Datasets:

enoriega

/

GENIA-Term-Corpus

like 0

[ "Clonality", "analysis", "of", "granulocytes", "and", "T", "lymphocytes", "in", "healthy", "females", "by", "the", "PCR-based", "HUMARA", "method", "." ]

[ "clonality", "analysis", "of", "granulocytes", "and", "t", "lymphocytes", "in", "healthy", "females", "by", "the", "pcr-based", "humara", "method", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "B-other_name", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Clonality", "analysis", "utilizing", "X-chromosome", "inactivation", "has", "been", "used", "in", "the", "study", "of", "various", "diseases", ",", "including", "hematological", "malignancies", "." ]

[ "clonality", "analysis", "utilizing", "x-chromosome", "inactivation", "has", "been", "used", "in", "the", "study", "of", "various", "diseases", ",", "including", "hematological", "malignancies", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "human", "androgen", "receptor", "gene", "(", "HUMARA", ")", "assay", "is", "the", "newest", "of", "such", "methods", ",", "and", "the", "majority", "of", "the", "female", "population", "can", "be", "assessed", "by", "this", "relatively", "simple", "procedure", "." ]

[ "the", "human", "androgen", "receptor", "gene", "(", "humara", ")", "assay", "is", "the", "newest", "of", "such", "methods", ",", "and", "the", "majority", "of", "the", "female", "population", "can", "be", "assessed", "by", "this", "relatively", "simple", "procedure", "." ]

[ "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "problem", "in", "using", "these", "clonality", "analysis", "methods", ",", "however", ",", "is", "that", "there", "may", "be", "significant", "variation", "in", "Lyonization", "in", "blood", "cells", "in", "normal", "individuals", "." ]

[ "one", "problem", "in", "using", "these", "clonality", "analysis", "methods", ",", "however", ",", "is", "that", "there", "may", "be", "significant", "variation", "in", "lyonization", "in", "blood", "cells", "in", "normal", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "To", "determine", "the", "diversity", "in", "X-chromosome", "methylation", "patterns", ",", "which", "reflect", "Lyonization", ",", "assessed", "by", "the", "HUMARA", "assay", "in", "the", "supposedly", "normal", "population", ",", "we", "analyzed", "granulocytes", "and", "T", "cells", "from", "97", "relatively", "young", "(", "18-", "to", "35-year-old", ")", "healthy", "female", "volunteers", "." ]

[ "to", "determine", "the", "diversity", "in", "x-chromosome", "methylation", "patterns", ",", "which", "reflect", "lyonization", ",", "assessed", "by", "the", "humara", "assay", "in", "the", "supposedly", "normal", "population", ",", "we", "analyzed", "granulocytes", "and", "t", "cells", "from", "97", "relatively", "young", "(", "18-", "to", "35-year-old", ")", "healthy", "female", "volunteers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "We", "found", "that", "the", "methylation", "patterns", "in", "the", "two", "HUMARA", "alleles", "were", "distributed", "even", "more", "widely", ",", "both", "in", "granuloctyes", "and", "in", "T", "cells", ",", "than", "previously", "reported", "with", "other", "methods", "." ]

[ "we", "found", "that", "the", "methylation", "patterns", "in", "the", "two", "humara", "alleles", "were", "distributed", "even", "more", "widely", ",", "both", "in", "granuloctyes", "and", "in", "t", "cells", ",", "than", "previously", "reported", "with", "other", "methods", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "found", "that", "the", "deviation", "of", "methylation", "in", "granulocytes", "and", "T", "cells", "was", "well", "correlated", "." ]

[ "we", "also", "found", "that", "the", "deviation", "of", "methylation", "in", "granulocytes", "and", "t", "cells", "was", "well", "correlated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "we", "conclude", "that", "appropriate", "controls", "from", "the", "same", "individuals", ",", "such", "as", "T", "cells", "in", "the", "case", "of", "stem", "cell", "disorders", ",", "should", "always", "be", "employed", "to", "conclusively", "determine", "whether", "certain", "cells", "of", "hematopoietic", "origin", "are", "clonal", "." ]

[ "thus", ",", "we", "conclude", "that", "appropriate", "controls", "from", "the", "same", "individuals", ",", "such", "as", "t", "cells", "in", "the", "case", "of", "stem", "cell", "disorders", ",", "should", "always", "be", "employed", "to", "conclusively", "determine", "whether", "certain", "cells", "of", "hematopoietic", "origin", "are", "clonal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "Regulation", "and", "specificity", "of", "MNDA", "expression", "in", "monocytes", ",", "macrophages", ",", "and", "leukemia/B", "lymphoma", "cell", "lines", "." ]

[ "regulation", "and", "specificity", "of", "mnda", "expression", "in", "monocytes", ",", "macrophages", ",", "and", "leukemia/b", "lymphoma", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "The", "expression", "of", "the", "human", "myeloid", "cell", "nuclear", "differentiation", "antigen", "(", "MNDA", ")", "was", "observed", "specifically", "in", "cells", "of", "the", "granulocyte-macrophage", "lineage", "in", "our", "earlier", "reports", "." ]

[ "the", "expression", "of", "the", "human", "myeloid", "cell", "nuclear", "differentiation", "antigen", "(", "mnda", ")", "was", "observed", "specifically", "in", "cells", "of", "the", "granulocyte-macrophage", "lineage", "in", "our", "earlier", "reports", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "specificity", "of", "MNDA", "expression", "for", "cells", "in", "the", "granulocyte-macrophage", "lineage", "was", "reexamined", "in", "cell", "lines", "established", "from", "patients", "with", "Philadelphia", "chromosome-positive", "chronic", "myeloid", "leukemia", "." ]

[ "the", "specificity", "of", "mnda", "expression", "for", "cells", "in", "the", "granulocyte-macrophage", "lineage", "was", "reexamined", "in", "cell", "lines", "established", "from", "patients", "with", "philadelphia", "chromosome-positive", "chronic", "myeloid", "leukemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Cell", "lines", "that", "expressed", "MNDA", "exhibited", "myeloid", "cell", "features", "and", "granulocyte", "or", "monocyte", "differentiation", "could", "be", "induced", "in", "vitro", ",", "while", "cell", "lines", "exhibiting", "properties", "of", "very", "early", "stage", "cells", "or", "multipotential", "cells", "did", "not", "express", "MNDA", "." ]

[ "cell", "lines", "that", "expressed", "mnda", "exhibited", "myeloid", "cell", "features", "and", "granulocyte", "or", "monocyte", "differentiation", "could", "be", "induced", "in", "vitro", ",", "while", "cell", "lines", "exhibiting", "properties", "of", "very", "early", "stage", "cells", "or", "multipotential", "cells", "did", "not", "express", "mnda", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Cells", "originating", "from", "cases", "of", "Burkitt's", "lymphoma", "were", "negative", "." ]

[ "cells", "originating", "from", "cases", "of", "burkitt's", "lymphoma", "were", "negative", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "By", "contrast", ",", "three", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "(", "immortalized", "in", "vitro", "with", "Epstein-Barr", "virus", ")", "were", "weakly", "positive", "and", "MNDA", "was", "up-regulated", "by", "interferon-alpha", "(", "IFN-alpha", ")", "treatment", "." ]

[ "by", "contrast", ",", "three", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "(", "immortalized", "in", "vitro", "with", "epstein-barr", "virus", ")", "were", "weakly", "positive", "and", "mnda", "was", "up-regulated", "by", "interferon-alpha", "(", "ifn-alpha", ")", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "As", "we", "reported", "previously", ",", "MNDA", "mRNA", "level", "in", "adherent", "monocytes", "is", "elevated", "by", "IFN-alpha", ";", "in", "this", "study", ",", "we", "further", "assessed", "MNDA", "expression", "in", "in", "vitro", "monocyte-derived", "macrophages", "." ]

[ "as", "we", "reported", "previously", ",", "mnda", "mrna", "level", "in", "adherent", "monocytes", "is", "elevated", "by", "ifn-alpha", ";", "in", "this", "study", ",", "we", "further", "assessed", "mnda", "expression", "in", "in", "vitro", "monocyte-derived", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Three", "additional", "agents", "(", "endotoxin", ",", "phytohemagglutinin", ",", "and", "phorbol", "ester", ")", "and", "other", "conditions", "that", "affect", "function", ",", "cytokine", "production", ",", "differentiation", ",", "and/or", "growth", "of", "monocytes", "were", "examined", "for", "their", "ability", "to", "alter", "MNDA", "expression", "." ]

[ "three", "additional", "agents", "(", "endotoxin", ",", "phytohemagglutinin", ",", "and", "phorbol", "ester", ")", "and", "other", "conditions", "that", "affect", "function", ",", "cytokine", "production", ",", "differentiation", ",", "and/or", "growth", "of", "monocytes", "were", "examined", "for", "their", "ability", "to", "alter", "mnda", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "The", "results", "varied", "with", "the", "agent", ",", "cell", "type", ",", "and", "stage", "of", "differentiation", "." ]

[ "the", "results", "varied", "with", "the", "agent", ",", "cell", "type", ",", "and", "stage", "of", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Changes", "in", "MNDA", "expression", "occurred", "slowly", "(", "hours", "to", "days", ")", ",", "suggesting", "that", "MNDA", "could", "mediate", "changes", "realized", "over", "a", "long", "period", "." ]

[ "changes", "in", "mnda", "expression", "occurred", "slowly", "(", "hours", "to", "days", ")", ",", "suggesting", "that", "mnda", "could", "mediate", "changes", "realized", "over", "a", "long", "period", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "also", "reveal", "a", "discordance", "in", "certain", "MNDA", "positive", "cells", "between", "steady-state", "levels", "or", "changes", "in", "levels", "of", "protein", "and", "mRNA", "indicating", "that", "the", "regulation", "of", "MNDA", "expression", "occurs", "at", "more", "than", "one", "point", "." ]

[ "the", "results", "also", "reveal", "a", "discordance", "in", "certain", "mnda", "positive", "cells", "between", "steady-state", "levels", "or", "changes", "in", "levels", "of", "protein", "and", "mrna", "indicating", "that", "the", "regulation", "of", "mnda", "expression", "occurs", "at", "more", "than", "one", "point", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Changes", "in", "MNDA", "expression", "are", "consistent", "with", "a", "role", "in", "opposing", "macrophage", "differentiation", "and", "activation", "of", "monocytes", "/macrophages", "." ]

[ "changes", "in", "mnda", "expression", "are", "consistent", "with", "a", "role", "in", "opposing", "macrophage", "differentiation", "and", "activation", "of", "monocytes", "/macrophages", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O" ]

[ "Differential", "expression", "and", "phosphorylation", "of", "CTCF", ",", "a", "c-myc", "transcriptional", "regulator", ",", "during", "differentiation", "of", "human", "myeloid", "cells", "." ]

[ "differential", "expression", "and", "phosphorylation", "of", "ctcf", ",", "a", "c-myc", "transcriptional", "regulator", ",", "during", "differentiation", "of", "human", "myeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CTCF", "is", "a", "transcriptional", "repressor", "of", "the", "c-myc", "gene", "." ]

[ "ctcf", "is", "a", "transcriptional", "repressor", "of", "the", "c-myc", "gene", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "CTCF", "has", "been", "characterized", "in", "some", "detail", ",", "there", "is", "very", "little", "information", "about", "the", "regulation", "of", "CTCF", "activity", "." ]

[ "although", "ctcf", "has", "been", "characterized", "in", "some", "detail", ",", "there", "is", "very", "little", "information", "about", "the", "regulation", "of", "ctcf", "activity", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Therefore", "we", "investigated", "CTCF", "expression", "and", "phosphorylation", "during", "induced", "differentiation", "of", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "." ]

[ "therefore", "we", "investigated", "ctcf", "expression", "and", "phosphorylation", "during", "induced", "differentiation", "of", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "found", "that", ":", "(", "i", ")", "both", "CTCF", "mRNA", "and", "protein", "are", "down-regulated", "during", "terminal", "differentiation", "in", "most", "cell", "lines", "tested", ";", "(", "ii", ")", "CTCF", "down-regulation", "is", "retarded", "and", "less", "pronounced", "than", "that", "of", "c-myc", ";", "(", "iii", ")", "CTCF", "protein", "is", "differentially", "phosphorylated", "and", "the", "phosphorylation", "profiles", "depend", "on", "the", "differentiation", "pathway", "." ]

[ "we", "found", "that", ":", "(", "i", ")", "both", "ctcf", "mrna", "and", "protein", "are", "down-regulated", "during", "terminal", "differentiation", "in", "most", "cell", "lines", "tested", ";", "(", "ii", ")", "ctcf", "down-regulation", "is", "retarded", "and", "less", "pronounced", "than", "that", "of", "c-myc", ";", "(", "iii", ")", "ctcf", "protein", "is", "differentially", "phosphorylated", "and", "the", "phosphorylation", "profiles", "depend", "on", "the", "differentiation", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "concluded", "that", "CTCF", "expression", "and", "activity", "is", "controlled", "at", "transcriptional", "and", "post-transcriptional", "levels", "." ]

[ "we", "concluded", "that", "ctcf", "expression", "and", "activity", "is", "controlled", "at", "transcriptional", "and", "post-transcriptional", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "human", "toll", "signaling", "pathway", ":", "divergence", "of", "nuclear", "factor", "kappaB", "and", "JNK", "/SAPK", "activation", "upstream", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "receptor-associated", "factor", "6", "(", "TRAF6", ")", "." ]

[ "the", "human", "toll", "signaling", "pathway", ":", "divergence", "of", "nuclear", "factor", "kappab", "and", "jnk", "/sapk", "activation", "upstream", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "receptor-associated", "factor", "6", "(", "traf6", ")", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "The", "human", "homologue", "of", "Drosophila", "Toll", "(", "hToll", ")", "is", "a", "recently", "cloned", "receptor", "of", "the", "interleukin", "1", "receptor", "(", "IL-1R", ")", "superfamily", ",", "and", "has", "been", "implicated", "in", "the", "activation", "of", "adaptive", "immunity", "." ]

[ "the", "human", "homologue", "of", "drosophila", "toll", "(", "htoll", ")", "is", "a", "recently", "cloned", "receptor", "of", "the", "interleukin", "1", "receptor", "(", "il-1r", ")", "superfamily", ",", "and", "has", "been", "implicated", "in", "the", "activation", "of", "adaptive", "immunity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Signaling", "by", "hToll", "is", "shown", "to", "occur", "through", "sequential", "recruitment", "of", "the", "adapter", "molecule", "MyD88", "and", "the", "IL-1R-associated", "kinase", "." ]

[ "signaling", "by", "htoll", "is", "shown", "to", "occur", "through", "sequential", "recruitment", "of", "the", "adapter", "molecule", "myd88", "and", "the", "il-1r-associated", "kinase", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Tumor", "necrosis", "factor", "receptor-activated", "factor", "6", "(", "TRAF6", ")", "and", "the", "nuclear", "factor", "kappaB", "(", "NF-kappaB", ")", "-inducing", "kinase", "(", "NIK", ")", "are", "both", "involved", "in", "subsequent", "steps", "of", "NF-kappaB", "activation", "." ]

[ "tumor", "necrosis", "factor", "receptor-activated", "factor", "6", "(", "traf6", ")", "and", "the", "nuclear", "factor", "kappab", "(", "nf-kappab", ")", "-inducing", "kinase", "(", "nik", ")", "are", "both", "involved", "in", "subsequent", "steps", "of", "nf-kappab", "activation", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O" ]

[ "Conversely", ",", "a", "dominant", "negative", "version", "of", "TRAF6", "failed", "to", "block", "hToll", "-induced", "activation", "of", "stress-activated", "protein", "kinase/c-Jun", "NH2-terminal", "kinases", ",", "thus", "suggesting", "an", "early", "divergence", "of", "the", "two", "pathways", "." ]

[ "conversely", ",", "a", "dominant", "negative", "version", "of", "traf6", "failed", "to", "block", "htoll", "-induced", "activation", "of", "stress-activated", "protein", "kinase/c-jun", "nh2-terminal", "kinases", ",", "thus", "suggesting", "an", "early", "divergence", "of", "the", "two", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fas", "ligation", "induces", "apoptosis", "and", "Jun", "kinase", "activation", "independently", "of", "CD45", "and", "Lck", "in", "human", "T", "cells", "." ]

[ "fas", "ligation", "induces", "apoptosis", "and", "jun", "kinase", "activation", "independently", "of", "cd45", "and", "lck", "in", "human", "t", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Stimulation", "through", "the", "Fas/APO-1", "receptor", "results", "in", "apoptosis", "through", "an", "incompletely", "characterized", "signaling", "pathway", "." ]

[ "stimulation", "through", "the", "fas/apo-1", "receptor", "results", "in", "apoptosis", "through", "an", "incompletely", "characterized", "signaling", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "More", "is", "known", "regarding", "signal", "transduction", "events", "that", "occur", "after", "ligation", "of", "the", "T-cell", "antigen", "receptor", "(", "TCR", ")", "." ]

[ "more", "is", "known", "regarding", "signal", "transduction", "events", "that", "occur", "after", "ligation", "of", "the", "t-cell", "antigen", "receptor", "(", "tcr", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "It", "has", "been", "shown", "that", "TCR", "stimulation", "requires", "both", "the", "membrane", "tyrosine", "phosphatase", ",", "CD45", ",", "and", "the", "Src-family", "kinase", ",", "Lck", ",", "to", "result", "in", "cellular", "activation", "." ]

[ "it", "has", "been", "shown", "that", "tcr", "stimulation", "requires", "both", "the", "membrane", "tyrosine", "phosphatase", ",", "cd45", ",", "and", "the", "src-family", "kinase", ",", "lck", ",", "to", "result", "in", "cellular", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Although", "prior", "studies", "suggest", "a", "role", "for", "protein", "tyrosine", "kinases", "and", "phosphatases", "in", "Fas", "signaling", ",", "we", "report", "here", "that", "Fas", "ligation", "induces", "apoptosis", "in", "T", "cells", "deficient", "in", "either", "CD45", "or", "Lck", "." ]

[ "although", "prior", "studies", "suggest", "a", "role", "for", "protein", "tyrosine", "kinases", "and", "phosphatases", "in", "fas", "signaling", ",", "we", "report", "here", "that", "fas", "ligation", "induces", "apoptosis", "in", "t", "cells", "deficient", "in", "either", "cd45", "or", "lck", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Further", ",", "in", "normal", "and", "CD45-", "or", "Lck-", "deficient", "cell", "lines", ",", "Fas", "stimulation", "results", "in", "activation", "of", "Jun", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "a", "proposed", "mediator", "of", "stress", "activation", "pathways", "." ]

[ "further", ",", "in", "normal", "and", "cd45-", "or", "lck-", "deficient", "cell", "lines", ",", "fas", "stimulation", "results", "in", "activation", "of", "jun", "kinase", "(", "jnk", ")", ",", "a", "proposed", "mediator", "of", "stress", "activation", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "also", "demonstrated", "a", "role", "for", "endogenous", "ceramide", "release", "in", "Fas-mediated", "apoptosis", "." ]

[ "previous", "studies", "have", "also", "demonstrated", "a", "role", "for", "endogenous", "ceramide", "release", "in", "fas-mediated", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O" ]

[ "We", "show", "that", "stimulation", "with", "a", "synthetic", "ceramide", "analog", "results", "in", "JNK", "activation", "as", "well", "as", "apoptosis", ",", "suggesting", "ceramide", "release", "occurs", "proximal", "to", "JNK", "activation", "in", "Fas", "signaling", "." ]

[ "we", "show", "that", "stimulation", "with", "a", "synthetic", "ceramide", "analog", "results", "in", "jnk", "activation", "as", "well", "as", "apoptosis", ",", "suggesting", "ceramide", "release", "occurs", "proximal", "to", "jnk", "activation", "in", "fas", "signaling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "suggest", "that", "although", "CD45", "and", "Lck", "are", "not", "required", "for", "Fas", "signaling", ",", "JNK", "activation", "may", "play", "an", "important", "role", "transducing", "distal", "signals", "that", "lead", "to", "apoptosis", "after", "Fas", "ligation", "." ]

[ "our", "data", "suggest", "that", "although", "cd45", "and", "lck", "are", "not", "required", "for", "fas", "signaling", ",", "jnk", "activation", "may", "play", "an", "important", "role", "transducing", "distal", "signals", "that", "lead", "to", "apoptosis", "after", "fas", "ligation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "GATA-1", "DNA", "binding", "activity", "is", "down-regulated", "in", "late", "S", "phase", "in", "erythroid", "cells", "." ]

[ "gata-1", "dna", "binding", "activity", "is", "down-regulated", "in", "late", "s", "phase", "in", "erythroid", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "have", "set", "out", "to", "test", "a", "model", "for", "tissue-specific", "gene", "expression", "that", "relies", "on", "the", "early", "replication", "of", "expressed", "genes", "to", "sequester", "limiting", "activating", "transcription", "factors", "." ]

[ "we", "have", "set", "out", "to", "test", "a", "model", "for", "tissue-specific", "gene", "expression", "that", "relies", "on", "the", "early", "replication", "of", "expressed", "genes", "to", "sequester", "limiting", "activating", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Using", "an", "erythroid", "cell", "line", ",", "we", "have", "tested", "the", "changes", "in", "the", "DNA", "binding", "activity", "of", "the", "lineage-restricted", "transcription", "factor", "GATA-1", "through", "the", "cell", "cycle", "." ]

[ "using", "an", "erythroid", "cell", "line", ",", "we", "have", "tested", "the", "changes", "in", "the", "dna", "binding", "activity", "of", "the", "lineage-restricted", "transcription", "factor", "gata-1", "through", "the", "cell", "cycle", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "find", "that", "GATA-1", "activity", "is", "low", "in", "G1", ",", "peaks", "in", "mid-S", "phase", ",", "and", "then", "decreases", "in", "G2/M", "." ]

[ "we", "find", "that", "gata-1", "activity", "is", "low", "in", "g1", ",", "peaks", "in", "mid-s", "phase", ",", "and", "then", "decreases", "in", "g2/m", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "binding", "activities", "of", "two", "ubiquitous", "transcription", "factors", ",", "Oct1", "and", "Sp1", ",", "remain", "high", "in", "G2/M", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "the", "binding", "activities", "of", "two", "ubiquitous", "transcription", "factors", ",", "oct1", "and", "sp1", ",", "remain", "high", "in", "g2/m", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "GATA-1", "protein", "and", "mRNA", "vary", "in", "a", "similar", "manner", "through", "the", "cell", "cycle", ",", "suggesting", "that", "the", "expression", "of", "the", "gene", "or", "the", "stability", "of", "its", "message", "is", "regulated", "." ]

[ "gata-1", "protein", "and", "mrna", "vary", "in", "a", "similar", "manner", "through", "the", "cell", "cycle", ",", "suggesting", "that", "the", "expression", "of", "the", "gene", "or", "the", "stability", "of", "its", "message", "is", "regulated", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "a", "number", "of", "transcription", "factors", "involved", "in", "the", "control", "of", "the", "cell", "cycle", "or", "DNA", "replication", "have", "been", "shown", "to", "peak", "in", "S", "phase", ",", "this", "is", "the", "first", "example", "of", "a", "lineage-restricted", "transcription", "factor", "displaying", "S", "phase", "-specific", "DNA", "binding", "activity", "." ]

[ "although", "a", "number", "of", "transcription", "factors", "involved", "in", "the", "control", "of", "the", "cell", "cycle", "or", "dna", "replication", "have", "been", "shown", "to", "peak", "in", "s", "phase", ",", "this", "is", "the", "first", "example", "of", "a", "lineage-restricted", "transcription", "factor", "displaying", "s", "phase", "-specific", "dna", "binding", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "interpretation", "of", "these", "data", "leads", "to", "a", "model", "in", "which", "the", "peak", "in", "GATA-1", "DNA", "binding", "amplifies", "the", "effect", "of", "early", "replication", "on", "the", "activation", "of", "erythroid-specific", "genes", "at", "the", "same", "time", "as", "preventing", "activation", "of", "non-erythroid", "genes", "containing", "GATA-responsive", "elements", "." ]

[ "one", "interpretation", "of", "these", "data", "leads", "to", "a", "model", "in", "which", "the", "peak", "in", "gata-1", "dna", "binding", "amplifies", "the", "effect", "of", "early", "replication", "on", "the", "activation", "of", "erythroid-specific", "genes", "at", "the", "same", "time", "as", "preventing", "activation", "of", "non-erythroid", "genes", "containing", "gata-responsive", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "These", "results", "may", "also", "relate", "to", "recent", "data", "implicating", "GATA-1", "function", "in", "apoptosis", "and", "cell", "cycle", "progression" ]

[ "these", "results", "may", "also", "relate", "to", "recent", "data", "implicating", "gata-1", "function", "in", "apoptosis", "and", "cell", "cycle", "progression" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name" ]

[ "Mononuclear", "leukocyte", "glucocorticoid", "receptor", "binding", "characteristics", "and", "down-regulation", "in", "major", "depression", "." ]

[ "mononuclear", "leukocyte", "glucocorticoid", "receptor", "binding", "characteristics", "and", "down-regulation", "in", "major", "depression", "." ]

[ "B-cell_type", "I-cell_type", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Some", "patients", "with", "major", "depressive", "disorder", "(", "MDD", ")", "have", "elevated", "plasma", "cortisol", "concentrations", "and", "show", "failure", "to", "suppress", "cortisol", "secretion", "upon", "administration", "of", "dexamethasone", "(", "DEX", ")", ",", "yet", "they", "do", "not", "have", "Cushingoid", "features", "." ]

[ "some", "patients", "with", "major", "depressive", "disorder", "(", "mdd", ")", "have", "elevated", "plasma", "cortisol", "concentrations", "and", "show", "failure", "to", "suppress", "cortisol", "secretion", "upon", "administration", "of", "dexamethasone", "(", "dex", ")", ",", "yet", "they", "do", "not", "have", "cushingoid", "features", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "To", "study", "whether", "this", "represents", "glucocorticoid", "(", "GC", ")", "resistance", ",", "[", "3H", "]", "-DEX-binding", "assays", "were", "used", "to", "measure", ",", "in", "vitro", ",", "the", "GC", "receptor", "affinity", "(", "1/Kd", ")", "and", "number", "(", "Bmax", ")", "in", "mononuclear", "leukocytes", "of", "11", "MDD", "patients", "and", "15", "control", "subjects", "." ]

[ "to", "study", "whether", "this", "represents", "glucocorticoid", "(", "gc", ")", "resistance", ",", "[", "3h", "]", "-dex-binding", "assays", "were", "used", "to", "measure", ",", "in", "vitro", ",", "the", "gc", "receptor", "affinity", "(", "1/kd", ")", "and", "number", "(", "bmax", ")", "in", "mononuclear", "leukocytes", "of", "11", "mdd", "patients", "and", "15", "control", "subjects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "No", "receptor", "abnormalities", "were", "detected", "in", "the", "MDD", "group", ";", "thus", "any", "cellular", "defect", "leading", "to", "a", "lack", "of", "responsiveness", "to", "GC", "in", "the", "MDD", "patients", ",", "if", "present", ",", "probably", "lies", "beyond", "the", "initial", "receptor", "binding", "." ]

[ "no", "receptor", "abnormalities", "were", "detected", "in", "the", "mdd", "group", ";", "thus", "any", "cellular", "defect", "leading", "to", "a", "lack", "of", "responsiveness", "to", "gc", "in", "the", "mdd", "patients", ",", "if", "present", ",", "probably", "lies", "beyond", "the", "initial", "receptor", "binding", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "DEX", "(", "1", ".", "0", "mg", "orally", ")", "was", "administered", "to", "study", "in", "vivo", "GC", "receptor", "down-regulation", "." ]

[ "dex", "(", "1", ".", "0", "mg", "orally", ")", "was", "administered", "to", "study", "in", "vivo", "gc", "receptor", "down-regulation", "." ]

[ "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-lipid", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Compared", "to", "the", "control", "group", ",", "fewer", "depressed", "subjects", "down-regulated", "Bmax", "after", "DEX", "." ]

[ "compared", "to", "the", "control", "group", ",", "fewer", "depressed", "subjects", "down-regulated", "bmax", "after", "dex", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "By", "paired", "t-test", ",", "Bmax", "decreased", "significantly", "in", "the", "control", "group", "but", "not", "in", "the", "depressed", "group", "." ]

[ "by", "paired", "t-test", ",", "bmax", "decreased", "significantly", "in", "the", "control", "group", "but", "not", "in", "the", "depressed", "group", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "Receptor", "number", "on", "the", "control", "day", "did", "not", "correlate", "significantly", "with", "the", "degree", "of", "receptor", "down-regulation", ",", "severity", "of", "depression", "or", "cortisol", "concentrations", "across", "all", "the", "subjects", "." ]

[ "receptor", "number", "on", "the", "control", "day", "did", "not", "correlate", "significantly", "with", "the", "degree", "of", "receptor", "down-regulation", ",", "severity", "of", "depression", "or", "cortisol", "concentrations", "across", "all", "the", "subjects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "do", "not", "lend", "support", "to", "previous", "reports", "suggesting", "that", "GC", "resistance", "in", "MDD", "results", "from", "a", "GC", "receptor-binding", "abnormality", ",", "and", "they", "emphasize", "the", "importance", "of", "considering", "receptor", "studies", "in", "the", "context", "of", "GC", "-mediated", "cell", "processes", "in", "order", "to", "identify", "the", "exact", "cellular", "defect", "(", "s", ")", "leading", "to", "GC", "resistance", "." ]

[ "these", "results", "do", "not", "lend", "support", "to", "previous", "reports", "suggesting", "that", "gc", "resistance", "in", "mdd", "results", "from", "a", "gc", "receptor-binding", "abnormality", ",", "and", "they", "emphasize", "the", "importance", "of", "considering", "receptor", "studies", "in", "the", "context", "of", "gc", "-mediated", "cell", "processes", "in", "order", "to", "identify", "the", "exact", "cellular", "defect", "(", "s", ")", "leading", "to", "gc", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O" ]

[ "A", "shortened", "life", "span", "of", "EKLF-/-", "adult", "erythrocytes", ",", "due", "to", "a", "deficiency", "of", "beta-globin", "chains", ",", "is", "ameliorated", "by", "human", "gamma-globin", "chains", "." ]

[ "a", "shortened", "life", "span", "of", "eklf-/-", "adult", "erythrocytes", ",", "due", "to", "a", "deficiency", "of", "beta-globin", "chains", ",", "is", "ameliorated", "by", "human", "gamma-globin", "chains", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O" ]

[ "Using", "homologous", "recombination", ",", "both", "EKLF", "alleles", "in", "murine", "embryonic", "stem", "(", "ES", ")", "cells", "were", "inactivated", "." ]

[ "using", "homologous", "recombination", ",", "both", "eklf", "alleles", "in", "murine", "embryonic", "stem", "(", "es", ")", "cells", "were", "inactivated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O" ]

[ "These", "EKLF-/-", "ES", "cells", "were", "capable", "of", "undergoing", "in", "vitro", "differentiation", "to", "form", "definitive", "erythroid", "colonies", "that", "were", "similar", "in", "size", "and", "number", "to", "those", "formed", "by", "wild-type", "ES", "cells", "." ]

[ "these", "eklf-/-", "es", "cells", "were", "capable", "of", "undergoing", "in", "vitro", "differentiation", "to", "form", "definitive", "erythroid", "colonies", "that", "were", "similar", "in", "size", "and", "number", "to", "those", "formed", "by", "wild-type", "es", "cells", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "However", ",", "the", "EKLF-/-", "colonies", "were", "poorly", "hemoglobinized", "and", "enucleated", "erythrocytes", "in", "these", "colonies", "contained", "numerous", "Heinz", "bodies", "." ]

[ "however", ",", "the", "eklf-/-", "colonies", "were", "poorly", "hemoglobinized", "and", "enucleated", "erythrocytes", "in", "these", "colonies", "contained", "numerous", "heinz", "bodies", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "Reverse", "transcriptase-polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT-PCR", ")", "analyses", "revealed", "that", "adult", "and", "embryonic", "globin", "genes", "were", "appropriately", "regulated", ",", "with", "the", "exception", "of", "beta", "h1-globin", ",", "which", "continued", "to", "be", "expressed", "at", "a", "very", "low", "level", "." ]

[ "reverse", "transcriptase-polymerase", "chain", "reaction", "(", "rt-pcr", ")", "analyses", "revealed", "that", "adult", "and", "embryonic", "globin", "genes", "were", "appropriately", "regulated", ",", "with", "the", "exception", "of", "beta", "h1-globin", ",", "which", "continued", "to", "be", "expressed", "at", "a", "very", "low", "level", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ratio", "of", "adult", "beta-globin/alpha-globin", "mRNA", "in", "the", "mutant", "ES", "cells", "was", "1/15", "of", "that", "in", "wild-type", "ES", "cells", "." ]

[ "the", "ratio", "of", "adult", "beta-globin/alpha-globin", "mrna", "in", "the", "mutant", "es", "cells", "was", "1/15", "of", "that", "in", "wild-type", "es", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "When", "the", "EKLF-/-", "cells", "were", "injected", "into", "blastocysts", ",", "they", "did", "not", "contribute", "at", "a", "detectable", "level", "to", "the", "mature", "erythrocyte", "compartment", "of", "the", "chimeric", "animals", ",", "based", "on", "analysis", "of", "glucose", "phosphate", "isomerase-1", "(", "GPI-1", ")", "isozymes", "and", "hemoglobins", "that", "distinguish", "ES", "cell-derived", "erythrocytes", "from", "host", "blastocyst-derived", "erythrocytes", "." ]

[ "when", "the", "eklf-/-", "cells", "were", "injected", "into", "blastocysts", ",", "they", "did", "not", "contribute", "at", "a", "detectable", "level", "to", "the", "mature", "erythrocyte", "compartment", "of", "the", "chimeric", "animals", ",", "based", "on", "analysis", "of", "glucose", "phosphate", "isomerase-1", "(", "gpi-1", ")", "isozymes", "and", "hemoglobins", "that", "distinguish", "es", "cell-derived", "erythrocytes", "from", "host", "blastocyst-derived", "erythrocytes", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "semiquantitative", "RT-PCR", "analysis", "of", "RNA", "from", "reticulocytes", "of", "the", "same", "chimeric", "animals", "suggested", "that", "the", "ES", "cell-derived", "reticulocytes", "were", "present", "at", "a", "level", "of", "6%", "to", "8%", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "semiquantitative", "rt-pcr", "analysis", "of", "rna", "from", "reticulocytes", "of", "the", "same", "chimeric", "animals", "suggested", "that", "the", "es", "cell-derived", "reticulocytes", "were", "present", "at", "a", "level", "of", "6%", "to", "8%", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "indicated", "that", "the", "EKLF-/-", "erythrocytes", "in", "adult", "animals", "must", "be", "short-lived", ",", "apparently", "due", "to", "the", "imbalance", "of", "beta-", "versus", "alpha-", "globin", "chains", ",", "leading", "to", "the", "precipitation", "of", "excess", "alpha-globin", "chains", "to", "form", "Heinz", "bodies", "." ]

[ "this", "indicated", "that", "the", "eklf-/-", "erythrocytes", "in", "adult", "animals", "must", "be", "short-lived", ",", "apparently", "due", "to", "the", "imbalance", "of", "beta-", "versus", "alpha-", "globin", "chains", ",", "leading", "to", "the", "precipitation", "of", "excess", "alpha-globin", "chains", "to", "form", "heinz", "bodies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "Consistent", "with", "this", "hypothesis", ",", "the", "short", "life", "span", "was", "ameliorated", "by", "introduction", "into", "the", "EKLF-/-", "ES", "cells", "of", "a", "human", "LCR/gamma-globin", "gene", ",", "as", "evidenced", "by", "the", "presence", "of", "ES", "cell-derived", "reticulocytes", "as", "well", "as", "mature", "erythrocytes", "in", "the", "blood", "of", "the", "chimeric", "animals", "." ]

[ "consistent", "with", "this", "hypothesis", ",", "the", "short", "life", "span", "was", "ameliorated", "by", "introduction", "into", "the", "eklf-/-", "es", "cells", "of", "a", "human", "lcr/gamma-globin", "gene", ",", "as", "evidenced", "by", "the", "presence", "of", "es", "cell-derived", "reticulocytes", "as", "well", "as", "mature", "erythrocytes", "in", "the", "blood", "of", "the", "chimeric", "animals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O" ]

[ "Selection", "and", "long-term", "persistence", "of", "reactive", "CTL", "clones", "during", "an", "EBV", "chronic", "response", "are", "determined", "by", "avidity", ",", "CD8", "variable", "contribution", "compensating", "for", "differences", "in", "TCR", "affinities", "." ]

[ "selection", "and", "long-term", "persistence", "of", "reactive", "ctl", "clones", "during", "an", "ebv", "chronic", "response", "are", "determined", "by", "avidity", ",", "cd8", "variable", "contribution", "compensating", "for", "differences", "in", "tcr", "affinities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Recent", "studies", "have", "suggested", "that", "the", "diversity", "of", "TCR", "repertoire", "after", "primary", "immunization", "is", "conserved", "in", "memory", "T", "cells", "and", "that", "a", "progressive", "narrowing", "of", "this", "repertoire", "may", "take", "place", "during", "recall", "infections", "." ]

[ "recent", "studies", "have", "suggested", "that", "the", "diversity", "of", "tcr", "repertoire", "after", "primary", "immunization", "is", "conserved", "in", "memory", "t", "cells", "and", "that", "a", "progressive", "narrowing", "of", "this", "repertoire", "may", "take", "place", "during", "recall", "infections", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "It", "now", "remains", "to", "be", "investigated", "which", "parameters", "determine", "the", "repertoire", "of", "the", "memory", "response", "and", "possibly", "restrict", "its", "diversity", "after", "subsequent", "antigenic", "challenges", "." ]

[ "it", "now", "remains", "to", "be", "investigated", "which", "parameters", "determine", "the", "repertoire", "of", "the", "memory", "response", "and", "possibly", "restrict", "its", "diversity", "after", "subsequent", "antigenic", "challenges", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "To", "address", "this", "question", ",", "we", "took", "advantage", "of", "a", "panel", "of", "CD8+", "T", "cell", "clones", "from", "the", "joint", "of", "a", "rheumatoid", "arthritis", "patient", "and", "selected", "for", "their", "reactivity", "against", "a", "single", "MHC/peptide", "complex", "." ]

[ "to", "address", "this", "question", ",", "we", "took", "advantage", "of", "a", "panel", "of", "cd8+", "t", "cell", "clones", "from", "the", "joint", "of", "a", "rheumatoid", "arthritis", "patient", "and", "selected", "for", "their", "reactivity", "against", "a", "single", "mhc/peptide", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "Characterization", "of", "both", "TCR", "chains", "documented", "a", "great", "diversity", "among", "those", "clones", "and", "the", "persistence", "of", "clonotypes", "over", "a", "2-yr", "period", "." ]

[ "characterization", "of", "both", "tcr", "chains", "documented", "a", "great", "diversity", "among", "those", "clones", "and", "the", "persistence", "of", "clonotypes", "over", "a", "2-yr", "period", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Strikingly", ",", "despite", "the", "observed", "repertoire", "heterogeneity", ",", "all", "clones", "displayed", "a", "narrow", "range", "of", "MHC", "/peptide", "density", "requirements", "in", "cytotoxicity", "assays", "(", "ED50", "between", "9", "and", "36", "nM", ")", "." ]

[ "strikingly", ",", "despite", "the", "observed", "repertoire", "heterogeneity", ",", "all", "clones", "displayed", "a", "narrow", "range", "of", "mhc", "/peptide", "density", "requirements", "in", "cytotoxicity", "assays", "(", "ed50", "between", "9", "and", "36", "nm", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "TCR", "affinities", "were", "then", "indirectly", "estimated", "by", "blocking", "CD8", "interaction", "with", "an", "anti-CD8", "mAb", "." ]

[ "tcr", "affinities", "were", "then", "indirectly", "estimated", "by", "blocking", "cd8", "interaction", "with", "an", "anti-cd8", "mab", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "We", "found", "a", "wide", "range", "of", "TCR", "affinities", "among", "the", "different", "clonotypes", "that", "segregated", "with", "Vbeta", "usage", "." ]

[ "we", "found", "a", "wide", "range", "of", "tcr", "affinities", "among", "the", "different", "clonotypes", "that", "segregated", "with", "vbeta", "usage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "thus", "propose", "that", "during", "an", "in", "vivo", "chronic", "response", ",", "a", "narrow", "range", "of", "avidity", "of", "the", "TCR", "-CD8", "complex", "conditions", "long-term", "clonotype", "persistence", ",", "and", "that", "the", "level", "of", "CD8", "contribution", "is", "adjusted", "to", "keep", "clonotypes", "with", "variable", "TCR", "affinities", "within", "this", "avidity", "window", "." ]

[ "we", "thus", "propose", "that", "during", "an", "in", "vivo", "chronic", "response", ",", "a", "narrow", "range", "of", "avidity", "of", "the", "tcr", "-cd8", "complex", "conditions", "long-term", "clonotype", "persistence", ",", "and", "that", "the", "level", "of", "cd8", "contribution", "is", "adjusted", "to", "keep", "clonotypes", "with", "variable", "tcr", "affinities", "within", "this", "avidity", "window", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "IL-12", "-induced", "activation", "of", "NK", "and", "T", "cells", "occurs", "in", "the", "absence", "of", "immediate-early", "activation", "gene", "expression", "." ]

[ "il-12", "-induced", "activation", "of", "nk", "and", "t", "cells", "occurs", "in", "the", "absence", "of", "immediate-early", "activation", "gene", "expression", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "The", "responses", "of", "lymphocytes", "to", "IL-2", "and", "IL-12", ",", "involving", "proliferation", ",", "differentiation", ",", "and", "cytokine", "production", ",", "are", "only", "partially", "overlapping", ",", "and", "may", "depend", "on", "induced", "differential", "expression", "of", "specific", "sets", "of", "genes", "." ]

[ "the", "responses", "of", "lymphocytes", "to", "il-2", "and", "il-12", ",", "involving", "proliferation", ",", "differentiation", ",", "and", "cytokine", "production", ",", "are", "only", "partially", "overlapping", ",", "and", "may", "depend", "on", "induced", "differential", "expression", "of", "specific", "sets", "of", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Using", "reverse-transcription", "PCR", "differential", "display", ",", "we", "isolated", "an", "mRNA", "species", "expressed", "in", "IL-2", "-but", "not", "IL-12", "-stimulated", "NK", "cells", "." ]

[ "using", "reverse-transcription", "pcr", "differential", "display", ",", "we", "isolated", "an", "mrna", "species", "expressed", "in", "il-2", "-but", "not", "il-12", "-stimulated", "nk", "cells", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "was", "identified", "as", "the", "mRNA", "encoding", "the", "transcription", "factor", "egr-1", ",", "which", "is", "expressed", "with", "fast", "kinetics", "in", "T", "and", "NK", "cells", "upon", "IL-2", ",", "but", "not", "IL-12", ",", "stimulation", "." ]

[ "this", "was", "identified", "as", "the", "mrna", "encoding", "the", "transcription", "factor", "egr-1", ",", "which", "is", "expressed", "with", "fast", "kinetics", "in", "t", "and", "nk", "cells", "upon", "il-2", ",", "but", "not", "il-12", ",", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "the", "accumulation", "of", "mRNA", "-encoding", "members", "of", "the", "AP-1", "transcription", "factor", "family", "demonstrated", "that", "c-fos", "and", "junB", "are", "also", "expressed", "upon", "stimulation", "of", "NK", "and", "T", "cells", "with", "IL-2", ",", "but", "not", "IL-12", ",", "whereas", "expression", "of", "c-jun", "and", "junD", "is", "not", "modified", "by", "either", "cytokine", "." ]

[ "analysis", "of", "the", "accumulation", "of", "mrna", "-encoding", "members", "of", "the", "ap-1", "transcription", "factor", "family", "demonstrated", "that", "c-fos", "and", "junb", "are", "also", "expressed", "upon", "stimulation", "of", "nk", "and", "t", "cells", "with", "il-2", ",", "but", "not", "il-12", ",", "whereas", "expression", "of", "c-jun", "and", "jund", "is", "not", "modified", "by", "either", "cytokine", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "increased", "AP-1", "DNA-binding", "activity", "and", "AP-1", "-dependent", "transcriptional", "activity", "were", "detected", "exclusively", "in", "IL-2", "-stimulated", "cells", "." ]

[ "accordingly", ",", "increased", "ap-1", "dna-binding", "activity", "and", "ap-1", "-dependent", "transcriptional", "activity", "were", "detected", "exclusively", "in", "il-2", "-stimulated", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "the", "expression", "of", "genes", "reported", "to", "regulate", "cytokine", "-induced", "proliferation", "demonstrated", "that", "both", "IL-2", "and", "IL-12", "induce", "c-myc", "mRNA", "accumulation", "in", "NK", "and", "T", "cells", ",", "whereas", "only", "IL-2", "induces", "bcl-2", "expression", "." ]

[ "analysis", "of", "the", "expression", "of", "genes", "reported", "to", "regulate", "cytokine", "-induced", "proliferation", "demonstrated", "that", "both", "il-2", "and", "il-12", "induce", "c-myc", "mrna", "accumulation", "in", "nk", "and", "t", "cells", ",", "whereas", "only", "il-2", "induces", "bcl-2", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "provide", "the", "first", "demonstration", "that", "IL-12", "-mediated", "activation", "of", "T", "and", "NK", "cells", "does", "not", "involve", "expression", "of", "members", "of", "the", "immediate-early", "activation", "genes", "family", "(", "egr-1", ",", "c-fos", ",", "and", "junB", ")", ",", "AP-1", "transcriptional", "activity", ",", "or", "bcl-2", "expression", "." ]

[ "our", "data", "provide", "the", "first", "demonstration", "that", "il-12", "-mediated", "activation", "of", "t", "and", "nk", "cells", "does", "not", "involve", "expression", "of", "members", "of", "the", "immediate-early", "activation", "genes", "family", "(", "egr-1", ",", "c-fos", ",", "and", "junb", ")", ",", "ap-1", "transcriptional", "activity", ",", "or", "bcl-2", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "This", "indicates", "that", "functional", "differences", "observed", "in", "IL-2-", "and", "IL-12-", "stimulated", "cells", "may", "depend", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "on", "differential", "gene", "regulation", "." ]

[ "this", "indicates", "that", "functional", "differences", "observed", "in", "il-2-", "and", "il-12-", "stimulated", "cells", "may", "depend", ",", "at", "least", "in", "part", ",", "on", "differential", "gene", "regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Cloning", "and", "expression", "of", "the", "Epstein-Barr", "virus", "-encoded", "dUTPase", ":", "patients", "with", "acute", ",", "reactivated", "or", "chronic", "virus", "infection", "develop", "antibodies", "against", "the", "enzyme", "." ]

[ "cloning", "and", "expression", "of", "the", "epstein-barr", "virus", "-encoded", "dutpase", ":", "patients", "with", "acute", ",", "reactivated", "or", "chronic", "virus", "infection", "develop", "antibodies", "against", "the", "enzyme", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "gene", "encoding", "the", "Epstein-Barr", "virus", "(", "EBV", ")", "-specific", "dUTPase", "was", "amplified", "from", "virus", "DNA", "by", "PCR", "." ]

[ "the", "gene", "encoding", "the", "epstein-barr", "virus", "(", "ebv", ")", "-specific", "dutpase", "was", "amplified", "from", "virus", "dna", "by", "pcr", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "The", "active", "enzyme", "was", "expressed", "in", "Escherichia", "coli", "and", "in", "insect", "cells", "as", "a", "non-fusion", "protein", "." ]

[ "the", "active", "enzyme", "was", "expressed", "in", "escherichia", "coli", "and", "in", "insect", "cells", "as", "a", "non-fusion", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "protein", "from", "E", ".", "coli", "specifically", "converted", "dUTP", "to", "dUMP", "and", "did", "not", "react", "with", "other", "dNTPs", "or", "NTPs", "." ]

[ "the", "protein", "from", "e", ".", "coli", "specifically", "converted", "dutp", "to", "dump", "and", "did", "not", "react", "with", "other", "dntps", "or", "ntps", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "B-nucleotide", "O", "B-nucleotide", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-nucleotide", "O", "B-nucleotide", "O" ]

[ "Preliminary", "experiments", "yielded", "a", "Km", "value", "of", "about", "0", ".", "8", "microM", "for", "dUTP", "." ]

[ "preliminary", "experiments", "yielded", "a", "km", "value", "of", "about", "0", ".", "8", "microm", "for", "dutp", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-nucleotide", "O" ]

[ "MAbs", "against", "the", "dUTPase", "reacted", "with", "a", "protein", "of", "approximately", "31", "kDa", "in", "12-O-tetradecanoyl-phorbol-13-acetate", "(", "TPA", ")", "-stimulated", "B", "cells", "harbouring", "either", "type", "1", "or", "type", "2", "EBV", "." ]

[ "mabs", "against", "the", "dutpase", "reacted", "with", "a", "protein", "of", "approximately", "31", "kda", "in", "12-o-tetradecanoyl-phorbol-13-acetate", "(", "tpa", ")", "-stimulated", "b", "cells", "harbouring", "either", "type", "1", "or", "type", "2", "ebv", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "protein", "was", "found", "in", "untreated", "cells", "at", "low", "levels", ",", "whereas", "induction", "of", "the", "lytic", "replication", "cycle", "by", "TPA", "treatment", "or", "by", "providing", "the", "immediate", "early", "transactivator", "BZLF1", "in", "trans", "resulted", "in", "increased", "expression", "." ]

[ "the", "protein", "was", "found", "in", "untreated", "cells", "at", "low", "levels", ",", "whereas", "induction", "of", "the", "lytic", "replication", "cycle", "by", "tpa", "treatment", "or", "by", "providing", "the", "immediate", "early", "transactivator", "bzlf1", "in", "trans", "resulted", "in", "increased", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "demonstrated", "that", "the", "virus", "dUTPase", "isolated", "from", "EBV", "-infected", "cells", "is", "a", "phosphoprotein", "." ]

[ "we", "demonstrated", "that", "the", "virus", "dutpase", "isolated", "from", "ebv", "-infected", "cells", "is", "a", "phosphoprotein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "protein", "expressed", "in", "insect", "cells", "was", "used", "to", "test", "for", "the", "presence", "of", "specific", "antibodies", "in", "sera", "from", "normal", ",", "healthy", "carriers", "and", "from", "patients", "with", "various", "diseases", "." ]

[ "the", "protein", "expressed", "in", "insect", "cells", "was", "used", "to", "test", "for", "the", "presence", "of", "specific", "antibodies", "in", "sera", "from", "normal", ",", "healthy", "carriers", "and", "from", "patients", "with", "various", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-tissue", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "the", "sera", "of", "EBV", "-negative", "individuals", "(", "0/3", ")", "or", "healthy", "carriers", "(", "0/33", ")", "did", "not", "contain", "detectable", "levels", "of", "antibodies", ",", "patients", "with", "mononucleosis", "(", "5/18", ")", ",", "chronic", "EBV", "infection", "(", "2/7", ")", ",", "EBV", "reactivation", "(", "7/20", ")", "and", "human", "immunodeficiency", "virus", "infection", "(", "5/24", ")", "showed", "elevated", "antibody", "titres", "against", "the", "enzyme", "." ]

[ "while", "the", "sera", "of", "ebv", "-negative", "individuals", "(", "0/3", ")", "or", "healthy", "carriers", "(", "0/33", ")", "did", "not", "contain", "detectable", "levels", "of", "antibodies", ",", "patients", "with", "mononucleosis", "(", "5/18", ")", ",", "chronic", "ebv", "infection", "(", "2/7", ")", ",", "ebv", "reactivation", "(", "7/20", ")", "and", "human", "immunodeficiency", "virus", "infection", "(", "5/24", ")", "showed", "elevated", "antibody", "titres", "against", "the", "enzyme", "." ]

[ "O", "O", "B-tissue", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "indicated", "that", "the", "dUTPase", "is", "expressed", "during", "EBV", "replication", "and", "reactivation", "." ]

[ "this", "indicated", "that", "the", "dutpase", "is", "expressed", "during", "ebv", "replication", "and", "reactivation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-nucleotide", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "enzyme", "might", "therefore", "be", "a", "potential", "target", "for", "drug", "therapy", "under", "conditions", "of", "active", "DNA", "replication", "." ]

[ "the", "enzyme", "might", "therefore", "be", "a", "potential", "target", "for", "drug", "therapy", "under", "conditions", "of", "active", "dna", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Modulation", "of", "CD28", "expression", ":", "distinct", "regulatory", "pathways", "during", "activation", "and", "replicative", "senescence", "." ]

[ "modulation", "of", "cd28", "expression", ":", "distinct", "regulatory", "pathways", "during", "activation", "and", "replicative", "senescence", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "costimulatory", "molecule", "CD28", "has", "a", "restricted", "tissue", "distribution", "and", "is", "expressed", "on", "T", "cells", "and", "some", "plasmacytoma", "cells", "." ]

[ "the", "costimulatory", "molecule", "cd28", "has", "a", "restricted", "tissue", "distribution", "and", "is", "expressed", "on", "t", "cells", "and", "some", "plasmacytoma", "cells", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]