tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Engagement",
"of",
"the",
"T",
"cell",
"receptor",
"for",
"antigen",
"activates",
"phospholipase",
"C",
"resulting",
"in",
"an",
"increase",
"in",
"intracellular",
"free",
"calcium",
"concentration",
"(",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
")",
"and",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"."
] | [
"engagement",
"of",
"the",
"t",
"cell",
"receptor",
"for",
"antigen",
"activates",
"phospholipase",
"c",
"resulting",
"in",
"an",
"increase",
"in",
"intracellular",
"free",
"calcium",
"concentration",
"(",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
")",
"and",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
"(",
"pkc",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Increased",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"activates",
"Ca2+",
"/calmodulin-dependent",
"kinases",
"including",
"the",
"multifunctional",
"Ca2+",
"/calmodulin-dependent",
"protein",
"kinase",
"II",
"(",
"CaM-K",
"II",
")",
",",
"as",
"well",
"as",
"calcineurin",
",",
"a",
"type",
"2B",
"protein",
"phosphatase",
"."
] | [
"increased",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"activates",
"ca2+",
"/calmodulin-dependent",
"kinases",
"including",
"the",
"multifunctional",
"ca2+",
"/calmodulin-dependent",
"protein",
"kinase",
"ii",
"(",
"cam-k",
"ii",
")",
",",
"as",
"well",
"as",
"calcineurin",
",",
"a",
"type",
"2b",
"protein",
"phosphatase",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Recent",
"studies",
"have",
"identified",
"calcineurin",
"as",
"a",
"key",
"enzyme",
"for",
"interleukin",
"(",
"IL",
")",
"-2",
"and",
"IL-4",
"promoter",
"activation",
"."
] | [
"recent",
"studies",
"have",
"identified",
"calcineurin",
"as",
"a",
"key",
"enzyme",
"for",
"interleukin",
"(",
"il",
")",
"-2",
"and",
"il-4",
"promoter",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"role",
"of",
"CaM-K",
"II",
"remains",
"unknown",
"."
] | [
"however",
",",
"the",
"role",
"of",
"cam-k",
"ii",
"remains",
"unknown",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"used",
"mutants",
"of",
"these",
"kinases",
"and",
"phosphatases",
"(",
"gamma",
"B*CaM-K",
"and",
"delta",
"CaM-AI",
",",
"respectively",
")",
"to",
"explore",
"their",
"relative",
"role",
"in",
"cytokine",
"gene",
"transcription",
"and",
"their",
"interactions",
"with",
"PKC",
"-dependent",
"signaling",
"systems",
"."
] | [
"we",
"have",
"used",
"mutants",
"of",
"these",
"kinases",
"and",
"phosphatases",
"(",
"gamma",
"b*cam-k",
"and",
"delta",
"cam-ai",
",",
"respectively",
")",
"to",
"explore",
"their",
"relative",
"role",
"in",
"cytokine",
"gene",
"transcription",
"and",
"their",
"interactions",
"with",
"pkc",
"-dependent",
"signaling",
"systems",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"gamma",
"B*CaM-K",
"and",
"delta",
"CaM-AI",
",",
"known",
"to",
"exhibit",
"constitutive",
"Ca",
"(",
"2+",
")",
"-independent",
"activity",
",",
"were",
"cotransfected",
"(",
"alone",
"or",
"in",
"combination",
")",
"in",
"Jurkat",
"T",
"cells",
"with",
"a",
"plasmid",
"containing",
"the",
"intact",
"IL-2",
"promoter",
"driving",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"chloramphenicol",
"acetyltransferase",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"gamma",
"b*cam-k",
"and",
"delta",
"cam-ai",
",",
"known",
"to",
"exhibit",
"constitutive",
"ca",
"(",
"2+",
")",
"-independent",
"activity",
",",
"were",
"cotransfected",
"(",
"alone",
"or",
"in",
"combination",
")",
"in",
"jurkat",
"t",
"cells",
"with",
"a",
"plasmid",
"containing",
"the",
"intact",
"il-2",
"promoter",
"driving",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"chloramphenicol",
"acetyltransferase",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"Cotransfection",
"of",
"gamma",
"B*CaM-K",
"with",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"construct",
"downregulated",
"its",
"transcription",
"in",
"response",
"to",
"stimulation",
"with",
"ionomycin",
"and",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"PMA",
")",
"."
] | [
"cotransfection",
"of",
"gamma",
"b*cam-k",
"with",
"the",
"il-2",
"promoter",
"construct",
"downregulated",
"its",
"transcription",
"in",
"response",
"to",
"stimulation",
"with",
"ionomycin",
"and",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"pma",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"inhibitory",
"effect",
"of",
"CaM-K",
"II",
"on",
"IL-2",
"promoter",
"was",
"associated",
"with",
"decreased",
"transcription",
"of",
"its",
"AP-1",
"and",
"NF-AT",
"transactivating",
"pathways",
"."
] | [
"the",
"inhibitory",
"effect",
"of",
"cam-k",
"ii",
"on",
"il-2",
"promoter",
"was",
"associated",
"with",
"decreased",
"transcription",
"of",
"its",
"ap-1",
"and",
"nf-at",
"transactivating",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Under",
"the",
"same",
"conditions",
",",
"delta",
"CaM-AI",
"superinduced",
"IL-2",
"promoter",
"activity",
"(",
"approximately",
"twofold",
"increase",
")",
"."
] | [
"under",
"the",
"same",
"conditions",
",",
"delta",
"cam-ai",
"superinduced",
"il-2",
"promoter",
"activity",
"(",
"approximately",
"twofold",
"increase",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"both",
"mutants",
"were",
"used",
"in",
"combination",
",",
"gamma",
"B*CaM-K",
"inhibited",
"the",
"induction",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"by",
"delta",
"CaM-AI",
"."
] | [
"when",
"both",
"mutants",
"were",
"used",
"in",
"combination",
",",
"gamma",
"b*cam-k",
"inhibited",
"the",
"induction",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"by",
"delta",
"cam-ai",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Similar",
"results",
"were",
"obtained",
"when",
"a",
"construct",
"containing",
"the",
"IL-4",
"promoter",
"also",
"was",
"used",
"."
] | [
"similar",
"results",
"were",
"obtained",
"when",
"a",
"construct",
"containing",
"the",
"il-4",
"promoter",
"also",
"was",
"used",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"gamma",
"B*CaM-K",
"also",
"downregulated",
"the",
"activation",
"of",
"AP-1",
"in",
"response",
"to",
"transfection",
"with",
"a",
"constitutively",
"active",
"mutant",
"of",
"PKC",
"or",
"stimulation",
"with",
"PMA",
"."
] | [
"gamma",
"b*cam-k",
"also",
"downregulated",
"the",
"activation",
"of",
"ap-1",
"in",
"response",
"to",
"transfection",
"with",
"a",
"constitutively",
"active",
"mutant",
"of",
"pkc",
"or",
"stimulation",
"with",
"pma",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"CaM-K",
"II",
"may",
"exert",
"negative",
"influences",
"on",
"cytokine",
"gene",
"transcription",
"in",
"human",
"T",
"cells",
",",
"and",
"provide",
"preliminary",
"evidence",
"for",
"negative",
"cross-talk",
"with",
"the",
"calcineurin-",
"and",
"PKC-",
"dependent",
"signaling",
"systems",
"."
] | [
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"cam-k",
"ii",
"may",
"exert",
"negative",
"influences",
"on",
"cytokine",
"gene",
"transcription",
"in",
"human",
"t",
"cells",
",",
"and",
"provide",
"preliminary",
"evidence",
"for",
"negative",
"cross-talk",
"with",
"the",
"calcineurin-",
"and",
"pkc-",
"dependent",
"signaling",
"systems",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activation",
"of",
"JAK3",
",",
"but",
"not",
"JAK1",
",",
"is",
"critical",
"for",
"IL-2",
"-induced",
"proliferation",
"and",
"STAT5",
"recruitment",
"by",
"a",
"COOH-terminal",
"region",
"of",
"the",
"IL-2",
"receptor",
"beta-chain",
"."
