ברצלונה פתחה את העונה עם זכייה בסופר קאפ הספרדי לאחר ניצחון 2–1 על סביליה. ב-28 באוקטובר אירחה ברצלונה את ריאל מדריד בקאמפ נואו. ריאל מדריד נחלשה משמעותית לאחר שכוככה כריסטיאנו רונאלדו ומאמנה זינדין זידאן עזבו בקיץ 2018. ברצלונה חסרה את מסי הפצוע, אך ניצחה את ריאל מדריד 5–1 משלושער של לואיס סוארס ושערים של קוטיניו וארתורו וידאל. ברצלונה לאחר מכן המשיכה ברצף של 24 משחקי ליגה ללא הפסד (כולל הקלאסיקו בברנבאו, בו ניצחה 1–0), וזכתה באליפות שנייה ברציפות, בפער של 11 נקודות מסגניתה אתלטיקו מדריד. מסי היה מלך השערים (36) והבישולים (13, בצוותא עם פאבלו סראביה) וזכה בפרס הפיצ'יצ'י ובנעל הזהב האירופית בפעם השלישית ברציפות ובפעם השישית בסך הכול, שיאים שטרם נשברו. הייתה זו האליפות העשירית של מסי, המקום השני בכל הזמנים (לאחר פרנסיסקו חנטו שזכה ב-12 אליפויות עם ריאל מדריד).
בגביע המלך, העפילה ברצלונה לגמר לאחר ניצחונות על לבאנטה, סביליה וריאל מדריד (אותה ניצחה בביתה 3–0), אך הפסידה בו לולנסיה, ובכך קטעה רצף של ארבע זכיות בגביע. בליגת האלופות הוגרלה ברצלונה לבית קשה שכלל את אינטר, טוטנהאם ופ.ס.וו. איינדהובן, אך היא סיימה ראשונה בבית וללא הפסד. ברצלונה המשיכה לחצי הגמר (לראשונה מאז 2015) עם ניצחונות על ליון ומנצ'סטר יונייטד, שם התמודדה מול ליברפול. במשחק הראשון שנערך בקאמפ נואו, כבש מסי צמד ברבע השעה האחרונה וקבע 3–0, אך למרות זאת הובסה ברצלונה במשחק הגומלין 0–4 והודחה מליגת האלופות. הייתה זאת הפעם השנייה ברציפות בה ברצלונה מודחת במשחק הגומלין למרות יתרון של שלושה שערים, והאוהדים החלו לדרוש את התפטרותו של ואלוורדה.
בעונה זו כבש מסי 51 שערים בכל המסגרות, והפך לשחקן השני בלבד בהיסטוריה של הכדורגל לכבוש למעלה מ-50 שערי מועדון ב-6 עונות שונות (לאחר כריסטיאנו רונאלדו שעשה זאת בשש העונות הרצופות בין 2010–2016).
במובנים רבים, הייתה עונה זאת סיומו של תור הזהב של ברצלונה שהחל עם מינויו של גוארדיולה למאמן ב-2008. ברצלונה זכתה ב-8 אליפויות מתוך 11 עונות, 6 גביעי מלך, ושלושה גביעי ליגת האלופות, ובסך הכל 29 תארים ב-11 שנים.
עונת 2019/20.
בקיץ 2019 רכשה ברצלונה את אנטואן גריזמן, חלוצה הצרפתי של אתלטיקו מדריד, תמורת 120 מיליון אירו. בנוסף, הקשר ההולנדי הצעיר פרנקי דה יונג נרכש מאייאקס ב-75 מיליון. השוער השני של הקבוצה, יאספר סילסן נמכר ב-35 מיליון אירו ובמקומו נרכש נטו ב-26 מיליון. מלקום נמכר לזניט סנקט פטרבורג ב-40 מיליון, וקוטיניו הושאל לעונה אחת לבאיירן מינכן תמורת 8.5 מיליון.
בספטמבר זכה מסי בפרס The Best של פיפ"א, ובדצמבר הוא זכה בכדור הזהב השישי והפך לשיאן הזכיות.
ברצלונה פתחה את העונה בליגה בצורה גרועה, אך עד ינואר היא התאוששה וחזרה למקום הראשון בטבלה. הקלאסיקו שנערך בדצמבר הסתיים בתיקו מאופס לראשונה מאז נובמבר 2002. במקביל סיימה ברצלונה ראשונה בשלב הבתים של ליגת האלופות בבית שכלל את בורוסיה דורטמונד ואינטר מילאנו. בינואר 2020 נערך הסופר קאפ הספרדי במתכונת חדשה של חצי גמר וגמר. ב-9 בינואר הפסידה ברצלונה 3–2 בחצי הגמר לאתלטיקו מדריד, וב-13 בינואר פוטר ואלוורדה ובמקומו הוחתם קיקה סטיין. ב-1 במרץ הפסידה ברצלונה 0–2 לריאל מדריד ואיבדה את ראשות הטבלה.
במרץ הושעתה הלה ליגה וליגת האלופות בשל התפשטות מגפת הקורונה. הליגה שבה לפעול רק ביוני עם אצטדיונים ריקים והסתיימה ביולי. ריאל מדריד זכתה באליפות עם המאמן החדש-ישן זינדין זידאן, ברצלונה סיימה שנייה עם פער של 5 נקודות. מסי סיים כמלך השערים עם 25 שערים (הנתון האישי הנמוך ביותר שלו מאז עונת 2008/09).
ליגת האלופות שבה לפעול באוגוסט וברצלונה ניצחה את נאפולי 3–1 בקאמפ נואו ועלתה לרבע הגמר (מאחר שהמשחק הראשון, ששוחק בפברואר, הסתיים בתיקו 1–1). מכאן ואילך המשחקים התקיימו בפורמט של משחק יחיד באצטדיון נייטרלי (אצטדיון האור ואצטדיון ז'וזה אלבלדה בליסבון, פורטוגל). ב-14 באוגוסט שיחקה ברצלונה מול באיירן מינכן, והובסה בתוצאה 2–8 (כאשר קוטיניו המושאל כובש צמד), התבוסה הקשה בתולדותיה במסגרת אירופית. הייתה זו הפעם הראשונה מאז 1946 בה ברצלונה סופגת שמיניית שערים.
במקביל, הייתה זאת עונת פריצה לצעירים רבים מלה מאסיה, לראשונה מזה שנים רבות. הבולט מביניהם היה אנסו פאטי, שכבש 8 שערים ב-33 הופעות בגיל 16 בלבד. הוא הכובש הצעיר ביותר של ברצלונה, והשחקן הצעיר ביותר לכבוש צמד בלה ליגה.
עונת 2020/21.
התבוסה 8–2 לבאיירן זעזעה את המועדון. ב-17 באוגוסט פוטר סטיין, ויום לאחר מכן פוטר המנהל הספורטיבי אריק אבידאל. ב-19 באוגוסט הודיע המועדון כי המאמן יהיה שחקן העבר רונלד קומאן. ב-25 באוגוסט הביע מסי את רצונו לעזוב את המועדון בפקס ששלח להנהלה, הצהרה שזכתה לתמיכה משחקני עבר והווה ולמהומה תקשורתית גדולה. יום למחרת הודיע המועדון כי מסי רשאי לעזוב באם ישלם את סעיף השחרור בסך 700 מיליון אירו, ולמעשה סירב לבקשתו. במקביל שוחררו שחקנים רבים ובראשם לואיס סוארס, שנזרק מהקבוצה בשיחת טלפון על ידי קומאן, בצורה שספגה ביקורת מצד חברו הטוב מסי. סוארס כבש 198 שערים במדי ברצלונה והוא הכובש השלישי בגודלו בתולדות המועדון. סוארס חתם באתלטיקו מדריד בספטמבר. לצידו נמכרו גם איוואן ראקיטיץ', ארתורו וידאל ונלסון סמדו. ארתור מלו הועבר ליובנטוס תמורת מיראלם פיאניץ', ולצידו נרכשו סרג'יניו דסט, פרנסיסקו טרינקאו ופדרי, שנרכש ב-5 מיליון אירו מלאס פאלמאס.
ברצלונה התחילה את העונה בצורה גרועה, עם 14 נקודות בלבד ב-12 המחזורים הראשונים, כולל הפסד 1–3 לריאל מדריד בבית (פאטי כבש את השער היחיד של ברצלונה). מסי, שנשאר בעל כרחו, כבש שני שערי שדה בלבד, מנגד פאטי כבש 4 שערים ב-7 הופעות ואף זכה בפרס שחקן חודש ספטמבר בליגה, אך בנובמבר נפצע והושבת למשך למעלה משנה. ב-27 באוקטובר 2020, לאחר ההפסד בקלאסיקו, התפטרה הנהלת המועדון והנשיא ברתומאו על מנת להימנע מהצבעת אי אמון. קרלס טוסקטס נבחר לנשיא הזמני עד לבחירות במרץ 2021.
בינואר נערך הסופר קאפ הספרדי, וברצלונה התמודדה בגמר מול אתלטיק בילבאו. המשחק נמשך להארכה ובו הפסידה ברצלונה 2–3. בדקה האחרונה של המשחק קיבל מסי כרטיס אדום ישיר, לאחר עבירה על שחקן היריבה. היה זה הכרטיס האדום היחיד בקריירה שלו בברצלונה. למרות הפתיחה הגרועה בליגה, מסי התאושש במחזורים הבאים וברצלונה החלה רצף של 14 ניצחונות מתוך 17 משחקים וללא הפסד בודד. הרצף נעצר ב-10 באפריל עם הפסד 1–2 לריאל מדריד. שני מחזורים לאחר מכן, ברצלונה הייתה יכולה לעלות לראשות הטבלה אך כשלה והפסידה 1–2 לגרנדה למרות יתרון 1–0 מרגליו של מסי. מכאן חלה ירידה בכושר הקבוצה, והפסד במחזור ה-37 (1–2 לסלטה ויגו, שוב לאחר שער יתרון של מסי) חתם את סיכוייה של ברצלונה לזכות באליפות. אתלטיקו מדריד זכתה באליפות (עם לואיס סוארס, שכבש 21 שערים) וברצלונה סיימה במקום השלישי, לראשונה מאז עונת 2007/08. בנוסף, הייתה זו הפעם הראשונה מאז 2008 בה ברצלונה לא זוכה בליגה במשך שתי עונות ברציפות. למרות זאת, מסי היה מלך השערים (30) וזכה בפרס הפיצ'יצ'י בפעם החמישית ברציפות והשמינית בסך הכול, שניהם שיאים של כל הזמנים.
בליגת האלופות הודחה ברצלונה כבר בשלב שמינית הגמר לאחר הפסד 2–5 במצטבר לפריס סן-ז'רמן, לראשונה מאז עונת 2006/07. בגביע המלך, העפילה ברצלונה לגמר לאחר ניצחונות על ראיו ואיקאנו, גרנדה וסביליה, ובגמר ניצחה 4–0 את אתלטיק בילבאו, וזכתה בגביע ה-31 שלה. היה זה הגביע הראשון מאז 2018 וברצלונה הפכה בכך לשיאנית הזכיות במפעל.
עונה זו הייתה עונת פריצה לצעירים רבים, הבולט שבהם היה פדרי, שהפך לשחקן הרכב קבוע והופיע ב-52 משחקים, יותר מכל שחקן אחר. פדרי זכה להכרה על כישרונו וזומן גם ל לקראת משחקי יורו 2020, ולמרות גילו הצעיר היה שחקן משמעותי בנבחרת ואף זכה בפרס השחקן הצעיר המצטיין בטורניר. בנוסף, שיחק פדרי באולימפיאדת טוקיו וזכה במדליית כסף, והיה לשחקן האירופי ששיחק הכי הרבה משחקים בעונת 2020/21, בגיל 18 בלבד. בנוסף, הצעירים רונלד אראוחו, סרג'יניו דסט, פרנסיסקו טרינקאו, אוסקר מינגסה וריקי פוץ' הרבו לשחק וחלקם היו לשחקנים חשובים במערך של קומאן.
עידן לאפורטה השני (2021–הווה).
הבחירות לנשיאות 2021 ועזיבת מסי.
ב-7 במרץ 2021 נבחר ז'ואן לאפורטה בשנית לנשיא המועדון, עם 54.28% מהקולות. ברתומאו, שעזב את התפקיד כארבעה חודשים קודם לכן, נחשב בעיני רבים לנשיא הגרוע ביותר בתולדות המועדון, לאחר ששאב את הקבוצה לשפל כלכלי וספורטיבי (בשל רכישות עתק שלא הצדיקו את עצמן והזנחת האקדמיה) וחובות שהגיעו ל-1.35 מיליארד אירו, אף על פי שקיבל את המועדון בשיא הצלחתו. בנוסף, נחשד ברתומאו בהפעלת קמפיין אנונימי ברשתות החברתיות נגד שחקני עבר והווה ואישים נוספים (כמו מסי, פיקה, צ'אבי, פויול, גוארדיולה ועוד), בפרשה שזכתה לכינוי בארסה-גייט . ברתומאו נעצר על ידי משטרת קטלוניה ב-1 במרץ.