tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Analysis",
"of",
"the",
"chromatin",
"organization",
"of",
"the",
"integrated",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HIV-1",
")",
"genome",
"has",
"previously",
"revealed",
"a",
"major",
"constitutive",
"DNase",
"I-hypersensitive",
"site",
"associated",
"with",
"the",
"pol",
"gene",
"(",
"E",
".",
"Verdin",
",",
"J",
".",
"Virol",
".",
"65",
":",
"6790-6799",
",",
"1991",
")",
"."
] | [
"analysis",
"of",
"the",
"chromatin",
"organization",
"of",
"the",
"integrated",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"hiv-1",
")",
"genome",
"has",
"previously",
"revealed",
"a",
"major",
"constitutive",
"dnase",
"i-hypersensitive",
"site",
"associated",
"with",
"the",
"pol",
"gene",
"(",
"e",
".",
"verdin",
",",
"j",
".",
"virol",
".",
"65",
":",
"6790-6799",
",",
"1991",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"present",
"report",
",",
"high-resolution",
"mapping",
"of",
"this",
"site",
"with",
"DNase",
"I",
"and",
"micrococcal",
"nuclease",
"identified",
"a",
"nucleosome-free",
"region",
"centered",
"around",
"nucleotides",
"(",
"nt",
")",
"4490",
"to",
"4766",
"."
] | [
"in",
"the",
"present",
"report",
",",
"high-resolution",
"mapping",
"of",
"this",
"site",
"with",
"dnase",
"i",
"and",
"micrococcal",
"nuclease",
"identified",
"a",
"nucleosome-free",
"region",
"centered",
"around",
"nucleotides",
"(",
"nt",
")",
"4490",
"to",
"4766",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"A",
"500-bp",
"fragment",
"encompassing",
"this",
"hypersensitive",
"site",
"(",
"nt",
"4481",
"to",
"4982",
")",
"exhibited",
"transcription-enhancing",
"activity",
"(",
"two-",
"to",
"threefold",
")",
"when",
"it",
"was",
"cloned",
"in",
"its",
"natural",
"position",
"with",
"respect",
"to",
"the",
"HIV-1",
"promoter",
"after",
"transient",
"transfection",
"in",
"U937",
"and",
"CEM",
"cells",
"."
] | [
"a",
"500-bp",
"fragment",
"encompassing",
"this",
"hypersensitive",
"site",
"(",
"nt",
"4481",
"to",
"4982",
")",
"exhibited",
"transcription-enhancing",
"activity",
"(",
"two-",
"to",
"threefold",
")",
"when",
"it",
"was",
"cloned",
"in",
"its",
"natural",
"position",
"with",
"respect",
"to",
"the",
"hiv-1",
"promoter",
"after",
"transient",
"transfection",
"in",
"u937",
"and",
"cem",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Using",
"in",
"vitro",
"footprinting",
"and",
"gel",
"shift",
"assays",
",",
"we",
"have",
"identified",
"four",
"distinct",
"binding",
"sites",
"for",
"nuclear",
"proteins",
"within",
"this",
"positive",
"regulatory",
"element",
"."
] | [
"using",
"in",
"vitro",
"footprinting",
"and",
"gel",
"shift",
"assays",
",",
"we",
"have",
"identified",
"four",
"distinct",
"binding",
"sites",
"for",
"nuclear",
"proteins",
"within",
"this",
"positive",
"regulatory",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Site",
"B",
"(",
"nt",
"4519",
"to",
"4545",
")",
"specifically",
"bound",
"four",
"distinct",
"nuclear",
"protein",
"complexes",
":",
"a",
"ubiquitous",
"factor",
",",
"a",
"T-cell-specific",
"factor",
",",
"a",
"B-cell-specific",
"factor",
",",
"and",
"the",
"monocyte/macrophage-",
"and",
"B-cell-specific",
"transcription",
"factor",
"PU",
".",
"1/Spi-1",
"."
] | [
"site",
"b",
"(",
"nt",
"4519",
"to",
"4545",
")",
"specifically",
"bound",
"four",
"distinct",
"nuclear",
"protein",
"complexes",
":",
"a",
"ubiquitous",
"factor",
",",
"a",
"t-cell-specific",
"factor",
",",
"a",
"b-cell-specific",
"factor",
",",
"and",
"the",
"monocyte/macrophage-",
"and",
"b-cell-specific",
"transcription",
"factor",
"pu",
".",
"1/spi-1",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"In",
"most",
"HIV-1",
"isolates",
"in",
"which",
"this",
"PU",
"box",
"was",
"not",
"conserved",
",",
"it",
"was",
"replaced",
"by",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"the",
"related",
"factor",
"Ets1",
"."
] | [
"in",
"most",
"hiv-1",
"isolates",
"in",
"which",
"this",
"pu",
"box",
"was",
"not",
"conserved",
",",
"it",
"was",
"replaced",
"by",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"the",
"related",
"factor",
"ets1",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Factors",
"binding",
"to",
"site",
"C",
"(",
"nt",
"4681",
"to",
"4701",
")",
"had",
"a",
"DNA-binding",
"specificity",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"factors",
"binding",
"to",
"site",
"B",
",",
"except",
"for",
"PU",
".",
"1/Spi-1",
"."
] | [
"factors",
"binding",
"to",
"site",
"c",
"(",
"nt",
"4681",
"to",
"4701",
")",
"had",
"a",
"dna-binding",
"specificity",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"factors",
"binding",
"to",
"site",
"b",
",",
"except",
"for",
"pu",
".",
"1/spi-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"A",
"GC",
"box",
"containing",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"Sp1",
"was",
"identified",
"(",
"nt",
"4623",
"to",
"4631",
")",
"."
] | [
"a",
"gc",
"box",
"containing",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"sp1",
"was",
"identified",
"(",
"nt",
"4623",
"to",
"4631",
")",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"Site",
"D",
"(",
"nt",
"4816",
"to",
"4851",
")",
"specifically",
"bound",
"a",
"ubiquitously",
"expressed",
"factor",
"."
] | [
"site",
"d",
"(",
"nt",
"4816",
"to",
"4851",
")",
"specifically",
"bound",
"a",
"ubiquitously",
"expressed",
"factor",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"identify",
"a",
"transcriptional",
"regulatory",
"element",
"associated",
"with",
"a",
"nuclease-",
"hypersensitive",
"site",
"in",
"the",
"pol",
"gene",
"of",
"HIV-1",
"and",
"suggest",
"that",
"its",
"activity",
"may",
"be",
"controlled",
"by",
"a",
"complex",
"interplay",
"of",
"cis-",
"regulatory",
"elements",
"."
] | [
"these",
"results",
"identify",
"a",
"transcriptional",
"regulatory",
"element",
"associated",
"with",
"a",
"nuclease-",
"hypersensitive",
"site",
"in",
"the",
"pol",
"gene",
"of",
"hiv-1",
"and",
"suggest",
"that",
"its",
"activity",
"may",
"be",
"controlled",
"by",
"a",
"complex",
"interplay",
"of",
"cis-",
"regulatory",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Differentiation",
"of",
"T-helper",
"lymphocytes",
":",
"selective",
"regulation",
"by",
"members",
"of",
"the",
"STAT",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"differentiation",
"of",
"t-helper",
"lymphocytes",
":",
"selective",
"regulation",
"by",
"members",
"of",
"the",
"stat",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Interleukin-4",
"(",
"IL-4",
")",
"and",
"interleukin-12",
"(",
"IL-12",
")",
"control",
"the",
"differentiation",
"of",
"T-helper",
"cells",
"."
] | [
"interleukin-4",
"(",
"il-4",
")",
"and",
"interleukin-12",
"(",
"il-12",
")",
"control",
"the",
"differentiation",
"of",
"t-helper",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"summarize",
"studies",
"which",
"investigate",
"the",
"mechanism",
"by",
"which",
"these",
"cytokines",
"selectively",
"reprogramme",
"gene",
"expression",
"in",
"T-lymphocytes",
"."
] | [
"here",
"we",
"summarize",
"studies",
"which",
"investigate",
"the",
"mechanism",
"by",
"which",
"these",
"cytokines",
"selectively",
"reprogramme",
"gene",
"expression",
"in",
"t-lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Cytokine",
"stimulation",
"leads",
"to",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"specific",
"tyrosine",
"residues",
"within",
"the",
"intracellular",
"domain",
"of",
"the",
"corresponding",
"cytokine",
"receptor",
"."