] | [
"activation",
"of",
"jak3",
",",
"but",
"not",
"jak1",
",",
"is",
"critical",
"for",
"il-2",
"-induced",
"proliferation",
"and",
"stat5",
"recruitment",
"by",
"a",
"cooh-terminal",
"region",
"of",
"the",
"il-2",
"receptor",
"beta-chain",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O"
] |
[
"A",
"number",
"of",
"cytokines",
"and",
"growth",
"factors",
"use",
"the",
"JAK",
"-STAT",
"pathway",
"to",
"signal",
"from",
"the",
"cell",
"membrane",
"to",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"a",
"number",
"of",
"cytokines",
"and",
"growth",
"factors",
"use",
"the",
"jak",
"-stat",
"pathway",
"to",
"signal",
"from",
"the",
"cell",
"membrane",
"to",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O"
] |
[
"While",
"homodimerizing",
"cytokine",
"receptors",
"may",
"transmit",
"signal",
"via",
"a",
"single",
"form",
"of",
"JAK",
"(",
"i",
".",
"e",
".",
"growth",
"hormone",
"receptors",
")",
",",
"several",
"multicomponent",
"cytokine",
"receptors",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"require",
"simultaneous",
"activation",
"of",
"pairs",
"of",
"different",
"JAK",
"kinases",
"(",
"i",
".",
"e",
".",
"interferon",
"receptors",
")",
"."
] | [
"while",
"homodimerizing",
"cytokine",
"receptors",
"may",
"transmit",
"signal",
"via",
"a",
"single",
"form",
"of",
"jak",
"(",
"i",
".",
"e",
".",
"growth",
"hormone",
"receptors",
")",
",",
"several",
"multicomponent",
"cytokine",
"receptors",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"require",
"simultaneous",
"activation",
"of",
"pairs",
"of",
"different",
"jak",
"kinases",
"(",
"i",
".",
"e",
".",
"interferon",
"receptors",
")",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Recent",
"evidence",
"for",
"a",
"preferential",
"coupling",
"of",
"JAK3",
"to",
"interleukin-2",
"receptor-gamma",
"(",
"IL-2R",
"gamma",
")",
"and",
"JAK1",
"to",
"IL-2R",
"beta",
"supports",
"the",
"concept",
"of",
"heterotrans-activation",
"of",
"JAK1",
"and",
"JAK3",
"caused",
"by",
"IL-2",
"-induced",
"heterodimerization",
"of",
"their",
"receptor",
"partners",
"."
] | [
"recent",
"evidence",
"for",
"a",
"preferential",
"coupling",
"of",
"jak3",
"to",
"interleukin-2",
"receptor-gamma",
"(",
"il-2r",
"gamma",
")",
"and",
"jak1",
"to",
"il-2r",
"beta",
"supports",
"the",
"concept",
"of",
"heterotrans-activation",
"of",
"jak1",
"and",
"jak3",
"caused",
"by",
"il-2",
"-induced",
"heterodimerization",
"of",
"their",
"receptor",
"partners",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"study",
"verified",
"the",
"ability",
"of",
"IL-2",
"to",
"cause",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"activation",
"of",
"JAK1",
"and",
"JAK3",
",",
"but",
"demonstrated",
"that",
"IL-2",
"stimulated",
"JAK3",
"to",
"a",
"significantly",
"larger",
"extent",
"than",
"JAK1",
"in",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"and",
"the",
"YT",
"cell",
"line",
"."
] | [
"the",
"present",
"study",
"verified",
"the",
"ability",
"of",
"il-2",
"to",
"cause",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"activation",
"of",
"jak1",
"and",
"jak3",
",",
"but",
"demonstrated",
"that",
"il-2",
"stimulated",
"jak3",
"to",
"a",
"significantly",
"larger",
"extent",
"than",
"jak1",
"in",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"and",
"the",
"yt",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"This",
"conclusion",
"was",
"based",
"upon",
"several",
"independent",
"criteria",
",",
"including",
"more",
"vigorous",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"JAK3",
",",
"more",
"marked",
"enzymatic",
"activation",
"of",
"JAK3",
"as",
"well",
"as",
"higher",
"abundance",
"of",
"JAK3",
"in",
"activated",
"IL-2",
"receptor",
"complexes",
"."
] | [
"this",
"conclusion",
"was",
"based",
"upon",
"several",
"independent",
"criteria",
",",
"including",
"more",
"vigorous",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"jak3",
",",
"more",
"marked",
"enzymatic",
"activation",
"of",
"jak3",
"as",
"well",
"as",
"higher",
"abundance",
"of",
"jak3",
"in",
"activated",
"il-2",
"receptor",
"complexes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"when",
"human",
"IL-2R",
"beta",
"was",
"stably",
"expressed",
"in",
"murine",
"BA/F3",
"cells",
",",
"robust",
"IL-2",
"-induced",
"proliferation",
"and",
"JAK3",
"activation",
"occurred",
"without",
"detectable",
"involvement",
"of",
"either",
"JAK1",
",",
"JAK2",
"or",
"TYK2",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"when",
"human",
"il-2r",
"beta",
"was",
"stably",
"expressed",
"in",
"murine",
"ba/f3",
"cells",
",",
"robust",
"il-2",
"-induced",
"proliferation",
"and",
"jak3",
"activation",
"occurred",
"without",
"detectable",
"involvement",
"of",
"either",
"jak1",
",",
"jak2",
"or",
"tyk2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"We",
"therefore",
"propose",
"that",
"IL-2",
"receptor",
"signal",
"transduction",
"does",
"not",
"depend",
"on",
"equimolar",
"heterodimerization",
"of",
"JAK1",
"and",
"JAK3",
"following",
"IL-2",
"-induced",
"heterodimerization",
"of",
"IL-2R",
"beta",
"and",
"IL-2R",
"gamma",
"."
] | [
"we",
"therefore",
"propose",
"that",
"il-2",
"receptor",
"signal",
"transduction",
"does",
"not",
"depend",
"on",
"equimolar",
"heterodimerization",
"of",
"jak1",
"and",
"jak3",
"following",
"il-2",
"-induced",
"heterodimerization",
"of",
"il-2r",
"beta",
"and",
"il-2r",
"gamma",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Nonetheless",
",",
"a",
"membrane-proximal",
"region",
"of",
"human",
"IL-2R",
"beta",
"(",
"Asn240-Leu335",
")",
"was",
"critical",
"for",
"JAK3",
"activation",
",",
"and",
"the",
"amount",
"of",
"JAK3",
"present",
"in",
"activated",
"IL-2",
"receptor",
"complexes",
"increased",
"with",
"time",
",",
"suggesting",
"that",
"stabilization",
"of",
"JAK3",
"binding",
"to",
"the",
"receptor",
"complex",
"relies",
"on",
"both",
"IL-2R",
"beta",
"and",
"IL-2R",
"gamma",
"."
] | [
"nonetheless",
",",
"a",
"membrane-proximal",
"region",
"of",
"human",
"il-2r",
"beta",
"(",
"asn240-leu335",
")",
"was",
"critical",
"for",
"jak3",
"activation",
",",
"and",
"the",
"amount",
"of",
"jak3",
"present",
"in",
"activated",
"il-2",
"receptor",
"complexes",
"increased",
"with",
"time",
",",
"suggesting",
"that",
"stabilization",
"of",
"jak3",
"binding",
"to",
"the",
"receptor",
"complex",
"relies",
"on",
"both",
"il-2r",
"beta",
"and",
"il-2r",
"gamma",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"STAT5",
"was",
"found",
"to",
"be",
"the",
"predominant",
"STAT",
"transcription",
"factor",
"used",
"by",
"IL-2",
"in",
"human",
"T",
"cells",
",",
"and",
"specifically",
"required",
"a",
"COOH-terminal",
"region",
"of",
"IL-2R",
"beta",
"(",
"Ser386-Val525",
")",
",",
"while",
"STAT5",
"recruitment",
"was",
"not",
"correlated",
"to",
"activation",
"of",
"IL-2R",
"gamma",
"or",
"JAK3",
"."
] | [
"moreover",
",",
"stat5",
"was",
"found",
"to",
"be",
"the",
"predominant",
"stat",
"transcription",
"factor",
"used",
"by",
"il-2",
"in",
"human",
"t",
"cells",
",",
"and",
"specifically",
"required",
"a",
"cooh-terminal",
"region",
"of",
"il-2r",
"beta",
"(",
"ser386-val525",
")",
",",
"while",
"stat5",
"recruitment",
"was",
"not",
"correlated",
"to",
"activation",
"of",
"il-2r",
"gamma",
"or",
"jak3",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Evidence",
"for",
"distinct",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"in",
"CD34+",
"progenitor",
"to",
"dendritic",
"cell",
"differentiation",
"from",
"a",
"human",
"cell",
"line",
"model",
"."
] | [
"evidence",
"for",
"distinct",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"in",
"cd34+",
"progenitor",
"to",
"dendritic",
"cell",
"differentiation",
"from",
"a",
"human",
"cell",
"line",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Intracellular",
"signals",
"that",
"mediate",
"differentiation",
"of",
"pluripotent",
"hemopoietic",
"progenitors",
"to",
"dendritic",
"cells",
"(",
"DC",
")",
"are",
"largely",
"undefined",
"."
] | [
"intracellular",
"signals",
"that",
"mediate",
"differentiation",
"of",
"pluripotent",
"hemopoietic",
"progenitors",
"to",
"dendritic",
"cells",
"(",
"dc",
")",
"are",
"largely",
"undefined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"activation",
"(",
"with",
"phorbol",
"ester",
"(",
"PMA",
")",
"alone",
")",
"specifically",
"induces",
"differentiation",
"of",
"primary",
"human",
"CD34+",
"hemopoietic",
"progenitor",
"cells",
"(",
"HPC",
")",
"to",
"mature",
"DC",
"."
] | [
"we",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"protein",
"kinase",
"c",
"(",
"pkc",
")",
"activation",
"(",
"with",
"phorbol",
"ester",
"(",
"pma",
")",
"alone",
")",
"specifically",
"induces",
"differentiation",
"of",
"primary",
"human",
"cd34+",
"hemopoietic",
"progenitor",
"cells",
"(",
"hpc",
")",
"to",
"mature",
"dc",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"now",
"find",
"that",
"cytokine-driven",
"(",
"granulocyte-macrophage",
"CSF",
"and",
"TNF-alpha",
")",
"CD34+",
"HPC",
"-->DC",
"differentiation",
"is",
"preferentially",
"blocked",
"by",
"inhibitors",
"of",
"PKC",
"activation",
"."
] | [
"we",
"now",
"find",
"that",
"cytokine-driven",
"(",
"granulocyte-macrophage",
"csf",
"and",
"tnf-alpha",
")",
"cd34+",
"hpc",
"-->dc",
"differentiation",
"is",
"preferentially",
"blocked",
"by",
"inhibitors",
"of",
"pkc",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"further",
"identify",
"intracellular",
"signals",
"and",
"downstream",
"events",
"important",
"in",
"CD34+",
"HPC",
"-->",
"DC",
"differentiation",
"we",
"have",
"characterized",
"a",
"human",
"leukemic",
"cell",
"line",
"model",
"of",
"this",
"process",
"."
] | [
"to",
"further",
"identify",
"intracellular",
"signals",
"and",
"downstream",
"events",
"important",
"in",
"cd34+",
"hpc",
"-->",
"dc",
"differentiation",
"we",
"have",
"characterized",
"a",
"human",
"leukemic",
"cell",
"line",
"model",
"of",
"this",
"process",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_type",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"CD34+",
"myelomonocytic",
"cell",
"line",
"KG1",
"differentiates",
"into",
"dendritic-like",
"cells",
"in",
"response",
"to",
"granulocyte-macrophage",
"CSF",
"plus",
"TNF-alpha",
",",
"or",
"PMA",
"(",
"with",
"or",
"without",
"the",
"calcium",
"ionophore",
"ionomycin",
",",
"or",
"TNF-alpha",
")",
",",
"with",
"different",
"stimuli",
"mediating",
"different",
"aspects",
"of",
"the",
"process",
"."
] | [
"the",
"cd34+",
"myelomonocytic",
"cell",
"line",
"kg1",
"differentiates",
"into",
"dendritic-like",
"cells",
"in",
"response",
"to",
"granulocyte-macrophage",
"csf",
"plus",
"tnf-alpha",
",",
"or",
"pma",
"(",
"with",
"or",
"without",
"the",
"calcium",
"ionophore",
"ionomycin",
",",
"or",
"tnf-alpha",
")",
",",
"with",
"different",
"stimuli",
"mediating",
"different",
"aspects",
"of",
"the",
"process",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Phenotypic",
"DC",
"characteristics",
"of",
"KG1",
"dendritic-like",
"cells",
"include",
"morphology",
"(",
"loosely",
"adherent",
"cells",
"with",
"long",
"neurite",
"processes",
")",
",",
"MHC",
"I+/",
"MHC",
"IIbright/CD83+/CD86+/",
"CD14",
"-",
"surface",
"Ag",
"expression",
",",
"and",
"RelB",
"and",
"DC",
"-CK1",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"phenotypic",
"dc",
"characteristics",
"of",
"kg1",
"dendritic-like",
"cells",
"include",
"morphology",
"(",
"loosely",
"adherent",
"cells",
"with",
"long",
"neurite",
"processes",
")",
",",
"mhc",
"i+/",
"mhc",
"iibright/cd83+/cd86+/",
"cd14",
"-",
"surface",
"ag",
"expression",
",",
"and",
"relb",
"and",
"dc",
"-ck1",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"B-other_name",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Functional",
"DC",
"characteristics",
"include",
"fluid",
"phase",
"macromolecule",
"uptake",
"(",
"FITC-dextran",
")",
"and",
"activation",
"of",
"resting",
"T",
"cells",
"."
] | [
"functional",
"dc",
"characteristics",
"include",
"fluid",
"phase",
"macromolecule",
"uptake",
"(",
"fitc-dextran",
")",
"and",
"activation",
"of",
"resting",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"KG1",
"to",
"the",
"PMA",
"-unresponsive",
"subline",
"KG1a",
"reveals",
"differences",
"in",
"expression",
"of",
"TNF",
"receptors",
"1",
"and",
"2",
";",
"PKC",
"isoforms",
"alpha",
",",
"beta",
"I",
",",
"beta",
"II",
",",
"and",
"mu",
";",
"and",
"RelB",
",",
"suggesting",
"that",
"these",
"components/pathways",
"are",
"important",
"for",
"DC",
"differentiation",
"."
] | [
"comparison",
"of",
"kg1",
"to",
"the",
"pma",
"-unresponsive",
"subline",
"kg1a",
"reveals",
"differences",
"in",
"expression",
"of",
"tnf",
"receptors",
"1",
"and",
"2",
";",
"pkc",
"isoforms",
"alpha",
",",
"beta",
"i",
",",
"beta",
"ii",
",",
"and",
"mu",
";",
"and",
"relb",
",",
"suggesting",
"that",
"these",
"components/pathways",
"are",
"important",
"for",
"dc",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"Together",
",",
"these",
"findings",
"demonstrate",
"that",
"cytokine",
"or",
"phorbol",
"ester",
"stimulation",
"of",
"KG1",
"is",
"a",
"model",
"of",
"human",
"CD34+",
"HPC",
"to",
"DC",
"differentiation",
"and",
"suggest",
"that",
"specific",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"mediate",
"specific",
"events",
"in",
"DC",
"lineage",
"commitment",
"."
] | [
"together",
",",
"these",
"findings",
"demonstrate",
"that",
"cytokine",
"or",
"phorbol",
"ester",
"stimulation",
"of",
"kg1",
"is",
"a",
"model",
"of",
"human",
"cd34+",
"hpc",
"to",
"dc",
"differentiation",
"and",
"suggest",
"that",
"specific",
"intracellular",
"signaling",
"pathways",
"mediate",
"specific",
"events",
"in",
"dc",
"lineage",
"commitment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Differential",
"utilization",
"of",
"Janus",
"kinase",
"-signal",
"transducer",
"activator",
"of",
"transcription",
"signaling",
"pathways",
"in",
"the",
"stimulation",
"of",
"human",
"natural",
"killer",
"cells",
"by",
"IL-2",
",",
"IL-12",
",",
"and",
"IFN-alpha",
"."
] | [
"differential",
"utilization",
"of",
"janus",
"kinase",
"-signal",
"transducer",
"activator",
"of",
"transcription",
"signaling",
"pathways",
"in",
"the",
"stimulation",
"of",
"human",
"natural",
"killer",
"cells",
"by",
"il-2",
",",
"il-12",
",",
"and",
"ifn-alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"IL-2-",
",",
"IL-12-",
",",
"and",
"IFN-alpha-",
"mediated",
"signaling",
"pathways",
"were",
"analyzed",
"in",
"primary",
"NK",
"cells",
"and",
"in",
"the",
"NK3",
".",
"3",
"cell",
"line",
"."
] | [
"il-2-",
",",
"il-12-",
",",
"and",
"ifn-alpha-",
"mediated",
"signaling",
"pathways",
"were",
"analyzed",
"in",
"primary",
"nk",
"cells",
"and",
"in",
"the",
"nk3",
".",
"3",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Gel",
"mobility",
"shift",
"and",
"immunoprecipitation",
"analyses",
"revealed",
"that",
"in",
"addition",
"to",
"activating",
"STAT3",
"(",
"signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"transcription-3",
")",
"and",
"STAT5",
",",
"IL-2",
"induced",
"tyrosine",
"and",
"serine",
"phosphorylation",
"of",
"STAT1",
"alpha",
",",
"which",
"formed",
"IFN-gamma-activated",
"sequence-binding",
"complexes",
"by",
"itself",
"and",
"with",
"STAT3",
"."
] | [
"gel",
"mobility",
"shift",
"and",
"immunoprecipitation",
"analyses",
"revealed",
"that",
"in",
"addition",
"to",
"activating",
"stat3",
"(",
"signal",
"transducer",
"and",
"activator",
"of",
"transcription-3",
")",
"and",
"stat5",
",",
"il-2",
"induced",
"tyrosine",
"and",
"serine",
"phosphorylation",
"of",
"stat1",
"alpha",
",",
"which",
"formed",
"ifn-gamma-activated",
"sequence-binding",
"complexes",
"by",
"itself",
"and",
"with",
"stat3",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Although",
"IL-2",
"and",
"IFN-alpha",
"activated",
"STAT1",
"alpha",
"and",
"STAT5",
",",
"IL-2",
"predominantly",
"activated",
"STAT5",
",",
"while",
"IFN-alpha",
"predominantly",
"activated",
"STAT1",
"alpha",
"."
] | [
"although",
"il-2",
"and",
"ifn-alpha",
"activated",
"stat1",
"alpha",
"and",
"stat5",
",",
"il-2",
"predominantly",
"activated",
"stat5",
",",
"while",
"ifn-alpha",
"predominantly",
"activated",
"stat1",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"IL-2",
"induced",
"less",
"STAT1",
"alpha",
"activation",
"and",
"IFN-alpha",
"induced",
"greater",
"STAT5",
"activation",
"in",
"NK3",
".",
"3",
"cells",
"compared",
"with",
"preactivated",
"primary",
"NK",
"cells",
"."
] | [
"il-2",
"induced",
"less",
"stat1",
"alpha",
"activation",
"and",
"ifn-alpha",
"induced",
"greater",
"stat5",
"activation",
"in",
"nk3",
".",
"3",
"cells",
"compared",
"with",
"preactivated",
"primary",
"nk",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"NK3",
".",
"3",
"cells",
",",
"IL-2",
"induced",
"comparable",
"formation",
"of",
"c-fos",
"promoter",
"sis-inducible",
"element",
"IFN-gamma-activated",
"sequence-binding",
"complexes",
"containing",
"STAT3",
"alone",
"with",
"complexes",
"containing",
"STAT3",
"and",
"STAT1",
"alpha",
",",
"while",
"in",
"preactivated",
"primary",
"NK",
"cells",
",",
"it",
"preferentially",
"induced",
"complexes",
"containing",
"STAT3",
"and",
"STAT1",
"alpha",
"."
] | [
"in",
"nk3",
".",
"3",
"cells",
",",
"il-2",
"induced",
"comparable",
"formation",
"of",
"c-fos",
"promoter",
"sis-inducible",
"element",
"ifn-gamma-activated",
"sequence-binding",
"complexes",
"containing",
"stat3",
"alone",
"with",
"complexes",
"containing",
"stat3",
"and",
"stat1",
"alpha",
",",
"while",
"in",
"preactivated",
"primary",
"nk",
"cells",
",",
"it",
"preferentially",
"induced",
"complexes",
"containing",
"stat3",
"and",
"stat1",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"signaling",
"in",
"NK3",
".",
"3",
"cells",
"is",
"not",
"always",
"identical",
"with",
"that",
"in",
"primary",
"NK",
"cells",
"."
] | [
"thus",
",",
"signaling",
"in",
"nk3",
".",
"3",
"cells",
"is",
"not",
"always",
"identical",
"with",
"that",
"in",
"primary",
"nk",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"IL-2",
"and",
"IFN-alpha",
",",
"IL-12",
"induced",
"strong",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"STAT4",
"and",
"variable",
"weak",
"phosphorylation",
"of",
"STAT3",
"."
] | [
"in",
"contrast",
"to",
"il-2",
"and",
"ifn-alpha",
",",
"il-12",
"induced",
"strong",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"stat4",
"and",
"variable",
"weak",
"phosphorylation",
"of",
"stat3",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"However",
",",
"supershift",
"analyses",
"using",
"the",
"c-fos",
"promoter",
"sis-inducible",
"element",
"probe",
"showed",
"that",
"IL-12",
"activated",
"STAT4",
",",
"STAT1",
"alpha",
",",
"and",
"STAT3",
",",
"and",
"induced",
"complexes",
"containing",
"STAT4",
"only",
",",
"STAT4",
"with",
"STAT1",
"alpha",
",",
"STAT3",
"with",
"STAT1",
"alpha",
",",
"or",
"STAT1",
"alpha",
"only",
"in",
"preactivated",
"primary",
"NK",
"cells",
"."
] | [
"however",
",",
"supershift",
"analyses",
"using",
"the",
"c-fos",
"promoter",
"sis-inducible",
"element",
"probe",
"showed",
"that",
"il-12",
"activated",
"stat4",
",",
"stat1",
"alpha",
",",
"and",
"stat3",
",",
"and",
"induced",
"complexes",
"containing",
"stat4",
"only",
",",
"stat4",
"with",
"stat1",
"alpha",
",",
"stat3",
"with",
"stat1",
"alpha",
",",
"or",
"stat1",
"alpha",
"only",
"in",
"preactivated",
"primary",
"nk",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"STAT1",
"alpha",
"activation",
"by",
"IL-12",
"correlated",
"with",
"increased",
"phosphorylation",
"of",
"serine",
",",
"but",
"not",
"tyrosine",
"."
] | [
"stat1",
"alpha",
"activation",
"by",
"il-12",
"correlated",
"with",
"increased",
"phosphorylation",
"of",
"serine",
",",
"but",
"not",
"tyrosine",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"IL-2",
"induced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"JAK1",
"and",
"JAK3",
",",
"while",
"IL-12",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"JAK2",
"and",
"TYK2",
"in",
"both",
"preactivated",
"primary",
"NK",
"and",
"NK3",
".",
"3",
"cells",
"."
] | [
"finally",
",",
"il-2",
"induced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"jak1",
"and",
"jak3",
",",
"while",
"il-12",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"jak2",
"and",
"tyk2",
"in",
"both",
"preactivated",
"primary",
"nk",
"and",
"nk3",
".",
"3",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Differential",
"phosphorylation",
"and",
"consequent",
"differential",
"activation",
"of",
"both",
"separate",
"and",
"overlapping",
"STAT",
"proteins",
"by",
"IL-2",
",",
"IL-12",
",",
"and",
"IFN-alpha",
"may",
"provide",
"a",
"molecular",
"basis",
"for",
"the",
"similarities",
"and",
"differences",
"in",
"the",
"actions",
"of",
"these",
"cytokines",
"on",
"NK",
"cells",
"."
] | [
"differential",
"phosphorylation",
"and",
"consequent",
"differential",
"activation",
"of",
"both",
"separate",
"and",
"overlapping",
"stat",
"proteins",
"by",
"il-2",
",",
"il-12",
",",
"and",
"ifn-alpha",
"may",
"provide",
"a",
"molecular",
"basis",
"for",
"the",
"similarities",
"and",
"differences",
"in",
"the",
"actions",
"of",
"these",
"cytokines",
"on",
"nk",
"cells",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Pivotal",
"role",
"for",
"the",
"NFIL3/E4BP4",
"transcription",
"factor",
"in",
"interleukin",
"3",
"-mediated",
"survival",
"of",
"pro-B",
"lymphocytes",
"."
] | [
"pivotal",
"role",
"for",
"the",
"nfil3/e4bp4",
"transcription",
"factor",
"in",
"interleukin",
"3",
"-mediated",
"survival",
"of",
"pro-b",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"E2A-HLF",
"(",
"hepatic",
"leukemia",
"factor",
")",
"oncoprotein",
",",
"generated",
"in",
"pro-B",
"lymphocytes",
"by",
"fusion",
"of",
"the",
"trans-activation",
"domain",
"of",
"E2A",
"to",
"the",
"basic",
"region/leucine",
"zipper",
"(",
"bZIP",
")",
"domain",
"of",
"HLF",
",",
"functions",
"as",
"an",
"anti-apoptotic",
"transcription",
"factor",
"in",
"leukemic",
"cell",
"transformation",
"."
] | [
"the",
"e2a-hlf",
"(",
"hepatic",
"leukemia",
"factor",
")",
"oncoprotein",
",",
"generated",
"in",
"pro-b",
"lymphocytes",
"by",
"fusion",
"of",
"the",
"trans-activation",
"domain",
"of",
"e2a",
"to",
"the",
"basic",
"region/leucine",
"zipper",
"(",
"bzip",
")",
"domain",
"of",
"hlf",
",",
"functions",
"as",
"an",
"anti-apoptotic",
"transcription",
"factor",
"in",
"leukemic",
"cell",
"transformation",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"When",
"introduced",
"into",
"interleukin",
"3",
"(",
"IL-3",
")",
"-dependent",
"mouse",
"pro-B",
"lymphocytes",
",",
"E2A-HLF",
"prevents",
"apoptosis",
"induced",
"by",
"growth",
"factor",
"deprivation",
",",
"suggesting",
"that",
"IL-3",
"mediates",
"cell",
"survival",
"through",
"activation",
"of",
"a",
"transcription",
"factor",
"whose",
"activity",
"can",
"be",
"constitutively",
"replaced",
"by",
"the",
"chimeric",
"oncoprotein",
"."
] | [
"when",
"introduced",
"into",
"interleukin",
"3",
"(",
"il-3",
")",
"-dependent",
"mouse",
"pro-b",
"lymphocytes",
",",
"e2a-hlf",
"prevents",
"apoptosis",
"induced",
"by",
"growth",
"factor",
"deprivation",
",",
"suggesting",
"that",
"il-3",
"mediates",
"cell",
"survival",
"through",
"activation",
"of",
"a",
"transcription",
"factor",
"whose",
"activity",
"can",
"be",
"constitutively",
"replaced",
"by",
"the",
"chimeric",
"oncoprotein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"considered",
"four",
"bZIP",
"transcription",
"factors",
"as",
"candidates",
"for",
"this",
"putative",
"IL-3",
"-regulated",
"factor",
",",
"each",
"of",
"which",
"binds",
"avidly",
"to",
"the",
"DNA",
"consensus",
"sequence",
"recognized",
"by",
"E2A-HLF",
"and",
"is",
"related",
"to",
"the",
"Caenorhabditis",
"elegans",
"CES-2",
"(",
"cell",
"death",
"specification",
"protein",
")",
"neuron-specific",
"mediator",
"of",
"cell",
"death",
"."
] | [
"we",
"considered",
"four",
"bzip",
"transcription",
"factors",
"as",
"candidates",
"for",
"this",
"putative",
"il-3",
"-regulated",
"factor",
",",
"each",
"of",
"which",
"binds",
"avidly",
"to",
"the",
"dna",
"consensus",
"sequence",
"recognized",
"by",
"e2a-hlf",
"and",
"is",
"related",
"to",
"the",
"caenorhabditis",
"elegans",
"ces-2",
"(",
"cell",
"death",
"specification",
"protein",
")",
"neuron-specific",
"mediator",
"of",
"cell",
"death",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"expression",
"and",
"binding",
"activity",
"of",
"the",
"Nfil3",
"protein",
"(",
"also",
"called",
"E4bp4",
")",
",",
"but",
"not",
"of",
"Hlf",
",",
"Dbp",
",",
"or",
"Tef",
",",
"was",
"found",
"to",
"be",
"regulated",
"by",
"IL-3",
"in",
"mouse",
"pro-B",
"cell",
"lines",
"(",
"Baf-3",
"and",
"FL5",
".",
"12",
")",
"."
] | [
"the",
"expression",
"and",
"binding",
"activity",
"of",
"the",
"nfil3",
"protein",
"(",
"also",
"called",
"e4bp4",
")",
",",
"but",
"not",
"of",
"hlf",
",",
"dbp",
",",
"or",
"tef",
",",
"was",
"found",
"to",
"be",
"regulated",
"by",
"il-3",
"in",
"mouse",
"pro-b",
"cell",
"lines",
"(",
"baf-3",
"and",
"fl5",
".",
"12",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O"
] |
[
"Northern",
"blot",
"analysis",
"showed",
"that",
"Nfil3/",
"E4bp4",
"is",
"regulated",
"as",
"a",
"\"delayed-early\"",
"IL-3",
"-responsive",
"gene",
",",
"requiring",
"de",
"novo",
"protein",
"synthesis",
"."
] | [
"northern",
"blot",
"analysis",
"showed",
"that",
"nfil3/",
"e4bp4",
"is",
"regulated",
"as",
"a",
"\"delayed-early\"",
"il-3",
"-responsive",
"gene",
",",
"requiring",
"de",
"novo",
"protein",
"synthesis",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"absence",
"of",
"IL-3",
",",
"enforced",
"expression",
"of",
"the",
"human",
"NFIL3/E4BP4",
"cDNA",
"promoted",
"the",
"survival",
"but",
"not",
"the",
"growth",
"of",
"IL-3",
"-dependent",
"pro-B",
"cells",
"."
] | [
"in",
"the",
"absence",
"of",
"il-3",
",",
"enforced",
"expression",
"of",
"the",
"human",
"nfil3/e4bp4",
"cdna",
"promoted",
"the",
"survival",
"but",
"not",
"the",
"growth",
"of",
"il-3",
"-dependent",
"pro-b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"implicate",
"NFIL3/E4BP4",
"(",
"nuclear",
"factor",
"regulated",
"by",
"IL-3",
"/adenovirus",
"E4",
"promoter",
"binding",
"protein",
")",
"in",
"a",
"distinct",
"growth",
"factor-regulated",
"signaling",
"pathway",
"that",
"is",
"responsible",
"for",
"the",
"survival",
"of",
"early",
"B-cell",
"progenitors",
",",
"and",
"whose",
"alteration",
"by",
"E2A-HLF",
"leads",
"to",
"childhood",
"B",
"lineage",
"leukemia",
"."
] | [
"our",
"results",
"implicate",
"nfil3/e4bp4",
"(",
"nuclear",
"factor",
"regulated",
"by",
"il-3",
"/adenovirus",
"e4",
"promoter",
"binding",
"protein",
")",
"in",
"a",
"distinct",
"growth",
"factor-regulated",
"signaling",
"pathway",
"that",
"is",
"responsible",
"for",
"the",
"survival",
"of",
"early",
"b-cell",
"progenitors",
",",
"and",
"whose",
"alteration",
"by",
"e2a-hlf",
"leads",
"to",
"childhood",
"b",
"lineage",
"leukemia",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Translocation",
"breakpoints",
"in",
"three",
"patients",
"with",
"campomelic",
"dysplasia",
"and",
"autosomal",
"sex",
"reversal",
"map",
"more",
"than",
"130",
"kb",
"from",
"SOX9",
"."
] | [
"translocation",
"breakpoints",
"in",
"three",
"patients",
"with",
"campomelic",
"dysplasia",
"and",
"autosomal",
"sex",
"reversal",
"map",
"more",
"than",
"130",
"kb",
"from",
"sox9",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Campomelic",
"dysplasia",
"(",
"CMPD1",
")",
"and",
"autosomal",
"XY",
"sex",
"reversal",
"(",
"SRA1",
")",
"are",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"the",
"SRY-related",
"gene",
"SOX9",
"on",
"17q",
"."
] | [
"campomelic",
"dysplasia",
"(",
"cmpd1",
")",
"and",
"autosomal",
"xy",
"sex",
"reversal",
"(",
"sra1",
")",
"are",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"the",
"sry-related",
"gene",
"sox9",
"on",
"17q",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"Unexpectedly",
",",
"the",
"17q",
"breakpoints",
"in",
"four",
"CMPD1",
"translocation",
"cases",
"previously",
"analyzed",
"by",
"us",
"and",
"others",
"map",
"50",
"kb",
"or",
"more",
"from",
"SOX9",
"."
] | [
"unexpectedly",
",",
"the",
"17q",
"breakpoints",
"in",
"four",
"cmpd1",
"translocation",
"cases",
"previously",
"analyzed",
"by",
"us",
"and",
"others",
"map",
"50",
"kb",
"or",
"more",
"from",
"sox9",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"present",
"clinical",
",",
"cytogenetic",
",",
"and",
"molecular",
"data",
"from",
"a",
"new",
"CMPD1",
"/SRA1",
"patient",
"with",
"t",
"(",
"6",
";",
"17",
")",
"(",
"q14",
";",
"q24",
")",
"."
] | [
"here",
",",
"we",
"present",
"clinical",
",",
"cytogenetic",
",",
"and",
"molecular",
"data",
"from",
"a",
"new",
"cmpd1",
"/sra1",
"patient",
"with",
"t",
"(",
"6",
";",
"17",
")",
"(",
"q14",
";",
"q24",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Fluorescence",
"in",
"situ",
"hybridization",
"has",
"shown",
"that",
"the",
"17q",
"breakpoint",
"in",
"this",
"case",
"maps",
"to",
"the",
"same",
"region",
"as",
"the",
"breakpoints",
"in",
"the",
"other",
"translocation",
"cases",
",",
"at",
"least",
"130",
"kb",
"from",
"SOX9",
"."
] | [
"fluorescence",
"in",
"situ",
"hybridization",
"has",
"shown",
"that",
"the",
"17q",
"breakpoint",
"in",
"this",
"case",
"maps",
"to",
"the",
"same",
"region",
"as",
"the",
"breakpoints",
"in",
"the",
"other",
"translocation",
"cases",
",",
"at",
"least",
"130",
"kb",
"from",
"sox9",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Likewise",
",",
"the",
"breakpoints",
"in",
"two",
"of",
"the",
"previously",
"described",
"cases",
"also",
"map",
"more",
"than",
"130",
"kb",
"and",
",",
"as",
"shown",
"by",
"pulsed",
"field",
"gel",
"electrophoresis",
"analysis",
",",
"at",
"most",
"400",
"kb",
"or",
"690",
"kb",
"from",
"SOX9",
"."
] | [
"likewise",
",",
"the",
"breakpoints",
"in",
"two",
"of",
"the",
"previously",
"described",
"cases",
"also",
"map",
"more",
"than",
"130",
"kb",
"and",
",",
"as",
"shown",
"by",
"pulsed",
"field",
"gel",
"electrophoresis",
"analysis",
",",
"at",
"most",
"400",
"kb",
"or",
"690",
"kb",
"from",
"sox9",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"By",
"using",
"a",
"SOX9",
"coding",
"sequence",
"polymorphism",
",",
"expression",
"of",
"both",
"SOX9",
"alleles",
"has",
"been",
"demonstrated",
"by",
"the",
"reverse",
"transcriptase",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"in",
"lymphoblastoid",
"cells",
"from",
"one",
"of",
"the",
"translocation",
"cases",
"."
] | [
"by",
"using",
"a",
"sox9",
"coding",
"sequence",
"polymorphism",
",",
"expression",
"of",
"both",
"sox9",
"alleles",
"has",
"been",
"demonstrated",
"by",
"the",
"reverse",
"transcriptase",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"in",
"lymphoblastoid",
"cells",
"from",
"one",
"of",
"the",
"translocation",
"cases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Changes",
"in",
"PKC",
"isoforms",
"in",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"changes",
"in",
"pkc",
"isoforms",
"in",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Alveolar",
"macrophages",
"play",
"an",
"important",
"role",
"in",
"host",
"defense",
"and",
"in",
"other",
"types",
"of",
"inflammatory",
"processes",
"in",
"the",
"lung",
"."
] | [
"alveolar",
"macrophages",
"play",
"an",
"important",
"role",
"in",
"host",
"defense",
"and",
"in",
"other",
"types",
"of",
"inflammatory",
"processes",
"in",
"the",
"lung",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-body_part",
"O"
] |
[
"These",
"cells",
"exhibit",
"many",
"alterations",
"in",
"function",
"compared",
"with",
"their",
"precursor",
"cells",
",",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"these",
"cells",
"exhibit",
"many",
"alterations",
"in",
"function",
"compared",
"with",
"their",
"precursor",
"cells",
",",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"To",
"evaluate",
"a",
"potential",
"mechanism",
"for",
"these",
"differences",
"in",
"function",
",",
"we",
"evaluated",
"expression",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"isoforms",
"."
] | [
"to",
"evaluate",
"a",
"potential",
"mechanism",
"for",
"these",
"differences",
"in",
"function",
",",
"we",
"evaluated",
"expression",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
"(",
"pkc",
")",
"isoforms",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"an",
"increase",
"in",
"Ca2+",
"-dependent",
"PKC",
"isoforms",
"in",
"monocytes",
"compared",
"with",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"we",
"found",
"an",
"increase",
"in",
"ca2+",
"-dependent",
"pkc",
"isoforms",
"in",
"monocytes",
"compared",
"with",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"also",
"found",
"differential",
"expression",
"of",
"the",
"Ca2+",
"-independent",
"isoforms",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"we",
"also",
"found",
"differential",
"expression",
"of",
"the",
"ca2+",
"-independent",
"isoforms",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"One",
"consequence",
"of",
"the",
"activation",
"of",
"PKC",
"can",
"be",
"increased",
"expression",
"of",
"mitogen-activated",
"protein",
"(",
"MAP",
")",
"kinase",
"pathways",
"."
] | [
"one",
"consequence",
"of",
"the",
"activation",
"of",
"pkc",
"can",
"be",
"increased",
"expression",
"of",
"mitogen-activated",
"protein",
"(",
"map",
")",
"kinase",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"we",
"also",
"evaluated",
"activation",
"of",
"the",
"MAP",
"kinase",
"extracellular",
"signal-regulated",
"kinase",
"(",
"ERK",
")",
"2",
"by",
"the",
"phorbol",
"ester",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"(",
"PMA",
")",
"."
] | [
"therefore",
",",
"we",
"also",
"evaluated",
"activation",
"of",
"the",
"map",
"kinase",
"extracellular",
"signal-regulated",
"kinase",
"(",
"erk",
")",
"2",
"by",
"the",
"phorbol",
"ester",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"(",
"pma",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"PMA",
"activated",
"ERK2",
"kinase",
"in",
"both",
"alveolar",
"macrophages",
"and",
"monocytes",
";",
"however",
",",
"monocytes",
"consistently",
"showed",
"a",
"significantly",
"greater",
"activation",
"of",
"ERK2",
"kinase",
"by",
"PMA",
"compared",
"with",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"pma",
"activated",
"erk2",
"kinase",
"in",
"both",
"alveolar",
"macrophages",
"and",
"monocytes",
";",
"however",
",",
"monocytes",
"consistently",
"showed",
"a",
"significantly",
"greater",
"activation",
"of",
"erk2",
"kinase",
"by",
"pma",
"compared",
"with",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Another",
"known",
"consequence",
"of",
"the",
"activation",
"of",
"PKC",
"and",
"subsequent",
"activation",
"of",
"ERK",
"kinase",
"is",
"activation",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"activator",
"protein-1",
"(",
"AP-1",
")",
"."
] | [
"another",
"known",
"consequence",
"of",
"the",
"activation",
"of",
"pkc",
"and",
"subsequent",
"activation",
"of",
"erk",
"kinase",
"is",
"activation",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"activator",
"protein-1",
"(",
"ap-1",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"evaluated",
"the",
"activation",
"of",
"AP-1",
"by",
"PMA",
"in",
"both",
"monocytes",
"and",
"macrophages",
"."
] | [
"we",
"evaluated",
"the",
"activation",
"of",
"ap-1",
"by",
"pma",
"in",
"both",
"monocytes",
"and",
"macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"very",
"little",
"detectable",
"activation",
"of",
"AP-1",
",",
"as",
"assessed",
"in",
"a",
"gel",
"shift",
"assay",
",",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
",",
"whereas",
"monocytes",
"showed",
"a",
"substantial",
"activation",
"of",
"AP-1",
"by",
"PMA",
"."
] | [
"we",
"found",
"very",
"little",
"detectable",
"activation",
"of",
"ap-1",
",",
"as",
"assessed",
"in",
"a",
"gel",
"shift",
"assay",
",",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
",",
"whereas",
"monocytes",
"showed",
"a",
"substantial",
"activation",
"of",
"ap-1",
"by",
"pma",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"These",
"studies",
"show",
"that",
"the",
"differential",
"expression",
"of",
"PKC",
"isoforms",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"and",
"blood",
"monocytes",
"is",
"associated",
"with",
"important",
"functional",
"alterations",
"in",
"the",
"cells",
"."
] | [
"these",
"studies",
"show",
"that",
"the",
"differential",
"expression",
"of",
"pkc",
"isoforms",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"and",
"blood",
"monocytes",
"is",
"associated",
"with",
"important",
"functional",
"alterations",
"in",
"the",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Involvement",
"of",
"intracellular",
"Ca2+",
"in",
"oxidant-induced",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"."
] | [
"involvement",
"of",
"intracellular",
"ca2+",
"in",
"oxidant-induced",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-atom",
"I-atom",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"human",
"Jurkat",
"T",
"cells",
"and",
"its",
"subclone",
"Wurzburg",
"cells",
"oxidant",
"challenge",
"elevated",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"by",
"mobilizing",
"Ca2+",
"from",
"intracellular",
"stores",
"."
] | [
"in",
"human",
"jurkat",
"t",
"cells",
"and",
"its",
"subclone",
"wurzburg",
"cells",
"oxidant",
"challenge",
"elevated",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"by",
"mobilizing",
"ca2+",
"from",
"intracellular",
"stores",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"I-atom",
"I-atom",
"I-atom",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"Jurkat",
"cells",
"this",
"effect",
"was",
"rapid",
"and",
"transient",
",",
"but",
"in",
"Wurzburg",
"cells",
"the",
"response",
"was",
"slow",
"and",
"sustained",
"."
] | [
"in",
"jurkat",
"cells",
"this",
"effect",
"was",
"rapid",
"and",
"transient",
",",
"but",
"in",
"wurzburg",
"cells",
"the",
"response",
"was",
"slow",
"and",
"sustained",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"H2O2",
"-induced",
"NF-kappaB",
"activation",
"in",
"Wurzburg",
"cells",
"was",
"not",
"influenced",
"by",
"the",
"presence",
"of",
"extracellular",
"EGTA",
"but",
"was",
"totally",
"inhibited",
"in",
"cells",
"that",
"were",
"loaded",
"with",
"esterified",
"EGTA",
"."
] | [
"h2o2",
"-induced",
"nf-kappab",
"activation",
"in",
"wurzburg",
"cells",
"was",
"not",
"influenced",
"by",
"the",
"presence",
"of",
"extracellular",
"egta",
"but",
"was",
"totally",
"inhibited",
"in",
"cells",
"that",
"were",
"loaded",
"with",
"esterified",
"egta",
"."
] | [
"B-inorganic",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"In",
"Jurkat",
"cells",
"that",
"are",
"not",
"sensitive",
"to",
"H2O2",
"-induced",
"NF-kappaB",
"activation",
",",
"H2O2",
"potentiated",
"NF-kappaB",
"activation",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"sustained",
"high",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"following",
"thapsigargin",
"treatment",
"."
] | [
"in",
"jurkat",
"cells",
"that",
"are",
"not",
"sensitive",
"to",
"h2o2",
"-induced",
"nf-kappab",
"activation",
",",
"h2o2",
"potentiated",
"nf-kappab",
"activation",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"sustained",
"high",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"following",
"thapsigargin",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-inorganic",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"B-inorganic",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"NF-kappaB",
"regulatory",
"effect",
"of",
"alpha-lipoate",
"and",
"N-acetylcysteine",
"appeared",
"to",
"be",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"due",
"to",
"their",
"ability",
"to",
"stabilize",
"elevation",
"of",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"following",
"oxidant",
"challenge",
"."
] | [
"nf-kappab",
"regulatory",
"effect",
"of",
"alpha-lipoate",
"and",
"n-acetylcysteine",
"appeared",
"to",
"be",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"due",
"to",
"their",
"ability",
"to",
"stabilize",
"elevation",
"of",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"following",
"oxidant",
"challenge",
"."
] | [
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Results",
"of",
"this",
"study",
"indicate",
"that",
"a",
"sustained",
"elevated",
"[",
"Ca2+",
"]",
"i",
"is",
"a",
"significant",
"factor",
"in",
"oxidant-induced",
"NF-kappaB",
"activation",
"."
] | [
"results",
"of",
"this",
"study",
"indicate",
"that",
"a",
"sustained",
"elevated",
"[",
"ca2+",
"]",
"i",
"is",
"a",
"significant",
"factor",
"in",
"oxidant-induced",
"nf-kappab",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"I-atom",
"I-atom",
"I-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_complex",
"O",
"O"
] |
[
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
",",
"a",
"natural",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"breakdown",
"product",
",",
"induces",
"interleukin-1",
"beta",
"and",
"interleukin-6",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
",",
"a",
"natural",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"breakdown",
"product",
",",
"induces",
"interleukin-1",
"beta",
"and",
"interleukin-6",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"A",
"study",
"of",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"involved",
"in",
"inflammatory",
"cytokine",
"expression",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"J",
"Biol",
"Chem",
"1994",
"Jun",
"17",
";",
"269",
"(",
"24",
")",
":",
"16983",
"]"
] | [
"a",
"study",
"of",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"involved",
"in",
"inflammatory",
"cytokine",
"expression",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"j",
"biol",
"chem",
"1994",
"jun",
"17",
";",
"269",
"(",
"24",
")",
":",
"16983",
"]"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"believed",
"that",
"induction",
"of",
"cytokine",
"expression",
"by",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"components",
"plays",
"a",
"role",
"in",
"the",
"development",
"and",
"course",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"it",
"is",
"believed",
"that",
"induction",
"of",
"cytokine",
"expression",
"by",
"bacterial",
"cell",
"wall",
"components",
"plays",
"a",
"role",
"in",
"the",
"development",
"and",
"course",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"most",
"attention",
"has",
"been",
"focused",
"on",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
"."
] | [
"however",
",",
"most",
"attention",
"has",
"been",
"focused",
"on",
"lipopolysaccharide",
"(",
"lps",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"studied",
"the",
"ability",
"of",
"N-acetylglucosaminyl-1",
",",
"6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanyl-D-",
"isoglutamyl-m-diaminopimelyl-D-alanine",
"(",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
")",
",",
"a",
"naturally",
"occurring",
"breakdown",
"product",
"of",
"peptidoglycan",
"that",
"is",
"produced",
"by",
"soluble",
"lytic",
"transglycosylase",
"of",
"Escherichia",
"coli",
",",
"to",
"induce",
"cytokine",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"we",
"studied",
"the",
"ability",
"of",
"n-acetylglucosaminyl-1",
",",
"6-anhydro-n-acetylmuramyl-l-alanyl-d-",
"isoglutamyl-m-diaminopimelyl-d-alanine",
"(",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
")",
",",
"a",
"naturally",
"occurring",
"breakdown",
"product",
"of",
"peptidoglycan",
"that",
"is",
"produced",
"by",
"soluble",
"lytic",
"transglycosylase",
"of",
"escherichia",
"coli",
",",
"to",
"induce",
"cytokine",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"was",
"found",
"to",
"strongly",
"induce",
"interleukin",
"(",
"IL",
")",
"-1",
"beta",
"and",
"IL-6",
"mRNA",
"expression",
"after",
"2",
"h",
"and",
"IL-1",
"beta",
"and",
"IL-6",
"protein",
"secretion",
"after",
"48",
"h",
"of",
"activation",
"."
] | [
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"was",
"found",
"to",
"strongly",
"induce",
"interleukin",
"(",
"il",
")",
"-1",
"beta",
"and",
"il-6",
"mrna",
"expression",
"after",
"2",
"h",
"and",
"il-1",
"beta",
"and",
"il-6",
"protein",
"secretion",
"after",
"48",
"h",
"of",
"activation",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"increase",
"in",
"mRNA",
"accumulation",
"was",
"at",
"least",
"partly",
"due",
"to",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"transcription",
"rates",
"of",
"the",
"respective",
"genes",
"and",
"was",
"accompanied",
"by",
"a",
"strong",
"induction",
"of",
"nuclear",
"factor-kappa",
"B",
"and",
"activator",
"protein-1",
"transcription",
"factor",
"expression",
"."
] | [
"the",
"increase",
"in",
"mrna",
"accumulation",
"was",
"at",
"least",
"partly",
"due",
"to",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"transcription",
"rates",
"of",
"the",
"respective",
"genes",
"and",
"was",
"accompanied",
"by",
"a",
"strong",
"induction",
"of",
"nuclear",
"factor-kappa",
"b",
"and",
"activator",
"protein-1",
"transcription",
"factor",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Experiments",
"using",
"inhibitors",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
",",
"protein",
"kinase",
"A",
",",
"and",
"tyrosine",
"kinase-dependent",
"pathways",
"revealed",
"that",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"-induced",
"IL-1",
"beta",
"and",
"IL-6",
"mRNA",
"expression",
"involves",
"activation",
"of",
"an",
"H7-inhibitable",
"pathway",
"."
] | [
"experiments",
"using",
"inhibitors",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
",",
"protein",
"kinase",
"a",
",",
"and",
"tyrosine",
"kinase-dependent",
"pathways",
"revealed",
"that",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"-induced",
"il-1",
"beta",
"and",
"il-6",
"mrna",
"expression",
"involves",
"activation",
"of",
"an",
"h7-inhibitable",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"By",
"using",
"the",
"protein",
"synthesis",
"inhibitor",
"cycloheximide",
",",
"it",
"was",
"shown",
"that",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"-induced",
"IL-6",
"mRNA",
"expression",
"depends",
"on",
"the",
"synthesis",
"of",
"new",
"protein",
",",
"whereas",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"-induced",
"IL-1",
"beta",
"mRNA",
"accumulation",
"does",
"not",
"."
] | [
"by",
"using",
"the",
"protein",
"synthesis",
"inhibitor",
"cycloheximide",
",",
"it",
"was",
"shown",
"that",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"-induced",
"il-6",
"mrna",
"expression",
"depends",
"on",
"the",
"synthesis",
"of",
"new",
"protein",
",",
"whereas",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"-induced",
"il-1",
"beta",
"mrna",
"accumulation",
"does",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"responses",
"to",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"were",
"compared",
"with",
"those",
"to",
"LPS",
"and",
"muramyldipeptide",
"(",
"MDP",
")",
",",
"it",
"was",
"found",
"that",
"the",
"optimal",
"response",
"to",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"induction",
"was",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"LPS",
"but",
"significantly",
"higher",
"than",
"the",
"response",
"to",
"MDP",
"."
] | [
"when",
"responses",
"to",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"were",
"compared",
"with",
"those",
"to",
"lps",
"and",
"muramyldipeptide",
"(",
"mdp",
")",
",",
"it",
"was",
"found",
"that",
"the",
"optimal",
"response",
"to",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"induction",
"was",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"lps",
"but",
"significantly",
"higher",
"than",
"the",
"response",
"to",
"mdp",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"maximal",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"-induced",
"IL-1",
"beta",
"and",
"IL-6",
"mRNA",
"expression",
"could",
"be",
"enhanced",
"by",
"co-stimulation",
"with",
"LPS",
"or",
"MDP",
",",
"suggesting",
"that",
"different",
"receptors",
"and/or",
"transduction",
"pathways",
"were",
"involved",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"maximal",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"-induced",
"il-1",
"beta",
"and",
"il-6",
"mrna",
"expression",
"could",
"be",
"enhanced",
"by",
"co-stimulation",
"with",
"lps",
"or",
"mdp",
",",
"suggesting",
"that",
"different",
"receptors",
"and/or",
"transduction",
"pathways",
"were",
"involved",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"induces",
"IL-1",
"beta",
"and",
"IL-6",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"suggesting",
"a",
"possible",
"role",
"for",
"G",
"(",
"Anh",
")",
"MTetra",
"in",
"the",
"release",
"of",
"cytokines",
"during",
"sepsis",
"."
] | [
"these",
"results",
"indicate",
"that",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"induces",
"il-1",
"beta",
"and",
"il-6",
"expression",
"in",
"human",
"monocytes",
"suggesting",
"a",
"possible",
"role",
"for",
"g",
"(",
"anh",
")",
"mtetra",
"in",
"the",
"release",
"of",
"cytokines",
"during",
"sepsis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Immune",
"response",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"to",
"HBx-antigen",
"of",
"hepatitis",
"B",
"virus",
"."
] | [
"immune",
"response",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"to",
"hbx-antigen",
"of",
"hepatitis",
"b",
"virus",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O"
] |
[
"The",
"hepatitis",
"B",
"virus",
"genome",
"encodes",
"a",
"transcriptional",
"transactivator",
"protein",
"designated",
"HBxAg",
"."
] | [
"the",
"hepatitis",
"b",
"virus",
"genome",
"encodes",
"a",
"transcriptional",
"transactivator",
"protein",
"designated",
"hbxag",
"."
] | [
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"investigated",
"whether",
"this",
"antigen",
"is",
"a",
"target",
"structure",
"for",
"human",
"T-lymphocytes",
"."
] | [
"we",
"have",
"investigated",
"whether",
"this",
"antigen",
"is",
"a",
"target",
"structure",
"for",
"human",
"t-lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Using",
"recombinant",
"HBxAg",
"protein",
",",
"we",
"found",
"HBxAg",
"-specific",
"stimulation",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"in",
"patients",
"with",
"acute",
"hepatitis",
"B",
"virus",
"infection",
"(",
"6",
"of",
"6",
")",
"and",
"chronic",
"hepatitis",
"B",
"virus",
"infection",
"(",
"6",
"of",
"17",
")",
"but",
"not",
"in",
"healthy",
"individuals",
"."
] | [
"using",
"recombinant",
"hbxag",
"protein",
",",
"we",
"found",
"hbxag",
"-specific",
"stimulation",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"in",
"patients",
"with",
"acute",
"hepatitis",
"b",
"virus",
"infection",
"(",
"6",
"of",
"6",
")",
"and",
"chronic",
"hepatitis",
"b",
"virus",
"infection",
"(",
"6",
"of",
"17",
")",
"but",
"not",
"in",
"healthy",
"individuals",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"With",
"HBxAg",
"-specific",
"synthetic",
"polypeptides",
",",
"several",
"T-cell",
"epitopes",
"were",
"identified",
"."
] | [
"with",
"hbxag",
"-specific",
"synthetic",
"polypeptides",
",",
"several",
"t-cell",
"epitopes",
"were",
"identified",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_N/A",
"I-protein_N/A",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Most",
"were",
"located",
"in",
"the",
"carboxyterminal",
"half",
"of",
"the",
"HBxAg",
"protein",
"."
] | [
"most",
"were",
"located",
"in",
"the",
"carboxyterminal",
"half",
"of",
"the",
"hbxag",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Five",
"T-cell",
"clones",
"specific",
"for",
"a",
"T-cell",
"epitope",
"located",
"at",
"the",
"carboxyterminal",
"region",
"of",
"HBxAg",
"were",
"established",
"and",
"found",
"to",
"belong",
"to",
"the",
"CD2/CD4-positive",
",",
"CD8-negative",
"subtype",
"."
] | [
"five",
"t-cell",
"clones",
"specific",
"for",
"a",
"t-cell",
"epitope",
"located",
"at",
"the",
"carboxyterminal",
"region",
"of",
"hbxag",
"were",
"established",
"and",
"found",
"to",
"belong",
"to",
"the",
"cd2/cd4-positive",
",",
"cd8-negative",
"subtype",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"establish",
"for",
"the",
"first",
"time",
"HBxAg",
"as",
"an",
"antigen",
"in",
"the",
"cellular",
"immune",
"response",
"."
] | [
"these",
"data",
"establish",
"for",
"the",
"first",
"time",
"hbxag",
"as",
"an",
"antigen",
"in",
"the",
"cellular",
"immune",
"response",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |