tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Effects",
"of",
"diesel",
"organic",
"extracts",
"on",
"chemokine",
"production",
"by",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"."
] | [
"effects",
"of",
"diesel",
"organic",
"extracts",
"on",
"chemokine",
"production",
"by",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"BACKGROUND",
":",
"Polyaromatic",
"hydrocarbons",
"(",
"PAHs",
")",
"associated",
"with",
"diesel",
"exhaust",
"particles",
"(",
"DEPs",
")",
"are",
"found",
"in",
"the",
"atmospheric",
"urban",
"pollution",
"."
] | [
"background",
":",
"polyaromatic",
"hydrocarbons",
"(",
"pahs",
")",
"associated",
"with",
"diesel",
"exhaust",
"particles",
"(",
"deps",
")",
"are",
"found",
"in",
"the",
"atmospheric",
"urban",
"pollution",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"Such",
"compounds",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"favor",
"IgE",
"production",
",",
"bronchial",
"hyperresponsiveness",
",",
"and",
"airway",
"inflammation",
"."
] | [
"such",
"compounds",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"favor",
"ige",
"production",
",",
"bronchial",
"hyperresponsiveness",
",",
"and",
"airway",
"inflammation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Chemokines",
"are",
"a",
"group",
"of",
"chemotactic",
"cytokines",
"involved",
"in",
"the",
"recruitment",
"of",
"inflammatory",
"cells",
"."
] | [
"chemokines",
"are",
"a",
"group",
"of",
"chemotactic",
"cytokines",
"involved",
"in",
"the",
"recruitment",
"of",
"inflammatory",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"OBJECTIVE",
":",
"We",
"investigated",
"the",
"effect",
"of",
"DEP-",
"PAHs",
"on",
"the",
"release",
"and",
"mRNA",
"expression",
"of",
"IL-8",
",",
"MCP-1",
",",
"and",
"RANTES",
"by",
"PBMCs",
"obtained",
"from",
"healthy",
"subjects",
"."
] | [
"objective",
":",
"we",
"investigated",
"the",
"effect",
"of",
"dep-",
"pahs",
"on",
"the",
"release",
"and",
"mrna",
"expression",
"of",
"il-8",
",",
"mcp-1",
",",
"and",
"rantes",
"by",
"pbmcs",
"obtained",
"from",
"healthy",
"subjects",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"METHODS",
":",
"Protein",
"production",
"in",
"supernatants",
"was",
"assessed",
"by",
"ELISA",
",",
"and",
"mRNA",
"expression",
"was",
"evaluated",
"by",
"semiquantitative",
"RT-",
"PCR",
"."
] | [
"methods",
":",
"protein",
"production",
"in",
"supernatants",
"was",
"assessed",
"by",
"elisa",
",",
"and",
"mrna",
"expression",
"was",
"evaluated",
"by",
"semiquantitative",
"rt-",
"pcr",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"RESULTS",
":",
"Secretion",
"of",
"IL-8",
"and",
"RANTES",
"increased",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"with",
"increasing",
"concentrations",
"of",
"DEP-",
"PAHs",
"(",
"range",
",",
"0",
".",
"5",
"ng",
"to",
"50",
"ng/mL",
")",
"."
] | [
"results",
":",
"secretion",
"of",
"il-8",
"and",
"rantes",
"increased",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"with",
"increasing",
"concentrations",
"of",
"dep-",
"pahs",
"(",
"range",
",",
"0",
".",
"5",
"ng",
"to",
"50",
"ng/ml",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"the",
"contrary",
",",
"the",
"release",
"of",
"MCP-1",
"was",
"significantly",
"inhibited",
",",
"also",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"on",
"the",
"contrary",
",",
"the",
"release",
"of",
"mcp-1",
"was",
"significantly",
"inhibited",
",",
"also",
"in",
"a",
"dose-dependent",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Messenger",
"RNA",
"production",
"coding",
"for",
"IL-8",
",",
"RANTES",
",",
"and",
"MCP-1",
"showed",
"parallel",
"variations",
"to",
"the",
"production",
"of",
"the",
"correspondent",
"proteins",
"."
] | [
"messenger",
"rna",
"production",
"coding",
"for",
"il-8",
",",
"rantes",
",",
"and",
"mcp-1",
"showed",
"parallel",
"variations",
"to",
"the",
"production",
"of",
"the",
"correspondent",
"proteins",
"."
] | [
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Effects",
"of",
"DEP-",
"PAHs",
"became",
"significant",
"at",
"7",
"hours",
"and",
"up",
"to",
"48",
"hours",
"time",
"culture",
"for",
"MCP-1",
",",
"and",
"up",
"to",
"24",
"hours",
"time",
"culture",
"for",
"IL-8",
"and",
"RANTES",
"."
] | [
"effects",
"of",
"dep-",
"pahs",
"became",
"significant",
"at",
"7",
"hours",
"and",
"up",
"to",
"48",
"hours",
"time",
"culture",
"for",
"mcp-1",
",",
"and",
"up",
"to",
"24",
"hours",
"time",
"culture",
"for",
"il-8",
"and",
"rantes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"supernatants",
"from",
"DEP-PAH-activated",
"cells",
",",
"compared",
"with",
"those",
"of",
"controls",
",",
"exhibited",
"a",
"significantly",
"enhanced",
"chemotactic",
"activity",
"for",
"neutrophils",
"and",
"eosinophils",
",",
"which",
"was",
"significantly",
"inhibited",
"by",
"pretreatment",
"with",
"anti-",
"IL-8",
"and",
"anti-",
"RANTES",
"neutralizing",
"antibodies",
",",
"respectively",
"."
] | [
"moreover",
",",
"supernatants",
"from",
"dep-pah-activated",
"cells",
",",
"compared",
"with",
"those",
"of",
"controls",
",",
"exhibited",
"a",
"significantly",
"enhanced",
"chemotactic",
"activity",
"for",
"neutrophils",
"and",
"eosinophils",
",",
"which",
"was",
"significantly",
"inhibited",
"by",
"pretreatment",
"with",
"anti-",
"il-8",
"and",
"anti-",
"rantes",
"neutralizing",
"antibodies",
",",
"respectively",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CONCLUSION",
":",
"These",
"findings",
"suggest",
"that",
"the",
"chemokine",
"pathways",
"are",
"modulated",
"by",
"DEP-",
"PAHs",
"at",
"the",
"transcriptional",
"level",
",",
"reinforcing",
"the",
"idea",
"that",
"the",
"development",
"of",
"inflammatory",
"reactions",
"might",
"be",
"affected",
"by",
"diesel",
"exhaust",
"emission",
"."
] | [
"conclusion",
":",
"these",
"findings",
"suggest",
"that",
"the",
"chemokine",
"pathways",
"are",
"modulated",
"by",
"dep-",
"pahs",
"at",
"the",
"transcriptional",
"level",
",",
"reinforcing",
"the",
"idea",
"that",
"the",
"development",
"of",
"inflammatory",
"reactions",
"might",
"be",
"affected",
"by",
"diesel",
"exhaust",
"emission",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Highly",
"polarized",
"HLA",
"class",
"II",
"antigen",
"processing",
"and",
"presentation",
"by",
"human",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
"."
] | [
"highly",
"polarized",
"hla",
"class",
"ii",
"antigen",
"processing",
"and",
"presentation",
"by",
"human",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"high",
"concentration",
"of",
"foreign",
"antigen",
"in",
"the",
"lumen",
"of",
"the",
"gastrointestinal",
"tract",
"is",
"separated",
"from",
"the",
"underlying",
"lymphocytes",
"by",
"a",
"single",
"cell",
"layer",
"of",
"polarized",
"epithelium",
"."
] | [
"the",
"high",
"concentration",
"of",
"foreign",
"antigen",
"in",
"the",
"lumen",
"of",
"the",
"gastrointestinal",
"tract",
"is",
"separated",
"from",
"the",
"underlying",
"lymphocytes",
"by",
"a",
"single",
"cell",
"layer",
"of",
"polarized",
"epithelium",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"Intestinal",
"epithelial",
"cells",
"can",
"express",
"HLA",
"class",
"II",
"antigens",
"and",
"may",
"function",
"as",
"antigen-presenting",
"cells",
"to",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"T",
"cells",
"within",
"the",
"intestinal",
"mucosa",
"."
] | [
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
"can",
"express",
"hla",
"class",
"ii",
"antigens",
"and",
"may",
"function",
"as",
"antigen-presenting",
"cells",
"to",
"cd4",
"(",
"+",
")",
"t",
"cells",
"within",
"the",
"intestinal",
"mucosa",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"Using",
"tetanus",
"toxoid",
"specific",
"and",
"HLA-DR-restricted",
"T",
"lymphocytes",
",",
"we",
"show",
"that",
"polarized",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
"directed",
"to",
"express",
"HLA-DR",
"molecules",
"are",
"able",
"to",
"initiate",
"class",
"II",
"processing",
"only",
"after",
"internalization",
"of",
"antigen",
"from",
"their",
"apical",
"surface",
"."
] | [
"using",
"tetanus",
"toxoid",
"specific",
"and",
"hla-dr-restricted",
"t",
"lymphocytes",
",",
"we",
"show",
"that",
"polarized",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
"directed",
"to",
"express",
"hla-dr",
"molecules",
"are",
"able",
"to",
"initiate",
"class",
"ii",
"processing",
"only",
"after",
"internalization",
"of",
"antigen",
"from",
"their",
"apical",
"surface",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Coexpression",
"of",
"the",
"class",
"II",
"transactivator",
"CIITA",
"in",
"these",
"cells",
",",
"which",
"stimulates",
"highly",
"efficient",
"class",
"II",
"processing",
"without",
"the",
"characteristic",
"decline",
"in",
"barrier",
"function",
"seen",
"in",
"polarized",
"monolayers",
"treated",
"with",
"the",
"proinflammatory",
"cytokine",
"gamma-IFN",
",",
"facilitates",
"antigen",
"processing",
"from",
"the",
"basolateral",
"surface",
"."
] | [
"coexpression",
"of",
"the",
"class",
"ii",
"transactivator",
"ciita",
"in",
"these",
"cells",
",",
"which",
"stimulates",
"highly",
"efficient",
"class",
"ii",
"processing",
"without",
"the",
"characteristic",
"decline",
"in",
"barrier",
"function",
"seen",
"in",
"polarized",
"monolayers",
"treated",
"with",
"the",
"proinflammatory",
"cytokine",
"gamma-ifn",
",",
"facilitates",
"antigen",
"processing",
"from",
"the",
"basolateral",
"surface",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"In",
"both",
"cases",
",",
"peptide",
"presentation",
"to",
"T",
"cells",
"via",
"class",
"II",
"molecules",
"was",
"restricted",
"to",
"the",
"basolateral",
"surface",
"."
] | [
"in",
"both",
"cases",
",",
"peptide",
"presentation",
"to",
"t",
"cells",
"via",
"class",
"ii",
"molecules",
"was",
"restricted",
"to",
"the",
"basolateral",
"surface",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"indicate",
"a",
"highly",
"polarized",
"functional",
"architecture",
"for",
"antigen",
"processing",
"and",
"presentation",
"by",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
",",
"and",
"suggest",
"that",
"the",
"functional",
"outcome",
"of",
"antigen",
"processing",
"by",
"the",
"intestinal",
"epithelium",
"is",
"both",
"dependent",
"on",
"the",
"cellular",
"surface",
"at",
"which",
"the",
"foreign",
"antigen",
"is",
"internalized",
"and",
"by",
"the",
"underlying",
"degree",
"of",
"mucosal",
"inflammation"
] | [
"these",
"data",
"indicate",
"a",
"highly",
"polarized",
"functional",
"architecture",
"for",
"antigen",
"processing",
"and",
"presentation",
"by",
"intestinal",
"epithelial",
"cells",
",",
"and",
"suggest",
"that",
"the",
"functional",
"outcome",
"of",
"antigen",
"processing",
"by",
"the",
"intestinal",
"epithelium",
"is",
"both",
"dependent",
"on",
"the",
"cellular",
"surface",
"at",
"which",
"the",
"foreign",
"antigen",
"is",
"internalized",
"and",
"by",
"the",
"underlying",
"degree",
"of",
"mucosal",
"inflammation"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name"
] |
[
"A",
"novel",
"transcription",
"factor",
"regulates",
"expression",
"of",
"the",
"vacuolar",
"H+-ATPase",
"B2",
"subunit",
"through",
"AP-2",
"sites",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"a",
"novel",
"transcription",
"factor",
"regulates",
"expression",
"of",
"the",
"vacuolar",
"h+-atpase",
"b2",
"subunit",
"through",
"ap-2",
"sites",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"During",
"monocyte-to-macrophage",
"differentiation",
",",
"the",
"cellular",
"content",
"of",
"vacuolar",
"H+-ATPase",
"(",
"V-ATPase",
")",
"increases",
"more",
"than",
"4-fold",
"."
] | [
"during",
"monocyte-to-macrophage",
"differentiation",
",",
"the",
"cellular",
"content",
"of",
"vacuolar",
"h+-atpase",
"(",
"v-atpase",
")",
"increases",
"more",
"than",
"4-fold",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"shown",
"previously",
"that",
"amplified",
"expression",
"of",
"the",
"B2",
"subunit",
"of",
"the",
"V-ATPase",
"occurs",
"solely",
"by",
"increased",
"transcription",
",",
"and",
"that",
"the",
"5'-untranslated",
"region",
"of",
"the",
"B2",
"gene",
",",
"containing",
"multiple",
"consensus",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factors",
"AP-2",
"and",
"Sp1",
",",
"is",
"required",
"for",
"this",
"expression",
"."
] | [
"we",
"have",
"shown",
"previously",
"that",
"amplified",
"expression",
"of",
"the",
"b2",
"subunit",
"of",
"the",
"v-atpase",
"occurs",
"solely",
"by",
"increased",
"transcription",
",",
"and",
"that",
"the",
"5'-untranslated",
"region",
"of",
"the",
"b2",
"gene",
",",
"containing",
"multiple",
"consensus",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factors",
"ap-2",
"and",
"sp1",
",",
"is",
"required",
"for",
"this",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"study",
"demonstrates",
"that",
"AP-2",
"binding",
"sequences",
"are",
"essential",
"for",
"increased",
"transcription",
"from",
"the",
"B2",
"promoter",
"during",
"monocyte-macrophage",
"differentiation",
"and",
"that",
"AP-2",
",",
"expressed",
"exogenously",
"in",
"THP-1",
"and",
"other",
"cells",
",",
"activates",
"transcription",
"from",
"the",
"B2",
"promoter",
"."
] | [
"the",
"present",
"study",
"demonstrates",
"that",
"ap-2",
"binding",
"sequences",
"are",
"essential",
"for",
"increased",
"transcription",
"from",
"the",
"b2",
"promoter",
"during",
"monocyte-macrophage",
"differentiation",
"and",
"that",
"ap-2",
",",
"expressed",
"exogenously",
"in",
"thp-1",
"and",
"other",
"cells",
",",
"activates",
"transcription",
"from",
"the",
"b2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"mobility",
"shift",
"assays",
",",
"a",
"nuclear",
"factor",
"from",
"THP-1",
"and",
"U-937",
"cells",
"was",
"identified",
"that",
"binds",
"to",
"several",
"AP-2",
"response",
"elements",
"within",
"the",
"B2",
"promoter",
",",
"but",
"does",
"not",
"react",
"with",
"AP-2",
"antibodies",
",",
"and",
"has",
"a",
"DNA",
"sequence",
"binding",
"affinity",
"profile",
"that",
"differs",
"from",
"AP-2",
"."
] | [
"in",
"mobility",
"shift",
"assays",
",",
"a",
"nuclear",
"factor",
"from",
"thp-1",
"and",
"u-937",
"cells",
"was",
"identified",
"that",
"binds",
"to",
"several",
"ap-2",
"response",
"elements",
"within",
"the",
"b2",
"promoter",
",",
"but",
"does",
"not",
"react",
"with",
"ap-2",
"antibodies",
",",
"and",
"has",
"a",
"dna",
"sequence",
"binding",
"affinity",
"profile",
"that",
"differs",
"from",
"ap-2",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"suggest",
"that",
"a",
"novel",
"AP-2",
"-like",
"transcription",
"factor",
"is",
"responsible",
"for",
"V-ATPase",
"B",
"subunit",
"amplification",
"during",
"monocyte",
"differentiation",
"."
] | [
"these",
"findings",
"suggest",
"that",
"a",
"novel",
"ap-2",
"-like",
"transcription",
"factor",
"is",
"responsible",
"for",
"v-atpase",
"b",
"subunit",
"amplification",
"during",
"monocyte",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"BCL-6",
"mutations",
"in",
"normal",
"germinal",
"center",
"B",
"cells",
":",
"evidence",
"of",
"somatic",
"hypermutation",
"acting",
"outside",
"Ig",
"loci",
"."
] | [
"bcl-6",
"mutations",
"in",
"normal",
"germinal",
"center",
"b",
"cells",
":",
"evidence",
"of",
"somatic",
"hypermutation",
"acting",
"outside",
"ig",
"loci",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"mechanism",
"involved",
"in",
"the",
"process",
"of",
"antigen-driven",
"somatic",
"hypermutation",
"of",
"Ig",
"genes",
"is",
"unknown",
",",
"but",
"it",
"is",
"commonly",
"believed",
"that",
"this",
"mechanism",
"is",
"restricted",
"to",
"the",
"Ig",
"loci",
"."
] | [
"the",
"molecular",
"mechanism",
"involved",
"in",
"the",
"process",
"of",
"antigen-driven",
"somatic",
"hypermutation",
"of",
"ig",
"genes",
"is",
"unknown",
",",
"but",
"it",
"is",
"commonly",
"believed",
"that",
"this",
"mechanism",
"is",
"restricted",
"to",
"the",
"ig",
"loci",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"B",
"cell",
"lymphomas",
"commonly",
"display",
"multiple",
"somatic",
"mutations",
"clustering",
"in",
"the",
"5'-regulatory",
"region",
"of",
"BCL-6",
",",
"a",
"proto-oncogene",
"encoding",
"for",
"a",
"POZ/Zinc",
"finger",
"transcriptional",
"repressor",
"expressed",
"in",
"germinal",
"center",
"(",
"GC",
")",
"B",
"cells",
"and",
"required",
"for",
"GC",
"formation",
"."
] | [
"b",
"cell",
"lymphomas",
"commonly",
"display",
"multiple",
"somatic",
"mutations",
"clustering",
"in",
"the",
"5'-regulatory",
"region",
"of",
"bcl-6",
",",
"a",
"proto-oncogene",
"encoding",
"for",
"a",
"poz/zinc",
"finger",
"transcriptional",
"repressor",
"expressed",
"in",
"germinal",
"center",
"(",
"gc",
")",
"b",
"cells",
"and",
"required",
"for",
"gc",
"formation",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"To",
"determine",
"whether",
"BCL-6",
"mutations",
"represent",
"a",
"tumor-associated",
"phenomenon",
"or",
"reflect",
"a",
"physiologic",
"mechanism",
",",
"we",
"screened",
"single",
"human",
"tonsillar",
"GC",
"B",
"cells",
"for",
"mutations",
"occurring",
"in",
"the",
"BCL-6",
"5'-noncoding",
"region",
"and",
"in",
"the",
"Ig",
"variable",
"heavy",
"chain",
"sequences",
"."
] | [
"to",
"determine",
"whether",
"bcl-6",
"mutations",
"represent",
"a",
"tumor-associated",
"phenomenon",
"or",
"reflect",
"a",
"physiologic",
"mechanism",
",",
"we",
"screened",
"single",
"human",
"tonsillar",
"gc",
"b",
"cells",
"for",
"mutations",
"occurring",
"in",
"the",
"bcl-6",
"5'-noncoding",
"region",
"and",
"in",
"the",
"ig",
"variable",
"heavy",
"chain",
"sequences",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Thirty",
"percent",
"of",
"GC",
"B",
"cells",
",",
"but",
"not",
"naive",
"B",
"cells",
",",
"displayed",
"mutations",
"in",
"the",
"742",
"bp",
"region",
"analyzed",
"within",
"the",
"first",
"intron",
"of",
"BCL-6",
"(",
"overall",
"frequency",
":",
"5",
"x",
"10",
"(",
"-4",
")",
"/bp",
")",
"."
] | [
"thirty",
"percent",
"of",
"gc",
"b",
"cells",
",",
"but",
"not",
"naive",
"b",
"cells",
",",
"displayed",
"mutations",
"in",
"the",
"742",
"bp",
"region",
"analyzed",
"within",
"the",
"first",
"intron",
"of",
"bcl-6",
"(",
"overall",
"frequency",
":",
"5",
"x",
"10",
"(",
"-4",
")",
"/bp",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Accordingly",
",",
"an",
"expanded",
"survey",
"in",
"lymphoid",
"malignancies",
"showed",
"that",
"BCL-6",
"mutations",
"are",
"restricted",
"to",
"B",
"cell",
"tumors",
"displaying",
"GC",
"or",
"post-GC",
"phenotype",
"and",
"carrying",
"mutated",
"Ig",
"variable",
"heavy",
"chain",
"sequences",
"."
] | [
"accordingly",
",",
"an",
"expanded",
"survey",
"in",
"lymphoid",
"malignancies",
"showed",
"that",
"bcl-6",
"mutations",
"are",
"restricted",
"to",
"b",
"cell",
"tumors",
"displaying",
"gc",
"or",
"post-gc",
"phenotype",
"and",
"carrying",
"mutated",
"ig",
"variable",
"heavy",
"chain",
"sequences",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"I-tissue",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"somatic",
"hypermutation",
"mechanism",
"active",
"in",
"GC",
"B",
"cells",
"physiologically",
"targets",
"non-Ig",
"sequences",
"."
] | [
"these",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"somatic",
"hypermutation",
"mechanism",
"active",
"in",
"gc",
"b",
"cells",
"physiologically",
"targets",
"non-ig",
"sequences",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Unicellular-unilineage",
"erythropoietic",
"cultures",
":",
"molecular",
"analysis",
"of",
"regulatory",
"gene",
"expression",
"at",
"sibling",
"cell",
"level",
"."
] | [
"unicellular-unilineage",
"erythropoietic",
"cultures",
":",
"molecular",
"analysis",
"of",
"regulatory",
"gene",
"expression",
"at",
"sibling",
"cell",
"level",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"vitro",
"studies",
"on",
"hematopoietic",
"control",
"mechanisms",
"have",
"been",
"hampered",
"by",
"the",
"heterogeneity",
"of",
"the",
"analyzed",
"cell",
"populations",
",",
"ie",
",",
"lack",
"of",
"lineage",
"specificity",
"and",
"developmental",
"stage",
"homogeneity",
"of",
"progenitor/precursor",
"cells",
"growing",
"in",
"culture",
"."
] | [
"in",
"vitro",
"studies",
"on",
"hematopoietic",
"control",
"mechanisms",
"have",
"been",
"hampered",
"by",
"the",
"heterogeneity",
"of",
"the",
"analyzed",
"cell",
"populations",
",",
"ie",
",",
"lack",
"of",
"lineage",
"specificity",
"and",
"developmental",
"stage",
"homogeneity",
"of",
"progenitor/precursor",
"cells",
"growing",
"in",
"culture",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"developed",
"unicellular",
"culture",
"systems",
"for",
"unilineage",
"differentiation",
"of",
"purified",
"hematopoietic",
"progenitor",
"cells",
"followed",
"by",
"daughter",
"cell",
"analysis",
"at",
"cellular",
"and",
"molecular",
"level",
"."
] | [
"we",
"developed",
"unicellular",
"culture",
"systems",
"for",
"unilineage",
"differentiation",
"of",
"purified",
"hematopoietic",
"progenitor",
"cells",
"followed",
"by",
"daughter",
"cell",
"analysis",
"at",
"cellular",
"and",
"molecular",
"level",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"culture",
"system",
"reported",
"here",
",",
"(",
"1",
")",
"the",
"growth",
"factor",
"(",
"GF",
")",
"stimulus",
"induces",
"cord",
"blood",
"(",
"CB",
")",
"progenitor",
"cells",
"to",
"proliferate",
"and",
"differentiate/mature",
"exclusively",
"along",
"the",
"erythroid",
"lineage",
";",
"(",
"2",
")",
"this",
"erythropoietic",
"wave",
"is",
"characterized",
"by",
"less",
"than",
"4%",
"apoptotic",
"cells",
";",
"(",
"3",
")",
"asymmetric",
"divisions",
"are",
"virtually",
"absent",
",",
"ie",
",",
"nonresponsive",
"hematopoietic",
"progenitors",
"with",
"no",
"erythropoietic",
"potential",
"are",
"forced",
"into",
"apoptosis",
";",
"(",
"4",
")",
"the",
"system",
"is",
"cell",
"division",
"controlled",
"(",
"cdc",
")",
",",
"ie",
",",
"the",
"number",
"of",
"divisions",
"performed",
"by",
"each",
"cell",
"is",
"monitored",
"."
] | [
"in",
"the",
"culture",
"system",
"reported",
"here",
",",
"(",
"1",
")",
"the",
"growth",
"factor",
"(",
"gf",
")",
"stimulus",
"induces",
"cord",
"blood",
"(",
"cb",
")",
"progenitor",
"cells",
"to",
"proliferate",
"and",
"differentiate/mature",
"exclusively",
"along",
"the",
"erythroid",
"lineage",
";",
"(",
"2",
")",
"this",
"erythropoietic",
"wave",
"is",
"characterized",
"by",
"less",
"than",
"4%",
"apoptotic",
"cells",
";",
"(",
"3",
")",
"asymmetric",
"divisions",
"are",
"virtually",
"absent",
",",
"ie",
",",
"nonresponsive",
"hematopoietic",
"progenitors",
"with",
"no",
"erythropoietic",
"potential",
"are",
"forced",
"into",
"apoptosis",
";",
"(",
"4",
")",
"the",
"system",
"is",
"cell",
"division",
"controlled",
"(",
"cdc",
")",
",",
"ie",
",",
"the",
"number",
"of",
"divisions",
"performed",
"by",
"each",
"cell",
"is",
"monitored",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Single-cell",
"reverse",
"transcriptase",
"-polymerase",
"chain",
"reaction",
"(",
"RT-PCR",
")",
"analysis",
"was",
"applied",
"to",
"this",
"culture",
"system",
"to",
"investigate",
"gene",
"expression",
"of",
"diverse",
"receptors",
",",
"markers",
"of",
"differentiation",
",",
"and",
"transcription",
"factors",
"(",
"EKLF",
",",
"GATA-1",
",",
"GATA-2",
",",
"p45",
"NF-E2",
",",
"PU",
".",
"1",
",",
"and",
"SCL/Tal1",
")",
"at",
"discrete",
"stages",
"of",
"erythropoietic",
"development",
"."
] | [
"single-cell",
"reverse",
"transcriptase",
"-polymerase",
"chain",
"reaction",
"(",
"rt-pcr",
")",
"analysis",
"was",
"applied",
"to",
"this",
"culture",
"system",
"to",
"investigate",
"gene",
"expression",
"of",
"diverse",
"receptors",
",",
"markers",
"of",
"differentiation",
",",
"and",
"transcription",
"factors",
"(",
"eklf",
",",
"gata-1",
",",
"gata-2",
",",
"p45",
"nf-e2",
",",
"pu",
".",
"1",
",",
"and",
"scl/tal1",
")",
"at",
"discrete",
"stages",
"of",
"erythropoietic",
"development",
"."
] | [
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Freshly",
"isolated",
"CD34",
"(",
"+",
")",
"cells",
"expressed",
"CD34",
",",
"c-kit",
",",
"PU",
".",
"1",
",",
"and",
"GATA-2",
"but",
"did",
"not",
"express",
"CD36",
",",
"erythropoietin",
"receptor",
"(",
"EpoR",
")",
",",
"SCL/Tal1",
",",
"EKLF",
",",
"NF-E2",
",",
"GATA-1",
",",
"or",
"glyocophorin",
"A",
"(",
"GPA",
")",
"."
] | [
"freshly",
"isolated",
"cd34",
"(",
"+",
")",
"cells",
"expressed",
"cd34",
",",
"c-kit",
",",
"pu",
".",
"1",
",",
"and",
"gata-2",
"but",
"did",
"not",
"express",
"cd36",
",",
"erythropoietin",
"receptor",
"(",
"epor",
")",
",",
"scl/tal1",
",",
"eklf",
",",
"nf-e2",
",",
"gata-1",
",",
"or",
"glyocophorin",
"a",
"(",
"gpa",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"early",
"to",
"intermediate",
"stages",
"of",
"erythroid",
"differentiation",
"we",
"monitored",
"the",
"induction",
"of",
"CD36",
",",
"Tal1",
",",
"EKLF",
",",
"NF-E2",
",",
"and",
"GATA-1",
"that",
"preceeded",
"expression",
"of",
"EpoR",
"."
] | [
"in",
"early",
"to",
"intermediate",
"stages",
"of",
"erythroid",
"differentiation",
"we",
"monitored",
"the",
"induction",
"of",
"cd36",
",",
"tal1",
",",
"eklf",
",",
"nf-e2",
",",
"and",
"gata-1",
"that",
"preceeded",
"expression",
"of",
"epor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"In",
"late",
"stages",
"of",
"erythroid",
"maturation",
",",
"GPA",
"was",
"upregulated",
",",
"whereas",
"CD34",
",",
"c-kit",
",",
"PU",
".",
"1",
",",
"and",
"GATA-2",
"were",
"barely",
"or",
"not",
"detected",
"."
] | [
"in",
"late",
"stages",
"of",
"erythroid",
"maturation",
",",
"gpa",
"was",
"upregulated",
",",
"whereas",
"cd34",
",",
"c-kit",
",",
"pu",
".",
"1",
",",
"and",
"gata-2",
"were",
"barely",
"or",
"not",
"detected",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"competitive",
"single-cell",
"RT-PCR",
"was",
"used",
"to",
"assay",
"CD34",
"mRNA",
"transcripts",
"in",
"sibling",
"CD34",
"(",
"+",
")",
"CD38",
"(",
"-",
")",
"cells",
"differentiating",
"in",
"unilineage",
"erythroid",
"cultures",
":",
"this",
"analysis",
"allowed",
"us",
"to",
"semiquantitate",
"the",
"gradual",
"downmodulation",
"of",
"CD34",
"mRNA",
"from",
"progenitor",
"cells",
"through",
"their",
"differentiating",
"erythroid",
"progeny",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"competitive",
"single-cell",
"rt-pcr",
"was",
"used",
"to",
"assay",
"cd34",
"mrna",
"transcripts",
"in",
"sibling",
"cd34",
"(",
"+",
")",
"cd38",
"(",
"-",
")",
"cells",
"differentiating",
"in",
"unilineage",
"erythroid",
"cultures",
":",
"this",
"analysis",
"allowed",
"us",
"to",
"semiquantitate",
"the",
"gradual",
"downmodulation",
"of",
"cd34",
"mrna",
"from",
"progenitor",
"cells",
"through",
"their",
"differentiating",
"erythroid",
"progeny",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"concluded",
"that",
"this",
"novel",
"culture",
"system",
",",
"coupled",
"with",
"single-cell",
"RT-PCR",
"analysis",
",",
"may",
"eliminate",
"the",
"ambiguities",
"intrinsic",
"to",
"molecular",
"studies",
"on",
"heterogeneous",
"populations",
"of",
"hematopoietic",
"progenitors",
"/precursors",
"growing",
"in",
"culture",
",",
"particularly",
"in",
"the",
"initial",
"stages",
"of",
"development",
"."
] | [
"it",
"is",
"concluded",
"that",
"this",
"novel",
"culture",
"system",
",",
"coupled",
"with",
"single-cell",
"rt-pcr",
"analysis",
",",
"may",
"eliminate",
"the",
"ambiguities",
"intrinsic",
"to",
"molecular",
"studies",
"on",
"heterogeneous",
"populations",
"of",
"hematopoietic",
"progenitors",
"/precursors",
"growing",
"in",
"culture",
",",
"particularly",
"in",
"the",
"initial",
"stages",
"of",
"development",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Glucocorticoid-induced",
"apoptosis",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"glucocorticoid-induced",
"apoptosis",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"induction",
"of",
"cell",
"death",
"in",
"lymphoid",
"cells",
"by",
"glucocorticoids",
"is",
"one",
"of",
"the",
"earliest",
"and",
"most",
"thoroughly",
"studied",
"models",
"of",
"apoptosis",
"."
] | [
"the",
"induction",
"of",
"cell",
"death",
"in",
"lymphoid",
"cells",
"by",
"glucocorticoids",
"is",
"one",
"of",
"the",
"earliest",
"and",
"most",
"thoroughly",
"studied",
"models",
"of",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Although",
"the",
"exact",
"mechanism",
"by",
"which",
"apoptosis",
"occurs",
"in",
"lymphocytes",
"is",
"unknown",
"many",
"biochemical",
"and",
"molecular",
"changes",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"occur",
"in",
"these",
"cells",
"in",
"response",
"to",
"glucocorticoids",
"."
] | [
"although",
"the",
"exact",
"mechanism",
"by",
"which",
"apoptosis",
"occurs",
"in",
"lymphocytes",
"is",
"unknown",
"many",
"biochemical",
"and",
"molecular",
"changes",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"occur",
"in",
"these",
"cells",
"in",
"response",
"to",
"glucocorticoids",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"The",
"role",
"of",
"chromatin",
"degradation",
"and",
"endonucleases",
"in",
"the",
"apoptotic",
"process",
"has",
"been",
"closely",
"studied",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"involvement",
"of",
"several",
"oncogenes",
"in",
"glucocorticoid",
"-induced",
"cell",
"lysis",
"."
] | [
"the",
"role",
"of",
"chromatin",
"degradation",
"and",
"endonucleases",
"in",
"the",
"apoptotic",
"process",
"has",
"been",
"closely",
"studied",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"involvement",
"of",
"several",
"oncogenes",
"in",
"glucocorticoid",
"-induced",
"cell",
"lysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"the",
"clinical",
"importance",
"of",
"glucocorticoid",
"-induced",
"apoptosis",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"lymphoid",
"neoplasms",
"has",
"recently",
"received",
"increased",
"attention",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"the",
"clinical",
"importance",
"of",
"glucocorticoid",
"-induced",
"apoptosis",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"lymphoid",
"neoplasms",
"has",
"recently",
"received",
"increased",
"attention",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interferon-gamma-induced",
"factor",
"binding",
"to",
"the",
"interleukin-4",
"-responsive",
"element",
"of",
"CD23b",
"promoter",
"in",
"human",
"tonsillar",
"mononuclear",
"cells",
":",
"role",
"in",
"transient",
"up-regulation",
"of",
"the",
"interleukin-4",
"-induced",
"CD23b",
"mRNA",
"."
] | [
"interferon-gamma-induced",
"factor",
"binding",
"to",
"the",
"interleukin-4",
"-responsive",
"element",
"of",
"cd23b",
"promoter",
"in",
"human",
"tonsillar",
"mononuclear",
"cells",
":",
"role",
"in",
"transient",
"up-regulation",
"of",
"the",
"interleukin-4",
"-induced",
"cd23b",
"mrna",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"of",
"human",
"tonsillar",
"mononuclear",
"cells",
"with",
"interleukin-4",
"(",
"IL-4",
")",
"and",
"interferon-gamma",
"(",
"IFN-gamma",
")",
"rapidly",
"induced",
"the",
"activation",
"of",
"distinct",
"nuclear",
"factors",
"with",
"different",
"mobilities",
",",
"both",
"of",
"which",
"bind",
"the",
"IL-4",
"response",
"element",
"(",
"IL-4RE",
")",
"of",
"CD23b",
"promoter",
"as",
"examined",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"(",
"EMSA",
")",
"."
] | [
"stimulation",
"of",
"human",
"tonsillar",
"mononuclear",
"cells",
"with",
"interleukin-4",
"(",
"il-4",
")",
"and",
"interferon-gamma",
"(",
"ifn-gamma",
")",
"rapidly",
"induced",
"the",
"activation",
"of",
"distinct",
"nuclear",
"factors",
"with",
"different",
"mobilities",
",",
"both",
"of",
"which",
"bind",
"the",
"il-4",
"response",
"element",
"(",
"il-4re",
")",
"of",
"cd23b",
"promoter",
"as",
"examined",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"(",
"emsa",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Co-treatment",
"of",
"IL-4",
"and",
"IFN-gamma",
"induced",
",",
"in",
"addition",
"to",
"the",
"two",
"distinct",
"complexes",
",",
"a",
"new",
"complex",
"with",
"an",
"intermediate",
"mobility",
"."
] | [
"co-treatment",
"of",
"il-4",
"and",
"ifn-gamma",
"induced",
",",
"in",
"addition",
"to",
"the",
"two",
"distinct",
"complexes",
",",
"a",
"new",
"complex",
"with",
"an",
"intermediate",
"mobility",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"IL-4",
"-induced",
"complex",
"reacted",
"with",
"anti-",
"STAT",
"(",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
")",
"6",
",",
"resulting",
"in",
"a",
"supershift",
"whereas",
"the",
"formation",
"of",
"the",
"IFN-gamma",
"-induced",
"complex",
"was",
"inhibited",
"by",
"anti-",
"STAT",
"1",
"."
] | [
"the",
"il-4",
"-induced",
"complex",
"reacted",
"with",
"anti-",
"stat",
"(",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
")",
"6",
",",
"resulting",
"in",
"a",
"supershift",
"whereas",
"the",
"formation",
"of",
"the",
"ifn-gamma",
"-induced",
"complex",
"was",
"inhibited",
"by",
"anti-",
"stat",
"1",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"intermediate",
"complex",
"appeared",
"to",
"react",
"with",
"both",
"anti-",
"STAT",
"6",
"and",
"anti-",
"STAT",
"1",
"."
] | [
"the",
"intermediate",
"complex",
"appeared",
"to",
"react",
"with",
"both",
"anti-",
"stat",
"6",
"and",
"anti-",
"stat",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Although",
"IFN-gamma",
"alone",
"did",
"not",
"induce",
"CD23",
"mRNA",
"transcription",
",",
"Northern",
"blot",
"analysis",
"revealed",
"a",
"transient",
"up-regulation",
"of",
"the",
"IL-4",
"-induced",
"CD23",
"mRNA",
"by",
"IFN-gamma",
"within",
"2",
"h",
"of",
"IFN-gamma",
"treatment",
"in",
"these",
"tonsillar",
"cells",
"."
] | [
"although",
"ifn-gamma",
"alone",
"did",
"not",
"induce",
"cd23",
"mrna",
"transcription",
",",
"northern",
"blot",
"analysis",
"revealed",
"a",
"transient",
"up-regulation",
"of",
"the",
"il-4",
"-induced",
"cd23",
"mrna",
"by",
"ifn-gamma",
"within",
"2",
"h",
"of",
"ifn-gamma",
"treatment",
"in",
"these",
"tonsillar",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"IL-4RE",
"of",
"the",
"IL-4",
"-inducible",
"gene",
"can",
"accommodate",
"both",
"IL-4-",
"and",
"IFN-gamma-",
"activated",
"factors",
",",
"such",
"as",
"STAT",
"6",
"and",
"STAT",
"1",
",",
"either",
"in",
"homodimeric",
"or",
"heterodimeric",
"forms",
"and",
"the",
"binding",
"of",
"these",
"different",
"proteins",
"to",
"the",
"respective",
"promoter",
"may",
"play",
"a",
"potential",
"regulatory",
"role",
"in",
"the",
"IL-4",
"-inducible",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"the",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"il-4re",
"of",
"the",
"il-4",
"-inducible",
"gene",
"can",
"accommodate",
"both",
"il-4-",
"and",
"ifn-gamma-",
"activated",
"factors",
",",
"such",
"as",
"stat",
"6",
"and",
"stat",
"1",
",",
"either",
"in",
"homodimeric",
"or",
"heterodimeric",
"forms",
"and",
"the",
"binding",
"of",
"these",
"different",
"proteins",
"to",
"the",
"respective",
"promoter",
"may",
"play",
"a",
"potential",
"regulatory",
"role",
"in",
"the",
"il-4",
"-inducible",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"thiol",
"antioxidant",
"regulates",
"IgE",
"isotype",
"switching",
"by",
"inhibiting",
"activation",
"of",
"nuclear",
"factor-kappaB",
"."
] | [
"a",
"thiol",
"antioxidant",
"regulates",
"ige",
"isotype",
"switching",
"by",
"inhibiting",
"activation",
"of",
"nuclear",
"factor-kappab",
"."
] | [
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"site",
"for",
"nuclear",
"factor-kappaB",
"(",
"NF-kappaB",
")",
"is",
"present",
"at",
"the",
"promoter",
"region",
"of",
"the",
"germline",
"Cepsilon",
"gene",
",",
"but",
"there",
"is",
"little",
"information",
"on",
"whether",
"this",
"factor",
"is",
"involved",
"in",
"regulating",
"IgE",
"synthesis",
"by",
"human",
"B",
"cells",
"."
] | [
"the",
"binding",
"site",
"for",
"nuclear",
"factor-kappab",
"(",
"nf-kappab",
")",
"is",
"present",
"at",
"the",
"promoter",
"region",
"of",
"the",
"germline",
"cepsilon",
"gene",
",",
"but",
"there",
"is",
"little",
"information",
"on",
"whether",
"this",
"factor",
"is",
"involved",
"in",
"regulating",
"ige",
"synthesis",
"by",
"human",
"b",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Accordingly",
",",
"we",
"studied",
"the",
"role",
"of",
"NF-kappaB",
"in",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"by",
"using",
"two",
"human",
"Burkitt's",
"lymphoma",
"B",
"cell",
"lines",
",",
"DND39",
"and",
"DG75",
"."
] | [
"accordingly",
",",
"we",
"studied",
"the",
"role",
"of",
"nf-kappab",
"in",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"by",
"using",
"two",
"human",
"burkitt's",
"lymphoma",
"b",
"cell",
"lines",
",",
"dnd39",
"and",
"dg75",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"both",
"cell",
"lines",
",",
"n-acetyl-L-cysteine",
"(",
"NAC",
")",
",",
"a",
"potent",
"thiol",
"antioxidant",
",",
"inhibited",
"the",
"triggering",
"of",
"the",
"nuclear",
"expression",
"of",
"NF-kappaB",
"by",
"IL-4",
"and",
"by",
"anti-CD40",
"monoclonal",
"antibody",
"."
] | [
"in",
"both",
"cell",
"lines",
",",
"n-acetyl-l-cysteine",
"(",
"nac",
")",
",",
"a",
"potent",
"thiol",
"antioxidant",
",",
"inhibited",
"the",
"triggering",
"of",
"the",
"nuclear",
"expression",
"of",
"nf-kappab",
"by",
"il-4",
"and",
"by",
"anti-cd40",
"monoclonal",
"antibody",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Although",
"IL-4",
"activated",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"STAT",
")",
"6",
"in",
"addition",
"to",
"NF-kappaB",
",",
"NAC",
"treatment",
"or",
"the",
"transfection",
"of",
"decoy",
"oligodeoxynucleotides",
"for",
"NF-kappaB",
"or",
"STAT6",
"only",
"partly",
"blocked",
"IL-4",
"-induced",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"."
] | [
"although",
"il-4",
"activated",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"stat",
")",
"6",
"in",
"addition",
"to",
"nf-kappab",
",",
"nac",
"treatment",
"or",
"the",
"transfection",
"of",
"decoy",
"oligodeoxynucleotides",
"for",
"nf-kappab",
"or",
"stat6",
"only",
"partly",
"blocked",
"il-4",
"-induced",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"these",
"two",
"decoy",
"oligodeoxynucleotides",
"together",
"almost",
"completely",
"abrogated",
"IL-4",
"-induced",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"."
] | [
"however",
",",
"these",
"two",
"decoy",
"oligodeoxynucleotides",
"together",
"almost",
"completely",
"abrogated",
"il-4",
"-induced",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Of",
"note",
",",
"CD40",
"-mediated",
"enhancement",
"of",
"IL-4",
"-driven",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"was",
"markedly",
"decreased",
"by",
"NAC",
"or",
"by",
"a",
"decoy",
"oligodeoxynucleotide",
"for",
"NF-kappaB",
"."
] | [
"of",
"note",
",",
"cd40",
"-mediated",
"enhancement",
"of",
"il-4",
"-driven",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"was",
"markedly",
"decreased",
"by",
"nac",
"or",
"by",
"a",
"decoy",
"oligodeoxynucleotide",
"for",
"nf-kappab",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"B-protein_complex",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"NAC",
"was",
"also",
"examined",
"on",
"deletional",
"switch",
"recombination",
"underlying",
"the",
"isotype",
"switch",
"to",
"IgE",
"."
] | [
"the",
"effect",
"of",
"nac",
"was",
"also",
"examined",
"on",
"deletional",
"switch",
"recombination",
"underlying",
"the",
"isotype",
"switch",
"to",
"ige",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"NAC",
"inhibited",
"the",
"generation",
"of",
"Smu/Sepsilon",
"switch",
"fragments",
"in",
"normal",
"human",
"B",
"cells",
"costimulated",
"with",
"IL-4",
"and",
"anti-CD40",
"monoclonal",
"antibody",
"."
] | [
"nac",
"inhibited",
"the",
"generation",
"of",
"smu/sepsilon",
"switch",
"fragments",
"in",
"normal",
"human",
"b",
"cells",
"costimulated",
"with",
"il-4",
"and",
"anti-cd40",
"monoclonal",
"antibody",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"It",
"also",
"abolished",
"IL-4",
"-induced",
"upregulation",
"of",
"CD40",
"but",
"promoted",
"upregulation",
"of",
"CD23",
"."
] | [
"it",
"also",
"abolished",
"il-4",
"-induced",
"upregulation",
"of",
"cd40",
"but",
"promoted",
"upregulation",
"of",
"cd23",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"coordination",
"of",
"NF-kappaB",
"and",
"STAT6",
"may",
"be",
"required",
"for",
"induction",
"of",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"by",
"IL-4",
",",
"and",
"that",
"CD40",
"-mediated",
"NF-kappaB",
"activation",
"may",
"be",
"important",
"in",
"regulating",
"both",
"enhancement",
"of",
"germline",
"Cepsilon",
"transcription",
"and",
"class",
"switching",
"to",
"IgE",
"."
] | [
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"coordination",
"of",
"nf-kappab",
"and",
"stat6",
"may",
"be",
"required",
"for",
"induction",
"of",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"by",
"il-4",
",",
"and",
"that",
"cd40",
"-mediated",
"nf-kappab",
"activation",
"may",
"be",
"important",
"in",
"regulating",
"both",
"enhancement",
"of",
"germline",
"cepsilon",
"transcription",
"and",
"class",
"switching",
"to",
"ige",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Glucocorticoid",
"receptors",
"in",
"mononuclear",
"cells",
"of",
"patients",
"with",
"sepsis",
"."
] | [
"glucocorticoid",
"receptors",
"in",
"mononuclear",
"cells",
"of",
"patients",
"with",
"sepsis",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Glucocorticoid",
"receptor",
"(",
"GR",
")",
"hormone-binding",
"activity",
"was",
"studied",
"by",
"a",
"whole-cell",
"method",
"in",
"mononuclear",
"cells",
"(",
"MNC",
")",
"from",
"peripheral",
"blood",
"of",
"7",
"patients",
"during",
"the",
"hemodynamic",
"compensatory",
"phase",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"glucocorticoid",
"receptor",
"(",
"gr",
")",
"hormone-binding",
"activity",
"was",
"studied",
"by",
"a",
"whole-cell",
"method",
"in",
"mononuclear",
"cells",
"(",
"mnc",
")",
"from",
"peripheral",
"blood",
"of",
"7",
"patients",
"during",
"the",
"hemodynamic",
"compensatory",
"phase",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"4",
"patients",
"were",
"receiving",
"dopamine",
",",
"which",
"did",
"not",
"affect",
"the",
"GR",
"count",
"."
] | [
"4",
"patients",
"were",
"receiving",
"dopamine",
",",
"which",
"did",
"not",
"affect",
"the",
"gr",
"count",
"."
] | [
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"patients",
"'",
"plasma",
"cortisol",
"concentrations",
"were",
"normal",
"or",
"slightly",
"elevated",
"."
] | [
"the",
"patients",
"'",
"plasma",
"cortisol",
"concentrations",
"were",
"normal",
"or",
"slightly",
"elevated",
"."
] | [
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Despite",
"a",
"wide",
"range",
",",
"the",
"mean",
"GR",
"count",
"and",
"affinity",
"in",
"MNC",
"from",
"septic",
"patients",
"did",
"not",
"differ",
"from",
"those",
"in",
"normal",
"controls",
",",
"suggesting",
"that",
"glucocorticoids",
"could",
"still",
"be",
"effective",
"in",
"the",
"hemodynamic",
"compensatory",
"phase",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"despite",
"a",
"wide",
"range",
",",
"the",
"mean",
"gr",
"count",
"and",
"affinity",
"in",
"mnc",
"from",
"septic",
"patients",
"did",
"not",
"differ",
"from",
"those",
"in",
"normal",
"controls",
",",
"suggesting",
"that",
"glucocorticoids",
"could",
"still",
"be",
"effective",
"in",
"the",
"hemodynamic",
"compensatory",
"phase",
"of",
"sepsis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"IL-2",
"and",
"IL-7",
"induce",
"heterodimerization",
"of",
"STAT5",
"isoforms",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphoblasts",
"."
] | [
"il-2",
"and",
"il-7",
"induce",
"heterodimerization",
"of",
"stat5",
"isoforms",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphoblasts",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Despite",
"differences",
"in",
"T",
"cell",
"responses",
"induced",
"by",
"interleukin",
"(",
"IL",
")",
"-2",
"and",
"IL-7",
",",
"both",
"cytokines",
"modulate",
"T",
"cell",
"functions",
"by",
"activation",
"of",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"STAT",
")",
"proteins",
"."
] | [
"despite",
"differences",
"in",
"t",
"cell",
"responses",
"induced",
"by",
"interleukin",
"(",
"il",
")",
"-2",
"and",
"il-7",
",",
"both",
"cytokines",
"modulate",
"t",
"cell",
"functions",
"by",
"activation",
"of",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"stat",
")",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"examined",
"the",
"contribution",
"of",
"the",
"two",
"isoforms",
"of",
"STAT5",
",",
"STAT5A",
"and",
"STAT5B",
",",
"to",
"IL-2-",
"and",
"IL-7-",
"induced",
"activation",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphoblasts",
"."
] | [
"we",
"examined",
"the",
"contribution",
"of",
"the",
"two",
"isoforms",
"of",
"stat5",
",",
"stat5a",
"and",
"stat5b",
",",
"to",
"il-2-",
"and",
"il-7-",
"induced",
"activation",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphoblasts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Both",
"cytokines",
"induced",
"assembly",
"of",
"STAT5A",
"and",
"STAT5B",
"containing",
"complexes",
"capable",
"of",
"binding",
"to",
"the",
"interferon-gamma",
"activation",
"sequence",
"(",
"GAS",
")",
",",
"and",
"these",
"complexes",
"rapidly",
"translocated",
"(",
"within",
"1",
"min",
")",
"into",
"the",
"nucleus",
"of",
"IL-2-",
"or",
"IL-7-",
"treated",
"cells",
"."
] | [
"both",
"cytokines",
"induced",
"assembly",
"of",
"stat5a",
"and",
"stat5b",
"containing",
"complexes",
"capable",
"of",
"binding",
"to",
"the",
"interferon-gamma",
"activation",
"sequence",
"(",
"gas",
")",
",",
"and",
"these",
"complexes",
"rapidly",
"translocated",
"(",
"within",
"1",
"min",
")",
"into",
"the",
"nucleus",
"of",
"il-2-",
"or",
"il-7-",
"treated",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"kinetics",
"of",
"this",
"translocation",
"were",
"delayed",
"in",
"IL-7",
"-treated",
"as",
"compared",
"to",
"IL-2",
"-treated",
"cells",
"."
] | [
"the",
"kinetics",
"of",
"this",
"translocation",
"were",
"delayed",
"in",
"il-7",
"-treated",
"as",
"compared",
"to",
"il-2",
"-treated",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-2",
"and",
"IL-7",
"were",
"equivalent",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"induce",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"STAT5A",
"and",
"STAT5B",
"and",
"to",
"facilitate",
"binding",
"of",
"these",
"STATs",
"to",
"an",
"immobilized",
"GAS",
"element",
"."
] | [
"il-2",
"and",
"il-7",
"were",
"equivalent",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"induce",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"stat5a",
"and",
"stat5b",
"and",
"to",
"facilitate",
"binding",
"of",
"these",
"stats",
"to",
"an",
"immobilized",
"gas",
"element",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Both",
"IL-2",
"and",
"IL-7",
"induced",
"substantial",
"amounts",
"of",
"STAT5A",
"/STAT5B",
"heterodimerization",
"."
] | [
"both",
"il-2",
"and",
"il-7",
"induced",
"substantial",
"amounts",
"of",
"stat5a",
"/stat5b",
"heterodimerization",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"we",
"observed",
"constitutive",
"association",
"of",
"STAT3",
"with",
"each",
"STAT5",
"isomer",
"."
] | [
"moreover",
",",
"we",
"observed",
"constitutive",
"association",
"of",
"stat3",
"with",
"each",
"stat5",
"isomer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"IL-2",
"and",
"IL-7",
"induce",
"assembly",
"of",
"STAT",
"heterodimers",
"in",
"a",
"similar",
"manner",
"and",
"that",
"subsequent",
"cellular",
"responses",
"may",
"be",
"driven",
"by",
"induction",
"of",
"similar",
"sets",
"of",
"genes",
"."
] | [
"these",
"data",
"suggest",
"that",
"il-2",
"and",
"il-7",
"induce",
"assembly",
"of",
"stat",
"heterodimers",
"in",
"a",
"similar",
"manner",
"and",
"that",
"subsequent",
"cellular",
"responses",
"may",
"be",
"driven",
"by",
"induction",
"of",
"similar",
"sets",
"of",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Costimulation",
"of",
"peripheral",
"blood",
"T",
"cell",
"activation",
"by",
"human",
"endothelial",
"cells",
"."
] | [
"costimulation",
"of",
"peripheral",
"blood",
"t",
"cell",
"activation",
"by",
"human",
"endothelial",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Enhanced",
"IL-2",
"transcription",
"correlates",
"with",
"increased",
"c-fos",
"synthesis",
"and",
"increased",
"Fos",
"content",
"of",
"AP-1",
"."
] | [
"enhanced",
"il-2",
"transcription",
"correlates",
"with",
"increased",
"c-fos",
"synthesis",
"and",
"increased",
"fos",
"content",
"of",
"ap-1",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Endothelial",
"cells",
"(",
"EC",
")",
"act",
"as",
"APC",
"for",
"resting",
"PBL",
"in",
"vitro",
",",
"and",
"may",
"have",
"important",
"roles",
"in",
"vivo",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"allograft",
"rejection",
"and",
"delayed",
"hypersensitivity",
"."
] | [
"endothelial",
"cells",
"(",
"ec",
")",
"act",
"as",
"apc",
"for",
"resting",
"pbl",
"in",
"vitro",
",",
"and",
"may",
"have",
"important",
"roles",
"in",
"vivo",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"allograft",
"rejection",
"and",
"delayed",
"hypersensitivity",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"previously",
"reported",
"that",
"human",
"umbilical",
"vein",
"EC",
"provide",
"costimulatory",
"signals",
"to",
"PHA-stimulated",
"PBL",
"via",
"CD2",
":",
"lymphocyte",
"function-associated",
"Ag-3",
"and",
"an",
"unidentified",
"ligand",
"pair",
",",
"resulting",
"in",
"a",
"three-",
"to",
"eight-fold",
"enhancement",
"of",
"IL-2",
"production",
"."
] | [
"we",
"previously",
"reported",
"that",
"human",
"umbilical",
"vein",
"ec",
"provide",
"costimulatory",
"signals",
"to",
"pha-stimulated",
"pbl",
"via",
"cd2",
":",
"lymphocyte",
"function-associated",
"ag-3",
"and",
"an",
"unidentified",
"ligand",
"pair",
",",
"resulting",
"in",
"a",
"three-",
"to",
"eight-fold",
"enhancement",
"of",
"il-2",
"production",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"physiologic",
"relevance",
"of",
"this",
"increase",
"was",
"demonstrated",
"by",
"the",
"proliferative",
"advantage",
"provided",
"by",
"EC",
"to",
"PBL",
"suboptimally",
"stimulated",
"with",
"mAb",
"OKT3",
"."
] | [
"the",
"physiologic",
"relevance",
"of",
"this",
"increase",
"was",
"demonstrated",
"by",
"the",
"proliferative",
"advantage",
"provided",
"by",
"ec",
"to",
"pbl",
"suboptimally",
"stimulated",
"with",
"mab",
"okt3",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"We",
"now",
"report",
"that",
"EC",
"costimulation",
"causes",
"increased",
"levels",
"of",
"IL-2",
"mRNA",
"as",
"a",
"result",
"of",
"increased",
"IL-2",
"transcription",
"in",
"PBL",
"."
] | [
"we",
"now",
"report",
"that",
"ec",
"costimulation",
"causes",
"increased",
"levels",
"of",
"il-2",
"mrna",
"as",
"a",
"result",
"of",
"increased",
"il-2",
"transcription",
"in",
"pbl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"therefore",
"examined",
"the",
"effects",
"of",
"EC",
"on",
"T",
"cell",
"nuclear",
"factors",
"known",
"to",
"regulate",
"IL-2",
"transcription",
",",
"including",
"c-jun",
"and",
"c-fos-two",
"components",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"AP-1",
",",
"NFAT",
",",
"and",
"others",
"."
] | [
"we",
"therefore",
"examined",
"the",
"effects",
"of",
"ec",
"on",
"t",
"cell",
"nuclear",
"factors",
"known",
"to",
"regulate",
"il-2",
"transcription",
",",
"including",
"c-jun",
"and",
"c-fos-two",
"components",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"ap-1",
",",
"nfat",
",",
"and",
"others",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PBL",
"constitutively",
"express",
"c-jun",
"transcripts",
",",
"and",
"the",
"level",
"of",
"c-jun",
"mRNA",
"is",
"not",
"altered",
"by",
"PHA",
"activation",
"in",
"the",
"absence",
"or",
"presence",
"of",
"EC",
"."
] | [
"pbl",
"constitutively",
"express",
"c-jun",
"transcripts",
",",
"and",
"the",
"level",
"of",
"c-jun",
"mrna",
"is",
"not",
"altered",
"by",
"pha",
"activation",
"in",
"the",
"absence",
"or",
"presence",
"of",
"ec",
"."
] | [
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"c-fos",
"mRNA",
"is",
"absent",
"from",
"resting",
"T",
"cells",
"and",
"is",
"induced",
"on",
"PHA",
"activation",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"c-fos",
"mrna",
"is",
"absent",
"from",
"resting",
"t",
"cells",
"and",
"is",
"induced",
"on",
"pha",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"EC",
"alone",
"do",
"not",
"induce",
"c-fos",
"mRNA",
"but",
"augment",
"the",
"level",
"of",
"c-fos",
"mRNA",
"in",
"PHA-activated",
"T",
"cells",
"by",
"3-",
"to",
"10-fold",
"."
] | [
"ec",
"alone",
"do",
"not",
"induce",
"c-fos",
"mrna",
"but",
"augment",
"the",
"level",
"of",
"c-fos",
"mrna",
"in",
"pha-activated",
"t",
"cells",
"by",
"3-",
"to",
"10-fold",
"."
] | [
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"effect",
"is",
"largely",
"independent",
"of",
"the",
"CD2",
":",
"lymphocyte",
"function-associated",
"Ag-3",
"pathway",
"."
] | [
"this",
"effect",
"is",
"largely",
"independent",
"of",
"the",
"cd2",
":",
"lymphocyte",
"function-associated",
"ag-3",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Gel-shift",
"analysis",
"reveals",
"the",
"constitutive",
"presence",
"of",
"nuclear",
"factors",
"in",
"resting",
"PBL",
"that",
"bind",
"to",
"the",
"proximal",
"AP-1",
"site",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"and",
"that",
"contain",
"immunoreactive",
"c-Jun",
"but",
"not",
"c-Fos",
"protein",
"."
] | [
"gel-shift",
"analysis",
"reveals",
"the",
"constitutive",
"presence",
"of",
"nuclear",
"factors",
"in",
"resting",
"pbl",
"that",
"bind",
"to",
"the",
"proximal",
"ap-1",
"site",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"and",
"that",
"contain",
"immunoreactive",
"c-jun",
"but",
"not",
"c-fos",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"AP-1",
"from",
"PHA-activated",
"cells",
"contains",
"c-Jun",
"and",
"low",
"levels",
"of",
"c-Fos",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"ap-1",
"from",
"pha-activated",
"cells",
"contains",
"c-jun",
"and",
"low",
"levels",
"of",
"c-fos",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Strikingly",
",",
"costimulation",
"with",
"EC",
"results",
"in",
"a",
"dramatic",
"increase",
"(",
"up",
"to",
"15-fold",
")",
"in",
"the",
"c-Fos",
"content",
"of",
"AP-1",
"."
] | [
"strikingly",
",",
"costimulation",
"with",
"ec",
"results",
"in",
"a",
"dramatic",
"increase",
"(",
"up",
"to",
"15-fold",
")",
"in",
"the",
"c-fos",
"content",
"of",
"ap-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Levels",
"of",
"other",
"nuclear",
"factors",
"involved",
"in",
"IL-2",
"regulation",
"were",
"not",
"altered",
"by",
"EC",
",",
"although",
"NFAT-DNA",
"complexes",
"migrated",
"at",
"a",
"slightly",
"different",
"mobility",
"."
] | [
"levels",
"of",
"other",
"nuclear",
"factors",
"involved",
"in",
"il-2",
"regulation",
"were",
"not",
"altered",
"by",
"ec",
",",
"although",
"nfat-dna",
"complexes",
"migrated",
"at",
"a",
"slightly",
"different",
"mobility",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"summary",
",",
"our",
"data",
"suggest",
"that",
"changes",
"in",
"the",
"composition",
"of",
"transcription",
"factor",
"AP-1",
"is",
"a",
"key",
"molecular",
"mechanism",
"for",
"increasing",
"IL-2",
"transcription",
"and",
"may",
"underlie",
"the",
"phenomenon",
"of",
"costimulation",
"by",
"EC",
"."
] | [
"in",
"summary",
",",
"our",
"data",
"suggest",
"that",
"changes",
"in",
"the",
"composition",
"of",
"transcription",
"factor",
"ap-1",
"is",
"a",
"key",
"molecular",
"mechanism",
"for",
"increasing",
"il-2",
"transcription",
"and",
"may",
"underlie",
"the",
"phenomenon",
"of",
"costimulation",
"by",
"ec",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Mouse",
"interleukin-2",
"receptor",
"alpha",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"mouse",
"interleukin-2",
"receptor",
"alpha",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interleukin-1",
"and",
"interleukin-2",
"control",
"transcription",
"via",
"distinct",
"cis-acting",
"elements",
"."
] | [
"interleukin-1",
"and",
"interleukin-2",
"control",
"transcription",
"via",
"distinct",
"cis-acting",
"elements",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"shown",
"that",
"interleukin-1",
"(",
"IL-1",
")",
"and",
"IL-2",
"control",
"IL-2",
"receptor",
"alpha",
"(",
"IL-2R",
"alpha",
")",
"gene",
"transcription",
"in",
"CD4-CD8-",
"murine",
"T",
"lymphocyte",
"precursors",
"."
] | [
"we",
"have",
"shown",
"that",
"interleukin-1",
"(",
"il-1",
")",
"and",
"il-2",
"control",
"il-2",
"receptor",
"alpha",
"(",
"il-2r",
"alpha",
")",
"gene",
"transcription",
"in",
"cd4-cd8-",
"murine",
"t",
"lymphocyte",
"precursors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"map",
"the",
"cis-acting",
"elements",
"that",
"mediate",
"interleukin",
"responsiveness",
"of",
"the",
"mouse",
"IL-2R",
"alpha",
"gene",
"using",
"a",
"thymic",
"lymphoma-derived",
"hybridoma",
"(",
"PC60",
")",
"."
] | [
"here",
"we",
"map",
"the",
"cis-acting",
"elements",
"that",
"mediate",
"interleukin",
"responsiveness",
"of",
"the",
"mouse",
"il-2r",
"alpha",
"gene",
"using",
"a",
"thymic",
"lymphoma-derived",
"hybridoma",
"(",
"pc60",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"transcriptional",
"response",
"of",
"the",
"IL-2R",
"alpha",
"gene",
"to",
"stimulation",
"by",
"IL-1",
"+",
"IL-2",
"is",
"biphasic",
"."
] | [
"the",
"transcriptional",
"response",
"of",
"the",
"il-2r",
"alpha",
"gene",
"to",
"stimulation",
"by",
"il-1",
"+",
"il-2",
"is",
"biphasic",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |