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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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PMC7369657
After 4 and 12 weeks of gastric perfusion, CQD-treated mice and untreated mice were sacrificed, and blood was collected for serum biochemistry assays and a complete blood panel test.
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PMC9429973
In univariate analyses, both CRP >8mg/l and albumin <40 g/l were associated with a higher risk of death (HR 3.85, 95% CI 1.85-8.0, p<0.001 and HR 2.49, 95% CI 1.13-5.49, p=0.024).
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PMC5925824
Volcano plots show Log2 fold change of gene expression (E) or cytokine levels (F) in the LY3300054 treated group compared to control group.
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PMC9516401
In conclusion, our findings suggested for the first time that the hydroalcoholic extracts of P. vulgaris, C. colocynthis, and P. oleracea might have a suppressive impact on the expression and the activity of IDE.
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PMC11001582
Further research is needed to parse this difference and its relevance, but it is noteworthy that cortical hyperexcitability is well described in both C9 and non-C9 ALS/FTD patients, indicating that new mechanistic insights into this early patient-relevant phenotype can be gained by future investigations in our polyGR mice.
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PMC10975211
Nonetheless, emerging evidence underscores the collaboration between the endoplasmic reticulum (ER) and mitochondria in signaling cell death.
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PMC11377827
Given that USP43 levels perturbed the kinetics of the abundance of HIF-1α on chromatin, we next determined if this altered the binding of HIF-1α to known target gene loci in HeLa cells.
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PMC9429973
Expression of CD38 and NKG2D ligands (MICA and MICB) after tinostamustine treatment was evaluated by FCM, WB and qPCR.
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PMC11687167
PCSK9 plays an important role in both infectious and noninfectious inflammatory diseases.
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PMC11791264
To understand the role of SETD7 in OC progression, we first examined the expression of SETD7 protein in OC cell lines.
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PMC9429973
Cytarabine resistant cells (AraC-R) were obtained by treating them during several weeks with increasing doses of cytarabine.
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PMC11515150
CAR-T cells against B-cell malignancies have been proven highly effective and broadly tolerable [37–39].
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PMC9429973
Median age at diagnosis was 53.3 years (range: 14.6-95.1) and 53% were males.
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PMC10808409
Significance from Caco-2 cells (untreated) at P < 0.0001.
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PMC11746948
The median (0, Q2, 50th percentile) is represented by a line inside the box, dividing the data into two halves.
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PMC11116779
p-values are expressed as p ≤ 0.0001, p ≤ 0.001, p ≤ 0.01, and p ≤ 0.05 vs. untreated cells (CTR).
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PMC11291490
Therefore, new TMUV vaccines with efficiency and easy transportation are needed to be further developed.
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PMC11126803
Interestingly, in other types of tumors, it has been reported that ERβ promotes the progression of tumors, including prostate cancer and RCC (1, 17, 23, 24, 25).
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PMC11745600
All male and female Ins1 NOG mice exhibited persistent severe hyperglycemia as early as 4 wk of age (Figure 2A and B).
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PMC3681794
Clones were selected for significant reduction in luciferase expression.
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PMC11621493
Assays were performed in the absence of CaCl2 and lipids were analyzed by HPLC-MS.
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PMC11753949
This paper does not report original code.
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PMC11674834
The main objective of the current study was to assess whether 3,4-DMA was genotoxic in CHO cells expressing human CYP1A2 and NAT1.
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PMC3915447
They also provide an aqueous interior space for incorporation of various bioactive macromolecules such as proteins.
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PMC11078693
Scale bar is 2 μm.
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PMC11587606
These experiments were repeated two times under identical conditions.
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PMC10914904
In addition to type I IFN production, the presence of cytoplasmic-viral dsRNA can trigger other pathways that are important for antiviral defense.
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PMC11767582
Thus, the more active compounds in our study displayed IC50 values in the nanomolar range for the tumor cell lines but not for the normal cells.
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PMC5308810
This is because using a cytotoxic agent and CXCR4-KLA together could simultaneously eliminate both chemo-sensitive and drug–resistant cancer cells.
