tokens
sequence
folded_tokens
sequence
labels
sequence
[ "Effects", "of", "diesel", "organic", "extracts", "on", "chemokine", "production", "by", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "." ]
[ "effects", "of", "diesel", "organic", "extracts", "on", "chemokine", "production", "by", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "." ]
[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "BACKGROUND", ":", "Polyaromatic", "hydrocarbons", "(", "PAHs", ")", "associated", "with", "diesel", "exhaust", "particles", "(", "DEPs", ")", "are", "found", "in", "the", "atmospheric", "urban", "pollution", "." ]
[ "background", ":", "polyaromatic", "hydrocarbons", "(", "pahs", ")", "associated", "with", "diesel", "exhaust", "particles", "(", "deps", ")", "are", "found", "in", "the", "atmospheric", "urban", "pollution", "." ]
[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O" ]
[ "Such", "compounds", "have", "been", "shown", "to", "favor", "IgE", "production", ",", "bronchial", "hyperresponsiveness", ",", "and", "airway", "inflammation", "." ]
[ "such", "compounds", "have", "been", "shown", "to", "favor", "ige", "production", ",", "bronchial", "hyperresponsiveness", ",", "and", "airway", "inflammation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Chemokines", "are", "a", "group", "of", "chemotactic", "cytokines", "involved", "in", "the", "recruitment", "of", "inflammatory", "cells", "." ]
[ "chemokines", "are", "a", "group", "of", "chemotactic", "cytokines", "involved", "in", "the", "recruitment", "of", "inflammatory", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "OBJECTIVE", ":", "We", "investigated", "the", "effect", "of", "DEP-", "PAHs", "on", "the", "release", "and", "mRNA", "expression", "of", "IL-8", ",", "MCP-1", ",", "and", "RANTES", "by", "PBMCs", "obtained", "from", "healthy", "subjects", "." ]
[ "objective", ":", "we", "investigated", "the", "effect", "of", "dep-", "pahs", "on", "the", "release", "and", "mrna", "expression", "of", "il-8", ",", "mcp-1", ",", "and", "rantes", "by", "pbmcs", "obtained", "from", "healthy", "subjects", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]
[ "METHODS", ":", "Protein", "production", "in", "supernatants", "was", "assessed", "by", "ELISA", ",", "and", "mRNA", "expression", "was", "evaluated", "by", "semiquantitative", "RT-", "PCR", "." ]
[ "methods", ":", "protein", "production", "in", "supernatants", "was", "assessed", "by", "elisa", ",", "and", "mrna", "expression", "was", "evaluated", "by", "semiquantitative", "rt-", "pcr", "." ]
[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "RESULTS", ":", "Secretion", "of", "IL-8", "and", "RANTES", "increased", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "with", "increasing", "concentrations", "of", "DEP-", "PAHs", "(", "range", ",", "0", ".", "5", "ng", "to", "50", "ng/mL", ")", "." ]
[ "results", ":", "secretion", "of", "il-8", "and", "rantes", "increased", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "with", "increasing", "concentrations", "of", "dep-", "pahs", "(", "range", ",", "0", ".", "5", "ng", "to", "50", "ng/ml", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "contrary", ",", "the", "release", "of", "MCP-1", "was", "significantly", "inhibited", ",", "also", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "." ]
[ "on", "the", "contrary", ",", "the", "release", "of", "mcp-1", "was", "significantly", "inhibited", ",", "also", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Messenger", "RNA", "production", "coding", "for", "IL-8", ",", "RANTES", ",", "and", "MCP-1", "showed", "parallel", "variations", "to", "the", "production", "of", "the", "correspondent", "proteins", "." ]
[ "messenger", "rna", "production", "coding", "for", "il-8", ",", "rantes", ",", "and", "mcp-1", "showed", "parallel", "variations", "to", "the", "production", "of", "the", "correspondent", "proteins", "." ]
[ "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "Effects", "of", "DEP-", "PAHs", "became", "significant", "at", "7", "hours", "and", "up", "to", "48", "hours", "time", "culture", "for", "MCP-1", ",", "and", "up", "to", "24", "hours", "time", "culture", "for", "IL-8", "and", "RANTES", "." ]
[ "effects", "of", "dep-", "pahs", "became", "significant", "at", "7", "hours", "and", "up", "to", "48", "hours", "time", "culture", "for", "mcp-1", ",", "and", "up", "to", "24", "hours", "time", "culture", "for", "il-8", "and", "rantes", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Moreover", ",", "supernatants", "from", "DEP-PAH-activated", "cells", ",", "compared", "with", "those", "of", "controls", ",", "exhibited", "a", "significantly", "enhanced", "chemotactic", "activity", "for", "neutrophils", "and", "eosinophils", ",", "which", "was", "significantly", "inhibited", "by", "pretreatment", "with", "anti-", "IL-8", "and", "anti-", "RANTES", "neutralizing", "antibodies", ",", "respectively", "." ]
[ "moreover", ",", "supernatants", "from", "dep-pah-activated", "cells", ",", "compared", "with", "those", "of", "controls", ",", "exhibited", "a", "significantly", "enhanced", "chemotactic", "activity", "for", "neutrophils", "and", "eosinophils", ",", "which", "was", "significantly", "inhibited", "by", "pretreatment", "with", "anti-", "il-8", "and", "anti-", "rantes", "neutralizing", "antibodies", ",", "respectively", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSION", ":", "These", "findings", "suggest", "that", "the", "chemokine", "pathways", "are", "modulated", "by", "DEP-", "PAHs", "at", "the", "transcriptional", "level", ",", "reinforcing", "the", "idea", "that", "the", "development", "of", "inflammatory", "reactions", "might", "be", "affected", "by", "diesel", "exhaust", "emission", "." ]
[ "conclusion", ":", "these", "findings", "suggest", "that", "the", "chemokine", "pathways", "are", "modulated", "by", "dep-", "pahs", "at", "the", "transcriptional", "level", ",", "reinforcing", "the", "idea", "that", "the", "development", "of", "inflammatory", "reactions", "might", "be", "affected", "by", "diesel", "exhaust", "emission", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Highly", "polarized", "HLA", "class", "II", "antigen", "processing", "and", "presentation", "by", "human", "intestinal", "epithelial", "cells", "." ]
[ "highly", "polarized", "hla", "class", "ii", "antigen", "processing", "and", "presentation", "by", "human", "intestinal", "epithelial", "cells", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "The", "high", "concentration", "of", "foreign", "antigen", "in", "the", "lumen", "of", "the", "gastrointestinal", "tract", "is", "separated", "from", "the", "underlying", "lymphocytes", "by", "a", "single", "cell", "layer", "of", "polarized", "epithelium", "." ]
[ "the", "high", "concentration", "of", "foreign", "antigen", "in", "the", "lumen", "of", "the", "gastrointestinal", "tract", "is", "separated", "from", "the", "underlying", "lymphocytes", "by", "a", "single", "cell", "layer", "of", "polarized", "epithelium", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]
[ "Intestinal", "epithelial", "cells", "can", "express", "HLA", "class", "II", "antigens", "and", "may", "function", "as", "antigen-presenting", "cells", "to", "CD4", "(", "+", ")", "T", "cells", "within", "the", "intestinal", "mucosa", "." ]
[ "intestinal", "epithelial", "cells", "can", "express", "hla", "class", "ii", "antigens", "and", "may", "function", "as", "antigen-presenting", "cells", "to", "cd4", "(", "+", ")", "t", "cells", "within", "the", "intestinal", "mucosa", "." ]
[ "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]
[ "Using", "tetanus", "toxoid", "specific", "and", "HLA-DR-restricted", "T", "lymphocytes", ",", "we", "show", "that", "polarized", "intestinal", "epithelial", "cells", "directed", "to", "express", "HLA-DR", "molecules", "are", "able", "to", "initiate", "class", "II", "processing", "only", "after", "internalization", "of", "antigen", "from", "their", "apical", "surface", "." ]
[ "using", "tetanus", "toxoid", "specific", "and", "hla-dr-restricted", "t", "lymphocytes", ",", "we", "show", "that", "polarized", "intestinal", "epithelial", "cells", "directed", "to", "express", "hla-dr", "molecules", "are", "able", "to", "initiate", "class", "ii", "processing", "only", "after", "internalization", "of", "antigen", "from", "their", "apical", "surface", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Coexpression", "of", "the", "class", "II", "transactivator", "CIITA", "in", "these", "cells", ",", "which", "stimulates", "highly", "efficient", "class", "II", "processing", "without", "the", "characteristic", "decline", "in", "barrier", "function", "seen", "in", "polarized", "monolayers", "treated", "with", "the", "proinflammatory", "cytokine", "gamma-IFN", ",", "facilitates", "antigen", "processing", "from", "the", "basolateral", "surface", "." ]
[ "coexpression", "of", "the", "class", "ii", "transactivator", "ciita", "in", "these", "cells", ",", "which", "stimulates", "highly", "efficient", "class", "ii", "processing", "without", "the", "characteristic", "decline", "in", "barrier", "function", "seen", "in", "polarized", "monolayers", "treated", "with", "the", "proinflammatory", "cytokine", "gamma-ifn", ",", "facilitates", "antigen", "processing", "from", "the", "basolateral", "surface", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]
[ "In", "both", "cases", ",", "peptide", "presentation", "to", "T", "cells", "via", "class", "II", "molecules", "was", "restricted", "to", "the", "basolateral", "surface", "." ]
[ "in", "both", "cases", ",", "peptide", "presentation", "to", "t", "cells", "via", "class", "ii", "molecules", "was", "restricted", "to", "the", "basolateral", "surface", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "indicate", "a", "highly", "polarized", "functional", "architecture", "for", "antigen", "processing", "and", "presentation", "by", "intestinal", "epithelial", "cells", ",", "and", "suggest", "that", "the", "functional", "outcome", "of", "antigen", "processing", "by", "the", "intestinal", "epithelium", "is", "both", "dependent", "on", "the", "cellular", "surface", "at", "which", "the", "foreign", "antigen", "is", "internalized", "and", "by", "the", "underlying", "degree", "of", "mucosal", "inflammation" ]
[ "these", "data", "indicate", "a", "highly", "polarized", "functional", "architecture", "for", "antigen", "processing", "and", "presentation", "by", "intestinal", "epithelial", "cells", ",", "and", "suggest", "that", "the", "functional", "outcome", "of", "antigen", "processing", "by", "the", "intestinal", "epithelium", "is", "both", "dependent", "on", "the", "cellular", "surface", "at", "which", "the", "foreign", "antigen", "is", "internalized", "and", "by", "the", "underlying", "degree", "of", "mucosal", "inflammation" ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name" ]
[ "A", "novel", "transcription", "factor", "regulates", "expression", "of", "the", "vacuolar", "H+-ATPase", "B2", "subunit", "through", "AP-2", "sites", "during", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "a", "novel", "transcription", "factor", "regulates", "expression", "of", "the", "vacuolar", "h+-atpase", "b2", "subunit", "through", "ap-2", "sites", "during", "monocytic", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "During", "monocyte-to-macrophage", "differentiation", ",", "the", "cellular", "content", "of", "vacuolar", "H+-ATPase", "(", "V-ATPase", ")", "increases", "more", "than", "4-fold", "." ]
[ "during", "monocyte-to-macrophage", "differentiation", ",", "the", "cellular", "content", "of", "vacuolar", "h+-atpase", "(", "v-atpase", ")", "increases", "more", "than", "4-fold", "." ]
[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "shown", "previously", "that", "amplified", "expression", "of", "the", "B2", "subunit", "of", "the", "V-ATPase", "occurs", "solely", "by", "increased", "transcription", ",", "and", "that", "the", "5'-untranslated", "region", "of", "the", "B2", "gene", ",", "containing", "multiple", "consensus", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "AP-2", "and", "Sp1", ",", "is", "required", "for", "this", "expression", "." ]
[ "we", "have", "shown", "previously", "that", "amplified", "expression", "of", "the", "b2", "subunit", "of", "the", "v-atpase", "occurs", "solely", "by", "increased", "transcription", ",", "and", "that", "the", "5'-untranslated", "region", "of", "the", "b2", "gene", ",", "containing", "multiple", "consensus", "binding", "sites", "for", "the", "transcription", "factors", "ap-2", "and", "sp1", ",", "is", "required", "for", "this", "expression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "demonstrates", "that", "AP-2", "binding", "sequences", "are", "essential", "for", "increased", "transcription", "from", "the", "B2", "promoter", "during", "monocyte-macrophage", "differentiation", "and", "that", "AP-2", ",", "expressed", "exogenously", "in", "THP-1", "and", "other", "cells", ",", "activates", "transcription", "from", "the", "B2", "promoter", "." ]
[ "the", "present", "study", "demonstrates", "that", "ap-2", "binding", "sequences", "are", "essential", "for", "increased", "transcription", "from", "the", "b2", "promoter", "during", "monocyte-macrophage", "differentiation", "and", "that", "ap-2", ",", "expressed", "exogenously", "in", "thp-1", "and", "other", "cells", ",", "activates", "transcription", "from", "the", "b2", "promoter", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "In", "mobility", "shift", "assays", ",", "a", "nuclear", "factor", "from", "THP-1", "and", "U-937", "cells", "was", "identified", "that", "binds", "to", "several", "AP-2", "response", "elements", "within", "the", "B2", "promoter", ",", "but", "does", "not", "react", "with", "AP-2", "antibodies", ",", "and", "has", "a", "DNA", "sequence", "binding", "affinity", "profile", "that", "differs", "from", "AP-2", "." ]
[ "in", "mobility", "shift", "assays", ",", "a", "nuclear", "factor", "from", "thp-1", "and", "u-937", "cells", "was", "identified", "that", "binds", "to", "several", "ap-2", "response", "elements", "within", "the", "b2", "promoter", ",", "but", "does", "not", "react", "with", "ap-2", "antibodies", ",", "and", "has", "a", "dna", "sequence", "binding", "affinity", "profile", "that", "differs", "from", "ap-2", "." ]
[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_line", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "These", "findings", "suggest", "that", "a", "novel", "AP-2", "-like", "transcription", "factor", "is", "responsible", "for", "V-ATPase", "B", "subunit", "amplification", "during", "monocyte", "differentiation", "." ]
[ "these", "findings", "suggest", "that", "a", "novel", "ap-2", "-like", "transcription", "factor", "is", "responsible", "for", "v-atpase", "b", "subunit", "amplification", "during", "monocyte", "differentiation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "BCL-6", "mutations", "in", "normal", "germinal", "center", "B", "cells", ":", "evidence", "of", "somatic", "hypermutation", "acting", "outside", "Ig", "loci", "." ]
[ "bcl-6", "mutations", "in", "normal", "germinal", "center", "b", "cells", ":", "evidence", "of", "somatic", "hypermutation", "acting", "outside", "ig", "loci", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "The", "molecular", "mechanism", "involved", "in", "the", "process", "of", "antigen-driven", "somatic", "hypermutation", "of", "Ig", "genes", "is", "unknown", ",", "but", "it", "is", "commonly", "believed", "that", "this", "mechanism", "is", "restricted", "to", "the", "Ig", "loci", "." ]
[ "the", "molecular", "mechanism", "involved", "in", "the", "process", "of", "antigen-driven", "somatic", "hypermutation", "of", "ig", "genes", "is", "unknown", ",", "but", "it", "is", "commonly", "believed", "that", "this", "mechanism", "is", "restricted", "to", "the", "ig", "loci", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "B", "cell", "lymphomas", "commonly", "display", "multiple", "somatic", "mutations", "clustering", "in", "the", "5'-regulatory", "region", "of", "BCL-6", ",", "a", "proto-oncogene", "encoding", "for", "a", "POZ/Zinc", "finger", "transcriptional", "repressor", "expressed", "in", "germinal", "center", "(", "GC", ")", "B", "cells", "and", "required", "for", "GC", "formation", "." ]
[ "b", "cell", "lymphomas", "commonly", "display", "multiple", "somatic", "mutations", "clustering", "in", "the", "5'-regulatory", "region", "of", "bcl-6", ",", "a", "proto-oncogene", "encoding", "for", "a", "poz/zinc", "finger", "transcriptional", "repressor", "expressed", "in", "germinal", "center", "(", "gc", ")", "b", "cells", "and", "required", "for", "gc", "formation", "." ]
[ "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "To", "determine", "whether", "BCL-6", "mutations", "represent", "a", "tumor-associated", "phenomenon", "or", "reflect", "a", "physiologic", "mechanism", ",", "we", "screened", "single", "human", "tonsillar", "GC", "B", "cells", "for", "mutations", "occurring", "in", "the", "BCL-6", "5'-noncoding", "region", "and", "in", "the", "Ig", "variable", "heavy", "chain", "sequences", "." ]
[ "to", "determine", "whether", "bcl-6", "mutations", "represent", "a", "tumor-associated", "phenomenon", "or", "reflect", "a", "physiologic", "mechanism", ",", "we", "screened", "single", "human", "tonsillar", "gc", "b", "cells", "for", "mutations", "occurring", "in", "the", "bcl-6", "5'-noncoding", "region", "and", "in", "the", "ig", "variable", "heavy", "chain", "sequences", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "Thirty", "percent", "of", "GC", "B", "cells", ",", "but", "not", "naive", "B", "cells", ",", "displayed", "mutations", "in", "the", "742", "bp", "region", "analyzed", "within", "the", "first", "intron", "of", "BCL-6", "(", "overall", "frequency", ":", "5", "x", "10", "(", "-4", ")", "/bp", ")", "." ]
[ "thirty", "percent", "of", "gc", "b", "cells", ",", "but", "not", "naive", "b", "cells", ",", "displayed", "mutations", "in", "the", "742", "bp", "region", "analyzed", "within", "the", "first", "intron", "of", "bcl-6", "(", "overall", "frequency", ":", "5", "x", "10", "(", "-4", ")", "/bp", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "an", "expanded", "survey", "in", "lymphoid", "malignancies", "showed", "that", "BCL-6", "mutations", "are", "restricted", "to", "B", "cell", "tumors", "displaying", "GC", "or", "post-GC", "phenotype", "and", "carrying", "mutated", "Ig", "variable", "heavy", "chain", "sequences", "." ]
[ "accordingly", ",", "an", "expanded", "survey", "in", "lymphoid", "malignancies", "showed", "that", "bcl-6", "mutations", "are", "restricted", "to", "b", "cell", "tumors", "displaying", "gc", "or", "post-gc", "phenotype", "and", "carrying", "mutated", "ig", "variable", "heavy", "chain", "sequences", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "the", "somatic", "hypermutation", "mechanism", "active", "in", "GC", "B", "cells", "physiologically", "targets", "non-Ig", "sequences", "." ]
[ "these", "results", "indicate", "that", "the", "somatic", "hypermutation", "mechanism", "active", "in", "gc", "b", "cells", "physiologically", "targets", "non-ig", "sequences", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "Unicellular-unilineage", "erythropoietic", "cultures", ":", "molecular", "analysis", "of", "regulatory", "gene", "expression", "at", "sibling", "cell", "level", "." ]
[ "unicellular-unilineage", "erythropoietic", "cultures", ":", "molecular", "analysis", "of", "regulatory", "gene", "expression", "at", "sibling", "cell", "level", "." ]
[ "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "In", "vitro", "studies", "on", "hematopoietic", "control", "mechanisms", "have", "been", "hampered", "by", "the", "heterogeneity", "of", "the", "analyzed", "cell", "populations", ",", "ie", ",", "lack", "of", "lineage", "specificity", "and", "developmental", "stage", "homogeneity", "of", "progenitor/precursor", "cells", "growing", "in", "culture", "." ]
[ "in", "vitro", "studies", "on", "hematopoietic", "control", "mechanisms", "have", "been", "hampered", "by", "the", "heterogeneity", "of", "the", "analyzed", "cell", "populations", ",", "ie", ",", "lack", "of", "lineage", "specificity", "and", "developmental", "stage", "homogeneity", "of", "progenitor/precursor", "cells", "growing", "in", "culture", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "developed", "unicellular", "culture", "systems", "for", "unilineage", "differentiation", "of", "purified", "hematopoietic", "progenitor", "cells", "followed", "by", "daughter", "cell", "analysis", "at", "cellular", "and", "molecular", "level", "." ]
[ "we", "developed", "unicellular", "culture", "systems", "for", "unilineage", "differentiation", "of", "purified", "hematopoietic", "progenitor", "cells", "followed", "by", "daughter", "cell", "analysis", "at", "cellular", "and", "molecular", "level", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "culture", "system", "reported", "here", ",", "(", "1", ")", "the", "growth", "factor", "(", "GF", ")", "stimulus", "induces", "cord", "blood", "(", "CB", ")", "progenitor", "cells", "to", "proliferate", "and", "differentiate/mature", "exclusively", "along", "the", "erythroid", "lineage", ";", "(", "2", ")", "this", "erythropoietic", "wave", "is", "characterized", "by", "less", "than", "4%", "apoptotic", "cells", ";", "(", "3", ")", "asymmetric", "divisions", "are", "virtually", "absent", ",", "ie", ",", "nonresponsive", "hematopoietic", "progenitors", "with", "no", "erythropoietic", "potential", "are", "forced", "into", "apoptosis", ";", "(", "4", ")", "the", "system", "is", "cell", "division", "controlled", "(", "cdc", ")", ",", "ie", ",", "the", "number", "of", "divisions", "performed", "by", "each", "cell", "is", "monitored", "." ]
[ "in", "the", "culture", "system", "reported", "here", ",", "(", "1", ")", "the", "growth", "factor", "(", "gf", ")", "stimulus", "induces", "cord", "blood", "(", "cb", ")", "progenitor", "cells", "to", "proliferate", "and", "differentiate/mature", "exclusively", "along", "the", "erythroid", "lineage", ";", "(", "2", ")", "this", "erythropoietic", "wave", "is", "characterized", "by", "less", "than", "4%", "apoptotic", "cells", ";", "(", "3", ")", "asymmetric", "divisions", "are", "virtually", "absent", ",", "ie", ",", "nonresponsive", "hematopoietic", "progenitors", "with", "no", "erythropoietic", "potential", "are", "forced", "into", "apoptosis", ";", "(", "4", ")", "the", "system", "is", "cell", "division", "controlled", "(", "cdc", ")", ",", "ie", ",", "the", "number", "of", "divisions", "performed", "by", "each", "cell", "is", "monitored", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Single-cell", "reverse", "transcriptase", "-polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT-PCR", ")", "analysis", "was", "applied", "to", "this", "culture", "system", "to", "investigate", "gene", "expression", "of", "diverse", "receptors", ",", "markers", "of", "differentiation", ",", "and", "transcription", "factors", "(", "EKLF", ",", "GATA-1", ",", "GATA-2", ",", "p45", "NF-E2", ",", "PU", ".", "1", ",", "and", "SCL/Tal1", ")", "at", "discrete", "stages", "of", "erythropoietic", "development", "." ]
[ "single-cell", "reverse", "transcriptase", "-polymerase", "chain", "reaction", "(", "rt-pcr", ")", "analysis", "was", "applied", "to", "this", "culture", "system", "to", "investigate", "gene", "expression", "of", "diverse", "receptors", ",", "markers", "of", "differentiation", ",", "and", "transcription", "factors", "(", "eklf", ",", "gata-1", ",", "gata-2", ",", "p45", "nf-e2", ",", "pu", ".", "1", ",", "and", "scl/tal1", ")", "at", "discrete", "stages", "of", "erythropoietic", "development", "." ]
[ "B-other_name", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Freshly", "isolated", "CD34", "(", "+", ")", "cells", "expressed", "CD34", ",", "c-kit", ",", "PU", ".", "1", ",", "and", "GATA-2", "but", "did", "not", "express", "CD36", ",", "erythropoietin", "receptor", "(", "EpoR", ")", ",", "SCL/Tal1", ",", "EKLF", ",", "NF-E2", ",", "GATA-1", ",", "or", "glyocophorin", "A", "(", "GPA", ")", "." ]
[ "freshly", "isolated", "cd34", "(", "+", ")", "cells", "expressed", "cd34", ",", "c-kit", ",", "pu", ".", "1", ",", "and", "gata-2", "but", "did", "not", "express", "cd36", ",", "erythropoietin", "receptor", "(", "epor", ")", ",", "scl/tal1", ",", "eklf", ",", "nf-e2", ",", "gata-1", ",", "or", "glyocophorin", "a", "(", "gpa", ")", "." ]
[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "In", "early", "to", "intermediate", "stages", "of", "erythroid", "differentiation", "we", "monitored", "the", "induction", "of", "CD36", ",", "Tal1", ",", "EKLF", ",", "NF-E2", ",", "and", "GATA-1", "that", "preceeded", "expression", "of", "EpoR", "." ]
[ "in", "early", "to", "intermediate", "stages", "of", "erythroid", "differentiation", "we", "monitored", "the", "induction", "of", "cd36", ",", "tal1", ",", "eklf", ",", "nf-e2", ",", "and", "gata-1", "that", "preceeded", "expression", "of", "epor", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]
[ "In", "late", "stages", "of", "erythroid", "maturation", ",", "GPA", "was", "upregulated", ",", "whereas", "CD34", ",", "c-kit", ",", "PU", ".", "1", ",", "and", "GATA-2", "were", "barely", "or", "not", "detected", "." ]
[ "in", "late", "stages", "of", "erythroid", "maturation", ",", "gpa", "was", "upregulated", ",", "whereas", "cd34", ",", "c-kit", ",", "pu", ".", "1", ",", "and", "gata-2", "were", "barely", "or", "not", "detected", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "competitive", "single-cell", "RT-PCR", "was", "used", "to", "assay", "CD34", "mRNA", "transcripts", "in", "sibling", "CD34", "(", "+", ")", "CD38", "(", "-", ")", "cells", "differentiating", "in", "unilineage", "erythroid", "cultures", ":", "this", "analysis", "allowed", "us", "to", "semiquantitate", "the", "gradual", "downmodulation", "of", "CD34", "mRNA", "from", "progenitor", "cells", "through", "their", "differentiating", "erythroid", "progeny", "." ]
[ "in", "addition", ",", "competitive", "single-cell", "rt-pcr", "was", "used", "to", "assay", "cd34", "mrna", "transcripts", "in", "sibling", "cd34", "(", "+", ")", "cd38", "(", "-", ")", "cells", "differentiating", "in", "unilineage", "erythroid", "cultures", ":", "this", "analysis", "allowed", "us", "to", "semiquantitate", "the", "gradual", "downmodulation", "of", "cd34", "mrna", "from", "progenitor", "cells", "through", "their", "differentiating", "erythroid", "progeny", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_line", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]
[ "It", "is", "concluded", "that", "this", "novel", "culture", "system", ",", "coupled", "with", "single-cell", "RT-PCR", "analysis", ",", "may", "eliminate", "the", "ambiguities", "intrinsic", "to", "molecular", "studies", "on", "heterogeneous", "populations", "of", "hematopoietic", "progenitors", "/precursors", "growing", "in", "culture", ",", "particularly", "in", "the", "initial", "stages", "of", "development", "." ]
[ "it", "is", "concluded", "that", "this", "novel", "culture", "system", ",", "coupled", "with", "single-cell", "rt-pcr", "analysis", ",", "may", "eliminate", "the", "ambiguities", "intrinsic", "to", "molecular", "studies", "on", "heterogeneous", "populations", "of", "hematopoietic", "progenitors", "/precursors", "growing", "in", "culture", ",", "particularly", "in", "the", "initial", "stages", "of", "development", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glucocorticoid-induced", "apoptosis", "of", "lymphoid", "cells", "." ]
[ "glucocorticoid-induced", "apoptosis", "of", "lymphoid", "cells", "." ]
[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "The", "induction", "of", "cell", "death", "in", "lymphoid", "cells", "by", "glucocorticoids", "is", "one", "of", "the", "earliest", "and", "most", "thoroughly", "studied", "models", "of", "apoptosis", "." ]
[ "the", "induction", "of", "cell", "death", "in", "lymphoid", "cells", "by", "glucocorticoids", "is", "one", "of", "the", "earliest", "and", "most", "thoroughly", "studied", "models", "of", "apoptosis", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "Although", "the", "exact", "mechanism", "by", "which", "apoptosis", "occurs", "in", "lymphocytes", "is", "unknown", "many", "biochemical", "and", "molecular", "changes", "have", "been", "shown", "to", "occur", "in", "these", "cells", "in", "response", "to", "glucocorticoids", "." ]
[ "although", "the", "exact", "mechanism", "by", "which", "apoptosis", "occurs", "in", "lymphocytes", "is", "unknown", "many", "biochemical", "and", "molecular", "changes", "have", "been", "shown", "to", "occur", "in", "these", "cells", "in", "response", "to", "glucocorticoids", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]
[ "The", "role", "of", "chromatin", "degradation", "and", "endonucleases", "in", "the", "apoptotic", "process", "has", "been", "closely", "studied", ",", "as", "well", "as", "the", "involvement", "of", "several", "oncogenes", "in", "glucocorticoid", "-induced", "cell", "lysis", "." ]
[ "the", "role", "of", "chromatin", "degradation", "and", "endonucleases", "in", "the", "apoptotic", "process", "has", "been", "closely", "studied", ",", "as", "well", "as", "the", "involvement", "of", "several", "oncogenes", "in", "glucocorticoid", "-induced", "cell", "lysis", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "clinical", "importance", "of", "glucocorticoid", "-induced", "apoptosis", "in", "the", "treatment", "of", "lymphoid", "neoplasms", "has", "recently", "received", "increased", "attention", "." ]
[ "in", "addition", ",", "the", "clinical", "importance", "of", "glucocorticoid", "-induced", "apoptosis", "in", "the", "treatment", "of", "lymphoid", "neoplasms", "has", "recently", "received", "increased", "attention", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interferon-gamma-induced", "factor", "binding", "to", "the", "interleukin-4", "-responsive", "element", "of", "CD23b", "promoter", "in", "human", "tonsillar", "mononuclear", "cells", ":", "role", "in", "transient", "up-regulation", "of", "the", "interleukin-4", "-induced", "CD23b", "mRNA", "." ]
[ "interferon-gamma-induced", "factor", "binding", "to", "the", "interleukin-4", "-responsive", "element", "of", "cd23b", "promoter", "in", "human", "tonsillar", "mononuclear", "cells", ":", "role", "in", "transient", "up-regulation", "of", "the", "interleukin-4", "-induced", "cd23b", "mrna", "." ]
[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O" ]
[ "Stimulation", "of", "human", "tonsillar", "mononuclear", "cells", "with", "interleukin-4", "(", "IL-4", ")", "and", "interferon-gamma", "(", "IFN-gamma", ")", "rapidly", "induced", "the", "activation", "of", "distinct", "nuclear", "factors", "with", "different", "mobilities", ",", "both", "of", "which", "bind", "the", "IL-4", "response", "element", "(", "IL-4RE", ")", "of", "CD23b", "promoter", "as", "examined", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "(", "EMSA", ")", "." ]
[ "stimulation", "of", "human", "tonsillar", "mononuclear", "cells", "with", "interleukin-4", "(", "il-4", ")", "and", "interferon-gamma", "(", "ifn-gamma", ")", "rapidly", "induced", "the", "activation", "of", "distinct", "nuclear", "factors", "with", "different", "mobilities", ",", "both", "of", "which", "bind", "the", "il-4", "response", "element", "(", "il-4re", ")", "of", "cd23b", "promoter", "as", "examined", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "(", "emsa", ")", "." ]
[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O" ]
[ "Co-treatment", "of", "IL-4", "and", "IFN-gamma", "induced", ",", "in", "addition", "to", "the", "two", "distinct", "complexes", ",", "a", "new", "complex", "with", "an", "intermediate", "mobility", "." ]
[ "co-treatment", "of", "il-4", "and", "ifn-gamma", "induced", ",", "in", "addition", "to", "the", "two", "distinct", "complexes", ",", "a", "new", "complex", "with", "an", "intermediate", "mobility", "." ]
[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "The", "IL-4", "-induced", "complex", "reacted", "with", "anti-", "STAT", "(", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", ")", "6", ",", "resulting", "in", "a", "supershift", "whereas", "the", "formation", "of", "the", "IFN-gamma", "-induced", "complex", "was", "inhibited", "by", "anti-", "STAT", "1", "." ]
[ "the", "il-4", "-induced", "complex", "reacted", "with", "anti-", "stat", "(", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", ")", "6", ",", "resulting", "in", "a", "supershift", "whereas", "the", "formation", "of", "the", "ifn-gamma", "-induced", "complex", "was", "inhibited", "by", "anti-", "stat", "1", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "The", "intermediate", "complex", "appeared", "to", "react", "with", "both", "anti-", "STAT", "6", "and", "anti-", "STAT", "1", "." ]
[ "the", "intermediate", "complex", "appeared", "to", "react", "with", "both", "anti-", "stat", "6", "and", "anti-", "stat", "1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "Although", "IFN-gamma", "alone", "did", "not", "induce", "CD23", "mRNA", "transcription", ",", "Northern", "blot", "analysis", "revealed", "a", "transient", "up-regulation", "of", "the", "IL-4", "-induced", "CD23", "mRNA", "by", "IFN-gamma", "within", "2", "h", "of", "IFN-gamma", "treatment", "in", "these", "tonsillar", "cells", "." ]
[ "although", "ifn-gamma", "alone", "did", "not", "induce", "cd23", "mrna", "transcription", ",", "northern", "blot", "analysis", "revealed", "a", "transient", "up-regulation", "of", "the", "il-4", "-induced", "cd23", "mrna", "by", "ifn-gamma", "within", "2", "h", "of", "ifn-gamma", "treatment", "in", "these", "tonsillar", "cells", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "The", "results", "suggest", "that", "the", "IL-4RE", "of", "the", "IL-4", "-inducible", "gene", "can", "accommodate", "both", "IL-4-", "and", "IFN-gamma-", "activated", "factors", ",", "such", "as", "STAT", "6", "and", "STAT", "1", ",", "either", "in", "homodimeric", "or", "heterodimeric", "forms", "and", "the", "binding", "of", "these", "different", "proteins", "to", "the", "respective", "promoter", "may", "play", "a", "potential", "regulatory", "role", "in", "the", "IL-4", "-inducible", "gene", "expression", "." ]
[ "the", "results", "suggest", "that", "the", "il-4re", "of", "the", "il-4", "-inducible", "gene", "can", "accommodate", "both", "il-4-", "and", "ifn-gamma-", "activated", "factors", ",", "such", "as", "stat", "6", "and", "stat", "1", ",", "either", "in", "homodimeric", "or", "heterodimeric", "forms", "and", "the", "binding", "of", "these", "different", "proteins", "to", "the", "respective", "promoter", "may", "play", "a", "potential", "regulatory", "role", "in", "the", "il-4", "-inducible", "gene", "expression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "thiol", "antioxidant", "regulates", "IgE", "isotype", "switching", "by", "inhibiting", "activation", "of", "nuclear", "factor-kappaB", "." ]
[ "a", "thiol", "antioxidant", "regulates", "ige", "isotype", "switching", "by", "inhibiting", "activation", "of", "nuclear", "factor-kappab", "." ]
[ "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]
[ "The", "binding", "site", "for", "nuclear", "factor-kappaB", "(", "NF-kappaB", ")", "is", "present", "at", "the", "promoter", "region", "of", "the", "germline", "Cepsilon", "gene", ",", "but", "there", "is", "little", "information", "on", "whether", "this", "factor", "is", "involved", "in", "regulating", "IgE", "synthesis", "by", "human", "B", "cells", "." ]
[ "the", "binding", "site", "for", "nuclear", "factor-kappab", "(", "nf-kappab", ")", "is", "present", "at", "the", "promoter", "region", "of", "the", "germline", "cepsilon", "gene", ",", "but", "there", "is", "little", "information", "on", "whether", "this", "factor", "is", "involved", "in", "regulating", "ige", "synthesis", "by", "human", "b", "cells", "." ]
[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "we", "studied", "the", "role", "of", "NF-kappaB", "in", "germline", "Cepsilon", "transcription", "by", "using", "two", "human", "Burkitt's", "lymphoma", "B", "cell", "lines", ",", "DND39", "and", "DG75", "." ]
[ "accordingly", ",", "we", "studied", "the", "role", "of", "nf-kappab", "in", "germline", "cepsilon", "transcription", "by", "using", "two", "human", "burkitt's", "lymphoma", "b", "cell", "lines", ",", "dnd39", "and", "dg75", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_line", "O", "B-cell_line", "O" ]
[ "In", "both", "cell", "lines", ",", "n-acetyl-L-cysteine", "(", "NAC", ")", ",", "a", "potent", "thiol", "antioxidant", ",", "inhibited", "the", "triggering", "of", "the", "nuclear", "expression", "of", "NF-kappaB", "by", "IL-4", "and", "by", "anti-CD40", "monoclonal", "antibody", "." ]
[ "in", "both", "cell", "lines", ",", "n-acetyl-l-cysteine", "(", "nac", ")", ",", "a", "potent", "thiol", "antioxidant", ",", "inhibited", "the", "triggering", "of", "the", "nuclear", "expression", "of", "nf-kappab", "by", "il-4", "and", "by", "anti-cd40", "monoclonal", "antibody", "." ]
[ "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "Although", "IL-4", "activated", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "STAT", ")", "6", "in", "addition", "to", "NF-kappaB", ",", "NAC", "treatment", "or", "the", "transfection", "of", "decoy", "oligodeoxynucleotides", "for", "NF-kappaB", "or", "STAT6", "only", "partly", "blocked", "IL-4", "-induced", "germline", "Cepsilon", "transcription", "." ]
[ "although", "il-4", "activated", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "stat", ")", "6", "in", "addition", "to", "nf-kappab", ",", "nac", "treatment", "or", "the", "transfection", "of", "decoy", "oligodeoxynucleotides", "for", "nf-kappab", "or", "stat6", "only", "partly", "blocked", "il-4", "-induced", "germline", "cepsilon", "transcription", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "these", "two", "decoy", "oligodeoxynucleotides", "together", "almost", "completely", "abrogated", "IL-4", "-induced", "germline", "Cepsilon", "transcription", "." ]
[ "however", ",", "these", "two", "decoy", "oligodeoxynucleotides", "together", "almost", "completely", "abrogated", "il-4", "-induced", "germline", "cepsilon", "transcription", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "note", ",", "CD40", "-mediated", "enhancement", "of", "IL-4", "-driven", "germline", "Cepsilon", "transcription", "was", "markedly", "decreased", "by", "NAC", "or", "by", "a", "decoy", "oligodeoxynucleotide", "for", "NF-kappaB", "." ]
[ "of", "note", ",", "cd40", "-mediated", "enhancement", "of", "il-4", "-driven", "germline", "cepsilon", "transcription", "was", "markedly", "decreased", "by", "nac", "or", "by", "a", "decoy", "oligodeoxynucleotide", "for", "nf-kappab", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "B-protein_complex", "O" ]
[ "The", "effect", "of", "NAC", "was", "also", "examined", "on", "deletional", "switch", "recombination", "underlying", "the", "isotype", "switch", "to", "IgE", "." ]
[ "the", "effect", "of", "nac", "was", "also", "examined", "on", "deletional", "switch", "recombination", "underlying", "the", "isotype", "switch", "to", "ige", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]
[ "NAC", "inhibited", "the", "generation", "of", "Smu/Sepsilon", "switch", "fragments", "in", "normal", "human", "B", "cells", "costimulated", "with", "IL-4", "and", "anti-CD40", "monoclonal", "antibody", "." ]
[ "nac", "inhibited", "the", "generation", "of", "smu/sepsilon", "switch", "fragments", "in", "normal", "human", "b", "cells", "costimulated", "with", "il-4", "and", "anti-cd40", "monoclonal", "antibody", "." ]
[ "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "It", "also", "abolished", "IL-4", "-induced", "upregulation", "of", "CD40", "but", "promoted", "upregulation", "of", "CD23", "." ]
[ "it", "also", "abolished", "il-4", "-induced", "upregulation", "of", "cd40", "but", "promoted", "upregulation", "of", "cd23", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "coordination", "of", "NF-kappaB", "and", "STAT6", "may", "be", "required", "for", "induction", "of", "germline", "Cepsilon", "transcription", "by", "IL-4", ",", "and", "that", "CD40", "-mediated", "NF-kappaB", "activation", "may", "be", "important", "in", "regulating", "both", "enhancement", "of", "germline", "Cepsilon", "transcription", "and", "class", "switching", "to", "IgE", "." ]
[ "these", "results", "suggest", "that", "coordination", "of", "nf-kappab", "and", "stat6", "may", "be", "required", "for", "induction", "of", "germline", "cepsilon", "transcription", "by", "il-4", ",", "and", "that", "cd40", "-mediated", "nf-kappab", "activation", "may", "be", "important", "in", "regulating", "both", "enhancement", "of", "germline", "cepsilon", "transcription", "and", "class", "switching", "to", "ige", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]
[ "Glucocorticoid", "receptors", "in", "mononuclear", "cells", "of", "patients", "with", "sepsis", "." ]
[ "glucocorticoid", "receptors", "in", "mononuclear", "cells", "of", "patients", "with", "sepsis", "." ]
[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "Glucocorticoid", "receptor", "(", "GR", ")", "hormone-binding", "activity", "was", "studied", "by", "a", "whole-cell", "method", "in", "mononuclear", "cells", "(", "MNC", ")", "from", "peripheral", "blood", "of", "7", "patients", "during", "the", "hemodynamic", "compensatory", "phase", "of", "sepsis", "." ]
[ "glucocorticoid", "receptor", "(", "gr", ")", "hormone-binding", "activity", "was", "studied", "by", "a", "whole-cell", "method", "in", "mononuclear", "cells", "(", "mnc", ")", "from", "peripheral", "blood", "of", "7", "patients", "during", "the", "hemodynamic", "compensatory", "phase", "of", "sepsis", "." ]
[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "4", "patients", "were", "receiving", "dopamine", ",", "which", "did", "not", "affect", "the", "GR", "count", "." ]
[ "4", "patients", "were", "receiving", "dopamine", ",", "which", "did", "not", "affect", "the", "gr", "count", "." ]
[ "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]
[ "The", "patients", "'", "plasma", "cortisol", "concentrations", "were", "normal", "or", "slightly", "elevated", "." ]
[ "the", "patients", "'", "plasma", "cortisol", "concentrations", "were", "normal", "or", "slightly", "elevated", "." ]
[ "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "a", "wide", "range", ",", "the", "mean", "GR", "count", "and", "affinity", "in", "MNC", "from", "septic", "patients", "did", "not", "differ", "from", "those", "in", "normal", "controls", ",", "suggesting", "that", "glucocorticoids", "could", "still", "be", "effective", "in", "the", "hemodynamic", "compensatory", "phase", "of", "sepsis", "." ]
[ "despite", "a", "wide", "range", ",", "the", "mean", "gr", "count", "and", "affinity", "in", "mnc", "from", "septic", "patients", "did", "not", "differ", "from", "those", "in", "normal", "controls", ",", "suggesting", "that", "glucocorticoids", "could", "still", "be", "effective", "in", "the", "hemodynamic", "compensatory", "phase", "of", "sepsis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O" ]
[ "IL-2", "and", "IL-7", "induce", "heterodimerization", "of", "STAT5", "isoforms", "in", "human", "peripheral", "blood", "T", "lymphoblasts", "." ]
[ "il-2", "and", "il-7", "induce", "heterodimerization", "of", "stat5", "isoforms", "in", "human", "peripheral", "blood", "t", "lymphoblasts", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Despite", "differences", "in", "T", "cell", "responses", "induced", "by", "interleukin", "(", "IL", ")", "-2", "and", "IL-7", ",", "both", "cytokines", "modulate", "T", "cell", "functions", "by", "activation", "of", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "STAT", ")", "proteins", "." ]
[ "despite", "differences", "in", "t", "cell", "responses", "induced", "by", "interleukin", "(", "il", ")", "-2", "and", "il-7", ",", "both", "cytokines", "modulate", "t", "cell", "functions", "by", "activation", "of", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "stat", ")", "proteins", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "We", "examined", "the", "contribution", "of", "the", "two", "isoforms", "of", "STAT5", ",", "STAT5A", "and", "STAT5B", ",", "to", "IL-2-", "and", "IL-7-", "induced", "activation", "of", "human", "peripheral", "blood", "T", "lymphoblasts", "." ]
[ "we", "examined", "the", "contribution", "of", "the", "two", "isoforms", "of", "stat5", ",", "stat5a", "and", "stat5b", ",", "to", "il-2-", "and", "il-7-", "induced", "activation", "of", "human", "peripheral", "blood", "t", "lymphoblasts", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Both", "cytokines", "induced", "assembly", "of", "STAT5A", "and", "STAT5B", "containing", "complexes", "capable", "of", "binding", "to", "the", "interferon-gamma", "activation", "sequence", "(", "GAS", ")", ",", "and", "these", "complexes", "rapidly", "translocated", "(", "within", "1", "min", ")", "into", "the", "nucleus", "of", "IL-2-", "or", "IL-7-", "treated", "cells", "." ]
[ "both", "cytokines", "induced", "assembly", "of", "stat5a", "and", "stat5b", "containing", "complexes", "capable", "of", "binding", "to", "the", "interferon-gamma", "activation", "sequence", "(", "gas", ")", ",", "and", "these", "complexes", "rapidly", "translocated", "(", "within", "1", "min", ")", "into", "the", "nucleus", "of", "il-2-", "or", "il-7-", "treated", "cells", "." ]
[ "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "kinetics", "of", "this", "translocation", "were", "delayed", "in", "IL-7", "-treated", "as", "compared", "to", "IL-2", "-treated", "cells", "." ]
[ "the", "kinetics", "of", "this", "translocation", "were", "delayed", "in", "il-7", "-treated", "as", "compared", "to", "il-2", "-treated", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]
[ "IL-2", "and", "IL-7", "were", "equivalent", "in", "their", "ability", "to", "induce", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "STAT5A", "and", "STAT5B", "and", "to", "facilitate", "binding", "of", "these", "STATs", "to", "an", "immobilized", "GAS", "element", "." ]
[ "il-2", "and", "il-7", "were", "equivalent", "in", "their", "ability", "to", "induce", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "stat5a", "and", "stat5b", "and", "to", "facilitate", "binding", "of", "these", "stats", "to", "an", "immobilized", "gas", "element", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "Both", "IL-2", "and", "IL-7", "induced", "substantial", "amounts", "of", "STAT5A", "/STAT5B", "heterodimerization", "." ]
[ "both", "il-2", "and", "il-7", "induced", "substantial", "amounts", "of", "stat5a", "/stat5b", "heterodimerization", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_molecule", "B-other_name", "O" ]
[ "Moreover", ",", "we", "observed", "constitutive", "association", "of", "STAT3", "with", "each", "STAT5", "isomer", "." ]
[ "moreover", ",", "we", "observed", "constitutive", "association", "of", "stat3", "with", "each", "stat5", "isomer", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]
[ "These", "data", "suggest", "that", "IL-2", "and", "IL-7", "induce", "assembly", "of", "STAT", "heterodimers", "in", "a", "similar", "manner", "and", "that", "subsequent", "cellular", "responses", "may", "be", "driven", "by", "induction", "of", "similar", "sets", "of", "genes", "." ]
[ "these", "data", "suggest", "that", "il-2", "and", "il-7", "induce", "assembly", "of", "stat", "heterodimers", "in", "a", "similar", "manner", "and", "that", "subsequent", "cellular", "responses", "may", "be", "driven", "by", "induction", "of", "similar", "sets", "of", "genes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]
[ "Costimulation", "of", "peripheral", "blood", "T", "cell", "activation", "by", "human", "endothelial", "cells", "." ]
[ "costimulation", "of", "peripheral", "blood", "t", "cell", "activation", "by", "human", "endothelial", "cells", "." ]
[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]
[ "Enhanced", "IL-2", "transcription", "correlates", "with", "increased", "c-fos", "synthesis", "and", "increased", "Fos", "content", "of", "AP-1", "." ]
[ "enhanced", "il-2", "transcription", "correlates", "with", "increased", "c-fos", "synthesis", "and", "increased", "fos", "content", "of", "ap-1", "." ]
[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Endothelial", "cells", "(", "EC", ")", "act", "as", "APC", "for", "resting", "PBL", "in", "vitro", ",", "and", "may", "have", "important", "roles", "in", "vivo", "in", "the", "pathogenesis", "of", "allograft", "rejection", "and", "delayed", "hypersensitivity", "." ]
[ "endothelial", "cells", "(", "ec", ")", "act", "as", "apc", "for", "resting", "pbl", "in", "vitro", ",", "and", "may", "have", "important", "roles", "in", "vivo", "in", "the", "pathogenesis", "of", "allograft", "rejection", "and", "delayed", "hypersensitivity", "." ]
[ "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "We", "previously", "reported", "that", "human", "umbilical", "vein", "EC", "provide", "costimulatory", "signals", "to", "PHA-stimulated", "PBL", "via", "CD2", ":", "lymphocyte", "function-associated", "Ag-3", "and", "an", "unidentified", "ligand", "pair", ",", "resulting", "in", "a", "three-", "to", "eight-fold", "enhancement", "of", "IL-2", "production", "." ]
[ "we", "previously", "reported", "that", "human", "umbilical", "vein", "ec", "provide", "costimulatory", "signals", "to", "pha-stimulated", "pbl", "via", "cd2", ":", "lymphocyte", "function-associated", "ag-3", "and", "an", "unidentified", "ligand", "pair", ",", "resulting", "in", "a", "three-", "to", "eight-fold", "enhancement", "of", "il-2", "production", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "The", "physiologic", "relevance", "of", "this", "increase", "was", "demonstrated", "by", "the", "proliferative", "advantage", "provided", "by", "EC", "to", "PBL", "suboptimally", "stimulated", "with", "mAb", "OKT3", "." ]
[ "the", "physiologic", "relevance", "of", "this", "increase", "was", "demonstrated", "by", "the", "proliferative", "advantage", "provided", "by", "ec", "to", "pbl", "suboptimally", "stimulated", "with", "mab", "okt3", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]
[ "We", "now", "report", "that", "EC", "costimulation", "causes", "increased", "levels", "of", "IL-2", "mRNA", "as", "a", "result", "of", "increased", "IL-2", "transcription", "in", "PBL", "." ]
[ "we", "now", "report", "that", "ec", "costimulation", "causes", "increased", "levels", "of", "il-2", "mrna", "as", "a", "result", "of", "increased", "il-2", "transcription", "in", "pbl", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]
[ "We", "therefore", "examined", "the", "effects", "of", "EC", "on", "T", "cell", "nuclear", "factors", "known", "to", "regulate", "IL-2", "transcription", ",", "including", "c-jun", "and", "c-fos-two", "components", "of", "the", "transcription", "factor", "AP-1", ",", "NFAT", ",", "and", "others", "." ]
[ "we", "therefore", "examined", "the", "effects", "of", "ec", "on", "t", "cell", "nuclear", "factors", "known", "to", "regulate", "il-2", "transcription", ",", "including", "c-jun", "and", "c-fos-two", "components", "of", "the", "transcription", "factor", "ap-1", ",", "nfat", ",", "and", "others", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PBL", "constitutively", "express", "c-jun", "transcripts", ",", "and", "the", "level", "of", "c-jun", "mRNA", "is", "not", "altered", "by", "PHA", "activation", "in", "the", "absence", "or", "presence", "of", "EC", "." ]
[ "pbl", "constitutively", "express", "c-jun", "transcripts", ",", "and", "the", "level", "of", "c-jun", "mrna", "is", "not", "altered", "by", "pha", "activation", "in", "the", "absence", "or", "presence", "of", "ec", "." ]
[ "B-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "c-fos", "mRNA", "is", "absent", "from", "resting", "T", "cells", "and", "is", "induced", "on", "PHA", "activation", "." ]
[ "in", "contrast", ",", "c-fos", "mrna", "is", "absent", "from", "resting", "t", "cells", "and", "is", "induced", "on", "pha", "activation", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "EC", "alone", "do", "not", "induce", "c-fos", "mRNA", "but", "augment", "the", "level", "of", "c-fos", "mRNA", "in", "PHA-activated", "T", "cells", "by", "3-", "to", "10-fold", "." ]
[ "ec", "alone", "do", "not", "induce", "c-fos", "mrna", "but", "augment", "the", "level", "of", "c-fos", "mrna", "in", "pha-activated", "t", "cells", "by", "3-", "to", "10-fold", "." ]
[ "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_molecule", "I-RNA_molecule", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "effect", "is", "largely", "independent", "of", "the", "CD2", ":", "lymphocyte", "function-associated", "Ag-3", "pathway", "." ]
[ "this", "effect", "is", "largely", "independent", "of", "the", "cd2", ":", "lymphocyte", "function-associated", "ag-3", "pathway", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]
[ "Gel-shift", "analysis", "reveals", "the", "constitutive", "presence", "of", "nuclear", "factors", "in", "resting", "PBL", "that", "bind", "to", "the", "proximal", "AP-1", "site", "of", "the", "IL-2", "promoter", "and", "that", "contain", "immunoreactive", "c-Jun", "but", "not", "c-Fos", "protein", "." ]
[ "gel-shift", "analysis", "reveals", "the", "constitutive", "presence", "of", "nuclear", "factors", "in", "resting", "pbl", "that", "bind", "to", "the", "proximal", "ap-1", "site", "of", "the", "il-2", "promoter", "and", "that", "contain", "immunoreactive", "c-jun", "but", "not", "c-fos", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "AP-1", "from", "PHA-activated", "cells", "contains", "c-Jun", "and", "low", "levels", "of", "c-Fos", "." ]
[ "in", "contrast", ",", "ap-1", "from", "pha-activated", "cells", "contains", "c-jun", "and", "low", "levels", "of", "c-fos", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Strikingly", ",", "costimulation", "with", "EC", "results", "in", "a", "dramatic", "increase", "(", "up", "to", "15-fold", ")", "in", "the", "c-Fos", "content", "of", "AP-1", "." ]
[ "strikingly", ",", "costimulation", "with", "ec", "results", "in", "a", "dramatic", "increase", "(", "up", "to", "15-fold", ")", "in", "the", "c-fos", "content", "of", "ap-1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]
[ "Levels", "of", "other", "nuclear", "factors", "involved", "in", "IL-2", "regulation", "were", "not", "altered", "by", "EC", ",", "although", "NFAT-DNA", "complexes", "migrated", "at", "a", "slightly", "different", "mobility", "." ]
[ "levels", "of", "other", "nuclear", "factors", "involved", "in", "il-2", "regulation", "were", "not", "altered", "by", "ec", ",", "although", "nfat-dna", "complexes", "migrated", "at", "a", "slightly", "different", "mobility", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "our", "data", "suggest", "that", "changes", "in", "the", "composition", "of", "transcription", "factor", "AP-1", "is", "a", "key", "molecular", "mechanism", "for", "increasing", "IL-2", "transcription", "and", "may", "underlie", "the", "phenomenon", "of", "costimulation", "by", "EC", "." ]
[ "in", "summary", ",", "our", "data", "suggest", "that", "changes", "in", "the", "composition", "of", "transcription", "factor", "ap-1", "is", "a", "key", "molecular", "mechanism", "for", "increasing", "il-2", "transcription", "and", "may", "underlie", "the", "phenomenon", "of", "costimulation", "by", "ec", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]
[ "Mouse", "interleukin-2", "receptor", "alpha", "gene", "expression", "." ]
[ "mouse", "interleukin-2", "receptor", "alpha", "gene", "expression", "." ]
[ "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interleukin-1", "and", "interleukin-2", "control", "transcription", "via", "distinct", "cis-acting", "elements", "." ]
[ "interleukin-1", "and", "interleukin-2", "control", "transcription", "via", "distinct", "cis-acting", "elements", "." ]
[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]
[ "We", "have", "shown", "that", "interleukin-1", "(", "IL-1", ")", "and", "IL-2", "control", "IL-2", "receptor", "alpha", "(", "IL-2R", "alpha", ")", "gene", "transcription", "in", "CD4-CD8-", "murine", "T", "lymphocyte", "precursors", "." ]
[ "we", "have", "shown", "that", "interleukin-1", "(", "il-1", ")", "and", "il-2", "control", "il-2", "receptor", "alpha", "(", "il-2r", "alpha", ")", "gene", "transcription", "in", "cd4-cd8-", "murine", "t", "lymphocyte", "precursors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]
[ "Here", "we", "map", "the", "cis-acting", "elements", "that", "mediate", "interleukin", "responsiveness", "of", "the", "mouse", "IL-2R", "alpha", "gene", "using", "a", "thymic", "lymphoma-derived", "hybridoma", "(", "PC60", ")", "." ]
[ "here", "we", "map", "the", "cis-acting", "elements", "that", "mediate", "interleukin", "responsiveness", "of", "the", "mouse", "il-2r", "alpha", "gene", "using", "a", "thymic", "lymphoma-derived", "hybridoma", "(", "pc60", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_line", "O", "O" ]
[ "The", "transcriptional", "response", "of", "the", "IL-2R", "alpha", "gene", "to", "stimulation", "by", "IL-1", "+", "IL-2", "is", "biphasic", "." ]
[ "the", "transcriptional", "response", "of", "the", "il-2r", "alpha", "gene", "to", "stimulation", "by", "il-1", "+", "il-2", "is", "biphasic", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]