] | [
"cytokine",
"stimulation",
"leads",
"to",
"the",
"phosphorylation",
"of",
"specific",
"tyrosine",
"residues",
"within",
"the",
"intracellular",
"domain",
"of",
"the",
"corresponding",
"cytokine",
"receptor",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"I-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"phosphotyrosines",
"serve",
"as",
"docking",
"sites",
"for",
"latent",
",",
"cytoplasmic",
"transcription",
"factors",
"known",
"as",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"Stat",
")",
"proteins",
"."
] | [
"these",
"phosphotyrosines",
"serve",
"as",
"docking",
"sites",
"for",
"latent",
",",
"cytoplasmic",
"transcription",
"factors",
"known",
"as",
"signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
"(",
"stat",
")",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Receptor/Stat",
"interaction",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"src",
"homology",
"2",
"(",
"SH2",
")",
"domain",
"of",
"the",
"corresponding",
"Stat",
"protein",
"."
] | [
"receptor/stat",
"interaction",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"src",
"homology",
"2",
"(",
"sh2",
")",
"domain",
"of",
"the",
"corresponding",
"stat",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Although",
"Stat",
"binding",
"to",
"the",
"intracellular",
"domain",
"of",
"the",
"cytokine",
"receptor",
"strongly",
"depends",
"on",
"the",
"phosphotyrosine",
"residue",
",",
"the",
"recruitment",
"of",
"a",
"specific",
"Stat",
"protein",
"is",
"dictated",
"by",
"amino",
"acid",
"residues",
"C-terminal",
"to",
"the",
"phosphotyrosine",
"."
] | [
"although",
"stat",
"binding",
"to",
"the",
"intracellular",
"domain",
"of",
"the",
"cytokine",
"receptor",
"strongly",
"depends",
"on",
"the",
"phosphotyrosine",
"residue",
",",
"the",
"recruitment",
"of",
"a",
"specific",
"stat",
"protein",
"is",
"dictated",
"by",
"amino",
"acid",
"residues",
"c-terminal",
"to",
"the",
"phosphotyrosine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"I-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"I-amino_acid_monomer",
"I-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Specific",
"docking",
"sites",
"within",
"individual",
"cytokine",
"receptors",
"have",
"been",
"identified",
"for",
"almost",
"all",
"Stat",
"proteins",
"."
] | [
"specific",
"docking",
"sites",
"within",
"individual",
"cytokine",
"receptors",
"have",
"been",
"identified",
"for",
"almost",
"all",
"stat",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"direct",
"coupling",
"between",
"cytokine",
"receptor",
"and",
"transcription",
"factor",
"helps",
"to",
"explain",
"how",
"different",
"cytokines",
"elicit",
"distinct",
"patterns",
"of",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"the",
"direct",
"coupling",
"between",
"cytokine",
"receptor",
"and",
"transcription",
"factor",
"helps",
"to",
"explain",
"how",
"different",
"cytokines",
"elicit",
"distinct",
"patterns",
"of",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Switching",
"gears",
"during",
"T-cell",
"maturation",
":",
"RANTES",
"and",
"late",
"transcription",
"."
] | [
"switching",
"gears",
"during",
"t-cell",
"maturation",
":",
"rantes",
"and",
"late",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Although",
"much",
"is",
"understood",
"about",
"the",
"induction",
"of",
"genes",
"expressed",
"early",
"(",
"within",
"24",
"h",
")",
"after",
"T-cell",
"activation",
",",
"little",
"is",
"known",
"about",
"the",
"regulation",
"of",
"expression",
"of",
"genes",
"expressed",
"'late'",
"(",
"three",
"or",
"more",
"days",
")",
"post-stimulation",
"."
] | [
"although",
"much",
"is",
"understood",
"about",
"the",
"induction",
"of",
"genes",
"expressed",
"early",
"(",
"within",
"24",
"h",
")",
"after",
"t-cell",
"activation",
",",
"little",
"is",
"known",
"about",
"the",
"regulation",
"of",
"expression",
"of",
"genes",
"expressed",
"'late'",
"(",
"three",
"or",
"more",
"days",
")",
"post-stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"A",
"better",
"understanding",
"of",
"transcriptional",
"regulation",
"at",
"this",
"important",
"stage",
"of",
"T-cell",
"maturation",
"may",
"yield",
"new",
"insights",
"into",
"T-cell",
"development",
"and",
"new",
"immunotherapeutic",
"targets",
"."
] | [
"a",
"better",
"understanding",
"of",
"transcriptional",
"regulation",
"at",
"this",
"important",
"stage",
"of",
"t-cell",
"maturation",
"may",
"yield",
"new",
"insights",
"into",
"t-cell",
"development",
"and",
"new",
"immunotherapeutic",
"targets",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Lymphocyte",
"cell",
"lines",
"from",
"vitamin",
"D-dependent",
"rickets",
"type",
"II",
"show",
"functional",
"defects",
"in",
"the",
"1",
"alpha",
",",
"25-dihydroxyvitamin",
"D3",
"receptor",
"."
] | [
"lymphocyte",
"cell",
"lines",
"from",
"vitamin",
"d-dependent",
"rickets",
"type",
"ii",
"show",
"functional",
"defects",
"in",
"the",
"1",
"alpha",
",",
"25-dihydroxyvitamin",
"d3",
"receptor",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Lymphocyte",
"cell",
"lines",
"were",
"established",
"from",
"five",
"patients",
"with",
"vitamin",
"D-dependent",
"rickets",
",",
"type",
"II",
"(",
"VDDR-II",
")",
"."
] | [
"lymphocyte",
"cell",
"lines",
"were",
"established",
"from",
"five",
"patients",
"with",
"vitamin",
"d-dependent",
"rickets",
",",
"type",
"ii",
"(",
"vddr-ii",
")",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"lines",
"were",
"established",
"by",
"infection",
"with",
"human",
"T-lymphotrophic",
"virus",
"type",
"I",
"(",
"HTLV-I",
")",
"."
] | [
"these",
"lines",
"were",
"established",
"by",
"infection",
"with",
"human",
"t-lymphotrophic",
"virus",
"type",
"i",
"(",
"htlv-i",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O"
] |
[
"Binding",
"of",
"[",
"3H",
"]",
"1",
"alpha",
",",
"25-dihydroxyvitamin",
"D3",
"(",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
")",
"to",
"its",
"receptor",
"in",
"these",
"cell",
"lines",
"was",
"compared",
"to",
"binding",
"studies",
"using",
"a",
"T-lymphocyte",
"cell",
"line",
"(",
"S-LB1",
")",
"from",
"a",
"normal",
"individual",
"."
] | [
"binding",
"of",
"[",
"3h",
"]",
"1",
"alpha",
",",
"25-dihydroxyvitamin",
"d3",
"(",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
")",
"to",
"its",
"receptor",
"in",
"these",
"cell",
"lines",
"was",
"compared",
"to",
"binding",
"studies",
"using",
"a",
"t-lymphocyte",
"cell",
"line",
"(",
"s-lb1",
")",
"from",
"a",
"normal",
"individual",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
"of",
"S-LB1",
"was",
"comparable",
"to",
"the",
"well-characterized",
"chick",
"intestinal",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
"in",
"terms",
"of",
"its",
"ligand",
"binding",
"affinity",
"and",
"capacity",
",",
"its",
"mobility",
"on",
"5-20%",
"sucrose",
"gradients",
",",
"and",
"its",
"adsorption",
"to",
"and",
"elution",
"properties",
"from",
"DNA-cellulose",
"."
] | [
"the",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
"of",
"s-lb1",
"was",
"comparable",
"to",
"the",
"well-characterized",
"chick",
"intestinal",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
"in",
"terms",
"of",
"its",
"ligand",
"binding",
"affinity",
"and",
"capacity",
",",
"its",
"mobility",
"on",
"5-20%",
"sucrose",
"gradients",
",",
"and",
"its",
"adsorption",
"to",
"and",
"elution",
"properties",
"from",
"dna-cellulose",
"."
] | [
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Three",
"cell",
"lines",
"established",
"from",
"patients",
"with",
"VDDR-II",
"(",
"Rh-",
"VDR",
",",
"Sh-",
"VDR",
",",
"and",
"Ab-",
"VDR",
")",
"showed",
"no",
"specific",
"binding",
"of",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"to",
"a",
"receptor",
"and",
"treatment",
"of",
"the",
"cultured",
"cells",
"with",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"did",
"not",
"stimulate",
"production",
"of",
"24",
",",
"25-dihydroxy-vitamin",
"D3",
"(",
"24",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
")",
",",
"a",
"response",
"which",
"is",
"diagnostic",
"of",
"the",
"presence",
"of",
"a",
"functional",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
"."
] | [
"three",
"cell",
"lines",
"established",
"from",
"patients",
"with",
"vddr-ii",
"(",
"rh-",
"vdr",
",",
"sh-",
"vdr",
",",
"and",
"ab-",
"vdr",
")",
"showed",
"no",
"specific",
"binding",
"of",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"to",
"a",
"receptor",
"and",
"treatment",
"of",
"the",
"cultured",
"cells",
"with",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"did",
"not",
"stimulate",
"production",
"of",
"24",
",",
"25-dihydroxy-vitamin",
"d3",
"(",
"24",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
")",
",",
"a",
"response",
"which",
"is",
"diagnostic",
"of",
"the",
"presence",
"of",
"a",
"functional",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"a",
"fourth",
"cell",
"line",
",",
"A1-VDR",
",",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"had",
"a",
"low",
"binding",
"capacity",
"and",
"25",
"(",
"OH",
")",
"D3-24-hydroxylase",
"activity",
"was",
"not",
"detectable",
"."
] | [
"in",
"a",
"fourth",
"cell",
"line",
",",
"a1-vdr",
",",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"had",
"a",
"low",
"binding",
"capacity",
"and",
"25",
"(",
"oh",
")",
"d3-24-hydroxylase",
"activity",
"was",
"not",
"detectable",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"24",
",",
"25-",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"synthesis",
"by",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"was",
"observed",
"in",
"the",
"fifth",
"cell",
"line",
",",
"designated",
"Ro-VDR",
",",
"although",
"the",
"sensitivity",
"to",
"hormone",
"treatment",
"was",
"lower",
"than",
"in",
"the",
"control",
"cell",
"line",
"from",
"a",
"normal",
"donor",
"."
] | [
"induction",
"of",
"24",
",",
"25-",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"synthesis",
"by",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"was",
"observed",
"in",
"the",
"fifth",
"cell",
"line",
",",
"designated",
"ro-vdr",
",",
"although",
"the",
"sensitivity",
"to",
"hormone",
"treatment",
"was",
"lower",
"than",
"in",
"the",
"control",
"cell",
"line",
"from",
"a",
"normal",
"donor",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"The",
"capacity",
"of",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"was",
"low",
"in",
"Ro-VDR",
"."
] | [
"the",
"capacity",
"of",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"was",
"low",
"in",
"ro-vdr",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"all",
"cell",
"lines",
"where",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"binding",
"to",
"a",
"receptor",
"was",
"detectable",
",",
"the",
"receptor",
"had",
"the",
"typical",
"sedimentation",
"coefficient",
"of",
"3",
".",
"7",
"S",
"on",
"sucrose",
"density",
"gradient",
"analysis",
"."
] | [
"in",
"all",
"cell",
"lines",
"where",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"binding",
"to",
"a",
"receptor",
"was",
"detectable",
",",
"the",
"receptor",
"had",
"the",
"typical",
"sedimentation",
"coefficient",
"of",
"3",
".",
"7",
"s",
"on",
"sucrose",
"density",
"gradient",
"analysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Binding",
"and",
"elution",
"properties",
"to",
"DNA-cellulose",
",",
"however",
",",
"differed",
"from",
"normal",
"in",
"both",
"Ro-VDR",
"and",
"A1-VDR",
"cells",
"where",
"elution",
"from",
"DNA-cellulose",
"occurred",
"at",
"a",
"lower",
"salt",
"concentration",
"than",
"is",
"typical",
"of",
"the",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
"."
] | [
"binding",
"and",
"elution",
"properties",
"to",
"dna-cellulose",
",",
"however",
",",
"differed",
"from",
"normal",
"in",
"both",
"ro-vdr",
"and",
"a1-vdr",
"cells",
"where",
"elution",
"from",
"dna-cellulose",
"occurred",
"at",
"a",
"lower",
"salt",
"concentration",
"than",
"is",
"typical",
"of",
"the",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
"."
] | [
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"While",
"Ro-VDR",
"cells",
"showed",
"typical",
"nuclear",
"localization",
"of",
"the",
"unoccupied",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
",",
"neither",
"the",
"unoccupied",
"nor",
"the",
"occupied",
"receptor",
"from",
"A1-VDR",
"cells",
"was",
"completely",
"localized",
"in",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"while",
"ro-vdr",
"cells",
"showed",
"typical",
"nuclear",
"localization",
"of",
"the",
"unoccupied",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
",",
"neither",
"the",
"unoccupied",
"nor",
"the",
"occupied",
"receptor",
"from",
"a1-vdr",
"cells",
"was",
"completely",
"localized",
"in",
"the",
"nucleus",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O"
] |
[
"In",
"a",
"series",
"of",
"functional",
"studies",
"we",
"found",
"that",
"modulation",
"of",
"the",
"level",
"of",
"the",
"mRNAs",
"coding",
"for",
"both",
"the",
"c-myc",
"oncogene",
"and",
"the",
"growth",
"factor",
"known",
"as",
"granulocyte-monocyte",
"colony",
"stimulating",
"activity",
"by",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"correlated",
"with",
"the",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"receptor",
"status",
"of",
"these",
"cells",
"."
] | [
"in",
"a",
"series",
"of",
"functional",
"studies",
"we",
"found",
"that",
"modulation",
"of",
"the",
"level",
"of",
"the",
"mrnas",
"coding",
"for",
"both",
"the",
"c-myc",
"oncogene",
"and",
"the",
"growth",
"factor",
"known",
"as",
"granulocyte-monocyte",
"colony",
"stimulating",
"activity",
"by",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"correlated",
"with",
"the",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"receptor",
"status",
"of",
"these",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Use",
"of",
"these",
"cell",
"lines",
"will",
"facilitate",
"further",
"study",
"of",
"the",
"molecular",
"defect",
"(",
"s",
")",
"in",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2D3",
"in",
"vitamin",
"D-dependent",
"rickets",
"type",
"II",
"and",
"will",
"allow",
"a",
"correlation",
"with",
"impairment",
"of",
"cellular",
"functions",
"."
] | [
"use",
"of",
"these",
"cell",
"lines",
"will",
"facilitate",
"further",
"study",
"of",
"the",
"molecular",
"defect",
"(",
"s",
")",
"in",
"the",
"receptor",
"for",
"1",
",",
"25",
"(",
"oh",
")",
"2d3",
"in",
"vitamin",
"d-dependent",
"rickets",
"type",
"ii",
"and",
"will",
"allow",
"a",
"correlation",
"with",
"impairment",
"of",
"cellular",
"functions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Effects",
"of",
"the",
"antisense",
"myb",
"expression",
"on",
"hemin-",
"and",
"erythropoietin-",
"induced",
"erythroid",
"differentiation",
"of",
"K562",
"cells",
"."
] | [
"effects",
"of",
"the",
"antisense",
"myb",
"expression",
"on",
"hemin-",
"and",
"erythropoietin-",
"induced",
"erythroid",
"differentiation",
"of",
"k562",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"order",
"to",
"elucidate",
"the",
"role",
"of",
"c-myb",
"gene",
"in",
"erythroid",
"differentiation",
"of",
"K562",
"cell",
"induced",
"by",
"hemin",
"(",
"Hm",
")",
"and",
"erythropoietin",
"(",
"Epo",
")",
",",
"we",
"constructed",
"recombinant",
"plasmid",
"that",
"could",
"produce",
"antisense",
"myb",
"RNA",
"after",
"induction",
"with",
"dexamethasone",
"."
