tokens
sequence
folded_tokens
sequence
labels
sequence
[ "Expression", "of", "E2A-HLF", "chimeric", "protein", "induced", "T-cell", "apoptosis", ",", "B-cell", "maturation", "arrest", ",", "and", "development", "of", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "." ]
[ "expression", "of", "e2a-hlf", "chimeric", "protein", "induced", "t-cell", "apoptosis", ",", "b-cell", "maturation", "arrest", ",", "and", "development", "of", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "The", "E2A-HLF", "fusion", "gene", ",", "generated", "by", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "(", "q22", ";", "p13", ")", "in", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "(", "ALL", ")", ",", "encodes", "a", "chimeric", "transcription", "factor", "in", "which", "the", "trans-activating", "domains", "of", "E2A", "are", "fused", "to", "the", "DNA-", "binding", "and", "dimerization", "domains", "of", "hepatic", "leukemic", "factor", "(", "HLF", ")", "." ]
[ "the", "e2a-hlf", "fusion", "gene", ",", "generated", "by", "t", "(", "17", ";", "19", ")", "(", "q22", ";", "p13", ")", "in", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "(", "all", ")", ",", "encodes", "a", "chimeric", "transcription", "factor", "in", "which", "the", "trans-activating", "domains", "of", "e2a", "are", "fused", "to", "the", "dna-", "binding", "and", "dimerization", "domains", "of", "hepatic", "leukemic", "factor", "(", "hlf", ")", "." ]
[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "To", "investigate", "its", "biological", "role", ",", "we", "generated", "transgenic", "mice", "expressing", "E2A-HLF", "using", "Ig", "enhancer", "and", "promoter", ",", "which", "direct", "transgene", "expression", "in", "cells", "committed", "to", "the", "lymphoid", "lineage", "." ]
[ "to", "investigate", "its", "biological", "role", ",", "we", "generated", "transgenic", "mice", "expressing", "e2a-hlf", "using", "ig", "enhancer", "and", "promoter", ",", "which", "direct", "transgene", "expression", "in", "cells", "committed", "to", "the", "lymphoid", "lineage", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "transgenic", "mice", "exhibited", "abnormal", "development", "in", "the", "thymus", "and", "spleen", "and", "were", "susceptible", "to", "infection", "." ]
[ "the", "transgenic", "mice", "exhibited", "abnormal", "development", "in", "the", "thymus", "and", "spleen", "and", "were", "susceptible", "to", "infection", "." ]
[ "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "The", "thymus", "contained", "small", "numbers", "of", "thymocytes", ",", "and", "TUNEL", "staining", "showed", "that", "higher", "population", "of", "thymocytes", "were", "undergoing", "apoptosis", "." ]
[ "the", "thymus", "contained", "small", "numbers", "of", "thymocytes", ",", "and", "tunel", "staining", "showed", "that", "higher", "population", "of", "thymocytes", "were", "undergoing", "apoptosis", "." ]
[ "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "The", "spleen", "exhibited", "a", "marked", "reduction", "in", "splenic", "lymphocytes", "and", "the", "flow", "cytometric", "analyses", "and", "the", "in", "vitro", "colony", "formation", "assays", "showed", "that", "the", "B-cell", "maturation", "was", "blocked", "at", "a", "very", "early", "developmental", "stage", "." ]
[ "the", "spleen", "exhibited", "a", "marked", "reduction", "in", "splenic", "lymphocytes", "and", "the", "flow", "cytometric", "analyses", "and", "the", "in", "vitro", "colony", "formation", "assays", "showed", "that", "the", "b-cell", "maturation", "was", "blocked", "at", "a", "very", "early", "developmental", "stage", "." ]
[ "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "These", "findings", "indicated", "that", "the", "expression", "of", "E2A-HLF", "induced", "T-cell", "apoptosis", "and", "B-cell", "maturation", "arrest", "in", "vivo", "and", "that", "the", "susceptibility", "of", "the", "transgenic", "mice", "to", "infection", "was", "due", "to", "immunodeficiency", "." ]
[ "these", "findings", "indicated", "that", "the", "expression", "of", "e2a-hlf", "induced", "t-cell", "apoptosis", "and", "b-cell", "maturation", "arrest", "in", "vivo", "and", "that", "the", "susceptibility", "of", "the", "transgenic", "mice", "to", "infection", "was", "due", "to", "immunodeficiency", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "Moreover", ",", "several", "transgenic", "mice", "developed", "acute", "leukemia", ",", "classified", "as", "T-", "ALL", "based", "on", "the", "surface", "marker", "analysis", "and", "DNA", "rearrangements", ",", "suggesting", "that", "an", "additional", "event", "is", "required", "for", "malignant", "transformation", "of", "lymphoid", "cells", "expressing", "E2A-HLF", "." ]
[ "moreover", ",", "several", "transgenic", "mice", "developed", "acute", "leukemia", ",", "classified", "as", "t-", "all", "based", "on", "the", "surface", "marker", "analysis", "and", "dna", "rearrangements", ",", "suggesting", "that", "an", "additional", "event", "is", "required", "for", "malignant", "transformation", "of", "lymphoid", "cells", "expressing", "e2a-hlf", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Our", "findings", "provide", "insight", "into", "the", "biological", "function", "of", "E2A-HLF", "in", "lymphoid", "development", "and", "also", "its", "role", "in", "leukemogenesis", "." ]
[ "our", "findings", "provide", "insight", "into", "the", "biological", "function", "of", "e2a-hlf", "in", "lymphoid", "development", "and", "also", "its", "role", "in", "leukemogenesis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "Delta-opioid", "receptors", "expressed", "by", "Jurkat", "T", "cells", "enhance", "IL-2", "secretion", "by", "increasing", "AP-1", "complexes", "and", "activity", "of", "the", "NF-AT/AP-1-binding", "promoter", "element", "." ]
[ "delta-opioid", "receptors", "expressed", "by", "jurkat", "t", "cells", "enhance", "il-2", "secretion", "by", "increasing", "ap-1", "complexes", "and", "activity", "of", "the", "nf-at/ap-1-binding", "promoter", "element", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "Recent", "molecular", "evidence", "points", "to", "transient", "and/or", "stage-specific", "expression", "of", "delta-", "and", "kappa-", "opioid", "receptors", "by", "thymic", "and", "peripheral", "T", "lymphocytes", "." ]
[ "recent", "molecular", "evidence", "points", "to", "transient", "and/or", "stage-specific", "expression", "of", "delta-", "and", "kappa-", "opioid", "receptors", "by", "thymic", "and", "peripheral", "t", "lymphocytes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "medical", "treatments", "or", "stress", "commonly", "increase", "opioid", "levels", ",", "it", "is", "important", "to", "understand", "the", "mechanisms", "by", "which", "opioids", "affect", "T", "lymphocyte", "functions", "." ]
