המנזרים הם חלק מההיסטוריה של הניצור המוקדם של מקסיקו. הפרנציסקנים הוזמנו ראשונים להגיע על ידי הרנאן קורטס, ואחריו זמן קצר לאחר מכן הגיעו הדומיניקנים והאוגוסטינים. לאחר שהתבססו במקסיקו סיטי וביתרת , הם ניצרו את האזור מדרום וממזרח להר הגעש. בין המיסיונרים היו חואן דה טקטו (Juan de Tecto), חואן דה איורה (Juan de Ayora) ו. האחרון למד נאוואטל כדי לתקשר עם הילידים. המנזרים הראשונים נבנו על ידי הפרנציסקנים בשנת 1524, שייסדו את המנזרים וחוצינגו, קוארנבקה, קלפן וטוצ'ימילקו. הדומיניקנים הלכו בעקבותיהם בשנת 1526, והקימו את המנזרים באואסטפק, טפוסטלאן, טטלה דל וולקאן ווייאפן. האוגוסטינים הגיעו בשנת 1533 והקימו את המנזרים באוקואיטוקו, טוטולפן, יקאפיסטלה, טלאקאפן, אטלאטלאווקאן וסקואלפן דה אמילפס. מאוחר יותר, אותם מנזרים שלחו מיסיונרים לחלקים אחרים של ספרד החדשה, כגון גררו, אואחאקה, צ'יאפס וגואטמלה.
המנזרים שימשו כאבני הפינה של העיירות שהוקמו או שהוקמו מחדש על ידי הספרדים בתקופה הקולוניאלית המוקדמת מאוד, כאשר שאר האוכלוסייה הילידית התיישבה או התיישבה מחדש סביבן. המנזרים שימשו גם כבתי חולים מוקדמים, בתי ספר ומתקני אחסון למזון ומים, כאשר לעיתים קרובות מובילה אליהן אמת מים. האוגוסטינים לא רק עסקו בניצור האוכלוסייה: הם הקימו את מרכזי החינוך הראשונים לילידים ללימוד מקצועות אירופאיים. הדומיניקנים נתנו עדיפות רבה יותר לפיתוח הכלכלי של האזורים שהם ניצרו, וניצלו את פוריות הארץ. הם היו בולטים יותר במקומות הגבוהים יותר.
חלקם, כמו זה בטלאיאקפן, שימשו קסרקטינים במהלך המהפכה המקסיקנית ונמצאו גרפיטי של חיילים מאותה תקופה. גם מנזרים אחרים, כמו יקאפיסטלה, מכילים כתובות גרפיטי מודרניות, בשל חוסר שמירה במקום.
המנזרים.
מנזר לה אסונסיון בקוארנבקה ידוע יותר בשם קתדרלת העיר. הוא נוסד על ידי הפרנציסקנים, ובמקור אפשרו רק לאצילים ילידים להיכנס לשטחו יחד עם הספרדים. זה היה המבנה החמישי בספרד החדשה בהזמנתו ובפיקוחו של המיסיונר . היחיד מבין ארבעה עשר המנזרים שהוכרזו ב-1994 שעבר שינויים משמעותיים במהלך ההיסטוריה שלו. בגלל חשיבות העיר ותפקידה של הכנסייה כמקום מושב הבישוף, עברו הכנסייה ושטחיה שינויים. הקפלה הפתוחה הגדולה הפכה לשער הראשי וקפלות האטריום הוגדלו לכנסיות בגודל משמעותי. הסבב האחרון של שיפוצים ושינויים גדולים, שכלל שיקום ציורי הקיר שלו על ידי מומחים והוספת אלמנטים מודרניים, במיוחד באזור המזבח הראשי, התרחש בסוף שנות השבעים ותחילת שנות השמונים של המאה ה-20. במנזר נשמרים מספר פרסקו, שבחלקם מתוארים מיסיונרים של ספרד החדשה בפיליפינים וביפן. הקפלה הפתוחה משמשת לעיתים קרובות לחתונות.
מנזר לידת ישו או הבשורה למרים בטפוסטלאן, הממוקם על גבעה בעמק טפוסטקו (Tepozteco), נבנה בשנים 1550–1564 ועדיין מתנשא מעל הבניינים האחרים בעיר. בתחילה שהו בו רק חמישה נזירים דומיניקנים. באטריום הגדול יש צלב אבן גדול עם סמלי הפסיון של ישו. יש קפלה פתוחה וקפלות בפינות, אך רובן הרוסות. הקלויסטר מכיל אפריז עם סמל המסדר. ישנן עדויות לסינקרטיזם של אמונות ילידות וקתוליות כגון דמותו של מלאך בעל תווי פנים אירופיים אך עם כנפי נשר, בדומה לאלה שניתן למצוא בקצלקואטל. בחלק הפנימי יש פרסקו עם כלב (גזע כלבים חסר שיער) עם לפיד בפיו וגבול מסביב לקירות עם פרחי סקווש וורדים, מוקף באבנים יקרות, כולל אבן מקומית המכונה בשם צ'לצ'יוויטה (chalchihuite). הכיכר מול אטריום של המנזר בטפוסטלאן היא שוק הומה שמוכר הכול, החל מצורכי מזון בסיסיים ועד אביזרי העידן החדש.
המנזר בטלאיאקפן נבנה בשנים 1554–1572 על ידי האוגוסטינים ומכיל את אחת הכנסיות הגדולות ביותר במדינת מורלוס. המנזר הוא בעיקר בסגנון רנסאנס, אך יש לו גם היבטים גותיים. גם כאן ניתן למצוא סינקרטיזם עם שילוב שמשות וירחים בעיטור חזית הכנסייה. אזור הקפלה הפתוחה ואזור הקלויסטר הוסב למוזיאון המנוהל על ידי אגודה אזרחית מקומית. כאן נמצאים שמורים בצורה הטובה ביותר יצירות ציורי הקיר בשחור-לבן של המתחם, יצירות קדם ספרדיות וקולוניאליות, וכן כמה שרידים חנוטים מהמאה ה-18. ציורי הקיר השמורים משתרעים על פני 2,700 מטרים רבועים ומתארים דמויות וסצנות כגון יוסף הקדוש, קתרינה מסיינה והצגת ישו בבית המקדש.
מנזר סן גיירמו ממוקם בטוטולפן ונבנה על ידי האוגוסטינים בשנת 1553. הקלויסטר שלו קטן אף על פי שקירותיו והתומכות שלו כבדים מאוד. הקפלות הפינתיות באטריום עדיין שלמות ויש מספר ציורי שמן בולטים ועוגב ישן בבית המקהלה בכנסייה. באחד החדרים בקומה הראשונה של המנזר ליד החזית הראשית של הכנסייה יש גם אפריז יוצא דופן בשני צבעים. עבודת ציור זו ועבודות אחרות במעברים הפנימיים של הקלויסטר שוחזרו לאחרונה. ארקדות אבן ועמודים מעוטרים באבנים קטנות משובצות במלט.
המנזר הדומיניקני על שם דומיניקוס הקדוש באואסטפק ממוקם על גבעה תלולה למדי מעל בימת פולחן קדם ספרדית. מסיבה זו, האטריום אינו ממוקם מול הכנסייה והוא גבוה יותר מהכנסייה. בחלק הפנימי של הכנסייה, קשתות גותיות תומכות בגג והקמרון מעוטר במוטיבים פרחוניים. ישנם שני קישוטים מאחורי המזבח מעץ מהמאה ה-17. במנזר של אואסטפק יש עמודים בקלויסטר עם תמונות של קדושים, וקמרונות חבית מעוטרים במוטיבים חוזרים כמו פלר דה ליס. בציורי הקיר כאן יש שרידים של צביעה יוצאת דופן בצבע כחול, אך רוב הציורים איבדו לגמרי את צבעם. רוב ציורי הקיר שנעלמו כליל נהרסו עקב לחות, הנובעת בעיקר מחוסר תחזוקה של ניקוז הגג. הקלויסטר של המנזר הוסב למוזיאון, אך רק שלושה מהאולמות פתוחים לקהל הרחב. הוא מכיל אוסף צנוע של יצירות קדם ספרדיות ובעלי חיים, חרקים וצמחים מהאזור.
המקדש והמנזר הישן של השליח מתי הקדוש באטלאטלאווקאן נבנה על ידי האוגוסטינים בסביבות 1570 על שרידי מקדש קדם ספרדי בחלק הגבוה ביותר של העיר. תחנות הצלב באטריום מיוצגות על ידי קפלות קטנות בצד החיצוני של קיר האטריום. יש בו שתי קפלות מקורות באטריום שלו, באחת מהן יש ציור קיר של העץ הגנאלוגי של אוגוסטינוס הקדוש. חזית הכנסייה גבוהה במיוחד, אלמנט נפוץ במבנים אוגוסטיניים, ומתנשאת לגובה של כ-50 מטרים. ציורי פרסקו כיסו את רוב פנים המתחם, עם קמרונות המשלבים אלמנטים מוריים עם אלה של הרנסאנס האיטלקי. תאי הווידוי נבנו בדפוס "s" בקיר המפריד בין הכנסייה לאזור הקלויסטר. בקלויסטר, אחת האטרקציות העיקריות היא קמרון אחד בקומת הקרקע, המעוטר בשרשרת עשויה תמונות של . המפלס העליון משמש כביתו של כומר הקהילה.
המקדש והמנזר הישן של השליח יעקב הקדוש באוקואיטוקו מתוארך לשנת 1534 והוא המנזר האוגוסטיני הראשון ביבשת האמריקאית, כאשר הכומר ערך את המיסה הראשונה שלו בשנת 1534. הוא שימש לא רק מרכז מיסיונרי, אלא גם מרכז הכשרה לנזירים. במנזר יש קמרון בקומה התחתונה של הקלויסטר שהדמויות המצוירות בו צבועות בחום, לבן וירוק. הקפלה לעולים לרגל סגורה, בניגוד למנזרים האחרים, אך שאר המתחם פתוח למבקרים. היו כמה שינויים במבנים מאז שנבנו, אך אלמנט אחד שנשמר היטב הוא מזרקת האבן מהמאה ה-16, העתיקה ביותר מבין כל המנזרים של אתר המורשת העולמית. מזרקה זו היא העתק של אחת המזרקות בארמון אלהמברה בקורדובה. היא כוללת שישה אריות מאבן חול הפונים למרכז, אשר פוסלו על ידי אומנים ילידים. בחלקו החיצוני של הקלויסטר, יש מזרקה נוספת שהייתה ידועה בעבר כמזרקת בתולות הים (Fuente de las Sirenas), אך היא הידרדרה קשות. שניהם סיפקו לקהילה מים שזרמו אליהם מפופוקטפטל.
מנזר דומיניקוס הקדוש בווייאפן הוא המנזר השוכן במקום הגבוה ביותר מבין כול המנזרים במדינת מורלוס, באקלים קר בהשוואה לרוב שטח המדינה. זהו אחד המנזרים הקרובים ביותר להר הגעש. הוא נוסד על ידי הדומיניקנים, אך המנזר שלו נבנה מלבני בוץ (אדובי) ועץ עם גג רעפים במקום אבן. הוא התפורר מהר יחסית בגלל איתני הטבע וננטש. הוא נשאר סגור ברובו עד היום. רק אזור האטריום פתוח למבקרים עד 13:00 בכל יום. החזית הצנועה של הכנסייה הראשית שרדה ויש בה גומחה בארוקית בולטת. אפשר גם לראות מספר ציורי קיר שנותרו.
מנזר יוחנן המטביל בטטלה דל וולקאן נבנה על ידי הדומיניקנים במחצית הראשונה של המאה ה-16 ואף ביקר בו הרנאן קורטס. הוא נמצא בגובה רב ליד הר הגעש מוקף ביער אורנים באקלים קר יחסית. בחוץ יש ארקדות המקיפות את המתחם, אך מוסתרות חלקית על ידי עצים. החלקים העליונים של הקירות מסביב למתחם מכוסים בצבע. בקומה התחתונה של הקלויסטר יש דמויות המתוארות על הקשתות ובקירות. רבים מהם הם נזירים אוגוסטינים. בקמרונות מעל השבילים ישנם כרובים רבים המביסים רוחות רעות וחלקם אף נלחמים זה בזה. אלמנט אדריכלי ייחודי הוא קירוי קורות עץ בסגנון מורי על חדר תשמישי הקדושה. מתקיים כאן שוק אומנות בכל יום רביעי. באטריום יש סדרה של ציורי קיר באיכות גבוהה מאוד, שצייר אומן יליד מקומי במאה ה-16. הם שוחזרו בשנת 2008.