tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Expression",
"of",
"E2A-HLF",
"chimeric",
"protein",
"induced",
"T-cell",
"apoptosis",
",",
"B-cell",
"maturation",
"arrest",
",",
"and",
"development",
"of",
"acute",
"lymphoblastic",
"leukemia",
"."
] | [
"expression",
"of",
"e2a-hlf",
"chimeric",
"protein",
"induced",
"t-cell",
"apoptosis",
",",
"b-cell",
"maturation",
"arrest",
",",
"and",
"development",
"of",
"acute",
"lymphoblastic",
"leukemia",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"E2A-HLF",
"fusion",
"gene",
",",
"generated",
"by",
"t",
"(",
"17",
";",
"19",
")",
"(",
"q22",
";",
"p13",
")",
"in",
"acute",
"lymphoblastic",
"leukemia",
"(",
"ALL",
")",
",",
"encodes",
"a",
"chimeric",
"transcription",
"factor",
"in",
"which",
"the",
"trans-activating",
"domains",
"of",
"E2A",
"are",
"fused",
"to",
"the",
"DNA-",
"binding",
"and",
"dimerization",
"domains",
"of",
"hepatic",
"leukemic",
"factor",
"(",
"HLF",
")",
"."
] | [
"the",
"e2a-hlf",
"fusion",
"gene",
",",
"generated",
"by",
"t",
"(",
"17",
";",
"19",
")",
"(",
"q22",
";",
"p13",
")",
"in",
"acute",
"lymphoblastic",
"leukemia",
"(",
"all",
")",
",",
"encodes",
"a",
"chimeric",
"transcription",
"factor",
"in",
"which",
"the",
"trans-activating",
"domains",
"of",
"e2a",
"are",
"fused",
"to",
"the",
"dna-",
"binding",
"and",
"dimerization",
"domains",
"of",
"hepatic",
"leukemic",
"factor",
"(",
"hlf",
")",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"investigate",
"its",
"biological",
"role",
",",
"we",
"generated",
"transgenic",
"mice",
"expressing",
"E2A-HLF",
"using",
"Ig",
"enhancer",
"and",
"promoter",
",",
"which",
"direct",
"transgene",
"expression",
"in",
"cells",
"committed",
"to",
"the",
"lymphoid",
"lineage",
"."
] | [
"to",
"investigate",
"its",
"biological",
"role",
",",
"we",
"generated",
"transgenic",
"mice",
"expressing",
"e2a-hlf",
"using",
"ig",
"enhancer",
"and",
"promoter",
",",
"which",
"direct",
"transgene",
"expression",
"in",
"cells",
"committed",
"to",
"the",
"lymphoid",
"lineage",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"transgenic",
"mice",
"exhibited",
"abnormal",
"development",
"in",
"the",
"thymus",
"and",
"spleen",
"and",
"were",
"susceptible",
"to",
"infection",
"."
] | [
"the",
"transgenic",
"mice",
"exhibited",
"abnormal",
"development",
"in",
"the",
"thymus",
"and",
"spleen",
"and",
"were",
"susceptible",
"to",
"infection",
"."
] | [
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"thymus",
"contained",
"small",
"numbers",
"of",
"thymocytes",
",",
"and",
"TUNEL",
"staining",
"showed",
"that",
"higher",
"population",
"of",
"thymocytes",
"were",
"undergoing",
"apoptosis",
"."
] | [
"the",
"thymus",
"contained",
"small",
"numbers",
"of",
"thymocytes",
",",
"and",
"tunel",
"staining",
"showed",
"that",
"higher",
"population",
"of",
"thymocytes",
"were",
"undergoing",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"spleen",
"exhibited",
"a",
"marked",
"reduction",
"in",
"splenic",
"lymphocytes",
"and",
"the",
"flow",
"cytometric",
"analyses",
"and",
"the",
"in",
"vitro",
"colony",
"formation",
"assays",
"showed",
"that",
"the",
"B-cell",
"maturation",
"was",
"blocked",
"at",
"a",
"very",
"early",
"developmental",
"stage",
"."
] | [
"the",
"spleen",
"exhibited",
"a",
"marked",
"reduction",
"in",
"splenic",
"lymphocytes",
"and",
"the",
"flow",
"cytometric",
"analyses",
"and",
"the",
"in",
"vitro",
"colony",
"formation",
"assays",
"showed",
"that",
"the",
"b-cell",
"maturation",
"was",
"blocked",
"at",
"a",
"very",
"early",
"developmental",
"stage",
"."
] | [
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"indicated",
"that",
"the",
"expression",
"of",
"E2A-HLF",
"induced",
"T-cell",
"apoptosis",
"and",
"B-cell",
"maturation",
"arrest",
"in",
"vivo",
"and",
"that",
"the",
"susceptibility",
"of",
"the",
"transgenic",
"mice",
"to",
"infection",
"was",
"due",
"to",
"immunodeficiency",
"."
] | [
"these",
"findings",
"indicated",
"that",
"the",
"expression",
"of",
"e2a-hlf",
"induced",
"t-cell",
"apoptosis",
"and",
"b-cell",
"maturation",
"arrest",
"in",
"vivo",
"and",
"that",
"the",
"susceptibility",
"of",
"the",
"transgenic",
"mice",
"to",
"infection",
"was",
"due",
"to",
"immunodeficiency",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"several",
"transgenic",
"mice",
"developed",
"acute",
"leukemia",
",",
"classified",
"as",
"T-",
"ALL",
"based",
"on",
"the",
"surface",
"marker",
"analysis",
"and",
"DNA",
"rearrangements",
",",
"suggesting",
"that",
"an",
"additional",
"event",
"is",
"required",
"for",
"malignant",
"transformation",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"expressing",
"E2A-HLF",
"."
] | [
"moreover",
",",
"several",
"transgenic",
"mice",
"developed",
"acute",
"leukemia",
",",
"classified",
"as",
"t-",
"all",
"based",
"on",
"the",
"surface",
"marker",
"analysis",
"and",
"dna",
"rearrangements",
",",
"suggesting",
"that",
"an",
"additional",
"event",
"is",
"required",
"for",
"malignant",
"transformation",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"expressing",
"e2a-hlf",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"provide",
"insight",
"into",
"the",
"biological",
"function",
"of",
"E2A-HLF",
"in",
"lymphoid",
"development",
"and",
"also",
"its",
"role",
"in",
"leukemogenesis",
"."
] | [
"our",
"findings",
"provide",
"insight",
"into",
"the",
"biological",
"function",
"of",
"e2a-hlf",
"in",
"lymphoid",
"development",
"and",
"also",
"its",
"role",
"in",
"leukemogenesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Delta-opioid",
"receptors",
"expressed",
"by",
"Jurkat",
"T",
"cells",
"enhance",
"IL-2",
"secretion",
"by",
"increasing",
"AP-1",
"complexes",
"and",
"activity",
"of",
"the",
"NF-AT/AP-1-binding",
"promoter",
"element",
"."
] | [
"delta-opioid",
"receptors",
"expressed",
"by",
"jurkat",
"t",
"cells",
"enhance",
"il-2",
"secretion",
"by",
"increasing",
"ap-1",
"complexes",
"and",
"activity",
"of",
"the",
"nf-at/ap-1-binding",
"promoter",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Recent",
"molecular",
"evidence",
"points",
"to",
"transient",
"and/or",
"stage-specific",
"expression",
"of",
"delta-",
"and",
"kappa-",
"opioid",
"receptors",
"by",
"thymic",
"and",
"peripheral",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"recent",
"molecular",
"evidence",
"points",
"to",
"transient",
"and/or",
"stage-specific",
"expression",
"of",
"delta-",
"and",
"kappa-",
"opioid",
"receptors",
"by",
"thymic",
"and",
"peripheral",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Since",
"medical",
"treatments",
"or",
"stress",
"commonly",
"increase",
"opioid",
"levels",
",",
"it",
"is",
"important",
"to",
"understand",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"opioids",
"affect",
"T",
"lymphocyte",
"functions",
"."
] | [
"since",
"medical",
"treatments",
"or",
"stress",
"commonly",
"increase",
"opioid",
"levels",
",",
"it",
"is",
"important",
"to",
"understand",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"opioids",
"affect",
"t",
"lymphocyte",
"functions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"therefore",
"created",
"and",
"studied",
"a",
"T",
"cell",
"line",
"expressing",
"the",
"cloned",
"delta-opioid",
"receptor",
"(",
"DOR1",
")",
"."
] | [
"we",
"therefore",
"created",
"and",
"studied",
"a",
"t",
"cell",
"line",
"expressing",
"the",
"cloned",
"delta-opioid",
"receptor",
"(",
"dor1",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"DOR1",
"ligation",
"by",
"a",
"specific",
"DOR1",
"agonist",
",",
"deltorphin",
",",
"augmented",
"IL-2",
"secretion",
"by",
"synergizing",
"with",
"signals",
"from",
"TCR-",
"CD3",
"and",
"CD28",
"."
] | [
"dor1",
"ligation",
"by",
"a",
"specific",
"dor1",
"agonist",
",",
"deltorphin",
",",
"augmented",
"il-2",
"secretion",
"by",
"synergizing",
"with",
"signals",
"from",
"tcr-",
"cd3",
"and",
"cd28",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Reporter",
"gene",
"constructs",
"were",
"used",
"to",
"map",
"this",
"effect",
"of",
"deltorphin",
"to",
"the",
"AP-1-",
"and",
"NF-AT/AP-1-",
"binding",
"sites",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"."
] | [
"reporter",
"gene",
"constructs",
"were",
"used",
"to",
"map",
"this",
"effect",
"of",
"deltorphin",
"to",
"the",
"ap-1-",
"and",
"nf-at/ap-1-",
"binding",
"sites",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"DOR1",
"signaling",
"increased",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
",",
"deltorphin",
"enhanced",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"NF-AT/AP-1-binding",
"site",
"via",
"a",
"mechanism",
"independent",
"of",
"calcineurin",
"and",
"distinct",
"from",
"the",
"effects",
"of",
"elevated",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"."
] | [
"although",
"dor1",
"signaling",
"increased",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
",",
"deltorphin",
"enhanced",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"nf-at/ap-1-binding",
"site",
"via",
"a",
"mechanism",
"independent",
"of",
"calcineurin",
"and",
"distinct",
"from",
"the",
"effects",
"of",
"elevated",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Deltorphin",
"also",
"increased",
"accumulation",
"of",
"AP-1",
"transcription",
"factor",
"complexes",
",",
"suggesting",
"that",
"DOR1",
"augments",
"IL-2",
"secretion",
"by",
"increasing",
"the",
"AP-1",
"component",
"of",
"the",
"NF-AT/AP-1",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"deltorphin",
"also",
"increased",
"accumulation",
"of",
"ap-1",
"transcription",
"factor",
"complexes",
",",
"suggesting",
"that",
"dor1",
"augments",
"il-2",
"secretion",
"by",
"increasing",
"the",
"ap-1",
"component",
"of",
"the",
"nf-at/ap-1",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"advance",
"the",
"molecular",
"understanding",
"of",
"opioid",
"effects",
"on",
"lymphocytes",
",",
"and",
"in",
"addition",
",",
"demonstrate",
"regulation",
"of",
"IL-2",
"synthesis",
"and",
"secretion",
"by",
"the",
"novel",
"mechanism",
"of",
"receptor-mediated",
"AP-1",
"induction",
"."
] | [
"these",
"results",
"advance",
"the",
"molecular",
"understanding",
"of",
"opioid",
"effects",
"on",
"lymphocytes",
",",
"and",
"in",
"addition",
",",
"demonstrate",
"regulation",
"of",
"il-2",
"synthesis",
"and",
"secretion",
"by",
"the",
"novel",
"mechanism",
"of",
"receptor-mediated",
"ap-1",
"induction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"IL4",
"and",
"IL13",
"receptors",
"share",
"the",
"gamma",
"c",
"chain",
"and",
"activate",
"STAT6",
",",
"STAT3",
"and",
"STAT5",
"proteins",
"in",
"normal",
"human",
"B",
"cells",
"."
] | [
"il4",
"and",
"il13",
"receptors",
"share",
"the",
"gamma",
"c",
"chain",
"and",
"activate",
"stat6",
",",
"stat3",
"and",
"stat5",
"proteins",
"in",
"normal",
"human",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"IL13",
"induces",
"the",
"same",
"biological",
"effects",
"as",
"IL4",
"in",
"normal",
"human",
"B",
"cells",
"."
] | [
"il13",
"induces",
"the",
"same",
"biological",
"effects",
"as",
"il4",
"in",
"normal",
"human",
"b",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"as",
"in",
"the",
"IL4R",
"complex",
",",
"both",
"IL4R",
"alpha",
"and",
"IL2R",
"gamma",
"c",
"are",
"components",
"of",
"the",
"IL13R",
"and",
"that",
"both",
"cytokines",
"induced",
"STAT6",
",",
"STAT3",
"and",
"STAT5",
"activation",
"in",
"B",
"cells",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"as",
"in",
"the",
"il4r",
"complex",
",",
"both",
"il4r",
"alpha",
"and",
"il2r",
"gamma",
"c",
"are",
"components",
"of",
"the",
"il13r",
"and",
"that",
"both",
"cytokines",
"induced",
"stat6",
",",
"stat3",
"and",
"stat5",
"activation",
"in",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"spite",
"of",
"this",
"similar",
"downstream",
"signalling",
",",
"IL4",
"and",
"IL13",
"used",
"a",
"different",
"set",
"of",
"Janus",
"kinases",
":",
"IL13",
"is",
"unable",
"to",
"activate",
"JAK1",
"and",
"JAK3",
"."
] | [
"in",
"spite",
"of",
"this",
"similar",
"downstream",
"signalling",
",",
"il4",
"and",
"il13",
"used",
"a",
"different",
"set",
"of",
"janus",
"kinases",
":",
"il13",
"is",
"unable",
"to",
"activate",
"jak1",
"and",
"jak3",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Attenuation",
"of",
"gamma",
"interferon",
"-induced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"in",
"mononuclear",
"phagocytes",
"infected",
"with",
"Leishmania",
"donovani",
":",
"selective",
"inhibition",
"of",
"signaling",
"through",
"Janus",
"kinases",
"and",
"Stat1",
"."
] | [
"attenuation",
"of",
"gamma",
"interferon",
"-induced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"in",
"mononuclear",
"phagocytes",
"infected",
"with",
"leishmania",
"donovani",
":",
"selective",
"inhibition",
"of",
"signaling",
"through",
"janus",
"kinases",
"and",
"stat1",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"induction",
"of",
"gene",
"transcription",
"in",
"response",
"to",
"gamma",
"interferon",
"is",
"impaired",
"in",
"mononuclear",
"phagocytes",
"infected",
"with",
"Leishmania",
"donovani",
",",
"and",
"the",
"mechanisms",
"involved",
"are",
"not",
"fully",
"understood",
"."
] | [
"the",
"induction",
"of",
"gene",
"transcription",
"in",
"response",
"to",
"gamma",
"interferon",
"is",
"impaired",
"in",
"mononuclear",
"phagocytes",
"infected",
"with",
"leishmania",
"donovani",
",",
"and",
"the",
"mechanisms",
"involved",
"are",
"not",
"fully",
"understood",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"changes",
"in",
"gene",
"expression",
"brought",
"about",
"by",
"gamma",
"interferon",
"are",
"thought",
"to",
"involve",
"transient",
"increases",
"in",
"the",
"activities",
"of",
"cellular",
"protein",
"tyrosine",
"kinases",
",",
"including",
"the",
"Janus",
"kinases",
"Jak1",
"and",
"Jak2",
",",
"leading",
"to",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"Stat1",
"."
] | [
"the",
"changes",
"in",
"gene",
"expression",
"brought",
"about",
"by",
"gamma",
"interferon",
"are",
"thought",
"to",
"involve",
"transient",
"increases",
"in",
"the",
"activities",
"of",
"cellular",
"protein",
"tyrosine",
"kinases",
",",
"including",
"the",
"janus",
"kinases",
"jak1",
"and",
"jak2",
",",
"leading",
"to",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"stat1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"To",
"investigate",
"the",
"mechanisms",
"accounting",
"for",
"the",
"impaired",
"responses",
"to",
"gamma",
"interferon",
",",
"a",
"model",
"system",
"for",
"examining",
"overall",
"changes",
"in",
"protein",
"tyrosine",
"phosphorylation",
",",
"activation",
"of",
"Jak1",
"and",
"Jak2",
"and",
"phosphorylation",
"of",
"Stat1",
"was",
"developed",
"in",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"-differentiated",
"U-937",
"cells",
"."
] | [
"to",
"investigate",
"the",
"mechanisms",
"accounting",
"for",
"the",
"impaired",
"responses",
"to",
"gamma",
"interferon",
",",
"a",
"model",
"system",
"for",
"examining",
"overall",
"changes",
"in",
"protein",
"tyrosine",
"phosphorylation",
",",
"activation",
"of",
"jak1",
"and",
"jak2",
"and",
"phosphorylation",
"of",
"stat1",
"was",
"developed",
"in",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"-differentiated",
"u-937",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Analysis",
"of",
"whole-cell",
"lysates",
"by",
"antiphosphotyrosine",
"immunoblotting",
"showed",
"that",
"incubation",
"with",
"gamma",
"interferon",
"brought",
"about",
"specific",
"increases",
"in",
"phosphotyrosine",
"labeling",
"of",
"several",
"proteins",
"."
] | [
"analysis",
"of",
"whole-cell",
"lysates",
"by",
"antiphosphotyrosine",
"immunoblotting",
"showed",
"that",
"incubation",
"with",
"gamma",
"interferon",
"brought",
"about",
"specific",
"increases",
"in",
"phosphotyrosine",
"labeling",
"of",
"several",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Increased",
"labeling",
"of",
"these",
"proteins",
"occurred",
"to",
"similar",
"extents",
"in",
"control",
"cells",
"and",
"in",
"cells",
"that",
"had",
"been",
"infected",
"with",
"L",
".",
"donovani",
"for",
"16",
"h",
"."
] | [
"increased",
"labeling",
"of",
"these",
"proteins",
"occurred",
"to",
"similar",
"extents",
"in",
"control",
"cells",
"and",
"in",
"cells",
"that",
"had",
"been",
"infected",
"with",
"l",
".",
"donovani",
"for",
"16",
"h",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Jak1",
",",
"Jak2",
",",
"and",
"Stat1",
"were",
"immunoprecipitated",
"from",
"control",
"and",
"interferon-treated",
"cells",
",",
"and",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"these",
"proteins",
",",
"detected",
"by",
"antiphosphotyrosine",
"immunoblotting",
"was",
"used",
"to",
"measured",
"their",
"activation",
"."
] | [
"jak1",
",",
"jak2",
",",
"and",
"stat1",
"were",
"immunoprecipitated",
"from",
"control",
"and",
"interferon-treated",
"cells",
",",
"and",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"these",
"proteins",
",",
"detected",
"by",
"antiphosphotyrosine",
"immunoblotting",
"was",
"used",
"to",
"measured",
"their",
"activation",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"Jak1",
",",
"Jak2",
",",
"and",
"Stat1",
"increased",
"markedly",
",",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
",",
"in",
"U-937",
"cells",
"incubated",
"with",
"gamma",
"interferon",
"."
] | [
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"jak1",
",",
"jak2",
",",
"and",
"stat1",
"increased",
"markedly",
",",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
",",
"in",
"u-937",
"cells",
"incubated",
"with",
"gamma",
"interferon",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"in",
"cells",
"infected",
"with",
"L",
".",
"donovani",
",",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"Jak1",
",",
"Jak2",
",",
"and",
"Stat1",
"was",
"markedly",
"impaired",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"in",
"cells",
"infected",
"with",
"l",
".",
"donovani",
",",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"jak1",
",",
"jak2",
",",
"and",
"stat1",
"was",
"markedly",
"impaired",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"effect",
"was",
"dependent",
"upon",
"the",
"duration",
"of",
"exposure",
"to",
"L",
".",
"donovani",
"and",
"was",
"maximal",
"and",
"complete",
"at",
"16",
"h",
"."
] | [
"this",
"effect",
"was",
"dependent",
"upon",
"the",
"duration",
"of",
"exposure",
"to",
"l",
".",
"donovani",
"and",
"was",
"maximal",
"and",
"complete",
"at",
"16",
"h",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Results",
"similar",
"to",
"those",
"observed",
"with",
"U-937",
"cells",
"were",
"also",
"obtained",
"with",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"results",
"similar",
"to",
"those",
"observed",
"with",
"u-937",
"cells",
"were",
"also",
"obtained",
"with",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"indicate",
"that",
"infection",
"of",
"human",
"mononuclear",
"phagocytes",
"with",
"L",
".",
"donovani",
"leads",
"to",
"impaired",
"gamma",
"interferon",
"-mediated",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"selective",
"effects",
"on",
"the",
"Jak-",
"Stat1",
"pathway",
"."
] | [
"these",
"findings",
"indicate",
"that",
"infection",
"of",
"human",
"mononuclear",
"phagocytes",
"with",
"l",
".",
"donovani",
"leads",
"to",
"impaired",
"gamma",
"interferon",
"-mediated",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"selective",
"effects",
"on",
"the",
"jak-",
"stat1",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Unresponsiveness",
"to",
"gamma",
"interferon",
"for",
"activation",
"of",
"this",
"pathway",
"may",
"explain",
"impaired",
"transcriptional",
"responses",
"in",
"leishmania-infected",
"cells",
"."
] | [
"unresponsiveness",
"to",
"gamma",
"interferon",
"for",
"activation",
"of",
"this",
"pathway",
"may",
"explain",
"impaired",
"transcriptional",
"responses",
"in",
"leishmania-infected",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Role",
"of",
"IKK1",
"and",
"IKK2",
"in",
"lipopolysaccharide",
"signaling",
"in",
"human",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"role",
"of",
"ikk1",
"and",
"ikk2",
"in",
"lipopolysaccharide",
"signaling",
"in",
"human",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Mononuclear",
"phagocytes",
"play",
"a",
"major",
"role",
"in",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"responses",
"."
] | [
"mononuclear",
"phagocytes",
"play",
"a",
"major",
"role",
"in",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"responses",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Bacterial",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
"induces",
"monocytes",
"to",
"express",
"a",
"variety",
"of",
"genes",
"by",
"activating",
"the",
"NF-kappaB/Rel",
"transcription",
"factor",
"family",
"."
] | [
"bacterial",
"lipopolysaccharide",
"(",
"lps",
")",
"induces",
"monocytes",
"to",
"express",
"a",
"variety",
"of",
"genes",
"by",
"activating",
"the",
"nf-kappab/rel",
"transcription",
"factor",
"family",
"."
] | [
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"we",
"have",
"reported",
"that",
"the",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"and",
"interleukin",
"1",
"signaling",
"pathways",
"activate",
"two",
"kinases",
",",
"IKK1",
"and",
"IKK2",
"."
] | [
"recently",
",",
"we",
"have",
"reported",
"that",
"the",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"and",
"interleukin",
"1",
"signaling",
"pathways",
"activate",
"two",
"kinases",
",",
"ikk1",
"and",
"ikk2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Phosphorylation",
"of",
"the",
"IkappaB",
"cytoplasmic",
"inhibitors",
",",
"IkappaBalpha",
",",
"IkappaBbeta",
",",
"and",
"IkappaBepsilon",
",",
"by",
"these",
"kinases",
"triggers",
"proteolytic",
"degradation",
"and",
"the",
"release",
"of",
"NF-kappaB/Rel",
"proteins",
"into",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"phosphorylation",
"of",
"the",
"ikappab",
"cytoplasmic",
"inhibitors",
",",
"ikappabalpha",
",",
"ikappabbeta",
",",
"and",
"ikappabepsilon",
",",
"by",
"these",
"kinases",
"triggers",
"proteolytic",
"degradation",
"and",
"the",
"release",
"of",
"nf-kappab/rel",
"proteins",
"into",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"At",
"present",
",",
"the",
"role",
"of",
"the",
"IKKs",
"in",
"LPS",
"signaling",
"has",
"not",
"been",
"investigated",
"."
] | [
"at",
"present",
",",
"the",
"role",
"of",
"the",
"ikks",
"in",
"lps",
"signaling",
"has",
"not",
"been",
"investigated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"report",
"that",
"LPS",
"induces",
"IKK",
"activity",
"in",
"human",
"monocytes",
"and",
"THP-1",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"here",
",",
"we",
"report",
"that",
"lps",
"induces",
"ikk",
"activity",
"in",
"human",
"monocytes",
"and",
"thp-1",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"kinetics",
"of",
"activation",
"of",
"kinase",
"activity",
"in",
"monocytic",
"cells",
"are",
"relatively",
"slow",
"with",
"maximal",
"activity",
"observed",
"at",
"60",
"min",
",",
"which",
"coincides",
"with",
"the",
"degradation",
"of",
"IkappaBs",
"and",
"the",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"NF-kappaB",
"."
] | [
"the",
"kinetics",
"of",
"activation",
"of",
"kinase",
"activity",
"in",
"monocytic",
"cells",
"are",
"relatively",
"slow",
"with",
"maximal",
"activity",
"observed",
"at",
"60",
"min",
",",
"which",
"coincides",
"with",
"the",
"degradation",
"of",
"ikappabs",
"and",
"the",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"nf-kappab",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_complex",
"O"
] |
[
"In",
"transfection",
"experiments",
",",
"overexpression",
"of",
"wild",
"type",
"IKK1",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"mutant",
"IKK1",
"(",
"K44M",
")",
",",
"or",
"wild",
"type",
"IKK2",
"did",
"not",
"affect",
"LPS",
"-induced",
"kappaB",
"-dependent",
"transcription",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"in",
"transfection",
"experiments",
",",
"overexpression",
"of",
"wild",
"type",
"ikk1",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"mutant",
"ikk1",
"(",
"k44m",
")",
",",
"or",
"wild",
"type",
"ikk2",
"did",
"not",
"affect",
"lps",
"-induced",
"kappab",
"-dependent",
"transcription",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"mutant",
"of",
"IKK2",
"inhibited",
"LPS",
"induction",
"of",
"kappaB",
"-dependent",
"transcription",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"a",
"dominant",
"negative",
"mutant",
"of",
"ikk2",
"inhibited",
"lps",
"induction",
"of",
"kappab",
"-dependent",
"transcription",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"LPS",
"induction",
"of",
"kappaB-dependent",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"monocytic",
"cells",
"requires",
"activation",
"of",
"IKK2",
"."
] | [
"these",
"results",
"indicate",
"that",
"lps",
"induction",
"of",
"kappab-dependent",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"monocytic",
"cells",
"requires",
"activation",
"of",
"ikk2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"retinoic",
"acid",
"and",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"as",
"inducers",
"of",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"comparison",
"of",
"retinoic",
"acid",
"and",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"as",
"inducers",
"of",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Several",
"human",
"myeloid",
"leukemia",
"cell",
"lines",
"growing",
"in",
"vitro",
"can",
"be",
"induced",
"to",
"differentiate",
"to",
"more",
"mature",
"monocyte/macrophage-like",
"cells",
"by",
"treatment",
"with",
"protein",
"kinase",
"C",
"-activating",
"phorbol",
"esters",
",",
"such",
"as",
"PMA",
"."
] | [
"several",
"human",
"myeloid",
"leukemia",
"cell",
"lines",
"growing",
"in",
"vitro",
"can",
"be",
"induced",
"to",
"differentiate",
"to",
"more",
"mature",
"monocyte/macrophage-like",
"cells",
"by",
"treatment",
"with",
"protein",
"kinase",
"c",
"-activating",
"phorbol",
"esters",
",",
"such",
"as",
"pma",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
"to",
"PMA",
",",
"cells",
"of",
"the",
"THP-1",
"myeloid",
"leukemia",
"cell",
"line",
"acquire",
"macrophage-like",
"characteristics",
"after",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"RA",
")",
"."
] | [
"in",
"addition",
"to",
"pma",
",",
"cells",
"of",
"the",
"thp-1",
"myeloid",
"leukemia",
"cell",
"line",
"acquire",
"macrophage-like",
"characteristics",
"after",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"ra",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"analyze",
"the",
"signal",
"transduction",
"mechanisms",
"induced",
"by",
"RA",
",",
"we",
"first",
"compared",
"the",
"effects",
"of",
"PMA",
"and",
"RA",
"on",
"the",
"expression",
"of",
"genes",
"which",
"are",
"known",
"to",
"be",
"regulated",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"to",
"analyze",
"the",
"signal",
"transduction",
"mechanisms",
"induced",
"by",
"ra",
",",
"we",
"first",
"compared",
"the",
"effects",
"of",
"pma",
"and",
"ra",
"on",
"the",
"expression",
"of",
"genes",
"which",
"are",
"known",
"to",
"be",
"regulated",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Both",
"RA",
"and",
"PMA",
"effectively",
"down-regulated",
"c-myc",
"expression",
",",
"while",
"c-myb",
"expression",
"decreased",
"only",
"after",
"PMA",
"treatment",
"."
] | [
"both",
"ra",
"and",
"pma",
"effectively",
"down-regulated",
"c-myc",
"expression",
",",
"while",
"c-myb",
"expression",
"decreased",
"only",
"after",
"pma",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"the",
"beta",
"2-integrin",
"genes",
",",
"CD11a",
"and",
"CD11b",
",",
"was",
"clearly",
"increased",
"after",
"both",
"of",
"these",
"treatments",
"."
] | [
"expression",
"of",
"the",
"beta",
"2-integrin",
"genes",
",",
"cd11a",
"and",
"cd11b",
",",
"was",
"clearly",
"increased",
"after",
"both",
"of",
"these",
"treatments",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Their",
"effects",
"on",
"the",
"src-family",
"tyrosine",
"kinase",
"genes",
"were",
"different",
":",
"hck",
"expression",
"was",
"similarly",
"induced",
"by",
"these",
"agents",
"but",
"lyn",
"expression",
"was",
"stronger",
"and",
"more",
"rapid",
"after",
"RA",
"treatment",
"."
] | [
"their",
"effects",
"on",
"the",
"src-family",
"tyrosine",
"kinase",
"genes",
"were",
"different",
":",
"hck",
"expression",
"was",
"similarly",
"induced",
"by",
"these",
"agents",
"but",
"lyn",
"expression",
"was",
"stronger",
"and",
"more",
"rapid",
"after",
"ra",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"RA",
"also",
"enhanced",
"lyn",
"mRNA",
"production",
"rapidly",
"in",
"HL-60",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"activation",
"of",
"lyn",
"gene",
"expression",
"is",
"common",
"in",
"monocytic",
"and",
"granulocytic",
"maturation",
"of",
"myeloid",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"ra",
"also",
"enhanced",
"lyn",
"mrna",
"production",
"rapidly",
"in",
"hl-60",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"activation",
"of",
"lyn",
"gene",
"expression",
"is",
"common",
"in",
"monocytic",
"and",
"granulocytic",
"maturation",
"of",
"myeloid",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"To",
"examine",
"whether",
"the",
"AP-1",
"enhancer",
"activity",
"is",
"involved",
"in",
"RA",
"-induced",
"monocytic",
"differentiation",
",",
"THP-1",
"cells",
"were",
"transiently",
"transfected",
"with",
"a",
"chloramphenicol",
"acetyl",
"transferase",
"(",
"CAT",
")",
"-reporter",
"gene",
"containing",
"5",
"copies",
"of",
"the",
"AP-1",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"to",
"examine",
"whether",
"the",
"ap-1",
"enhancer",
"activity",
"is",
"involved",
"in",
"ra",
"-induced",
"monocytic",
"differentiation",
",",
"thp-1",
"cells",
"were",
"transiently",
"transfected",
"with",
"a",
"chloramphenicol",
"acetyl",
"transferase",
"(",
"cat",
")",
"-reporter",
"gene",
"containing",
"5",
"copies",
"of",
"the",
"ap-1",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"PMA",
",",
"RA",
"did",
"not",
"induce",
"any",
"CAT",
"activity",
"in",
"these",
"cells",
",",
"thus",
"suggesting",
"that",
"the",
"RA",
"-induced",
"changes",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"those",
"genes",
"described",
"above",
"were",
"not",
"dependent",
"on",
"the",
"AP-1",
"enhancer",
"activity",
"."
] | [
"in",
"contrast",
"to",
"pma",
",",
"ra",
"did",
"not",
"induce",
"any",
"cat",
"activity",
"in",
"these",
"cells",
",",
"thus",
"suggesting",
"that",
"the",
"ra",
"-induced",
"changes",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"those",
"genes",
"described",
"above",
"were",
"not",
"dependent",
"on",
"the",
"ap-1",
"enhancer",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Targeted",
"remodeling",
"of",
"human",
"beta-globin",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"produces",
"increased",
"expression",
"and",
"decreased",
"silencing",
"."
] | [
"targeted",
"remodeling",
"of",
"human",
"beta-globin",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"produces",
"increased",
"expression",
"and",
"decreased",
"silencing",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"chromatin",
"structure",
"of",
"the",
"human",
"beta-globin",
"gene",
"locus",
"assumes",
"a",
"transcriptionally-active",
"conformation",
"in",
"erythroid",
"cells",
"."
] | [
"the",
"chromatin",
"structure",
"of",
"the",
"human",
"beta-globin",
"gene",
"locus",
"assumes",
"a",
"transcriptionally-active",
"conformation",
"in",
"erythroid",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"One",
"feature",
"of",
"this",
"chromatin",
"reorganization",
"is",
"the",
"formation",
"of",
"DNase",
"1",
"hypersensitive",
"sites",
"in",
"the",
"regions",
"of",
"active",
"globin",
"gene",
"promoters",
"."
] | [
"one",
"feature",
"of",
"this",
"chromatin",
"reorganization",
"is",
"the",
"formation",
"of",
"dnase",
"1",
"hypersensitive",
"sites",
"in",
"the",
"regions",
"of",
"active",
"globin",
"gene",
"promoters",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"This",
"reorganization",
"requires",
"the",
"globin",
"locus",
"control",
"region",
"and",
"is",
"associated",
"with",
"normal",
"expression",
"of",
"the",
"beta-like",
"globin",
"genes",
"."
] | [
"this",
"reorganization",
"requires",
"the",
"globin",
"locus",
"control",
"region",
"and",
"is",
"associated",
"with",
"normal",
"expression",
"of",
"the",
"beta-like",
"globin",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"To",
"determine",
"whether",
"it",
"is",
"possible",
"to",
"artificially",
"enhance",
"the",
"opening",
"of",
"the",
"chromatin",
"structure",
"of",
"a",
"minimal",
"beta-globin",
"promoter",
",",
"we",
"placed",
"a",
"101bp",
",",
"erythroid-specific",
"DNase",
"1",
"hypersensitive",
"site-forming",
"element",
"(",
"HSFE",
")",
"immediately",
"upstream",
"of",
"the",
"beta-globin",
"promoter",
"and",
"gene",
"."
] | [
"to",
"determine",
"whether",
"it",
"is",
"possible",
"to",
"artificially",
"enhance",
"the",
"opening",
"of",
"the",
"chromatin",
"structure",
"of",
"a",
"minimal",
"beta-globin",
"promoter",
",",
"we",
"placed",
"a",
"101bp",
",",
"erythroid-specific",
"dnase",
"1",
"hypersensitive",
"site-forming",
"element",
"(",
"hsfe",
")",
"immediately",
"upstream",
"of",
"the",
"beta-globin",
"promoter",
"and",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"element",
"includes",
"binding",
"sites",
"for",
"NF-E2",
",",
"AP-1",
",",
"GATA-1",
"and",
"Sp-1",
"."
] | [
"this",
"element",
"includes",
"binding",
"sites",
"for",
"nf-e2",
",",
"ap-1",
",",
"gata-1",
"and",
"sp-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Constructs",
"were",
"stably",
"transfected",
"into",
"murine",
"erythroleukemia",
"cells",
"and",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"and",
"gene",
"expression",
"were",
"analyzed",
"."
] | [
"constructs",
"were",
"stably",
"transfected",
"into",
"murine",
"erythroleukemia",
"cells",
"and",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"and",
"gene",
"expression",
"were",
"analyzed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"HSFE",
"induced",
"an",
"area",
"of",
"enhanced",
"DNase",
"1",
"hypersensitivity",
"extending",
"from",
"the",
"transcriptional",
"start",
"site",
"to",
"-300bp",
"of",
"the",
"artificial",
"promoter",
"and",
"significantly",
"increased",
"the",
"proportion",
"of",
"beta-globin",
"promoters",
"in",
"an",
"open",
"chromatin",
"configuration",
"."
] | [
"the",
"hsfe",
"induced",
"an",
"area",
"of",
"enhanced",
"dnase",
"1",
"hypersensitivity",
"extending",
"from",
"the",
"transcriptional",
"start",
"site",
"to",
"-300bp",
"of",
"the",
"artificial",
"promoter",
"and",
"significantly",
"increased",
"the",
"proportion",
"of",
"beta-globin",
"promoters",
"in",
"an",
"open",
"chromatin",
"configuration",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"O"
] |
[
"This",
"remodeling",
"of",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"resulted",
"in",
"3-fold",
"increases",
"in",
"beta-globin",
"gene",
"transcription",
"and",
"induction",
",",
"and",
"inhibited",
"long-term",
"beta-globin",
"gene",
"silencing",
"."
] | [
"this",
"remodeling",
"of",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"resulted",
"in",
"3-fold",
"increases",
"in",
"beta-globin",
"gene",
"transcription",
"and",
"induction",
",",
"and",
"inhibited",
"long-term",
"beta-globin",
"gene",
"silencing",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"a",
"relatively",
"small",
"cis-acting",
"element",
"is",
"able",
"to",
"enhance",
"remodeling",
"of",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"resulting",
"in",
"increased",
"beta-globin",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"these",
"results",
"indicate",
"that",
"a",
"relatively",
"small",
"cis-acting",
"element",
"is",
"able",
"to",
"enhance",
"remodeling",
"of",
"promoter",
"chromatin",
"structure",
"resulting",
"in",
"increased",
"beta-globin",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"RNA",
"polymerase",
"II",
"transcription",
"in",
"human",
"cells",
"by",
"synthetic",
"DNA-binding",
"ligands",
"[",
"see",
"comments",
"]"
] | [
"inhibition",
"of",
"rna",
"polymerase",
"ii",
"transcription",
"in",
"human",
"cells",
"by",
"synthetic",
"dna-binding",
"ligands",
"[",
"see",
"comments",
"]"
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sequence-specific",
"DNA-binding",
"small",
"molecules",
"that",
"can",
"permeate",
"human",
"cells",
"potentially",
"could",
"regulate",
"transcription",
"of",
"specific",
"genes",
"."
] | [
"sequence-specific",
"dna-binding",
"small",
"molecules",
"that",
"can",
"permeate",
"human",
"cells",
"potentially",
"could",
"regulate",
"transcription",
"of",
"specific",
"genes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Multiple",
"cellular",
"DNA-binding",
"transcription",
"factors",
"are",
"required",
"by",
"HIV",
"type",
"1",
"for",
"RNA",
"synthesis",
"."
] | [
"multiple",
"cellular",
"dna-binding",
"transcription",
"factors",
"are",
"required",
"by",
"hiv",
"type",
"1",
"for",
"rna",
"synthesis",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Two",
"pyrrole-imidazole",
"polyamides",
"were",
"designed",
"to",
"bind",
"DNA",
"sequences",
"immediately",
"adjacent",
"to",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factors",
"Ets-1",
",",
"lymphoid-enhancer",
"binding",
"factor",
"1",
",",
"and",
"TATA-box",
"binding",
"protein",
"."
] | [
"two",
"pyrrole-imidazole",
"polyamides",
"were",
"designed",
"to",
"bind",
"dna",
"sequences",
"immediately",
"adjacent",
"to",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factors",
"ets-1",
",",
"lymphoid-enhancer",
"binding",
"factor",
"1",
",",
"and",
"tata-box",
"binding",
"protein",
"."
] | [
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"synthetic",
"ligands",
"specifically",
"inhibit",
"DNA-binding",
"of",
"each",
"transcription",
"factor",
"and",
"HIV",
"type",
"1",
"transcription",
"in",
"cell-free",
"assays",
"."
] | [
"these",
"synthetic",
"ligands",
"specifically",
"inhibit",
"dna-binding",
"of",
"each",
"transcription",
"factor",
"and",
"hiv",
"type",
"1",
"transcription",
"in",
"cell-free",
"assays",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"When",
"used",
"in",
"combination",
",",
"the",
"polyamides",
"inhibit",
"virus",
"replication",
"by",
">99%",
"in",
"isolated",
"human",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
",",
"with",
"no",
"detectable",
"cell",
"toxicity",
"."
] | [
"when",
"used",
"in",
"combination",
",",
"the",
"polyamides",
"inhibit",
"virus",
"replication",
"by",
">99%",
"in",
"isolated",
"human",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
",",
"with",
"no",
"detectable",
"cell",
"toxicity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ability",
"of",
"small",
"molecules",
"to",
"target",
"predetermined",
"DNA",
"sequences",
"located",
"within",
"RNA",
"polymerase",
"II",
"promoters",
"suggests",
"a",
"general",
"approach",
"for",
"regulation",
"of",
"gene",
"expression",
",",
"as",
"well",
"as",
"a",
"mechanism",
"for",
"the",
"inhibition",
"of",
"viral",
"replication",
"."
] | [
"the",
"ability",
"of",
"small",
"molecules",
"to",
"target",
"predetermined",
"dna",
"sequences",
"located",
"within",
"rna",
"polymerase",
"ii",
"promoters",
"suggests",
"a",
"general",
"approach",
"for",
"regulation",
"of",
"gene",
"expression",
",",
"as",
"well",
"as",
"a",
"mechanism",
"for",
"the",
"inhibition",
"of",
"viral",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Regulation",
"of",
"IL-4",
"expression",
"by",
"the",
"transcription",
"factor",
"JunB",
"during",
"T",
"helper",
"cell",
"differentiation",
"."
] | [
"regulation",
"of",
"il-4",
"expression",
"by",
"the",
"transcription",
"factor",
"junb",
"during",
"t",
"helper",
"cell",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"basis",
"for",
"restricted",
"cytokine",
"expression",
"by",
"T",
"helper",
"1",
"(",
"Th1",
")",
"and",
"T",
"helper",
"2",
"(",
"Th2",
")",
"cells",
"is",
"unclear",
"."
] | [
"the",
"molecular",
"basis",
"for",
"restricted",
"cytokine",
"expression",
"by",
"t",
"helper",
"1",
"(",
"th1",
")",
"and",
"t",
"helper",
"2",
"(",
"th2",
")",
"cells",
"is",
"unclear",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Previous",
"studies",
"found",
"that",
"P1",
",",
"an",
"element",
"of",
"the",
"interleukin",
"4",
"(",
"IL-4",
")",
"promoter",
"that",
"binds",
"AP-1",
",",
"is",
"important",
"for",
"Th2-restricted",
"IL-4",
"expression",
"."
] | [
"previous",
"studies",
"found",
"that",
"p1",
",",
"an",
"element",
"of",
"the",
"interleukin",
"4",
"(",
"il-4",
")",
"promoter",
"that",
"binds",
"ap-1",
",",
"is",
"important",
"for",
"th2-restricted",
"il-4",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"show",
"that",
"JunB",
",",
"but",
"not",
"the",
"other",
"Jun",
"family",
"members",
",",
"was",
"selectively",
"induced",
"in",
"Th2",
"cells",
"and",
"not",
"in",
"Th1",
"cells",
"during",
"differentiation",
"."
] | [
"here",
"we",
"show",
"that",
"junb",
",",
"but",
"not",
"the",
"other",
"jun",
"family",
"members",
",",
"was",
"selectively",
"induced",
"in",
"th2",
"cells",
"and",
"not",
"in",
"th1",
"cells",
"during",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"JunB",
"has",
"previously",
"been",
"considered",
"to",
"be",
"a",
"negative",
"regulator",
"of",
"transcription",
"."
] | [
"junb",
"has",
"previously",
"been",
"considered",
"to",
"be",
"a",
"negative",
"regulator",
"of",
"transcription",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"we",
"show",
"that",
"JunB",
"binds",
"directly",
"to",
"the",
"P1",
"site",
"and",
"synergizes",
"with",
"c-Maf",
"to",
"activate",
"an",
"IL-4",
"luciferase",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"however",
",",
"we",
"show",
"that",
"junb",
"binds",
"directly",
"to",
"the",
"p1",
"site",
"and",
"synergizes",
"with",
"c-maf",
"to",
"activate",
"an",
"il-4",
"luciferase",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"JunB",
"-control",
"of",
"IL-4",
"expression",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"JunB",
"at",
"Thr",
"102",
"and-",
"104",
"by",
"JNK",
"MAP",
"kinase",
"."
] | [
"junb",
"-control",
"of",
"il-4",
"expression",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"junb",
"at",
"thr",
"102",
"and-",
"104",
"by",
"jnk",
"map",
"kinase",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"synergy",
"between",
"c-Maf",
"and",
"JunB",
"can",
"be",
"attributed",
"to",
"cooperative",
"DNA",
"binding",
",",
"which",
"is",
"facilitated",
"by",
"JunB",
"phosphorylation",
"."
] | [
"the",
"synergy",
"between",
"c-maf",
"and",
"junb",
"can",
"be",
"attributed",
"to",
"cooperative",
"dna",
"binding",
",",
"which",
"is",
"facilitated",
"by",
"junb",
"phosphorylation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"transgenic",
"mice",
",",
"elevated",
"JunB",
"levels",
"caused",
"increased",
"expression",
"of",
"several",
"Th2",
"cytokines",
"in",
"developing",
"Th1",
"cells",
"."
] | [
"in",
"transgenic",
"mice",
",",
"elevated",
"junb",
"levels",
"caused",
"increased",
"expression",
"of",
"several",
"th2",
"cytokines",
"in",
"developing",
"th1",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"JunB",
"also",
"upregulated",
"IL-4",
"expression",
"in",
"response",
"to",
"immunization",
"."
] | [
"junb",
"also",
"upregulated",
"il-4",
"expression",
"in",
"response",
"to",
"immunization",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"early",
"increase",
"of",
"JunB",
"protein",
"in",
"Th2",
"cells",
"can",
"provide",
"the",
"specificity",
"for",
"c-Maf",
"in",
"IL-4",
"expression",
"during",
"T",
"cell",
"development",
"and",
"directs",
"thereby",
"Th2",
"differentiation",
"."
] | [
"thus",
",",
"the",
"early",
"increase",
"of",
"junb",
"protein",
"in",
"th2",
"cells",
"can",
"provide",
"the",
"specificity",
"for",
"c-maf",
"in",
"il-4",
"expression",
"during",
"t",
"cell",
"development",
"and",
"directs",
"thereby",
"th2",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Reconstitution",
"of",
"T",
"cell",
"antigen",
"receptor-induced",
"Erk2",
"kinase",
"activation",
"in",
"Lck-negative",
"JCaM1",
"cells",
"by",
"Syk",
"."
] | [
"reconstitution",
"of",
"t",
"cell",
"antigen",
"receptor-induced",
"erk2",
"kinase",
"activation",
"in",
"lck-negative",
"jcam1",
"cells",
"by",
"syk",
"."
] | [
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"two",
"related",
"protein-",
"tyrosine",
"kinases",
"Syk",
"and",
"Zap",
"are",
"rapidly",
"phosphorylated",
"on",
"tyrosine",
"residues",
"and",
"enzymatically",
"activated",
"upon",
"crosslinking",
"of",
"the",
"T",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"."
] | [
"the",
"two",
"related",
"protein-",
"tyrosine",
"kinases",
"syk",
"and",
"zap",
"are",
"rapidly",
"phosphorylated",
"on",
"tyrosine",
"residues",
"and",
"enzymatically",
"activated",
"upon",
"crosslinking",
"of",
"the",
"t",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"reported",
"that",
"the",
"activation",
"of",
"Syk",
"is",
"less",
"dependent",
"on",
"the",
"Src",
"family",
"kinase",
"Lck",
"than",
"the",
"activation",
"of",
"Zap",
"."
] | [
"we",
"have",
"previously",
"reported",
"that",
"the",
"activation",
"of",
"syk",
"is",
"less",
"dependent",
"on",
"the",
"src",
"family",
"kinase",
"lck",
"than",
"the",
"activation",
"of",
"zap",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"report",
"that",
"overexpression",
"of",
"Syk",
"in",
"the",
"Lck",
"-negative",
"JCaM1",
"cells",
"enabled",
"the",
"T",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"/CD3",
"complex",
"to",
"induce",
"a",
"normal",
"activation",
"of",
"the",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"MAPK",
")",
"pathway",
"and",
"expression",
"of",
"a",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
"reporter",
"construct",
"."
] | [
"here",
"we",
"report",
"that",
"overexpression",
"of",
"syk",
"in",
"the",
"lck",
"-negative",
"jcam1",
"cells",
"enabled",
"the",
"t",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"/cd3",
"complex",
"to",
"induce",
"a",
"normal",
"activation",
"of",
"the",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"mapk",
")",
"pathway",
"and",
"expression",
"of",
"a",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"t",
"cells",
"reporter",
"construct",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"Zap",
"and",
"other",
"protein-",
"tyrosine",
"kinases",
"were",
"unable",
"to",
"reconstitute",
"these",
"signaling",
"pathways",
"when",
"expressed",
"at",
"the",
"same",
"levels",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"zap",
"and",
"other",
"protein-",
"tyrosine",
"kinases",
"were",
"unable",
"to",
"reconstitute",
"these",
"signaling",
"pathways",
"when",
"expressed",
"at",
"the",
"same",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"parallel",
",",
"Syk",
"was",
"phosphorylated",
"on",
"tyrosine",
",",
"while",
"Zap",
"was",
"not",
"."
] | [
"in",
"parallel",
",",
"syk",
"was",
"phosphorylated",
"on",
"tyrosine",
",",
"while",
"zap",
"was",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Syk",
"-mediated",
"T",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"-induced",
"MAPK",
"activation",
"was",
"detectable",
"within",
"1",
"min",
"of",
"receptor",
"stimulation",
"and",
"peaked",
"at",
"3-5",
"min",
"."
] | [
"the",
"syk",
"-mediated",
"t",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"-induced",
"mapk",
"activation",
"was",
"detectable",
"within",
"1",
"min",
"of",
"receptor",
"stimulation",
"and",
"peaked",
"at",
"3-5",
"min",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"capacity",
"of",
"Syk",
"to",
"reconstitute",
"the",
"MAPK",
"response",
"required",
"the",
"catalytic",
"activity",
"of",
"Syk",
",",
"an",
"intact",
"autophosphorylation",
"site",
"(",
"Y518",
"and",
"Y519",
")",
",",
"both",
"Src",
"homology",
"2",
"domains",
"and",
"it",
"was",
"blocked",
"by",
"the",
"inhibitory",
"N17-mutated",
"dominant-negative",
"Ras",
"construct",
"."
] | [
"the",
"capacity",
"of",
"syk",
"to",
"reconstitute",
"the",
"mapk",
"response",
"required",
"the",
"catalytic",
"activity",
"of",
"syk",
",",
"an",
"intact",
"autophosphorylation",
"site",
"(",
"y518",
"and",
"y519",
")",
",",
"both",
"src",
"homology",
"2",
"domains",
"and",
"it",
"was",
"blocked",
"by",
"the",
"inhibitory",
"n17-mutated",
"dominant-negative",
"ras",
"construct",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"A",
"Y341",
"-->",
"F",
"mutant",
"of",
"Syk",
",",
"which",
"is",
"deficient",
"in",
"its",
"interaction",
"with",
"phospholipase",
"Cy1",
"and",
"Vav",
",",
"was",
"less",
"efficient",
"than",
"wild-type",
"Syk",
"."
] | [
"a",
"y341",
"-->",
"f",
"mutant",
"of",
"syk",
",",
"which",
"is",
"deficient",
"in",
"its",
"interaction",
"with",
"phospholipase",
"cy1",
"and",
"vav",
",",
"was",
"less",
"efficient",
"than",
"wild-type",
"syk",
"."
] | [
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"Syk",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"Zap",
",",
"can",
"transduce",
"signals",
"from",
"the",
"T",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"independently",
"of",
"Lck",
"."
] | [
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"syk",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"zap",
",",
"can",
"transduce",
"signals",
"from",
"the",
"t",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"independently",
"of",
"lck",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Human",
"T-cell",
"leukemia",
"virus",
"type",
"I",
"Tax",
"activation",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"/Rel",
"involves",
"phosphorylation",
"and",
"degradation",
"of",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"and",
"RelA",
"(",
"p65",
")",
"-mediated",
"induction",
"of",
"the",
"c-rel",
"gene",
"."
] | [
"human",
"t-cell",
"leukemia",
"virus",
"type",
"i",
"tax",
"activation",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"/rel",
"involves",
"phosphorylation",
"and",
"degradation",
"of",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"and",
"rela",
"(",
"p65",
")",
"-mediated",
"induction",
"of",
"the",
"c-rel",
"gene",
"."
] | [
"B-other_name",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-other_name",
"B-protein_subunit",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"The",
"tax",
"gene",
"product",
"of",
"human",
"T-cell",
"leukemia",
"virus",
"type",
"I",
"(",
"HTLV-I",
")",
"is",
"a",
"potent",
"transcriptional",
"activator",
"that",
"both",
"stimulates",
"viral",
"gene",
"expression",
"and",
"activates",
"an",
"array",
"of",
"cellular",
"genes",
"involved",
"in",
"T-cell",
"growth",
"."
] | [
"the",
"tax",
"gene",
"product",
"of",
"human",
"t-cell",
"leukemia",
"virus",
"type",
"i",
"(",
"htlv-i",
")",
"is",
"a",
"potent",
"transcriptional",
"activator",
"that",
"both",
"stimulates",
"viral",
"gene",
"expression",
"and",
"activates",
"an",
"array",
"of",
"cellular",
"genes",
"involved",
"in",
"t-cell",
"growth",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"Tax",
"acts",
"indirectly",
"by",
"inducing",
"or",
"modifying",
"the",
"action",
"of",
"various",
"host",
"transcription",
"factors",
",",
"including",
"members",
"of",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"/Rel",
"family",
"of",
"enhancer-binding",
"proteins",
"."
] | [
"tax",
"acts",
"indirectly",
"by",
"inducing",
"or",
"modifying",
"the",
"action",
"of",
"various",
"host",
"transcription",
"factors",
",",
"including",
"members",
"of",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"/rel",
"family",
"of",
"enhancer-binding",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"In",
"resting",
"T",
"cells",
",",
"many",
"of",
"these",
"NF-kappa",
"B",
"/Rel",
"factors",
"are",
"sequestered",
"in",
"the",
"cytoplasm",
"by",
"various",
"ankyrin-rich",
"inhibitory",
"proteins",
",",
"including",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"."
] | [
"in",
"resting",
"t",
"cells",
",",
"many",
"of",
"these",
"nf-kappa",
"b",
"/rel",
"factors",
"are",
"sequestered",
"in",
"the",
"cytoplasm",
"by",
"various",
"ankyrin-rich",
"inhibitory",
"proteins",
",",
"including",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"HTLV-I",
"Tax",
"expression",
"leads",
"to",
"the",
"constitutive",
"nuclear",
"expression",
"of",
"biologically",
"active",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"c-Rel",
"complexes",
";",
"however",
",",
"the",
"biochemical",
"mechanism",
"(",
"s",
")",
"underlying",
"this",
"response",
"remains",
"poorly",
"understood",
"."
] | [
"htlv-i",
"tax",
"expression",
"leads",
"to",
"the",
"constitutive",
"nuclear",
"expression",
"of",
"biologically",
"active",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"c-rel",
"complexes",
";",
"however",
",",
"the",
"biochemical",
"mechanism",
"(",
"s",
")",
"underlying",
"this",
"response",
"remains",
"poorly",
"understood",
"."
] | [
"B-virus",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"Tax",
"-stimulated",
"nuclear",
"expression",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"in",
"both",
"HTLV-I",
"-infected",
"and",
"Tax",
"-transfected",
"human",
"T",
"cells",
"is",
"associated",
"with",
"the",
"phosphorylation",
"and",
"rapid",
"proteolytic",
"degradation",
"of",
"I",
"kappa",
"B",
"alpha",
"."
] | [
"in",
"this",
"study",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"tax",
"-stimulated",
"nuclear",
"expression",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"in",
"both",
"htlv-i",
"-infected",
"and",
"tax",
"-transfected",
"human",
"t",
"cells",
"is",
"associated",
"with",
"the",
"phosphorylation",
"and",
"rapid",
"proteolytic",
"degradation",
"of",
"i",
"kappa",
"b",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |