דורגו נסוג לתוך הפרובינציה, שם צפוי היה לקבל תמיכה מבעלי החוות ומרוסאס שהוצב שם כקולונל. הם הצליחו לגייס צבא קטן, אך הובסו בקרב נווארו ב-9 בדצמבר 1828.
רוסאס יעץ לדורגו להימלט לסנטה פה, אך הוא סירב. רוסאס עצמו פנה לכיוון סנטה פה וחבר שם למושל אסטניסלאו לופס (Estanislao López), ודורגו נלכד על ידי לוואז'ה שחיסל אותו. דורגו הביע משאלה שמותו לא יגרום לגל של שפיכות דמים, אך חרף זאת - פרצה עקובה מדם לאחר שהגנרל חוסה מריה פס (José María Paz) - בן בריתו של לוואז'ה - פלש לקורדובה בינואר 1829.
לוואז'ה עצמו חיסל את תומכיו של דורגו ושלח כוחות לכל רחבי הפרובינציה לפעול נגד הפדרליים, ובכך קוממו נגדם ביתר שאת את בעלי החוות והגאוצ'וס קשי היום; ולבסוף פנה לכיוון סנטה פה, כבש את רוסריו, אך הובס לבסוף בידי המושל לופס ורוסאס בקרב גשר מרקס (Puente de Márquez) ב-26 באפריל 1829.
לופס חזר לסנטה פה, ורוסאס הטיל מצור על בואנוס איירס, בה גברה ההתנגדות ללוואז'ה והאהדה לרוסאס.
לוואז'ה התייצב לבדו וללא הודעה מוקדמת במפקדתו של רוסאס, המתין לשובו, וחתם ב-24 ביוני 1829 על הסכם קניואלאס (Cañuelas) לגבי עריכת בחירות, הצגת רשימת משותפת של אוניטריים ופדרליים, ובחירת פליקס דה אלסאגה ( Félix de Álzaga) כמושל.
האוניטרים לא כיבדו את ההסכם, הציגו מועמד משלהם, וניצחו בבחירות תוך שימוש באלימות. לוואז'ה חתם על הסכם חדש עם רוסאס שבעקבותיו נבחר כמושל הגנרל חואן חוסה ויאמונטה (Juan José Viamonte) שכינס מחדש את הרשות המחוקקת שלוואז'ה הדיח ובכך סלל את הדרך לבחירה העתידית ברוסאס כמושל.
הממשל הראשון.
הרשות המחוקקת בחרה ברוסאס כמושל ב-6 בדצמבר 1829, כשנה לאחר ההפיכה של לוואז'ה, תוך שהיא מסמיכה אותו להשיב את הסדר על כנו ומעניקה לו את "כל האמצעים השגרתיים והחריגים שימצא לנכון עד לכינוסה של רשות מחוקקת חדשה"
. ניסוח זה שנתפס בדיעבד כהתרת רסן ואישור לשימוש ברוטלי בכח, היה כנראה ניסוח מקובל באותה תקופה בעת מינוי מושלים.
צעדו הראשון כמושל היה עריכת הלוויה רבת רושם לדורגו, ובכך הוא קנה את לבם של פשוטי העם בבירה, לאחר שכבר זכה לאהדת הכפריים בפרובינציה.
לאחר מכן פרסם את משנתו הלאומית והסמכותית, ואת תקוותו לשלטון ארוך ויציב.
הוא עצמו נקט בגישה פרגמטית, ולמרות שנחשב לפדרלי - בהיבטים שונים פעל כאוניטרי במציאות שהייתה פדרלית (הפירוד בין הפרובינציות והיעדר שלטון מרכזי).
מלחמת האזרחים בפרובינציות הפנימיות.
הגנרל חוסה מריה פס (José María Paz) כבש את קורדובה והביס את פקונדו קירוגה (Facundo Quiroga), לעתיד - אחד הקאודיז'וס הבולטים בתקופת רוסאס ובן ברית שלו.
רוסאס שלח משלחת לתווך בין השניים, אך בעקבות תבוסתו - קירוגה נמלט לבואנוס איירס, ורוסאס קיבל אותו כמנצח.
פס ניצל את ניצחונו כדי לפלוש לפרובינציות שסייעו לקירוגה ולהחליף שם את השלטון לאוניטרי; וכך נוצרו שני מחנות:
קוריינטס התמהמהה בהצטרפותה להסכם הפדרלי (יחד בואנוס איירס, סנטה פה ואנטרה ריוס) בשל חילוקי דעות סביב השימוש בהכנסות ממכס בנמל בואנוס איירס, שרוסאס - בדומה לקודמיו האוניטרים - השתמש בהן לטובת בואנוס איירס - לחיזוקה ולשגשוגה.
חואן פליפה איברה (Juan Felipe Ibarra) - מושל סנטיאגו דל אסטרו במהלך שנות ה-20 של אותה מאה והקאודיז'ו שהוביל לניתוקה מטוקומן - גלה באותה עת בסנטה פה, ועודד את המושל לופס לפתוח במלחמת גרילה נגד כוחותיו של פס בקורדובה, שיטת לחימה שהעניקה יתרון מול העדיפות הצבאית של הגנרל האוניטרי, ובתחילת 1831 הצטרפו אליהם כוחות מאונוס איירס בפיקוד רמון בלקרסה (Ramón Balcarce).
בעקבות תבוסתם של האוניטרים בקרב פריילה מארטו (Fraile Muerto) ב-5 בפברואר 1831 - פס החליט לפקד בעצמו על הכוחות במזרח קורדובה, בגבול עם סנטה פה.
מנגד, קירוגה הביע את רצונו לחזור לחזית וביקש מרוסאס להעמיד כח צבאי לרשותו, וקיבל אסירים מהכלא איתם נע לכיוון דרום קורדובה, ובתוספת סיוע שקיבל בדרך מהפדרליים בשטח - כבש את הפרובינציות של קוז'ו ואת לה ריוחה בפחות מחודש.
ב-10 במאי 1831 הגנרל פס נפל בשבי באופן מפתיע לאחר שמונטונרה (יחידת פרשים לא סדירה) של לופס לכדה אותו בהטלה בולאדורה
(פלצור (לאסו) המקובל בארגנטינה), ובעקבות כך - הגנרל גרגוריו אראוס דה למדריד (Gregorio Aráoz de Lamadrid) הועמד בראש האוניטרים.
למדריד נסוג צפונה, הובס בידי קירוגה בקרב לה סיודדלה (La Ciudadela) ב-4 בנובמבר 1831, ועם כיבושה של טוקומן בידי הפדרליים - הליגה הפנימית התפרקה.
הוועדה הייצוגית בסנטה פה.
בחודשים הבאים הצטרפו הפרובינציות הנותרות להסכם הפדרלי: ב-1831 מנדוסה, קורדובה, סנטיאגו דל אסטרו, ולה ריוחה; וב-1832 טוקומן, סן חואן, סן לואיס, סלטה וקטמרקה.
בסנטה פה התכנסה הוועדה הייצוגית (La Comisión Representativa) ורבים ממציגי הפרובינציות ראו בסיום המלחמה בזדמנות לארגן את המדינה ולקבוע לה חוקה, אם כי רוסאס התמהמה וטען שיש קודם כל לארגן את הפרובינציות ולאחר מכן את המדינה כולה; ושהחוקה צריכה להיות בהמשך לסדר החדש ולא זו שמכוננת אותו; ולבסוף ניצל חילוקי דעות עם נציג קוריינטס כדי להחזיר את נציגיו מהוועדה, היא התפזרה ללא תוצאות באוגוסט 1832, ומלאכת הכנת החוקה נדחתה ב-20 שנה.
הארץ התחלקה בין שלושה מוקדי השפעה:
היחסים בין שלושתם לא היו טובים במיוחד, אך במשך מספר שנים נוצר מעין טריאומווירט וירטואלי ששלט על הארץ כולה.
במכתב שרוסאס שלח ב-1832 לקירוגה הוא הביע משאלה לקיים את הרצון "האוניטרי" של העם ולאחד את המדינה, חרף היותו פדרלי.
הממשל בפרובינציה של בואנוס איירס.
תקופת הממשל הראשונה של רוסאס הייתה תקופה של סדר אך לא של עריצות כמו השנייה, למרות שיש היסטוריונים המוצאים את יסודות השנייה בראשונה, ואף שיתף פעולה עם גורמים שבעתיד יאשים אותם באוניטריזם.
בין היתר יש המאשימים אותו בכיבושם של איי פוקלנד (Islas Malvinas) בידי האנגלים, למרות שזה קרה ב-3 בינואר 1833, בתקופה בה משל חואן רמון בלקרסה (Juan Ramón Balcarce) שהחליף אותו בשעה שעסק בכיבוש המדבר
בתקופת ממשל זה הושלטה משמעת בצבא, נקבעו תקנות מסחריות, נוסדו יישובים, מערכת המשפט הוחלה גם על יישובים באזורים הפנימיים של הפרובינציה שהיו רחוקים מהעיר בואנוס איירס, ונחתמו הסכמי שלום עם הצ'יפים האינדיאניים שסייעו לשמור על גבולות שקטים.
עם זאת, רוסאס לא נהנה מתמיכה בלתי מסויגת, ונאלץ להתמודד עם התנגדות עיקשת במהלך כהונתו.
בין הכהונות.
בסוף 1832 רוסאס נבחר מחדש על ידי הרשות המחוקקת, אולם הוא סירב - או בשל האופוזיציה שעמדה מולו או מפני שרצה "שינסו להסתדר לבד", אך ללא ספק היה מדובר בוויתור טקטי בטרם ישוב לתפקיד בעתיד.
במקומו נבחר חואן רמון בלקרסה (Juan Ramón Balcarce) - מהגנרלים הבולטים במלחמת העצמאות של ארגנטינה, ומנהיג של קבוצה פדרלית שלא הזדהתה לגמרי עם רוסאס; והתפקיד עבר אליו ב-18 בדצמבר 1832.
המערכה במדבר.
האזור המיושב בשטח בו שוכנת כיום הפרובינציה של בואנוס איירס כללה בתחילת המאה ה-19 רצועה צרה של כמה עשרות ק"מ לכל היותר לאורך חופי ריו דה לה פלטה ונהר הפרנה, רצועה שהלכה והתרחבה וכללה בשנות השלושים של אותה מאה את כל המחצית הצפונית של הפרובינציה.
האזורים מדרום לקו גבול לא רשמי זה היו בשליטת שבטי האינדיאנים.
לאחר סיום כהונתו הראשונה - רוסאס החל לארגן את ההתפשטות דרומה בתיאום עם קורדובה, סן לואיס ומנדוסה; כאשר באותה תקופה גם צ'ילה נקטה בצעד דומה בשטחה. הוא הציע את תפקיד המפקד הכללי של כל הכוחות לפקונדו קירוגה, אך הלה סירב; ורוסאס החל להכין את כוחותיו בשטחי החוות שלו.
חוק שאושר ב-1833 הסמיך את ממשל הפרובינציה לגייס הלוואות למימון הפעולה, אך לא נמצאו מקורות מתאימים, ולבסוף רוסאס ומקורביו מימנו חלק גדול מההוצאות בעצמם וגייסו את השאר מגורמים פרטיים; והכוח היה מוכן במרץ 1833.
הכח העיקרי היה במזרח הפרובינציה בפיקודו של רוסאס, הוא הביס את הצ'יפים הבולטים בשטח וחתם על הסכמי שיתוף פעולה עם המשניים. הוא שילב בין פעולות התפשטות להסכמים חלקיים עד 1839 עת העדיף הסכם שלום כללי ויציב.
צ'ארלס דרווין חקר את האזורים הכבושים ואף תיאר חלק מהמערכות ביומן שלו ואת החיסולים ההמוניים שנעשו כלאחר יד וזעזעו אותו.
במערכה נכבשו שטחים מסוימים, אך הרבה פחות מאשר במערכה לכיבוש המדבר בידי חוליו ארחנטינו רוקה (Julio Argentino Roca) ב-1879.
ההישג הגדול של רוסאס היה קניית נאמנותם של הצבא, בעלי החוות ודעת הקהל; ותמיכתן של הפרובינציות הדרומיות שראו עצמן בנות חורין לתקוף ולבזוז את שטחי האינדיאנים.
הסכמי השלום עם האינדיאנים כללו מתן אספקה שוטפת להם: מבחינת תושבי בואנוס איירס זה נראה כניצול תשלומי המיסים שלהם, אך בעיני האינדיאנים זה הצטייר כדמי שימוש באדמותיהם. מבחינת רוסאס זה הבטיח את נאמנותם כשהוא חזר למשול בפרובינציה.
מהפכת הרסטורטורים (השבת הסדר הישן על כנו).
בשעה שרוסאס היה שקוע בפעילותו הצבאית - התגלעו חילוקי דעות במחנה הפדרלי שמשל בבואנוס איירס בין נאמניו הליברליים של המושל בלקרסה, לבין נאמניו של רוסאס - בעלי חוות, אנשי צבא וסוחרים קטנים - שכינו את אנשיו של בלקרסה "גבּים שחורים" (Lomos negros) על שם הכרזות שלהם שצידן האחורי היה שחור.
העימות -באוקטובר 1833 - התנהל ברובו בעיתונות, והממשל סגר מספר ביטאונים משני הצדדים. הדמות הבולטת במחנה של רוסאס הייתה אשתו ויועצתו - אנקרנסיון אסקורה (Encarnación Ezcurra) - שכינסה מדי יום את תומכיו בביתם וארגנה הפגנות ואף פעולות אלימות.