[ "since", "medical", "treatments", "or", "stress", "commonly", "increase", "opioid", "levels", ",", "it", "is", "important", "to", "understand", "the", "mechanisms", "by", "which", "opioids", "affect", "t", "lymphocyte", "functions", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "We", "therefore", "created", "and", "studied", "a", "T", "cell", "line", "expressing", "the", "cloned", "delta-opioid", "receptor", "(", "DOR1", ")", "." ]
[ "we", "therefore", "created", "and", "studied", "a", "t", "cell", "line", "expressing", "the", "cloned", "delta-opioid", "receptor", "(", "dor1", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "DOR1", "ligation", "by", "a", "specific", "DOR1", "agonist", ",", "deltorphin", ",", "augmented", "IL-2", "secretion", "by", "synergizing", "with", "signals", "from", "TCR-", "CD3", "and", "CD28", "." ]
[ "dor1", "ligation", "by", "a", "specific", "dor1", "agonist", ",", "deltorphin", ",", "augmented", "il-2", "secretion", "by", "synergizing", "with", "signals", "from", "tcr-", "cd3", "and", "cd28", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Reporter", "gene", "constructs", "were", "used", "to", "map", "this", "effect", "of", "deltorphin", "to", "the", "AP-1-", "and", "NF-AT/AP-1-", "binding", "sites", "of", "the", "IL-2", "promoter", "." ]
[ "reporter", "gene", "constructs", "were", "used", "to", "map", "this", "effect", "of", "deltorphin", "to", "the", "ap-1-", "and", "nf-at/ap-1-", "binding", "sites", "of", "the", "il-2", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "Although", "DOR1", "signaling", "increased", "[", "Ca2+", "]", "i", ",", "deltorphin", "enhanced", "transcriptional", "activity", "of", "the", "NF-AT/AP-1-binding", "site", "via", "a", "mechanism", "independent", "of", "calcineurin", "and", "distinct", "from", "the", "effects", "of", "elevated", "[", "Ca2+", "]", "i", "." ]
[ "although", "dor1", "signaling", "increased", "[", "ca2+", "]", "i", ",", "deltorphin", "enhanced", "transcriptional", "activity", "of", "the", "nf-at/ap-1-binding", "site", "via", "a", "mechanism", "independent", "of", "calcineurin", "and", "distinct", "from", "the", "effects", "of", "elevated", "[", "ca2+", "]", "i", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "B-atom", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-atom", "O", "O", "O" ]
[ "Deltorphin", "also", "increased", "accumulation", "of", "AP-1", "transcription", "factor", "complexes", ",", "suggesting", "that", "DOR1", "augments", "IL-2", "secretion", "by", "increasing", "the", "AP-1", "component", "of", "the", "NF-AT/AP-1", "transcription", "factor", "." ]
[ "deltorphin", "also", "increased", "accumulation", "of", "ap-1", "transcription", "factor", "complexes", ",", "suggesting", "that", "dor1", "augments", "il-2", "secretion", "by", "increasing", "the", "ap-1", "component", "of", "the", "nf-at/ap-1", "transcription", "factor", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "These", "results", "advance", "the", "molecular", "understanding", "of", "opioid", "effects", "on", "lymphocytes", ",", "and", "in", "addition", ",", "demonstrate", "regulation", "of", "IL-2", "synthesis", "and", "secretion", "by", "the", "novel", "mechanism", "of", "receptor-mediated", "AP-1", "induction", "." ]
[ "these", "results", "advance", "the", "molecular", "understanding", "of", "opioid", "effects", "on", "lymphocytes", ",", "and", "in", "addition", ",", "demonstrate", "regulation", "of", "il-2", "synthesis", "and", "secretion", "by", "the", "novel", "mechanism", "of", "receptor-mediated", "ap-1", "induction", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "IL4", "and", "IL13", "receptors", "share", "the", "gamma", "c", "chain", "and", "activate", "STAT6", ",", "STAT3", "and", "STAT5", "proteins", "in", "normal", "human", "B", "cells", "." ]
[ "il4", "and", "il13", "receptors", "share", "the", "gamma", "c", "chain", "and", "activate", "stat6", ",", "stat3", "and", "stat5", "proteins", "in", "normal", "human", "b", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "IL13", "induces", "the", "same", "biological", "effects", "as", "IL4", "in", "normal", "human", "B", "cells", "." ]
[ "il13", "induces", "the", "same", "biological", "effects", "as", "il4", "in", "normal", "human", "b", "cells", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "We", "show", "that", "as", "in", "the", "IL4R", "complex", ",", "both", "IL4R", "alpha", "and", "IL2R", "gamma", "c", "are", "components", "of", "the", "IL13R", "and", "that", "both", "cytokines", "induced", "STAT6", ",", "STAT3", "and", "STAT5", "activation", "in", "B", "cells", "." ]
[ "we", "show", "that", "as", "in", "the", "il4r", "complex", ",", "both", "il4r", "alpha", "and", "il2r", "gamma", "c", "are", "components", "of", "the", "il13r", "and", "that", "both", "cytokines", "induced", "stat6", ",", "stat3", "and", "stat5", "activation", "in", "b", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "In", "spite", "of", "this", "similar", "downstream", "signalling", ",", "IL4", "and", "IL13", "used", "a", "different", "set", "of", "Janus", "kinases", ":", "IL13", "is", "unable", "to", "activate", "JAK1", "and", "JAK3", "." ]
[ "in", "spite", "of", "this", "similar", "downstream", "signalling", ",", "il4", "and", "il13", "used", "a", "different", "set", "of", "janus", "kinases", ":", "il13", "is", "unable", "to", "activate", "jak1", "and", "jak3", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Attenuation", "of", "gamma", "interferon", "-induced", "tyrosine", "phosphorylation", "in", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "Leishmania", "donovani", ":", "selective", "inhibition", "of", "signaling", "through", "Janus", "kinases", "and", "Stat1", "." ]
[ "attenuation", "of", "gamma", "interferon", "-induced", "tyrosine", "phosphorylation", "in", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "leishmania", "donovani", ":", "selective", "inhibition", "of", "signaling", "through", "janus", "kinases", "and", "stat1", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]
[ "The", "induction", "of", "gene", "transcription", "in", "response", "to", "gamma", "interferon", "is", "impaired", "in", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "Leishmania", "donovani", ",", "and", "the", "mechanisms", "involved", "are", "not", "fully", "understood", "." ]
[ "the", "induction", "of", "gene", "transcription", "in", "response", "to", "gamma", "interferon", "is", "impaired", "in", "mononuclear", "phagocytes", "infected", "with", "leishmania", "donovani", ",", "and", "the", "mechanisms", "involved", "are", "not", "fully", "understood", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "changes", "in", "gene", "expression", "brought", "about", "by", "gamma", "interferon", "are", "thought", "to", "involve", "transient", "increases", "in", "the", "activities", "of", "cellular", "protein", "tyrosine", "kinases", ",", "including", "the", "Janus", "kinases", "Jak1", "and", "Jak2", ",", "leading", "to", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "the", "transcription", "factor", "Stat1", "." ]
[ "the", "changes", "in", "gene", "expression", "brought", "about", "by", "gamma", "interferon", "are", "thought", "to", "involve", "transient", "increases", "in", "the", "activities", "of", "cellular", "protein", "tyrosine", "kinases", ",", "including", "the", "janus", "kinases", "jak1", "and", "jak2", ",", "leading", "to", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "the", "transcription", "factor", "stat1", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "O" ]
[ "To", "investigate", "the", "mechanisms", "accounting", "for", "the", "impaired", "responses", "to", "gamma", "interferon", ",", "a", "model", "system", "for", "examining", "overall", "changes", "in", "protein", "tyrosine", "phosphorylation", ",", "activation", "of", "Jak1", "and", "Jak2", "and", "phosphorylation", "of", "Stat1", "was", "developed", "in", "phorbol", "12-myristate", "13-acetate", "-differentiated", "U-937", "cells", "." ]
[ "to", "investigate", "the", "mechanisms", "accounting", "for", "the", "impaired", "responses", "to", "gamma", "interferon", ",", "a", "model", "system", "for", "examining", "overall", "changes", "in", "protein", "tyrosine", "phosphorylation", ",", "activation", "of", "jak1", "and", "jak2", "and", "phosphorylation", "of", "stat1", "was", "developed", "in", "phorbol", "12-myristate", "13-acetate", "-differentiated", "u-937", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Analysis", "of", "whole-cell", "lysates", "by", "antiphosphotyrosine", "immunoblotting", "showed", "that", "incubation", "with", "gamma", "interferon", "brought", "about", "specific", "increases", "in", "phosphotyrosine", "labeling", "of", "several", "proteins", "." ]
[ "analysis", "of", "whole-cell", "lysates", "by", "antiphosphotyrosine", "immunoblotting", "showed", "that", "incubation", "with", "gamma", "interferon", "brought", "about", "specific", "increases", "in", "phosphotyrosine", "labeling", "of", "several", "proteins", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Increased", "labeling", "of", "these", "proteins", "occurred", "to", "similar", "extents", "in", "control", "cells", "and", "in", "cells", "that", "had", "been", "infected", "with", "L", ".", "donovani", "for", "16", "h", "." ]
[ "increased", "labeling", "of", "these", "proteins", "occurred", "to", "similar", "extents", "in", "control", "cells", "and", "in", "cells", "that", "had", "been", "infected", "with", "l", ".", "donovani", "for", "16", "h", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Jak1", ",", "Jak2", ",", "and", "Stat1", "were", "immunoprecipitated", "from", "control", "and", "interferon-treated", "cells", ",", "and", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "these", "proteins", ",", "detected", "by", "antiphosphotyrosine", "immunoblotting", "was", "used", "to", "measured", "their", "activation", "." ]
[ "jak1", ",", "jak2", ",", "and", "stat1", "were", "immunoprecipitated", "from", "control", "and", "interferon-treated", "cells", ",", "and", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "these", "proteins", ",", "detected", "by", "antiphosphotyrosine", "immunoblotting", "was", "used", "to", "measured", "their", "activation", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Tyrosine", "phosphorylation", "of", "Jak1", ",", "Jak2", ",", "and", "Stat1", "increased", "markedly", ",", "in", "a", "dose-dependent", "manner", ",", "in", "U-937", "cells", "incubated", "with", "gamma", "interferon", "." ]
[ "tyrosine", "phosphorylation", "of", "jak1", ",", "jak2", ",", "and", "stat1", "increased", "markedly", ",", "in", "a", "dose-dependent", "manner", ",", "in", "u-937", "cells", "incubated", "with", "gamma", "interferon", "." ]
[ "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "in", "cells", "infected", "with", "L", ".", "donovani", ",", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "Jak1", ",", "Jak2", ",", "and", "Stat1", "was", "markedly", "impaired", "." ]
[ "in", "contrast", ",", "in", "cells", "infected", "with", "l", ".", "donovani", ",", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "jak1", ",", "jak2", ",", "and", "stat1", "was", "markedly", "impaired", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "effect", "was", "dependent", "upon", "the", "duration", "of", "exposure", "to", "L", ".", "donovani", "and", "was", "maximal", "and", "complete", "at", "16", "h", "." ]
[ "this", "effect", "was", "dependent", "upon", "the", "duration", "of", "exposure", "to", "l", ".", "donovani", "and", "was", "maximal", "and", "complete", "at", "16", "h", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Results", "similar", "to", "those", "observed", "with", "U-937", "cells", "were", "also", "obtained", "with", "human", "peripheral", "blood", "monocytes", "." ]
[ "results", "similar", "to", "those", "observed", "with", "u-937", "cells", "were", "also", "obtained", "with", "human", "peripheral", "blood", "monocytes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "These", "findings", "indicate", "that", "infection", "of", "human", "mononuclear", "phagocytes", "with", "L", ".", "donovani", "leads", "to", "impaired", "gamma", "interferon", "-mediated", "tyrosine", "phosphorylation", "and", "selective", "effects", "on", "the", "Jak-", "Stat1", "pathway", "." ]
[ "these", "findings", "indicate", "that", "infection", "of", "human", "mononuclear", "phagocytes", "with", "l", ".", "donovani", "leads", "to", "impaired", "gamma", "interferon", "-mediated", "tyrosine", "phosphorylation", "and", "selective", "effects", "on", "the", "jak-", "stat1", "pathway", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]
[ "Unresponsiveness", "to", "gamma", "interferon", "for", "activation", "of", "this", "pathway", "may", "explain", "impaired", "transcriptional", "responses", "in", "leishmania-infected", "cells", "." ]
[ "unresponsiveness", "to", "gamma", "interferon", "for", "activation", "of", "this", "pathway", "may", "explain", "impaired", "transcriptional", "responses", "in", "leishmania-infected", "cells", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Role", "of", "IKK1", "and", "IKK2", "in", "lipopolysaccharide", "signaling", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]
[ "role", "of", "ikk1", "and", "ikk2", "in", "lipopolysaccharide", "signaling", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Mononuclear", "phagocytes", "play", "a", "major", "role", "in", "immune", "and", "inflammatory", "responses", "." ]
[ "mononuclear", "phagocytes", "play", "a", "major", "role", "in", "immune", "and", "inflammatory", "responses", "." ]
[ "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "induces", "monocytes", "to", "express", "a", "variety", "of", "genes", "by", "activating", "the", "NF-kappaB/Rel", "transcription", "factor", "family", "." ]
[ "bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "lps", ")", "induces", "monocytes", "to", "express", "a", "variety", "of", "genes", "by", "activating", "the", "nf-kappab/rel", "transcription", "factor", "family", "." ]
[ "B-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "we", "have", "reported", "that", "the", "tumor", "necrosis", "factor", "and", "interleukin", "1", "signaling", "pathways", "activate", "two", "kinases", ",", "IKK1", "and", "IKK2", "." ]
[ "recently", ",", "we", "have", "reported", "that", "the", "tumor", "necrosis", "factor", "and", "interleukin", "1", "signaling", "pathways", "activate", "two", "kinases", ",", "ikk1", "and", "ikk2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Phosphorylation", "of", "the", "IkappaB", "cytoplasmic", "inhibitors", ",", "IkappaBalpha", ",", "IkappaBbeta", ",", "and", "IkappaBepsilon", ",", "by", "these", "kinases", "triggers", "proteolytic", "degradation", "and", "the", "release", "of", "NF-kappaB/Rel", "proteins", "into", "the", "nucleus", "." ]
[ "phosphorylation", "of", "the", "ikappab", "cytoplasmic", "inhibitors", ",", "ikappabalpha", ",", "ikappabbeta", ",", "and", "ikappabepsilon", ",", "by", "these", "kinases", "triggers", "proteolytic", "degradation", "and", "the", "release", "of", "nf-kappab/rel", "proteins", "into", "the", "nucleus", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "present", ",", "the", "role", "of", "the", "IKKs", "in", "LPS", "signaling", "has", "not", "been", "investigated", "." ]
[ "at", "present", ",", "the", "role", "of", "the", "ikks", "in", "lps", "signaling", "has", "not", "been", "investigated", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "report", "that", "LPS", "induces", "IKK", "activity", "in", "human", "monocytes", "and", "THP-1", "monocytic", "cells", "." ]
[ "here", ",", "we", "report", "that", "lps", "induces", "ikk", "activity", "in", "human", "monocytes", "and", "thp-1", "monocytic", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]
[ "The", "kinetics", "of", "activation", "of", "kinase", "activity", "in", "monocytic", "cells", "are", "relatively", "slow", "with", "maximal", "activity", "observed", "at", "60", "min", ",", "which", "coincides", "with", "the", "degradation", "of", "IkappaBs", "and", "the", "nuclear", "translocation", "of", "NF-kappaB", "." ]
[ "the", "kinetics", "of", "activation", "of", "kinase", "activity", "in", "monocytic", "cells", "are", "relatively", "slow", "with", "maximal", "activity", "observed", "at", "60", "min", ",", "which", "coincides", "with", "the", "degradation", "of", "ikappabs", "and", "the", "nuclear", "translocation", "of", "nf-kappab", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "O" ]
[ "In", "transfection", "experiments", ",", "overexpression", "of", "wild", "type", "IKK1", ",", "a", "dominant", "negative", "mutant", "IKK1", "(", "K44M", ")", ",", "or", "wild", "type", "IKK2", "did", "not", "affect", "LPS", "-induced", "kappaB", "-dependent", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "." ]
[ "in", "transfection", "experiments", ",", "overexpression", "of", "wild", "type", "ikk1", ",", "a", "dominant", "negative", "mutant", "ikk1", "(", "k44m", ")", ",", "or", "wild", "type", "ikk2", "did", "not", "affect", "lps", "-induced", "kappab", "-dependent", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "a", "dominant", "negative", "mutant", "of", "IKK2", "inhibited", "LPS", "induction", "of", "kappaB", "-dependent", "transcription", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "." ]
[ "in", "contrast", ",", "a", "dominant", "negative", "mutant", "of", "ikk2", "inhibited", "lps", "induction", "of", "kappab", "-dependent", "transcription", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "LPS", "induction", "of", "kappaB-dependent", "gene", "expression", "in", "human", "monocytic", "cells", "requires", "activation", "of", "IKK2", "." ]
[ "these", "results", "indicate", "that", "lps", "induction", "of", "kappab-dependent", "gene", "expression", "in", "human", "monocytic", "cells", "requires", "activation", "of", "ikk2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Comparison", "of", "retinoic", "acid", "and", "phorbol", "myristate", "acetate", "as", "inducers", "of", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "comparison", "of", "retinoic", "acid", "and", "phorbol", "myristate", "acetate", "as", "inducers", "of", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Several", "human", "myeloid", "leukemia", "cell", "lines", "growing", "in", "vitro", "can", "be", "induced", "to", "differentiate", "to", "more", "mature", "monocyte/macrophage-like", "cells", "by", "treatment", "with", "protein", "kinase", "C", "-activating", "phorbol", "esters", ",", "such", "as", "PMA", "." ]
[ "several", "human", "myeloid", "leukemia", "cell", "lines", "growing", "in", "vitro", "can", "be", "induced", "to", "differentiate", "to", "more", "mature", "monocyte/macrophage-like", "cells", "by", "treatment", "with", "protein", "kinase", "c", "-activating", "phorbol", "esters", ",", "such", "as", "pma", "." ]
[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]
[ "In", "addition", "to", "PMA", ",", "cells", "of", "the", "THP-1", "myeloid", "leukemia", "cell", "line", "acquire", "macrophage-like", "characteristics", "after", "treatment", "with", "all-trans", "retinoic", "acid", "(", "RA", ")", "." ]
[ "in", "addition", "to", "pma", ",", "cells", "of", "the", "thp-1", "myeloid", "leukemia", "cell", "line", "acquire", "macrophage-like", "characteristics", "after", "treatment", "with", "all-trans", "retinoic", "acid", "(", "ra", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O" ]
[ "To", "analyze", "the", "signal", "transduction", "mechanisms", "induced", "by", "RA", ",", "we", "first", "compared", "the", "effects", "of", "PMA", "and", "RA", "on", "the", "expression", "of", "genes", "which", "are", "known", "to", "be", "regulated", "during", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "to", "analyze", "the", "signal", "transduction", "mechanisms", "induced", "by", "ra", ",", "we", "first", "compared", "the", "effects", "of", "pma", "and", "ra", "on", "the", "expression", "of", "genes", "which", "are", "known", "to", "be", "regulated", "during", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Both", "RA", "and", "PMA", "effectively", "down-regulated", "c-myc", "expression", ",", "while", "c-myb", "expression", "decreased", "only", "after", "PMA", "treatment", "." ]
[ "both", "ra", "and", "pma", "effectively", "down-regulated", "c-myc", "expression", ",", "while", "c-myb", "expression", "decreased", "only", "after", "pma", "treatment", "." ]
[ "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O" ]
[ "Expression", "of", "the", "beta", "2-integrin", "genes", ",", "CD11a", "and", "CD11b", ",", "was", "clearly", "increased", "after", "both", "of", "these", "treatments", "." ]
[ "expression", "of", "the", "beta", "2-integrin", "genes", ",", "cd11a", "and", "cd11b", ",", "was", "clearly", "increased", "after", "both", "of", "these", "treatments", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Their", "effects", "on", "the", "src-family", "tyrosine", "kinase", "genes", "were", "different", ":", "hck", "expression", "was", "similarly", "induced", "by", "these", "agents", "but", "lyn", "expression", "was", "stronger", "and", "more", "rapid", "after", "RA", "treatment", "." ]
[ "their", "effects", "on", "the", "src-family", "tyrosine", "kinase", "genes", "were", "different", ":", "hck", "expression", "was", "similarly", "induced", "by", "these", "agents", "but", "lyn", "expression", "was", "stronger", "and", "more", "rapid", "after", "ra", "treatment", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O" ]
[ "RA", "also", "enhanced", "lyn", "mRNA", "production", "rapidly", "in", "HL-60", ",", "indicating", "that", "the", "activation", "of", "lyn", "gene", "expression", "is", "common", "in", "monocytic", "and", "granulocytic", "maturation", "of", "myeloid", "leukemia", "cells", "." ]
[ "ra", "also", "enhanced", "lyn", "mrna", "production", "rapidly", "in", "hl-60", ",", "indicating", "that", "the", "activation", "of", "lyn", "gene", "expression", "is", "common", "in", "monocytic", "and", "granulocytic", "maturation", "of", "myeloid", "leukemia", "cells", "." ]
[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "To", "examine", "whether", "the", "AP-1", "enhancer", "activity", "is", "involved", "in", "RA", "-induced", "monocytic", "differentiation", ",", "THP-1", "cells", "were", "transiently", "transfected", "with", "a", "chloramphenicol", "acetyl", "transferase", "(", "CAT", ")", "-reporter", "gene", "containing", "5", "copies", "of", "the", "AP-1", "binding", "sites", "." ]
[ "to", "examine", "whether", "the", "ap-1", "enhancer", "activity", "is", "involved", "in", "ra", "-induced", "monocytic", "differentiation", ",", "thp-1", "cells", "were", "transiently", "transfected", "with", "a", "chloramphenicol", "acetyl", "transferase", "(", "cat", ")", "-reporter", "gene", "containing", "5", "copies", "of", "the", "ap-1", "binding", "sites", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "PMA", ",", "RA", "did", "not", "induce", "any", "CAT", "activity", "in", "these", "cells", ",", "thus", "suggesting", "that", "the", "RA", "-induced", "changes", "in", "the", "expression", "of", "those", "genes", "described", "above", "were", "not", "dependent", "on", "the", "AP-1", "enhancer", "activity", "." ]
[ "in", "contrast", "to", "pma", ",", "ra", "did", "not", "induce", "any", "cat", "activity", "in", "these", "cells", ",", "thus", "suggesting", "that", "the", "ra", "-induced", "changes", "in", "the", "expression", "of", "those", "genes", "described", "above", "were", "not", "dependent", "on", "the", "ap-1", "enhancer", "activity", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]
[ "Targeted", "remodeling", "of", "human", "beta-globin", "promoter", "chromatin", "structure", "produces", "increased", "expression", "and", "decreased", "silencing", "." ]
[ "targeted", "remodeling", "of", "human", "beta-globin", "promoter", "chromatin", "structure", "produces", "increased", "expression", "and", "decreased", "silencing", "." ]
[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "chromatin", "structure", "of", "the", "human", "beta-globin", "gene", "locus", "assumes", "a", "transcriptionally-active", "conformation", "in", "erythroid", "cells", "." ]
[ "the", "chromatin", "structure", "of", "the", "human", "beta-globin", "gene", "locus", "assumes", "a", "transcriptionally-active", "conformation", "in", "erythroid", "cells", "." ]
[ "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "One", "feature", "of", "this", "chromatin", "reorganization", "is", "the", "formation", "of", "DNase", "1", "hypersensitive", "sites", "in", "the", "regions", "of", "active", "globin", "gene", "promoters", "." ]
[ "one", "feature", "of", "this", "chromatin", "reorganization", "is", "the", "formation", "of", "dnase", "1", "hypersensitive", "sites", "in", "the", "regions", "of", "active", "globin", "gene", "promoters", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]
[ "This", "reorganization", "requires", "the", "globin", "locus", "control", "region", "and", "is", "associated", "with", "normal", "expression", "of", "the", "beta-like", "globin", "genes", "." ]
[ "this", "reorganization", "requires", "the", "globin", "locus", "control", "region", "and", "is", "associated", "with", "normal", "expression", "of", "the", "beta-like", "globin", "genes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]
[ "To", "determine", "whether", "it", "is", "possible", "to", "artificially", "enhance", "the", "opening", "of", "the", "chromatin", "structure", "of", "a", "minimal", "beta-globin", "promoter", ",", "we", "placed", "a", "101bp", ",", "erythroid-specific", "DNase", "1", "hypersensitive", "site-forming", "element", "(", "HSFE", ")", "immediately", "upstream", "of", "the", "beta-globin", "promoter", "and", "gene", "." ]
[ "to", "determine", "whether", "it", "is", "possible", "to", "artificially", "enhance", "the", "opening", "of", "the", "chromatin", "structure", "of", "a", "minimal", "beta-globin", "promoter", ",", "we", "placed", "a", "101bp", ",", "erythroid-specific", "dnase", "1", "hypersensitive", "site-forming", "element", "(", "hsfe", ")", "immediately", "upstream", "of", "the", "beta-globin", "promoter", "and", "gene", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "element", "includes", "binding", "sites", "for", "NF-E2", ",", "AP-1", ",", "GATA-1", "and", "Sp-1", "." ]
[ "this", "element", "includes", "binding", "sites", "for", "nf-e2", ",", "ap-1", ",", "gata-1", "and", "sp-1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Constructs", "were", "stably", "transfected", "into", "murine", "erythroleukemia", "cells", "and", "promoter", "chromatin", "structure", "and", "gene", "expression", "were", "analyzed", "." ]
[ "constructs", "were", "stably", "transfected", "into", "murine", "erythroleukemia", "cells", "and", "promoter", "chromatin", "structure", "and", "gene", "expression", "were", "analyzed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "HSFE", "induced", "an", "area", "of", "enhanced", "DNase", "1", "hypersensitivity", "extending", "from", "the", "transcriptional", "start", "site", "to", "-300bp", "of", "the", "artificial", "promoter", "and", "significantly", "increased", "the", "proportion", "of", "beta-globin", "promoters", "in", "an", "open", "chromatin", "configuration", "." ]
[ "the", "hsfe", "induced", "an", "area", "of", "enhanced", "dnase", "1", "hypersensitivity", "extending", "from", "the", "transcriptional", "start", "site", "to", "-300bp", "of", "the", "artificial", "promoter", "and", "significantly", "increased", "the", "proportion", "of", "beta-globin", "promoters", "in", "an", "open", "chromatin", "configuration", "." ]
[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O" ]
[ "This", "remodeling", "of", "promoter", "chromatin", "structure", "resulted", "in", "3-fold", "increases", "in", "beta-globin", "gene", "transcription", "and", "induction", ",", "and", "inhibited", "long-term", "beta-globin", "gene", "silencing", "." ]
[ "this", "remodeling", "of", "promoter", "chromatin", "structure", "resulted", "in", "3-fold", "increases", "in", "beta-globin", "gene", "transcription", "and", "induction", ",", "and", "inhibited", "long-term", "beta-globin", "gene", "silencing", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "a", "relatively", "small", "cis-acting", "element", "is", "able", "to", "enhance", "remodeling", "of", "promoter", "chromatin", "structure", "resulting", "in", "increased", "beta-globin", "gene", "expression", "." ]
[ "these", "results", "indicate", "that", "a", "relatively", "small", "cis-acting", "element", "is", "able", "to", "enhance", "remodeling", "of", "promoter", "chromatin", "structure", "resulting", "in", "increased", "beta-globin", "gene", "expression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O" ]
[ "Inhibition", "of", "RNA", "polymerase", "II", "transcription", "in", "human", "cells", "by", "synthetic", "DNA-binding", "ligands", "[", "see", "comments", "]" ]
[ "inhibition", "of", "rna", "polymerase", "ii", "transcription", "in", "human", "cells", "by", "synthetic", "dna-binding", "ligands", "[", "see", "comments", "]" ]
[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Sequence-specific", "DNA-binding", "small", "molecules", "that", "can", "permeate", "human", "cells", "potentially", "could", "regulate", "transcription", "of", "specific", "genes", "." ]
[ "sequence-specific", "dna-binding", "small", "molecules", "that", "can", "permeate", "human", "cells", "potentially", "could", "regulate", "transcription", "of", "specific", "genes", "." ]
[ "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multiple", "cellular", "DNA-binding", "transcription", "factors", "are", "required", "by", "HIV", "type", "1", "for", "RNA", "synthesis", "." ]
[ "multiple", "cellular", "dna-binding", "transcription", "factors", "are", "required", "by", "hiv", "type", "1", "for", "rna", "synthesis", "." ]
[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Two", "pyrrole-imidazole", "polyamides", "were", "designed", "to", "bind", "DNA", "sequences", "immediately", "adjacent", "to", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "Ets-1", ",", "lymphoid-enhancer", "binding", "factor", "1", ",", "and", "TATA-box", "binding", "protein", "." ]
[ "two", "pyrrole-imidazole", "polyamides", "were", "designed", "to", "bind", "dna", "sequences", "immediately", "adjacent", "to", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "ets-1", ",", "lymphoid-enhancer", "binding", "factor", "1", ",", "and", "tata-box", "binding", "protein", "." ]
[ "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O" ]
[ "These", "synthetic", "ligands", "specifically", "inhibit", "DNA-binding", "of", "each", "transcription", "factor", "and", "HIV", "type", "1", "transcription", "in", "cell-free", "assays", "." ]
[ "these", "synthetic", "ligands", "specifically", "inhibit", "dna-binding", "of", "each", "transcription", "factor", "and", "hiv", "type", "1", "transcription", "in", "cell-free", "assays", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "When", "used", "in", "combination", ",", "the", "polyamides", "inhibit", "virus", "replication", "by", ">99%", "in", "isolated", "human", "peripheral", "blood", "lymphocytes", ",", "with", "no", "detectable", "cell", "toxicity", "." ]
[ "when", "used", "in", "combination", ",", "the", "polyamides", "inhibit", "virus", "replication", "by", ">99%", "in", "isolated", "human", "peripheral", "blood", "lymphocytes", ",", "with", "no", "detectable", "cell", "toxicity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ability", "of", "small", "molecules", "to", "target", "predetermined", "DNA", "sequences", "located", "within", "RNA", "polymerase", "II", "promoters", "suggests", "a", "general", "approach", "for", "regulation", "of", "gene", "expression", ",", "as", "well", "as", "a", "mechanism", "for", "the", "inhibition", "of", "viral", "replication", "." ]
[ "the", "ability", "of", "small", "molecules", "to", "target", "predetermined", "dna", "sequences", "located", "within", "rna", "polymerase", "ii", "promoters", "suggests", "a", "general", "approach", "for", "regulation", "of", "gene", "expression", ",", "as", "well", "as", "a", "mechanism", "for", "the", "inhibition", "of", "viral", "replication", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Regulation", "of", "IL-4", "expression", "by", "the", "transcription", "factor", "JunB", "during", "T", "helper", "cell", "differentiation", "." ]
[ "regulation", "of", "il-4", "expression", "by", "the", "transcription", "factor", "junb", "during", "t", "helper", "cell", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "The", "molecular", "basis", "for", "restricted", "cytokine", "expression", "by", "T", "helper", "1", "(", "Th1", ")", "and", "T", "helper", "2", "(", "Th2", ")", "cells", "is", "unclear", "." ]
[ "the", "molecular", "basis", "for", "restricted", "cytokine", "expression", "by", "t", "helper", "1", "(", "th1", ")", "and", "t", "helper", "2", "(", "th2", ")", "cells", "is", "unclear", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "found", "that", "P1", ",", "an", "element", "of", "the", "interleukin", "4", "(", "IL-4", ")", "promoter", "that", "binds", "AP-1", ",", "is", "important", "for", "Th2-restricted", "IL-4", "expression", "." ]
[ "previous", "studies", "found", "that", "p1", ",", "an", "element", "of", "the", "interleukin", "4", "(", "il-4", ")", "promoter", "that", "binds", "ap-1", ",", "is", "important", "for", "th2-restricted", "il-4", "expression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "show", "that", "JunB", ",", "but", "not", "the", "other", "Jun", "family", "members", ",", "was", "selectively", "induced", "in", "Th2", "cells", "and", "not", "in", "Th1", "cells", "during", "differentiation", "." ]
[ "here", "we", "show", "that", "junb", ",", "but", "not", "the", "other", "jun", "family", "members", ",", "was", "selectively", "induced", "in", "th2", "cells", "and", "not", "in", "th1", "cells", "during", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O" ]
[ "JunB", "has", "previously", "been", "considered", "to", "be", "a", "negative", "regulator", "of", "transcription", "." ]
[ "junb", "has", "previously", "been", "considered", "to", "be", "a", "negative", "regulator", "of", "transcription", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "we", "show", "that", "JunB", "binds", "directly", "to", "the", "P1", "site", "and", "synergizes", "with", "c-Maf", "to", "activate", "an", "IL-4", "luciferase", "reporter", "gene", "." ]
[ "however", ",", "we", "show", "that", "junb", "binds", "directly", "to", "the", "p1", "site", "and", "synergizes", "with", "c-maf", "to", "activate", "an", "il-4", "luciferase", "reporter", "gene", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]
[ "JunB", "-control", "of", "IL-4", "expression", "is", "mediated", "by", "the", "phosphorylation", "of", "JunB", "at", "Thr", "102", "and-", "104", "by", "JNK", "MAP", "kinase", "." ]
[ "junb", "-control", "of", "il-4", "expression", "is", "mediated", "by", "the", "phosphorylation", "of", "junb", "at", "thr", "102", "and-", "104", "by", "jnk", "map", "kinase", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "The", "synergy", "between", "c-Maf", "and", "JunB", "can", "be", "attributed", "to", "cooperative", "DNA", "binding", ",", "which", "is", "facilitated", "by", "JunB", "phosphorylation", "." ]
[ "the", "synergy", "between", "c-maf", "and", "junb", "can", "be", "attributed", "to", "cooperative", "dna", "binding", ",", "which", "is", "facilitated", "by", "junb", "phosphorylation", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "In", "transgenic", "mice", ",", "elevated", "JunB", "levels", "caused", "increased", "expression", "of", "several", "Th2", "cytokines", "in", "developing", "Th1", "cells", "." ]
[ "in", "transgenic", "mice", ",", "elevated", "junb", "levels", "caused", "increased", "expression", "of", "several", "th2", "cytokines", "in", "developing", "th1", "cells", "." ]
[ "O", "B-other_artificial_source", "I-other_artificial_source", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "JunB", "also", "upregulated", "IL-4", "expression", "in", "response", "to", "immunization", "." ]
[ "junb", "also", "upregulated", "il-4", "expression", "in", "response", "to", "immunization", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "Thus", ",", "the", "early", "increase", "of", "JunB", "protein", "in", "Th2", "cells", "can", "provide", "the", "specificity", "for", "c-Maf", "in", "IL-4", "expression", "during", "T", "cell", "development", "and", "directs", "thereby", "Th2", "differentiation", "." ]
[ "thus", ",", "the", "early", "increase", "of", "junb", "protein", "in", "th2", "cells", "can", "provide", "the", "specificity", "for", "c-maf", "in", "il-4", "expression", "during", "t", "cell", "development", "and", "directs", "thereby", "th2", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Reconstitution", "of", "T", "cell", "antigen", "receptor-induced", "Erk2", "kinase", "activation", "in", "Lck-negative", "JCaM1", "cells", "by", "Syk", "." ]
[ "reconstitution", "of", "t", "cell", "antigen", "receptor-induced", "erk2", "kinase", "activation", "in", "lck-negative", "jcam1", "cells", "by", "syk", "." ]
[ "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "The", "two", "related", "protein-", "tyrosine", "kinases", "Syk", "and", "Zap", "are", "rapidly", "phosphorylated", "on", "tyrosine", "residues", "and", "enzymatically", "activated", "upon", "crosslinking", "of", "the", "T", "cell", "antigen", "receptor", "." ]
[ "the", "two", "related", "protein-", "tyrosine", "kinases", "syk", "and", "zap", "are", "rapidly", "phosphorylated", "on", "tyrosine", "residues", "and", "enzymatically", "activated", "upon", "crosslinking", "of", "the", "t", "cell", "antigen", "receptor", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "We", "have", "previously", "reported", "that", "the", "activation", "of", "Syk", "is", "less", "dependent", "on", "the", "Src", "family", "kinase", "Lck", "than", "the", "activation", "of", "Zap", "." ]
[ "we", "have", "previously", "reported", "that", "the", "activation", "of", "syk", "is", "less", "dependent", "on", "the", "src", "family", "kinase", "lck", "than", "the", "activation", "of", "zap", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Here", "we", "report", "that", "overexpression", "of", "Syk", "in", "the", "Lck", "-negative", "JCaM1", "cells", "enabled", "the", "T", "cell", "antigen", "receptor", "/CD3", "complex", "to", "induce", "a", "normal", "activation", "of", "the", "mitogen-activated", "protein", "kinase", "(", "MAPK", ")", "pathway", "and", "expression", "of", "a", "nuclear", "factor", "of", "activated", "T", "cells", "reporter", "construct", "." ]
[ "here", "we", "report", "that", "overexpression", "of", "syk", "in", "the", "lck", "-negative", "jcam1", "cells", "enabled", "the", "t", "cell", "antigen", "receptor", "/cd3", "complex", "to", "induce", "a", "normal", "activation", "of", "the", "mitogen-activated", "protein", "kinase", "(", "mapk", ")", "pathway", "and", "expression", "of", "a", "nuclear", "factor", "of", "activated", "t", "cells", "reporter", "construct", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "Zap", "and", "other", "protein-", "tyrosine", "kinases", "were", "unable", "to", "reconstitute", "these", "signaling", "pathways", "when", "expressed", "at", "the", "same", "levels", "." ]
[ "in", "contrast", ",", "zap", "and", "other", "protein-", "tyrosine", "kinases", "were", "unable", "to", "reconstitute", "these", "signaling", "pathways", "when", "expressed", "at", "the", "same", "levels", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "parallel", ",", "Syk", "was", "phosphorylated", "on", "tyrosine", ",", "while", "Zap", "was", "not", "." ]
[ "in", "parallel", ",", "syk", "was", "phosphorylated", "on", "tyrosine", ",", "while", "zap", "was", "not", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Syk", "-mediated", "T", "cell", "antigen", "receptor", "-induced", "MAPK", "activation", "was", "detectable", "within", "1", "min", "of", "receptor", "stimulation", "and", "peaked", "at", "3-5", "min", "." ]
[ "the", "syk", "-mediated", "t", "cell", "antigen", "receptor", "-induced", "mapk", "activation", "was", "detectable", "within", "1", "min", "of", "receptor", "stimulation", "and", "peaked", "at", "3-5", "min", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "capacity", "of", "Syk", "to", "reconstitute", "the", "MAPK", "response", "required", "the", "catalytic", "activity", "of", "Syk", ",", "an", "intact", "autophosphorylation", "site", "(", "Y518", "and", "Y519", ")", ",", "both", "Src", "homology", "2", "domains", "and", "it", "was", "blocked", "by", "the", "inhibitory", "N17-mutated", "dominant-negative", "Ras", "construct", "." ]
[ "the", "capacity", "of", "syk", "to", "reconstitute", "the", "mapk", "response", "required", "the", "catalytic", "activity", "of", "syk", ",", "an", "intact", "autophosphorylation", "site", "(", "y518", "and", "y519", ")", ",", "both", "src", "homology", "2", "domains", "and", "it", "was", "blocked", "by", "the", "inhibitory", "n17-mutated", "dominant-negative", "ras", "construct", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "A", "Y341", "-->", "F", "mutant", "of", "Syk", ",", "which", "is", "deficient", "in", "its", "interaction", "with", "phospholipase", "Cy1", "and", "Vav", ",", "was", "less", "efficient", "than", "wild-type", "Syk", "." ]
[ "a", "y341", "-->", "f", "mutant", "of", "syk", ",", "which", "is", "deficient", "in", "its", "interaction", "with", "phospholipase", "cy1", "and", "vav", ",", "was", "less", "efficient", "than", "wild-type", "syk", "." ]
[ "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Our", "results", "suggest", "that", "Syk", ",", "in", "contrast", "to", "Zap", ",", "can", "transduce", "signals", "from", "the", "T", "cell", "antigen", "receptor", "independently", "of", "Lck", "." ]
[ "our", "results", "suggest", "that", "syk", ",", "in", "contrast", "to", "zap", ",", "can", "transduce", "signals", "from", "the", "t", "cell", "antigen", "receptor", "independently", "of", "lck", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Human", "T-cell", "leukemia", "virus", "type", "I", "Tax", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "/Rel", "involves", "phosphorylation", "and", "degradation", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "and", "RelA", "(", "p65", ")", "-mediated", "induction", "of", "the", "c-rel", "gene", "." ]
[ "human", "t-cell", "leukemia", "virus", "type", "i", "tax", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "/rel", "involves", "phosphorylation", "and", "degradation", "of", "i", "kappa", "b", "alpha", "and", "rela", "(", "p65", ")", "-mediated", "induction", "of", "the", "c-rel", "gene", "." ]
[ "B-other_name", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "B-other_name", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "The", "tax", "gene", "product", "of", "human", "T-cell", "leukemia", "virus", "type", "I", "(", "HTLV-I", ")", "is", "a", "potent", "transcriptional", "activator", "that", "both", "stimulates", "viral", "gene", "expression", "and", "activates", "an", "array", "of", "cellular", "genes", "involved", "in", "T-cell", "growth", "." ]
[ "the", "tax", "gene", "product", "of", "human", "t-cell", "leukemia", "virus", "type", "i", "(", "htlv-i", ")", "is", "a", "potent", "transcriptional", "activator", "that", "both", "stimulates", "viral", "gene", "expression", "and", "activates", "an", "array", "of", "cellular", "genes", "involved", "in", "t-cell", "growth", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O" ]
[ "Tax", "acts", "indirectly", "by", "inducing", "or", "modifying", "the", "action", "of", "various", "host", "transcription", "factors", ",", "including", "members", "of", "the", "NF-kappa", "B", "/Rel", "family", "of", "enhancer-binding", "proteins", "." ]
[ "tax", "acts", "indirectly", "by", "inducing", "or", "modifying", "the", "action", "of", "various", "host", "transcription", "factors", ",", "including", "members", "of", "the", "nf-kappa", "b", "/rel", "family", "of", "enhancer-binding", "proteins", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "In", "resting", "T", "cells", ",", "many", "of", "these", "NF-kappa", "B", "/Rel", "factors", "are", "sequestered", "in", "the", "cytoplasm", "by", "various", "ankyrin-rich", "inhibitory", "proteins", ",", "including", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]
[ "in", "resting", "t", "cells", ",", "many", "of", "these", "nf-kappa", "b", "/rel", "factors", "are", "sequestered", "in", "the", "cytoplasm", "by", "various", "ankyrin-rich", "inhibitory", "proteins", ",", "including", "i", "kappa", "b", "alpha", "." ]
[ "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "HTLV-I", "Tax", "expression", "leads", "to", "the", "constitutive", "nuclear", "expression", "of", "biologically", "active", "NF-kappa", "B", "and", "c-Rel", "complexes", ";", "however", ",", "the", "biochemical", "mechanism", "(", "s", ")", "underlying", "this", "response", "remains", "poorly", "understood", "." ]
[ "htlv-i", "tax", "expression", "leads", "to", "the", "constitutive", "nuclear", "expression", "of", "biologically", "active", "nf-kappa", "b", "and", "c-rel", "complexes", ";", "however", ",", "the", "biochemical", "mechanism", "(", "s", ")", "underlying", "this", "response", "remains", "poorly", "understood", "." ]
[ "B-virus", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "Tax", "-stimulated", "nuclear", "expression", "of", "NF-kappa", "B", "in", "both", "HTLV-I", "-infected", "and", "Tax", "-transfected", "human", "T", "cells", "is", "associated", "with", "the", "phosphorylation", "and", "rapid", "proteolytic", "degradation", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]
[ "in", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "tax", "-stimulated", "nuclear", "expression", "of", "nf-kappa", "b", "in", "both", "htlv-i", "-infected", "and", "tax", "-transfected", "human", "t", "cells", "is", "associated", "with", "the", "phosphorylation", "and", "rapid", "proteolytic", "degradation", "of", "i", "kappa", "b", "alpha", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]