tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"We",
"also",
"show",
"that",
"DFX",
"treatment",
"limits",
"the",
"in",
"vivo",
"activation",
"of",
"NF-kappaB",
",",
"a",
"transcription",
"factor",
"involved",
"in",
"both",
"TNF-alpha",
"gene",
"transcription",
"and",
"TNF-alpha",
"signalling",
"(",
"P<0",
".",
"005",
")",
"."
] | [
"we",
"also",
"show",
"that",
"dfx",
"treatment",
"limits",
"the",
"in",
"vivo",
"activation",
"of",
"nf-kappab",
",",
"a",
"transcription",
"factor",
"involved",
"in",
"both",
"tnf-alpha",
"gene",
"transcription",
"and",
"tnf-alpha",
"signalling",
"(",
"p<0",
".",
"005",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"TNF-alpha",
"bioavailability",
"and",
"signalling",
"are",
"impaired",
"in",
"patients",
"upon",
"DFX",
"treatment",
"."
] | [
"we",
"conclude",
"that",
"tnf-alpha",
"bioavailability",
"and",
"signalling",
"are",
"impaired",
"in",
"patients",
"upon",
"dfx",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"mechanism",
"may",
"contribute",
"to",
"delayed",
"progression",
"of",
"the",
"HIV-1",
"infection",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"this",
"mechanism",
"may",
"contribute",
"to",
"delayed",
"progression",
"of",
"the",
"hiv-1",
"infection",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Copyright",
"1999",
"Academic",
"Press",
"."
] | [
"copyright",
"1999",
"academic",
"press",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"control",
"of",
"lytic",
"replication",
"of",
"Epstein-Barr",
"virus",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"(",
"Review",
")",
"."
] | [
"the",
"control",
"of",
"lytic",
"replication",
"of",
"epstein-barr",
"virus",
"in",
"b",
"lymphocytes",
"(",
"review",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Uncontrolled",
"replication",
"of",
"a",
"virus",
",",
"which",
"is",
"harmful",
"to",
"the",
"host",
"is",
"also",
"disadvantageous",
"to",
"the",
"virus",
"."
] | [
"uncontrolled",
"replication",
"of",
"a",
"virus",
",",
"which",
"is",
"harmful",
"to",
"the",
"host",
"is",
"also",
"disadvantageous",
"to",
"the",
"virus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Most",
"viruses",
"cannot",
"compete",
"with",
"the",
"various",
"immune",
"mechanisms",
"and",
"become",
"eliminated",
"in",
"the",
"course",
"of",
"infection",
"."
] | [
"most",
"viruses",
"cannot",
"compete",
"with",
"the",
"various",
"immune",
"mechanisms",
"and",
"become",
"eliminated",
"in",
"the",
"course",
"of",
"infection",
"."
] | [
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"only",
"the",
"time",
"between",
"infection",
"and",
"eradication",
"remains",
"for",
"these",
"viruses",
"to",
"proliferate",
"."
] | [
"therefore",
",",
"only",
"the",
"time",
"between",
"infection",
"and",
"eradication",
"remains",
"for",
"these",
"viruses",
"to",
"proliferate",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"few",
"viruses",
",",
"like",
"the",
"Herpesviruses",
"or",
"the",
"papillomaviruses",
",",
"however",
",",
"have",
"developed",
"a",
"sophisticated",
"strategy",
"for",
"persisting",
"lifelong",
",",
"usually",
"asymptomatically",
"in",
"the",
"host",
",",
"hiding",
"from",
"the",
"immune",
"system",
"and",
"producing",
"infectious",
"progeny",
"at",
"the",
"same",
"time",
"."
] | [
"a",
"few",
"viruses",
",",
"like",
"the",
"herpesviruses",
"or",
"the",
"papillomaviruses",
",",
"however",
",",
"have",
"developed",
"a",
"sophisticated",
"strategy",
"for",
"persisting",
"lifelong",
",",
"usually",
"asymptomatically",
"in",
"the",
"host",
",",
"hiding",
"from",
"the",
"immune",
"system",
"and",
"producing",
"infectious",
"progeny",
"at",
"the",
"same",
"time",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"strategy",
"depends",
"on",
"a",
"separation",
"of",
"latency",
"and",
"the",
"lytic",
"replication",
",",
"either",
"by",
"time",
"due",
"to",
"differentiation-dependent",
"mechanisms",
"or",
"by",
"spatial",
"separation",
"as",
"the",
"result",
"of",
"different",
"host",
"cell",
"types",
"."
] | [
"this",
"strategy",
"depends",
"on",
"a",
"separation",
"of",
"latency",
"and",
"the",
"lytic",
"replication",
",",
"either",
"by",
"time",
"due",
"to",
"differentiation-dependent",
"mechanisms",
"or",
"by",
"spatial",
"separation",
"as",
"the",
"result",
"of",
"different",
"host",
"cell",
"types",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"are",
"true",
"for",
"the",
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"."
] | [
"both",
"are",
"true",
"for",
"the",
"epstein-barr",
"virus",
"(",
"ebv",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O"
] |
[
"B",
"cells",
"and",
"epithelial",
"cells",
"have",
"a",
"pivotal",
"role",
"in",
"the",
"life",
"cycle",
"of",
"the",
"virus",
"."
] | [
"b",
"cells",
"and",
"epithelial",
"cells",
"have",
"a",
"pivotal",
"role",
"in",
"the",
"life",
"cycle",
"of",
"the",
"virus",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"former",
"can",
"become",
"latently",
"infected",
"and",
"are",
"thought",
"to",
"be",
"the",
"virus",
"reservoir",
"in",
"vivo",
",",
"whereas",
"the",
"latter",
"were",
"shown",
"to",
"be",
"permissive",
"for",
"lytic",
"replication",
"."
] | [
"the",
"former",
"can",
"become",
"latently",
"infected",
"and",
"are",
"thought",
"to",
"be",
"the",
"virus",
"reservoir",
"in",
"vivo",
",",
"whereas",
"the",
"latter",
"were",
"shown",
"to",
"be",
"permissive",
"for",
"lytic",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"However",
",",
"replication",
"of",
"EBV",
"in",
"vivo",
"is",
"controlled",
"primarily",
"by",
"host",
"immune",
"mechanisms",
"selecting",
"for",
"cells",
"that",
"are",
"not",
"permissive",
"for",
"viral",
"replication",
"as",
"the",
"result",
"of",
"a",
"particular",
"set",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"however",
",",
"replication",
"of",
"ebv",
"in",
"vivo",
"is",
"controlled",
"primarily",
"by",
"host",
"immune",
"mechanisms",
"selecting",
"for",
"cells",
"that",
"are",
"not",
"permissive",
"for",
"viral",
"replication",
"as",
"the",
"result",
"of",
"a",
"particular",
"set",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"factors",
"control",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"regulatory",
"immediate-early",
"genes",
"and",
",",
"in",
"addition",
",",
"lytic",
"and",
"latent",
"cycle",
"regulatory",
"genes",
"negatively",
"interfere",
"with",
"each",
"other",
"and",
"thus",
"link",
"cellular",
"and",
"viral",
"gene",
"regulatory",
"mechanisms",
"."
] | [
"these",
"factors",
"control",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"regulatory",
"immediate-early",
"genes",
"and",
",",
"in",
"addition",
",",
"lytic",
"and",
"latent",
"cycle",
"regulatory",
"genes",
"negatively",
"interfere",
"with",
"each",
"other",
"and",
"thus",
"link",
"cellular",
"and",
"viral",
"gene",
"regulatory",
"mechanisms",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Disturbance",
"of",
"both",
"the",
"immune",
"surveillance",
"as",
"well",
"as",
"viral",
"gene",
"regulation",
"may",
"result",
"in",
"EBV",
"-associated",
"disease",
"."
] | [
"disturbance",
"of",
"both",
"the",
"immune",
"surveillance",
"as",
"well",
"as",
"viral",
"gene",
"regulation",
"may",
"result",
"in",
"ebv",
"-associated",
"disease",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Oxidant-regulation",
"of",
"gene",
"expression",
"in",
"the",
"chronically",
"inflamed",
"intestine",
"."
] | [
"oxidant-regulation",
"of",
"gene",
"expression",
"in",
"the",
"chronically",
"inflamed",
"intestine",
"."
] | [
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"I-body_part",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"becoming",
"increasingly",
"apparent",
"that",
"the",
"chronic",
"gut",
"inflammation",
"observed",
"in",
"the",
"idiopathic",
"inflammatory",
"bowel",
"diseases",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"ulcerative",
"colitis",
",",
"Crohn's",
"disease",
")",
"is",
"associated",
"with",
"enhanced",
"production",
"of",
"leukocyte-derived",
"oxidants",
"."
] | [
"it",
"is",
"becoming",
"increasingly",
"apparent",
"that",
"the",
"chronic",
"gut",
"inflammation",
"observed",
"in",
"the",
"idiopathic",
"inflammatory",
"bowel",
"diseases",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"ulcerative",
"colitis",
",",
"crohn's",
"disease",
")",
"is",
"associated",
"with",
"enhanced",
"production",
"of",
"leukocyte-derived",
"oxidants",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"Oxidants",
"such",
"as",
"hydrogen",
"peroxide",
"are",
"known",
"to",
"activate",
"certain",
"transcription",
"factors",
"such",
"as",
"nuclear",
"transcription",
"factor",
"kappa",
"beta",
"."
] | [
"oxidants",
"such",
"as",
"hydrogen",
"peroxide",
"are",
"known",
"to",
"activate",
"certain",
"transcription",
"factors",
"such",
"as",
"nuclear",
"transcription",
"factor",
"kappa",
"beta",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"Nuclear",
"transcription",
"factor",
"kB",
"(",
"NF-kappa",
"B",
")",
"is",
"a",
"ubiquitous",
"transcription",
"factor",
"and",
"pleiotropic",
"regulator",
"of",
"numerous",
"genes",
"involved",
"in",
"the",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"responses",
"."
] | [
"nuclear",
"transcription",
"factor",
"kb",
"(",
"nf-kappa",
"b",
")",
"is",
"a",
"ubiquitous",
"transcription",
"factor",
"and",
"pleiotropic",
"regulator",
"of",
"numerous",
"genes",
"involved",
"in",
"the",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"responses",
"."
] | [
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"transcription",
"factor",
"is",
"activated",
"via",
"the",
"selective",
"phosphorylation",
",",
"ubiquination",
"and",
"degradation",
"of",
"its",
"inhibitor",
"protein",
"I-kB",
"thereby",
"allowing",
"translocation",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"into",
"the",
"nucleus",
"where",
"it",
"upregulates",
"the",
"transcription",
"of",
"a",
"variety",
"of",
"adhesion",
"molecules",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"ICAM-1",
",",
"VCAM-1",
")",
",",
"cytokines",
"(",
"TNF",
",",
"IL-1",
",",
"IL-6",
")",
"and",
"enzymes",
"(",
"iNOS",
")",
"."
] | [
"this",
"transcription",
"factor",
"is",
"activated",
"via",
"the",
"selective",
"phosphorylation",
",",
"ubiquination",
"and",
"degradation",
"of",
"its",
"inhibitor",
"protein",
"i-kb",
"thereby",
"allowing",
"translocation",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"into",
"the",
"nucleus",
"where",
"it",
"upregulates",
"the",
"transcription",
"of",
"a",
"variety",
"of",
"adhesion",
"molecules",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"icam-1",
",",
"vcam-1",
")",
",",
"cytokines",
"(",
"tnf",
",",
"il-1",
",",
"il-6",
")",
"and",
"enzymes",
"(",
"inos",
")",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proteolytic",
"degradation",
"of",
"the",
"post-translationally",
"modified",
"I-kappa",
"B",
"is",
"known",
"to",
"be",
"mediated",
"by",
"the",
"26S",
"proteasome",
"complex",
"."
] | [
"the",
"proteolytic",
"degradation",
"of",
"the",
"post-translationally",
"modified",
"i-kappa",
"b",
"is",
"known",
"to",
"be",
"mediated",
"by",
"the",
"26s",
"proteasome",
"complex",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"Based",
"upon",
"work",
"from",
"our",
"laboratory",
",",
"we",
"propose",
"that",
"inhibition",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"produces",
"significant",
"anti",
"inflammatory",
"activity",
"which",
"may",
"be",
"mediated",
"by",
"the",
"inhibition",
"of",
"transcription",
"of",
"certain",
"pro-inflammatory",
"mediators",
"and",
"adhesion",
"molecules",
"."
] | [
"based",
"upon",
"work",
"from",
"our",
"laboratory",
",",
"we",
"propose",
"that",
"inhibition",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"produces",
"significant",
"anti",
"inflammatory",
"activity",
"which",
"may",
"be",
"mediated",
"by",
"the",
"inhibition",
"of",
"transcription",
"of",
"certain",
"pro-inflammatory",
"mediators",
"and",
"adhesion",
"molecules",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Herpesvirus",
"saimiri",
"immortalized",
"gamma",
"delta",
"T",
"cell",
"line",
"activated",
"by",
"IL-12",
"."
] | [
"herpesvirus",
"saimiri",
"immortalized",
"gamma",
"delta",
"t",
"cell",
"line",
"activated",
"by",
"il-12",
"."
] | [
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"IL-12",
"is",
"a",
"novel",
"heterodimeric",
"cytokine",
"important",
"for",
"the",
"regulation",
"and",
"differentiation",
"of",
"lymphocytes",
"and",
"NK",
"cells",
"."
] | [
"il-12",
"is",
"a",
"novel",
"heterodimeric",
"cytokine",
"important",
"for",
"the",
"regulation",
"and",
"differentiation",
"of",
"lymphocytes",
"and",
"nk",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"Like",
"other",
"cytokines",
",",
"IL-12",
"mediates",
"its",
"biologic",
"activity",
"through",
"high-affinity",
"receptors",
"expressed",
"on",
"responsive",
"cells",
"."
] | [
"like",
"other",
"cytokines",
",",
"il-12",
"mediates",
"its",
"biologic",
"activity",
"through",
"high-affinity",
"receptors",
"expressed",
"on",
"responsive",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"To",
"date",
",",
"a",
"large",
"number",
"of",
"receptors",
"for",
"IL-12",
"have",
"been",
"found",
"only",
"on",
"PBMC",
"following",
"activation",
"with",
"PHA",
"or",
"IL-2",
"."
] | [
"to",
"date",
",",
"a",
"large",
"number",
"of",
"receptors",
"for",
"il-12",
"have",
"been",
"found",
"only",
"on",
"pbmc",
"following",
"activation",
"with",
"pha",
"or",
"il-2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"To",
"gain",
"further",
"knowledge",
"of",
"the",
"IL-12R",
"complex",
"and",
"the",
"IL-12",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"in",
"cytotoxic",
"T",
"cells",
",",
"we",
"studied",
"a",
"number",
"of",
"human",
"T",
"cell",
"lines",
"that",
"had",
"been",
"transformed",
"to",
"permanent",
"growth",
"with",
"Herpesvirus",
"saimiri",
",",
"an",
"oncogenic",
"virus",
"of",
"nonhuman",
"primates",
"."
