tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"IL-1",
"induces",
"a",
"rapid",
",",
"protein",
"synthesis-independent",
"appearance",
"of",
"IL-2R",
"alpha",
"mRNA",
"that",
"is",
"blocked",
"by",
"inhibitors",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"."
] | [
"il-1",
"induces",
"a",
"rapid",
",",
"protein",
"synthesis-independent",
"appearance",
"of",
"il-2r",
"alpha",
"mrna",
"that",
"is",
"blocked",
"by",
"inhibitors",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"also",
"primes",
"cells",
"to",
"become",
"IL-2",
"responsive",
"and",
"thereby",
"prepares",
"the",
"second",
"phase",
",",
"in",
"which",
"IL-2",
"induces",
"a",
"100-fold",
"further",
"increase",
"in",
"IL-2R",
"alpha",
"transcripts",
"."
] | [
"it",
"also",
"primes",
"cells",
"to",
"become",
"il-2",
"responsive",
"and",
"thereby",
"prepares",
"the",
"second",
"phase",
",",
"in",
"which",
"il-2",
"induces",
"a",
"100-fold",
"further",
"increase",
"in",
"il-2r",
"alpha",
"transcripts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Transient",
"transfection",
"experiments",
"show",
"that",
"several",
"elements",
"in",
"the",
"promoter-proximal",
"region",
"of",
"the",
"IL-2R",
"alpha",
"gene",
"contribute",
"to",
"IL-1",
"responsiveness",
",",
"most",
"importantly",
"an",
"NF-kappa",
"B",
"site",
"conserved",
"in",
"the",
"human",
"and",
"mouse",
"gene",
"."
] | [
"transient",
"transfection",
"experiments",
"show",
"that",
"several",
"elements",
"in",
"the",
"promoter-proximal",
"region",
"of",
"the",
"il-2r",
"alpha",
"gene",
"contribute",
"to",
"il-1",
"responsiveness",
",",
"most",
"importantly",
"an",
"nf-kappa",
"b",
"site",
"conserved",
"in",
"the",
"human",
"and",
"mouse",
"gene",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-2",
"responsiveness",
",",
"on",
"the",
"other",
"hand",
",",
"depends",
"on",
"a",
"78-nucleotide",
"segment",
"1",
".",
"3",
"kilobases",
"upstream",
"of",
"the",
"major",
"transcription",
"start",
"site",
"."
] | [
"il-2",
"responsiveness",
",",
"on",
"the",
"other",
"hand",
",",
"depends",
"on",
"a",
"78-nucleotide",
"segment",
"1",
".",
"3",
"kilobases",
"upstream",
"of",
"the",
"major",
"transcription",
"start",
"site",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"This",
"segment",
"functions",
"as",
"an",
"IL-2-inducible",
"enhancer",
"and",
"lies",
"within",
"a",
"region",
"that",
"becomes",
"DNase",
"I",
"hypersensitive",
"in",
"normal",
"T",
"cells",
"in",
"which",
"IL-2R",
"alpha",
"expression",
"has",
"been",
"induced",
"."
] | [
"this",
"segment",
"functions",
"as",
"an",
"il-2-inducible",
"enhancer",
"and",
"lies",
"within",
"a",
"region",
"that",
"becomes",
"dnase",
"i",
"hypersensitive",
"in",
"normal",
"t",
"cells",
"in",
"which",
"il-2r",
"alpha",
"expression",
"has",
"been",
"induced",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-2",
"responsiveness",
"requires",
"three",
"distinct",
"elements",
"within",
"the",
"enhancer",
"."
] | [
"il-2",
"responsiveness",
"requires",
"three",
"distinct",
"elements",
"within",
"the",
"enhancer",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Two",
"of",
"these",
"are",
"potential",
"binding",
"sites",
"for",
"STAT",
"proteins",
"."
] | [
"two",
"of",
"these",
"are",
"potential",
"binding",
"sites",
"for",
"stat",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"[",
"Regulation",
"of",
"transcription",
"of",
"the",
"interleukin-2",
"gene",
"in",
"B-lymphocytes",
"]"
] | [
"[",
"regulation",
"of",
"transcription",
"of",
"the",
"interleukin-2",
"gene",
"in",
"b-lymphocytes",
"]"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Since",
"most",
"B",
"cell",
"clones",
"immortalized",
"with",
"EBV",
"virus",
"can",
"be",
"induced",
"to",
"produce",
"interleukin-2",
",",
"a",
"typical",
"T",
"cell",
"cytokine",
",",
"we",
"studied",
"the",
"role",
"of",
"different",
"elements",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"in",
"such",
"clones",
"by",
"transfection",
"."
] | [
"since",
"most",
"b",
"cell",
"clones",
"immortalized",
"with",
"ebv",
"virus",
"can",
"be",
"induced",
"to",
"produce",
"interleukin-2",
",",
"a",
"typical",
"t",
"cell",
"cytokine",
",",
"we",
"studied",
"the",
"role",
"of",
"different",
"elements",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"in",
"such",
"clones",
"by",
"transfection",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"was",
"found",
",",
"in",
"particular",
",",
"that",
"the",
"element",
"TCEd",
",",
"which",
"binds",
"the",
"transcription",
"factor",
"NF-kB",
",",
"is",
"very",
"active",
"in",
"all",
"three",
"B",
"clones",
"tested",
"."
] | [
"it",
"was",
"found",
",",
"in",
"particular",
",",
"that",
"the",
"element",
"tced",
",",
"which",
"binds",
"the",
"transcription",
"factor",
"nf-kb",
",",
"is",
"very",
"active",
"in",
"all",
"three",
"b",
"clones",
"tested",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"element",
"has",
"no",
"activity",
"in",
"T",
"cells",
"of",
"the",
"Jurkat",
"line",
"."
] | [
"this",
"element",
"has",
"no",
"activity",
"in",
"t",
"cells",
"of",
"the",
"jurkat",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"NFATd",
"element",
",",
"which",
"binds",
"the",
"transcription",
"factor",
"NFAT-1",
"and",
"is",
"very",
"active",
"in",
"T",
"cells",
",",
"is",
"only",
"weakly",
"active",
"in",
"one",
"B",
"clone",
"and",
"not",
"at",
"all",
"in",
"another",
"."
] | [
"the",
"nfatd",
"element",
",",
"which",
"binds",
"the",
"transcription",
"factor",
"nfat-1",
"and",
"is",
"very",
"active",
"in",
"t",
"cells",
",",
"is",
"only",
"weakly",
"active",
"in",
"one",
"b",
"clone",
"and",
"not",
"at",
"all",
"in",
"another",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Different",
"elements",
"thus",
"contribute",
"to",
"IL-2",
"promoter",
"activity",
"in",
"different",
"cells",
"."
] | [
"different",
"elements",
"thus",
"contribute",
"to",
"il-2",
"promoter",
"activity",
"in",
"different",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"CD8",
"antigen",
"and",
"suppressor",
"activity",
"by",
"glucocorticoids",
"in",
"a",
"CEM",
"human",
"leukemic",
"cell",
"clone",
"."
] | [
"induction",
"of",
"cd8",
"antigen",
"and",
"suppressor",
"activity",
"by",
"glucocorticoids",
"in",
"a",
"cem",
"human",
"leukemic",
"cell",
"clone",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"relationship",
"between",
"glucocorticoid",
"effect",
"and",
"regulation",
"of",
"cell",
"surface",
"antigens",
"was",
"investigated",
"in",
"two",
"models",
"of",
"leukemic",
"cell",
"lines",
",",
"CEM",
"C7",
"denoted",
"(",
"r+",
",",
"ly+",
")",
"and",
"CEM",
"C1",
"(",
"r+",
",",
"ly-",
")",
"."
] | [
"the",
"relationship",
"between",
"glucocorticoid",
"effect",
"and",
"regulation",
"of",
"cell",
"surface",
"antigens",
"was",
"investigated",
"in",
"two",
"models",
"of",
"leukemic",
"cell",
"lines",
",",
"cem",
"c7",
"denoted",
"(",
"r+",
",",
"ly+",
")",
"and",
"cem",
"c1",
"(",
"r+",
",",
"ly-",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"reactivity",
"of",
"murine",
"monoclonal",
"antibodies",
",",
"anti-CD4-FITC",
",",
"anti-CD8-FITC",
",",
"anti-CD2-FITC",
"and",
"anti-calla-FITC",
",",
"were",
"analyzed",
"using",
"flow",
"cytometry",
"."
] | [
"the",
"reactivity",
"of",
"murine",
"monoclonal",
"antibodies",
",",
"anti-cd4-fitc",
",",
"anti-cd8-fitc",
",",
"anti-cd2-fitc",
"and",
"anti-calla-fitc",
",",
"were",
"analyzed",
"using",
"flow",
"cytometry",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"suppressor",
"function",
"was",
"determined",
"using",
"[",
"3H",
"]",
"thymidine",
"incorporation",
"into",
"phytohemagglutinin",
"-activated",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"."
] | [
"the",
"suppressor",
"function",
"was",
"determined",
"using",
"[",
"3h",
"]",
"thymidine",
"incorporation",
"into",
"phytohemagglutinin",
"-activated",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-nucleotide",
"I-nucleotide",
"I-nucleotide",
"I-nucleotide",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Dexamethasone",
"treatment",
"of",
"a",
"human",
"leukemic",
"cell",
"clone",
"CEM",
"C7",
"caused",
"an",
"increase",
"in",
"a",
"subset",
"of",
"cells",
"expressing",
"the",
"surface",
"antigen",
"CD8",
",",
"which",
"is",
"present",
"on",
"suppressor",
"and",
"cytotoxic",
"T-lymphocytes",
"."
] | [
"dexamethasone",
"treatment",
"of",
"a",
"human",
"leukemic",
"cell",
"clone",
"cem",
"c7",
"caused",
"an",
"increase",
"in",
"a",
"subset",
"of",
"cells",
"expressing",
"the",
"surface",
"antigen",
"cd8",
",",
"which",
"is",
"present",
"on",
"suppressor",
"and",
"cytotoxic",
"t-lymphocytes",
"."
] | [
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"By",
"comparison",
",",
"there",
"was",
"no",
"modification",
"of",
"the",
"expression",
"of",
"CD4",
"antigen",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"at",
"high",
"levels",
"in",
"these",
"cells",
"."
] | [
"by",
"comparison",
",",
"there",
"was",
"no",
"modification",
"of",
"the",
"expression",
"of",
"cd4",
"antigen",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"at",
"high",
"levels",
"in",
"these",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"two",
"days",
"of",
"treatment",
"with",
"5",
"x",
"10",
"(",
"-8",
")",
"M",
"dexamethasone",
",",
"CEM",
"C7",
"cells",
"showed",
"a",
"two-fold",
"increase",
"in",
"suppressor",
"activity",
"compared",
"to",
"untreated",
"cells",
"."
] | [
"after",
"two",
"days",
"of",
"treatment",
"with",
"5",
"x",
"10",
"(",
"-8",
")",
"m",
"dexamethasone",
",",
"cem",
"c7",
"cells",
"showed",
"a",
"two-fold",
"increase",
"in",
"suppressor",
"activity",
"compared",
"to",
"untreated",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"there",
"was",
"no",
"regulation",
"by",
"glucocorticoids",
"of",
"either",
"the",
"CD8",
"or",
"CD4",
"antigens",
"in",
"the",
"leukemic",
"clone",
"CEM",
"C1",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"there",
"was",
"no",
"regulation",
"by",
"glucocorticoids",
"of",
"either",
"the",
"cd8",
"or",
"cd4",
"antigens",
"in",
"the",
"leukemic",
"clone",
"cem",
"c1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"no",
"modification",
"of",
"the",
"suppressor",
"function",
"in",
"CEM",
"C1",
"cells",
"by",
"dexamethasone",
"was",
"observed",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"no",
"modification",
"of",
"the",
"suppressor",
"function",
"in",
"cem",
"c1",
"cells",
"by",
"dexamethasone",
"was",
"observed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"human",
"leukemic",
"cells",
"studied",
"here",
",",
"the",
"ability",
"to",
"induce",
"CD8",
"antigen",
"expression",
"in",
"a",
"CD4+",
"cells",
"correlates",
"with",
"the",
"ability",
"to",
"induce",
"cell",
"lysis",
"in",
"a",
"glucocorticoid",
"receptor",
"positive",
"cell",
"population",
"."
] | [
"in",
"the",
"human",
"leukemic",
"cells",
"studied",
"here",
",",
"the",
"ability",
"to",
"induce",
"cd8",
"antigen",
"expression",
"in",
"a",
"cd4+",
"cells",
"correlates",
"with",
"the",
"ability",
"to",
"induce",
"cell",
"lysis",
"in",
"a",
"glucocorticoid",
"receptor",
"positive",
"cell",
"population",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Targeted",
"degradation",
"of",
"c-Fos",
",",
"but",
"not",
"v-Fos",
",",
"by",
"a",
"phosphorylation-dependent",
"signal",
"on",
"c-Jun",
"."
] | [
"targeted",
"degradation",
"of",
"c-fos",
",",
"but",
"not",
"v-fos",
",",
"by",
"a",
"phosphorylation-dependent",
"signal",
"on",
"c-jun",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"proto-oncogene",
"products",
"c-Fos",
"and",
"c-Jun",
"heterodimerize",
"through",
"their",
"leucine",
"zippers",
"to",
"form",
"the",
"AP-1",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"the",
"proto-oncogene",
"products",
"c-fos",
"and",
"c-jun",
"heterodimerize",
"through",
"their",
"leucine",
"zippers",
"to",
"form",
"the",
"ap-1",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"heterodimer",
"is",
"regulated",
"by",
"signal-dependent",
"phosphorylation",
"and",
"dephosphorylation",
"events",
"."
] | [
"the",
"transcriptional",
"activity",
"of",
"the",
"heterodimer",
"is",
"regulated",
"by",
"signal-dependent",
"phosphorylation",
"and",
"dephosphorylation",
"events",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"stability",
"of",
"c-Fos",
"was",
"found",
"to",
"also",
"be",
"controlled",
"by",
"intracellular",
"signal",
"transduction",
"."
] | [
"the",
"stability",
"of",
"c-fos",
"was",
"found",
"to",
"also",
"be",
"controlled",
"by",
"intracellular",
"signal",
"transduction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"transient",
"expression",
"and",
"in",
"vitro",
"degradation",
"experiments",
",",
"the",
"stability",
"of",
"c-Fos",
"was",
"decreased",
"when",
"the",
"protein",
"was",
"dimerized",
"with",
"phosphorylated",
"c-Jun",
"."
] | [
"in",
"transient",
"expression",
"and",
"in",
"vitro",
"degradation",
"experiments",
",",
"the",
"stability",
"of",
"c-fos",
"was",
"decreased",
"when",
"the",
"protein",
"was",
"dimerized",
"with",
"phosphorylated",
"c-jun",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"c-Jun",
"protein",
"isolated",
"from",
"phorbol",
"ester-induced",
"cells",
"did",
"not",
"target",
"c-Fos",
"for",
"degradation",
",",
"which",
"suggests",
"that",
"c-Fos",
"is",
"transiently",
"stabilized",
"after",
"stimulation",
"of",
"cell",
"growth",
"."
] | [
"c-jun",
"protein",
"isolated",
"from",
"phorbol",
"ester-induced",
"cells",
"did",
"not",
"target",
"c-fos",
"for",
"degradation",
",",
"which",
"suggests",
"that",
"c-fos",
"is",
"transiently",
"stabilized",
"after",
"stimulation",
"of",
"cell",
"growth",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"v-Fos",
"protein",
",",
"the",
"retroviral",
"counterpart",
"of",
"c-Fos",
",",
"was",
"not",
"susceptible",
"to",
"degradation",
"targeted",
"by",
"c-Jun",
"."
] | [
"v-fos",
"protein",
",",
"the",
"retroviral",
"counterpart",
"of",
"c-fos",
",",
"was",
"not",
"susceptible",
"to",
"degradation",
"targeted",
"by",
"c-jun",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"protein",
"phosphatases",
"by",
"okadaic",
"acid",
"induces",
"AP1",
"in",
"human",
"T",
"cells",
"."
] | [
"inhibition",
"of",
"protein",
"phosphatases",
"by",
"okadaic",
"acid",
"induces",
"ap1",
"in",
"human",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"To",
"examine",
"the",
"role",
"of",
"protein",
"phosphatases",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
",",
"Jurkat",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"okadaic",
"acid",
",",
"an",
"inhibitor",
"of",
"type",
"1",
"and",
"2A",
"phosphatases",
",",
"and",
"nuclear",
"extracts",
"were",
"examined",
"for",
"the",
"presence",
"of",
"AP1",
"as",
"a",
"measure",
"of",
"early",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] | [
"to",
"examine",
"the",
"role",
"of",
"protein",
"phosphatases",
"in",
"t",
"cell",
"activation",
",",
"jurkat",
"cells",
"were",
"treated",
"with",
"okadaic",
"acid",
",",
"an",
"inhibitor",
"of",
"type",
"1",
"and",
"2a",
"phosphatases",
",",
"and",
"nuclear",
"extracts",
"were",
"examined",
"for",
"the",
"presence",
"of",
"ap1",
"as",
"a",
"measure",
"of",
"early",
"t",
"cell",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Okadaic",
"acid",
"was",
"found",
"to",
"be",
"a",
"potent",
"inducer",
"of",
"AP1",
"."
] | [
"okadaic",
"acid",
"was",
"found",
"to",
"be",
"a",
"potent",
"inducer",
"of",
"ap1",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"phorbol",
"esters",
"such",
"as",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"PMA",
")",
",",
"the",
"induction",
"of",
"AP1",
"by",
"okadaic",
"acid",
"occurs",
"predominantly",
"by",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"the",
"jun",
"and",
"fos",
"family",
"of",
"proto-oncogenes",
"."
] | [
"in",
"contrast",
"to",
"phorbol",
"esters",
"such",
"as",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"pma",
")",
",",
"the",
"induction",
"of",
"ap1",
"by",
"okadaic",
"acid",
"occurs",
"predominantly",
"by",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"the",
"jun",
"and",
"fos",
"family",
"of",
"proto-oncogenes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Surprisingly",
",",
"while",
"the",
"addition",
"of",
"phytohemagglutinin",
"further",
"enhanced",
"the",
"induction",
"of",
"AP1",
",",
"the",
"addition",
"of",
"PMA",
"inhibited",
"it",
"."
] | [
"surprisingly",
",",
"while",
"the",
"addition",
"of",
"phytohemagglutinin",
"further",
"enhanced",
"the",
"induction",
"of",
"ap1",
",",
"the",
"addition",
"of",
"pma",
"inhibited",
"it",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Okadaic",
"acid",
"treatment",
"was",
"found",
"to",
"dramatically",
"increase",
"mRNA",
"transcripts",
"of",
"the",
"jun",
"family",
"of",
"proto-oncogenes",
"including",
"c-jun",
",",
"junD",
",",
"and",
"junB",
"and",
"to",
"a",
"lesser",
"extent",
"the",
"fos",
"family",
"including",
"c-fos",
"and",
"fra-1",
"."
] | [
"okadaic",
"acid",
"treatment",
"was",
"found",
"to",
"dramatically",
"increase",
"mrna",
"transcripts",
"of",
"the",
"jun",
"family",
"of",
"proto-oncogenes",
"including",
"c-jun",
",",
"jund",
",",
"and",
"junb",
"and",
"to",
"a",
"lesser",
"extent",
"the",
"fos",
"family",
"including",
"c-fos",
"and",
"fra-1",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"By",
"comparison",
",",
"PMA",
"is",
"a",
"very",
"inefficient",
"inducer",
"of",
"the",
"jun",
"gene",
"family",
"in",
"Jurkat",
"cells",
"."
] | [
"by",
"comparison",
",",
"pma",
"is",
"a",
"very",
"inefficient",
"inducer",
"of",
"the",
"jun",
"gene",
"family",
"in",
"jurkat",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Similar",
"to",
"its",
"effect",
"on",
"the",
"induction",
"of",
"AP1",
"by",
"okadaic",
"acid",
",",
"PMA",
"inhibits",
"the",
"induction",
"of",
"c-jun",
"mRNA",
"by",
"okadaic",
"acid",
"."
] | [
"similar",
"to",
"its",
"effect",
"on",
"the",
"induction",
"of",
"ap1",
"by",
"okadaic",
"acid",
",",
"pma",
"inhibits",
"the",
"induction",
"of",
"c-jun",
"mrna",
"by",
"okadaic",
"acid",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"Transfection",
"of",
"c-jun",
"promoter",
"constructs",
"confirmed",
"the",
"marked",
"difference",
"between",
"PMA",
"and",
"okadaic",
"acid",
"in",
"inducing",
"c-jun",
"transcription",
"."
] | [
"transfection",
"of",
"c-jun",
"promoter",
"constructs",
"confirmed",
"the",
"marked",
"difference",
"between",
"pma",
"and",
"okadaic",
"acid",
"in",
"inducing",
"c-jun",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"induction",
"of",
"AP1",
"by",
"okadaic",
"acid",
"suggests",
"that",
"protein",
"phosphatases",
"1",
"and",
"2A",
"(",
"PP1",
"and",
"PP2A",
")",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
"as",
"important",
"negative",
"regulators",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"AP1",
"."
] | [
"the",
"induction",
"of",
"ap1",
"by",
"okadaic",
"acid",
"suggests",
"that",
"protein",
"phosphatases",
"1",
"and",
"2a",
"(",
"pp1",
"and",
"pp2a",
")",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"t",
"cell",
"activation",
"as",
"important",
"negative",
"regulators",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"ap1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"CAG",
"repeat",
"length",
"variation",
"in",
"sperm",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"Kennedy's",
"disease",
"."
] | [
"cag",
"repeat",
"length",
"variation",
"in",
"sperm",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"kennedy's",
"disease",
"."
] | [
"B-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"I-DNA_N/A",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Using",
"a",
"modified",
"sperm",
"typing",
"protocol",
",",
"the",
"mutation",
"frequency",
"of",
"the",
"CAG",
"repeat",
"region",
"at",
"the",
"androgen",
"receptor",
"locus",
"has",
"been",
"measured",
"using",
"a",
"rare",
"semen",
"sample",
"from",
"an",
"individual",
"with",
"spinal",
"and",
"bulbar",
"muscular",
"atrophy",
"(",
"SBMA",
")",
"."
] | [
"using",
"a",
"modified",
"sperm",
"typing",
"protocol",
",",
"the",
"mutation",
"frequency",
"of",
"the",
"cag",
"repeat",
"region",
"at",
"the",
"androgen",
"receptor",
"locus",
"has",
"been",
"measured",
"using",
"a",
"rare",
"semen",
"sample",
"from",
"an",
"individual",
"with",
"spinal",
"and",
"bulbar",
"muscular",
"atrophy",
"(",
"sbma",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Among",
"258",
"X",
"chromosome-containing",
"sperm",
",",
"19%",
"had",
"a",
"repeat",
"number",
"equal",
"to",
"the",
"donor's",
"somatic",
"DNA",
"(",
"47",
"repeats",
")",
",",
"66%",
"were",
"expansions",
"and",
"15%",
"were",
"contractions",
"."
] | [
"among",
"258",
"x",
"chromosome-containing",
"sperm",
",",
"19%",
"had",
"a",
"repeat",
"number",
"equal",
"to",
"the",
"donor's",
"somatic",
"dna",
"(",
"47",
"repeats",
")",
",",
"66%",
"were",
"expansions",
"and",
"15%",
"were",
"contractions",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"average",
"expansion",
"was",
"2",
".",
"7",
"repeats",
"."
] | [
"the",
"average",
"expansion",
"was",
"2",
".",
"7",
"repeats",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"than",
"half",
"of",
"the",
"expansions",
"involved",
"one",
"or",
"two",
"repeats",
";",
"the",
"largest",
"was",
"11",
"repeats",
"."
] | [
"more",
"than",
"half",
"of",
"the",
"expansions",
"involved",
"one",
"or",
"two",
"repeats",
";",
"the",
"largest",
"was",
"11",
"repeats",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"68%",
"of",
"the",
"contractions",
"were",
"also",
"one",
"or",
"two",
"repeats",
"but",
"six",
"(",
"16%",
")",
"were",
"very",
"large",
"(",
"12-25",
"repeats",
")",
"."
] | [
"68%",
"of",
"the",
"contractions",
"were",
"also",
"one",
"or",
"two",
"repeats",
"but",
"six",
"(",
"16%",
")",
"were",
"very",
"large",
"(",
"12-25",
"repeats",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"contraction",
"generated",
"an",
"allele",
"in",
"an",
"intermediate",
"size",
"range",
"(",
"33-39",
"repeats",
")",
"."
] | [
"one",
"contraction",
"generated",
"an",
"allele",
"in",
"an",
"intermediate",
"size",
"range",
"(",
"33-39",
"repeats",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Such",
"alleles",
"have",
"not",
"been",
"observed",
"among",
"more",
"than",
"900",
"normal",
"and",
"SBMA",
"X-chromosomes",
"that",
"have",
"been",
"examined",
"."
] | [
"such",
"alleles",
"have",
"not",
"been",
"observed",
"among",
"more",
"than",
"900",
"normal",
"and",
"sbma",
"x-chromosomes",
"that",
"have",
"been",
"examined",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"the",
"SBMA",
"sperm",
"typing",
"results",
"with",
"mutation",
"frequency",
"data",
"on",
"normal",
"alleles",
"supports",
"the",
"hypothesis",
"that",
"trinucleotide",
"repeat",
"expansions",
"may",
"have",
"a",
"different",
"molecular",
"origin",
"than",
"contractions",
"."
] | [
"comparison",
"of",
"the",
"sbma",
"sperm",
"typing",
"results",
"with",
"mutation",
"frequency",
"data",
"on",
"normal",
"alleles",
"supports",
"the",
"hypothesis",
"that",
"trinucleotide",
"repeat",
"expansions",
"may",
"have",
"a",
"different",
"molecular",
"origin",
"than",
"contractions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Role",
"of",
"the",
"X2",
"box",
"in",
"activated",
"transcription",
"from",
"the",
"DRA",
"promoter",
"in",
"B",
"cells",
"."
] | [
"role",
"of",
"the",
"x2",
"box",
"in",
"activated",
"transcription",
"from",
"the",
"dra",
"promoter",
"in",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"investigated",
"the",
"function",
"of",
"the",
"evolutionary",
"conserved",
"X2",
"box",
"in",
"the",
"promoter",
"of",
"the",
"HLA-DRA",
"gene",
"from",
"the",
"human",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"(",
"MHC",
")",
"in",
"resting",
"and",
"activated",
"B",
"cells",
"."
] | [
"we",
"investigated",
"the",
"function",
"of",
"the",
"evolutionary",
"conserved",
"x2",
"box",
"in",
"the",
"promoter",
"of",
"the",
"hla-dra",
"gene",
"from",
"the",
"human",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"(",
"mhc",
")",
"in",
"resting",
"and",
"activated",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"NF-X2",
",",
"which",
"contains",
"members",
"of",
"the",
"AP-1/ATF/CREB",
"families",
"of",
"transcription",
"factors",
",",
"interacts",
"with",
"the",
"X2",
"box",
"(",
"5'-TGCGTCA-3'",
")",
"from",
"positions",
"-97",
"to",
"-91",
"in",
"the",
"DRA",
"promoter",
"."
] | [
"nf-x2",
",",
"which",
"contains",
"members",
"of",
"the",
"ap-1/atf/creb",
"families",
"of",
"transcription",
"factors",
",",
"interacts",
"with",
"the",
"x2",
"box",
"(",
"5'-tgcgtca-3'",
")",
"from",
"positions",
"-97",
"to",
"-91",
"in",
"the",
"dra",
"promoter",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"resting",
"Raji",
"cells",
",",
"little",
"to",
"no",
"binding",
"to",
"the",
"X2",
"box",
"was",
"observed",
"."
] | [
"in",
"resting",
"raji",
"cells",
",",
"little",
"to",
"no",
"binding",
"to",
"the",
"x2",
"box",
"was",
"observed",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"sharp",
"contrast",
",",
"in",
"B",
"cells",
"treated",
"with",
"the",
"phorbol",
"ester",
"12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate",
"(",
"TPA",
")",
",",
"strong",
"interactions",
"between",
"the",
"X2",
"box",
"and",
"NF-X2",
"containing",
"c-Fos",
"were",
"observed",
"."
] | [
"in",
"sharp",
"contrast",
",",
"in",
"b",
"cells",
"treated",
"with",
"the",
"phorbol",
"ester",
"12-o-tetradecanoylphorbol-13-acetate",
"(",
"tpa",
")",
",",
"strong",
"interactions",
"between",
"the",
"x2",
"box",
"and",
"nf-x2",
"containing",
"c-fos",
"were",
"observed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"determined",
"by",
"transient",
"expression",
"and",
"RNA",
"analyses",
",",
"the",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"also",
"increased",
"rates",
"of",
"transcription",
"from",
"the",
"wild-type",
"DRA",
"promoter",
"but",
"not",
"from",
"a",
"DRA",
"promoter",
"bearing",
"clustered",
"point",
"mutations",
"in",
"the",
"X2",
"box",
"."
] | [
"as",
"determined",
"by",
"transient",
"expression",
"and",
"rna",
"analyses",
",",
"the",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
"(",
"pkc",
")",
"also",
"increased",
"rates",
"of",
"transcription",
"from",
"the",
"wild-type",
"dra",
"promoter",
"but",
"not",
"from",
"a",
"dra",
"promoter",
"bearing",
"clustered",
"point",
"mutations",
"in",
"the",
"x2",
"box",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Since",
"the",
"co-expression",
"with",
"a",
"dominant",
"negative",
"c-Fos",
"abolished",
"the",
"responsiveness",
"to",
"TPA",
",",
"we",
"conclude",
"that",
"activated",
"transcription",
"of",
"the",
"DRA",
"gene",
"depends",
"on",
"interactions",
"between",
"the",
"X2",
"box",
"and",
"NF-X2",
",",
"which",
"contains",
"c-Fos",
"."
] | [
"since",
"the",
"co-expression",
"with",
"a",
"dominant",
"negative",
"c-fos",
"abolished",
"the",
"responsiveness",
"to",
"tpa",
",",
"we",
"conclude",
"that",
"activated",
"transcription",
"of",
"the",
"dra",
"gene",
"depends",
"on",
"interactions",
"between",
"the",
"x2",
"box",
"and",
"nf-x2",
",",
"which",
"contains",
"c-fos",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Common",
"and",
"distinct",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"in",
"human",
"neutrophils",
"utilized",
"by",
"platelet",
"activating",
"factor",
"and",
"FMLP",
"."
] | [
"common",
"and",
"distinct",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"in",
"human",
"neutrophils",
"utilized",
"by",
"platelet",
"activating",
"factor",
"and",
"fmlp",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"of",
"human",
"neutrophils",
"with",
"chemoattractants",
"FMLP",
"or",
"platelet",
"activating",
"factor",
"(",
"PAF",
")",
"results",
"in",
"different",
"but",
"overlapping",
"functional",
"responses",
"."
] | [
"stimulation",
"of",
"human",
"neutrophils",
"with",
"chemoattractants",
"fmlp",
"or",
"platelet",
"activating",
"factor",
"(",
"paf",
")",
"results",
"in",
"different",
"but",
"overlapping",
"functional",
"responses",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"questioned",
"whether",
"these",
"differences",
"might",
"reflect",
"patterns",
"of",
"intracellular",
"signal",
"transduction",
"."
] | [
"we",
"questioned",
"whether",
"these",
"differences",
"might",
"reflect",
"patterns",
"of",
"intracellular",
"signal",
"transduction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"with",
"either",
"PAF",
"or",
"FMLP",
"resulted",
"in",
"equivalent",
"phosphorylation",
"and",
"activation",
"of",
"the",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"MAPk",
")",
"homologue",
"38-kD",
"murine",
"MAP",
"kinase",
"homologous",
"to",
"HOG-1",
"(",
"p38",
")",
"MAPk",
"."
] | [
"stimulation",
"with",
"either",
"paf",
"or",
"fmlp",
"resulted",
"in",
"equivalent",
"phosphorylation",
"and",
"activation",
"of",
"the",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"mapk",
")",
"homologue",
"38-kd",
"murine",
"map",
"kinase",
"homologous",
"to",
"hog-1",
"(",
"p38",
")",
"mapk",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Neither",
"FMLP",
"nor",
"PAF",
"activated",
"c-jun",
"NH2-terminal",
"MAPk",
"(",
"JNKs",
")",
"."
] | [
"neither",
"fmlp",
"nor",
"paf",
"activated",
"c-jun",
"nh2-terminal",
"mapk",
"(",
"jnks",
")",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Under",
"identical",
"conditions",
",",
"FMLP",
"but",
"not",
"PAF",
",",
"resulted",
"in",
"significant",
"p42/44",
"(",
"ERK",
")",
"MAPk",
"activation",
"."
] | [
"under",
"identical",
"conditions",
",",
"fmlp",
"but",
"not",
"paf",
",",
"resulted",
"in",
"significant",
"p42/44",
"(",
"erk",
")",
"mapk",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"FMLP",
"and",
"PAF",
"activated",
"MAP",
"kinase",
"kinase-3",
"(",
"MKK3",
")",
",",
"a",
"known",
"activator",
"of",
"p38",
"MAPk",
"."
] | [
"both",
"fmlp",
"and",
"paf",
"activated",
"map",
"kinase",
"kinase-3",
"(",
"mkk3",
")",
",",
"a",
"known",
"activator",
"of",
"p38",
"mapk",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Both",
"MAP",
"ERK",
"kinase",
"kinase-1",
"(",
"MEKK1",
")",
"and",
"Raf",
"are",
"activated",
"strongly",
"by",
"FMLP",
",",
"but",
"minimally",
"by",
"PAF",
"."
] | [
"both",
"map",
"erk",
"kinase",
"kinase-1",
"(",
"mekk1",
")",
"and",
"raf",
"are",
"activated",
"strongly",
"by",
"fmlp",
",",
"but",
"minimally",
"by",
"paf",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Pertussis",
"toxin",
"blocked",
"FMLP",
"-induced",
"activation",
"of",
"the",
"p42/44",
"(",
"ERK",
")",
"MAPk",
"cascade",
",",
"but",
"not",
"that",
"of",
"p38",
"MAPk",
"."
] | [
"pertussis",
"toxin",
"blocked",
"fmlp",
"-induced",
"activation",
"of",
"the",
"p42/44",
"(",
"erk",
")",
"mapk",
"cascade",
",",
"but",
"not",
"that",
"of",
"p38",
"mapk",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"A",
"specific",
"p38",
"MAPk",
"inhibitor",
"(",
"SK&F",
"86002",
")",
"blocked",
"superoxide",
"anion",
"production",
"in",
"response",
"to",
"FMLP",
"and",
"reduced",
"adhesion",
"and",
"chemotaxis",
"in",
"response",
"to",
"PAF",
"or",
"FMLP",
"."
] | [
"a",
"specific",
"p38",
"mapk",
"inhibitor",
"(",
"sk&f",
"86002",
")",
"blocked",
"superoxide",
"anion",
"production",
"in",
"response",
"to",
"fmlp",
"and",
"reduced",
"adhesion",
"and",
"chemotaxis",
"in",
"response",
"to",
"paf",
"or",
"fmlp",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"demonstrate",
"distinct",
"patterns",
"of",
"intracellular",
"signaling",
"for",
"two",
"chemoattractants",
"and",
"suggest",
"that",
"selective",
"activation",
"of",
"intracellular",
"signaling",
"cascades",
"may",
"underlie",
"different",
"patterns",
"of",
"functional",
"responses",
"."
] | [
"these",
"results",
"demonstrate",
"distinct",
"patterns",
"of",
"intracellular",
"signaling",
"for",
"two",
"chemoattractants",
"and",
"suggest",
"that",
"selective",
"activation",
"of",
"intracellular",
"signaling",
"cascades",
"may",
"underlie",
"different",
"patterns",
"of",
"functional",
"responses",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"CD27",
"/CD70",
"interaction",
"augments",
"IgE",
"secretion",
"by",
"promoting",
"the",
"differentiation",
"of",
"memory",
"B",
"cells",
"into",
"plasma",
"cells",
"."
] | [
"cd27",
"/cd70",
"interaction",
"augments",
"ige",
"secretion",
"by",
"promoting",
"the",
"differentiation",
"of",
"memory",
"b",
"cells",
"into",
"plasma",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"induction",
"of",
"IgE",
"switching",
"in",
"B",
"cells",
"requires",
"several",
"signals",
"given",
"by",
"cytokines",
"and",
"cell",
"contact-delivered",
"signals",
"."
] | [
"the",
"induction",
"of",
"ige",
"switching",
"in",
"b",
"cells",
"requires",
"several",
"signals",
"given",
"by",
"cytokines",
"and",
"cell",
"contact-delivered",
"signals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"investigated",
"the",
"role",
"of",
"CD27",
"/CD70",
"interaction",
"in",
"B",
"cell",
"IgE",
"synthesis",
"."
] | [
"here",
",",
"we",
"investigated",
"the",
"role",
"of",
"cd27",
"/cd70",
"interaction",
"in",
"b",
"cell",
"ige",
"synthesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"addition",
"of",
"CD27",
"ligand",
"(",
"CD70",
")",
"transfectants",
"to",
"B",
"cell",
"cultures",
"increased",
"the",
"IgE",
"synthesis",
"synergistically",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"IL-4",
"plus",
"anti-CD40",
"mAb",
"(",
"anti-CD40",
")",
"."
] | [
"the",
"addition",
"of",
"cd27",
"ligand",
"(",
"cd70",
")",
"transfectants",
"to",
"b",
"cell",
"cultures",
"increased",
"the",
"ige",
"synthesis",
"synergistically",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"il-4",
"plus",
"anti-cd40",
"mab",
"(",
"anti-cd40",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"CD70",
"transfectants",
"was",
"dose",
"dependent",
"and",
"was",
"completely",
"blocked",
"by",
"anti-CD70",
"mAb",
"."
] | [
"the",
"effect",
"of",
"cd70",
"transfectants",
"was",
"dose",
"dependent",
"and",
"was",
"completely",
"blocked",
"by",
"anti-cd70",
"mab",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group"
] |
[
"CD27+",
"B",
"cells",
"had",
"the",
"ability",
"to",
"produce",
"IgE",
",",
"which",
"was",
"increased",
"by",
"contact",
"with",
"CD70",
"transfectants",
",",
"whereas",
"CD27-",
"B",
"cells",
"did",
"not",
"produce",
"IgE",
"."
] | [
"cd27+",
"b",
"cells",
"had",
"the",
"ability",
"to",
"produce",
"ige",
",",
"which",
"was",
"increased",
"by",
"contact",
"with",
"cd70",
"transfectants",
",",
"whereas",
"cd27-",
"b",
"cells",
"did",
"not",
"produce",
"ige",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"CD27",
"/CD70",
"interaction",
"enhanced",
"B",
"cell",
"proliferation",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"IL-4",
"or",
"IL-4",
"plus",
"anti-CD40",
"."
] | [
"cd27",
"/cd70",
"interaction",
"enhanced",
"b",
"cell",
"proliferation",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"il-4",
"or",
"il-4",
"plus",
"anti-cd40",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"augmentation",
"of",
"B",
"cell",
"proliferation",
"by",
"CD70",
"transfectants",
"was",
"apparent",
"in",
"CD27+",
"B",
"cells",
",",
"but",
"was",
"mild",
"in",
"CD27-",
"B",
"cells",
"."
] | [
"the",
"augmentation",
"of",
"b",
"cell",
"proliferation",
"by",
"cd70",
"transfectants",
"was",
"apparent",
"in",
"cd27+",
"b",
"cells",
",",
"but",
"was",
"mild",
"in",
"cd27-",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"helper",
"activity",
"for",
"IgE",
"synthesis",
"by",
"the",
"CD27",
"/CD70",
"interaction",
"did",
"not",
"contribute",
"to",
"the",
"enhancement",
"of",
"germline",
"epsilon",
"transcripts",
"."
] | [
"the",
"helper",
"activity",
"for",
"ige",
"synthesis",
"by",
"the",
"cd27",
"/cd70",
"interaction",
"did",
"not",
"contribute",
"to",
"the",
"enhancement",
"of",
"germline",
"epsilon",
"transcripts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Flow",
"cytometric",
"and",
"morphological",
"analyses",
"demonstrated",
"that",
"the",
"addition",
"of",
"CD70",
"transfectants",
"to",
"B",
"cell",
"cultures",
"remarkably",
"promoted",
"differentiation",
"into",
"plasma",
"cells",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"IL-4",
"and",
"CD40",
"signaling",
"."
] | [
"flow",
"cytometric",
"and",
"morphological",
"analyses",
"demonstrated",
"that",
"the",
"addition",
"of",
"cd70",
"transfectants",
"to",
"b",
"cell",
"cultures",
"remarkably",
"promoted",
"differentiation",
"into",
"plasma",
"cells",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"il-4",
"and",
"cd40",
"signaling",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"CD27",
"cross-linking",
"resulted",
"in",
"the",
"up-regulation",
"of",
"positive",
"regulatory",
"domain",
"I-binding",
"factor-1",
"."
] | [
"finally",
",",
"cd27",
"cross-linking",
"resulted",
"in",
"the",
"up-regulation",
"of",
"positive",
"regulatory",
"domain",
"i-binding",
"factor-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
",",
"our",
"findings",
"indicate",
"that",
"signaling",
"via",
"CD27",
"on",
"B",
"cells",
"induces",
"IgE",
"synthesis",
",",
"in",
"cooperation",
"with",
"IL-4",
"and",
"CD40",
"signaling",
",",
"by",
"promoting",
"the",
"generation",
"of",
"plasma",
"cells",
"through",
"up-regulation",
"of",
"positive",
"regulatory",
"domain",
"I-binding",
"factor-1",
"."
] | [
"taken",
"together",
",",
"our",
"findings",
"indicate",
"that",
"signaling",
"via",
"cd27",
"on",
"b",
"cells",
"induces",
"ige",
"synthesis",
",",
"in",
"cooperation",
"with",
"il-4",
"and",
"cd40",
"signaling",
",",
"by",
"promoting",
"the",
"generation",
"of",
"plasma",
"cells",
"through",
"up-regulation",
"of",
"positive",
"regulatory",
"domain",
"i-binding",
"factor-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Epstein-Barr",
"virus",
"nuclear",
"protein",
"2",
"transactivation",
"of",
"the",
"latent",
"membrane",
"protein",
"1",
"promoter",
"is",
"mediated",
"by",
"J",
"kappa",
"and",
"PU",
".",
"1",
"."
] | [
"epstein-barr",
"virus",
"nuclear",
"protein",
"2",
"transactivation",
"of",
"the",
"latent",
"membrane",
"protein",
"1",
"promoter",
"is",
"mediated",
"by",
"j",
"kappa",
"and",
"pu",
".",
"1",
"."
] | [
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"the",
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"latent",
"membrane",
"protein",
"1",
"(",
"LMP-1",
")",
"oncogene",
"is",
"regulated",
"by",
"the",
"EBV",
"nuclear",
"protein",
"2",
"(",
"EBNA-2",
")",
"transactivator",
"."
] | [
"expression",
"of",
"the",
"epstein-barr",
"virus",
"(",
"ebv",
")",
"latent",
"membrane",
"protein",
"1",
"(",
"lmp-1",
")",
"oncogene",
"is",
"regulated",
"by",
"the",
"ebv",
"nuclear",
"protein",
"2",
"(",
"ebna-2",
")",
"transactivator",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"EBNA-2",
"is",
"known",
"to",
"interact",
"with",
"the",
"cellular",
"DNA-binding",
"protein",
"J",
"kappa",
"and",
"is",
"recruited",
"to",
"promoters",
"containing",
"the",
"GTGGGAA",
"J",
"kappa",
"recognition",
"sequence",
"."
] | [
"ebna-2",
"is",
"known",
"to",
"interact",
"with",
"the",
"cellular",
"dna-binding",
"protein",
"j",
"kappa",
"and",
"is",
"recruited",
"to",
"promoters",
"containing",
"the",
"gtgggaa",
"j",
"kappa",
"recognition",
"sequence",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"minimal",
"EBNA-2",
"-responsive",
"LMP-1",
"promoter",
"includes",
"one",
"J",
"kappa",
"-binding",
"site",
",",
"and",
"we",
"now",
"show",
"that",
"mutation",
"of",
"that",
"site",
",",
"such",
"that",
"J",
"kappa",
"cannot",
"bind",
",",
"reduces",
"EBNA-2",
"responsiveness",
"by",
"60%",
"."
] | [
"the",
"minimal",
"ebna-2",
"-responsive",
"lmp-1",
"promoter",
"includes",
"one",
"j",
"kappa",
"-binding",
"site",
",",
"and",
"we",
"now",
"show",
"that",
"mutation",
"of",
"that",
"site",
",",
"such",
"that",
"j",
"kappa",
"cannot",
"bind",
",",
"reduces",
"ebna-2",
"responsiveness",
"by",
"60%",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"identify",
"other",
"factors",
"which",
"interact",
"with",
"the",
"LMP-1",
"EBNA-2",
"response",
"element",
"(",
"E2RE",
")",
",",
"a",
"-236/-145",
"minimal",
"E2RE",
"was",
"used",
"as",
"a",
"probe",
"in",
"an",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"."
] | [
"to",
"identify",
"other",
"factors",
"which",
"interact",
"with",
"the",
"lmp-1",
"ebna-2",
"response",
"element",
"(",
"e2re",
")",
",",
"a",
"-236/-145",
"minimal",
"e2re",
"was",
"used",
"as",
"a",
"probe",
"in",
"an",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"previously",
"characterized",
"factors",
"J",
"kappa",
",",
"PU",
".",
"1",
",",
"and",
"AML1",
"bind",
"to",
"the",
"LMP-1",
"E2RE",
",",
"along",
"with",
"six",
"other",
"unidentified",
"factors",
"(",
"LBF2",
"to",
"LBF7",
")",
"."
] | [
"the",
"previously",
"characterized",
"factors",
"j",
"kappa",
",",
"pu",
".",
"1",
",",
"and",
"aml1",
"bind",
"to",
"the",
"lmp-1",
"e2re",
",",
"along",
"with",
"six",
"other",
"unidentified",
"factors",
"(",
"lbf2",
"to",
"lbf7",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Binding",
"sites",
"were",
"mapped",
"for",
"each",
"factor",
"."
] | [
"binding",
"sites",
"were",
"mapped",
"for",
"each",
"factor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"LBF4",
"is",
"B-",
"and",
"T-cell",
"specific",
"and",
"recognizes",
"the",
"PU",
".",
"1",
"GGAA",
"core",
"sequence",
"as",
"shown",
"by",
"methylation",
"interference",
"."
] | [
"lbf4",
"is",
"b-",
"and",
"t-cell",
"specific",
"and",
"recognizes",
"the",
"pu",
".",
"1",
"ggaa",
"core",
"sequence",
"as",
"shown",
"by",
"methylation",
"interference",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"LBF4",
"has",
"a",
"molecular",
"mass",
"of",
"105",
"kDa",
"and",
"is",
"probably",
"unrelated",
"to",
"PU",
".",
"1",
"."
] | [
"lbf4",
"has",
"a",
"molecular",
"mass",
"of",
"105",
"kda",
"and",
"is",
"probably",
"unrelated",
"to",
"pu",
".",
"1",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"LBF2",
"was",
"found",
"only",
"in",
"epithelial",
"cell",
"lines",
",",
"whereas",
"LBF3",
",",
"LBF5",
",",
"LBF6",
",",
"and",
"LBF7",
"were",
"not",
"cell",
"type",
"specific",
"."
] | [
"lbf2",
"was",
"found",
"only",
"in",
"epithelial",
"cell",
"lines",
",",
"whereas",
"lbf3",
",",
"lbf5",
",",
"lbf6",
",",
"and",
"lbf7",
"were",
"not",
"cell",
"type",
"specific",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"of",
"the",
"AML1-",
"or",
"LBF4-",
"binding",
"sites",
"had",
"no",
"effect",
"on",
"EBNA-2",
"transactivation",
",",
"whereas",
"mutation",
"of",
"the",
"PU",
".",
"1",
"-binding",
"site",
"completely",
"eliminated",
"EBNA-2",
"responses",
"."
] | [
"mutations",
"of",
"the",
"aml1-",
"or",
"lbf4-",
"binding",
"sites",
"had",
"no",
"effect",
"on",
"ebna-2",
"transactivation",
",",
"whereas",
"mutation",
"of",
"the",
"pu",
".",
"1",
"-binding",
"site",
"completely",
"eliminated",
"ebna-2",
"responses",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"gst-",
"EBNA-2",
"fusion",
"protein",
"specifically",
"depleted",
"PU",
".",
"1",
"from",
"nuclear",
"extracts",
"and",
"bound",
"in",
"vitro",
"translated",
"PU",
".",
"1",
",",
"providing",
"biochemical",
"evidence",
"for",
"a",
"direct",
"EBNA-2",
"-PU",
".",
"1",
"interaction",
"."
] | [
"a",
"gst-",
"ebna-2",
"fusion",
"protein",
"specifically",
"depleted",
"pu",
".",
"1",
"from",
"nuclear",
"extracts",
"and",
"bound",
"in",
"vitro",
"translated",
"pu",
".",
"1",
",",
"providing",
"biochemical",
"evidence",
"for",
"a",
"direct",
"ebna-2",
"-pu",
".",
"1",
"interaction",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"EBNA-2",
"transactivation",
"of",
"the",
"LMP-1",
"promoter",
"is",
"dependent",
"on",
"interaction",
"with",
"at",
"least",
"two",
"distinct",
"sequence-specific",
"DNA-binding",
"proteins",
",",
"J",
"kappa",
"and",
"PU",
".",
"1",
"."
] | [
"thus",
",",
"ebna-2",
"transactivation",
"of",
"the",
"lmp-1",
"promoter",
"is",
"dependent",
"on",
"interaction",
"with",
"at",
"least",
"two",
"distinct",
"sequence-specific",
"dna-binding",
"proteins",
",",
"j",
"kappa",
"and",
"pu",
".",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"LBF3",
",",
"LBF5",
",",
"LBF6",
",",
"or",
"LBF7",
"may",
"also",
"be",
"involved",
",",
"since",
"their",
"binding",
"sites",
"also",
"contribute",
"to",
"EBNA-2",
"responsiveness",
"."
] | [
"lbf3",
",",
"lbf5",
",",
"lbf6",
",",
"or",
"lbf7",
"may",
"also",
"be",
"involved",
",",
"since",
"their",
"binding",
"sites",
"also",
"contribute",
"to",
"ebna-2",
"responsiveness",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Phorbol",
"ester",
"reduces",
"constitutive",
"nuclear",
"NF",
"kappa",
"B",
"and",
"inhibits",
"HIV-1",
"production",
"in",
"mature",
"human",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"phorbol",
"ester",
"reduces",
"constitutive",
"nuclear",
"nf",
"kappa",
"b",
"and",
"inhibits",
"hiv-1",
"production",
"in",
"mature",
"human",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"NF",
"kappa",
"B",
"is",
"a",
"potent",
"mediator",
"of",
"specific",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"and",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"play",
"a",
"role",
"in",
"transcription",
"of",
"the",
"HIV-1",
"genome",
"in",
"promonocytic",
"leukemias",
"."
] | [
"nf",
"kappa",
"b",
"is",
"a",
"potent",
"mediator",
"of",
"specific",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"and",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"play",
"a",
"role",
"in",
"transcription",
"of",
"the",
"hiv-1",
"genome",
"in",
"promonocytic",
"leukemias",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"is",
"little",
"information",
"available",
"on",
"the",
"response",
"of",
"NF",
"kappa",
"B",
"to",
"cytokines",
"in",
"normal",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"there",
"is",
"little",
"information",
"available",
"on",
"the",
"response",
"of",
"nf",
"kappa",
"b",
"to",
"cytokines",
"in",
"normal",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"used",
"a",
"32P-labeled",
"oligonucleotide",
"derived",
"from",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV-1",
")",
"long",
"terminal",
"repeat",
",",
"which",
"contains",
"a",
"tandem",
"repeat",
"of",
"the",
"NF",
"kappa",
"B",
"binding",
"sequence",
",",
"as",
"a",
"probe",
"in",
"a",
"gel",
"retardation",
"assay",
"to",
"study",
"this",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"we",
"have",
"used",
"a",
"32p-labeled",
"oligonucleotide",
"derived",
"from",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"hiv-1",
")",
"long",
"terminal",
"repeat",
",",
"which",
"contains",
"a",
"tandem",
"repeat",
"of",
"the",
"nf",
"kappa",
"b",
"binding",
"sequence",
",",
"as",
"a",
"probe",
"in",
"a",
"gel",
"retardation",
"assay",
"to",
"study",
"this",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_substructure",
"I-DNA_substructure",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Using",
"this",
"assay",
",",
"we",
"have",
"detected",
"NF",
"kappa",
"B",
"in",
"extracts",
"of",
"nuclei",
"from",
"normal",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"using",
"this",
"assay",
",",
"we",
"have",
"detected",
"nf",
"kappa",
"b",
"in",
"extracts",
"of",
"nuclei",
"from",
"normal",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Treatment",
"of",
"normal",
"monocytes",
"with",
"12-0-tetradecanoyl",
"phorbol-13-acetate",
"(",
"TPA",
")",
"for",
"4-24",
"h",
"caused",
"the",
"complete",
"disappearance",
"of",
"NF",
"kappa",
"B",
"from",
"nuclear",
"extracts",
"of",
"monocytes",
"."
] | [
"treatment",
"of",
"normal",
"monocytes",
"with",
"12-0-tetradecanoyl",
"phorbol-13-acetate",
"(",
"tpa",
")",
"for",
"4-24",
"h",
"caused",
"the",
"complete",
"disappearance",
"of",
"nf",
"kappa",
"b",
"from",
"nuclear",
"extracts",
"of",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"similar",
"result",
"was",
"obtained",
"with",
"the",
"mature",
"monocytic",
"leukemia",
"cell",
"line",
"THP-1",
"."
] | [
"a",
"similar",
"result",
"was",
"obtained",
"with",
"the",
"mature",
"monocytic",
"leukemia",
"cell",
"line",
"thp-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_line",
"O"
] |