enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "Our", "results", "indicate", "that", "I", "kappa", "b", "beta", ",", "but", "not", "I", "kappa", "B", "alpha", ",", "is", "required", "for", "the", "signal-dependent", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "our", "results", "indicate", "that", "i", "kappa", "b", "beta", ",", "but", "not", "i", "kappa", "b", "alpha", ",", "is", "required", "for", "the", "signal-dependent", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "However", ",", "I", "kappa", "B", "alpha", "is", "required", "for", "the", "postinduction", "repression", "of", "NF-kappa", "B", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "however", ",", "i", "kappa", "b", "alpha", "is", "required", "for", "the", "postinduction", "repression", "of", "nf-kappa", "b", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "These", "results", "define", "distinct", "roles", "for", "the", "two", "forms", "of", "I", "kappa", "B", "and", "demonstrate", "the", "necessity", "for", "stringent", "control", "of", "NF-kappa", "B", "." ]

[ "these", "results", "define", "distinct", "roles", "for", "the", "two", "forms", "of", "i", "kappa", "b", "and", "demonstrate", "the", "necessity", "for", "stringent", "control", "of", "nf-kappa", "b", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Preferential", "presentation", "of", "herpes", "simplex", "virus", "T-cell", "antigen", "by", "HLA", "DQA1*0501/DQB1*0201", "in", "comparison", "to", "HLA", "DQA1*0201/DQB1*0201", "." ]

[ "preferential", "presentation", "of", "herpes", "simplex", "virus", "t-cell", "antigen", "by", "hla", "dqa1*0501/dqb1*0201", "in", "comparison", "to", "hla", "dqa1*0201/dqb1*0201", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "HLA", "DQA1", "locus", "is", "polymorphic", "." ]

[ "the", "hla", "dqa1", "locus", "is", "polymorphic", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O" ]

[ "Haplotypes", "containing", "HLA", "DQA1*0501", ",", "but", "not", "HLA", "DQA1*0201", ",", "together", "with", "HLA", "DQB1*0201", "are", "associated", "with", "Grave's", "disease", "and", "celiac", "sprue", "." ]

[ "haplotypes", "containing", "hla", "dqa1*0501", ",", "but", "not", "hla", "dqa1*0201", ",", "together", "with", "hla", "dqb1*0201", "are", "associated", "with", "grave's", "disease", "and", "celiac", "sprue", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "we", "demonstrate", "a", "functional", "correlate", "of", "DQA1", "polymorphism", "." ]

[ "in", "this", "report", ",", "we", "demonstrate", "a", "functional", "correlate", "of", "dqa1", "polymorphism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "T", "cells", "infiltrating", "a", "herpes", "simplex", "virus", "(", "HSV", ")", "lesion", "from", "a", "HLA", "DQ", "2", ",", "7", "individual", "yielded", "a", "virus-specific", "CD4+", "clone", "restricted", "by", "DQ2", "." ]

[ "t", "cells", "infiltrating", "a", "herpes", "simplex", "virus", "(", "hsv", ")", "lesion", "from", "a", "hla", "dq", "2", ",", "7", "individual", "yielded", "a", "virus-specific", "cd4+", "clone", "restricted", "by", "dq2", "." ]

[ "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Presentation", "of", "viral", "peptide", "and", "protein", "segregated", "with", "DQA1", "allele", ",", "because", "cell", "lines", "bearing", "DQA1*0501/DQB1*0201", "heterodimers", "presented", "antigen", "in", "proliferation", "and", "cytotoxicity", "assays", "much", "more", "efficiently", "than", "cell", "lines", "bearing", "DQA1*0201/DQB1*0201", "." ]

[ "presentation", "of", "viral", "peptide", "and", "protein", "segregated", "with", "dqa1", "allele", ",", "because", "cell", "lines", "bearing", "dqa1*0501/dqb1*0201", "heterodimers", "presented", "antigen", "in", "proliferation", "and", "cytotoxicity", "assays", "much", "more", "efficiently", "than", "cell", "lines", "bearing", "dqa1*0201/dqb1*0201", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_complex", "O" ]

[ "Binding", "of", "viral", "peptide", "to", "cell", "lines", "bearing", "DQA1*0201", ",", "in", "comparison", "to", "DQA1*0501", ",", "was", "only", "moderately", "reduced", "and", "may", "not", "explain", "this", "effect", "." ]

[ "binding", "of", "viral", "peptide", "to", "cell", "lines", "bearing", "dqa1*0201", ",", "in", "comparison", "to", "dqa1*0501", ",", "was", "only", "moderately", "reduced", "and", "may", "not", "explain", "this", "effect", "." ]

[ "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Truncation", "and", "substitution", "analyses", "of", "peptide", "binding", "and", "T-cell", "activation", "were", "performed", "to", "determine", "which", "viral", "peptide", "residues", "contacting", "TCR", "might", "therefore", "be", "presented", "in", "an", "altered", "conformation", "by", "DQA1*0201/DQB1*0201", "." ]

[ "truncation", "and", "substitution", "analyses", "of", "peptide", "binding", "and", "t-cell", "activation", "were", "performed", "to", "determine", "which", "viral", "peptide", "residues", "contacting", "tcr", "might", "therefore", "be", "presented", "in", "an", "altered", "conformation", "by", "dqa1*0201/dqb1*0201", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O" ]

[ "Residues", "432", ",", "435", ",", "437", ",", "438", ",", "and", "440", "(", "position", "P1", ",", "P4", ",", "P6", ",", "P7", ",", "and", "P9", ")", "contributed", "to", "DQ2", "binding", ",", "whereas", "residues", "431", ",", "433", ",", "434", ",", "and", "436", "(", "positions", "P", "1", ",", "P2", ",", "P3", ",", "and", "P5", ")", "contributed", "to", "TCR", "contact", "." ]

[ "residues", "432", ",", "435", ",", "437", ",", "438", ",", "and", "440", "(", "position", "p1", ",", "p4", ",", "p6", ",", "p7", ",", "and", "p9", ")", "contributed", "to", "dq2", "binding", ",", "whereas", "residues", "431", ",", "433", ",", "434", ",", "and", "436", "(", "positions", "p", "1", ",", "p2", ",", "p3", ",", "and", "p5", ")", "contributed", "to", "tcr", "contact", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Differential", "presentation", "of", "peptide", "by", "HLA", "DQ2", "heterodimers", "varying", "at", "the", "DQA1", "locus", "may", "have", "relevance", "to", "host", "defense", "and", "the", "pathogenesis", "of", "HLA", "DQ2", "-associated", "autoimmune", "diseases", "." ]

[ "differential", "presentation", "of", "peptide", "by", "hla", "dq2", "heterodimers", "varying", "at", "the", "dqa1", "locus", "may", "have", "relevance", "to", "host", "defense", "and", "the", "pathogenesis", "of", "hla", "dq2", "-associated", "autoimmune", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "GATA", "transcription", "factors", "associate", "with", "a", "novel", "class", "of", "nuclear", "bodies", "in", "erythroblasts", "and", "megakaryocytes", "." ]

[ "gata", "transcription", "factors", "associate", "with", "a", "novel", "class", "of", "nuclear", "bodies", "in", "erythroblasts", "and", "megakaryocytes", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "The", "nuclear", "distribution", "of", "GATA", "transcription", "factors", "in", "murine", "haemopoietic", "cells", "was", "examined", "by", "indirect", "immunofluorescence", "." ]

[ "the", "nuclear", "distribution", "of", "gata", "transcription", "factors", "in", "murine", "haemopoietic", "cells", "was", "examined", "by", "indirect", "immunofluorescence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Specific", "bright", "foci", "of", "GATA-1", "fluorescence", "were", "observed", "in", "erythroleukaemia", "cells", "and", "primary", "murine", "erythroblasts", "and", "megakaryocytes", ",", "in", "addition", "to", "diffuse", "nucleoplasmic", "localization", "." ]

[ "specific", "bright", "foci", "of", "gata-1", "fluorescence", "were", "observed", "in", "erythroleukaemia", "cells", "and", "primary", "murine", "erythroblasts", "and", "megakaryocytes", ",", "in", "addition", "to", "diffuse", "nucleoplasmic", "localization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "These", "foci", ",", "which", "were", "preferentially", "found", "adjacent", "to", "nucleoli", "or", "at", "the", "nuclear", "periphery", ",", "did", "not", "represent", "sites", "of", "active", "transcription", "or", "binding", "of", "GATA-1", "to", "consensus", "sites", "in", "the", "beta-globin", "loci", "." ]

[ "these", "foci", ",", "which", "were", "preferentially", "found", "adjacent", "to", "nucleoli", "or", "at", "the", "nuclear", "periphery", ",", "did", "not", "represent", "sites", "of", "active", "transcription", "or", "binding", "of", "gata-1", "to", "consensus", "sites", "in", "the", "beta-globin", "loci", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Immunoelectron", "microscopy", "demonstrated", "the", "presence", "of", "intensely", "labelled", "structures", "likely", "to", "represent", "the", "GATA-1", "foci", "seen", "by", "immunofluorescence", "." ]

[ "immunoelectron", "microscopy", "demonstrated", "the", "presence", "of", "intensely", "labelled", "structures", "likely", "to", "represent", "the", "gata-1", "foci", "seen", "by", "immunofluorescence", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "The", "GATA-1", "nuclear", "bodies", "differed", "from", "previously", "described", "nuclear", "structures", "and", "there", "was", "no", "co-localization", "with", "nuclear", "antigens", "involved", "in", "RNA", "processing", "or", "other", "ubiquitous", "(", "Spl", ",", "c-Jun", "and", "TBP", ")", "or", "haemopoietic", "(", "NF-E2", ")", "transcription", "factors", "." ]

[ "the", "gata-1", "nuclear", "bodies", "differed", "from", "previously", "described", "nuclear", "structures", "and", "there", "was", "no", "co-localization", "with", "nuclear", "antigens", "involved", "in", "rna", "processing", "or", "other", "ubiquitous", "(", "spl", ",", "c-jun", "and", "tbp", ")", "or", "haemopoietic", "(", "nf-e2", ")", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "GATA-2", "and", "GATA-3", "proteins", "also", "localized", "to", "the", "same", "nuclear", "bodies", "in", "cell", "lines", "co-expressing", "GATA", "-1", "and", "-2", "or", "GATA", "-1", "and", "-3", "gene", "products", "." ]

[ "interestingly", ",", "gata-2", "and", "gata-3", "proteins", "also", "localized", "to", "the", "same", "nuclear", "bodies", "in", "cell", "lines", "co-expressing", "gata", "-1", "and", "-2", "or", "gata", "-1", "and", "-3", "gene", "products", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "pattern", "of", "distribution", "is", ",", "thus", "far", ",", "unique", "to", "the", "GATA", "transcription", "factors", "and", "suggests", "a", "protein-protein", "interaction", "with", "other", "components", "of", "the", "nuclear", "bodies", "via", "the", "GATA", "zinc", "finger", "domain", "." ]

[ "this", "pattern", "of", "distribution", "is", ",", "thus", "far", ",", "unique", "to", "the", "gata", "transcription", "factors", "and", "suggests", "a", "protein-protein", "interaction", "with", "other", "components", "of", "the", "nuclear", "bodies", "via", "the", "gata", "zinc", "finger", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "role", "of", "Stat4", "in", "species-specific", "regulation", "of", "Th", "cell", "development", "by", "type", "I", "IFNs", "." ]

[ "the", "role", "of", "stat4", "in", "species-specific", "regulation", "of", "th", "cell", "development", "by", "type", "i", "ifns", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Type", "I", "IFNs", "(", "IFN-alpha/beta", ")", ",", "in", "addition", "to", "IL-12", ",", "have", "been", "shown", "to", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "differentiation", "of", "human", ",", "but", "not", "mouse", ",", "Th", "cells", "." ]

[ "type", "i", "ifns", "(", "ifn-alpha/beta", ")", ",", "in", "addition", "to", "il-12", ",", "have", "been", "shown", "to", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "differentiation", "of", "human", ",", "but", "not", "mouse", ",", "th", "cells", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "show", "here", "that", "IFN-alpha/beta", "act", "directly", "on", "human", "T", "cells", "to", "drive", "Th1", "development", ",", "bypassing", "the", "need", "for", "IL-12", "-induced", "signaling", ",", "whereas", "IFN-alpha", "cannot", "substitute", "IL-12", "for", "mouse", "Th1", "development", "." ]

[ "we", "show", "here", "that", "ifn-alpha/beta", "act", "directly", "on", "human", "t", "cells", "to", "drive", "th1", "development", ",", "bypassing", "the", "need", "for", "il-12", "-induced", "signaling", ",", "whereas", "ifn-alpha", "cannot", "substitute", "il-12", "for", "mouse", "th1", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "molecular", "basis", "for", "this", "species", "specificity", "is", "that", "IFN-alpha", "/beta", "activate", "Stat4", "in", "differentiating", "human", ",", "but", "not", "mouse", ",", "Th", "cells", "." ]

[ "the", "molecular", "basis", "for", "this", "species", "specificity", "is", "that", "ifn-alpha", "/beta", "activate", "stat4", "in", "differentiating", "human", ",", "but", "not", "mouse", ",", "th", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Unlike", "IL-12", ",", "which", "acts", "only", "on", "Th1", "cells", ",", "IFN-alpha", "/beta", "can", "activate", "Stat4", "not", "only", "in", "human", "Th1", ",", "but", "also", "in", "Th2", "cells", "." ]

[ "unlike", "il-12", ",", "which", "acts", "only", "on", "th1", "cells", ",", "ifn-alpha", "/beta", "can", "activate", "stat4", "not", "only", "in", "human", "th1", ",", "but", "also", "in", "th2", "cells", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "However", ",", "restimulation", "of", "human", "Th2", "lines", "and", "clones", "in", "the", "presence", "of", "IFN-alpha", "does", "not", "induce", "the", "production", "of", "IFN-gamma", "." ]

[ "however", ",", "restimulation", "of", "human", "th2", "lines", "and", "clones", "in", "the", "presence", "of", "ifn-alpha", "does", "not", "induce", "the", "production", "of", "ifn-gamma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "activation", "of", "Stat4", ",", "which", "is", "necessary", "for", "the", "differentiation", "of", "naive", "T", "cells", "into", "polarized", "Th1", "cells", ",", "is", "not", "sufficient", "to", "induce", "phenotype", "reversal", "of", "human", "Th2", "cells", "." ]

[ "these", "results", "suggest", "that", "activation", "of", "stat4", ",", "which", "is", "necessary", "for", "the", "differentiation", "of", "naive", "t", "cells", "into", "polarized", "th1", "cells", ",", "is", "not", "sufficient", "to", "induce", "phenotype", "reversal", "of", "human", "th2", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "functional", "domains", "of", "the", "murine", "Thy-1", "gene", "promoter", "." ]

[ "the", "functional", "domains", "of", "the", "murine", "thy-1", "gene", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "Thy-1", "gene", "promoter", "resembles", "a", "\"housekeeping\"", "promoter", "in", "that", "it", "is", "located", "within", "a", "methylation-free", "island", ",", "lacks", "a", "canonical", "TATA", "box", ",", "and", "displays", "heterogeneity", "in", "the", "5'-end", "termini", "of", "the", "mRNA", "." ]

[ "the", "thy-1", "gene", "promoter", "resembles", "a", "\"housekeeping\"", "promoter", "in", "that", "it", "is", "located", "within", "a", "methylation-free", "island", ",", "lacks", "a", "canonical", "tata", "box", ",", "and", "displays", "heterogeneity", "in", "the", "5'-end", "termini", "of", "the", "mrna", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_domain_or_region", "I-RNA_domain_or_region", "O", "O", "B-RNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Using", "transgenic", "mice", ",", "we", "show", "that", "this", "promoter", "does", "not", "confer", "any", "tissue", "specificity", "and", "is", "active", "only", "in", "a", "position-dependent", "manner", "." ]

[ "using", "transgenic", "mice", ",", "we", "show", "that", "this", "promoter", "does", "not", "confer", "any", "tissue", "specificity", "and", "is", "active", "only", "in", "a", "position-dependent", "manner", "." ]

[ "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "It", "can", "only", "be", "activated", "in", "a", "tissue-specific", "manner", "by", "elements", "that", "lie", "downstream", "of", "the", "initiation", "site", "." ]

[ "it", "can", "only", "be", "activated", "in", "a", "tissue-specific", "manner", "by", "elements", "that", "lie", "downstream", "of", "the", "initiation", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "have", "analyzed", "the", "functional", "domains", "of", "the", "minimal", "Thy-1", "promoter", "and", "show", "that", "the", "dominant", "promoter", "elements", "consist", "of", "multiple", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factor", "Sp1", ",", "an", "inverted", "CCAAT", "box", ",", "and", "sequences", "proximal", "to", "the", "transcription", "start", "site", "." ]

[ "we", "have", "analyzed", "the", "functional", "domains", "of", "the", "minimal", "thy-1", "promoter", "and", "show", "that", "the", "dominant", "promoter", "elements", "consist", "of", "multiple", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factor", "sp1", ",", "an", "inverted", "ccaat", "box", ",", "and", "sequences", "proximal", "to", "the", "transcription", "start", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "DNase", "I", "and", "gel", "mobility", "shift", "assays", "show", "the", "binding", "of", "a", "number", "of", "nuclear", "factors", "to", "these", "elements", ",", "including", "Sp1", "and", "CP1", "." ]

[ "dnase", "i", "and", "gel", "mobility", "shift", "assays", "show", "the", "binding", "of", "a", "number", "of", "nuclear", "factors", "to", "these", "elements", ",", "including", "sp1", "and", "cp1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Our", "results", "show", "that", "the", "structure", "of", "this", "promoter", "only", "permits", "productive", "interactions", "of", "the", "two", "transcription", "factors", "Sp1", "and", "CP1", "with", "the", "basal", "transcription", "machinery", "in", "the", "presence", "of", "enhancer", "sequences", "." ]

[ "our", "results", "show", "that", "the", "structure", "of", "this", "promoter", "only", "permits", "productive", "interactions", "of", "the", "two", "transcription", "factors", "sp1", "and", "cp1", "with", "the", "basal", "transcription", "machinery", "in", "the", "presence", "of", "enhancer", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Evaluation", "of", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "cystic", "fibrosis", "for", "the", "presence", "of", "adenovirus", "E1a", "sequences", "relevant", "to", "the", "use", "of", "E1a-", "adenovirus", "vectors", "for", "gene", "therapy", "for", "the", "respiratory", "manifestations", "of", "cystic", "fibrosis", "." ]

[ "evaluation", "of", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "cystic", "fibrosis", "for", "the", "presence", "of", "adenovirus", "e1a", "sequences", "relevant", "to", "the", "use", "of", "e1a-", "adenovirus", "vectors", "for", "gene", "therapy", "for", "the", "respiratory", "manifestations", "of", "cystic", "fibrosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Lung", "disease", "associated", "with", "disorders", "such", "as", "cystic", "fibrosis", "(", "CF", ")", "may", "be", "amenable", "to", "somatic", "gene", "therapy", "in", "which", "there", "is", "delivery", "of", "the", "normal", "gene", "directly", "to", "the", "respiratory", "epithelium", "using", "E1a-", "adenovirus", "(", "Ad", ")", "type", "2-", "or", "5-based", "vectors", "." ]

[ "lung", "disease", "associated", "with", "disorders", "such", "as", "cystic", "fibrosis", "(", "cf", ")", "may", "be", "amenable", "to", "somatic", "gene", "therapy", "in", "which", "there", "is", "delivery", "of", "the", "normal", "gene", "directly", "to", "the", "respiratory", "epithelium", "using", "e1a-", "adenovirus", "(", "ad", ")", "type", "2-", "or", "5-based", "vectors", "." ]

[ "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "I-virus", "O" ]

[ "For", "safety", "reasons", ",", "the", "Ad", "vectors", "are", "rendered", "replication", "deficient", "by", "deletion", "of", "the", "E1a", "region", "." ]

[ "for", "safety", "reasons", ",", "the", "ad", "vectors", "are", "rendered", "replication", "deficient", "by", "deletion", "of", "the", "e1a", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Because", "there", "is", "the", "theoretical", "possibility", "of", "an", "E1a-", "replication-deficient", "vector", "replicating", "as", "a", "result", "of", "recombination", "or", "complementation", "with", "Ad", "2/5", "E1a", "sequences", "present", "in", "the", "target", "cell", ",", "this", "study", "is", "directed", "toward", "evaluating", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "CF", "for", "the", "presence", "of", "E1a", "sequences", "." ]

[ "because", "there", "is", "the", "theoretical", "possibility", "of", "an", "e1a-", "replication-deficient", "vector", "replicating", "as", "a", "result", "of", "recombination", "or", "complementation", "with", "ad", "2/5", "e1a", "sequences", "present", "in", "the", "target", "cell", ",", "this", "study", "is", "directed", "toward", "evaluating", "respiratory", "epithelium", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "cf", "for", "the", "presence", "of", "e1a", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "B-multi_cell", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "Ad", "2/5", "E1a-specific", "primers", "and", "the", "polymerase", "chain", "reaction", "to", "evaluate", "DNA", "recovered", "from", "freshly", "isolated", "nasal", "and", "bronchial", "epithelium", "recovered", "by", "brushing", ",", "E1a", "sequences", "were", "detected", "in", "respiratory", "epithelium", "of", "19", "of", "91", "normals", "(", "21%", ")", "." ]

[ "using", "ad", "2/5", "e1a-specific", "primers", "and", "the", "polymerase", "chain", "reaction", "to", "evaluate", "dna", "recovered", "from", "freshly", "isolated", "nasal", "and", "bronchial", "epithelium", "recovered", "by", "brushing", ",", "e1a", "sequences", "were", "detected", "in", "respiratory", "epithelium", "of", "19", "of", "91", "normals", "(", "21%", ")", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "E1a-positive", "samples", ",", "the", "average", "of", "E1a", "copy", "number", "was", "55", "+/-", "18/10", "(", "3", ")", "recovered", "cells", "." ]

[ "in", "the", "e1a-positive", "samples", ",", "the", "average", "of", "e1a", "copy", "number", "was", "55", "+/-", "18/10", "(", "3", ")", "recovered", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "CF", "individuals", ",", "7", "of", "52", "(", "13%", ")", "had", "detectable", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", ",", "with", "E1a", "copy", "number", "in", "the", "positive", "samples", "of", "80", "+/-", "21/10", "(", "3", ")", "recovered", "cells", "." ]

[ "in", "cf", "individuals", ",", "7", "of", "52", "(", "13%", ")", "had", "detectable", "e1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", ",", "with", "e1a", "copy", "number", "in", "the", "positive", "samples", "of", "80", "+/-", "21/10", "(", "3", ")", "recovered", "cells", "." ]

[ "O", "B-other_name", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "demonstrate", "that", "there", "are", "detectable", "Ad", "2/5", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "a", "small", "percentage", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "CF", "." ]

[ "these", "results", "demonstrate", "that", "there", "are", "detectable", "ad", "2/5", "e1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "of", "a", "small", "percentage", "of", "normals", "and", "individuals", "with", "cf", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Because", "of", "the", "theoretical", "potential", "of", "such", "sequences", "supporting", "replication", "of", "E1a-", "Ad", "vectors", ",", "human", "gene", "therapy", "protocols", "for", "CF", "utilizing", "such", "vectors", "should", "consider", "evaluating", "study", "individuals", "for", "the", "presence", "of", "Ad", "2/5", "E1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "." ]

[ "because", "of", "the", "theoretical", "potential", "of", "such", "sequences", "supporting", "replication", "of", "e1a-", "ad", "vectors", ",", "human", "gene", "therapy", "protocols", "for", "cf", "utilizing", "such", "vectors", "should", "consider", "evaluating", "study", "individuals", "for", "the", "presence", "of", "ad", "2/5", "e1a", "sequences", "in", "the", "respiratory", "epithelium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "The", "role", "of", "Rel/", "NF-kappa", "B", "proteins", "in", "viral", "oncogenesis", "and", "the", "regulation", "of", "viral", "transcription", "." ]

[ "the", "role", "of", "rel/", "nf-kappa", "b", "proteins", "in", "viral", "oncogenesis", "and", "the", "regulation", "of", "viral", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Rel", "/NF-kappa", "B", "is", "a", "ubiquitous", "transcription", "factor", "that", "consists", "of", "multiple", "polypeptide", "subunits", ",", "and", "is", "subject", "to", "complex", "regulatory", "mechanisms", "that", "involve", "protein-protein", "interactions", ",", "phosphorylation", ",", "ubiquitination", ",", "proteolytic", "degradation", ",", "and", "nucleocytoplasmic", "translocation", "." ]

[ "rel", "/nf-kappa", "b", "is", "a", "ubiquitous", "transcription", "factor", "that", "consists", "of", "multiple", "polypeptide", "subunits", ",", "and", "is", "subject", "to", "complex", "regulatory", "mechanisms", "that", "involve", "protein-protein", "interactions", ",", "phosphorylation", ",", "ubiquitination", ",", "proteolytic", "degradation", ",", "and", "nucleocytoplasmic", "translocation", "." ]

[ "B-protein_complex", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "sophisticated", "control", "of", "Rel", "/NF-kappa", "B", "activity", "is", "not", "surprising", "since", "this", "transcription", "factor", "is", "involved", "in", "a", "wide", "array", "of", "cellular", "responses", "to", "extracellular", "cues", ",", "associated", "with", "growth", ",", "development", ",", "apoptosis", ",", "and", "pathogen", "invasion", "." ]

[ "the", "sophisticated", "control", "of", "rel", "/nf-kappa", "b", "activity", "is", "not", "surprising", "since", "this", "transcription", "factor", "is", "involved", "in", "a", "wide", "array", "of", "cellular", "responses", "to", "extracellular", "cues", ",", "associated", "with", "growth", ",", "development", ",", "apoptosis", ",", "and", "pathogen", "invasion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Thus", ",", "it", "is", "not", "unexpected", "that", "this", "versatile", "cellular", "homeostatic", "switch", "would", "be", "affected", "by", "a", "variety", "of", "viral", "pathogens", ",", "which", "have", "evolved", "mechanisms", "to", "utilize", "various", "aspects", "of", "Rel", "/NF-kappa", "B", "activity", "to", "facilitate", "their", "replication", ",", "cell", "survival", "and", "possibly", "evasion", "of", "immune", "responses", "." ]

[ "thus", ",", "it", "is", "not", "unexpected", "that", "this", "versatile", "cellular", "homeostatic", "switch", "would", "be", "affected", "by", "a", "variety", "of", "viral", "pathogens", ",", "which", "have", "evolved", "mechanisms", "to", "utilize", "various", "aspects", "of", "rel", "/nf-kappa", "b", "activity", "to", "facilitate", "their", "replication", ",", "cell", "survival", "and", "possibly", "evasion", "of", "immune", "responses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "This", "review", "will", "cover", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "are", "utilized", "by", "mammalian", "oncogenic", "viruses", "to", "affect", "the", "activity", "of", "Rel/", "NF-kappa", "B", "transcription", "factors", "and", "the", "role", "of", "Rel", "/NF-kappa", "B", "in", "the", "regulation", "of", "viral", "gene", "expression", "and", "replication", "." ]

[ "this", "review", "will", "cover", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "are", "utilized", "by", "mammalian", "oncogenic", "viruses", "to", "affect", "the", "activity", "of", "rel/", "nf-kappa", "b", "transcription", "factors", "and", "the", "role", "of", "rel", "/nf-kappa", "b", "in", "the", "regulation", "of", "viral", "gene", "expression", "and", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "HSF2-beta", "inhibits", "hemin", "-induced", "heat", "shock", "gene", "expression", "and", "erythroid", "differentiation", "in", "K562", "cells", "." ]

[ "overexpression", "of", "hsf2-beta", "inhibits", "hemin", "-induced", "heat", "shock", "gene", "expression", "and", "erythroid", "differentiation", "in", "k562", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Acquisition", "of", "heat", "shock", "factor", "2", "(", "HSF2", ")", "DNA", "binding", "activity", "is", "accompanied", "by", "induced", "transcription", "of", "heat", "shock", "genes", "in", "hemin-treated", "K562", "cells", "undergoing", "erythroid", "differentiation", "." ]

[ "acquisition", "of", "heat", "shock", "factor", "2", "(", "hsf2", ")", "dna", "binding", "activity", "is", "accompanied", "by", "induced", "transcription", "of", "heat", "shock", "genes", "in", "hemin-treated", "k562", "cells", "undergoing", "erythroid", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Previous", "studies", "revealed", "that", "HSF2", "consists", "of", "two", "alternatively", "spliced", "isoforms", ",", "HSF2-alpha", "and", "HSF2-beta", ",", "whose", "relative", "abundance", "is", "developmentally", "regulated", "and", "varies", "between", "different", "tissues", "." ]

[ "previous", "studies", "revealed", "that", "hsf2", "consists", "of", "two", "alternatively", "spliced", "isoforms", ",", "hsf2-alpha", "and", "hsf2-beta", ",", "whose", "relative", "abundance", "is", "developmentally", "regulated", "and", "varies", "between", "different", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "investigate", "whether", "the", "molar", "ratio", "of", "HSF2-alpha", "and", "HSF2-beta", "isoforms", "is", "crucial", "for", "the", "activation", "of", "HSF2", "and", "whether", "the", "HSF2", "isoforms", "play", "functionally", "distinct", "roles", "during", "the", "hemin-mediated", "erythroid", "differentiation", ",", "we", "generated", "cell", "clones", "expressing", "different", "levels", "of", "HSF2-alpha", "and", "HSF2-beta", "." ]

[ "to", "investigate", "whether", "the", "molar", "ratio", "of", "hsf2-alpha", "and", "hsf2-beta", "isoforms", "is", "crucial", "for", "the", "activation", "of", "hsf2", "and", "whether", "the", "hsf2", "isoforms", "play", "functionally", "distinct", "roles", "during", "the", "hemin-mediated", "erythroid", "differentiation", ",", "we", "generated", "cell", "clones", "expressing", "different", "levels", "of", "hsf2-alpha", "and", "hsf2-beta", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "We", "show", "that", "in", "parental", "K562", "cells", ",", "the", "HSF2-alpha", "isoform", "is", "predominantly", "expressed", "and", "HSF2", "can", "be", "activated", "upon", "hemin", "treatment", "." ]

[ "we", "show", "that", "in", "parental", "k562", "cells", ",", "the", "hsf2-alpha", "isoform", "is", "predominantly", "expressed", "and", "hsf2", "can", "be", "activated", "upon", "hemin", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "when", "HSF2-beta", "is", "expressed", "at", "levels", "exceeding", "those", "of", "endogenous", "HSF2-alpha", ",", "the", "hemin-induced", "DNA", "binding", "activity", "and", "transcription", "of", "heat", "shock", "genes", "are", "repressed", ",", "whereas", "overexpression", "of", "HSF2-alpha", "results", "in", "an", "enhanced", "hemin", "response", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "when", "hsf2-beta", "is", "expressed", "at", "levels", "exceeding", "those", "of", "endogenous", "hsf2-alpha", ",", "the", "hemin-induced", "dna", "binding", "activity", "and", "transcription", "of", "heat", "shock", "genes", "are", "repressed", ",", "whereas", "overexpression", "of", "hsf2-alpha", "results", "in", "an", "enhanced", "hemin", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "the", "hemin", "-induced", "accumulation", "of", "globin", ",", "known", "as", "a", "marker", "of", "erythroid", "differentiation", ",", "is", "decreased", "in", "cells", "overexpressing", "HSF2-beta", "." ]

[ "furthermore", ",", "the", "hemin", "-induced", "accumulation", "of", "globin", ",", "known", "as", "a", "marker", "of", "erythroid", "differentiation", ",", "is", "decreased", "in", "cells", "overexpressing", "hsf2-beta", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "We", "suggest", "that", "HSF2-beta", "acts", "as", "a", "negative", "regulator", "of", "HSF2", "activity", "during", "hemin-mediated", "erythroid", "differentiation", "of", "K562", "cells", "." ]

[ "we", "suggest", "that", "hsf2-beta", "acts", "as", "a", "negative", "regulator", "of", "hsf2", "activity", "during", "hemin-mediated", "erythroid", "differentiation", "of", "k562", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Involvement", "of", "phospholipase", "D", "in", "the", "activation", "of", "transcription", "factor", "AP-1", "in", "human", "T", "lymphoid", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "involvement", "of", "phospholipase", "d", "in", "the", "activation", "of", "transcription", "factor", "ap-1", "in", "human", "t", "lymphoid", "jurkat", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "The", "induction", "of", "the", "AP-1", "transcription", "factor", "has", "been", "ascribed", "to", "the", "early", "events", "leading", "to", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "the", "induction", "of", "the", "ap-1", "transcription", "factor", "has", "been", "ascribed", "to", "the", "early", "events", "leading", "to", "t", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "have", "examined", "the", "possibility", "that", "stimulation", "of", "phospholipase", "D", "(", "PLD", ")", "may", "regulate", "activation", "of", "transcription", "factor", "AP-1", "in", "human", "T", "cells", "by", "transfecting", "human", "T", "lymphocyte", "Jurkat", "cells", "with", "a", "plasmid", "containing", "an", "AP-1", "enhancer", "element", "and", "a", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "reporter", "gene", "." ]

[ "we", "have", "examined", "the", "possibility", "that", "stimulation", "of", "phospholipase", "d", "(", "pld", ")", "may", "regulate", "activation", "of", "transcription", "factor", "ap-1", "in", "human", "t", "cells", "by", "transfecting", "human", "t", "lymphocyte", "jurkat", "cells", "with", "a", "plasmid", "containing", "an", "ap-1", "enhancer", "element", "and", "a", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "reporter", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "detected", "activatable", "PLD", "in", "Jurkat", "cells", ",", "and", "we", "have", "found", "that", "addition", "of", "phosphatidic", "acid", "(", "PA", ")", ",", "the", "physiologic", "product", "of", "PLD", "action", "on", "phospholipids", ",", "is", "rapidly", "incorporated", "into", "Jurkat", "cells", "and", "leads", "to", "activation", "of", "transcription", "factor", "AP-1", "." ]

[ "we", "have", "detected", "activatable", "pld", "in", "jurkat", "cells", ",", "and", "we", "have", "found", "that", "addition", "of", "phosphatidic", "acid", "(", "pa", ")", ",", "the", "physiologic", "product", "of", "pld", "action", "on", "phospholipids", ",", "is", "rapidly", "incorporated", "into", "jurkat", "cells", "and", "leads", "to", "activation", "of", "transcription", "factor", "ap-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Treatment", "of", "Jurkat", "cells", "with", "anti-CD3", "mAb", "activated", "both", "PLD", "and", "transcription", "factor", "AP-1", "." ]

[ "treatment", "of", "jurkat", "cells", "with", "anti-cd3", "mab", "activated", "both", "pld", "and", "transcription", "factor", "ap-1", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Wortmannin", ",", "an", "inhibitor", "of", "receptor-coupled", "PLD", "activation", ",", "blocked", "the", "anti-CD3", "-induced", "increases", "in", "both", "PLD", "activity", "and", "AP-1", "enhancer", "activity", "." ]

[ "wortmannin", ",", "an", "inhibitor", "of", "receptor-coupled", "pld", "activation", ",", "blocked", "the", "anti-cd3", "-induced", "increases", "in", "both", "pld", "activity", "and", "ap-1", "enhancer", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "We", "found", "a", "good", "correlation", "in", "the", "transfected", "cells", "between", "PLD", "activation", "and", "induction", "of", "AP-1", "enhancer", "activity", "under", "different", "experimental", "conditions", "." ]

[ "we", "found", "a", "good", "correlation", "in", "the", "transfected", "cells", "between", "pld", "activation", "and", "induction", "of", "ap-1", "enhancer", "activity", "under", "different", "experimental", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "ethanol", ",", "an", "inhibitor", "of", "the", "PLD", "pathway", ",", "blocked", "the", "anti-CD3-stimulated", "AP-1", "enhancer", "activity", "." ]

[ "furthermore", ",", "ethanol", ",", "an", "inhibitor", "of", "the", "pld", "pathway", ",", "blocked", "the", "anti-cd3-stimulated", "ap-1", "enhancer", "activity", "." ]

[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "However", ",", "this", "anti-CD3", "-mediated", "response", "was", "not", "inhibited", "by", "neomycin", ",", "an", "inhibitor", "of", "phosphoinositide", "hydrolysis", "." ]

[ "however", ",", "this", "anti-cd3", "-mediated", "response", "was", "not", "inhibited", "by", "neomycin", ",", "an", "inhibitor", "of", "phosphoinositide", "hydrolysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "increases", "in", "AP-1", "enhancer", "activity", "induced", "by", "PA", "or", "anti-CD3", "mAb", "were", "efficiently", "abrogated", "by", "the", "presence", "of", "propranolol", ",", "an", "inhibitor", "of", "PA", "phosphohydrolase", "and", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "." ]

[ "the", "increases", "in", "ap-1", "enhancer", "activity", "induced", "by", "pa", "or", "anti-cd3", "mab", "were", "efficiently", "abrogated", "by", "the", "presence", "of", "propranolol", ",", "an", "inhibitor", "of", "pa", "phosphohydrolase", "and", "protein", "kinase", "c", "(", "pkc", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "the", "PA", "-and", "the", "anti-CD3", "-induced", "increases", "in", "AP-1", "enhancer", "activity", "were", "blocked", "by", "the", "presence", "of", "PKC", "inhibitors", "or", "by", "PKC", "down-regulation", "." ]

[ "furthermore", ",", "the", "pa", "-and", "the", "anti-cd3", "-induced", "increases", "in", "ap-1", "enhancer", "activity", "were", "blocked", "by", "the", "presence", "of", "pkc", "inhibitors", "or", "by", "pkc", "down-regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "These", "data", "indicate", "that", "PLD", "stimulation", "can", "activate", "the", "transcription", "factor", "AP-1", "in", "T", "lymphocytes", ",", "and", "suggest", "that", "the", "induction", "of", "AP-1", "enhancer", "factor", "activity", "by", "PA", "is", "mediated", "via", "PKC", "stimulation", ",", "either", "through", "a", "direct", "activating", "effect", "of", "PA", "or", "through", "PA", "-derived", "diacylglycerol", "formation", "." ]

[ "these", "data", "indicate", "that", "pld", "stimulation", "can", "activate", "the", "transcription", "factor", "ap-1", "in", "t", "lymphocytes", ",", "and", "suggest", "that", "the", "induction", "of", "ap-1", "enhancer", "factor", "activity", "by", "pa", "is", "mediated", "via", "pkc", "stimulation", ",", "either", "through", "a", "direct", "activating", "effect", "of", "pa", "or", "through", "pa", "-derived", "diacylglycerol", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "also", "provide", "evidence", "for", "a", "role", "of", "PLD", "-derived", "lipids", "in", "the", "induction", "of", "AP-1", "enhancer", "activity", "resulting", "from", "stimulation", "of", "the", "TCR/CD3", "complex", ",", "suggesting", "that", "increased", "PLD", "activity", "can", "play", "an", "important", "role", "in", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "these", "data", "also", "provide", "evidence", "for", "a", "role", "of", "pld", "-derived", "lipids", "in", "the", "induction", "of", "ap-1", "enhancer", "activity", "resulting", "from", "stimulation", "of", "the", "tcr/cd3", "complex", ",", "suggesting", "that", "increased", "pld", "activity", "can", "play", "an", "important", "role", "in", "t", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O" ]

[ "GABP", "factors", "bind", "to", "a", "distal", "interleukin", "2", "(", "IL-2", ")", "enhancer", "and", "contribute", "to", "c-Raf", "-mediated", "increase", "in", "IL-2", "induction", "." ]

[ "gabp", "factors", "bind", "to", "a", "distal", "interleukin", "2", "(", "il-2", ")", "enhancer", "and", "contribute", "to", "c-raf", "-mediated", "increase", "in", "il-2", "induction", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Triggering", "of", "the", "T-cell", "receptor-CD3", "complex", "activates", "two", "major", "signal", "cascades", "in", "T", "lymphocytes", ",", "(", "i", ")", "Ca2+-dependent", "signal", "cascades", "and", "(", "ii", ")", "protein", "kinase", "cascades", "." ]

[ "triggering", "of", "the", "t-cell", "receptor-cd3", "complex", "activates", "two", "major", "signal", "cascades", "in", "t", "lymphocytes", ",", "(", "i", ")", "ca2+-dependent", "signal", "cascades", "and", "(", "ii", ")", "protein", "kinase", "cascades", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Both", "signal", "cascades", "contribute", "to", "the", "induction", "of", "the", "interleukin", "2", "(", "IL-2", ")", "gene", "during", "T-cell", "activation", "." ]

[ "both", "signal", "cascades", "contribute", "to", "the", "induction", "of", "the", "interleukin", "2", "(", "il-2", ")", "gene", "during", "t-cell", "activation", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Prominent", "protein", "kinase", "cascades", "are", "those", "that", "activate", "mitogen-activated", "protein", "(", "MAP", ")", "kinases", "." ]

[ "prominent", "protein", "kinase", "cascades", "are", "those", "that", "activate", "mitogen-activated", "protein", "(", "map", ")", "kinases", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "We", "show", "here", "that", "c-Raf", ",", "which", "is", "at", "the", "helm", "of", "the", "classic", "MAP-", "Erk", "cascade", ",", "contributes", "to", "IL-2", "induction", "through", "a", "distal", "enhancer", "element", "spanning", "the", "nucleotides", "from", "positions", "-502", "to", "-413", "in", "front", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "of", "the", "IL-2", "gene", "." ]

[ "we", "show", "here", "that", "c-raf", ",", "which", "is", "at", "the", "helm", "of", "the", "classic", "map-", "erk", "cascade", ",", "contributes", "to", "il-2", "induction", "through", "a", "distal", "enhancer", "element", "spanning", "the", "nucleotides", "from", "positions", "-502", "to", "-413", "in", "front", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "of", "the", "il-2", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Induction", "of", "this", "distal", "IL-2", "enhancer", "differs", "from", "induction", "of", "the", "proximal", "IL-2", "promoter-enhancer", ",", "since", "it", "is", "induced", "by", "phorbol", "esters", "alone", "and", "independent", "from", "Ca2+", "signals", "." ]

[ "induction", "of", "this", "distal", "il-2", "enhancer", "differs", "from", "induction", "of", "the", "proximal", "il-2", "promoter-enhancer", ",", "since", "it", "is", "induced", "by", "phorbol", "esters", "alone", "and", "independent", "from", "ca2+", "signals", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O" ]

[ "In", "DNA-protein", "binding", "studies", ",", "we", "detected", "the", "binding", "of", "transcription", "factors", "GABP", "alpha", "and", "-beta", "to", "a", "dyad", "symmetry", "element", "(", "DSE", ")", "of", "the", "distal", "enhancer", ",", "which", "is", "formed", "by", "palindromic", "binding", "sites", "of", "Ets-like", "factors", "." ]

[ "in", "dna-protein", "binding", "studies", ",", "we", "detected", "the", "binding", "of", "transcription", "factors", "gabp", "alpha", "and", "-beta", "to", "a", "dyad", "symmetry", "element", "(", "dse", ")", "of", "the", "distal", "enhancer", ",", "which", "is", "formed", "by", "palindromic", "binding", "sites", "of", "ets-like", "factors", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Introduction", "of", "point", "mutations", "suppressing", "GABP", "binding", "to", "the", "DSE", "interfered", "with", "the", "induction", "of", "the", "distal", "enhancer", "and", "the", "entire", "IL-2", "promoter-enhancer", ",", "while", "overexpression", "of", "both", "GABP", "factors", "enhanced", "the", "IL-2", "promoter-enhancer", "induction", "." ]

[ "introduction", "of", "point", "mutations", "suppressing", "gabp", "binding", "to", "the", "dse", "interfered", "with", "the", "induction", "of", "the", "distal", "enhancer", "and", "the", "entire", "il-2", "promoter-enhancer", ",", "while", "overexpression", "of", "both", "gabp", "factors", "enhanced", "the", "il-2", "promoter-enhancer", "induction", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "BXB", ",", "a", "constitutive", "active", "version", "of", "c-Raf", ",", "and", "of", "further", "members", "of", "the", "Ras", "-", "Raf", "-", "Erk", "signal", "cascade", "exerted", "an", "increase", "of", "GABP", "-mediated", "promoter-enhancer", "induction", "." ]

[ "overexpression", "of", "bxb", ",", "a", "constitutive", "active", "version", "of", "c-raf", ",", "and", "of", "further", "members", "of", "the", "ras", "-", "raf", "-", "erk", "signal", "cascade", "exerted", "an", "increase", "of", "gabp", "-mediated", "promoter-enhancer", "induction", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conjunction", "with", "previously", "published", "data", "on", "c-Raf", "-induced", "phosphorylation", "of", "GABP", "factors", "(", "E", ".", "Flory", ",", "A", ".", "Hoffmeyer", ",", "U", ".", "Smola", ",", "U", ".", "R", ".", "Rapp", ",", "and", "J", ".", "T", ".", "Bruder", ",", "J", ".", "Virol", ".", "70", ":", "2260-", "2268", ",", "1996", ")", ",", "these", "results", "indicate", "a", "contribution", "of", "GABP", "factors", "to", "the", "Raf", "-mediated", "enhancement", "of", "IL-2", "induction", "during", "T-cell", "activation", "." ]

[ "in", "conjunction", "with", "previously", "published", "data", "on", "c-raf", "-induced", "phosphorylation", "of", "gabp", "factors", "(", "e", ".", "flory", ",", "a", ".", "hoffmeyer", ",", "u", ".", "smola", ",", "u", ".", "r", ".", "rapp", ",", "and", "j", ".", "t", ".", "bruder", ",", "j", ".", "virol", ".", "70", ":", "2260-", "2268", ",", "1996", ")", ",", "these", "results", "indicate", "a", "contribution", "of", "gabp", "factors", "to", "the", "raf", "-mediated", "enhancement", "of", "il-2", "induction", "during", "t-cell", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Thrombin", "-induced", "p65", "homodimer", "binding", "to", "downstream", "NF-kappa", "B", "site", "of", "the", "promoter", "mediates", "endothelial", "ICAM-1", "expression", "and", "neutrophil", "adhesion", "." ]

[ "thrombin", "-induced", "p65", "homodimer", "binding", "to", "downstream", "nf-kappa", "b", "site", "of", "the", "promoter", "mediates", "endothelial", "icam-1", "expression", "and", "neutrophil", "adhesion", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "the", "mechanisms", "by", "which", "proinflammatory", "mediator", ",", "thrombin", ",", "released", "during", "intravascular", "coagulation", "and", "tissue", "injury", ",", "induces", "ICAM-1", "(", "CD54", ")", "expression", "in", "endothelial", "cells", "." ]

[ "we", "investigated", "the", "mechanisms", "by", "which", "proinflammatory", "mediator", ",", "thrombin", ",", "released", "during", "intravascular", "coagulation", "and", "tissue", "injury", ",", "induces", "icam-1", "(", "cd54", ")", "expression", "in", "endothelial", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Stimulation", "of", "HUVEC", "with", "thrombin", "resulted", "in", "dose-", "and", "time-dependent", "increases", "in", "ICAM-1", "mRNA", "and", "cell", "surface", "expression", "and", "in", "ICAM-1", "-dependent", "endothelial", "adhesivity", "toward", "polymorphonuclear", "leukocytes", "." ]

[ "stimulation", "of", "huvec", "with", "thrombin", "resulted", "in", "dose-", "and", "time-dependent", "increases", "in", "icam-1", "mrna", "and", "cell", "surface", "expression", "and", "in", "icam-1", "-dependent", "endothelial", "adhesivity", "toward", "polymorphonuclear", "leukocytes", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_line", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Transient", "transfection", "of", "endothelial", "cells", "with", "ICAM-1", "promoter", "luciferase", "reporter", "gene", "(", "ICAM-1LUC", ")", "constructs", "indicated", "that", "deletion", "of", "upstream", "NF-kappa", "B", "site", "(", "-533", "bases", "from", "translation", "start", "site", ")", "had", "no", "effect", "on", "thrombin", "responsiveness", ",", "whereas", "mutation/deletion", "of", "downstream", "NF-kappa", "B", "site", "(", "-223", "bases", "from", "the", "translation", "start", "site", ")", "prevented", "the", "activation", "of", "ICAM-1", "promoter", ",", "indicating", "that", "the", "downstream", "NF-kappa", "B", "site", "is", "critical", "for", "thrombin", "inducibility", "." ]

[ "transient", "transfection", "of", "endothelial", "cells", "with", "icam-1", "promoter", "luciferase", "reporter", "gene", "(", "icam-1luc", ")", "constructs", "indicated", "that", "deletion", "of", "upstream", "nf-kappa", "b", "site", "(", "-533", "bases", "from", "translation", "start", "site", ")", "had", "no", "effect", "on", "thrombin", "responsiveness", ",", "whereas", "mutation/deletion", "of", "downstream", "nf-kappa", "b", "site", "(", "-223", "bases", "from", "the", "translation", "start", "site", ")", "prevented", "the", "activation", "of", "icam-1", "promoter", ",", "indicating", "that", "the", "downstream", "nf-kappa", "b", "site", "is", "critical", "for", "thrombin", "inducibility", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "NF-kappa", "B", "-directed", "luciferase", "activity", "increased", "approximately", "3-fold", "when", "cells", "transfected", "with", "the", "plasmid", "pNF-kappa", "BLUC", "containing", "five", "copies", "of", "consensus", "NF-kappa", "B", "site", "linked", "to", "a", "minimal", "adenovirus", "E1B", "promoter-luciferase", "gene", "were", "exposed", "to", "thrombin", ",", "indicating", "that", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "was", "essential", "for", "thrombin", "response", "." ]

[ "nf-kappa", "b", "-directed", "luciferase", "activity", "increased", "approximately", "3-fold", "when", "cells", "transfected", "with", "the", "plasmid", "pnf-kappa", "bluc", "containing", "five", "copies", "of", "consensus", "nf-kappa", "b", "site", "linked", "to", "a", "minimal", "adenovirus", "e1b", "promoter-luciferase", "gene", "were", "exposed", "to", "thrombin", ",", "indicating", "that", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "was", "essential", "for", "thrombin", "response", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Gel", "supershift", "assays", "demonstrated", "that", "thrombin", "induced", "binding", "of", "NF-kappa", "Bp65", "(", "Rel", "A", ")", "to", "downstream", "NF-kappa", "B", "site", "of", "the", "ICAM-1", "promoter", "." ]

[ "gel", "supershift", "assays", "demonstrated", "that", "thrombin", "induced", "binding", "of", "nf-kappa", "bp65", "(", "rel", "a", ")", "to", "downstream", "nf-kappa", "b", "site", "of", "the", "icam-1", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Thrombin", "receptor", "activation", "peptide", ",", "a", "14-amino-acid", "peptide", "representing", "the", "new", "NH2", "terminus", "of", "proteolytically", "activated", "receptor-1", ",", "mimicked", "thrombin", "'s", "action", "in", "inducing", "ICAM-1", "expression", "." ]

[ "thrombin", "receptor", "activation", "peptide", ",", "a", "14-amino-acid", "peptide", "representing", "the", "new", "nh2", "terminus", "of", "proteolytically", "activated", "receptor-1", ",", "mimicked", "thrombin", "'s", "action", "in", "inducing", "icam-1", "expression", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "These", "data", "indicate", "that", "thrombin", "activates", "endothelial", "ICAM-1", "expression", "and", "polymorphonuclear", "leukocyte", "adhesion", "by", "NF-kappa", "Bp65", "binding", "to", "the", "downstream", "NF-kappa", "B", "site", "of", "ICAM-1", "promoter", "after", "proteolytically", "activated", "receptor-1", "activation", "." ]

[ "these", "data", "indicate", "that", "thrombin", "activates", "endothelial", "icam-1", "expression", "and", "polymorphonuclear", "leukocyte", "adhesion", "by", "nf-kappa", "bp65", "binding", "to", "the", "downstream", "nf-kappa", "b", "site", "of", "icam-1", "promoter", "after", "proteolytically", "activated", "receptor-1", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "[", "Molecular-biologic", "aspects", "of", "interaction", "between", "nervous", "and", "immune", "systems", "]" ]

[ "[", "molecular-biologic", "aspects", "of", "interaction", "between", "nervous", "and", "immune", "systems", "]" ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "problem", "of", "the", "neuro-immuno", "interactions", "on", "the", "level", "of", "the", "protein", "trans-factors", ",", "stimulating", "interleukin-2", "(", "IL-2", ")", "gene", "expression", "was", "discussed", "." ]

[ "the", "problem", "of", "the", "neuro-immuno", "interactions", "on", "the", "level", "of", "the", "protein", "trans-factors", ",", "stimulating", "interleukin-2", "(", "il-2", ")", "gene", "expression", "was", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "physico-chemical", "and", "functional", "parameters", "of", "the", "low", "molecular", "nuclear", "proteins", "(", "SP", "and", "BP-", "14", ",", "18", ",", "19", "kDs", ")", "isolated", "from", "splenic", "and", "brain", "cells", "of", "immunized", "rats", "were", "studied", "." ]

[ "the", "physico-chemical", "and", "functional", "parameters", "of", "the", "low", "molecular", "nuclear", "proteins", "(", "sp", "and", "bp-", "14", ",", "18", ",", "19", "kds", ")", "isolated", "from", "splenic", "and", "brain", "cells", "of", "immunized", "rats", "were", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O" ]

[ "The", "binding", "of", "these", "proteins", "to", "the", "regulatory", "region", "of", "IL-2", "gene", "in", "vitro", "and", "stimulation", "of", "the", "IL-2mRNA", "synthesis", "in", "splenic", "T-lymphocytes", "culture", "in", "normal", "conditions", "were", "shown", "." ]

[ "the", "binding", "of", "these", "proteins", "to", "the", "regulatory", "region", "of", "il-2", "gene", "in", "vitro", "and", "stimulation", "of", "the", "il-2mrna", "synthesis", "in", "splenic", "t-lymphocytes", "culture", "in", "normal", "conditions", "were", "shown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "protective", "effect", "of", "SP", "and", "BP", "on", "the", "IL-2mRNA", "synthesis", "in", "stressful", "conditions", "and", "by", "the", "T-cells", "treatment", "with", "the", "CsA", "was", "demonstrated", "." ]

[ "the", "protective", "effect", "of", "sp", "and", "bp", "on", "the", "il-2mrna", "synthesis", "in", "stressful", "conditions", "and", "by", "the", "t-cells", "treatment", "with", "the", "csa", "was", "demonstrated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O" ]

[ "Selection", "of", "optimal", "kappa", "B/Rel", "DNA-binding", "motifs", ":", "interaction", "of", "both", "subunits", "of", "NF-kappa", "B", "with", "DNA", "is", "required", "for", "transcriptional", "activation", "." ]

[ "selection", "of", "optimal", "kappa", "b/rel", "dna-binding", "motifs", ":", "interaction", "of", "both", "subunits", "of", "nf-kappa", "b", "with", "dna", "is", "required", "for", "transcriptional", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Analysis", "of", "the", "p50", "and", "p65", "subunits", "of", "the", "NF-kappa", "B", "transcription", "factor", "complex", "has", "revealed", "that", "both", "proteins", "can", "interact", "with", "related", "DNA", "sequences", "through", "either", "homo-", "or", "hetero", "dimer", "formation", "." ]

[ "analysis", "of", "the", "p50", "and", "p65", "subunits", "of", "the", "nf-kappa", "b", "transcription", "factor", "complex", "has", "revealed", "that", "both", "proteins", "can", "interact", "with", "related", "dna", "sequences", "through", "either", "homo-", "or", "hetero", "dimer", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "product", "of", "the", "proto-oncogene", "c-rel", "can", "bind", "to", "similar", "DNA", "motifs", "by", "itself", "or", "as", "a", "heterodimer", "with", "p50", "or", "p65", "." ]

[ "in", "addition", ",", "the", "product", "of", "the", "proto-oncogene", "c-rel", "can", "bind", "to", "similar", "dna", "motifs", "by", "itself", "or", "as", "a", "heterodimer", "with", "p50", "or", "p65", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O" ]

[ "However", ",", "these", "studies", "have", "used", "a", "limited", "number", "of", "known", "kappa", "B", "DNA", "motifs", ",", "and", "the", "question", "of", "the", "optimal", "DNA", "sequences", "preferred", "by", "each", "homodimer", "has", "not", "been", "addressed", "." ]

[ "however", ",", "these", "studies", "have", "used", "a", "limited", "number", "of", "known", "kappa", "b", "dna", "motifs", ",", "and", "the", "question", "of", "the", "optimal", "dna", "sequences", "preferred", "by", "each", "homodimer", "has", "not", "been", "addressed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "purified", "recombinant", "p50", ",", "p65", ",", "and", "c-Rel", "proteins", ",", "optimal", "DNA-binding", "motifs", "were", "selected", "from", "a", "pool", "of", "random", "oligonucleotides", "." ]

[ "using", "purified", "recombinant", "p50", ",", "p65", ",", "and", "c-rel", "proteins", ",", "optimal", "dna-binding", "motifs", "were", "selected", "from", "a", "pool", "of", "random", "oligonucleotides", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O" ]

[ "Alignment", "of", "the", "selected", "sequences", "allowed", "us", "to", "predict", "a", "consensus", "sequence", "for", "binding", "of", "the", "individual", "homodimeric", "Rel-related", "proteins", ",", "and", "DNA-protein", "binding", "analysis", "of", "the", "selected", "DNA", "sequences", "revealed", "sequence", "specificity", "of", "the", "proteins", "." ]

[ "alignment", "of", "the", "selected", "sequences", "allowed", "us", "to", "predict", "a", "consensus", "sequence", "for", "binding", "of", "the", "individual", "homodimeric", "rel-related", "proteins", ",", "and", "dna-protein", "binding", "analysis", "of", "the", "selected", "dna", "sequences", "revealed", "sequence", "specificity", "of", "the", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Contrary", "to", "previous", "assumptions", ",", "we", "observed", "that", "p65", "homodimers", "can", "interact", "with", "a", "subset", "of", "DNA", "sequences", "not", "recognized", "by", "p50", "homodimers", "." ]

[ "contrary", "to", "previous", "assumptions", ",", "we", "observed", "that", "p65", "homodimers", "can", "interact", "with", "a", "subset", "of", "dna", "sequences", "not", "recognized", "by", "p50", "homodimers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O" ]