "transcription", "factor", "." ]

[ "reversal", "of", "apoptosis", "by", "the", "leukaemia-associated", "e2a-hlf", "chimaeric", "transcription", "factor", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "E2A-HLF", "(", "for", "hepatic", "leukaemia", "factor", ")", "fusion", "gene", ",", "formed", "by", "action", "of", "the", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "(", "q22", ";", "p13", ")", "chromosomal", "translocation", ",", "drives", "the", "leukaemic", "transformation", "of", "early", "B-cell", "precursors", ",", "but", "the", "mechanism", "of", "this", "activity", "remains", "unknown", "." ]

[ "the", "e2a-hlf", "(", "for", "hepatic", "leukaemia", "factor", ")", "fusion", "gene", ",", "formed", "by", "action", "of", "the", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "(", "q22", ";", "p13", ")", "chromosomal", "translocation", ",", "drives", "the", "leukaemic", "transformation", "of", "early", "b-cell", "precursors", ",", "but", "the", "mechanism", "of", "this", "activity", "remains", "unknown", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "that", "human", "leukaemia", "cells", "carrying", "the", "translocation", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "rapidly", "died", "by", "apoptosis", "when", "programmed", "to", "express", "a", "dominant-negative", "suppressor", "of", "the", "fusion", "protein", "E2A-HLF", ",", "indicating", "that", "the", "chimaeric", "oncoprotein", "probably", "affects", "cell", "survival", "rather", "than", "cell", "growth", "." ]

[ "here", "we", "report", "that", "human", "leukaemia", "cells", "carrying", "the", "translocation", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "rapidly", "died", "by", "apoptosis", "when", "programmed", "to", "express", "a", "dominant-negative", "suppressor", "of", "the", "fusion", "protein", "e2a-hlf", ",", "indicating", "that", "the", "chimaeric", "oncoprotein", "probably", "affects", "cell", "survival", "rather", "than", "cell", "growth", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Moreover", ",", "when", "introduced", "into", "murine", "pro-B", "lymphocytes", ",", "the", "oncogenic", "E2A-HLF", "fusion", "protein", "reversed", "both", "interleukin-3-dependent", "and", "p53-mediated", "apoptosis", "." ]

[ "moreover", ",", "when", "introduced", "into", "murine", "pro-b", "lymphocytes", ",", "the", "oncogenic", "e2a-hlf", "fusion", "protein", "reversed", "both", "interleukin-3-dependent", "and", "p53-mediated", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "close", "homology", "of", "the", "basic", "region/leucine", "zipper", "(", "bZIP", ")", "DNA-binding", "and", "dimerization", "domain", "of", "HLF", "to", "that", "of", "the", "CES-2", "cell-death", "specification", "protein", "of", "Caenorhabditis", "elegans", "suggests", "a", "model", "of", "leukaemogenesis", "in", "which", "E2A-HLF", "blocks", "an", "early", "step", "within", "an", "evolutionarily", "conserved", "cell-death", "pathway", "." ]

[ "the", "close", "homology", "of", "the", "basic", "region/leucine", "zipper", "(", "bzip", ")", "dna-binding", "and", "dimerization", "domain", "of", "hlf", "to", "that", "of", "the", "ces-2", "cell-death", "specification", "protein", "of", "caenorhabditis", "elegans", "suggests", "a", "model", "of", "leukaemogenesis", "in", "which", "e2a-hlf", "blocks", "an", "early", "step", "within", "an", "evolutionarily", "conserved", "cell-death", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Role", "of", "ascorbate", "in", "the", "activation", "of", "NF-kappaB", "by", "tumour", "necrosis", "factor-alpha", "in", "T-cells", "." ]

[ "role", "of", "ascorbate", "in", "the", "activation", "of", "nf-kappab", "by", "tumour", "necrosis", "factor-alpha", "in", "t-cells", "." ]

[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "The", "first", "product", "of", "ascorbate", "oxidation", ",", "the", "ascorbate", "free", "radical", "(", "AFR", ")", ",", "acts", "in", "biological", "systems", "mainly", "as", "an", "oxidant", ",", "and", "through", "its", "role", "in", "the", "plasma", "membrane", "redox", "system", "exerts", "different", "effects", "on", "the", "cell", "." ]

[ "the", "first", "product", "of", "ascorbate", "oxidation", ",", "the", "ascorbate", "free", "radical", "(", "afr", ")", ",", "acts", "in", "biological", "systems", "mainly", "as", "an", "oxidant", ",", "and", "through", "its", "role", "in", "the", "plasma", "membrane", "redox", "system", "exerts", "different", "effects", "on", "the", "cell", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "I-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "investigated", "the", "role", "of", "ascorbate", ",", "AFR", "and", "dehydroascorbate", "(", "DHA", ")", "in", "the", "activation", "of", "the", "NF-kappaB", "transcription", "factor", "in", "Jurkat", "T-cells", "stimulated", "by", "tumour", "necrosis", "factor-alpha", "(", "TNF-alpha", ")", "." ]

[ "we", "have", "investigated", "the", "role", "of", "ascorbate", ",", "afr", "and", "dehydroascorbate", "(", "dha", ")", "in", "the", "activation", "of", "the", "nf-kappab", "transcription", "factor", "in", "jurkat", "t-cells", "stimulated", "by", "tumour", "necrosis", "factor-alpha", "(", "tnf-alpha", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "show", ",", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "that", "ascorbate", "increases", "the", "binding", "of", "NF-kappaB", "to", "DNA", "in", "TNF-alpha", "-stimulated", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "here", "we", "show", ",", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "that", "ascorbate", "increases", "the", "binding", "of", "nf-kappab", "to", "dna", "in", "tnf-alpha", "-stimulated", "jurkat", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ability", "of", "ascorbate", "to", "enhance", "cytoplasmic", "inhibitory", "IkBalpha", "protein", "degradation", "correlates", "completely", "with", "its", "capacity", "to", "induce", "NF-kappaB", "binding", "to", "DNA", "and", "to", "potentiate", "NF-kappaB", "-mediated", "transactivation", "of", "the", "HIV-1", "long", "terminal", "repeat", "promoter", "in", "TNF-alpha", "-stimulated", "Jurkat", "cells", "but", "not", "in", "cells", "stimulated", "with", "PMA", "plus", "ionomycin", "." ]

[ "the", "ability", "of", "ascorbate", "to", "enhance", "cytoplasmic", "inhibitory", "ikbalpha", "protein", "degradation", "correlates", "completely", "with", "its", "capacity", "to", "induce", "nf-kappab", "binding", "to", "dna", "and", "to", "potentiate", "nf-kappab", "-mediated", "transactivation", "of", "the", "hiv-1", "long", "terminal", "repeat", "promoter", "in", "tnf-alpha", "-stimulated", "jurkat", "cells", "but", "not", "in", "cells", "stimulated", "with", "pma", "plus", "ionomycin", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "AFR", "behaves", "like", "ascorbate", ",", "while", "DHA", "and", "ascorbate", "phosphate", "do", "not", "affect", "TNF-alpha", "-mediated", "NF-kappaB", "activation", "." ]

[ "afr", "behaves", "like", "ascorbate", ",", "while", "dha", "and", "ascorbate", "phosphate", "do", "not", "affect", "tnf-alpha", "-mediated", "nf-kappab", "activation", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "O", "O" ]

[ "These", "results", "provide", "new", "evidence", "for", "a", "possible", "relationship", "between", "the", "activation", "of", "the", "electron-transport", "system", "at", "the", "plasma", "membrane", "by", "ascorbate", "or", "its", "free", "radical", "and", "redox-dependent", "gene", "transcription", "in", "T-cells", "." ]

[ "these", "results", "provide", "new", "evidence", "for", "a", "possible", "relationship", "between", "the", "activation", "of", "the", "electron-transport", "system", "at", "the", "plasma", "membrane", "by", "ascorbate", "or", "its", "free", "radical", "and", "redox-dependent", "gene", "transcription", "in", "t-cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Thyroid", "hormone", "receptors", "form", "distinct", "nuclear", "protein-", "dependent", "and", "independent", "complexes", "with", "a", "thyroid", "hormone", "response", "element", "." ]

[ "thyroid", "hormone", "receptors", "form", "distinct", "nuclear", "protein-", "dependent", "and", "independent", "complexes", "with", "a", "thyroid", "hormone", "response", "element", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "have", "examined", "the", "binding", "of", "nuclear", "proteins", "and", "recombinant", "thyroid", "hormone", "receptors", "(", "TRs", ")", "to", "the", "palindromic", "thyroid", "hormone", "responsive", "element", "AGGTCATGACCT", "(", "TREp", ")", "using", "a", "gel", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "." ]

[ "we", "have", "examined", "the", "binding", "of", "nuclear", "proteins", "and", "recombinant", "thyroid", "hormone", "receptors", "(", "trs", ")", "to", "the", "palindromic", "thyroid", "hormone", "responsive", "element", "aggtcatgacct", "(", "trep", ")", "using", "a", "gel", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-polynucleotide", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Four", "specific", "protein-DNA", "complexes", "were", "detected", "after", "incubation", "of", "nuclear", "extracts", "(", "NE", ")", "from", "T3-responsive", "pituitary", "(", "GH3", ")", "cells", "with", "a", "TREp", "-containing", "DNA", "fragment", "." ]

[ "four", "specific", "protein-dna", "complexes", "were", "detected", "after", "incubation", "of", "nuclear", "extracts", "(", "ne", ")", "from", "t3-responsive", "pituitary", "(", "gh3", ")", "cells", "with", "a", "trep", "-containing", "dna", "fragment", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-cell_component", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "was", "compared", "with", "the", "TREp", "binding", "of", "reticulocyte", "lysate-synthesized", "TRs", "." ]

[ "this", "was", "compared", "with", "the", "trep", "binding", "of", "reticulocyte", "lysate-synthesized", "trs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "TR", "alpha", "1", "and", "TR", "beta", "2", "each", "formed", "a", "single", "major", "TR", ":", "TREp", "complex", "which", "comigrated", "with", "the", "least", "retarded", "complex", "formed", "by", "GH3", "NE", ",", "while", "TR", "beta", "1", "formed", "multiple", "complexes", "suggesting", "that", "it", "can", "bind", "to", "TREp", "as", "an", "oligomer", "." ]

[ "tr", "alpha", "1", "and", "tr", "beta", "2", "each", "formed", "a", "single", "major", "tr", ":", "trep", "complex", "which", "comigrated", "with", "the", "least", "retarded", "complex", "formed", "by", "gh3", "ne", ",", "while", "tr", "beta", "1", "formed", "multiple", "complexes", "suggesting", "that", "it", "can", "bind", "to", "trep", "as", "an", "oligomer", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_complex", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "coincubation", "of", "35S-", "TR", "alpha", "1", ",", "GH3", "NE", ",", "and", "unlabeled", "TREp", "resulted", "in", "not", "only", "the", "35S-TR", ":", "TREp", "complex", ",", "but", "in", "two", "additional", "more", "greatly", "retarded", "complexes", "containing", "35S-", "TR", "alpha", "1", "and", "comigrating", "with", "those", "formed", "by", "GH3", "extract", "alone", "." ]

[ "interestingly", ",", "coincubation", "of", "35s-", "tr", "alpha", "1", ",", "gh3", "ne", ",", "and", "unlabeled", "trep", "resulted", "in", "not", "only", "the", "35s-tr", ":", "trep", "complex", ",", "but", "in", "two", "additional", "more", "greatly", "retarded", "complexes", "containing", "35s-", "tr", "alpha", "1", "and", "comigrating", "with", "those", "formed", "by", "gh3", "extract", "alone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O" ]

[ "Incubation", "of", "each", "of", "the", "TRs", "with", "NE", "from", "COS-7", "cells", ",", "which", "do", "not", "possess", "sufficient", "endogenous", "TRs", "to", "mediate", "T3-responses", ",", "resulted", "in", "formation", "of", "a", "new", ",", "more", "greatly", "shifted", "complex", "." ]

[ "incubation", "of", "each", "of", "the", "trs", "with", "ne", "from", "cos-7", "cells", ",", "which", "do", "not", "possess", "sufficient", "endogenous", "trs", "to", "mediate", "t3-responses", ",", "resulted", "in", "formation", "of", "a", "new", ",", "more", "greatly", "shifted", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-cell_component", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "A", "similar", ",", "heat", "labile", "activity", "which", "altered", "mobility", "of", "the", "TR", ":", "TRE", "complex", "was", "also", "present", "in", "NE", "from", "T3-unresponsive", "JEG-3", "cells", "." ]

[ "a", "similar", ",", "heat", "labile", "activity", "which", "altered", "mobility", "of", "the", "tr", ":", "tre", "complex", "was", "also", "present", "in", "ne", "from", "t3-unresponsive", "jeg-3", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "At", "high", "concentration", "of", "NE", ",", "all", "of", "the", "TR", "bound", "to", "TREp", "was", "more", "greatly", "retarded", "than", "in", "the", "absence", "of", "NE", "." ]

[ "at", "high", "concentration", "of", "ne", ",", "all", "of", "the", "tr", "bound", "to", "trep", "was", "more", "greatly", "retarded", "than", "in", "the", "absence", "of", "ne", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O" ]

[ "Truncation", "of", "TR", "alpha", "1", "at", "amino", "acid", "210", "prevented", "additional", "complex", "formation", "in", "the", "presence", "of", "NE", "without", "affecting", "DNA", "binding", ",", "suggesting", "that", "the", "carboxyl-terminus", "of", "the", "TRs", "is", "essential", "for", "interaction", "with", "nuclear", "proteins", "." ]

[ "truncation", "of", "tr", "alpha", "1", "at", "amino", "acid", "210", "prevented", "additional", "complex", "formation", "in", "the", "presence", "of", "ne", "without", "affecting", "dna", "binding", ",", "suggesting", "that", "the", "carboxyl-terminus", "of", "the", "trs", "is", "essential", "for", "interaction", "with", "nuclear", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "(", "ABSTRACT", "TRUNCATED", "AT", "250", "WORDS", ")" ]

[ "(", "abstract", "truncated", "at", "250", "words", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Expression", "of", "c-fos", "correlates", "with", "IFN-alpha", "responsiveness", "in", "Philadelphia", "chromosome", "positive", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "." ]

[ "expression", "of", "c-fos", "correlates", "with", "ifn-alpha", "responsiveness", "in", "philadelphia", "chromosome", "positive", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "This", "study", "evaluates", "(", "i", ")", "constitutive", "levels", "of", "oncogene", "and", "p53", "transcripts", "in", "chronic", "phase", "CML", "patients", "and", "(", "ii", ")", "their", "modulations", "subsequent", "to", "in", "vivo", "therapy", "with", "rIFN-alpha", "2c", "." ]

[ "this", "study", "evaluates", "(", "i", ")", "constitutive", "levels", "of", "oncogene", "and", "p53", "transcripts", "in", "chronic", "phase", "cml", "patients", "and", "(", "ii", ")", "their", "modulations", "subsequent", "to", "in", "vivo", "therapy", "with", "rifn-alpha", "2c", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "pbmc", ")", "and", "bone", "marrow", "cells", "of", "26", "patients", "were", "examined", "for", "c-fos", ",", "c-myc", ",", "p53", "and", "the", "hybrid", "bcr/abl", "mRNA", "levels", "." ]

[ "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "pbmc", ")", "and", "bone", "marrow", "cells", "of", "26", "patients", "were", "examined", "for", "c-fos", ",", "c-myc", ",", "p53", "and", "the", "hybrid", "bcr/abl", "mrna", "levels", "." ]

[ "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Results", "indicated", "that", "(", "i", ")", "constitutive", "c-fos", "transcript", "levels", "are", "significantly", "higher", "in", "patients", "subsequently", "responding", "to", "IFN-alpha", "therapy", "(", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "and", "positively", "correlated", "with", "the", "proportion", "of", "lymphocytes", "(", "r", "=", "0", ".", "6895", ",", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "and", "negatively", "with", "the", "proportion", "of", "immature", "cells", "(", "r", "=", "-0", ".", "568", ",", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "contained", "in", "the", "pbmc", "preparations", "tested", ",", "(", "ii", ")", "constitutive", "mRNA", "levels", "of", "the", "hybrid", "bcr/abl", ",", "c-myc", "and", "p53", "are", "positively", "correlated", "with", "each", "other", ",", "but", "failed", "to", "relate", "to", "disease", "parameters", ",", "and", "(", "iii", ")", "acute", "and", "chronic", "in", "vivo", "exposure", "to", "IFN-alpha", "is", "accompanied", "by", "upregulation", "of", "c-fos", "and", "downregulation", "of", "c-myc", "mRNA", "levels", "in", "responder", "patients", "." ]

[ "results", "indicated", "that", "(", "i", ")", "constitutive", "c-fos", "transcript", "levels", "are", "significantly", "higher", "in", "patients", "subsequently", "responding", "to", "ifn-alpha", "therapy", "(", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "and", "positively", "correlated", "with", "the", "proportion", "of", "lymphocytes", "(", "r", "=", "0", ".", "6895", ",", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "and", "negatively", "with", "the", "proportion", "of", "immature", "cells", "(", "r", "=", "-0", ".", "568", ",", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "contained", "in", "the", "pbmc", "preparations", "tested", ",", "(", "ii", ")", "constitutive", "mrna", "levels", "of", "the", "hybrid", "bcr/abl", ",", "c-myc", "and", "p53", "are", "positively", "correlated", "with", "each", "other", ",", "but", "failed", "to", "relate", "to", "disease", "parameters", ",", "and", "(", "iii", ")", "acute", "and", "chronic", "in", "vivo", "exposure", "to", "ifn-alpha", "is", "accompanied", "by", "upregulation", "of", "c-fos", "and", "downregulation", "of", "c-myc", "mrna", "levels", "in", "responder", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "B-multi_cell", "B-multi_cell", "O" ]

[ "TAR", "independent", "activation", "of", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "in", "phorbol", "ester", "stimulated", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "tar", "independent", "activation", "of", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "in", "phorbol", "ester", "stimulated", "t", "lymphocytes", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Multiple", "regulatory", "elements", "in", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "long", "terminal", "repeat", "(", "HIV", "LTR", ")", "are", "required", "for", "activation", "of", "HIV", "gene", "expression", "." ]

[ "multiple", "regulatory", "elements", "in", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "long", "terminal", "repeat", "(", "hiv", "ltr", ")", "are", "required", "for", "activation", "of", "hiv", "gene", "expression", "." ]

[ "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Previous", "transfection", "studies", "of", "HIV", "LTR", "constructs", "linked", "to", "the", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "gene", "indicated", "that", "multiple", "regulatory", "regions", "including", "the", "enhancer", ",", "SP1", ",", "TATA", "and", "TAR", "regions", "were", "important", "for", "HIV", "gene", "expression", "." ]

[ "previous", "transfection", "studies", "of", "hiv", "ltr", "constructs", "linked", "to", "the", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "gene", "indicated", "that", "multiple", "regulatory", "regions", "including", "the", "enhancer", ",", "sp1", ",", "tata", "and", "tar", "regions", "were", "important", "for", "hiv", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "To", "characterize", "these", "regulatory", "elements", "further", ",", "mutations", "in", "these", "regions", "were", "inserted", "into", "both", "the", "5'", "and", "3'", "HIV", "LTRs", "and", "infectious", "proviral", "constructs", "were", "assembled", "." ]

[ "to", "characterize", "these", "regulatory", "elements", "further", ",", "mutations", "in", "these", "regions", "were", "inserted", "into", "both", "the", "5'", "and", "3'", "hiv", "ltrs", "and", "infectious", "proviral", "constructs", "were", "assembled", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "O", "O" ]

[ "These", "constructs", "were", "transfected", "into", "either", "HeLa", "cells", ",", "Jurkat", "cells", "or", "U937", "cells", "in", "both", "the", "presence", "and", "absence", "of", "phorbol", "esters", "which", "have", "previously", "been", "demonstrated", "to", "activate", "HIV", "gene", "expression", "." ]

[ "these", "constructs", "were", "transfected", "into", "either", "hela", "cells", ",", "jurkat", "cells", "or", "u937", "cells", "in", "both", "the", "presence", "and", "absence", "of", "phorbol", "esters", "which", "have", "previously", "been", "demonstrated", "to", "activate", "hiv", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Viral", "gene", "expression", "was", "assayed", "by", "the", "level", "of", "p24", "gag", "protein", "released", "from", "cultures", "transfected", "with", "the", "proviral", "constructs", "." ]

[ "viral", "gene", "expression", "was", "assayed", "by", "the", "level", "of", "p24", "gag", "protein", "released", "from", "cultures", "transfected", "with", "the", "proviral", "constructs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O" ]

[ "Results", "in", "all", "cell", "lines", "indicated", "that", "mutations", "of", "the", "SP1", ",", "TATA", "and", "the", "TAR", "loop", "and", "stem", "secondary", "structure", "resulted", "in", "marked", "decreases", "in", "gene", "expression", "while", "mutations", "of", "the", "enhancer", "motif", "or", "TAR", "primary", "sequence", "resulted", "in", "only", "slight", "decreases", "." ]

[ "results", "in", "all", "cell", "lines", "indicated", "that", "mutations", "of", "the", "sp1", ",", "tata", "and", "the", "tar", "loop", "and", "stem", "secondary", "structure", "resulted", "in", "marked", "decreases", "in", "gene", "expression", "while", "mutations", "of", "the", "enhancer", "motif", "or", "tar", "primary", "sequence", "resulted", "in", "only", "slight", "decreases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "viruses", "containing", "mutations", "in", "either", "the", "TAR", "loop", "sequences", "or", "stem", "secondary", "structure", "which", "were", "very", "defective", "for", "gene", "expression", "in", "untreated", "Jurkat", "cells", ",", "gave", "nearly", "wild-type", "levels", "of", "gene", "expression", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "Jurkat", "cells", "but", "not", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "HeLa", "or", "U937", "cells", "." ]

[ "however", ",", "viruses", "containing", "mutations", "in", "either", "the", "tar", "loop", "sequences", "or", "stem", "secondary", "structure", "which", "were", "very", "defective", "for", "gene", "expression", "in", "untreated", "jurkat", "cells", ",", "gave", "nearly", "wild-type", "levels", "of", "gene", "expression", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "jurkat", "cells", "but", "not", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "hela", "or", "u937", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-virus", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "High", "level", "gene", "expression", "of", "these", "TAR", "mutant", "constructs", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "Jurkat", "cells", "was", "eliminated", "by", "second", "site", "mutations", "in", "the", "enhancer", "region", "or", "by", "disruption", "of", "the", "tat", "gene", "." ]

[ "high", "level", "gene", "expression", "of", "these", "tar", "mutant", "constructs", "in", "phorbol", "ester", "-treated", "jurkat", "cells", "was", "eliminated", "by", "second", "site", "mutations", "in", "the", "enhancer", "region", "or", "by", "disruption", "of", "the", "tat", "gene", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "(", "ABSTRACT", "TRUNCATED", "AT", "250", "WORDS", ")" ]

[ "(", "abstract", "truncated", "at", "250", "words", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "regulatory", "element", "in", "the", "human", "interleukin", "2", "gene", "promoter", "is", "a", "binding", "site", "for", "the", "zinc", "finger", "proteins", "Sp1", "and", "EGR-1", "." ]

[ "a", "regulatory", "element", "in", "the", "human", "interleukin", "2", "gene", "promoter", "is", "a", "binding", "site", "for", "the", "zinc", "finger", "proteins", "sp1", "and", "egr-1", "." ]

[ "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Activation", "of", "the", "interleukin", "2", "(", "IL-2", ")", "gene", "after", "antigen", "recognition", "is", "a", "critical", "event", "for", "T", "cell", "proliferation", "and", "effector", "function", "." ]

[ "activation", "of", "the", "interleukin", "2", "(", "il-2", ")", "gene", "after", "antigen", "recognition", "is", "a", "critical", "event", "for", "t", "cell", "proliferation", "and", "effector", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Prior", "studies", "have", "identified", "several", "transcription", "factors", "that", "contribute", "to", "the", "activity", "of", "the", "IL-2", "promoter", "in", "stimulated", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "prior", "studies", "have", "identified", "several", "transcription", "factors", "that", "contribute", "to", "the", "activity", "of", "the", "il-2", "promoter", "in", "stimulated", "t", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Here", "we", "describe", "a", "novel", "regulatory", "element", "within", "the", "IL-2", "promoter", "located", "immediately", "upstream", "of", "the", "nuclear", "factor", "of", "activated", "T", "cell", "(", "NFAT", ")", "domain", "." ]

[ "here", "we", "describe", "a", "novel", "regulatory", "element", "within", "the", "il-2", "promoter", "located", "immediately", "upstream", "of", "the", "nuclear", "factor", "of", "activated", "t", "cell", "(", "nfat", ")", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O" ]

[ "This", "region", "(", "termed", "the", "zinc", "finger", "protein", "binding", "region", "(", "ZIP", ")", ")", "serves", "as", "binding", "site", "for", "two", "differently", "regulated", "zinc", "finger", "proteins", ":", "the", "constitutively", "expressed", "transcription", "factor", "Sp1", "and", "the", "inducible", "early", "growth", "response", "protein", "EGR-1", "." ]

[ "this", "region", "(", "termed", "the", "zinc", "finger", "protein", "binding", "region", "(", "zip", ")", ")", "serves", "as", "binding", "site", "for", "two", "differently", "regulated", "zinc", "finger", "proteins", ":", "the", "constitutively", "expressed", "transcription", "factor", "sp1", "and", "the", "inducible", "early", "growth", "response", "protein", "egr-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "unstimulated", "cells", "which", "do", "not", "secrete", "IL-2", ",", "only", "Sp1", "binds", "to", "this", "region", ",", "while", "in", "stimulated", "IL-2", "secreting", "cells", "the", "inducible", "EGR-1", "protein", "recognizes", "this", "element", "." ]

[ "in", "unstimulated", "cells", "which", "do", "not", "secrete", "il-2", ",", "only", "sp1", "binds", "to", "this", "region", ",", "while", "in", "stimulated", "il-2", "secreting", "cells", "the", "inducible", "egr-1", "protein", "recognizes", "this", "element", "." ]

[ "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "Jurkat", "T", "cells", ",", "the", "ZIP", "site", "serves", "as", "an", "activator", "for", "IL-2", "gene", "expression", ",", "and", "a", "combination", "of", "ZIP", "and", "NFAT", "binding", "sites", "is", "required", "for", "maximal", "IL-2", "promoter", "activity", "." ]

[ "in", "jurkat", "t", "cells", ",", "the", "zip", "site", "serves", "as", "an", "activator", "for", "il-2", "gene", "expression", ",", "and", "a", "combination", "of", "zip", "and", "nfat", "binding", "sites", "is", "required", "for", "maximal", "il-2", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "a", "critical", "role", "of", "the", "ZIP", "site", "for", "IL-2", "promoter", "activity", "." ]

[ "these", "results", "suggest", "a", "critical", "role", "of", "the", "zip", "site", "for", "il-2", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Nonimmunoglobulin", "gene", "hypermutation", "in", "germinal", "center", "B", "cells", "." ]

[ "nonimmunoglobulin", "gene", "hypermutation", "in", "germinal", "center", "b", "cells", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Somatic", "hypermutation", "is", "the", "most", "critical", "mechanism", "underlying", "the", "diversification", "of", "Ig", "genes", "." ]

[ "somatic", "hypermutation", "is", "the", "most", "critical", "mechanism", "underlying", "the", "diversification", "of", "ig", "genes", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "Although", "mutation", "occurs", "specifically", "in", "B", "cells", "during", "the", "germinal", "center", "reaction", ",", "it", "remains", "a", "matter", "of", "debate", "whether", "the", "mutation", "machinery", "also", "targets", "non-", "Ig", "genes", "." ]

[ "although", "mutation", "occurs", "specifically", "in", "b", "cells", "during", "the", "germinal", "center", "reaction", ",", "it", "remains", "a", "matter", "of", "debate", "whether", "the", "mutation", "machinery", "also", "targets", "non-", "ig", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "We", "have", "studied", "mutations", "in", "the", "5'", "noncoding", "region", "of", "the", "Bcl6", "gene", "in", "different", "subtypes", "of", "lymphomas", "." ]

[ "we", "have", "studied", "mutations", "in", "the", "5'", "noncoding", "region", "of", "the", "bcl6", "gene", "in", "different", "subtypes", "of", "lymphomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "O" ]

[ "We", "found", "frequent", "hypermutation", "in", "follicular", "lymphoma", "(", "25", "of", "59", "=", "42%", ")", "(", "germinal", "center", "cell", "origin", ")", "and", "mucosa-associated", "lymphoid", "tissue", "(", "MALT", ")", "lymphoma", "(", "19", "of", "45", "=", "42%", ")", "(", "postgerminal", "center", ")", ",", "but", "only", "occasionally", "in", "mantle", "cell", "lymphoma", "(", "1", "of", "21", "=", "4", ".", "8%", ")", "(", "pregerminal", "center", ")", "." ]

[ "we", "found", "frequent", "hypermutation", "in", "follicular", "lymphoma", "(", "25", "of", "59", "=", "42%", ")", "(", "germinal", "center", "cell", "origin", ")", "and", "mucosa-associated", "lymphoid", "tissue", "(", "malt", ")", "lymphoma", "(", "19", "of", "45", "=", "42%", ")", "(", "postgerminal", "center", ")", ",", "but", "only", "occasionally", "in", "mantle", "cell", "lymphoma", "(", "1", "of", "21", "=", "4", ".", "8%", ")", "(", "pregerminal", "center", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "B-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O" ]

[ "Most", "mutations", "were", "outside", "the", "motifs", "potentially", "important", "for", "transcription", ",", "suggesting", "they", "were", "not", "important", "in", "lymphomagenesis", "but", "may", ",", "like", "Ig", "mutation", ",", "represent", "an", "inherent", "feature", "of", "the", "lymphoma", "precursor", "cells", "." ]

[ "most", "mutations", "were", "outside", "the", "motifs", "potentially", "important", "for", "transcription", ",", "suggesting", "they", "were", "not", "important", "in", "lymphomagenesis", "but", "may", ",", "like", "ig", "mutation", ",", "represent", "an", "inherent", "feature", "of", "the", "lymphoma", "precursor", "cells", "." ]

[ "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Therefore", ",", "we", "investigated", "their", "normal", "cell", "counterparts", "microdissected", "from", "a", "reactive", "tonsil", "." ]

[ "therefore", ",", "we", "investigated", "their", "normal", "cell", "counterparts", "microdissected", "from", "a", "reactive", "tonsil", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "Bcl6", "mutation", "was", "found", "in", "13", "of", "24", "(", "54%", ")", "clones", "from", "the", "germinal", "centre", "but", "only", "in", "1", "of", "24", "(", "4%", ")", "clones", "from", "the", "naive", "B", "cells", "of", "the", "mantle", "zone", "." ]

[ "bcl6", "mutation", "was", "found", "in", "13", "of", "24", "(", "54%", ")", "clones", "from", "the", "germinal", "centre", "but", "only", "in", "1", "of", "24", "(", "4%", ")", "clones", "from", "the", "naive", "b", "cells", "of", "the", "mantle", "zone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "The", "frequency", ",", "distribution", ",", "and", "nature", "of", "these", "mutations", "were", "similar", "to", "those", "resulting", "from", "the", "Ig", "hypermutation", "process", "." ]

[ "the", "frequency", ",", "distribution", ",", "and", "nature", "of", "these", "mutations", "were", "similar", "to", "those", "resulting", "from", "the", "ig", "hypermutation", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "results", "show", "unequivocal", "evidence", "of", "non-", "Ig", "gene", "hypermutation", "in", "germinal", "center", "B", "cells", "and", "provide", "fresh", "insights", "into", "the", "process", "of", "hypermutation", "and", "lymphomagenesis", "." ]

[ "the", "results", "show", "unequivocal", "evidence", "of", "non-", "ig", "gene", "hypermutation", "in", "germinal", "center", "b", "cells", "and", "provide", "fresh", "insights", "into", "the", "process", "of", "hypermutation", "and", "lymphomagenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Interferon", "affects", "nuclear", "proteins", "in", "cells", "of", "clinically", "sensitive", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "patients", "." ]

[ "interferon", "affects", "nuclear", "proteins", "in", "cells", "of", "clinically", "sensitive", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "patients", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O" ]

[ "Cytoplasmic", "protein", "extracts", "from", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "(", "CML", ")", "cells", "contained", "an", "activity", "that", "altered", "the", "electrophoretic", "mobility", "of", "complexes", "formed", "between", "nuclear", "proteins", "and", "the", "transcriptional", "enhancers", "of", "interferon", "(", "IFN", ")", "-inducible", "genes", "." ]

[ "cytoplasmic", "protein", "extracts", "from", "chronic", "myelogenous", "leukemia", "(", "cml", ")", "cells", "contained", "an", "activity", "that", "altered", "the", "electrophoretic", "mobility", "of", "complexes", "formed", "between", "nuclear", "proteins", "and", "the", "transcriptional", "enhancers", "of", "interferon", "(", "ifn", ")", "-inducible", "genes", "." ]

[ "B-cell_component", "I-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exposure", "of", "CML", "cells", "to", "IFN-alpha", "diminished", "the", "effect", "of", "the", "CML", "cytoplasmic", "proteins", "on", "these", "nuclear", "protein-DNA", "complexes", "." ]

[ "exposure", "of", "cml", "cells", "to", "ifn-alpha", "diminished", "the", "effect", "of", "the", "cml", "cytoplasmic", "proteins", "on", "these", "nuclear", "protein-dna", "complexes", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "The", "presence", "of", "clinical", "responsiveness", "to", "IFN-alpha", "correlated", "with", "the", "sensitivity", "to", "the", "IFN", "-induced", "change", "in", "the", "electrophoretic", "mobility", "of", "nuclear", "protein-DNA", "complexes", "." ]

[ "the", "presence", "of", "clinical", "responsiveness", "to", "ifn-alpha", "correlated", "with", "the", "sensitivity", "to", "the", "ifn", "-induced", "change", "in", "the", "electrophoretic", "mobility", "of", "nuclear", "protein-dna", "complexes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "These", "data", "suggest", "that", "the", "action", "of", "IFN-alpha", "in", "CML", "may", "be", "linked", "to", "a", "pathway", "that", "can", "result", "in", "posttranslational", "modification", "of", "nuclear", "proteins", "." ]

[ "these", "data", "suggest", "that", "the", "action", "of", "ifn-alpha", "in", "cml", "may", "be", "linked", "to", "a", "pathway", "that", "can", "result", "in", "posttranslational", "modification", "of", "nuclear", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Activation", "of", "c-Jun", "N-terminal", "kinase", "in", "bacterial", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "macrophages", "." ]

[ "activation", "of", "c-jun", "n-terminal", "kinase", "in", "bacterial", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Activation", "of", "macrophages", "by", "bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "induces", "transcription", "of", "genes", "that", "encode", "for", "proinflammatory", "regulators", "of", "the", "immune", "response", "." ]

[ "activation", "of", "macrophages", "by", "bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "lps", ")", "induces", "transcription", "of", "genes", "that", "encode", "for", "proinflammatory", "regulators", "of", "the", "immune", "response", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Previous", "work", "has", "suggested", "that", "activation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein", "1", "(", "AP-1", ")", "is", "one", "LPS", "-induced", "event", "that", "mediates", "this", "response", "." ]

[ "previous", "work", "has", "suggested", "that", "activation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein", "1", "(", "ap-1", ")", "is", "one", "lps", "-induced", "event", "that", "mediates", "this", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consistent", "with", "this", "notion", ",", "we", "found", "that", "LPS", "stimulated", "AP-1", "-mediated", "transcription", "of", "a", "transfected", "reporter", "gene", "in", "the", "murine", "macrophage", "cell", "line", "RAW", "264", ".", "7", "." ]

[ "consistent", "with", "this", "notion", ",", "we", "found", "that", "lps", "stimulated", "ap-1", "-mediated", "transcription", "of", "a", "transfected", "reporter", "gene", "in", "the", "murine", "macrophage", "cell", "line", "raw", "264", ".", "7", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "As", "AP-1", "activity", "is", "regulated", "in", "part", "by", "activation", "of", "the", "c-Jun", "N-terminal", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "which", "phosphorylates", "and", "subsequently", "increases", "the", "transcriptional", "activity", "of", "c-Jun", ",", "we", "examined", "whether", "LPS", "treatment", "of", "macrophages", "resulted", "in", "activation", "of", "this", "kinase", "." ]

[ "as", "ap-1", "activity", "is", "regulated", "in", "part", "by", "activation", "of", "the", "c-jun", "n-terminal", "kinase", "(", "jnk", ")", ",", "which", "phosphorylates", "and", "subsequently", "increases", "the", "transcriptional", "activity", "of", "c-jun", ",", "we", "examined", "whether", "lps", "treatment", "of", "macrophages", "resulted", "in", "activation", "of", "this", "kinase", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "LPS", "treatment", "of", "RAW", "264", ".", "7", "cells", ",", "murine", "bone", "marrow-derived", "macrophages", ",", "and", "the", "human", "monocyte", "cell", "line", "THP-1", "resulted", "in", "rapid", "activation", "of", "the", "p46", "and", "p54", "isoforms", "of", "JNK", "." ]

[ "lps", "treatment", "of", "raw", "264", ".", "7", "cells", ",", "murine", "bone", "marrow-derived", "macrophages", ",", "and", "the", "human", "monocyte", "cell", "line", "thp-1", "resulted", "in", "rapid", "activation", "of", "the", "p46", "and", "p54", "isoforms", "of", "jnk", "." ]

[ "B-lipid", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Treatment", "with", "wild-type", "and", "rough", "mutant", "forms", "of", "LPS", "and", "synthetic", "lipid", "A", "resulted", "in", "JNK", "activation", ",", "while", "pretreatment", "with", "the", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "herbimycin", "A", "inhibited", "this", "response", "." ]

[ "treatment", "with", "wild-type", "and", "rough", "mutant", "forms", "of", "lps", "and", "synthetic", "lipid", "a", "resulted", "in", "jnk", "activation", ",", "while", "pretreatment", "with", "the", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "herbimycin", "a", "inhibited", "this", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Binding", "of", "LPS", "-", "LPS", "binding", "protein", "(", "LBP", ")", "complexes", "to", "CD14", ",", "a", "surface", "receptor", "that", "mediates", "many", "LPS", "responses", ",", "was", "found", "to", "be", "crucial", ",", "as", "pretreatment", "of", "THP-1", "cells", "with", "the", "monoclonal", "antibody", "60b", ",", "which", "blocks", "this", "binding", ",", "inhibited", "JNK", "activation", "." ]

[ "binding", "of", "lps", "-", "lps", "binding", "protein", "(", "lbp", ")", "complexes", "to", "cd14", ",", "a", "surface", "receptor", "that", "mediates", "many", "lps", "responses", ",", "was", "found", "to", "be", "crucial", ",", "as", "pretreatment", "of", "thp-1", "cells", "with", "the", "monoclonal", "antibody", "60b", ",", "which", "blocks", "this", "binding", ",", "inhibited", "jnk", "activation", "." ]

[ "O", "O", "B-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "LPS", "activation", "of", "JNK", "in", "monocyte/macrophage", "cells", "is", "a", "CD14-", "and", "protein", "tyrosine", "phosphorylation-", "dependent", "event", "that", "may", "mediate", "the", "early", "activation", "of", "AP-1", "in", "regulating", "LPS", "-triggered", "gene", "induction", "." ]

[ "these", "results", "suggest", "that", "lps", "activation", "of", "jnk", "in", "monocyte/macrophage", "cells", "is", "a", "cd14-", "and", "protein", "tyrosine", "phosphorylation-", "dependent", "event", "that", "may", "mediate", "the", "early", "activation", "of", "ap-1", "in", "regulating", "lps", "-triggered", "gene", "induction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Physical", "interactions", "between", "Ets", "and", "NF-kappaB/NFAT", "proteins", "play", "an", "important", "role", "in", "their", "cooperative", "activation", "of", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "enhancer", "in", "T", "cells", "." ]

[ "physical", "interactions", "between", "ets", "and", "nf-kappab/nfat", "proteins", "play", "an", "important", "role", "in", "their", "cooperative", "activation", "of", "the", "human", "immunodeficiency", "virus", "enhancer", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "transcriptional", "regulatory", "elements", "of", "many", "inducible", "T-cell", "genes", "contain", "adjacent", "or", "overlapping", "binding", "sites", "for", "the", "Ets", "and", "NF-kappaB/NFAT", "families", "of", "transcription", "factors", "." ]

[ "the", "transcriptional", "regulatory", "elements", "of", "many", "inducible", "t-cell", "genes", "contain", "adjacent", "or", "overlapping", "binding", "sites", "for", "the", "ets", "and", "nf-kappab/nfat", "families", "of", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Similar", "arrays", "of", "functionally", "important", "NF-kappaB/NFAT", "and", "Ets", "binding", "sites", "are", "present", "in", "the", "transcriptional", "enhancers", "of", "human", "immunodeficiency", "viruses", "types", "1", "and", "2", "(", "HIV-1", "and", "HIV-2", ")", ",", "suggesting", "that", "this", "pattern", "of", "nuclear", "protein", "binding", "sites", "reflects", "an", "evolutionarily", "conserved", "mechanism", "for", "regulating", "inducible", "T-cell", "gene", "expression", "that", "has", "been", "co-opted", "during", "HIV", "evolution", "." ]

[ "similar", "arrays", "of", "functionally", "important", "nf-kappab/nfat", "and", "ets", "binding", "sites", "are", "present", "in", "the", "transcriptional", "enhancers", "of", "human", "immunodeficiency", "viruses", "types", "1", "and", "2", "(", "hiv-1", "and", "hiv-2", ")", ",", "suggesting", "that", "this", "pattern", "of", "nuclear", "protein", "binding", "sites", "reflects", "an", "evolutionarily", "conserved", "mechanism", "for", "regulating", "inducible", "t-cell", "gene", "expression", "that", "has", "been", "co-opted", "during", "hiv", "evolution", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Despite", "these", "findings", ",", "the", "molecular", "mechanisms", "by", "which", "Ets", "and", "NF-kappaB/NFAT", "proteins", "cooperatively", "regulate", "inducible", "T-cell", "gene", "expression", "remained", "unknown", "." ]

[ "despite", "these", "findings", ",", "the", "molecular", "mechanisms", "by", "which", "ets", "and", "nf-kappab/nfat", "proteins", "cooperatively", "regulate", "inducible", "t-cell", "gene", "expression", "remained", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "studies", "described", "in", "this", "report", ",", "we", "demonstrated", "a", "physical", "interaction", "between", "multiple", "Ets", "and", "NF-kappaB/NFAT", "proteins", "both", "in", "vitro", "and", "in", "activated", "normal", "human", "T", "cells", "." ]

[ "in", "the", "studies", "described", "in", "this", "report", ",", "we", "demonstrated", "a", "physical", "interaction", "between", "multiple", "ets", "and", "nf-kappab/nfat", "proteins", "both", "in", "vitro", "and", "in", "activated", "normal", "human", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "This", "interaction", "is", "mediated", "by", "the", "Ets", "domain", "of", "Ets", "proteins", "and", "the", "C-terminal", "region", "of", "the", "Rel", "homology", "domains", "of", "NF-kappaB/NFAT", "proteins", "." ]

[ "this", "interaction", "is", "mediated", "by", "the", "ets", "domain", "of", "ets", "proteins", "and", "the", "c-terminal", "region", "of", "the", "rel", "homology", "domains", "of", "nf-kappab/nfat", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "Ets", "-", "NF-kappaB", "/", "NFAT", "interaction", "requires", "the", "presence", "of", "DNA", "binding", "sites", "for", "both", "proteins", ",", "as", "it", "is", "abolished", "by", "the", "DNA", "intercalating", "agents", "propidium", "iodide", "and", "ethidium", "bromide", "and", "enhanced", "by", "the", "presence", "of", "synthetic", "oligonucleotides", "containing", "binding", "sites", "for", "Ets", "and", "NF-kappaB", "proteins", "." ]

[ "in", "addition", ",", "the", "ets", "-", "nf-kappab", "/", "nfat", "interaction", "requires", "the", "presence", "of", "dna", "binding", "sites", "for", "both", "proteins", ",", "as", "it", "is", "abolished", "by", "the", "dna", "intercalating", "agents", "propidium", "iodide", "and", "ethidium", "bromide", "and", "enhanced", "by", "the", "presence", "of", "synthetic", "oligonucleotides", "containing", "binding", "sites", "for", "ets", "and", "nf-kappab", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "A", "dominant-negative", "mutant", "of", "NF-kappaB", "p50", "that", "binds", "DNA", "but", "fails", "to", "interact", "with", "Ets", "proteins", "inhibits", "the", "synergistic", "activation", "of", "the", "HIV-1", "and", "HIV-2", "enhancers", "by", "NF-kappaB", "(", "p50", "+", "p65", ")", "and", "Ets-1", ",", "suggesting", "that", "physical", "interaction", "between", "Ets", "and", "NF-kappaB", "proteins", "is", "required", "for", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "HIV-1", "and", "HIV-2", "enhancers", "." ]

[ "a", "dominant-negative", "mutant", "of", "nf-kappab", "p50", "that", "binds", "dna", "but", "fails", "to", "interact", "with", "ets", "proteins", "inhibits", "the", "synergistic", "activation", "of", "the", "hiv-1", "and", "hiv-2", "enhancers", "by", "nf-kappab", "(", "p50", "+", "p65", ")", "and", "ets-1", ",", "suggesting", "that", "physical", "interaction", "between", "ets", "and", "nf-kappab", "proteins", "is", "required", "for", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "hiv-1", "and", "hiv-2", "enhancers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "evolutionarily", "conserved", "physical", "interactions", "between", "Ets", "and", "NF-kappaB/NFAT", "proteins", "are", "important", "in", "regulating", "the", "inducible", "expression", "of", "T-cell", "genes", "and", "viruses", "." ]

[ "taken", "together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "evolutionarily", "conserved", "physical", "interactions", "between", "ets", "and", "nf-kappab/nfat", "proteins", "are", "important", "in", "regulating", "the", "inducible", "expression", "of", "t-cell", "genes", "and", "viruses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O" ]

[ "These", "interactions", "represent", "a", "potential", "target", "for", "the", "development", "of", "novel", "immunosuppressive", "and", "antiviral", "therapies", "." ]

[ "these", "interactions", "represent", "a", "potential", "target", "for", "the", "development", "of", "novel", "immunosuppressive", "and", "antiviral", "therapies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reduction", "of", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", "expression", "and", "signalling", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "from", "patients", "with", "thalassaemia", "or", "sickle", "cell", "anaemia", "upon", "treatment", "with", "desferrioxamine", "." ]

[ "reduction", "of", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", "expression", "and", "signalling", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "from", "patients", "with", "thalassaemia", "or", "sickle", "cell", "anaemia", "upon", "treatment", "with", "desferrioxamine", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "Recent", "evidence", "indicates", "that", "the", "rate", "of", "progression", "of", "the", "HIV-1", "disease", "is", "significantly", "reduced", "in", "thalassaemia", "major", "patients", "upon", "treatment", "with", "high", "doses", "of", "desferrioxamine", "(", "DFX", ")", "." ]

[ "recent", "evidence", "indicates", "that", "the", "rate", "of", "progression", "of", "the", "hiv-1", "disease", "is", "significantly", "reduced", "in", "thalassaemia", "major", "patients", "upon", "treatment", "with", "high", "doses", "of", "desferrioxamine", "(", "dfx", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "authors", "have", "previously", "demonstrated", "that", "in", "vitro", "exposure", "of", "mononuclear", "cells", "to", "DFX", "decreases", "the", "bioavailability", "of", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF-alpha", ")", "which", "has", "a", "stimulatory", "effect", "on", "HIV-1", "replication", "." ]

[ "the", "authors", "have", "previously", "demonstrated", "that", "in", "vitro", "exposure", "of", "mononuclear", "cells", "to", "dfx", "decreases", "the", "bioavailability", "of", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "tnf-alpha", ")", "which", "has", "a", "stimulatory", "effect", "on", "hiv-1", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "therefore", ",", "TNF-alpha", "bioavailability", "from", "mononuclear", "cells", "isolated", "from", "10", "patients", "with", "thalassaemia", "or", "sickle", "cell", "anaemia", "given", "DFX", "as", "compared", "to", "10", "untreated", "subjects", "has", "been", "evaluated", "." ]

[ "in", "this", "study", ",", "therefore", ",", "tnf-alpha", "bioavailability", "from", "mononuclear", "cells", "isolated", "from", "10", "patients", "with", "thalassaemia", "or", "sickle", "cell", "anaemia", "given", "dfx", "as", "compared", "to", "10", "untreated", "subjects", "has", "been", "evaluated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Evidence", "is", "presented", "showing", "that", "DFX", "treatment", "reduces", "TNF-alpha", "bioavailability", "(", "P<0", ".", "05", ")", "by", "inhibiting", "its", "steady", "state", "(", "P<0", ".", "05", ")", "and", "by", "enhancing", "its", "inactivation", "through", "binding", "to", "soluble", "TNF-alpha", "receptor", "type", "II", "(", "P<0", ".", "05", ")", "." ]

[ "evidence", "is", "presented", "showing", "that", "dfx", "treatment", "reduces", "tnf-alpha", "bioavailability", "(", "p<0", ".", "05", ")", "by", "inhibiting", "its", "steady", "state", "(", "p<0", ".", "05", ")", "and", "by", "enhancing", "its", "inactivation", "through", "binding", "to", "soluble", "tnf-alpha", "receptor", "type", "ii", "(", "p<0", ".", "05", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]