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PMC11621493
Cells were washed again 3 × 10 min with PBS and subsequently covered with VECTASHIELD® Antifade Mounting Medium (H-1000, Vector Laboratories Inc, Newark) supplemented with 1 μg/ml DAPI.
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PMC9429973
T. Tzenou, A. Roumelioti, N. El Gkotmi, P. Christoforou, N.-E. Loutsidi, A. Apsemidou, I. Tzannou, T. Ioannis, C. Giatra, F. Karaolidou, Z. Mellios, B. Maria, S. Gigantes, I. Baltadakis, D. Karakasis BMT-UNIT, EVAGGELISMOS GENERAL HOSPITAL, ATHENS, Greece Background: Angioimmunobastic Lymphoma (AITL) and T-γδ-hepatosplenic lymphomab(HSTCL) consist two rare, aggressive T-NHL subtypes while patients with Mycosis Fungoides/Sézary (MF/SS) syndrome may have a more indolent disease course but are rarely cured with conventional therapy.
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PMC8481254
Among numerous changes in the phenotypes of tumor phenotype, O-GlcNAcylation is only one part.
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PMC9046263
Bright-field images were acquired using a Leica SP8 confocal microscope (40X magnification, far red = 635 nm, green = 488 nm).
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PMC11607638
Relative quantification was analyzed by 2 method.
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PMC11509278
3α-DIOL and ADT are then converted into two inactive and easily excreted 3α-DIOL-17 glucuronide (3α-DIOL-17G) and ADT-3 glucuronide (ADT-3G).
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PMC11394730
Piperine-based treatments may become a standard part of the management of cancer, but further studies are needed to understand the specific molecular targets and pathways influenced by piperine, as well as an assessment of its efficacy and safety .
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PMC9118379
Evaluation of 320 variant PSMs at the peptide and variant event levels.
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PMC9429973
Despite being favorable, up to 30-50% of patients with CBF-AML eventually relapse.
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PMC11049294
In one clone, where GLA could not be detected, a further aliquot was thawed and DNA was extracted using the QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany).
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PMC10589262
This analysis showed that the endogenous MT-KIT bound to both P85 and GRB2 (Fig. 2C).
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PMC11345828
Following the cross coupling, the nitrogen of indole intermediate 36 was alkylated with methyl iodide under basic conditions.
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PMC8973725
After washing, the blots were incubated with horseradish peroxidase-conjugated secondary antibodies for 1 h at room temperature and visualized using a super-enhanced chemiluminescence chromogenic substrate (Applygen, Beijing, China).
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PMC9844987
Resulting p-values were FDR-adjusted according to the total number of promoters or decomposed promoters tested genome-wide within the MatrixEQTL R package.
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PMC3765139
Results of Poisson’s distribution with the frequency of proliferating cells in CD133+ (black column) and CD133- (white column) D10 cells, results expressed as mean percentages ± SD; (*) = p ≤ 0.001.
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PMC11269933
Finally, three independent 1000 ns atomistic molecular dynamics simulations were conducted under the isothermal-isobaric ensemble, using periodic boundary conditions.
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PMC11583010
Membranous staining progressively decreased after 96 hours.
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Arrowheads indicate double-positive cells.
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PMC5535901
Jurkat cells were plated in T75 flasks at a cell density of 0.3 × 10 /mL overnight.
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PMC11745823
The SI is classified as 0, 1, 2, 3 and 4, which denotes negative, mild, moderate, strong and very strong staining, respectively.
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PMC11470999
injection.
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PMC11759543
We combined a fixed dose of vorinostat (2 μM) with three different dosages of doxorubicin to determine the optimal combination dose (Fig. 1E).
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PMC11763126
2CBDP1 inhibits ccRCC proliferation.
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PMC11593084
A significant reduction was observed in the PC-10 xenograft on days 22 (p < 0.01), 26 (p < 0.01), and 28 (p < 0.01) (Figure 5B).
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PMC3681794
However changes in apoptotic proteins can be independent of HIF-1 , , and in several cell types hypoxia-induced drug resistance is only partially reversed by HIF-1 inhibition suggesting the existence of HIF-1 independent mechanisms of drug resistance. ,
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PMC10810426
Significance was determined by 2-way ANOVA (Tukey’s multiple comparison test). *
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PMC11779605
Ovarian cancer metastases and recurrences primarily disseminate through the peritoneum, where accumulation of ascitic fluid is a common occurrence with increasing frequency with more advanced cancer stages.
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PMC11451940
The presence of the corresponding organic ligands in complexes 1–7 can be seen from the characteristic absorption bands observed in the infrared spectra around 3060, 2870, 2850, 1650, 1590, and 1430 cm, which can be attributed to the stretching vibrations of ν(CH)ar, ν(CH2)aliph, ν(CH3)aliph, ν(C <svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" version="1.0" width="13.200000pt" height="16.000000pt" viewBox="0 0 13.200000 16.000000" preserveAspectRatio="xMidYMid meet"><metadata> Created by potrace 1.16, written by Peter Selinger 2001-2019 </metadata><g transform="translate(1.000000,15.000000) scale(0.017500,-0.017500)" fill="currentColor" stroke="none"><path d="M0 440 l0 -40 320 0 320 0 0 40 0 40 -320 0 -320 0 0 -40z M0 280 l0 -40 320 0 320 0 0 40 0 40 -320 0 -320 0 0 -40z"/></g></svg> O), ν(C–N)ar, and ν(C–C)ring, respectively.
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PMC6889484
No detectable virus was measured in 100% CEM/D128K cells. (
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PMC11437637
This study was approved by the ethics committee of the First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University and adhered to the principles of the Declaration of Helsinki.
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PMC9429973
A. Chanan-Khan, T. Liu, K. Yang, A. Cohen, K. Fahrbach, J. Campbell, B. Tang Mayo Clinic, Jacksonville; Beigene USA, San Mateo; Evidera, Lexington, United States of America Background: Zanubrutinib, a next-generation Bruton’s tyrosine kinase inhibitor (BTKi), demonstrated superior overall response rate and a trend toward improved progression-free survival (PFS) as compared to ibrutinib in patients with relapsed or refractory (R/R) chronic lymphocytic leukemia (CLL) in the phase 3 ALPINE trial (NCT03734016) based on interim analysis.
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PMC11609529
The YM fusion in ovarian cancer ES-2 cells comprises two functional domains: YAP1 (1–328 aa) and MAML2 (172–1153 aa).
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PMC11484188
miR-1343-3p mimic, inhibitor and pre-miR-scrambled (Scr) were obtained from Shanghai GenePharma Co., Ltd. (Table I).
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PMC9341513
We previously showed that the method gives good predictions of both population level data (e.g., Hi-C or 4C) and single-cell measurements (e.g., from fluorescence microscopy) (Buckle et al. 2018).
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Then, 10 µL MTT solution (5 mg/mL) (Merck, USA) was added to the 96-well culture plates, and cells were incubated for 3 h at 37°C, 5% CO2.
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H and C NMR (for JC-2) spectroscopies were performed using a 250 MHz Bruker Electrospin spectrometer in CDCl3.
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d Principal component analysis revealed significant differences in protein expression between ADSC-EVs and AT-EVs.
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ABC transporter inhibition leads to an intracellular accumulation of these fluorescence dyes.
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GLI1 and GLI2 mRNA expression were quantified in human cancer cell lines (U87MG, T98G, SK-MES-1 and H1437) using TaqMan qRT-PCR as described above.
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EWS–WT1 is a determinant of DSRCT cells’ sensitivity to PARPi and ATRi.
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Epstein-Barr virus is widespread across the globe and is associated with a variety of human diseases.
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The short in vivo persistence remains a challenge for universal CAR-T cells.
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Cisplatin affects the immune cells in the tumor cells and conversely, immune cells aid in the development of cisplatin resistance through complex mechanisms.
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The dicarbollide C atoms were arranged in a nearly gauche conformation with a (C1–C2–C1′–C2′) torsion angle of 38.94(16)°.
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These findings provide valuable information for in-depth understanding of the relationship between snails and environmental microorganisms.
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Another important point is the evaluation of the safety of herbal products.
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Pts were subsequently treated by different regimens of systemic therapy (DT in 12 cases, MPT in 3 cases and VTD in 3 cases).
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These findings validated the effective silencing of the CASP8AP2 gene in 60% of the clones, further confirmed through sequencing (Fig. 4).
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Cell migration was assessed after treatment with different concentrations of cetuximab (0, 10, 50, 100, 200, 300 μg/ml) for 48 h, and changes in migration size were observed with an inverted microscope.
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Defining the ablative region within a cryolesion can be complicated as the primary modes and mechanisms of cell death vary following exposure to different temperatures .
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These results were further corroborated in disseminated PDX AML model, showing complete clearance of DNMT3A and NPM1 mutation- positive blasts and recovery of murine BM in animals treated with RVU120.
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The preliminary results from the phase 1b multicohort TRIMM-2 study showed tolerable safety with no overlapping toxicities, and encouraging efficacy, supporting the combination of teclistamab with daratumumab for the treatment of RRMM.
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Only the highest concentration of 200 µM PD98059 greatly inhibited granulosa cells, with an inhibition rate of 50%.
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To exemplify, Altomare et al. developed a model where repeated asbestos treatment of heterozygous NF2 mice induced rapid onset of MPM.
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PMC11638255
Libraries were quantified using a High Sensitivity DNA chip (Agilent, USA; #5067-4626) on a Bioanalyzer 2200 and the Qubit High Sensitivity double-stranded DNA Assay Kit (Thermo Fisher Scientific, USA; #Q32851).
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PMC10253553
This suggests that the residual phospho-NDRG1 (Th346) in cells treated with 10 nM Torin 2 might contribute to the prevention of apoptosis.
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PMC5261804
We divided the PPI essentiality data from the 165 cell lines analyzed in Fig 2 based on the presence or absence of wild type PTEN or APC tumor suppressor genes.
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PMC8740518
Nevertheless, we detected changes in plasma levels of some hormones.
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PMC11759751
This study did not clarify the changes of CD19 CAR T cell subsets after pretreatment of B-NHL cells with chidamide.
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PMC11240571
When mice were implanted with HT1080 cells or 143B cells, CD63-positive exosomes and human PD-L1 expression were detected (Supplemental Figure S3A).
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PMC11629192
B cells can produce anti-NMDAR antibodies causing NMDAR internalized and leading to NMDAR hypofunction, extrasynaptic NMDAR hyperfunction or neuronal network imbalance with impaired intraneuronal activity which is involved in the pathological mechanism of anti-NMDAR encephalitis .
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PMC9429973
The median follow up from ASCT was 9 months (1-59).
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PMC7961460
Only one report is available to date , where authors, using serological identification of antigens recombinant expression cloning (SEREX), demonstrated the presence of the c10orf118 antigen in the sera of patients with cutaneous T-cell lymphoma and, interestingly, also in serum of a control, albeit without addressing its role and activity.
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PMC11763111
After counting viable cells with trypan blue (Gibco, 15250061) staining, effector and target cells were seeded in 96-well plates at various E:T ratios and incubated for 12 h. Negative control wells contained only target cells without effector cells.
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PMC11750712
For the reverse killing assay, mock and CAR-transduced T cells were co-cultured with autologous TRBC1 and TRBC2 non-transduced T cells.
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PMC10006224
The heterodimer of NIPBL-MAU2 is currently viewed as the cohesin loader, necessary for activation of the cohesin ATPase.
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PMC11525028
Moreover, ROC analysis demonstrated that the combined index of NAT10, ATF4, and ASNS exhibited a higher predictive value for OS and LMFS than the individual marker NAT10.
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PMC11640247
Following transfection, cells were rinsed with phosphate-buffered saline and lysed using passive lysis buffer in accordance with the manufacturer’s protocol.
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PMC11047729
Salvicine is a structurally modified derivative of Salvia prionitis that exhibits antitumor activities.
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