Datasets:

ascolda

/

ru_en_Crystallography_and_Spectroscopy

like 1

{ "ru": "Различить эти два типа ПВ можно при сравнении данных XAFS и мессбауэровской спектроскопии, поскольку время зондирования мессбауэровских измерений (10-8‒10-9 с) намного больше временнóго масштаба динамики электронов в твердых телах.", "en": "One can distinguish between these two MV types by comparing XAFS and Mössbauer spectroscopy data, because the probing time in Mössbauer measurements (10–8‒10–9 s exceeds greatly the time scale of electron dynamics in solids." }

{ "ru": "Принимая во внимание данные мессбауэровской спектроскопии, полагаем, что состояние ПВ европия в исследованных соединениях также неоднородно, и катионы Eu2+ и Eu3+ занимают различные кристаллографические позиции.", "en": "Taking into account the Mössbauer data, we suggest that the europium MV state in the compounds under study is also inhomogeneous, and Eu2+ and Eu3+ cations occupy different crystallographic sites." }

{ "ru": "Вейвлет-анализ позволяет построить 2D-корреляцию EXAFS-осцилляций одновременно в реальном (R) и импульсном (k) пространствах и разделить вклады легких и тяжелых элементов в ближайшие координационные сферы (КС).", "en": "The wavelet analysis makes it possible to construct a 2D correlation of EXAFS oscillations simultaneously in the real (R) and momentum (k) spaces and separate the contributions of light and heavy elements to the nearest coordination shells (CSs)." }

{ "ru": "Как видно, амплитуды модулей фурье-преобразования КС, состоящих из ионов металлов, следующих за первой кислородной сферой, практически исчезают после отжига при 750°С. Это свидетельствует об аморфизации структуры цирконатов и гафнатов при указанной температуре отжига.", "en": "It can be seen that the amplitudes of the Fourier transform moduli for the CSs consisting of metal ions, following the first oxygen shell, almost disappear after annealing at 750°С, thus indicating the amorphization of zirconate and hafnate structure at the aforementioned annealing temperature." }

{ "ru": "Следовательно, после отжига при 750°С степень аморфизации гафната европия выше, чем у цирконата и титаната европия (рис. 4г).", "en": "Therefore, the degree of amorphization of europium hafnate annealed at 750°С exceeds that for europium zirconate and titanate (Fig. 4d)." }

{ "ru": "При этом в отличие от приведенных выше данных для локального окружения переходных металлов на вейвлет-картах не видно каких-либо признаков проявления следующих после кислородной КС металлического окружения европия.", "en": "At the same time, in contrast to the above data on the local environment of transition metals, the wavelet maps exhibit no manifestations of the metal CSs of europium, next after the oxygen CS." }

{ "ru": "Изменение интенсивности представлено в виде цветовых оттенков.", "en": "The intensities are shown on a color scale." }

{ "ru": "Оно идет по линейной границе фаз, и в результате полного перехода IIIII напряжения и дефекты, полученные в кристаллах после перехода IIIII, полностью снимаются.", "en": "It occurs along the linear interface, and, as a result of the complete IIIII transition, the stresses and defects accumulated in crystals after the IIIII transition are completely removed." }

{ "ru": "На рис. 2 приведены фотографии, которые иллюстрируют рост кристалла модификации III с двумя зародышами, которые имеют линейную границу фаз.", "en": "Figure 2 shows photographs illustrating the growth of III-crystal with two nuclei, which have a linear phase boundary." }

{ "ru": "Расстояния между уровнями с разными проекциями момента определяются величиной внутрикристаллического поля .", "en": "The spacings between the levels with different moment projections are determined by the value of intracrystalline field Hcr." }

{ "ru": "Полную ширину ядерного уровня можно уменьшить за счет выбора кристаллического материала с низким значением коэффициента внутренней электронной конверсии :", "en": "The nuclear-level full width can be reduced by choosing a crystalline material with a small internal electron conversion coefficient α:" }

{ "ru": "Выражение (8) решает проблему определения электромагнитных полей в полости в общем случае.", "en": "Expression (8) solves the problem of determining electromagnetic fields in a cavity in the general case." }

{ "ru": "Эта проблема отсутствует при использовании специального типа ондуляторов, создающих циркулярную поляризацию излучения, имеющихся на некоторых станциях, например ID12 ESRF [6].", "en": "This problem is absent for undulators of special type, which produce circularly polarized radiation; such undulators are applied at several facilities, in particular, at ID12 ESRF [6]." }

{ "ru": "В антиферромагнетиках направление антиферромагнитной оси может быть определено с помощью XMLD (X-ray Magnetic Linear Dichroism) с использованием зависимости коэффициента поглощения от угла между вектором поляризации излучения и выделенным антиферромагнитной осью направлением [14].", "en": "The direction of the antiferromagnetic axis in antiferromagnets can be determined by the method of X-ray magnetic linear dichroism (XMLD) using the dependence of the absorption coefficient on the angle between the radiation polarization vector and the direction isolated by the antiferromagnetic axis [14]." }

{ "ru": "Измерение σσ'-, ππ'- и σπ'-компонент матрицы является обычным делом при исследовании «запрещенных» отражений при энергиях вблизи краев поглощения атомов [30, 31] (здесь σ, σ', π, π' – векторы линейных поляризаций падающего и дифрагированного излучения).", "en": "Measurement of the σσ', ππ', and σπ' matrix components is a conventional procedure when studying \"forbidden\" reflections at energies near the atomic absorption edge [30, 31] (here, σ, σ', π, π' are the linear-polarization vectors of the incident and diffracted radiation)." }

{ "ru": "Из выражения (3) следует, что круговой дихроизм в дифракционном отражении может присутствовать, только если в рассеянии присутствуют недиагональные члены, описывающие рассеяние с изменением поляризации.", "en": "It follows from expression (3) that CD may exist in diffraction reflection only if the scattering signal contains off-diagonal terms, which describe the scattering with a change in polarization." }

{ "ru": "При этом уменьшается протяженность структуры типа “штопор” вблизи гомеотропной границы ячейки.", "en": "In this case, the length of the \"screw\"-type structure near the homeotropic cell boundary decreases." }

{ "ru": "Спектральные свойства образцов измеряли с помощью оптоволоконного спектрометра AvaSpec-2048-USB2-UA.", "en": "The spectral properties of the samples were measured using an AvaSpec-2048-USB2-UA fiber spectrometer." }

{ "ru": "ХЖК-структура, сформированная в гибридной ячейке, также обладает брэгговским отражением, но по сравнению с планарной ячейкой ширина зоны увеличена, а края размыты.", "en": "The CLC structure formed in the hybrid cell also features Bragg reflection. However, in comparison with the planar cell, the band is wider and the edges are diffuse." }

{ "ru": "В этом случае появляется область поглощения красителя DCM с максимумом на длине волны 478 нм, что искажает спектральную форму стоп-зон (рис. 1б).", "en": "In this case, there arises a region of DCM dye absorption with a peak at 478 nm, which distorts the spectral shape of stop bands (Fig. 1b)." }

{ "ru": "Таким образом, генерация света в гибридной ячейке существует, как и в ячейке Гранжана, но она многомодовая в связи с более пологим склоном стоп-зоны в гибридной ячейке.", "en": "Thus, the light emission in the hybrid cell does exist, as in the case of the Grandjean cell, but it is multimode due to the more gentle slope of the stop band in the hybrid cell." }

{ "ru": "В этом случае конфигурация РОС такова, что существуют условия генерации для большего числа мод при заданной интенсивности накачки.", "en": "In this case, the DF configuration is such that the conditions for lasing of a larger number of modes at a given pump intensity are manifested." }

{ "ru": "Планарно-ориентирующее виртуальное покрытие (3) нанесено на нижнюю подложку.", "en": "The planar-aligning virtual coating 3 is deposited on the lower substrate." }

{ "ru": "Показатели преломления материала E7 при T = 20C и λ = 589.3 нм равны n|| = 1.747 и n⊥ = 1.522 (Δn = 0.225).", "en": "The refractive indices of the E7 material at T = 20C and λ = 589.3 nm are n|| = 1.747 and n⊥ = 1.522 (Δn = 0.225)." }

{ "ru": "Только при слабой энергии сцепления 0.02 мДж/м2 величина шага приближается к значению в планарно-планарной ячейке, т.е. к естественной величине р0 = 320 нм.", "en": "Only at a low anchoring energy of 0.02 mJ/m2, the pitch approaches the corresponding value for the planar–planar cell, i.e., the natural value р0 = 320 nm." }

{ "ru": "Также нельзя исключить, что этот серп принадлежит к Волго-Уральской группе, включающей в себя серпы с крюком и серпы с выделенным стержнем [3].", "en": "It also cannot be excluded that the sickle belongs to the Volga–Ural group, which includes sickles with a hook and sickles with an isolated rod [3]." }

{ "ru": "Элементный состав серпов.", "en": "Elemental composition of sickles." }

{ "ru": "Масс-спектрометрия с индуктивно-связанной плазмой и атомно-эмиссионная спектрометрия.", "en": "Inductively coupled plasma mass spectrometry and atomic-emission spectrometry." }

{ "ru": "Микроэлементный состав металла фрагмента серпа из пос. Чорелек 1 по данным МС-ИСП", "en": "Microelemental composition of the metal of the sickle fragment from the Chorelek 1 settlement, according to the ICP-MS data" }

{ "ru": "ЦП окисляет четыре иона Fe2+ и осуществляет четырехэлектронный перенос на кислород с образованием воды, препятствуя неферментативной реакции окисления железа, ведущей к появлению свободных радикалов, что делает его природным антиоксидантом.", "en": "CP oxidizes four Fe2+ ions and carries out four-electron transfer to oxygen with the formation of water, impeding non-enzymatic oxidation of iron (leading to the occurrence of free radicals), which makes it a natural antioxidant." }

{ "ru": "ЦП концентрировали до 80 мг/мл с помощью центрифужной ячейки Vivaspin 20 (для M > 100 кДа), трижды заменяя буферный раствор (0.1 M Hepes-NaOH, рН 7.5).", "en": "CP was concentrated to 80 mg/mL using a centrifuge cell Vivaspin 20 (for M > 100 kDa), changing three times the buffer solution (0.1 M Hepes-NaOH, рН 7.5)." }

{ "ru": "Несмотря на сходное значение коэффициента Мэтьюса разрешение структуры моноклинной формы ЦП человека значительно хуже.", "en": "Despite the close values of the Matthews coefficient, the structural resolution for the monoclinic modification of human CP is much worse." }

{ "ru": "Однако в данном случае, вероятно, сыграли роль меньший размер кристалла и его форма в виде тонкой пластины.", "en": "However, this is likely due to the smaller crystal size and its shape in the form of a thin plate." }

{ "ru": "Впервые в истории структурных исследований ЦП, несмотря на невысокое разрешение, для этой петли присутствует электронная плотность, позволяющая определить позиции Сα-атомов участка 884–892.", "en": "For the first time in the history of structural studies of CP, despite the low resolution, electron density was revealed for this loop, as a result of which the positions of the Сα atoms of fragment 884–892 could be determined." }

{ "ru": "Также это еще раз подтверждает что протокол, разработанный в [18], позволяет получать недеградированный ЦП.", "en": "This confirms again that the protocol developed in [18] makes it possible to obtain undegraded CP." }

{ "ru": "Конформация петли в моноклинном ЦП естественно не может точно соответствовать конформации этой петли в комплексе.", "en": "Obviously, the loop conformation in monoclinic CP cannot exactly correspond to the conformation of this loop in the complex." }

{ "ru": "Общая структура ЦП.", "en": "General CP structure." }

{ "ru": "Сравнение конформаций петли 882–894 в ЦП (пр. гр. I2) (показана стиками: атомы углерода показаны зеленым, кислорода – красным, азота – синим) и в комплексе ЦП–МПО (красный).", "en": "Comparison of the conformations of the 882–894 loop in CP (sp. gr. I2) (presented by sticks; carbon, oxygen, and nitrogen atoms are shown green, red, and blue, respectively) and in the CP–MPO complex (red)." }

{ "ru": "ИОННАЯ ПРОВОДИМОСТЬ КРИСТАЛЛОВ ФЛЮОРИТОВОГО ТВЕРДОГО РАСТВОРА СИСТЕМЫ PbF2–CdF2–MnF2", "en": "Ionic Conductivity of Crystals of Fluorite-type Solid Solution of the PbF2–CdF2– MnF2 System" }

{ "ru": "Обнаружено, что концентрационная зависимость dc(x) кристаллов (Pb0.67Cd0.33)MnxF2 является немонотонной.", "en": "The concentration dependence dc(x) of (Pb0.67Cd0.33)MnxF2 crystals is found to be nonmonotonic." }

{ "ru": "Соединения и твердые растворы на основе PbF2 представляют несомненный интерес как фтор-ионные твердые электролиты [1, 2].", "en": "Compound and solid solutions based on PbF2 are of undoubted interest as fluorine-ion solid electrolytes [1, 2]." }

{ "ru": "Фазовый состав и параметры элементарной ячейки полученных образцов определяли методом рентгенофазового анализа (РФА).", "en": "The phase composition and unit-cell parameters of the crystal samples were determined by X-ray diffraction (XRD) analysis." }

{ "ru": "где h – толщина кристалла, S – площадь электрода.", "en": "where h is the crystal thickness and S is the electrode area." }

{ "ru": "Параметры решетки флюоритовой фазы и ионная проводимость (dc) кристаллов PbCdxF2 и (Pb0.67Cd0.33)MnxF2 при комнатной температуре", "en": "Lattice parameters of the fluorite phase and ionic conductivity (dc) of PbCdxF2 and (Pb0.67Cd0.33)MnxF2 crystals at room temperature" }

{ "ru": "Видно, что за счет эффекта КФС усиливаются малые группы гармоник.", "en": "One can see that small groups of harmonics are amplified due to the QPM effect." }

{ "ru": "Например, на нижнем спектре рис. 1 усиленными являются гармоники, расположенные в окрестности энергий фотонов ~500, 1500, 2300 эВ, которые соответствуют рабочему диапазону SASE 3 XFEL.", "en": "For example, in the lower spectrum in Fig. 1, amplification is observed for the harmonics in the vicinity of photon energies ~500, 1500, and 2300 eV, which correspond to the SASE 3 XFEL operating range." }

{ "ru": "Максимумы пространственного распределения располагаются не на оси распространения импульса, что свидетельствует о деструктивной интерференции вкладов различных атомов среды.", "en": "The spatial distribution maxima deviate from the pulse propagation axis, which is indicative of destructive interference of contributions from different atoms of the medium." }

{ "ru": "Перед процессом кристаллизации ZnO подложки прогревали до температуры 600°C.", "en": "Before the ZnO crystallization, the substrates were heated to a temperature of 600°C." }

{ "ru": "Для обеих частей образца ее максимум находится на длине волны 383 нм (~3.24 эВ), а полуширина (ширина полосы на половине ее высоты) равна 24 нм (0.2 эВ).", "en": "For both parts of the sample, its maximum is at a wavelength of 383 nm (3.24 eV) and the half-width (FWHM) is 24 nm (0.2 eV)." }

{ "ru": "Исследованы фотолюминесцентные свойства полученной структуры как при низкоинтенсивном непрерывном уровне возбуждения, так и при относительно мощном импульсном лазерном возбуждении, показана их слабая вариабельность в зависимости от удаленности зон образца от источника цинка при синтезе, что подтверждает в целом хорошую однородность оптических свойств образца.", "en": "The photoluminescent properties of the synthesized structure were studied both at a low-intensity cw excitation level and upon relatively high-power pulsed laser excitation. Their weak dependence on the distance of sample zones from the zinc source during the synthesis was shown, which confirmed the generally good uniformity of the sample optical properties." }

{ "ru": "Особое внимание уделяется экспериментальной реализации метода рентгеновской спектроскопии поглощения для измерений на поверхности жидкости.", "en": "Particular attention is paid to the experimental implementation of X-ray absorption spectroscopy (XAS) for measurements on liquid surfaces." }

{ "ru": "Особый интерес представляет применение метода рентгеновской спектроскопии поглощения в исследованиях белковых двумерных комплексов на поверхности жидкости [6, 7].", "en": "Of particular interest is the application of XAS in studies of two-dimensional protein complexes on a liquid surface [6, 7]." }

{ "ru": "В настоящем обзоре обсуждаются возможности экспериментальной станции “Ленгмюр” Курчатовского источника синхротронного излучения для реализации исследований на жидкости с использованием двух спектрально-селективных методик: метода СРВ и рентгеновской спектроскопии поглощения.", "en": "In this review we consider the possibilities of the “Langmuir” beamline of the Kurchatov Synchrotron Radiation Source (KSRS) for implementing studies on liquid surfaces using two spectral-selective techniques: the XSW method and XAS." }

{ "ru": "В таких экспериментах первичный пучок падает на поверхность жидкости под скользящим углом менее критического угла ПВО, что ограничивает глубину проникновения излучения в жидкую субфазу.", "en": "In these experiments a primary beam falls on a liquid surface at a grazing angle less than the TER critical angle, which limits the radiation penetration depth into the liquid subphase." }

{ "ru": "Отличительной чертой СРВ в угловой области ПВО является обратно пропорциональная зависимость периода от угла .", "en": "A distinctive feature of XSW in the TER angular range is the inversely proportional angular dependence of the wave period." }

{ "ru": "Важным фактором, влияющим на проникновение наночастиц через альвеолярно-капиллярную мембрану в легких, является первичный контакт с легочным сурфактантом, покрывающим внутренние стенки альвеол и бронхов.", "en": "An important factor affecting the penetration of nanoparticles through the alveolar-capillary membrane in the lungs is the primary contact with the pulmonary surfactant covering the inner walls of alveoli and bronchi." }

{ "ru": "Он активирует альвеолярные макрофаги, стимулирует механизм очистки поверхности бронхов и альвеолярного эпителия (мукоциллиарный клиренс), адсорбирует на своей поверхности и агрегирует некоторые бактерии и вирусы [22].", "en": "It activates alveolar macrophages, stimulates the mechanism of cleaning the surface of bronchi and alveolar epithelium (mucociliary clearance), and adsorbs and aggregates some bacteria and viruses on its surface [22]." }

{ "ru": "Молекулы фосфолипидов в легочном сурфактанте располагаются в виде упорядоченного мономолекулярного слоя на жидкости, покрывающей гликокалекс на поверхности альвеол.", "en": "Phospholipid molecules in pulmonary surfactant are arranged into an ordered monomolecular layer on the fluid covering the glycocalex on the alveoli surface." }

{ "ru": "Для проведенных исследований был выбран Сурфактант БЛ – немодифицированный природный препарат, содержащий весь набор липидов нативного легочного сурфактанта (включая минорные липидные составляющие), а также связанные с сурфактантом гидрофобные белки [25].", "en": "Surfactant BL was chosen for studies. This is an unmodified natural preparation, containing the entire set of lipids of native pulmonary surfactant (including minor lipid components), as well as related hydrophobic proteins [25]." }

{ "ru": "Рентгеновские измерения начинали через 1 ч после завершения электрораспыления.", "en": "X-ray measurements were started 1 h after the end of electrospraying." }

{ "ru": "На рис. 3 представлена угловая зависимость выхода Au-флуоресценции, а также угловая зависимость выхода флуоресценции от атомов фосфора, присутствующих в полярных группах молекул фосфолипидов в монослое Сурфактанта-БЛ.", "en": "Figure 3 shows the angular dependence of Au fluorescence yield and the angular dependence of fluorescence yield from the phosphorus atoms present in the polar groups of phospholipid molecules in the Surfactant BL monolayer." }

{ "ru": "Важно отметить, что проведенные измерения позволили выявить характерные временные масштабы, определяющие проникновение гидрофильных наночастиц Au в монослой легочного сурфактанта.", "en": "It is important that these measurements made it possible to reveal the characteristic time scales determining the penetration of hydrophilic Au nanoparticles into the lung surfactant monolayer." }

{ "ru": "Кроме того, большое значение имеет возможность получать информацию о некристаллических белковых наносистемах в условиях, приближенных к физиологическим условиям функционирования белковых макромолекул.", "en": "In addition, the possibility of obtaining information about noncrystalline protein nanosystems under conditions close to the physiological conditions for protein macromolecules functioning is also of great importance." }

{ "ru": "В настоящем разделе представлены результаты исследований, посвященных изучению локальной геометрии ионов церия, адсорбированных под монослоем жирной кислоты.", "en": "In this section we present the results of the studies devoted to the local geometry of cerium ions adsorbed under a fatty acid monolayer." }

{ "ru": "Анализ полученных экспериментальных данных показал, что выход флуоресценции от церия представляет собой сумму двух вкладов: от ионов, присутствующих в тонком слое у поверхности (рис. 5, кривая 2), и ионов, равномерно распределенных в объеме водной субфазы (рис. 5, кривая 3).", "en": "An analysis of the experimental data showed that the cerium fluorescence yield is the sum of two components: one from the ions present in the thin layer near the surface (Fig. 5, curve 2) and the other from the ions uniformly distributed over the aqueous subphase bulk (Fig. 5, curve 3)." }

{ "ru": "Толщина и положение этого слоя были определены исходя из наилучшего совпадения расчетных кривых с экспериментальными данными.", "en": "The thickness and position of this layer were determined proceeding from the best coincidence between the calculated curves and experimental data." }

{ "ru": "Для определения изменений в локальном атомном окружении металла был проведен анализ протяженной части рентгеновского спектра поглощения.", "en": "To determine the changes in the local atomic environment of metal, the extended part of X-ray absorption spectrum was analyzed." }

{ "ru": "Как видно из рис. 6в, расчеты хорошо согласуются с экспериментальными данными.", "en": "As can be seen in Fig. 6c, the calculation results agree well with the experimental data." }

{ "ru": "Анализ EXAFS-спектров, полученных для монослоя арахиновой кислоты, сформированного на растворе нитрата церия, был выполнен с использованием той же модели, что и для водного раствора нитрата церия.", "en": "The EXAFS spectra obtained for the arachidic acid monolayer formed on a cerium nitrate solution were analyzed using the same model as for the aqueous solution of cerium nitrate." }

{ "ru": "ОБРАЗЦЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЙ И МЕТОДИКА ЭКСПЕРИМЕНТА", "en": "EXPERIMENTAL" }

{ "ru": "Согласно [5] для кристаллов CaF2, активированных ионами Y и Lu, в отличие от кристаллов, активированных другими ионами редкоземельного ряда, превращения фотохромных РС-центров в РС+-центры при рентгеновском облучении наблюдаются лишь при низкой температуре.", "en": "According to [5], for the CaF2 crystals activated with Y and Lu ions, in contrast to the crystals activated with other rare-earth ions, the transformation of photochromic PC centers into РС+ centers under X-ray irradiation was observed only at low temperature." }

{ "ru": "Анализ спектров по указанной схеме позволяет дать ответ, какого типа фотохромные ЦО изначально формируются в спектрах облученных кристаллов – РС или РС+.", "en": "An analysis according to the aforementioned scheme makes it possible to answer the question to what type (РС or РС+) the photochromic CCs initially formed in the spectra of irradiated crystals belong." }

{ "ru": "Известно [1, 4], что с увеличением доли трифторида RF3 в твердых растворах MеF2–RF3 образуются более крупные кластер-дефекты, в частности кластеры типа R4F23 и R6F36–37, в составе которых присутствуют многочисленные виды дефектов (катионы с избыточными положительными зарядами, междоузельные ионы фтора, анионные вакансии).", "en": "It is known [1, 4] that an increase in the fraction of RF3 trifluoride in MеF2–RF3 solid solutions leads to the formation of larger cluster defects, in particular, clusters of the R4F23 and R6F36–37 types. These clusters contain defects of numerous types (cations with excess positive charge, interstitial fluorine ions, and anion vacancies)." }

{ "ru": "СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ГРАНИЦЫ МЕЖДУ МОНОМЕРАМИ В ДИМЕРЕ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГИСТОНОПОДОБНЫХ БЕЛКОВ HU МЕТОДОМ MM-GBSA", "en": "Comparative Analysis of the Interfaces between Monomers in the Dimers of Bacterial Histone-Like HU Proteins by the MM-GBSA Method" }

{ "ru": "ДНК-связывающие гистоноподобные HU-белки бактерий являются наиболее распространенными и высоко представленными нуклеоид-ассоциированными белками бактерий и потенциальными терапевтическими мишенями [7–9].", "en": "Bacterial histone-like DNA-binding HU proteins are the most abundant and highly conserved nucleoid-associated proteins in bacteria and are considered as potential therapeutic targets [7–9]." }

{ "ru": "Использовали силовое поле ff14SB, обеспечивающее высокую точность моделирования боковых цепей аминокислотных остатков [23], и модель воды TIP3P, подходящую для использования с силовым полем ff14SB.", "en": "The calculations were carried out in the ff14SB force field, which provides high accuracy of modeling of amino-acid side chains [23], using the TIP3P water model suitable for use with the ff14SB force field." }

{ "ru": "Из графиков на рис. 2 и 3 видно, что радиусы инерции во всех системах находятся в диапазоне от 1.9 до 2.2 нм.", "en": "As is seen in the plots shown in Figs. 2 and 3, the radii of gyration in all systems are in the range from 1.9 to 2.2 nm." }

{ "ru": "В табл. 4 представлены расчетные ΔGдим для четырех HU-белков дикого типа и трех мутантов HUSpM, а также взятые из литературных источников Tпл, измеренные с помощью ДСК.", "en": "Table 4 presents the calculated ΔGdim values for four wild-type HU proteins and three mutants of HUSpM and also the literature data on the Tm values measured by DSC." }

{ "ru": "В то же время у термоустойчивого HUSpM, у которого два тепловых перехода, связанные с плавлением границы раздела, происходят при температурах 74.5 и 84.3С, выигрыш свободной энергии при формировании димера составляет около –180 ккал/моль.", "en": "Meanwhile, the free energy change of dimer formation of thermostable HUSpM, which shows two thermal transitions associated with the melting of the interface at 74.5 and 84.3С, is about –180 kcal/mol." }

{ "ru": "Работа выполнена при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 20-04-01001) в части моделирования, МД-экспериментов и термодинамических расчетов.", "en": "This study was financially supported by the Russian Foundation for Basic Research (project no. 20-04-01001 supporting molecular modeling calculations, MD simulations, and thermodynamic calculations)." }

{ "ru": "Мономер A показан поверхностью, на которой область, доступная растворителю, окрашена серым цветом, а область, участвующая в формировании границы между мономерами, окрашена в соответствии с электростатическим потенциалом: незаряженная поверхность обесцвечена, а максимальному заряду соответствует максимальная интенсивность окраски.", "en": "The monomer A is represented by a surface, in which the solvent-accessible area is highlighted in gray and the surface involved in the interface between monomers is colored according to the electrostatic potentials: the uncharged surface is colorless and the highest color intensity corresponds to the highest charge." }

{ "ru": "СКФ, вычисленные для остатков разных мономеров, показаны серым и черным цветом.", "en": "The root-mean-square fluctuations calculated for residues of different monomers are given in gray and black." }

{ "ru": "Боковая группа Y69 не имеет электронной плотности, что может говорить о ее относительной подвижности.", "en": "There is no electron density for the side chain of Y69, which may be indicative of its relatively high mobility." }

{ "ru": "Боковая группа остатка Y69 триплета имеет слабо выраженную электронную плотность, не позволяющую однозначно задать ей определенную конформацию, что может свидетельствовать об относительной подвижности этой группы в структуре mRubyFTS148F.", "en": "A weak electron density for the side chain of the residue Y69 of the triad has makes it impossible to unambiguously assign a definite conformation to this moiety and may be indicative of its relatively high mobility in the mRubyFTS148F structure." }

{ "ru": "Фолд белка показан в виде ленточной модели с окраской по элементам вторичной структуры: а – остатки хромофоробразующего триплета показаны розовым, Polder-карта для хромофоробразующего триплета и остатка F148 показана серой поверхностью на уровне срезки 3σ; б – электронная плотность для карбоксильного кислорода отмечена голубым кружком.", "en": "The protein fold is shown in a ribbon representation colored according to the secondary structure elements: (a) the residues of the chromophore-forming triad are pink, the polder map for the chromophore-forming triad and the residue F148 is represented by a gray mesh contoured at 3σ; (b) the electron density for the carboxyl oxygen atom is enclosed in a blue circle." }

{ "ru": "ПОЛУЧЕНИЕ, КРИСТАЛЛИЗАЦИЯ И ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЕ РЕНТГЕНОВСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ РЕКОМБИНАНТНОГО АЛЛЕРГЕНА Der p 3 ИЗ КЛЕЩА ДОМАШНЕЙ ПЫЛИ Dermatophagoides pteronyssinus", "en": "Preparation, Crystallization, and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of Recombinant House Dust Mite Allergen Der p 3 from Dermatophagoides Pteronyssinus" }

{ "ru": "Для амплификации гена аллергена Der p 3 были синтезированы олигонуклеотидные праймеры (Der-forward 5'-GGTGGTCATATGAATCCAATTCTACCAGCATCACC-3' и Der-reverse 5'-GGTGGTCTCGAGCTGTGACGTTTTGATTTCAATCCAA-3'), подобранные на основании последовательности мРНК из банка данных (LOC113796035).", "en": "The oligonucleotide primers (Der-forward 5'-GGTGGTCATATGAATCCAATTCTACCAGCATCACC-3' and Der-reverse 5'-GGTGGTCTCGAGCTGTGACGTTTTGATTTCAATCCAA-3') for the amplification of the allergen Der p 3 gene were synthesized based on the mRNA reference sequence from the database (LOC113796035)." }

{ "ru": "Обработку набора экспериментальных интенсивностей отражений проводили с помощью программы iMosflm [15].", "en": "The X-ray intensity data were processed with the iMosflm program [15]." }

{ "ru": "Кроме того, особенности структуры белка BmCBP, установленной в , позволяют предположить, что BmCBP может связывать и переносить широкий спектр различных соединений, однако набор известных лигандов, связываемых с BmCBP, остается достаточно ограниченным (лютеин, зеаксантин, астаксантин и кантаксантин) и требует дальнейших исследований.", "en": "Besides, the structural features of the protein BmCBP determined in suggest that BmCBP can bind and transport a wide range of various compounds. However, the range of the known ligands bound to BmCBP is rather small (lutein, zeaxanthin, astaxanthin, and canthaxanthin) and this issue requires further studies." }

{ "ru": "Белок BmCBP (68-297 ао; Uniprot ID: Q8MYA9), содержащий N-концевой гексагистидиновый таг, экспрессировали в клетках E. coli штамма C41 (DE3) в течение ночи при +20°C в среде LB, содержащей 0.1 мМ ИПТГ, как это описано в .", "en": "The protein BmCBP (68-297 residues; Uniprot ID: Q8MYA9) containing the N-terminal hexahistidine tag was expressed in the E. coli C41 (DE3) strain overnight at 20°C in LB medium supplemented with 0.1 mM IPTG, as described in ." }

{ "ru": "Проводили лизирование клеточной суспензии ультразвуком.", "en": "The cell suspension was lysed by ultrasound." }

{ "ru": "После проведения хроматографии измеряли значение Rf для каждого каротиноида.", "en": "After the chromatography, the Rf values were measured for all carotenoids." }

{ "ru": "Получение холоформы BmCBP.", "en": "Preparation of Holo BmCBP" }

{ "ru": "Обработку дифракционных данных проводили с помощью программ XDS и XSСALE .", "en": "The X-ray diffraction data were processed using the XDS and XSСALE programs ." }

{ "ru": "Как было неоднократно показано ранее, подобный спектральный сдвиг однозначно говорит о факте связывания каротиноида с водорастворимым белком .", "en": "As demonstrated in many studies, this spectral shift is definitely indicative of the binding of carotenoid to a water-soluble protein ." }

{ "ru": "Другая ситуация обнаружена в в структуре гомолога BmCBP – белка STARD3 человека (29% идентичности), в котором остаток аргинина, соответствующий R185 в составе BmCBP, частично входил в лигандсвязывающую полость, уменьшая ее объем.", "en": "This differs from the structure of the human protein homologous to BmCBP (29% identity). In the structure of STARD3, an arginine residue corresponding to R185 in BmCBP is partially involved in the ligand-binding pocket, thereby decreasing its volume." }

{ "ru": "На врезках изображен цвет этих препаратов; б – спектры поглощения комплексов BmCBP с CRT-416 и зеаксантином (ZEA).", "en": "The inserts show the color of these preparations; (b) absorption spectra of BmCBP in complexes with CRT-416 and zeaxanthin (ZEA)." }

{ "ru": "При моделировании кристаллической структуры определяется иерархическая последовательность ее самосборки в кристаллографическом пространстве XYZ, т.е. восстанавливается симметрийно-топологический код формирования макроструктуры в виде последовательности значимых элементарных событий, характеризующих самую короткую (быструю) программу конвергентной кластерной самосборки.", "en": "Modeling of a crystal structure implies determination of the hierarchical sequence of its self-assembly in the XYZ crystallographic space (i.e., the symmetry and topology code of macrostructure formation is reconstructed in the form of a sequence of significant elementary events, characterizing the shortest (most rapid) program of convergent cluster self-assembly)." }

{ "ru": "Центр кластера-прекурсора находится в общей позиции 8d (0.29, 0.42, 0.71).", "en": "The precursor cluster center is located at the shared 8d site (0.29, 0.42, 0.71)." }

{ "ru": "Каркас структуры S33 формируется при связывании двух слоев вдоль оси Y.", "en": "The framework of structure is formed as a result of bonding of two layers along the Y axis." }