פרל קראב או פרל הלווייתנית (באנגלית: Pearl Krabs, היא ביתו המתבגרת של יוג'ין קראב שמנהל את מסעדת "הסרטן הפריך". את קולה של פרל מדבבת לורי אלן, ובעברית דון לני גבאי (ברוב הפרקים). דמותה הופיעה לראשונה בפרק "המגפיים".
פרל היא ראשתן גדול-ראש. צבע גופה של פרל הוא אפור וצבע שערה הוא בלונד. פרל גבוהה משאר הדמויות בצורה משמעותית. בדרך כלל היא לובשת חולצה ורודה, שעליה מודפסת האות P. פעמים רבות מתביישת פרל באביה, יוג'ין קראב.
בפרק "יום הולדת לווייתנית" חגגה פרל את יום הולדתה ה-16, וראתה את להקת הבנים שבוכים בשיר ברכה לכבודה. כפי שנראה בפרק "מנהרת הכפפה", בובספוג מגדיר את פרל כחברה שלו, אך פרל אינה מסכימה עם בובספוג כלל. בפרק "פרצוף ספחת", צומח לפרל חצ'קון על אפה, והיא מנסה לעשות הכל על מנת להיפטר ממנו. בפרק "כאבי גדילה", פרל חווה כאבי גדילה של גיל ההתבגרות, ודורשת ממר קראב להביא לה הרבה אוכל. בפרק "המנהלת החדשה", הופך מר קראב את פרל למנהלת של מסעדת "הסרטן הפריך". פרל משנה את שמו של הסרטן הפריך לשם "הסרטן המחבק". סבא של פרל הוא סבא קרבא שהוא שודד ים.
גברת פאף.
גברת פאף (באנגלית: Mrs. Puff) היא דג אבו נפחא, ומורתו לנהיגה של בובספוג. גברת פאף שונאת את בובספוג, משום שהוא מנסה להוציא רישיון שוב ושוב ללא הצלחה ומבצע עברות תנועה רבות שבגללן היא נשלחת לכלא. פאף מעדיפה להיות בכלא, משום ששם היא לא נאלצת לסבול את נוכחותו.
גברת פאף היא בת זוגו של מר קראב. בהמשך היא מנהלת רומן עם דמות משנה נוספת.
בפרק "עבודת קיץ" גברת פאף ניסתה להתחמק מבובספוג ובטעות התנגשה עם רכבה במסעדת "הסרטן הפריך". כדי שדבר התאונה לא ידווח לרשויות, גברת פאף הסכימה לעבוד במסעדת "הסרטן הפריך", אך כשגילתה שבובספוג עובד במקום ולאחר שלא יכלה לסבול אותו יותר, היא ברחה מהמסעדה.
בפרק אחר, לגברת פאף נמאס מבובספוג עד כדי כך שהיא נותנת לו רישיון נהיגה, כדי שהוא ייצא מחייה.
, פאף הופיעה כאשר היא שרה את "Thank Gosh it's Monday" (בעברית: "תודה לאל שהיום יום שני") יחד עם בובספוג וכל תושבי ביקיני בוטום.
גברת פאף סובלת לא פעם מהזיות, וכן מהפרעת דחק פוסט-טראומטית (שמתגלית כאשר היא נכנסת להתקף בו היא בטוחה שהם נוהגים ושחייבים לבלום את כלי הרכב בטרם תיגרם תאונה). בהמשך, נרמז כי גברת פאף סובלת אף מקלפטומניה ומאגרנות כפייתית, משנמצא כי בין מטלטליה חפצים רבים שאינם שייכים לה, וכן כי גנבה את חלזון המחמד של סקווידויד.
דמויות משניות.
משפחת מכנסמרובע.
משפחת מכנסמרובע היא משפחה דמיונית הנוצרה בחלק מהסדרה "בובספוג מכנסמרובע". בני המשפחה כולה מופיעים יחד רק בפרקים ספורים.
אילן יוחסין.
בובספוג בן יחיד. הסדרה מפרטת יותר על משפחת אימו.
איש הים ונער הפלא.
איש הים (באנגלית: Mermaid Man. בפרקים ספורים הוא מכונה בשם בתול הים). שמו האמיתי הוא ארני. איש הים ושותפו, נער הפלא הם גיבורי־העל של ביקיני בוטום, כוכבים של תוכנית טלוויזיה פיקטיבית בשם "הרפתקאותיהם של איש הים ונער הפלא", והם מופיעים בסדרה מאז שהיו צעירים. כעת הם זקנים, ומתגוררים בבית־אבות בביקיני בוטום.
את איש הים הזקן דיבב ארנסט בורגניין, עד למותו ביולי 2012, ואז החליף אותו ג'ו וייט. את איש הים הצעיר דיבב אדם ווסט. איש הים מהווה פארודיה על אקווהמן ובאטמן. איש הים הופיע לראשונה בפרק "איש הים ונער הפלא".
נער הקסם או נער הפלא (באנגלית: Barnacle Boy. בפרקים ספורים הוא מכונה בשם נער ספחת) הוא שותפו לסדרה של איש הים, שמו האמיתי הוא טים.
את קולו של נער הפלא דיבב טים קונוויי עד 2012 (לאחר מותו של ארנסט בורגניין, איש הים ונער הפלא לא הופיעו יותר בסדרה, וטים קונוויי עצמו נפטר ב-2019). נער הפלא מהווה פארודיה על רובין ואקווהלאד. נער הפלא הופיע לראשונה בפרק "איש הים ונער קסם".
בניגוד לשאר הדמויות, איש הים ונער הפלא הם אנושיים.
מן ריי.
מן ריי (באנגלית: Man Ray) הוא אויבם המושבע של איש הים ונער הפלא. את קולו של מן ריי דיבב ג'ון ריס-דייוויס בשתי הופעתיו הראשונות והחל מהופעתו השלישית, בוב ג'ולס. מן ריי מהווה פארודיה על הנבל מאקווהמן, בלאק מנטה. מן ריי הופיע לראשונה בפרק "איש הים ונער הפלא 3".
עורו של מן ריי הוא אדום. מן ריי לובש קסדה כחולה שמשמשת כראשו והוא יכול להוריד אותה ובעל כפפות כחולות. למן ריי שרירים מפותחים והוא בעל כוחות על־טבעיים. בפרק "בחזרה לעבר", מן ריי ממיס בניינים, כבישים ורחובות בעזרת ידיו, והוא מקבל עזרה משתי צרעות ים. בפרק "גיבורי הפעולה", בובספוג ופטריק מכווצים את קסדתו של מן ריי.
הבועה המזוהמת.
הבועה המזוהמת (באנגלית: Dirty Bubble) הוא אויב נוסף של איש הים ונער הפלא. הופעתו הראשונה של הבועה המזוהמת בסדרה הייתה בפרק "איש הים ונער הפלא". את קולו של הבועה המזוהמת דיבב צ'ארלס נלסון ריילי בהופעתו הראשונה, אך מאז הוחלף במדבב טום קני.
חולשותיו של הבועה המזוהמת הם דברים חדים (כמו חוד של עיפרון), כפי שנראה בפרק "איש הים ונער הפלא", ובאחד הפרקים מתגלה כי אם מרטיבים אותו הוא הופך לבועתי טוב הלב ונהיה רשע כשהוא מתלכלך.
הבועה המזוהמת חבר במועדון הקריאה של הנבלים, אשר בו חברים כל נבלי העל בסדרה.
לארי הלובסטר.
לארי הלובסטר (באנגלית: Larry the Lobster) הוא שרירן ובעל מכון כושר, אשר עובד כמציל בחוף לגונה. את קולו מדובב דאג לורנס. לארי הופיע לראשונה בסדרה בפרק "מכנסיים קרועים".
לארי הוא יהיר ושוויצר. בפרק "חיים בהכחשה", אמר לארי כי אסור לחיות כמו בובספוג ופטריק, שפוחדים מהצל של עצמם, וכי הוא עצמו חי יום-יום כאילו הוא היום האחרון בחייו.
הוא חבר של סנדי מחבורת הקשוחים של החוף.
ההולנדי המעופף.
ההולנדי המעופף (באנגלית: Flying Dutchman) הוא רוח רפאים ירוקה של שודד ים אשר רודפת את ביקיני בוטום. דמותו של ההולנדי נעשתה בהשראת סיפורי הספינה ההולנדי המעופף. את קולו מדבב בריאן דויל-מראיי.
ההולנדי המעופף משאיר במהלך הליכתו אבק ירוק. הוא נראה כמו רוח רפאים ירוקה של שודד ים, בעל זקן מדובלל, כובע שודד ים, וזוג צמות קטנות. במקום רגליים יש לו זנב מתפתל. הוא מפליג בספינת רפאים. בפרק "בובספוג מכנסמרובע נגד הגל הגדול" התגלה כי ההולנדי המעופף יצא בעברו כשהיה תלמיד תיכון, עם דודתו של מר קראב, לוסי.
ההולנדי המעופף הופיע לראשונה בסדרה בפרק "הפחדן". בפרק "קללת ביקיני בוטום", ההולנדי המעופף הפך את בובספוג ואת פטריק לרוחות. בפרק "הרוח באה להתארח", כתוצאה מתאונה בה נהרסה ספינת הרפאים של ההולנדי המעופף, ההולנדי התארח בביתו של בובספוג עד שהספינה תוקנה. עד כה הופיעה הדמות ב־11 פרקים.. בנוסף, ההולנדי הופיע באחד הפרקים כמלאך המוות שמלווה את מר קראב ל-"תא של דייוויד ג'ונס" (גיהנום).
ההולנדי המעופף מופיע במרבית משחקי הווידאו של בובספוג. משחק הווידאו הראשון שהופיע בו הוא נקרא "בובספוג מכנסמרובע: אגדת המרית", שם שימש כבוס הסופי. במשך השנים הופיעה הדמות בשמונה משחקים נוספים - חמישה מתוכם מבית היוצר של בובספוג ושלושת האחרים מבית היוצר של ניקלודיאון.
פאטצ'י הפיראט.
פאטצ'י הפיראט (באנגלית: Patchy the Pirate), הוא נשיא מועדון המעריצים של בובספוג. בניגוד לשאר הדמויות בסדרה, פאטצ'י הפיראט הוא דמות לייב אקשן. את דמותו של פאטצ'י הפיראט מגלם טום קני.
לפאטצ'י הפיראט זקן שחור ורטייה בעינו השמאלית. כמו כן, יש פרוטזה במקום יד ימין, ורגל מעץ. יש לו תוכי מדבר בשם פוטי ופעמים רבות הם רבים זה עם זה.
פאטצ'י הפיראט הופיע לראשונה בפרק "חג מולד שמח". בפרק "הספוג שידע לעוף", הוא מאבד את "הפרק האבוד" של בובספוג. בפרק 255 מצליח לפגוש את בובספוג ואף שר לו שיר יום הולדת.
פוטי התוכי.
פּוֹטי התוכי (באנגלית: Potty the Parrot) הוא תוכי מדבר חסר טקט, וחיית המחמד של פאטצ'י הפיראט, נשיא מועדון המעריצים של בובספוג. עד שנת 2005, דיבב אותו סטיבן הילנבורג. החל משנת 2005 מדבב אותו פול טיביט.
פוטי התוכי הופיע לראשונה בפרק "חג מולד שמח", והוא מופיע תמיד עם פאטצ'י הפיראט, ונתפס כחברו הטוב ביותר. עם זאת, בפרקים רבים פוטי הוא היריב של פאטצ'י. בפרק "חבר או אויב" פאטצ'י ופוטי רבים זה עם זה בעת שהם עובדים כטבחים במסעדה.
סקוויליאם פנסיסן.
סקוויליאם פנסיסן השלישי, או בקיצור סקוויליאם פנסיסן (באנגלית: Squilliam Fancyson) הוא נבל המשנה בסדרה, והוא אויבו המושבע של סקווידוויד עוד מימי התיכון. את קולו של סקוויליאם מדבב די בראדלי בייקר ובגרסה העברית גלעד קלטר בכל הפרקים מלבד הפרק "שובו של סקווילאם" שבו דיבב יובל סגל.
סקוויליאם עשיר וקורא לסקווידוויד "סקווידי", באופן שמקטין אותו. ביתו גדול פי 4 מביתו של סקווידוויד. סקווידוויד מקנא בעושרו, בנגינתו ובפרסומו של סקוויליאם. סקוויליאם אוהב להשוויץ בפני סקווידוויד, אך לעיתים סקווידוויד גורם לסקוויליאם לקנא בו. בפרק "אני אוהב לרקוד", סקווידוויד מבצע אודישן ריקוד להשתתפות בתוכנית טלוויזיה. לאחר שסקווידוויד מתקבל, הוא מגלה שאת התוכנית מנחה ומנהל סקוויליאם.
בטסי קראב.
בטסי קראב או גברת קראב (באנגלית: Betsy Krabs) היא אמו של יוג'ין קראב וסבתה של פרל קראב. גברת קראב נשואה לוויקטור קראב. ויקטור אינו מופיע בסדרה, אך מוזכר בה. את קולה דיבב פול טיביט עד לפרק "משבר גיל העמידה". החל מהפרק שלאחריו, מדבבת את קולה ארווין סירנה ובגרסה העברית יעל יעקב. גברת קראב הופיעה לראשונה בפרק "פה מלוכלך".