] | [
"to",
"gain",
"further",
"knowledge",
"of",
"the",
"il-12r",
"complex",
"and",
"the",
"il-12",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"in",
"cytotoxic",
"t",
"cells",
",",
"we",
"studied",
"a",
"number",
"of",
"human",
"t",
"cell",
"lines",
"that",
"had",
"been",
"transformed",
"to",
"permanent",
"growth",
"with",
"herpesvirus",
"saimiri",
",",
"an",
"oncogenic",
"virus",
"of",
"nonhuman",
"primates",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"This",
"paper",
"reports",
"the",
"expression",
"of",
"IL-12R",
"on",
"a",
"human",
"gamma",
"delta",
"T",
"cell",
"line",
"that",
"responds",
"to",
"IL-12",
"with",
"enhanced",
"cytolytic",
"activity",
"and",
"increased",
"expression",
"of",
"cytolytic",
"effector",
"molecules",
"granzyme",
"B",
"and",
"perforin",
"."
] | [
"this",
"paper",
"reports",
"the",
"expression",
"of",
"il-12r",
"on",
"a",
"human",
"gamma",
"delta",
"t",
"cell",
"line",
"that",
"responds",
"to",
"il-12",
"with",
"enhanced",
"cytolytic",
"activity",
"and",
"increased",
"expression",
"of",
"cytolytic",
"effector",
"molecules",
"granzyme",
"b",
"and",
"perforin",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Using",
"these",
"T",
"cells",
"as",
"a",
"model",
"of",
"IL-12",
"signal",
"transduction",
",",
"we",
"confirmed",
"that",
"these",
"events",
"involve",
"members",
"of",
"the",
"Janus",
"kinase",
"family",
"of",
"nonreceptor",
"tyrosine",
"kinases",
"JAK2",
",",
"TYK2",
",",
"and",
"signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"transcription",
"4",
"."
] | [
"using",
"these",
"t",
"cells",
"as",
"a",
"model",
"of",
"il-12",
"signal",
"transduction",
",",
"we",
"confirmed",
"that",
"these",
"events",
"involve",
"members",
"of",
"the",
"janus",
"kinase",
"family",
"of",
"nonreceptor",
"tyrosine",
"kinases",
"jak2",
",",
"tyk2",
",",
"and",
"signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"transcription",
"4",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Interleukin",
"1beta",
"mediates",
"the",
"modulatory",
"effects",
"of",
"monocytes",
"on",
"LNCaP",
"human",
"prostate",
"cancer",
"cells",
"."
] | [
"interleukin",
"1beta",
"mediates",
"the",
"modulatory",
"effects",
"of",
"monocytes",
"on",
"lncap",
"human",
"prostate",
"cancer",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Proliferative",
"and",
"secretory",
"responses",
"in",
"androgen-sensitive",
"prostate",
"cancer",
"LNCaP",
"cells",
"are",
"regulated",
"by",
"steroid",
"and",
"peptide",
"hormones",
"and",
"by",
"differentiation-promoting",
"substances",
"."
] | [
"proliferative",
"and",
"secretory",
"responses",
"in",
"androgen-sensitive",
"prostate",
"cancer",
"lncap",
"cells",
"are",
"regulated",
"by",
"steroid",
"and",
"peptide",
"hormones",
"and",
"by",
"differentiation-promoting",
"substances",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"present",
"study",
",",
"we",
"evaluated",
"whether",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"that",
"exhibit",
"anti-tumour",
"activity",
"in",
"haematopoietic",
"and",
"solid",
"tumours",
"influence",
"growth",
"and",
"secretion",
"in",
"the",
"LNCaP",
"cell",
"line",
"."
] | [
"in",
"the",
"present",
"study",
",",
"we",
"evaluated",
"whether",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"that",
"exhibit",
"anti-tumour",
"activity",
"in",
"haematopoietic",
"and",
"solid",
"tumours",
"influence",
"growth",
"and",
"secretion",
"in",
"the",
"lncap",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"For",
"this",
"purpose",
",",
"LNCaP",
"cells",
"were",
"incubated",
"with",
"monocyte-conditioned",
"medium",
"(",
"MCM",
")",
",",
"and",
"proliferation",
"as",
"well",
"as",
"expression",
"of",
"androgen",
"receptor",
"(",
"AR",
")",
"and",
"secretion",
"of",
"prostate-specific",
"antigen",
"(",
"PSA",
")",
"were",
"assessed",
"."
] | [
"for",
"this",
"purpose",
",",
"lncap",
"cells",
"were",
"incubated",
"with",
"monocyte-conditioned",
"medium",
"(",
"mcm",
")",
",",
"and",
"proliferation",
"as",
"well",
"as",
"expression",
"of",
"androgen",
"receptor",
"(",
"ar",
")",
"and",
"secretion",
"of",
"prostate-specific",
"antigen",
"(",
"psa",
")",
"were",
"assessed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Conditioned",
"medium",
"from",
"monocytes",
"reduced",
"proliferation",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"conditioned",
"medium",
"from",
"monocytes",
"reduced",
"proliferation",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Incubation",
"with",
"40%",
"MCM",
"caused",
"a",
"50%",
"reduction",
"in",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"incubation",
"with",
"40%",
"mcm",
"caused",
"a",
"50%",
"reduction",
"in",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"AR",
"protein",
"decreased",
"by",
"70%",
"and",
"PSA",
"levels",
"in",
"supernatants",
"from",
"LNCaP",
"cells",
"were",
"reduced",
"by",
"approximately",
"80%",
"following",
"treatment",
"with",
"MCM",
"."
] | [
"ar",
"protein",
"decreased",
"by",
"70%",
"and",
"psa",
"levels",
"in",
"supernatants",
"from",
"lncap",
"cells",
"were",
"reduced",
"by",
"approximately",
"80%",
"following",
"treatment",
"with",
"mcm",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"We",
"focused",
"on",
"the",
"contribution",
"of",
"two",
"major",
"products",
"of",
"activated",
"monocytes",
",",
"prostaglandin",
"E2",
"and",
"interleukin",
"1beta",
"(",
"IL-1beta",
")",
",",
"to",
"the",
"MCM",
"modulatory",
"action",
"."
] | [
"we",
"focused",
"on",
"the",
"contribution",
"of",
"two",
"major",
"products",
"of",
"activated",
"monocytes",
",",
"prostaglandin",
"e2",
"and",
"interleukin",
"1beta",
"(",
"il-1beta",
")",
",",
"to",
"the",
"mcm",
"modulatory",
"action",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"LNCaP",
"cells",
"treated",
"with",
"prostaglandin",
"E2",
"showed",
"neither",
"a",
"reduction",
"in",
"proliferation",
"nor",
"a",
"down-regulation",
"of",
"AR",
"and",
"PSA",
"levels",
"."
] | [
"lncap",
"cells",
"treated",
"with",
"prostaglandin",
"e2",
"showed",
"neither",
"a",
"reduction",
"in",
"proliferation",
"nor",
"a",
"down-regulation",
"of",
"ar",
"and",
"psa",
"levels",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effects",
"of",
"MCM",
"on",
"cellular",
"proliferation",
",",
"AR",
"protein",
"and",
"PSA",
"secretion",
"were",
"abolished",
"by",
"pretreatment",
"of",
"MCM",
"with",
"a",
"neutralizing",
"anti-",
"IL-1beta",
"antibody",
"."
] | [
"the",
"effects",
"of",
"mcm",
"on",
"cellular",
"proliferation",
",",
"ar",
"protein",
"and",
"psa",
"secretion",
"were",
"abolished",
"by",
"pretreatment",
"of",
"mcm",
"with",
"a",
"neutralizing",
"anti-",
"il-1beta",
"antibody",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"recombinant",
"IL-1beta",
"was",
"able",
"to",
"replace",
"MCM",
"for",
"the",
"inhibition",
"of",
"proliferation",
"and",
"down-regulation",
"of",
"AR",
"and",
"PSA",
"proteins",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"recombinant",
"il-1beta",
"was",
"able",
"to",
"replace",
"mcm",
"for",
"the",
"inhibition",
"of",
"proliferation",
"and",
"down-regulation",
"of",
"ar",
"and",
"psa",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"LNCaP",
"cells",
"were",
"shown",
"to",
"express",
"the",
"IL-1beta",
"receptor",
"type",
"1",
",",
"which",
"transduces",
"IL-1beta",
"signal",
"."
] | [
"lncap",
"cells",
"were",
"shown",
"to",
"express",
"the",
"il-1beta",
"receptor",
"type",
"1",
",",
"which",
"transduces",
"il-1beta",
"signal",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"reveal",
"that",
"monocyte-derived",
"IL-1beta",
"inhibits",
"the",
"proliferation",
"of",
"androgen-responsive",
"prostate",
"tumour",
"cells",
"and",
"reduces",
"AR",
"and",
"PSA",
"levels",
"."
] | [
"our",
"findings",
"reveal",
"that",
"monocyte-derived",
"il-1beta",
"inhibits",
"the",
"proliferation",
"of",
"androgen-responsive",
"prostate",
"tumour",
"cells",
"and",
"reduces",
"ar",
"and",
"psa",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Significance",
"of",
"quantitative",
"analysis",
"of",
"AML1",
"/ETO",
"transcripts",
"in",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cells",
"from",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"acute",
"myelogenous",
"leukemia",
"."
] | [
"significance",
"of",
"quantitative",
"analysis",
"of",
"aml1",
"/eto",
"transcripts",
"in",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cells",
"from",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"acute",
"myelogenous",
"leukemia",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Autologous",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cell",
"transplantation",
"(",
"PBSCT",
")",
"is",
"replacing",
"autologous",
"bone",
"marrow",
"transplantation",
"(",
"BMT",
")",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"leukemia",
"."
] | [
"autologous",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cell",
"transplantation",
"(",
"pbsct",
")",
"is",
"replacing",
"autologous",
"bone",
"marrow",
"transplantation",
"(",
"bmt",
")",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"leukemia",
"."
] | [
"B-other_name",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"One",
"of",
"the",
"potential",
"advantages",
"of",
"autologous",
"PBSCT",
"is",
"the",
"possibility",
"that",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cells",
"(",
"PBSC",
")",
"are",
"less",
"likely",
"to",
"be",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
"than",
"bone",
"marrow",
"grafts",
"."
] | [
"one",
"of",
"the",
"potential",
"advantages",
"of",
"autologous",
"pbsct",
"is",
"the",
"possibility",
"that",
"peripheral",
"blood",
"stem",
"cells",
"(",
"pbsc",
")",
"are",
"less",
"likely",
"to",
"be",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
"than",
"bone",
"marrow",
"grafts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"major",
"problem",
"still",
"remains",
"the",
"high",
"incidence",
"of",
"leukemic",
"relapse",
"following",
"autologous",
"PBSCT",
",",
"which",
"may",
"be",
"caused",
"by",
"the",
"reinfusion",
"of",
"PBSC",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
"."
] | [
"however",
",",
"the",
"major",
"problem",
"still",
"remains",
"the",
"high",
"incidence",
"of",
"leukemic",
"relapse",
"following",
"autologous",
"pbsct",
",",
"which",
"may",
"be",
"caused",
"by",
"the",
"reinfusion",
"of",
"pbsc",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"we",
"have",
"developed",
"a",
"quantitative",
"assay",
"using",
"competitive",
"reverse",
"transcriptase",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"that",
"estimates",
"the",
"number",
"of",
"AML1",
"/ETO",
"transcripts",
"in",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"acute",
"myelogenous",
"leukemia",
"(",
"AML",
")",
",",
"in",
"order",
"to",
"determine",
"the",
"degree",
"of",
"leukemic",
"cell",
"contamination",
"in",
"PBSC",
"harvests",
",",
"and",
"to",
"monitor",
"minimal",
"residual",
"disease",
"(",
"MRD",
")",
"quantitatively",
"in",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"AML",
"."
] | [
"recently",
",",
"we",
"have",
"developed",
"a",
"quantitative",
"assay",
"using",
"competitive",
"reverse",
"transcriptase",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"that",
"estimates",
"the",
"number",
"of",
"aml1",
"/eto",
"transcripts",
"in",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"acute",
"myelogenous",
"leukemia",
"(",
"aml",
")",
",",
"in",
"order",
"to",
"determine",
"the",
"degree",
"of",
"leukemic",
"cell",
"contamination",
"in",
"pbsc",
"harvests",
",",
"and",
"to",
"monitor",
"minimal",
"residual",
"disease",
"(",
"mrd",
")",
"quantitatively",
"in",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"aml",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"indicate",
"that",
"although",
"PBSC",
"harvests",
"collected",
"after",
"consolidation",
"chemotherapy",
"are",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
",",
"the",
"degree",
"of",
"leukemic",
"cell",
"contamination",
"decreases",
"with",
"repeated",
"cycles",
"of",
"chemotherapy",
"."
] | [
"our",
"data",
"indicate",
"that",
"although",
"pbsc",
"harvests",
"collected",
"after",
"consolidation",
"chemotherapy",
"are",
"contaminated",
"by",
"leukemic",
"cells",
",",
"the",
"degree",
"of",
"leukemic",
"cell",
"contamination",
"decreases",
"with",
"repeated",
"cycles",
"of",
"chemotherapy",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"the",
"MRD",
"in",
"PBSC",
"harvests",
"is",
"less",
"than",
"in",
"the",
"corresponding",
"bone",
"marrow",
"obtained",
"on",
"the",
"day",
"of",
"the",
"PBSC",
"collection",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"the",
"mrd",
"in",
"pbsc",
"harvests",
"is",
"less",
"than",
"in",
"the",
"corresponding",
"bone",
"marrow",
"obtained",
"on",
"the",
"day",
"of",
"the",
"pbsc",
"collection",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"appears",
"to",
"be",
"no",
"relationship",
"between",
"the",
"number",
"of",
"AML1",
"/ETO",
"transcripts",
"found",
"in",
"the",
"infused",
"PBSC",
"harvests",
"and",
"the",
"incidence",
"of",
"leukemic",
"relapse",
"following",
"autologous",
"PBSCT",
"in",
"our",
"study",
"."
] | [
"there",
"appears",
"to",
"be",
"no",
"relationship",
"between",
"the",
"number",
"of",
"aml1",
"/eto",
"transcripts",
"found",
"in",
"the",
"infused",
"pbsc",
"harvests",
"and",
"the",
"incidence",
"of",
"leukemic",
"relapse",
"following",
"autologous",
"pbsct",
"in",
"our",
"study",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"a",
"substantial",
"decrease",
"of",
"AML1",
"/ETO",
"transcripts",
"was",
"seen",
"following",
"autologous",
"PBSCT",
"."
] | [
"however",
",",
"a",
"substantial",
"decrease",
"of",
"aml1",
"/eto",
"transcripts",
"was",
"seen",
"following",
"autologous",
"pbsct",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"quantitative",
"analysis",
"of",
"AML1",
"/ETO",
"transcripts",
"may",
"be",
"clinically",
"useful",
"in",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"AML",
"."
] | [
"thus",
",",
"the",
"quantitative",
"analysis",
"of",
"aml1",
"/eto",
"transcripts",
"may",
"be",
"clinically",
"useful",
"in",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"8",
";",
"21",
")",
"aml",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Transcription",
"factor",
"binding",
"sites",
"downstream",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"transcription",
"start",
"site",
"are",
"important",
"for",
"virus",
"infectivity",
"."
] | [
"transcription",
"factor",
"binding",
"sites",
"downstream",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"transcription",
"start",
"site",
"are",
"important",
"for",
"virus",
"infectivity",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"When",
"transcriptionally",
"active",
",",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"promoter",
"contains",
"a",
"nucleosome-free",
"region",
"encompassing",
"both",
"the",
"promoter",
"/enhancer",
"region",
"and",
"a",
"large",
"region",
"(",
"255",
"nucleotides",
"[",
"nt",
"]",
")",
"downstream",
"of",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"."
] | [
"when",
"transcriptionally",
"active",
",",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"hiv",
")",
"promoter",
"contains",
"a",
"nucleosome-free",
"region",
"encompassing",
"both",
"the",
"promoter",
"/enhancer",
"region",
"and",
"a",
"large",
"region",
"(",
"255",
"nucleotides",
"[",
"nt",
"]",
")",
"downstream",
"of",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"identified",
"new",
"binding",
"sites",
"for",
"transcription",
"factors",
"downstream",
"of",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"(",
"nt",
"465",
"to",
"720",
")",
":",
"three",
"AP-1",
"sites",
"(",
"I",
",",
"II",
",",
"and",
"III",
")",
",",
"an",
"AP3-like",
"motif",
"(",
"AP3-L",
")",
",",
"a",
"downstream",
"binding",
"factor",
"(",
"DBF",
")",
"site",
",",
"and",
"juxtaposed",
"Sp1",
"sites",
"."
] | [
"we",
"have",
"previously",
"identified",
"new",
"binding",
"sites",
"for",
"transcription",
"factors",
"downstream",
"of",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"(",
"nt",
"465",
"to",
"720",
")",
":",
"three",
"ap-1",
"sites",
"(",
"i",
",",
"ii",
",",
"and",
"iii",
")",
",",
"an",
"ap3-like",
"motif",
"(",
"ap3-l",
")",
",",
"a",
"downstream",
"binding",
"factor",
"(",
"dbf",
")",
"site",
",",
"and",
"juxtaposed",
"sp1",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"show",
"that",
"the",
"DBF",
"site",
"is",
"an",
"interferon-responsive",
"factor",
"(",
"IRF",
")",
"binding",
"site",
"and",
"that",
"the",
"AP3-L",
"motif",
"binds",
"the",
"T-cell-specific",
"factor",
"NF-AT",
"."
] | [
"here",
",",
"we",
"show",
"that",
"the",
"dbf",
"site",
"is",
"an",
"interferon-responsive",
"factor",
"(",
"irf",
")",
"binding",
"site",
"and",
"that",
"the",
"ap3-l",
"motif",
"binds",
"the",
"t-cell-specific",
"factor",
"nf-at",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Mutations",
"that",
"abolish",
"the",
"binding",
"of",
"each",
"factor",
"to",
"its",
"cognate",
"site",
"are",
"introduced",
"in",
"an",
"infectious",
"HIV-1",
"molecular",
"clone",
"to",
"study",
"their",
"effect",
"on",
"HIV-1",
"transcription",
"and",
"replication",
"."
] | [
"mutations",
"that",
"abolish",
"the",
"binding",
"of",
"each",
"factor",
"to",
"its",
"cognate",
"site",
"are",
"introduced",
"in",
"an",
"infectious",
"hiv-1",
"molecular",
"clone",
"to",
"study",
"their",
"effect",
"on",
"hiv-1",
"transcription",
"and",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Individual",
"mutation",
"of",
"the",
"DBF",
"or",
"AP3-L",
"site",
"as",
"well",
"as",
"the",
"double",
"mutation",
"AP-1",
"(",
"III",
")",
"/",
"AP3-L",
"did",
"not",
"affect",
"HIV-1",
"replication",
"compared",
"to",
"that",
"of",
"the",
"wild-type",
"virus",
"."
] | [
"individual",
"mutation",
"of",
"the",
"dbf",
"or",
"ap3-l",
"site",
"as",
"well",
"as",
"the",
"double",
"mutation",
"ap-1",
"(",
"iii",
")",
"/",
"ap3-l",
"did",
"not",
"affect",
"hiv-1",
"replication",
"compared",
"to",
"that",
"of",
"the",
"wild-type",
"virus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"proviruses",
"carrying",
"mutations",
"in",
"the",
"Sp1",
"sites",
"were",
"totally",
"defective",
"in",
"terms",
"of",
"replication",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"proviruses",
"carrying",
"mutations",
"in",
"the",
"sp1",
"sites",
"were",
"totally",
"defective",
"in",
"terms",
"of",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Virus",
"production",
"occurred",
"with",
"slightly",
"delayed",
"kinetics",
"for",
"viruses",
"containing",
"combined",
"mutations",
"in",
"the",
"AP-1",
"(",
"III",
")",
",",
"AP3-L",
",",
"and",
"DBF",
"sites",
"and",
"in",
"the",
"AP3-L",
"and",
"DBF-sites",
",",
"whereas",
"viruses",
"mutated",
"in",
"the",
"AP-1",
"(",
"I",
",",
"II",
",",
"III",
")",
"and",
"AP3-L",
"sites",
"and",
"in",
"the",
"AP-1",
"(",
"I",
",",
"II",
",",
"III",
")",
",",
"AP3-L",
",",
"and",
"DBF",
"sites",
"exhibited",
"a",
"severely",
"defective",
"replicative",
"phenotype",
"."
] | [
"virus",
"production",
"occurred",
"with",
"slightly",
"delayed",
"kinetics",
"for",
"viruses",
"containing",
"combined",
"mutations",
"in",
"the",
"ap-1",
"(",
"iii",
")",
",",
"ap3-l",
",",
"and",
"dbf",
"sites",
"and",
"in",
"the",
"ap3-l",
"and",
"dbf-sites",
",",
"whereas",
"viruses",
"mutated",
"in",
"the",
"ap-1",
"(",
"i",
",",
"ii",
",",
"iii",
")",
"and",
"ap3-l",
"sites",
"and",
"in",
"the",
"ap-1",
"(",
"i",
",",
"ii",
",",
"iii",
")",
",",
"ap3-l",
",",
"and",
"dbf",
"sites",
"exhibited",
"a",
"severely",
"defective",
"replicative",
"phenotype",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"RNA-packaging",
"defect",
"could",
"be",
"measured",
"for",
"any",
"of",
"the",
"mutant",
"viruses",
"as",
"determined",
"by",
"quantification",
"of",
"their",
"HIV",
"genomic",
"RNA",
"."
] | [
"no",
"rna-packaging",
"defect",
"could",
"be",
"measured",
"for",
"any",
"of",
"the",
"mutant",
"viruses",
"as",
"determined",
"by",
"quantification",
"of",
"their",
"hiv",
"genomic",
"rna",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Measurement",
"of",
"the",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"HIV-1",
"promoter",
"after",
"transient",
"transfection",
"of",
"the",
"HIV-1",
"provirus",
"DNA",
"or",
"of",
"long",
"terminal",
"repeat-luciferase",
"constructs",
"showed",
"a",
"positive",
"correlation",
"between",
"the",
"transcriptional",
"and",
"the",
"replication",
"defects",
"for",
"most",
"mutants",
"."
] | [
"measurement",
"of",
"the",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"hiv-1",
"promoter",
"after",
"transient",
"transfection",
"of",
"the",
"hiv-1",
"provirus",
"dna",
"or",
"of",
"long",
"terminal",
"repeat-luciferase",
"constructs",
"showed",
"a",
"positive",
"correlation",
"between",
"the",
"transcriptional",
"and",
"the",
"replication",
"defects",
"for",
"most",
"mutants",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tcf-1",
"-mediated",
"transcription",
"in",
"T",
"lymphocytes",
":",
"differential",
"role",
"for",
"glycogen",
"synthase",
"kinase-3",
"in",
"fibroblasts",
"and",
"T",
"cells",
"."
] | [
"tcf-1",
"-mediated",
"transcription",
"in",
"t",
"lymphocytes",
":",
"differential",
"role",
"for",
"glycogen",
"synthase",
"kinase-3",
"in",
"fibroblasts",
"and",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Beta-catenin",
"is",
"the",
"vertebrate",
"homolog",
"of",
"the",
"Drosophila",
"segment",
"polarity",
"gene",
"Armadillo",
"and",
"plays",
"roles",
"in",
"both",
"cell-cell",
"adhesion",
"and",
"transduction",
"of",
"the",
"Wnt",
"signaling",
"cascade",
"."
] | [
"beta-catenin",
"is",
"the",
"vertebrate",
"homolog",
"of",
"the",
"drosophila",
"segment",
"polarity",
"gene",
"armadillo",
"and",
"plays",
"roles",
"in",
"both",
"cell-cell",
"adhesion",
"and",
"transduction",
"of",
"the",
"wnt",
"signaling",
"cascade",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"members",
"of",
"the",
"Lef/Tcf",
"transcription",
"factor",
"family",
"have",
"been",
"identified",
"as",
"protein",
"partners",
"of",
"beta-catenin",
",",
"explaining",
"how",
"beta-catenin",
"alters",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"recently",
",",
"members",
"of",
"the",
"lef/tcf",
"transcription",
"factor",
"family",
"have",
"been",
"identified",
"as",
"protein",
"partners",
"of",
"beta-catenin",
",",
"explaining",
"how",
"beta-catenin",
"alters",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"report",
"that",
"in",
"T",
"cells",
",",
"Tcf-1",
"also",
"becomes",
"transcriptionally",
"active",
"through",
"interaction",
"with",
"beta-catenin",
",",
"suggesting",
"that",
"the",
"Wnt",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"is",
"operational",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"as",
"well",
"."
] | [
"here",
"we",
"report",
"that",
"in",
"t",
"cells",
",",
"tcf-1",
"also",
"becomes",
"transcriptionally",
"active",
"through",
"interaction",
"with",
"beta-catenin",
",",
"suggesting",
"that",
"the",
"wnt",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"is",
"operational",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"as",
"well",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"although",
"Wnt",
"signals",
"are",
"known",
"to",
"inhibit",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"negative",
"regulatory",
"protein",
"kinase",
"glycogen",
"synthase",
"kinase-3beta",
"(",
"GSK-3beta",
")",
",",
"resulting",
"in",
"increased",
"levels",
"of",
"beta-catenin",
",",
"we",
"find",
"no",
"evidence",
"for",
"involvement",
"of",
"GSK-3beta",
"in",
"Tcf-mediated",
"transcription",
"in",
"T",
"cells",
"."
] | [
"however",
",",
"although",
"wnt",
"signals",
"are",
"known",
"to",
"inhibit",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"negative",
"regulatory",
"protein",
"kinase",
"glycogen",
"synthase",
"kinase-3beta",
"(",
"gsk-3beta",
")",
",",
"resulting",
"in",
"increased",
"levels",
"of",
"beta-catenin",
",",
"we",
"find",
"no",
"evidence",
"for",
"involvement",
"of",
"gsk-3beta",
"in",
"tcf-mediated",
"transcription",
"in",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"That",
"is",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"GSK-3beta",
"does",
"not",
"specifically",
"activate",
"Tcf",
"transcription",
"and",
"stimuli",
"(",
"lithium",
"or",
"phytohemagglutinin",
")",
"that",
"inhibit",
"GSK-3beta",
"activity",
"also",
"do",
"not",
"activate",
"Tcf",
"reporter",
"genes",
"."
] | [
"that",
"is",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"gsk-3beta",
"does",
"not",
"specifically",
"activate",
"tcf",
"transcription",
"and",
"stimuli",
"(",
"lithium",
"or",
"phytohemagglutinin",
")",
"that",
"inhibit",
"gsk-3beta",
"activity",
"also",
"do",
"not",
"activate",
"tcf",
"reporter",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"inhibition",
"of",
"GSK-3beta",
"is",
"insufficient",
"to",
"activate",
"Tcf-dependent",
"transcription",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"thus",
",",
"inhibition",
"of",
"gsk-3beta",
"is",
"insufficient",
"to",
"activate",
"tcf-dependent",
"transcription",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"in",
"C57MG",
"fibroblast",
"cells",
",",
"lithium",
"inactivates",
"GSK-3beta",
"and",
"induces",
"Tcf-controlled",
"transcription",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"in",
"c57mg",
"fibroblast",
"cells",
",",
"lithium",
"inactivates",
"gsk-3beta",
"and",
"induces",
"tcf-controlled",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-atom",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"This",
"is",
"the",
"first",
"demonstration",
"that",
"lithium",
"can",
"alter",
"gene",
"expression",
"of",
"Tcf-responsive",
"genes",
",",
"and",
"points",
"to",
"a",
"difference",
"in",
"regulation",
"of",
"Wnt",
"signaling",
"between",
"fibroblasts",
"and",
"lymphocytes",
"."
] | [
"this",
"is",
"the",
"first",
"demonstration",
"that",
"lithium",
"can",
"alter",
"gene",
"expression",
"of",
"tcf-responsive",
"genes",
",",
"and",
"points",
"to",
"a",
"difference",
"in",
"regulation",
"of",
"wnt",
"signaling",
"between",
"fibroblasts",
"and",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Control",
"of",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"proteolysis",
"by",
"site-specific",
",",
"signal-induced",
"phosphorylation",
"."
] | [
"control",
"of",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"proteolysis",
"by",
"site-specific",
",",
"signal-induced",
"phosphorylation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"inhibits",
"transcription",
"factor",
"NF-kappa",
"B",
"by",
"retaining",
"it",
"in",
"the",
"cytoplasm",
"."
] | [
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"inhibits",
"transcription",
"factor",
"nf-kappa",
"b",
"by",
"retaining",
"it",
"in",
"the",
"cytoplasm",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O"
] |
[
"Various",
"stimuli",
",",
"typically",
"those",
"associated",
"with",
"stress",
"or",
"pathogens",
",",
"rapidly",
"inactivate",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"."
] | [
"various",
"stimuli",
",",
"typically",
"those",
"associated",
"with",
"stress",
"or",
"pathogens",
",",
"rapidly",
"inactivate",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"This",
"liberates",
"NF-kappa",
"B",
"to",
"translocate",
"to",
"the",
"nucleus",
"and",
"initiate",
"transcription",
"of",
"genes",
"important",
"for",
"the",
"defense",
"of",
"the",
"organism",
"."
] | [
"this",
"liberates",
"nf-kappa",
"b",
"to",
"translocate",
"to",
"the",
"nucleus",
"and",
"initiate",
"transcription",
"of",
"genes",
"important",
"for",
"the",
"defense",
"of",
"the",
"organism",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activation",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"correlates",
"with",
"phosphorylation",
"of",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"and",
"requires",
"the",
"proteolysis",
"of",
"this",
"inhibitor",
"."
] | [
"activation",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"correlates",
"with",
"phosphorylation",
"of",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"and",
"requires",
"the",
"proteolysis",
"of",
"this",
"inhibitor",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"either",
"serine-32",
"or",
"serine-36",
"of",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"was",
"mutated",
",",
"the",
"protein",
"did",
"not",
"undergo",
"signal-induced",
"phosphorylation",
"or",
"degradation",
",",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"could",
"not",
"be",
"activated",
"."
] | [
"when",
"either",
"serine-32",
"or",
"serine-36",
"of",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"was",
"mutated",
",",
"the",
"protein",
"did",
"not",
"undergo",
"signal-induced",
"phosphorylation",
"or",
"degradation",
",",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"could",
"not",
"be",
"activated",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"phosphorylation",
"at",
"one",
"or",
"both",
"of",
"these",
"residues",
"is",
"critical",
"for",
"activation",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"phosphorylation",
"at",
"one",
"or",
"both",
"of",
"these",
"residues",
"is",
"critical",
"for",
"activation",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Detection",
"of",
"minimal",
"residual",
"disease",
"in",
"a",
"patient",
"with",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"by",
"RT-PCR",
":",
"necessity",
"of",
"chemotherapy",
"following",
"ATRA",
"therapy",
"."
] | [
"detection",
"of",
"minimal",
"residual",
"disease",
"in",
"a",
"patient",
"with",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"by",
"rt-pcr",
":",
"necessity",
"of",
"chemotherapy",
"following",
"atra",
"therapy",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"PML/RAR",
"alpha",
"fusion",
"gene",
"resulting",
"from",
"the",
"t",
"(",
"15",
";",
"17",
")",
"translocation",
"is",
"a",
"specific",
"marker",
"for",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"(",
"APL",
")",
"."
] | [
"the",
"pml/rar",
"alpha",
"fusion",
"gene",
"resulting",
"from",
"the",
"t",
"(",
"15",
";",
"17",
")",
"translocation",
"is",
"a",
"specific",
"marker",
"for",
"acute",
"promyelocytic",
"leukemia",
"(",
"apl",
")",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"examined",
"bone",
"marrow",
"cells",
"by",
"reverse",
"transcriptase-polymerase",
"chain",
"reaction",
"(",
"RT-PCR",
")",
"to",
"detect",
"residual",
"PML/RAR",
"alpha",
"mRNA",
"-containing",
"cells",
"following",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"ATRA",
")",
"and",
"cytotoxic",
"chemotherapy",
"in",
"a",
"patient",
"with",
"APL",
"."
] | [
"we",
"examined",
"bone",
"marrow",
"cells",
"by",
"reverse",
"transcriptase-polymerase",
"chain",
"reaction",
"(",
"rt-pcr",
")",
"to",
"detect",
"residual",
"pml/rar",
"alpha",
"mrna",
"-containing",
"cells",
"following",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"atra",
")",
"and",
"cytotoxic",
"chemotherapy",
"in",
"a",
"patient",
"with",
"apl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"This",
"RT-PCR",
"assay",
"can",
"detect",
"one",
"leukemic",
"cell",
"in",
"10",
"(",
"2",
")",
"normal",
"cells",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"this",
"rt-pcr",
"assay",
"can",
"detect",
"one",
"leukemic",
"cell",
"in",
"10",
"(",
"2",
")",
"normal",
"cells",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"PML/RAR",
"alpha",
"mRNA",
"was",
"still",
"detectable",
"despite",
"clinical",
"remission",
"following",
"ATRA",
"treatment",
",",
"but",
"undetectable",
"following",
"consolidation",
"with",
"chemotherapy",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"pml/rar",
"alpha",
"mrna",
"was",
"still",
"detectable",
"despite",
"clinical",
"remission",
"following",
"atra",
"treatment",
",",
"but",
"undetectable",
"following",
"consolidation",
"with",
"chemotherapy",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"show",
"that",
"this",
"technique",
"is",
"useful",
"for",
"the",
"identification",
"of",
"minimal",
"residual",
"disease",
"in",
"patients",
"with",
"APL",
"and",
"that",
"cytotoxic",
"chemotherapy",
"following",
"ATRA",
"therapy",
"is",
"required",
"for",
"the",
"elimination",
"of",
"APL",
"cells",
"."
] | [
"these",
"data",
"show",
"that",
"this",
"technique",
"is",
"useful",
"for",
"the",
"identification",
"of",
"minimal",
"residual",
"disease",
"in",
"patients",
"with",
"apl",
"and",
"that",
"cytotoxic",
"chemotherapy",
"following",
"atra",
"therapy",
"is",
"required",
"for",
"the",
"elimination",
"of",
"apl",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"activity",
"in",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"induces",
"caspase-dependent",
"apoptosis",
"without",
"detectable",
"activation",
"of",
"caspase",
"-1",
"and",
"-3",
"."
] | [
"inhibition",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"activity",
"in",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"induces",
"caspase-dependent",
"apoptosis",
"without",
"detectable",
"activation",
"of",
"caspase",
"-1",
"and",
"-3",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"NF-kappa",
"B",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"transcriptional",
"control",
"of",
"various",
"genes",
"that",
"act",
"as",
"extrinsic",
"and",
"intrinsic",
"survival",
"factors",
"for",
"T",
"cells",
"."
] | [
"nf-kappa",
"b",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"transcriptional",
"control",
"of",
"various",
"genes",
"that",
"act",
"as",
"extrinsic",
"and",
"intrinsic",
"survival",
"factors",
"for",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"show",
"that",
"suppression",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"activity",
"with",
"cell-permeable",
"SN50",
"peptide",
",",
"which",
"masks",
"the",
"nuclear",
"localization",
"sequence",
"of",
"NF-kappa",
"B1",
"dimers",
"and",
"prevents",
"their",
"nuclear",
"localization",
",",
"induces",
"apoptosis",
"in",
"resting",
"normal",
"human",
"PBL",
"."
] | [
"our",
"findings",
"show",
"that",
"suppression",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"activity",
"with",
"cell-permeable",
"sn50",
"peptide",
",",
"which",
"masks",
"the",
"nuclear",
"localization",
"sequence",
"of",
"nf-kappa",
"b1",
"dimers",
"and",
"prevents",
"their",
"nuclear",
"localization",
",",
"induces",
"apoptosis",
"in",
"resting",
"normal",
"human",
"pbl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-peptide",
"B-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"resulted",
"in",
"the",
"externalization",
"of",
"phosphatidylserine",
",",
"induction",
"of",
"DNA",
"breaks",
",",
"and",
"morphological",
"changes",
"consistent",
"with",
"apoptosis",
"."
] | [
"inhibition",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"resulted",
"in",
"the",
"externalization",
"of",
"phosphatidylserine",
",",
"induction",
"of",
"dna",
"breaks",
",",
"and",
"morphological",
"changes",
"consistent",
"with",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"DNA",
"fragmentation",
"was",
"efficiently",
"blocked",
"by",
"the",
"caspase",
"inhibitor",
"Z-VAD-fmk",
"and",
"partially",
"blocked",
"by",
"Ac-DEVD-fmk",
",",
"suggesting",
"that",
"SN50",
"-mediated",
"apoptosis",
"is",
"caspase",
"-dependent",
"."
] | [
"dna",
"fragmentation",
"was",
"efficiently",
"blocked",
"by",
"the",
"caspase",
"inhibitor",
"z-vad-fmk",
"and",
"partially",
"blocked",
"by",
"ac-devd-fmk",
",",
"suggesting",
"that",
"sn50",
"-mediated",
"apoptosis",
"is",
"caspase",
"-dependent",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"apoptosis",
"induced",
"by",
"NF-kappa",
"B",
"suppression",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"that",
"induced",
"by",
"TPEN",
"(",
"N",
",",
"N",
",",
"N'",
",",
"N'-tetrakis",
"[",
"2-pyridylmethyl",
"]",
"ethylenediamine",
")",
"or",
"soluble",
"Fas",
"ligand",
"(",
"CD95",
")",
",",
"was",
"observed",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"active",
"death",
"effector",
"proteases",
"caspase-1",
"-like",
"(",
"IL-1",
"converting",
"enzyme",
")",
",",
"caspase-3",
"-like",
"(",
"CPP32/Yama/apopain",
")",
",",
"and",
"caspase-6",
"-like",
"and",
"without",
"cleavage",
"of",
"caspase-3",
"substrates",
"poly",
"(",
"ADP",
"-ribose",
")",
"polymerase",
"and",
"DNA",
"fragmentation",
"factor-45",
"."
] | [
"interestingly",
",",
"apoptosis",
"induced",
"by",
"nf-kappa",
"b",
"suppression",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"that",
"induced",
"by",
"tpen",
"(",
"n",
",",
"n",
",",
"n'",
",",
"n'-tetrakis",
"[",
"2-pyridylmethyl",
"]",
"ethylenediamine",
")",
"or",
"soluble",
"fas",
"ligand",
"(",
"cd95",
")",
",",
"was",
"observed",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"active",
"death",
"effector",
"proteases",
"caspase-1",
"-like",
"(",
"il-1",
"converting",
"enzyme",
")",
",",
"caspase-3",
"-like",
"(",
"cpp32/yama/apopain",
")",
",",
"and",
"caspase-6",
"-like",
"and",
"without",
"cleavage",
"of",
"caspase-3",
"substrates",
"poly",
"(",
"adp",
"-ribose",
")",
"polymerase",
"and",
"dna",
"fragmentation",
"factor-45",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-nucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"suggest",
"either",
"low",
"level",
"of",
"activation",
"is",
"required",
"or",
"that",
"different",
"caspases",
"are",
"involved",
"."
] | [
"these",
"findings",
"suggest",
"either",
"low",
"level",
"of",
"activation",
"is",
"required",
"or",
"that",
"different",
"caspases",
"are",
"involved",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Preactivation",
"of",
"T",
"cells",
"resulting",
"in",
"NF-kappa",
"B",
"nuclear",
"translocation",
"protected",
"cells",
"from",
"SN50",
"-induced",
"apoptosis",
"."
] | [
"preactivation",
"of",
"t",
"cells",
"resulting",
"in",
"nf-kappa",
"b",
"nuclear",
"translocation",
"protected",
"cells",
"from",
"sn50",
"-induced",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"demonstrate",
"an",
"essential",
"role",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"in",
"survival",
"of",
"naive",
"PBL",
"."
] | [
"our",
"findings",
"demonstrate",
"an",
"essential",
"role",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"in",
"survival",
"of",
"naive",
"pbl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
",",
"enhanced",
"granulopoiesis",
",",
"and",
"neonatal",
"lethality",
"in",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"-deficient",
"mice",
"."
] | [
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
",",
"enhanced",
"granulopoiesis",
",",
"and",
"neonatal",
"lethality",
"in",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"-deficient",
"mice",
"."
] | [
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Transcription",
"factors",
"belonging",
"to",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"family",
"are",
"controlled",
"by",
"inhibitory",
"I",
"kappa",
"B",
"proteins",
",",
"mainly",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"and",
"I",
"kappa",
"B",
"beta",
"."
] | [
"transcription",
"factors",
"belonging",
"to",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"family",
"are",
"controlled",
"by",
"inhibitory",
"i",
"kappa",
"b",
"proteins",
",",
"mainly",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"and",
"i",
"kappa",
"b",
"beta",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Apparently",
"normal",
"at",
"birth",
",",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"-/-",
"mice",
"exhibit",
"severe",
"runting",
",",
"skin",
"defects",
",",
"and",
"extensive",
"granulopoiesis",
"postnatally",
",",
"typically",
"dying",
"by",
"8",
"days",
"."
] | [
"apparently",
"normal",
"at",
"birth",
",",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"-/-",
"mice",
"exhibit",
"severe",
"runting",
",",
"skin",
"defects",
",",
"and",
"extensive",
"granulopoiesis",
"postnatally",
",",
"typically",
"dying",
"by",
"8",
"days",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hematopoietic",
"tissues",
"from",
"these",
"mice",
"display",
"elevated",
"levels",
"of",
"both",
"nuclear",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"mRNAs",
"of",
"some",
",",
"but",
"not",
"all",
",",
"genes",
"thought",
"to",
"be",
"regulated",
"by",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"hematopoietic",
"tissues",
"from",
"these",
"mice",
"display",
"elevated",
"levels",
"of",
"both",
"nuclear",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"mrnas",
"of",
"some",
",",
"but",
"not",
"all",
",",
"genes",
"thought",
"to",
"be",
"regulated",
"by",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"NF-kappa",
"B",
"elevation",
"results",
"in",
"these",
"phenotypic",
"abnormalities",
"because",
"mice",
"lacking",
"both",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"and",
"the",
"p50",
"subunit",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"show",
"a",
"dramatically",
"delayed",
"onset",
"of",
"abnormalities",
"."
] | [
"nf-kappa",
"b",
"elevation",
"results",
"in",
"these",
"phenotypic",
"abnormalities",
"because",
"mice",
"lacking",
"both",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"and",
"the",
"p50",
"subunit",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"show",
"a",
"dramatically",
"delayed",
"onset",
"of",
"abnormalities",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"hematopoietic",
"cells",
",",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"-/-",
"embryonic",
"fibroblasts",
"show",
"minimal",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
",",
"as",
"well",
"as",
"normal",
"signal-dependent",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"that",
"is",
"concomitant",
"with",
"I",
"kappa",
"B",
"beta",
"degradation",
"."
] | [
"in",
"contrast",
"to",
"hematopoietic",
"cells",
",",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"-/-",
"embryonic",
"fibroblasts",
"show",
"minimal",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
",",
"as",
"well",
"as",
"normal",
"signal-dependent",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"that",
"is",
"concomitant",
"with",
"i",
"kappa",
"b",
"beta",
"degradation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |