enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "Although", "CD28", "is", "constitutively", "expressed", ",", "its", "expression", "is", "transiently", "down-regulated", "following", "T", "cell", "activation", "and", "declines", "progressively", "with", "in", "vitro", "senescence", "." ]

[ "although", "cd28", "is", "constitutively", "expressed", ",", "its", "expression", "is", "transiently", "down-regulated", "following", "t", "cell", "activation", "and", "declines", "progressively", "with", "in", "vitro", "senescence", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vivo", ",", "CD8+", "T", "cells", "and", ",", "less", "frequently", ",", "CD4+", "T", "cells", "may", "completely", "lose", "CD28", "surface", "expression", "during", "chronic", "infections", "and", "with", "aging", "." ]

[ "in", "vivo", ",", "cd8+", "t", "cells", "and", ",", "less", "frequently", ",", "cd4+", "t", "cells", "may", "completely", "lose", "cd28", "surface", "expression", "during", "chronic", "infections", "and", "with", "aging", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "correlates", "with", "changes", "of", "nuclear", "protein-binding", "activities", "to", "two", "motifs", ",", "site", "alpha", "and", "beta", ",", "within", "the", "CD28", "minimal", "promoter", "." ]

[ "this", "correlates", "with", "changes", "of", "nuclear", "protein-binding", "activities", "to", "two", "motifs", ",", "site", "alpha", "and", "beta", ",", "within", "the", "cd28", "minimal", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "alpha-", "and", "beta-bound", "complexes", "are", "found", "only", "in", "lymphoid", "tissues", ",", "in", "CD28+", "T", "cells", ",", "and", "in", "some", "transformed", "B", "cells", "." ]

[ "both", "alpha-", "and", "beta-bound", "complexes", "are", "found", "only", "in", "lymphoid", "tissues", ",", "in", "cd28+", "t", "cells", ",", "and", "in", "some", "transformed", "b", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "These", "complexes", "are", "coordinately", "expressed", "except", "during", "replicative", "senescence", ",", "which", "is", "characterized", "by", "the", "down-modulation", "of", "site", "beta", "-but", "not", "site", "alpha", "-binding", "activities", "." ]

[ "these", "complexes", "are", "coordinately", "expressed", "except", "during", "replicative", "senescence", ",", "which", "is", "characterized", "by", "the", "down-modulation", "of", "site", "beta", "-but", "not", "site", "alpha", "-binding", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "T", "cell", "activation", "induces", "a", "parallel", "decline", "in", "both", "site", "alpha-", "and", "beta-", "binding", "activities", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "t", "cell", "activation", "induces", "a", "parallel", "decline", "in", "both", "site", "alpha-", "and", "beta-", "binding", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CD4+", "and", "CD8+", "T", "cells", "differ", "in", "their", "beta-binding", "profiles", ",", "which", "may", "explain", "the", "more", "pronounced", "down-regulation", "of", "CD28", "in", "senescent", "CD8+", "T", "cells", "." ]

[ "cd4+", "and", "cd8+", "t", "cells", "differ", "in", "their", "beta-binding", "profiles", ",", "which", "may", "explain", "the", "more", "pronounced", "down-regulation", "of", "cd28", "in", "senescent", "cd8+", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "In", "vivo", "expanded", "CD4+CD28null", "and", "CD8+CD28null", "T", "cells", "uniformly", "lack", "alpha-", "and", "beta-", "bound", "complexes", ",", "resembling", "the", "pattern", "seen", "in", "chronically", "activated", "cells", "and", "not", "of", "senescent", "cells", "." ]

[ "in", "vivo", "expanded", "cd4+cd28null", "and", "cd8+cd28null", "t", "cells", "uniformly", "lack", "alpha-", "and", "beta-", "bound", "complexes", ",", "resembling", "the", "pattern", "seen", "in", "chronically", "activated", "cells", "and", "not", "of", "senescent", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Attenuation", "of", "HLA-DR", "expression", "by", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "Mycobacterium", "tuberculosis", "is", "related", "to", "intracellular", "sequestration", "of", "immature", "class", "II", "heterodimers", "." ]

[ "attenuation", "of", "hla-dr", "expression", "by", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "mycobacterium", "tuberculosis", "is", "related", "to", "intracellular", "sequestration", "of", "immature", "class", "ii", "heterodimers", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "MHC", "class", "II", "expression", "was", "examined", "in", "macrophages", "infected", "with", "Mycobacterium", "tuberculosis", "." ]

[ "mhc", "class", "ii", "expression", "was", "examined", "in", "macrophages", "infected", "with", "mycobacterium", "tuberculosis", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O" ]

[ "IFN-gamma", "increased", "the", "surface", "expression", "of", "class", "II", "molecules", "in", "THP-1", "cells", "and", "this", "was", "markedly", "reduced", "in", "cells", "infected", "with", "M", ".", "tuberculosis", "." ]

[ "ifn-gamma", "increased", "the", "surface", "expression", "of", "class", "ii", "molecules", "in", "thp-1", "cells", "and", "this", "was", "markedly", "reduced", "in", "cells", "infected", "with", "m", ".", "tuberculosis", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O" ]

[ "Despite", "this", "effect", ",", "steady", "state", "levels", "of", "HLA-DRalpha", ",", "HLA-DRbeta", ",", "and", "invariant", "(", "Ii", ")", "chains", "were", "equivalent", "in", "control", "and", "infected", "cells", "." ]

[ "despite", "this", "effect", ",", "steady", "state", "levels", "of", "hla-dralpha", ",", "hla-drbeta", ",", "and", "invariant", "(", "ii", ")", "chains", "were", "equivalent", "in", "control", "and", "infected", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Metabolic", "labeling", "combined", "with", "pulse-chase", "experiments", "and", "biochemical", "analysis", "showed", "that", "the", "majority", "of", "class", "II", "molecules", "in", "infected", "cells", "became", "resistant", "to", "endoglycosidase", "H", ",", "consistent", "with", "normal", "Golgi", "processing", "." ]

[ "metabolic", "labeling", "combined", "with", "pulse-chase", "experiments", "and", "biochemical", "analysis", "showed", "that", "the", "majority", "of", "class", "ii", "molecules", "in", "infected", "cells", "became", "resistant", "to", "endoglycosidase", "h", ",", "consistent", "with", "normal", "golgi", "processing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-cell_component", "O", "O" ]

[ "However", ",", "results", "of", "intracellular", "staining", "and", "dual", "color", "confocal", "microscopy", "revealed", "a", "significant", "defect", "in", "transport", "of", "newly", "synthesized", "class", "II", "molecules", "through", "the", "endocytic", "compartment", "." ]

[ "however", ",", "results", "of", "intracellular", "staining", "and", "dual", "color", "confocal", "microscopy", "revealed", "a", "significant", "defect", "in", "transport", "of", "newly", "synthesized", "class", "ii", "molecules", "through", "the", "endocytic", "compartment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Thus", ",", "compared", "with", "findings", "in", "control", "cells", ",", "class", "II", "molecules", "in", "infected", "cells", "colocalized", "to", "a", "minimal", "extent", "with", "a", "lysosomal-associated", "membrane", "protein-1", "+", "endosomal", "compartment", "." ]

[ "thus", ",", "compared", "with", "findings", "in", "control", "cells", ",", "class", "ii", "molecules", "in", "infected", "cells", "colocalized", "to", "a", "minimal", "extent", "with", "a", "lysosomal-associated", "membrane", "protein-1", "+", "endosomal", "compartment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "in", "contrast", "to", "control", "cells", ",", "class", "II", "molecules", "in", "infected", "cells", "failed", "to", "colocalize", "with", "endocytosed", "BSA", "under", "conditions", "where", "this", "marker", "is", "known", "to", "label", "late", "endosomes", ",", "lysosomes", ",", "and", "the", "MHC", "class", "II", "compartment", "." ]

[ "in", "addition", ",", "in", "contrast", "to", "control", "cells", ",", "class", "ii", "molecules", "in", "infected", "cells", "failed", "to", "colocalize", "with", "endocytosed", "bsa", "under", "conditions", "where", "this", "marker", "is", "known", "to", "label", "late", "endosomes", ",", "lysosomes", ",", "and", "the", "mhc", "class", "ii", "compartment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-cell_component", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Consistent", "with", "defective", "transport", "along", "the", "endocytic", "pathway", ",", "the", "maturation", "of", "SDS-stable", "class", "II", "alphabeta", "dimers", "--dependent", "upon", "removal", "of", "Ii", "chain", "and", "peptide", "loading", "of", "class", "II", "dimers", "in", "the", "MHC", "class", "II", "compartment", "--was", "markedly", "impaired", "in", "M", ".", "tuberculosis", "-infected", "cells", "." ]

[ "consistent", "with", "defective", "transport", "along", "the", "endocytic", "pathway", ",", "the", "maturation", "of", "sds-stable", "class", "ii", "alphabeta", "dimers", "--dependent", "upon", "removal", "of", "ii", "chain", "and", "peptide", "loading", "of", "class", "ii", "dimers", "in", "the", "mhc", "class", "ii", "compartment", "--was", "markedly", "impaired", "in", "m", ".", "tuberculosis", "-infected", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "These", "findings", "indicate", "that", "defective", "transport", "and", "processing", "of", "class", "II", "molecules", "through", "the", "endosomal/lysosomal", "system", "is", "responsible", "for", "diminished", "cell", "surface", "expression", "of", "MHC", "class", "II", "molecules", "in", "cells", "infected", "with", "M", ".", "tuberculosis", "." ]

[ "these", "findings", "indicate", "that", "defective", "transport", "and", "processing", "of", "class", "ii", "molecules", "through", "the", "endosomal/lysosomal", "system", "is", "responsible", "for", "diminished", "cell", "surface", "expression", "of", "mhc", "class", "ii", "molecules", "in", "cells", "infected", "with", "m", ".", "tuberculosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O" ]

[ "IL-10", "inhibits", "nuclear", "factor-kappa", "B/Rel", "nuclear", "activity", "in", "CD3-stimulated", "human", "peripheral", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "il-10", "inhibits", "nuclear", "factor-kappa", "b/rel", "nuclear", "activity", "in", "cd3-stimulated", "human", "peripheral", "t", "lymphocytes", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "IL-10", "markedly", "reduces", "nuclear", "factor", "(", "NF", ")", "-kappa", "B/Rel", "nuclear", "activity", "induced", "in", "PBMC", "by", "stimulation", "with", "the", "anti-CD3", "mAb", "OKT3", "." ]

[ "il-10", "markedly", "reduces", "nuclear", "factor", "(", "nf", ")", "-kappa", "b/rel", "nuclear", "activity", "induced", "in", "pbmc", "by", "stimulation", "with", "the", "anti-cd3", "mab", "okt3", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "inhibition", "is", "exerted", "specifically", "on", "the", "NF-kappa", "B/Rel", "activation", "induced", "by", "mAb", "OKT3", ",", "and", "not", "that", "produced", "by", "PMA", "." ]

[ "the", "inhibition", "is", "exerted", "specifically", "on", "the", "nf-kappa", "b/rel", "activation", "induced", "by", "mab", "okt3", ",", "and", "not", "that", "produced", "by", "pma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "As", "judged", "by", "supershifting", "the", "DNA-protein", "complexes", "with", "Abs", "recognizing", "specific", "components", "of", "the", "NF-kappa", "B/Rel", "protein", "family", ",", "the", "p50/p65", "(", "Rel", "A", ")", "heterodimeric", "form", "of", "NF-kappa", "B", "is", "primarily", "affected", "." ]

[ "as", "judged", "by", "supershifting", "the", "dna-protein", "complexes", "with", "abs", "recognizing", "specific", "components", "of", "the", "nf-kappa", "b/rel", "protein", "family", ",", "the", "p50/p65", "(", "rel", "a", ")", "heterodimeric", "form", "of", "nf-kappa", "b", "is", "primarily", "affected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "maximal", "effect", "is", "observed", "at", "the", "IL-10", "concentration", "of", "20", "U/ml", "." ]

[ "the", "maximal", "effect", "is", "observed", "at", "the", "il-10", "concentration", "of", "20", "u/ml", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-10", "inhibitory", "activity", "is", "exerted", "on", "T", "lymphocytes", "and", "is", "mediated", "by", "monocytes", "." ]

[ "il-10", "inhibitory", "activity", "is", "exerted", "on", "t", "lymphocytes", "and", "is", "mediated", "by", "monocytes", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Indeed", ",", "monocytes", "pretreated", "with", "IL-10", "are", "able", "so", "inhibit", "NF-kappa", "B", "nuclear", "activity", "in", "purified", "T", "lymphocytes", "stimulated", "with", "OKT3", "." ]

[ "indeed", ",", "monocytes", "pretreated", "with", "il-10", "are", "able", "so", "inhibit", "nf-kappa", "b", "nuclear", "activity", "in", "purified", "t", "lymphocytes", "stimulated", "with", "okt3", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Soluble", "factors", "do", "not", "appear", "to", "be", "involved", "in", "the", "mechanism", "of", "inhibition", "." ]

[ "soluble", "factors", "do", "not", "appear", "to", "be", "involved", "in", "the", "mechanism", "of", "inhibition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "other", "hand", ",", "the", "up-regulation", "of", "CD80", "Ag", ",", "found", "on", "monocytes", "obtained", "from", "PBMC", "incubated", "with", "OKT3", ",", "is", "not", "detected", "after", "addition", "of", "IL-10", ",", "and", "the", "anti-CD28", "mAb", "CLB-CD28/1", "restores", "the", "NF-kappa", "B/Rel", "nuclear", "activity", "in", "IL-10", "-inhibited", "lymphocytes", "." ]

[ "on", "the", "other", "hand", ",", "the", "up-regulation", "of", "cd80", "ag", ",", "found", "on", "monocytes", "obtained", "from", "pbmc", "incubated", "with", "okt3", ",", "is", "not", "detected", "after", "addition", "of", "il-10", ",", "and", "the", "anti-cd28", "mab", "clb-cd28/1", "restores", "the", "nf-kappa", "b/rel", "nuclear", "activity", "in", "il-10", "-inhibited", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "the", "NF-kappa", "B/Rel", "inhibition", "might", "be", "ascribed", "to", "a", "lack", "of", "cooperation", "between", "accessory", "cells", "and", "T", "lymphocytes", ",", "resulting", "from", "down-regulation", "of", "a", "costimulatory", "molecule", ",", "such", "as", "CD80", ",", "produced", "by", "IL-10", "on", "activated", "monocytes", "." ]

[ "therefore", ",", "the", "nf-kappa", "b/rel", "inhibition", "might", "be", "ascribed", "to", "a", "lack", "of", "cooperation", "between", "accessory", "cells", "and", "t", "lymphocytes", ",", "resulting", "from", "down-regulation", "of", "a", "costimulatory", "molecule", ",", "such", "as", "cd80", ",", "produced", "by", "il-10", "on", "activated", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "IL-10", "can", "inhibit", "the", "induction", "of", "NF-kappa", "B/Rel", "nuclear", "activity", "in", "CD3-stimulated", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "our", "results", "demonstrate", "that", "il-10", "can", "inhibit", "the", "induction", "of", "nf-kappa", "b/rel", "nuclear", "activity", "in", "cd3-stimulated", "t", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_line", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Since", "inappropriate", "activation", "of", "kappa", "B-driven", "genes", "has", "a", "physiopathologic", "role", "in", "a", "number", "of", "diseases", ",", "such", "as", "HIV", "infection", ",", "our", "findings", "support", "the", "possibility", "of", "using", "this", "cytokine", "to", "suppress", "an", "undesirable", "activation", "of", "these", "transcription", "factors", "." ]

[ "since", "inappropriate", "activation", "of", "kappa", "b-driven", "genes", "has", "a", "physiopathologic", "role", "in", "a", "number", "of", "diseases", ",", "such", "as", "hiv", "infection", ",", "our", "findings", "support", "the", "possibility", "of", "using", "this", "cytokine", "to", "suppress", "an", "undesirable", "activation", "of", "these", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "CD30", "is", "a", "CD40", "-inducible", "molecule", "that", "negatively", "regulates", "CD40", "-mediated", "immunoglobulin", "class", "switching", "in", "non-antigen-selected", "human", "B", "cells", "." ]

[ "cd30", "is", "a", "cd40", "-inducible", "molecule", "that", "negatively", "regulates", "cd40", "-mediated", "immunoglobulin", "class", "switching", "in", "non-antigen-selected", "human", "b", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "We", "used", "our", "monoclonal", "model", "of", "germinal", "center", "maturation", ",", "CL-01", "B", "cells", ",", "to", "investigate", "the", "role", "of", "CD30", "in", "human", "B", "cell", "differentiation", "." ]

[ "we", "used", "our", "monoclonal", "model", "of", "germinal", "center", "maturation", ",", "cl-01", "b", "cells", ",", "to", "investigate", "the", "role", "of", "cd30", "in", "human", "b", "cell", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "CL-01", "cells", "are", "IgM", "+", "IgD", "+", "CD30", "+", "and", "switch", "to", "IgG", ",", "IgA", ",", "and", "IgE", "when", "exposed", "to", "CD40L", "and", "IL-4", "." ]

[ "cl-01", "cells", "are", "igm", "+", "igd", "+", "cd30", "+", "and", "switch", "to", "igg", ",", "iga", ",", "and", "ige", "when", "exposed", "to", "cd40l", "and", "il-4", "." ]

[ "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Switching", "is", "hampered", "by", "CD30", "coengagement", ",", "possibly", "through", "interference", "with", "the", "CD40", "-mediated", "NF-kappaB", "-dependent", "transcriptional", "activation", "of", "downstream", "C", "(", "H", ")", "genes", "." ]

[ "switching", "is", "hampered", "by", "cd30", "coengagement", ",", "possibly", "through", "interference", "with", "the", "cd40", "-mediated", "nf-kappab", "-dependent", "transcriptional", "activation", "of", "downstream", "c", "(", "h", ")", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "The", "physiological", "relevance", "of", "this", "phenomenon", "is", "emphasized", "by", "similar", "CD30", "-mediated", "effects", "in", "naive", "B", "cells", "." ]

[ "the", "physiological", "relevance", "of", "this", "phenomenon", "is", "emphasized", "by", "similar", "cd30", "-mediated", "effects", "in", "naive", "b", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Expression", "of", "CD30", "by", "these", "cells", "is", "induced", "by", "CD40L", "but", "is", "inhibited", "by", "B", "cell", "receptor", "coengagement", "and/or", "exposure", "to", "IL-6", "and", "IL-12", "." ]

[ "expression", "of", "cd30", "by", "these", "cells", "is", "induced", "by", "cd40l", "but", "is", "inhibited", "by", "b", "cell", "receptor", "coengagement", "and/or", "exposure", "to", "il-6", "and", "il-12", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Our", "data", "suggest", "that", "CD30", "critically", "regulates", "the", "CD40", "-mediated", "differentiation", "of", "non-antigen-selected", "human", "B", "cells", "." ]

[ "our", "data", "suggest", "that", "cd30", "critically", "regulates", "the", "cd40", "-mediated", "differentiation", "of", "non-antigen-selected", "human", "b", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Inducible", "nitric", "oxide", ":", "an", "autoregulatory", "feedback", "inhibitor", "of", "vascular", "inflammation", "." ]

[ "inducible", "nitric", "oxide", ":", "an", "autoregulatory", "feedback", "inhibitor", "of", "vascular", "inflammation", "." ]

[ "B-inorganic", "B-inorganic", "I-inorganic", "O", "O", "B-inorganic", "I-inorganic", "I-inorganic", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Inducible", "nitric", "oxide", "(", "iNO", ")", "is", "produced", "at", "sites", "of", "vascular", "inflammation", "by", "resident", "and", "nonresident", "vascular", "wall", "cells", ",", "but", "its", "role", "in", "the", "inflammatory", "process", "is", "not", "known", "." ]

[ "inducible", "nitric", "oxide", "(", "ino", ")", "is", "produced", "at", "sites", "of", "vascular", "inflammation", "by", "resident", "and", "nonresident", "vascular", "wall", "cells", ",", "but", "its", "role", "in", "the", "inflammatory", "process", "is", "not", "known", "." ]

[ "B-inorganic", "B-inorganic", "I-inorganic", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "show", "that", "a", "novel", "function", "of", "iNO", "is", "to", "terminate", "inflammatory", "processes", "." ]

[ "in", "this", "study", ",", "we", "show", "that", "a", "novel", "function", "of", "ino", "is", "to", "terminate", "inflammatory", "processes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "find", "that", "iNO", "produced", "by", "murine", "macrophage-like", "cells", ",", "RAW264", ".", "7", ",", "can", "inhibit", "cytokine", "-induced", "endothelial", "cell", "activation", "in", "a", "separated", "and", "mixed", "endothelial-RAW264", ".", "7", "coculture", "system", "." ]

[ "we", "find", "that", "ino", "produced", "by", "murine", "macrophage-like", "cells", ",", "raw264", ".", "7", ",", "can", "inhibit", "cytokine", "-induced", "endothelial", "cell", "activation", "in", "a", "separated", "and", "mixed", "endothelial-raw264", ".", "7", "coculture", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "iNO", "production", "and", "endothelial", "VCAM-1", "expression", "were", "induced", "simultaneously", "with", "bacterial", "LPS", "and", "murine-specific", "IFN-gamma", "." ]

[ "both", "ino", "production", "and", "endothelial", "vcam-1", "expression", "were", "induced", "simultaneously", "with", "bacterial", "lps", "and", "murine-specific", "ifn-gamma", "." ]

[ "O", "B-inorganic", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "iNO", "synthase", "(", "iNOS", ")", "activity", "with", "N", "omega-monomethyl-L-arginine", "in", "endothelial-RAW264", ".", "7", "cocultures", ",", "stimulated", "with", "murine-specific", "IFN-gamma", "and", "LPS", ",", "decreased", "iNO", "production", "by", "86%", ",", "augmented", "VCAM-1", "and", "iNOS", "expression", "in", "endothelial", "and", "RAW264", ".", "7", "cells", ",", "respectively", ",", "and", "increased", "monocyte", "adhesion", "to", "the", "endothelial", "cell", "surface", "." ]

[ "inhibition", "of", "ino", "synthase", "(", "inos", ")", "activity", "with", "n", "omega-monomethyl-l-arginine", "in", "endothelial-raw264", ".", "7", "cocultures", ",", "stimulated", "with", "murine-specific", "ifn-gamma", "and", "lps", ",", "decreased", "ino", "production", "by", "86%", ",", "augmented", "vcam-1", "and", "inos", "expression", "in", "endothelial", "and", "raw264", ".", "7", "cells", ",", "respectively", ",", "and", "increased", "monocyte", "adhesion", "to", "the", "endothelial", "cell", "surface", "." ]

[ "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "I-amino_acid_monomer", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "Transient", "transfection", "studies", "using", "various", "VCAM-1", "promoter", "constructs", "demonstrated", "that", "inhibitory", "effects", "of", "iNO", "on", "VCAM-1", "gene", "transcription", "were", "mediated", ",", "in", "part", ",", "by", "inhibitory", "effects", "of", "iNO", "on", "kappa", "B", "cis-acting", "elements", "." ]

[ "transient", "transfection", "studies", "using", "various", "vcam-1", "promoter", "constructs", "demonstrated", "that", "inhibitory", "effects", "of", "ino", "on", "vcam-1", "gene", "transcription", "were", "mediated", ",", "in", "part", ",", "by", "inhibitory", "effects", "of", "ino", "on", "kappa", "b", "cis-acting", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-inorganic", "O", "B-protein_molecule", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-inorganic", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "Immunofluorescence", "studies", "using", "an", "Ab", "to", "the", "RelA", "(", "p65", ")", "subunit", "of", "nuclear", "factor-kappa", "B", "revealed", "that", "iNO", "inhibited", "the", "activation", "of", "nuclear", "factor-kappa", "B", "." ]

[ "immunofluorescence", "studies", "using", "an", "ab", "to", "the", "rela", "(", "p65", ")", "subunit", "of", "nuclear", "factor-kappa", "b", "revealed", "that", "ino", "inhibited", "the", "activation", "of", "nuclear", "factor-kappa", "b", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "These", "studies", "indicate", "that", "iNO", "attenuates", "iNOS", "expression", "in", "macrophages", "and", "inhibits", "monocyte", "adhesion", "to", "endothelial", "cells", ",", "and", "suggest", "that", "endogenously", "derived", "iNO", "may", "be", "an", "important", "autoregulatory", "inhibitor", "of", "vascular", "inflammation" ]

[ "these", "studies", "indicate", "that", "ino", "attenuates", "inos", "expression", "in", "macrophages", "and", "inhibits", "monocyte", "adhesion", "to", "endothelial", "cells", ",", "and", "suggest", "that", "endogenously", "derived", "ino", "may", "be", "an", "important", "autoregulatory", "inhibitor", "of", "vascular", "inflammation" ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-inorganic", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name" ]

[ "ALY", ",", "a", "context-dependent", "coactivator", "of", "LEF-1", "and", "AML-1", ",", "is", "required", "for", "TCRalpha", "enhancer", "function", "." ]

[ "aly", ",", "a", "context-dependent", "coactivator", "of", "lef-1", "and", "aml-1", ",", "is", "required", "for", "tcralpha", "enhancer", "function", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "LEF-1", "is", "a", "transcription", "factor", "that", "participates", "in", "the", "regulation", "of", "the", "T-cell", "receptor", "alpha", "(", "TCR", "alpha", ")", "enhancer", "by", "facilitating", "the", "assembly", "of", "multiple", "proteins", "into", "a", "higher", "order", "nucleoprotein", "complex", "." ]

[ "lef-1", "is", "a", "transcription", "factor", "that", "participates", "in", "the", "regulation", "of", "the", "t-cell", "receptor", "alpha", "(", "tcr", "alpha", ")", "enhancer", "by", "facilitating", "the", "assembly", "of", "multiple", "proteins", "into", "a", "higher", "order", "nucleoprotein", "complex", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "The", "function", "of", "LEF-1", "is", "dependent", ",", "in", "part", ",", "on", "the", "HMG", "domain", "that", "induces", "a", "sharp", "bend", "in", "the", "DNA", "helix", ",", "and", "on", "an", "activation", "domain", "that", "stimulates", "transcription", "only", "in", "a", "specific", "context", "of", "other", "enhancer-binding", "proteins", "." ]

[ "the", "function", "of", "lef-1", "is", "dependent", ",", "in", "part", ",", "on", "the", "hmg", "domain", "that", "induces", "a", "sharp", "bend", "in", "the", "dna", "helix", ",", "and", "on", "an", "activation", "domain", "that", "stimulates", "transcription", "only", "in", "a", "specific", "context", "of", "other", "enhancer-binding", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "With", "the", "aim", "of", "gaining", "insight", "into", "the", "function", "of", "context-dependent", "activation", "domains", ",", "we", "cloned", "ALY", ",", "a", "novel", "LEF-1", "-interacting", "protein", "." ]

[ "with", "the", "aim", "of", "gaining", "insight", "into", "the", "function", "of", "context-dependent", "activation", "domains", ",", "we", "cloned", "aly", ",", "a", "novel", "lef-1", "-interacting", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O" ]

[ "ALY", "is", "a", "ubiquitously", "expressed", ",", "nuclear", "protein", "that", "specifically", "associates", "with", "the", "activation", "domains", "of", "LEF-1", "and", "AML-1", "(", "CBF", "alpha2", ",", "PEBP2", "alpha", "(", "B", ")", ",", "which", "is", "another", "protein", "component", "of", "the", "TCR", "alpha", "enhancer", "complex", "." ]

[ "aly", "is", "a", "ubiquitously", "expressed", ",", "nuclear", "protein", "that", "specifically", "associates", "with", "the", "activation", "domains", "of", "lef-1", "and", "aml-1", "(", "cbf", "alpha2", ",", "pebp2", "alpha", "(", "b", ")", ",", "which", "is", "another", "protein", "component", "of", "the", "tcr", "alpha", "enhancer", "complex", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "ALY", "can", "increase", "DNA", "binding", "by", "both", "LEF-1", "and", "AML", "proteins", "." ]

[ "in", "addition", ",", "aly", "can", "increase", "dna", "binding", "by", "both", "lef-1", "and", "aml", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Overexpression", "of", "ALY", "stimulates", "the", "activity", "of", "the", "TCR", "alpha", "enhancer", "complex", "reconstituted", "in", "transfected", "nonlymphoid", "HeLa", "cells", ",", "whereas", "down-regulation", "of", "ALY", "by", "anti-sense", "oligonucleotides", "virtually", "eliminates", "TCR", "alpha", "enhancer", "activity", "in", "T", "cells", "." ]

[ "overexpression", "of", "aly", "stimulates", "the", "activity", "of", "the", "tcr", "alpha", "enhancer", "complex", "reconstituted", "in", "transfected", "nonlymphoid", "hela", "cells", ",", "whereas", "down-regulation", "of", "aly", "by", "anti-sense", "oligonucleotides", "virtually", "eliminates", "tcr", "alpha", "enhancer", "activity", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Similar", "to", "LEF-1", ",", "ALY", "can", "stimulate", "transcription", "in", "the", "context", "of", "the", "TCR", "alpha", "enhancer", "but", "apparently", "not", "when", "tethered", "to", "DNA", "through", "an", "heterologous", "DNA-binding", "domain", "." ]

[ "similar", "to", "lef-1", ",", "aly", "can", "stimulate", "transcription", "in", "the", "context", "of", "the", "tcr", "alpha", "enhancer", "but", "apparently", "not", "when", "tethered", "to", "dna", "through", "an", "heterologous", "dna-binding", "domain", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "propose", "that", "ALY", "mediates", "context-dependent", "transcriptional", "activation", "by", "facilitating", "the", "functional", "collaboration", "of", "multiple", "proteins", "in", "the", "TCR", "alpha", "enhancer", "complex", "." ]

[ "we", "propose", "that", "aly", "mediates", "context-dependent", "transcriptional", "activation", "by", "facilitating", "the", "functional", "collaboration", "of", "multiple", "proteins", "in", "the", "tcr", "alpha", "enhancer", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Glucocorticoid", "receptor", "regulates", "expression", "of", "L-selectin", "and", "CD11/CD18", "on", "human", "neutrophils", "[", "see", "comments", "]" ]

[ "glucocorticoid", "receptor", "regulates", "expression", "of", "l-selectin", "and", "cd11/cd18", "on", "human", "neutrophils", "[", "see", "comments", "]" ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BACKGROUND", ":", "Recent", "studies", "have", "raised", "the", "hypothesis", "that", "glucocorticoids", "could", "diminish", "the", "ability", "of", "endothelial", "cells", "to", "direct", "leukocyte", "traffic", "into", "inflamed", "tissues", "by", "inhibiting", "expression", "of", "the", "adhesion", "molecules", "endothelial-leukocyte", "adhesion", "molecule-1", "and", "intercellular", "adhesion", "molecule-1", "." ]

[ "background", ":", "recent", "studies", "have", "raised", "the", "hypothesis", "that", "glucocorticoids", "could", "diminish", "the", "ability", "of", "endothelial", "cells", "to", "direct", "leukocyte", "traffic", "into", "inflamed", "tissues", "by", "inhibiting", "expression", "of", "the", "adhesion", "molecules", "endothelial-leukocyte", "adhesion", "molecule-1", "and", "intercellular", "adhesion", "molecule-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "aim", "of", "the", "present", "study", "was", "to", "investigate", "whether", "glucocorticoids", "also", "regulate", "the", "expression", "of", "L-selectin", "and", "CD11/CD18", "integrins", "on", "human", "neutrophil", "granulocytes", "." ]

[ "the", "aim", "of", "the", "present", "study", "was", "to", "investigate", "whether", "glucocorticoids", "also", "regulate", "the", "expression", "of", "l-selectin", "and", "cd11/cd18", "integrins", "on", "human", "neutrophil", "granulocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O" ]

[ "METHODS", "AND", "RESULTS", ":", "Incubation", "of", "human", "whole", "blood", "with", "platelet-activating", "factor", "(", "PAF", ",", "1", "mumol/L", ")", "evoked", "downregulation", "of", "L-selectin", "and", "upregulation", "of", "CD11/CD18", "adhesion", "receptors", "on", "neutrophils", "as", "measured", "by", "flow", "cytometry", "." ]

[ "methods", "and", "results", ":", "incubation", "of", "human", "whole", "blood", "with", "platelet-activating", "factor", "(", "paf", ",", "1", "mumol/l", ")", "evoked", "downregulation", "of", "l-selectin", "and", "upregulation", "of", "cd11/cd18", "adhesion", "receptors", "on", "neutrophils", "as", "measured", "by", "flow", "cytometry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "While", "dexamethasone", "(", "0", ".", "1", "nmol/L", "to", "100", "mumol/L", ")", "did", "not", "affect", "expression", "of", "adhesion", "molecules", "on", "resting", "neutrophils", ",", "it", "attenuated", "the", "PAF", "-induced", "changes", "in", "L-selectin", "and", "CD18", "expression", "in", "a", "time-", "and", "concentration-dependent", "fashion", "with", "IC50", "values", "of", "31", "and", "13", "nmol/L", ",", "respectively", "." ]

[ "while", "dexamethasone", "(", "0", ".", "1", "nmol/l", "to", "100", "mumol/l", ")", "did", "not", "affect", "expression", "of", "adhesion", "molecules", "on", "resting", "neutrophils", ",", "it", "attenuated", "the", "paf", "-induced", "changes", "in", "l-selectin", "and", "cd18", "expression", "in", "a", "time-", "and", "concentration-dependent", "fashion", "with", "ic50", "values", "of", "31", "and", "13", "nmol/l", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "effects", "of", "dexamethasone", "were", "completely", "aborted", "by", "RU-486", "(", "10", "mumol/L", ")", ",", "which", "blocks", "transcriptional", "activation", "of", "the", "glucocorticoid", "receptor", ",", "and", "by", "the", "protein", "synthesis", "inhibitor", "cycloheximide", "(", "35", ".", "5", "mumol/L", ")", "." ]

[ "these", "effects", "of", "dexamethasone", "were", "completely", "aborted", "by", "ru-486", "(", "10", "mumol/l", ")", ",", "which", "blocks", "transcriptional", "activation", "of", "the", "glucocorticoid", "receptor", ",", "and", "by", "the", "protein", "synthesis", "inhibitor", "cycloheximide", "(", "35", ".", "5", "mumol/l", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dexamethasone", ",", "up", "to", "a", "concentration", "of", "1", "mumol/L", ",", "neither", "affected", "significantly", "the", "release", "of", "granule", "enzymes", "nor", "interfered", "with", "PAF", "binding", "to", "its", "membrane", "receptors", "." ]

[ "dexamethasone", ",", "up", "to", "a", "concentration", "of", "1", "mumol/l", ",", "neither", "affected", "significantly", "the", "release", "of", "granule", "enzymes", "nor", "interfered", "with", "paf", "binding", "to", "its", "membrane", "receptors", "." ]

[ "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "CONCLUSIONS", ":", "Our", "results", "show", "that", "glucocorticoids", "at", "clinically", "relevant", "concentrations", "exert", "specific", "actions", "on", "expression", "of", "adhesion", "molecules", "on", "activated", "neutrophils", ",", "which", "are", "mediated", "through", "ligation", "of", "glucocorticoid", "receptors", "and", "induction", "of", "protein", "synthesis", ",", "and", "suggest", "a", "novel", "mechanism", "by", "which", "anti-inflammatory", "corticosteroids", "may", "inhibit", "leukocyte", "accumulation", "." ]

[ "conclusions", ":", "our", "results", "show", "that", "glucocorticoids", "at", "clinically", "relevant", "concentrations", "exert", "specific", "actions", "on", "expression", "of", "adhesion", "molecules", "on", "activated", "neutrophils", ",", "which", "are", "mediated", "through", "ligation", "of", "glucocorticoid", "receptors", "and", "induction", "of", "protein", "synthesis", ",", "and", "suggest", "a", "novel", "mechanism", "by", "which", "anti-inflammatory", "corticosteroids", "may", "inhibit", "leukocyte", "accumulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Adherence-dependent", "increase", "in", "human", "monocyte", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "is", "associated", "with", "increases", "in", "c-fos", ",", "c-jun", ",", "and", "EGR2", "mRNA", "." ]

[ "adherence-dependent", "increase", "in", "human", "monocyte", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "is", "associated", "with", "increases", "in", "c-fos", ",", "c-jun", ",", "and", "egr2", "mrna", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Adherence", "is", "an", "important", "initial", "step", "in", "the", "transition", "of", "a", "circulating", "monocyte", "to", "a", "tissue", "macrophage", "." ]

[ "adherence", "is", "an", "important", "initial", "step", "in", "the", "transition", "of", "a", "circulating", "monocyte", "to", "a", "tissue", "macrophage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "This", "differentiation", "is", "accompanied", "by", "an", "augmented", "capacity", "to", "generate", "growth", "factors", "." ]

[ "this", "differentiation", "is", "accompanied", "by", "an", "augmented", "capacity", "to", "generate", "growth", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "We", "hypothesized", "that", "adherence", "itself", "might", "be", "an", "important", "trigger", "for", "a", "sequence", "of", "gene", "activation", "culminating", "in", "cells", "with", "increased", "mRNA", "encoding", "profibrotic", "growth", "factors", "such", "as", "platelet-derived", "growth", "factor", "B", "subunit", "(", "PDGF", "[", "B", "]", ")", "and", "transforming", "growth", "factor-beta", "(", "TGF-beta", ")", "." ]

[ "we", "hypothesized", "that", "adherence", "itself", "might", "be", "an", "important", "trigger", "for", "a", "sequence", "of", "gene", "activation", "culminating", "in", "cells", "with", "increased", "mrna", "encoding", "profibrotic", "growth", "factors", "such", "as", "platelet-derived", "growth", "factor", "b", "subunit", "(", "pdgf", "[", "b", "]", ")", "and", "transforming", "growth", "factor-beta", "(", "tgf-beta", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "After", "in", "vitro", "adherence", ",", "human", "monocytes", "had", "a", "biphasic", "increase", "in", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "with", "peaks", "at", "6", "h", "and", "13", "d", "." ]

[ "after", "in", "vitro", "adherence", ",", "human", "monocytes", "had", "a", "biphasic", "increase", "in", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "with", "peaks", "at", "6", "h", "and", "13", "d", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "increase", "in", "TGF-beta", "mRNA", "was", "observed", "." ]

[ "no", "increase", "in", "tgf-beta", "mrna", "was", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "6-h", "increase", "in", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "was", "adherence", "dependent", ",", "and", "in", "addition", ",", "was", "abrogated", "when", "the", "cytoskeletal", "integrity", "was", "compromised", "by", "cytochalasin", "D", "." ]

[ "the", "6-h", "increase", "in", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "was", "adherence", "dependent", ",", "and", "in", "addition", ",", "was", "abrogated", "when", "the", "cytoskeletal", "integrity", "was", "compromised", "by", "cytochalasin", "d", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O" ]

[ "The", "6-h", "increase", "in", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "was", "unaltered", "by", "adherence", "in", "the", "presence", "of", "the", "monocyte", "stimulus", "lipopolysaccharide", "." ]

[ "the", "6-h", "increase", "in", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "was", "unaltered", "by", "adherence", "in", "the", "presence", "of", "the", "monocyte", "stimulus", "lipopolysaccharide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O" ]

[ "Adherence", "to", "either", "fibronectin", "or", "collagen-coated", "plastic", "had", "little", "consistent", "effect", "on", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "accumulation", "." ]

[ "adherence", "to", "either", "fibronectin", "or", "collagen-coated", "plastic", "had", "little", "consistent", "effect", "on", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "accumulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O" ]

[ "The", "increased", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "observed", "in", "adherent", "monocytes", "was", "accompanied", "by", "increases", "in", "mRNAs", "of", "the", "early", "growth", "response", "genes", "c-fos", "(", "maximal", "at", "20", "min", ")", ",", "c-jun", ",", "and", "EGR2", "(", "maximal", "at", "6-24", "h", ")", "." ]

[ "the", "increased", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "observed", "in", "adherent", "monocytes", "was", "accompanied", "by", "increases", "in", "mrnas", "of", "the", "early", "growth", "response", "genes", "c-fos", "(", "maximal", "at", "20", "min", ")", ",", "c-jun", ",", "and", "egr2", "(", "maximal", "at", "6-24", "h", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "increase", "in", "c-jun", "and", "EGR2", ",", "but", "not", "c-fos", ",", "mRNA", "was", "also", "abrogated", "by", "cytochalasin", "D", "." ]

[ "the", "increase", "in", "c-jun", "and", "egr2", ",", "but", "not", "c-fos", ",", "mrna", "was", "also", "abrogated", "by", "cytochalasin", "d", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O" ]

[ "These", "observations", "suggest", "that", "adherence", "results", "in", "increases", "of", "c-fos", ",", "c-jun", ",", "EGR2", ",", "and", "PDGF", "(", "B", ")", "mRNA", "." ]

[ "these", "observations", "suggest", "that", "adherence", "results", "in", "increases", "of", "c-fos", ",", "c-jun", ",", "egr2", ",", "and", "pdgf", "(", "b", ")", "mrna", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "increases", "in", "c-jun", ",", "EGR2", ",", "and", "PDGF", "(", "B", ")", "may", "depend", "on", "cytoskeletal", "rearrangement", "." ]

[ "in", "addition", ",", "the", "increases", "in", "c-jun", ",", "egr2", ",", "and", "pdgf", "(", "b", ")", "may", "depend", "on", "cytoskeletal", "rearrangement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Modulation", "of", "these", "events", "at", "the", "time", "of", "adherence", "offers", "a", "mechanism", "by", "which", "differential", "priming", "of", "the", "cells", "may", "be", "accomplished", "." ]

[ "modulation", "of", "these", "events", "at", "the", "time", "of", "adherence", "offers", "a", "mechanism", "by", "which", "differential", "priming", "of", "the", "cells", "may", "be", "accomplished", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Calcium", "signalling", "in", "T", "cells", "stimulated", "by", "a", "cyclophilin", "B-binding", "protein", "." ]

[ "calcium", "signalling", "in", "t", "cells", "stimulated", "by", "a", "cyclophilin", "b-binding", "protein", "." ]

[ "B-atom", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "immunosuppressant", "drug", "cyclosporin", "A", "blocks", "a", "calcium", "-dependent", "signal", "from", "the", "T-cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "that", "normally", "leads", "to", "T-cell", "activation", "." ]

[ "the", "immunosuppressant", "drug", "cyclosporin", "a", "blocks", "a", "calcium", "-dependent", "signal", "from", "the", "t-cell", "receptor", "(", "tcr", ")", "that", "normally", "leads", "to", "t-cell", "activation", "." ]

[ "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "When", "bound", "to", "cyclophilin", ",", "cyclosporin", "A", "binds", "and", "inactivates", "the", "key", "signalling", "intermediate", "calcineurin", "." ]

[ "when", "bound", "to", "cyclophilin", ",", "cyclosporin", "a", "binds", "and", "inactivates", "the", "key", "signalling", "intermediate", "calcineurin", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "To", "identify", "potential", "cellular", "homologues", "of", "cyclosporin", "A", "that", "might", "regulate", "calcium", "signalling", ",", "we", "have", "cloned", "human", "genes", "encoding", "cyclophilin", "B-binding-proteins", "using", "the", "yeast", "two-hybrid", "system", "." ]

[ "to", "identify", "potential", "cellular", "homologues", "of", "cyclosporin", "a", "that", "might", "regulate", "calcium", "signalling", ",", "we", "have", "cloned", "human", "genes", "encoding", "cyclophilin", "b-binding-proteins", "using", "the", "yeast", "two-hybrid", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "O", "O", "O" ]

[ "One", "gene", "product", ",", "when", "overexpressed", "in", "Jurkat", "T", "cells", ",", "specifically", "induced", "transcription", "from", "the", "interleukin-2", "enhancer", ",", "by", "activating", "the", "T-cell-specific", "transcription", "factors", "NF-AT", "and", "NF-IL2A", "." ]

[ "one", "gene", "product", ",", "when", "overexpressed", "in", "jurkat", "t", "cells", ",", "specifically", "induced", "transcription", "from", "the", "interleukin-2", "enhancer", ",", "by", "activating", "the", "t-cell-specific", "transcription", "factors", "nf-at", "and", "nf-il2a", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "This", "protein", ",", "termed", "calcium", "-signal", "modulating", "cyclophilin", "ligand", "(", "CAML", ")", ",", "acts", "downstream", "of", "the", "TCR", "and", "upstream", "of", "calcineurin", "by", "causing", "an", "influx", "of", "calcium", "." ]

[ "this", "protein", ",", "termed", "calcium", "-signal", "modulating", "cyclophilin", "ligand", "(", "caml", ")", ",", "acts", "downstream", "of", "the", "tcr", "and", "upstream", "of", "calcineurin", "by", "causing", "an", "influx", "of", "calcium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O" ]

[ "CAML", "appears", "to", "be", "a", "new", "participant", "in", "the", "calcium", "-signal", "transduction", "pathway", ",", "implicating", "cyclophilin", "B", "in", "calcium", "signalling", ",", "even", "in", "the", "absence", "of", "cyclosporin", "." ]

[ "caml", "appears", "to", "be", "a", "new", "participant", "in", "the", "calcium", "-signal", "transduction", "pathway", ",", "implicating", "cyclophilin", "b", "in", "calcium", "signalling", ",", "even", "in", "the", "absence", "of", "cyclosporin", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "Abnormal", "NF-kappa", "B", "activity", "in", "T", "lymphocytes", "from", "patients", "with", "systemic", "lupus", "erythematosus", "is", "associated", "with", "decreased", "p65-RelA", "protein", "expression", "." ]

[ "abnormal", "nf-kappa", "b", "activity", "in", "t", "lymphocytes", "from", "patients", "with", "systemic", "lupus", "erythematosus", "is", "associated", "with", "decreased", "p65-rela", "protein", "expression", "." ]

[ "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O" ]

[ "Numerous", "cellular", "and", "biochemical", "abnormalities", "in", "immune", "regulation", "have", "been", "described", "in", "patients", "with", "systemic", "lupus", "erythematosus", "(", "SLE", ")", ",", "including", "surface", "Ag", "receptor", "-initiated", "signaling", "events", "and", "lymphokine", "production", "." ]

[ "numerous", "cellular", "and", "biochemical", "abnormalities", "in", "immune", "regulation", "have", "been", "described", "in", "patients", "with", "systemic", "lupus", "erythematosus", "(", "sle", ")", ",", "including", "surface", "ag", "receptor", "-initiated", "signaling", "events", "and", "lymphokine", "production", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Because", "NF-kappa", "B", "contributes", "to", "the", "transcription", "of", "numerous", "inflammatory", "genes", "and", "has", "been", "shown", "to", "be", "a", "molecular", "target", "of", "antiinflammatory", "drugs", ",", "we", "sought", "to", "characterize", "the", "functional", "role", "of", "the", "NF-kappa", "B", "protein", "complex", "in", "lupus", "T", "cells", "." ]

[ "because", "nf-kappa", "b", "contributes", "to", "the", "transcription", "of", "numerous", "inflammatory", "genes", "and", "has", "been", "shown", "to", "be", "a", "molecular", "target", "of", "antiinflammatory", "drugs", ",", "we", "sought", "to", "characterize", "the", "functional", "role", "of", "the", "nf-kappa", "b", "protein", "complex", "in", "lupus", "t", "cells", "." ]

[ "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Freshly", "isolated", "T", "cells", "from", "lupus", "patients", ",", "rheumatoid", "arthritis", "(", "RA", ")", "patients", ",", "and", "normal", "individuals", "were", "activated", "physiologically", "via", "the", "TCR", "with", "anti-CD3", "and", "anti-CD28", "Abs", "to", "assess", "proximal", "membrane", "signaling", ",", "and", "with", "PMA", "and", "a", "calcium", "ionophore", "(", "A23187", ")", "to", "bypass", "membrane-mediated", "signaling", "events", "." ]

[ "freshly", "isolated", "t", "cells", "from", "lupus", "patients", ",", "rheumatoid", "arthritis", "(", "ra", ")", "patients", ",", "and", "normal", "individuals", "were", "activated", "physiologically", "via", "the", "tcr", "with", "anti-cd3", "and", "anti-cd28", "abs", "to", "assess", "proximal", "membrane", "signaling", ",", "and", "with", "pma", "and", "a", "calcium", "ionophore", "(", "a23187", ")", "to", "bypass", "membrane-mediated", "signaling", "events", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "measured", "the", "NF-kappa", "B", "binding", "activity", "in", "nuclear", "extracts", "by", "gel", "shift", "analysis", "." ]

[ "we", "measured", "the", "nf-kappa", "b", "binding", "activity", "in", "nuclear", "extracts", "by", "gel", "shift", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "When", "compared", "with", "normal", "cells", ",", "the", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "activity", "in", "SLE", "patients", "was", "significantly", "decreased", "in", "SLE", ",", "but", "not", "in", "RA", ",", "patients", "." ]

[ "when", "compared", "with", "normal", "cells", ",", "the", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "activity", "in", "sle", "patients", "was", "significantly", "decreased", "in", "sle", ",", "but", "not", "in", "ra", ",", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-other_name", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-multi_cell", "O" ]

[ "NF-kappa", "B", "binding", "activity", "was", "absent", "in", "several", "SLE", "patients", "who", "were", "not", "receiving", "any", "medication", ",", "including", "corticosteroids", "." ]

[ "nf-kappa", "b", "binding", "activity", "was", "absent", "in", "several", "sle", "patients", "who", "were", "not", "receiving", "any", "medication", ",", "including", "corticosteroids", "." ]

[ "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "Also", ",", "NF-kappa", "B", "activity", "remained", "absent", "in", "follow-up", "studies", "." ]

[ "also", ",", "nf-kappa", "b", "activity", "remained", "absent", "in", "follow-up", "studies", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "supershift", "experiments", "using", "specific", "Abs", ",", "we", "showed", "that", ",", "in", "the", "group", "of", "SLE", "patients", "who", "displayed", "undetectable", "NF-kappa", "B", "activity", ",", "p65", "complexes", "were", "not", "formed", "." ]

[ "in", "supershift", "experiments", "using", "specific", "abs", ",", "we", "showed", "that", ",", "in", "the", "group", "of", "sle", "patients", "who", "displayed", "undetectable", "nf-kappa", "b", "activity", ",", "p65", "complexes", "were", "not", "formed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "immunoblot", "analysis", "of", "nuclear", "extracts", "showed", "decreased", "or", "absent", "p65", "protein", "levels", "." ]

[ "finally", ",", "immunoblot", "analysis", "of", "nuclear", "extracts", "showed", "decreased", "or", "absent", "p65", "protein", "levels", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "As", "p65", "complexes", "are", "transcriptionally", "active", "in", "comparison", "to", "the", "p50", "homodimer", ",", "this", "novel", "finding", "may", "provide", "insight", "on", "the", "origin", "of", "abnormal", "cytokine", "or", "other", "gene", "transcription", "in", "SLE", "patients", "." ]

[ "as", "p65", "complexes", "are", "transcriptionally", "active", "in", "comparison", "to", "the", "p50", "homodimer", ",", "this", "novel", "finding", "may", "provide", "insight", "on", "the", "origin", "of", "abnormal", "cytokine", "or", "other", "gene", "transcription", "in", "sle", "patients", "." ]

[ "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "B-multi_cell", "O" ]

[ "Uncoupling", "of", "nonreceptor", "tyrosine", "kinases", "from", "PLC-gamma1", "in", "an", "SLP-76-deficient", "T", "cell", "." ]

[ "uncoupling", "of", "nonreceptor", "tyrosine", "kinases", "from", "plc-gamma1", "in", "an", "slp-76-deficient", "t", "cell", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "nonreceptor", "protein", "tyrosine", "kinases", "(", "PTKs", ")", "is", "essential", "for", "T", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "responsiveness", ";", "however", ",", "the", "function", "of", "individual", "PTK", "substrates", "is", "often", "uncertain", "." ]

[ "activation", "of", "nonreceptor", "protein", "tyrosine", "kinases", "(", "ptks", ")", "is", "essential", "for", "t", "cell", "receptor", "(", "tcr", ")", "responsiveness", ";", "however", ",", "the", "function", "of", "individual", "ptk", "substrates", "is", "often", "uncertain", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "mutant", "T", "cell", "line", "was", "isolated", "that", "lacked", "expression", "of", "SLP-76", "(", "SH2", "domain-containing", "leukocyte", "protein", "of", "76", "kilodaltons", ")", ",", "a", "hematopoietically", "expressed", "adaptor", "protein", "and", "PTK", "substrate", "." ]

[ "a", "mutant", "t", "cell", "line", "was", "isolated", "that", "lacked", "expression", "of", "slp-76", "(", "sh2", "domain-containing", "leukocyte", "protein", "of", "76", "kilodaltons", ")", ",", "a", "hematopoietically", "expressed", "adaptor", "protein", "and", "ptk", "substrate", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "SLP-76", "was", "not", "required", "for", "TCR", "-induced", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "most", "proteins", ",", "but", "was", "required", "for", "optimal", "tyrosine", "phosphorylation", "and", "activation", "of", "phospholipase", "C-gamma1", "(", "PLC-gamma1", ")", ",", "as", "well", "as", "Ras", "pathway", "activation", "." ]

[ "slp-76", "was", "not", "required", "for", "tcr", "-induced", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "most", "proteins", ",", "but", "was", "required", "for", "optimal", "tyrosine", "phosphorylation", "and", "activation", "of", "phospholipase", "c-gamma1", "(", "plc-gamma1", ")", ",", "as", "well", "as", "ras", "pathway", "activation", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "TCR", "-inducible", "gene", "expression", "was", "dependent", "on", "SLP-76", "." ]

[ "tcr", "-inducible", "gene", "expression", "was", "dependent", "on", "slp-76", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]