] | [
"in",
"order",
"to",
"elucidate",
"the",
"role",
"of",
"c-myb",
"gene",
"in",
"erythroid",
"differentiation",
"of",
"k562",
"cell",
"induced",
"by",
"hemin",
"(",
"hm",
")",
"and",
"erythropoietin",
"(",
"epo",
")",
",",
"we",
"constructed",
"recombinant",
"plasmid",
"that",
"could",
"produce",
"antisense",
"myb",
"rna",
"after",
"induction",
"with",
"dexamethasone",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"During",
"treatment",
"with",
"Hm",
",",
"K562",
"cells",
"constitutively",
"expressed",
"c-myb",
"mRNA",
",",
"and",
"50%",
"of",
"them",
"began",
"to",
"synthesize",
"hemoglobin",
"(",
"Hb",
")",
"."
] | [
"during",
"treatment",
"with",
"hm",
",",
"k562",
"cells",
"constitutively",
"expressed",
"c-myb",
"mrna",
",",
"and",
"50%",
"of",
"them",
"began",
"to",
"synthesize",
"hemoglobin",
"(",
"hb",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"antisense",
"myb",
"RNA",
"reduced",
"the",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mRNA",
",",
"and",
"the",
"percentage",
"of",
"Hb",
"-synthesizing",
"cells",
"was",
"decreased",
"to",
"20%",
"."
] | [
"expression",
"of",
"antisense",
"myb",
"rna",
"reduced",
"the",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mrna",
",",
"and",
"the",
"percentage",
"of",
"hb",
"-synthesizing",
"cells",
"was",
"decreased",
"to",
"20%",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"presence",
"of",
"Epo",
",",
"c-myb",
"mRNA",
"declined",
"and",
"20%",
"of",
"K562",
"cells",
"synthesized",
"Hb",
"regardless",
"of",
"antisense",
"myb",
"RNA",
"expression",
"."
] | [
"in",
"the",
"presence",
"of",
"epo",
",",
"c-myb",
"mrna",
"declined",
"and",
"20%",
"of",
"k562",
"cells",
"synthesized",
"hb",
"regardless",
"of",
"antisense",
"myb",
"rna",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"suggested",
"that",
"constitutive",
"expression",
"of",
"c-myb",
"mRNA",
"is",
"necessary",
"for",
"Hm",
"-induced",
"differentiation",
",",
"and",
"that",
"a",
"decrease",
"in",
"the",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mRNA",
"induced",
"by",
"antisense",
"myb",
"RNA",
"expression",
"suppresses",
"Hm",
"-induced",
"differentiation",
"."
] | [
"it",
"is",
"suggested",
"that",
"constitutive",
"expression",
"of",
"c-myb",
"mrna",
"is",
"necessary",
"for",
"hm",
"-induced",
"differentiation",
",",
"and",
"that",
"a",
"decrease",
"in",
"the",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mrna",
"induced",
"by",
"antisense",
"myb",
"rna",
"expression",
"suppresses",
"hm",
"-induced",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mRNA",
"in",
"K562",
"cells",
"was",
"reduced",
"during",
"the",
"differentiation",
"induced",
"by",
"Epo",
"."
] | [
"the",
"amount",
"of",
"c-myb",
"mrna",
"in",
"k562",
"cells",
"was",
"reduced",
"during",
"the",
"differentiation",
"induced",
"by",
"epo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"GATA-1",
"mRNA",
"was",
"almost",
"constant",
"during",
"Hm",
"-induced",
"differentiation",
",",
"but",
"increased",
"during",
"Epo",
"treatment",
"."
] | [
"expression",
"of",
"gata-1",
"mrna",
"was",
"almost",
"constant",
"during",
"hm",
"-induced",
"differentiation",
",",
"but",
"increased",
"during",
"epo",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"supposed",
"that",
"the",
"mechanism",
"of",
"Hm",
"-induced",
"differentiation",
"is",
"distinguished",
"from",
"that",
"of",
"Epo",
"-induced",
"differentiation",
"in",
"K562",
"cells",
"."
] | [
"it",
"is",
"supposed",
"that",
"the",
"mechanism",
"of",
"hm",
"-induced",
"differentiation",
"is",
"distinguished",
"from",
"that",
"of",
"epo",
"-induced",
"differentiation",
"in",
"k562",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"BMRF1",
"promoter",
"for",
"early",
"antigen",
"(",
"EA-D",
")",
"is",
"regulated",
"by",
"the",
"EBV",
"transactivators",
",",
"BRLF1",
"and",
"BZLF1",
",",
"in",
"a",
"cell-specific",
"manner",
"."
] | [
"the",
"epstein-barr",
"virus",
"(",
"ebv",
")",
"bmrf1",
"promoter",
"for",
"early",
"antigen",
"(",
"ea-d",
")",
"is",
"regulated",
"by",
"the",
"ebv",
"transactivators",
",",
"brlf1",
"and",
"bzlf1",
",",
"in",
"a",
"cell-specific",
"manner",
"."
] | [
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"Epstein-Barr",
"virus",
"early",
"antigen",
"diffuse",
"component",
"(",
"EA-D",
")",
"is",
"essential",
"for",
"Epstein-Barr",
"virus",
"DNA",
"polymerase",
"activity",
",",
"and",
"its",
"activity",
"is",
"suppressed",
"during",
"latent",
"infection",
"."
] | [
"the",
"epstein-barr",
"virus",
"early",
"antigen",
"diffuse",
"component",
"(",
"ea-d",
")",
"is",
"essential",
"for",
"epstein-barr",
"virus",
"dna",
"polymerase",
"activity",
",",
"and",
"its",
"activity",
"is",
"suppressed",
"during",
"latent",
"infection",
"."
] | [
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"investigated",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"promoter",
"(",
"BMRF1",
")",
"for",
"this",
"early",
"gene",
"by",
"studying",
"its",
"responsiveness",
"in",
"vitro",
"to",
"two",
"immediate-early",
"viral",
"transactivators",
",",
"BZLF1",
"(",
"Z",
")",
"and",
"BRLF1",
"(",
"R",
")",
",",
"focusing",
"on",
"the",
"differences",
"in",
"response",
"in",
"lymphoid",
"cells",
"and",
"epithelial",
"cells",
"."
] | [
"we",
"investigated",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"promoter",
"(",
"bmrf1",
")",
"for",
"this",
"early",
"gene",
"by",
"studying",
"its",
"responsiveness",
"in",
"vitro",
"to",
"two",
"immediate-early",
"viral",
"transactivators",
",",
"bzlf1",
"(",
"z",
")",
"and",
"brlf1",
"(",
"r",
")",
",",
"focusing",
"on",
"the",
"differences",
"in",
"response",
"in",
"lymphoid",
"cells",
"and",
"epithelial",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"lymphoid",
"cells",
",",
"Z",
"or",
"R",
"alone",
"produced",
"only",
"small",
"increases",
"in",
"EA-D",
"promoter",
"activity",
",",
"whereas",
"both",
"transactivators",
"together",
"produced",
"a",
"large",
"stimulatory",
"effect",
"."
] | [
"in",
"lymphoid",
"cells",
",",
"z",
"or",
"r",
"alone",
"produced",
"only",
"small",
"increases",
"in",
"ea-d",
"promoter",
"activity",
",",
"whereas",
"both",
"transactivators",
"together",
"produced",
"a",
"large",
"stimulatory",
"effect",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"epithelial",
"cells",
",",
"the",
"Z",
"transactivator",
"alone",
"produced",
"maximal",
"stimulation",
"of",
"the",
"EA-D",
"promoter",
";",
"the",
"effect",
"of",
"R",
"and",
"Z",
"together",
"was",
"no",
"greater",
"than",
"that",
"of",
"Z",
"alone",
"."
] | [
"in",
"epithelial",
"cells",
",",
"the",
"z",
"transactivator",
"alone",
"produced",
"maximal",
"stimulation",
"of",
"the",
"ea-d",
"promoter",
";",
"the",
"effect",
"of",
"r",
"and",
"z",
"together",
"was",
"no",
"greater",
"than",
"that",
"of",
"z",
"alone",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Deletional",
"analysis",
"and",
"site-directed",
"mutagenesis",
"of",
"the",
"EA-D",
"promoter",
"demonstrated",
"that",
"in",
"epithelial",
"cells",
"the",
"potential",
"AP-1",
"binding",
"site",
"plays",
"an",
"essential",
"role",
"in",
"Z",
"responsiveness",
",",
"although",
"sequences",
"further",
"upstream",
"are",
"also",
"important",
"."
] | [
"deletional",
"analysis",
"and",
"site-directed",
"mutagenesis",
"of",
"the",
"ea-d",
"promoter",
"demonstrated",
"that",
"in",
"epithelial",
"cells",
"the",
"potential",
"ap-1",
"binding",
"site",
"plays",
"an",
"essential",
"role",
"in",
"z",
"responsiveness",
",",
"although",
"sequences",
"further",
"upstream",
"are",
"also",
"important",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"lymphoid",
"cells",
",",
"only",
"the",
"upstream",
"sequences",
"are",
"required",
"for",
"transactivation",
"by",
"the",
"Z/R",
"combination",
",",
"and",
"the",
"AP-1",
"site",
"is",
"dispensable",
"."
] | [
"in",
"lymphoid",
"cells",
",",
"only",
"the",
"upstream",
"sequences",
"are",
"required",
"for",
"transactivation",
"by",
"the",
"z/r",
"combination",
",",
"and",
"the",
"ap-1",
"site",
"is",
"dispensable",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"EA-D",
"(",
"BMRF1",
")",
"promoter",
"regulation",
"by",
"Z",
"and",
"R",
"is",
"cell",
"type",
"specific",
"and",
"appears",
"to",
"involve",
"different",
"mechanisms",
"in",
"each",
"cell",
"type",
"."
] | [
"these",
"data",
"suggest",
"that",
"ea-d",
"(",
"bmrf1",
")",
"promoter",
"regulation",
"by",
"z",
"and",
"r",
"is",
"cell",
"type",
"specific",
"and",
"appears",
"to",
"involve",
"different",
"mechanisms",
"in",
"each",
"cell",
"type",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"B/Rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphocytes",
"by",
"anti-HLA",
"class",
"I",
"monoclonal",
"antibodies",
"."
] | [
"induction",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"b/rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphocytes",
"by",
"anti-hla",
"class",
"i",
"monoclonal",
"antibodies",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Monoclonal",
"antibodies",
"against",
"either",
"monomorphic",
"or",
"polymorphic",
"determinants",
"of",
"class",
"I",
"antigen",
"induced",
"in",
"PBMC",
"and",
"highly",
"purified",
"T",
"lymphocytes",
"the",
"nuclear",
"activity",
"of",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"complexes",
"."
] | [
"monoclonal",
"antibodies",
"against",
"either",
"monomorphic",
"or",
"polymorphic",
"determinants",
"of",
"class",
"i",
"antigen",
"induced",
"in",
"pbmc",
"and",
"highly",
"purified",
"t",
"lymphocytes",
"the",
"nuclear",
"activity",
"of",
"nf-kappa",
"b/rel",
"complexes",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"These",
"included",
"both",
"p50/p50",
"and",
"p50/p65",
"dimers",
",",
"recognized",
"by",
"specific",
"antibodies",
"in",
"EMSA",
"."
] | [
"these",
"included",
"both",
"p50/p50",
"and",
"p50/p65",
"dimers",
",",
"recognized",
"by",
"specific",
"antibodies",
"in",
"emsa",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"induced",
"complexes",
"were",
"detectable",
"in",
"extracts",
"of",
"cells",
"incubated",
"with",
"anti-class",
"I",
"monoclonal",
"antibody",
"(",
"mAb",
")",
"for",
"1",
".",
"5",
"h",
";",
"the",
"induction",
"was",
"maximal",
"at",
"5",
"h",
",",
"persistent",
"at",
"16",
"h",
"and",
"no",
"longer",
"observed",
"at",
"40",
"h",
"."
] | [
"the",
"induced",
"complexes",
"were",
"detectable",
"in",
"extracts",
"of",
"cells",
"incubated",
"with",
"anti-class",
"i",
"monoclonal",
"antibody",
"(",
"mab",
")",
"for",
"1",
".",
"5",
"h",
";",
"the",
"induction",
"was",
"maximal",
"at",
"5",
"h",
",",
"persistent",
"at",
"16",
"h",
"and",
"no",
"longer",
"observed",
"at",
"40",
"h",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mAb",
"failed",
"to",
"induce",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"cells",
"incubated",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"3",
",",
"4-dichloroisocoumarin",
",",
"an",
"inhibitor",
"of",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"degradation",
"."
] | [
"the",
"mab",
"failed",
"to",
"induce",
"nf-kappa",
"b/rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"cells",
"incubated",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"3",
",",
"4-dichloroisocoumarin",
",",
"an",
"inhibitor",
"of",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"degradation",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Together",
",",
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"class",
"I",
"triggering",
"can",
"induce",
"the",
"activity",
"of",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphocytes",
",",
"thereby",
"modulating",
"the",
"expression",
"of",
"genes",
"regulated",
"by",
"these",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"together",
",",
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"class",
"i",
"triggering",
"can",
"induce",
"the",
"activity",
"of",
"nf-kappa",
"b/rel",
"nuclear",
"activity",
"in",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphocytes",
",",
"thereby",
"modulating",
"the",
"expression",
"of",
"genes",
"regulated",
"by",
"these",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Central",
"nervous",
"system",
"-derived",
"cells",
"express",
"a",
"kappa",
"B-binding",
"activity",
"that",
"enhances",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"transcription",
"in",
"vitro",
"and",
"facilitates",
"TAR",
"-independent",
"transactivation",
"by",
"Tat",
"."
] | [
"central",
"nervous",
"system",
"-derived",
"cells",
"express",
"a",
"kappa",
"b-binding",
"activity",
"that",
"enhances",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"transcription",
"in",
"vitro",
"and",
"facilitates",
"tar",
"-independent",
"transactivation",
"by",
"tat",
"."
] | [
"B-body_part",
"I-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"Tat",
"protein",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HIV-1",
")",
"is",
"a",
"potent",
"activator",
"of",
"long",
"terminal",
"repeat",
"-directed",
"transcription",
"."
] | [
"the",
"tat",
"protein",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"hiv-1",
")",
"is",
"a",
"potent",
"activator",
"of",
"long",
"terminal",
"repeat",
"-directed",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"in",
"most",
"cell",
"types",
",",
"activation",
"requires",
"interaction",
"of",
"Tat",
"with",
"the",
"unusual",
"transcription",
"element",
"TAR",
",",
"astrocytic",
"glial",
"cells",
"support",
"TAR",
"-independent",
"transactivation",
"of",
"HIV-1",
"transcription",
"by",
"Tat",
"."
] | [
"while",
"in",
"most",
"cell",
"types",
",",
"activation",
"requires",
"interaction",
"of",
"tat",
"with",
"the",
"unusual",
"transcription",
"element",
"tar",
",",
"astrocytic",
"glial",
"cells",
"support",
"tar",
"-independent",
"transactivation",
"of",
"hiv-1",
"transcription",
"by",
"tat",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"alternative",
"pathway",
"of",
"Tat",
"activation",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"viral",
"enhancer",
",",
"a",
"kappa",
"B",
"domain",
"capable",
"of",
"binding",
"the",
"prototypical",
"form",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"B",
"(",
"NF-kappa",
"B",
")",
"present",
"in",
"many",
"cell",
"types",
",",
"including",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"this",
"alternative",
"pathway",
"of",
"tat",
"activation",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"viral",
"enhancer",
",",
"a",
"kappa",
"b",
"domain",
"capable",
"of",
"binding",
"the",
"prototypical",
"form",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"nuclear",
"factor",
"kappa",
"b",
"(",
"nf-kappa",
"b",
")",
"present",
"in",
"many",
"cell",
"types",
",",
"including",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Tat",
"transactivation",
"mediated",
"by",
"the",
"kappa",
"B",
"domain",
"is",
"sufficient",
"to",
"allow",
"replication",
"of",
"TAR",
"-deleted",
"mutant",
"HIV-1",
"in",
"astrocytes",
"."
] | [
"tat",
"transactivation",
"mediated",
"by",
"the",
"kappa",
"b",
"domain",
"is",
"sufficient",
"to",
"allow",
"replication",
"of",
"tar",
"-deleted",
"mutant",
"hiv-1",
"in",
"astrocytes",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"study",
"demonstrates",
"the",
"existence",
"of",
"kappa",
"B-specific",
"binding",
"factors",
"present",
"in",
"human",
"glial",
"astrocytes",
"that",
"differ",
"from",
"prototypical",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"the",
"present",
"study",
"demonstrates",
"the",
"existence",
"of",
"kappa",
"b-specific",
"binding",
"factors",
"present",
"in",
"human",
"glial",
"astrocytes",
"that",
"differ",
"from",
"prototypical",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"novel",
"astrocyte-derived",
"kappa",
"B-binding",
"activity",
"is",
"retained",
"on",
"an",
"HIV-1",
"Tat",
"affinity",
"column",
",",
"while",
"prototypical",
"NF-kappa",
"B",
"from",
"Jurkat",
"T",
"cells",
"is",
"not",
"."
] | [
"the",
"novel",
"astrocyte-derived",
"kappa",
"b-binding",
"activity",
"is",
"retained",
"on",
"an",
"hiv-1",
"tat",
"affinity",
"column",
",",
"while",
"prototypical",
"nf-kappa",
"b",
"from",
"jurkat",
"t",
"cells",
"is",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vitro",
"transcription",
"studies",
"demonstrate",
"that",
"astrocyte-derived",
"kappa",
"B-binding",
"factors",
"activate",
"transcription",
"of",
"the",
"HIV-1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"and",
"that",
"this",
"activation",
"is",
"dependent",
"on",
"the",
"kappa",
"B",
"domain",
"."
] | [
"in",
"vitro",
"transcription",
"studies",
"demonstrate",
"that",
"astrocyte-derived",
"kappa",
"b-binding",
"factors",
"activate",
"transcription",
"of",
"the",
"hiv-1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"and",
"that",
"this",
"activation",
"is",
"dependent",
"on",
"the",
"kappa",
"b",
"domain",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"TAR",
"-independent",
"transactivation",
"of",
"HIV-1",
"transcription",
"is",
"reproduced",
"in",
"vitro",
"in",
"an",
"astrocyte",
"factor-dependent",
"manner",
"which",
"correlates",
"with",
"kappa",
"B-binding",
"activity",
"."
] | [
"moreover",
",",
"tar",
"-independent",
"transactivation",
"of",
"hiv-1",
"transcription",
"is",
"reproduced",
"in",
"vitro",
"in",
"an",
"astrocyte",
"factor-dependent",
"manner",
"which",
"correlates",
"with",
"kappa",
"b-binding",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"importance",
"of",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"-enriched",
"kappa",
"B",
"transcription",
"factor",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"HIV-1",
"expression",
"is",
"discussed",
"."
] | [
"the",
"importance",
"of",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"-enriched",
"kappa",
"b",
"transcription",
"factor",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"hiv-1",
"expression",
"is",
"discussed",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"actions",
"of",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"suggest",
"a",
"novel",
"step",
"in",
"the",
"activation",
"of",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"the",
"actions",
"of",
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"suggest",
"a",
"novel",
"step",
"in",
"the",
"activation",
"of",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"are",
"immunosuppressive",
"compounds",
"that",
"have",
"similar",
"inhibitory",
"effects",
"on",
"the",
"expression",
"of",
"several",
"lymphokines",
"produced",
"by",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"are",
"immunosuppressive",
"compounds",
"that",
"have",
"similar",
"inhibitory",
"effects",
"on",
"the",
"expression",
"of",
"several",
"lymphokines",
"produced",
"by",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Despite",
"their",
"similar",
"effects",
"the",
"drugs",
"bind",
"to",
"two",
"different",
"cytosolic",
"protein",
",",
"cyclophilin",
"and",
"FKBP",
"respectively",
",",
"which",
"raises",
"the",
"possibility",
"that",
"they",
"have",
"different",
"modes",
"of",
"action",
"."
] | [
"despite",
"their",
"similar",
"effects",
"the",
"drugs",
"bind",
"to",
"two",
"different",
"cytosolic",
"protein",
",",
"cyclophilin",
"and",
"fkbp",
"respectively",
",",
"which",
"raises",
"the",
"possibility",
"that",
"they",
"have",
"different",
"modes",
"of",
"action",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"constructs",
"in",
"which",
"mRNA",
"production",
"controlled",
"by",
"a",
"specific",
"transcription",
"factor",
"could",
"be",
"readily",
"measured",
"we",
"found",
"that",
"both",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"completely",
"inhibited",
"transcription",
"activated",
"by",
"NF-AT",
",",
"NFIL2",
"A",
",",
"NFIL2",
"B",
"and",
"partially",
"inhibited",
"transcription",
"activated",
"by",
"NF",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"using",
"constructs",
"in",
"which",
"mrna",
"production",
"controlled",
"by",
"a",
"specific",
"transcription",
"factor",
"could",
"be",
"readily",
"measured",
"we",
"found",
"that",
"both",
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"completely",
"inhibited",
"transcription",
"activated",
"by",
"nf-at",
",",
"nfil2",
"a",
",",
"nfil2",
"b",
"and",
"partially",
"inhibited",
"transcription",
"activated",
"by",
"nf",
"kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"inhibited",
"only",
"transcriptional",
"activation",
"that",
"was",
"dependent",
"on",
"Ca2+",
"mobilization",
"."
] | [
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"inhibited",
"only",
"transcriptional",
"activation",
"that",
"was",
"dependent",
"on",
"ca2+",
"mobilization",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"However",
",",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"did",
"not",
"inhibit",
"Ca2+",
"mobilization",
"dependent",
"expression",
"of",
"c-fos",
"mRNA",
"indicating",
"that",
"only",
"a",
"subset",
"of",
"signalling",
"pathways",
"regulated",
"by",
"Ca2+",
"is",
"sensitive",
"to",
"these",
"drugs",
"."
] | [
"however",
",",
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"did",
"not",
"inhibit",
"ca2+",
"mobilization",
"dependent",
"expression",
"of",
"c-fos",
"mrna",
"indicating",
"that",
"only",
"a",
"subset",
"of",
"signalling",
"pathways",
"regulated",
"by",
"ca2+",
"is",
"sensitive",
"to",
"these",
"drugs",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"we",
"did",
"not",
"observe",
"any",
"qualitative",
"differences",
"between",
"the",
"effect",
"of",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"on",
"six",
"different",
"transcription",
"factors",
"which",
"suggests",
"that",
"these",
"drugs",
"may",
"interfere",
"with",
"the",
"activity",
"of",
"a",
"novel",
"Ca2+",
"dependent",
"step",
"that",
"regulates",
"several",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"we",
"did",
"not",
"observe",
"any",
"qualitative",
"differences",
"between",
"the",
"effect",
"of",
"cyclosporin",
"a",
"and",
"fk506",
"on",
"six",
"different",
"transcription",
"factors",
"which",
"suggests",
"that",
"these",
"drugs",
"may",
"interfere",
"with",
"the",
"activity",
"of",
"a",
"novel",
"ca2+",
"dependent",
"step",
"that",
"regulates",
"several",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Up-regulation",
"of",
"high-affinity",
"dehydroepiandrosterone",
"binding",
"activity",
"by",
"dehydroepiandrosterone",
"in",
"activated",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"up-regulation",
"of",
"high-affinity",
"dehydroepiandrosterone",
"binding",
"activity",
"by",
"dehydroepiandrosterone",
"in",
"activated",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Although",
"evidence",
"indicates",
"that",
"dehydroepiandrosterone",
"(",
"DHEA",
")",
"exerts",
"direct",
"physiological",
"effects",
",",
"its",
"mechanism",
"of",
"action",
"remains",
"unknown",
"."
] | [
"although",
"evidence",
"indicates",
"that",
"dehydroepiandrosterone",
"(",
"dhea",
")",
"exerts",
"direct",
"physiological",
"effects",
",",
"its",
"mechanism",
"of",
"action",
"remains",
"unknown",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"DHEA",
"binding",
"sites",
"were",
"examined",
"using",
"a",
"whole-cell",
"binding",
"assay",
"in",
"a",
"human",
"T",
"lymphoid",
"cell",
"line",
",",
"PEER",
",",
"revealing",
"that",
"a",
"single",
"class",
"of",
"high-affinity",
"binding",
"sites",
"for",
"DHEA",
"(",
"dissociation",
"constant",
"=",
"7",
".",
"4",
"+/-",
"0",
".",
"53",
"nmol/L",
",",
"mean",
"+/-",
"SE",
",",
"n",
"=",
"4",
")",
"was",
"greatly",
"increased",
"when",
"treated",
"with",
"DHEA",
",",
"phorbol-12-myristate-13-acetate",
",",
"and",
"the",
"Ca2+",
"ionophore",
"A23187",
"."
] | [
"dhea",
"binding",
"sites",
"were",
"examined",
"using",
"a",
"whole-cell",
"binding",
"assay",
"in",
"a",
"human",
"t",
"lymphoid",
"cell",
"line",
",",
"peer",
",",
"revealing",
"that",
"a",
"single",
"class",
"of",
"high-affinity",
"binding",
"sites",
"for",
"dhea",
"(",
"dissociation",
"constant",
"=",
"7",
".",
"4",
"+/-",
"0",
".",
"53",
"nmol/l",
",",
"mean",
"+/-",
"se",
",",
"n",
"=",
"4",
")",
"was",
"greatly",
"increased",
"when",
"treated",
"with",
"dhea",
",",
"phorbol-12-myristate-13-acetate",
",",
"and",
"the",
"ca2+",
"ionophore",
"a23187",
"."
] | [
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Bound",
"[",
"3H",
"]",
"DHEA",
"was",
"displaced",
"sensitively",
"by",
"DHEA",
"and",
"secondarily",
"by",
"dihydrotestosterone",
",",
"but",
"not",
"effectively",
"by",
"other",
"steroids",
",",
"including",
"DHEA",
"sulfate",
"."
] | [
"bound",
"[",
"3h",
"]",
"dhea",
"was",
"displaced",
"sensitively",
"by",
"dhea",
"and",
"secondarily",
"by",
"dihydrotestosterone",
",",
"but",
"not",
"effectively",
"by",
"other",
"steroids",
",",
"including",
"dhea",
"sulfate",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"not",
"only",
"indicate",
"the",
"existence",
"of",
"a",
"DHEA",
"receptor",
",",
"but",
"also",
"suggest",
"that",
"T",
"cells",
"become",
"susceptible",
"to",
"regulation",
"by",
"DHEA",
"during",
"the",
"process",
"of",
"signal-induced",
"activation",
"."
] | [
"these",
"results",
"not",
"only",
"indicate",
"the",
"existence",
"of",
"a",
"dhea",
"receptor",
",",
"but",
"also",
"suggest",
"that",
"t",
"cells",
"become",
"susceptible",
"to",
"regulation",
"by",
"dhea",
"during",
"the",
"process",
"of",
"signal-induced",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Oncogene",
"amplification",
"correlates",
"with",
"dense",
"lymphocyte",
"infiltration",
"in",
"human",
"breast",
"cancers",
":",
"a",
"role",
"for",
"hematopoietic",
"growth",
"factor",
"release",
"by",
"tumor",
"cells",
"?"
] | [
"oncogene",
"amplification",
"correlates",
"with",
"dense",
"lymphocyte",
"infiltration",
"in",
"human",
"breast",
"cancers",
":",
"a",
"role",
"for",
"hematopoietic",
"growth",
"factor",
"release",
"by",
"tumor",
"cells",
"?"
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"One",
"hundred",
"six",
"primary",
"breast",
"cancer",
"samples",
"were",
"analysed",
"for",
"c-erbB2",
",",
"int-2",
",",
"and",
"c-myc",
"gene",
"amplification",
"."
] | [
"one",
"hundred",
"six",
"primary",
"breast",
"cancer",
"samples",
"were",
"analysed",
"for",
"c-erbb2",
",",
"int-2",
",",
"and",
"c-myc",
"gene",
"amplification",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Surgically",
"confirmed",
"nodal",
"involvement",
"was",
"observed",
"in",
"42%",
"."
] | [
"surgically",
"confirmed",
"nodal",
"involvement",
"was",
"observed",
"in",
"42%",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Level",
"of",
"gene",
"amplification",
"was",
"studied",
"by",
"Southern",
"and/or",
"slot",
"blot",
"techniques",
"."
] | [
"level",
"of",
"gene",
"amplification",
"was",
"studied",
"by",
"southern",
"and/or",
"slot",
"blot",
"techniques",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Amplified",
"c-erbB2",
"gene",
"sequences",
"were",
"present",
"in",
"21",
".",
"5%",
"of",
"all",
"samples",
"."
] | [
"amplified",
"c-erbb2",
"gene",
"sequences",
"were",
"present",
"in",
"21",
".",
"5%",
"of",
"all",
"samples",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Int-2",
"was",
"amplified",
"in",
"13",
".",
"1%",
"and",
"c-myc",
"was",
"amplified",
"in",
"10",
".",
"3%",
"."
] | [
"int-2",
"was",
"amplified",
"in",
"13",
".",
"1%",
"and",
"c-myc",
"was",
"amplified",
"in",
"10",
".",
"3%",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"a",
"non-parametric",
"test",
"(",
"Kruskal-Wallis",
")",
"a",
"strong",
"negative",
"association",
"was",
"found",
"between",
"high",
"levels",
"of",
"c-erbB2",
"amplification",
"and",
"absence",
"of",
"estrogen",
"receptor",
"(",
"ER",
")",
"(",
"P",
"=",
".",
"0009",
")",
"or",
"progesterone",
"receptor",
"(",
"PR",
")",
"(",
"P",
"=",
".",
"011",
")",
"expression",
"."
] | [
"in",
"a",
"non-parametric",
"test",
"(",
"kruskal-wallis",
")",
"a",
"strong",
"negative",
"association",
"was",
"found",
"between",
"high",
"levels",
"of",
"c-erbb2",
"amplification",
"and",
"absence",
"of",
"estrogen",
"receptor",
"(",
"er",
")",
"(",
"p",
"=",
".",
"0009",
")",
"or",
"progesterone",
"receptor",
"(",
"pr",
")",
"(",
"p",
"=",
".",
"011",
")",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"correlations",
"were",
"found",
"between",
"all",
"or",
"high",
"levels",
"of",
"amplification",
"of",
"each",
"oncogene",
"separately",
"or",
"combined",
"with",
"T",
",",
"N",
",",
"grade",
",",
"multifocality",
"of",
"tumor",
",",
"or",
"associated",
"carcinoma",
"in",
"situ",
"."
] | [
"no",
"correlations",
"were",
"found",
"between",
"all",
"or",
"high",
"levels",
"of",
"amplification",
"of",
"each",
"oncogene",
"separately",
"or",
"combined",
"with",
"t",
",",
"n",
",",
"grade",
",",
"multifocality",
"of",
"tumor",
",",
"or",
"associated",
"carcinoma",
"in",
"situ",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"was",
"a",
"trend",
"approaching",
"statistical",
"significance",
"for",
"patients",
"with",
"c-erbB2",
"amplifications",
"to",
"have",
"positive",
"lymph",
"nodes",
"at",
"surgery",
"(",
"P",
"=",
"0",
".",
"09",
")",
"."
] | [
"there",
"was",
"a",
"trend",
"approaching",
"statistical",
"significance",
"for",
"patients",
"with",
"c-erbb2",
"amplifications",
"to",
"have",
"positive",
"lymph",
"nodes",
"at",
"surgery",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"09",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"somewhat",
"surprising",
"finding",
"however",
"was",
"a",
"very",
"strong",
"association",
"between",
"oncogene",
"amplification",
"and",
"dense",
"lymphocyte",
"infiltration",
"of",
"the",
"tumor",
"(",
"P",
"=",
".",
"05",
")",
".",
"This",
"correlation",
"is",
"even",
"stronger",
"when",
"only",
"high",
"levels",
"of",
"amplification",
"are",
"considered",
",",
"either",
"for",
"each",
"oncogene",
"separately",
"(",
"P",
"=",
".",
"0048",
")",
"or",
"in",
"combination",
"(",
"P",
"=",
".",
"0007",
")",
"."
] | [
"a",
"somewhat",
"surprising",
"finding",
"however",
"was",
"a",
"very",
"strong",
"association",
"between",
"oncogene",
"amplification",
"and",
"dense",
"lymphocyte",
"infiltration",
"of",
"the",
"tumor",
"(",
"p",
"=",
".",
"05",
")",
".",
"this",
"correlation",
"is",
"even",
"stronger",
"when",
"only",
"high",
"levels",
"of",
"amplification",
"are",
"considered",
",",
"either",
"for",
"each",
"oncogene",
"separately",
"(",
"p",
"=",
".",
"0048",
")",
"or",
"in",
"combination",
"(",
"p",
"=",
".",
"0007",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"propose",
"that",
"malignant",
"cell",
"cytokine",
"production",
"may",
"help",
"explain",
"this",
"observation",
"."
] | [
"we",
"propose",
"that",
"malignant",
"cell",
"cytokine",
"production",
"may",
"help",
"explain",
"this",
"observation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Glucocorticoid",
"resistance",
"in",
"the",
"squirrel",
"monkey",
"is",
"associated",
"with",
"overexpression",
"of",
"the",
"immunophilin",
"FKBP51",
"."
] | [
"glucocorticoid",
"resistance",
"in",
"the",
"squirrel",
"monkey",
"is",
"associated",
"with",
"overexpression",
"of",
"the",
"immunophilin",
"fkbp51",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Squirrel",
"monkeys",
"are",
"neotropical",
"primates",
"that",
"have",
"high",
"circulating",
"cortisol",
"to",
"compensate",
"for",
"expression",
"of",
"glucocorticoid",
"receptors",
"(",
"GRs",
")",
"with",
"reduced",
"affinity",
"."
] | [
"squirrel",
"monkeys",
"are",
"neotropical",
"primates",
"that",
"have",
"high",
"circulating",
"cortisol",
"to",
"compensate",
"for",
"expression",
"of",
"glucocorticoid",
"receptors",
"(",
"grs",
")",
"with",
"reduced",
"affinity",
"."
] | [
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"low",
"binding",
"affinity",
"of",
"squirrel",
"monkey",
"GR",
"does",
"not",
"result",
"from",
"substitutions",
"in",
"the",
"receptor",
",",
"because",
"squirrel",
"monkey",
"GR",
"expressed",
"in",
"vitro",
"exhibits",
"high",
"affinity",
"."
] | [
"the",
"low",
"binding",
"affinity",
"of",
"squirrel",
"monkey",
"gr",
"does",
"not",
"result",
"from",
"substitutions",
"in",
"the",
"receptor",
",",
"because",
"squirrel",
"monkey",
"gr",
"expressed",
"in",
"vitro",
"exhibits",
"high",
"affinity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Rather",
",",
"squirrel",
"monkeys",
"express",
"a",
"soluble",
"factor",
"that",
",",
"in",
"mixing",
"studies",
"of",
"cytosol",
"from",
"squirrel",
"monkey",
"lymphocytes",
"(",
"SML",
")",
"and",
"mouse",
"L929",
"cells",
",",
"reduced",
"GR",
"binding",
"affinity",
"by",
"11-fold",
"."
] | [
"rather",
",",
"squirrel",
"monkeys",
"express",
"a",
"soluble",
"factor",
"that",
",",
"in",
"mixing",
"studies",
"of",
"cytosol",
"from",
"squirrel",
"monkey",
"lymphocytes",
"(",
"sml",
")",
"and",
"mouse",
"l929",
"cells",
",",
"reduced",
"gr",
"binding",
"affinity",
"by",
"11-fold",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"an",
"effort",
"to",
"identify",
"this",
"factor",
",",
"the",
"cellular",
"levels",
"of",
"components",
"of",
"the",
"GR",
"heterocomplex",
"in",
"SML",
"and",
"human",
"lymphocytes",
"(",
"HL",
")",
"were",
"compared",
"."
] | [
"in",
"an",
"effort",
"to",
"identify",
"this",
"factor",
",",
"the",
"cellular",
"levels",
"of",
"components",
"of",
"the",
"gr",
"heterocomplex",
"in",
"sml",
"and",
"human",
"lymphocytes",
"(",
"hl",
")",
"were",
"compared",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"immunophilin",
"FKBP51",
"was",
"13-fold",
"higher",
"in",
"SML",
"than",
"in",
"HL",
"cytosol",
";",
"FKBP52",
"in",
"SML",
"was",
"42%",
"of",
"that",
"in",
"HL",
"cytosol",
"."
] | [
"the",
"immunophilin",
"fkbp51",
"was",
"13-fold",
"higher",
"in",
"sml",
"than",
"in",
"hl",
"cytosol",
";",
"fkbp52",
"in",
"sml",
"was",
"42%",
"of",
"that",
"in",
"hl",
"cytosol",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O"
] |
[
"A",
"role",
"for",
"changes",
"in",
"immunophilins",
",",
"causing",
"glucocorticoid",
"resistance",
"in",
"neotropical",
"primates",
",",
"is",
"supported",
"by",
"the",
"following",
":",
"the",
"changes",
"in",
"FKBP51",
"and",
"FKBP52",
"were",
"observed",
"in",
"cells",
"from",
"other",
"neotropical",
"primates",
"with",
"glucocorticoid",
"resistance",
";",
"the",
"elevated",
"level",
"of",
"FKBP51",
"was",
"reflected",
"in",
"an",
"abundance",
"of",
"FKBP51",
"in",
"heat",
"shock",
"protein",
"90",
"complexes",
"in",
"SML",
";",
"when",
"cytosols",
"of",
"SML",
"and",
"L929",
"cells",
"were",
"mixed",
",",
"the",
"decrease",
"in",
"GR",
"binding",
"was",
"associated",
"with",
"incorporation",
"of",
"FKBP51",
"into",
"GR",
"heterocomplexes",
";",
"the",
"effect",
"of",
"SML",
"cytosol",
"on",
"GR",
"binding",
"was",
"reproduced",
"with",
"cytosol",
"from",
"COS",
"cells",
"expressing",
"squirrel",
"monkey",
"FKBP51",
";",
"and",
"both",
"the",
"effect",
"of",
"SML",
"cytosol",
"on",
"GR",
"binding",
"and",
"the",
"incorporation",
"of",
"FKBP51",
"into",
"GR",
"heterocomplexes",
"were",
"blocked",
"by",
"FK506",
"."
] | [
"a",
"role",
"for",
"changes",
"in",
"immunophilins",
",",
"causing",
"glucocorticoid",
"resistance",
"in",
"neotropical",
"primates",
",",
"is",
"supported",
"by",
"the",
"following",
":",
"the",
"changes",
"in",
"fkbp51",
"and",
"fkbp52",
"were",
"observed",
"in",
"cells",
"from",
"other",
"neotropical",
"primates",
"with",
"glucocorticoid",
"resistance",
";",
"the",
"elevated",
"level",
"of",
"fkbp51",
"was",
"reflected",
"in",
"an",
"abundance",
"of",
"fkbp51",
"in",
"heat",
"shock",
"protein",
"90",
"complexes",
"in",
"sml",
";",
"when",
"cytosols",
"of",
"sml",
"and",
"l929",
"cells",
"were",
"mixed",
",",
"the",
"decrease",
"in",
"gr",
"binding",
"was",
"associated",
"with",
"incorporation",
"of",
"fkbp51",
"into",
"gr",
"heterocomplexes",
";",
"the",
"effect",
"of",
"sml",
"cytosol",
"on",
"gr",
"binding",
"was",
"reproduced",
"with",
"cytosol",
"from",
"cos",
"cells",
"expressing",
"squirrel",
"monkey",
"fkbp51",
";",
"and",
"both",
"the",
"effect",
"of",
"sml",
"cytosol",
"on",
"gr",
"binding",
"and",
"the",
"incorporation",
"of",
"fkbp51",
"into",
"gr",
"heterocomplexes",
"were",
"blocked",
"by",
"fk506",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Regulation",
"of",
"GR",
"binding",
"by",
"FKBP51",
"represents",
"a",
"previously",
"unrecognized",
"mechanism",
"for",
"regulating",
"glucocorticoid",
"sensitivity",
"."
] | [
"regulation",
"of",
"gr",
"binding",
"by",
"fkbp51",
"represents",
"a",
"previously",
"unrecognized",
"mechanism",
"for",
"regulating",
"glucocorticoid",
"sensitivity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |