חוברת זו מציגה דובר לא ידוע, שמשייך עצמו תחילה לכל דבר שקיים. ככל שהסיפור מתמשך, הוא נזכר בעברו ובקשריו עם חברי ליגת הצדק, בעיקר האל ג'ורדן וסופרמן. תיבות הטקסט שבהן הוא מדבר לקורא הן צהובות על רקע שחור, ועם הזמן הרקע משתנה לאדום. בדפים האחרונים, תיבות הטקסט מכילות סמל ברק צהוב. כאשר הדובר נזכר בחברויותיו ובקשריו עם אנשים, מחשבותיו מתחילות להתפקס, בציינו כי "אני מכיר אותו. אני כבר לא כל דבר שקיים. אני אלומת אור שמתפצלת דרך מנסרה". אולם, הוא עדיין מסוגל לראות צל העוטף את הכל בצורתו של נבל-העל דארקסייד. בעמוד האחרון, הירח נמצא על רקע שמיים אדומים, וברק צהוב מכה בו באלכסון, בצורת סמלו של פלאש, בעוד הדובר מציין כי כעת הוא זוכר.
מאמר של הניו יורק דיילי ניוז פורסם באותו יום, וציין את שובו של בארי אלן לחיים. הכותב ג'ף ג'ונס אף הוסיף וציין, כי כאשר הרוע המוחלט חוזר ליקום DC, הגיבור הגדול ביותר גם צריך.
המשבר האחרון.
חזרתו הגשמית של בארי אלן מתרחשת בחוברת השנייה של אירועי המשבר האחרון. לקראת סוף הגיליון, ג'יי גאריק ווולי וסט מרגישים תנודות, עליהן גאריק מעיר "אתה לא מזהה את התנודות האלה? זה לא יכול להיות... לא אחרי כל כך הרבה שנים... לא אחרי כל הזמן שעבר". בעמוד האחרון מופיע בארי אלן כשהוא במרדף אחר הקליע שהרג את אוריון, משיג את הרייסר השחור וצועק לעבר וסט וגאריק "ברחו!". בחוברת השלישית, גאריק מיידע את אייריס כי בעלה חי וקיים.
בינתיים, וולי ובארי רצים לתוך העתיד, ובעת מנוחתם וולי שואל את בארי אם באמת זה הוא. בארי מצר על העובדה כי לא יכל לעצור את מותו של אוריון, ותוהה מדוע חזר לאחר שהיה מת כל כך הרבה שנים. לאחר מכן, הם מתעמתים מול וונדר וומן, באטוומן, קאטוומן וג'יגנטה, שהפכו לאלות הזעם הלוחמות בעקבות שחרורה של משוואת האנטי-חיים. חרף העובדה שגרסה חדשה זו של אלות הזעם מסוגלות לאתר מאיצים, בארי מביסן באמצעות מומחיותו הרבה ורץ לכל אורך כדור הארץ החרב. הוא מוצא את אשתו ומציל אותה מעבדותה של משוואת האנטי-חיים. בראותה בפעם הראשונה מזה שנים, בארי מוצף ברגשות ומנשק אותה, וכוח המהירות שמאגף את גופו משחרר אותה מהשפעתה של משוואת האנטי-חיים. בחוברת מספר 17 האחרונה, בארי ווולי מובילים את הרייסר השחור לדארקסייד ומנציחים עליו מכה, שיחד עם קליע-אל אותו ירה עליו באטמן מבטיחים את תבוסתו האולטימטיבית.
הפלאש: לידה מחדש.
בשנת 2009, הכותב ג'ף ג'ונס והמאייר אית'ן ואן סקייבר יצרו מיני סדרה בת שש חוברות המחזירה את בארי אלן לתפקיד מרכזי ביקום DC כפלאש, בד בבד עם החזרתו של האל ג'ורדן לחיים במיני סדרה "". כאשר נשאלו מי מהפלאשים יופיע, הצמד ענה "כולם". המיני סדרה מתחילה עם חגיגות הערים קי-סטון סיטי וסנטרל סיטי את חזרתו של הפלאש, אולם בארי אלן מתחמק מהחגיגות ומנסה להבין את הנסיבות לחזרתו. ביקור במוזיאון הפלאש ושל חברו האל ג'ורדן אינו משקיט את דעתו והוא מתחיל לרוץ. כשנשאל על ידי ג'ורדן עבור מה, עונה אלן "עבור כל מה שהעולם יזדקק ממני".
מתגלה כי אמו של אלן נרצחה כשהיה ילד, וכי אביו נעצר באשמת ביצוע הפשע (וזאת בניגוד לסיפורים המקוריים שלפני המשבר, בהם שני ההורים חיים ובריאים). בארי מתאר עובדה זאת כ"התיק הפתוח היחיד שהשארתי מאחור". לפני שיעמוד על טיבם של הדברים, המאיץ הנבל סאביטר נמלט מכוח המהירות דרך פלאש, שרודף אחריו. כאשר בארי מצליח לשים ידיו על סאביטר, זה האחרון זועק מכאבים ומתפורר לאבק, לא לפני שאומר לבארי שהוא היה ההתחלה, והוא יהיה הסוף. באותו רגע, וולי וסט, ילדיו איירי וג'יי, ליברטי בל, ג'יי גאריק וקיד פלאש מתפתלים כולם מכאבים ונאגפים בברק. כשהוא בהלם על מה שעשה לסאביטר, אלן תוהה מה גרם לכך.
מאבקו של בארי בכת המהירות מסתיים במותו של מנהיגם, שרצה לנקום על מותו של סאביטר. הדבר גורם בשנית לכאבם של המאיצים השונים, אם כי וולי וסט זוכה להצצה לעתיד של בארי אלן כפלאש שחור. כשהוא מגלה שעצם נוכחותו מסכנת את חייהם של חפים מפשע, בארי חוזר חזרה לכוח המהירות, שם הוא פוגש בחבריו הוותיקים ג'וני קוויק ובמקס מרקורי. מקס מנסה להגיד לאלן שהפיכתו לפלאש שחור אינה באשמתו, וכאשר שניהם נמשכים לתוך כיס נוסף בכוח המהירות, הגורם העיקרי למעשים אלה מתגלה כפרופסור זום.
זום מגלה את תוכניתו לפרטי פרטיה - לאחר שבארי עזר לקיד פלאש במאבקו נגד סופרבוי-פריים באירועי המשבר האינסופי, ת'ון שלח פעימה תת-הכרתית לכוח המהירות כדי למשוך את מה שנשאר מתודעתו של אלן, מה שגרם להופעתו מחדש במשבר האחרון. לאחר מכן, זום הפך את עצמו לסוג חדש של מאיץ ויצר כוח מהירות שלילי שזיהם את אלן ואת המאיצים האחרים. לפני שבארי מסוגל להמשיך ולהילחם, זום נעלם. מקס מגלה לבארי שאלן הוא זה שיצר את מקור כוחם של המאיצים, ובמשך חייו יצר ללא יודעין את כוח המהירות הרגיל. וולי וסט נכנס עמוק לתוך כוח המהירות כדי להוציא את דודו משם, מוצא אותם והשלושה נמלטים חזרה. כעת כשהם טעונים בכמות רבה של כוח, בארי, וולי, ג'יי, מקס ובארט מתקיפים את פרופסור זום.
למרות שמספרם עולה על זום, הוא מצליח להוציא אלן מהמשוואה. הוא מגלה לו כי הוא אחראי לכל דבר רע שקרה בחייו של בארי, כולל מות אמו. בהמשך, הוא מחליט להרוג את אייריס לפני שהיא ובארי כלל נפגשו. בארי רודף אחרי זום, ומצטרף אליו וולי, שאומר לו לדחוף את גבולותיו כמה שרק אפשר כדי לשבור את מחסום הזמן. הם משיגים את ת'ון, בארי הופך לברק שגרם לכוחותיו, והשניים עוצרים בעד זום מלהרוג את אייריס. כשהם מחזירים את זום חזרה לזמן ההווה, הם מגלים שליגת הצדק, חברת הצדק והאאוטסיידרס יצרו מתקן מיוחד שנועד להחזיק את זום כלוא. הפלאשים קושרים אותו כדי למנוע ממנו לרוץ, ובארי משליך אותו למתקן ובכך מנתק אותו מכוח המהירות השלילי. לאחר שהאיום הוסר, כולם חוגגים את שובם של בארי והמאיצים לעולם החיים. הוא סוגר את תיק הירצחה של אמו ומתכוון לקחת על עצמו מספר תיקים נוספים שנותרו פתוחים מהשנים בהן נעדר. הוא מבלה יחד עם אייריס מעט לפני שהוא יוצא עם יתר חברי ליגת הצדק לוושינגטון הבירה לחגוג את חזרתו.
הלילה האפל ביותר.
בארי אלן הוא אחד הגיבורים המשתתפים בסיפור "הלילה האפל ביותר", יחד עם האל ג'ורדן, הגרין לנטרן של תור הכסף. הוא וג'ורדן מביטים במצבתו של באטמן ומהרהרים על מותם שלהם - בארי באירועי המשבר וג'ורדן באירועי דמדומי הברקת, כאשר מותו של בארי עורר צער עמוק ואילו מותו של ג'ורדן עורר זעם. ג'ורדן מסכם זאת באומרו "אני מתתי כחוטא. אתה מתת כמלאך". הם מציינים גם את מותם של אקווהמן ושל הצייד ממאדים, שהיו ליבה ונשמתה של ליגת הצדק, ומקווים שגם הם יחזרו לחיים.
בקרב עם הפקח השחור ז'ון ז'ונס, בארי מגלה משקע שחור מסתורי בקבר של באטמן, המתגבש כדם ומתחיל להשחית אותו ולהרקיב את עורו. הפקח השחור מבקש להרוג את ג'ורדן ואת אלן ולהחזירם בין המתים כדי לשמור על האיזון של היקום. אלן מביס את הפקח השחור יחד עם ג'ורדן וגיבורי-על נוספים כאטום, מירה, פיירסטורם ושניים מחברי שבט אינדיגו, ולאחר מכן מצטרף לוולי ולבארט למירוץ ברחבי העולם כדי להזהיר את כל גיבורי-על בנוגע לאיום של הפקחים השחורים. המסר שלו מגיע גם לידי קבוצת "הפושעים" שלא במתכוון, המגלים שחבריהם המתים ישובו לנקום בהם, והם מחליטים לפעול קודם ולהתקיף את הכלא "איירון הייטס" - אינם מודעים שהפושעים המתים מחכים להם.
בארי עוצר בעיר הולדתו של האל ג'ורדן, קוסט סיטי, שם הוא עד להגעת אדונם של הפקחים השחורים נקרון ומשרתיו סקאר והיד השחורה. ליגת הצדק, הטיטאנים, וולי ובארט מגיעים למקום ועוזרים לבארי להתעמת מול נקרון, אך זה האחרון משתמש בטבעות כוח שחורות כדי להפוך את סופרמן, החץ הירוק, בארט וגיבורי-על נוספים לפקחים שחורים. בארי והאל מוצאים את עצמם מותקפים מכל החזיתות ונאלצים לברוח. בארי נוסע בזמן יחד עם האל שתי שניות קדימה, מה שמשאיר את טבעות הכוח ללא מטרות עליהן יוכלו להשתלט ובכך הופך אותן לחסרות שימוש. כשבארי והאל מצטרפים מחדש למאבק בנקרון, שומר היקום גאנטת יוצר טבעת כוח כחולה, ובוחר בבארי כפקח כחול. הוא מצטרף לשורותיהם של חיל הפקחים הכחולים בראשותו של סיינט ווקר, ובד בבד לומד את מגבלותיה של טבעת הכוח החדשה שלו. בארי נאלץ להילחם נגד נכדו בארט, שאותו מגלה טבעת הכוח כחי אך כמי שעומד להיכנע לכוחה של טבעת הכוח השחורה. עד מהרה, בארי נעשה מיומן ביצירתם של מבני אנרגיה כחולים בהתבסס על דמיונו וביכולת התעופה החדשה שלו. הוא יוצר דמויות של בארט כאימפולס וכקיד פלאש בתקווה שהפקח השחור הצעיר יגיב להן, ובדיוק כאשר הוא מתכוון לקחת ממנו את טבעת הכוח השחורה, פרופסור זום מגיע, ווולי וסיינט ווקר עוזרים לבארי להביסו. בסוף אירועי "הלילה האפל ביותר", בארי ובארט מצטרפים באופן זמני לחיל הפקחים הלבנים.
הפלאש: כרך שלישי.
הכרך השלישי של הפלאש מתחיל עם סיום "הלילה האפל ביותר", ובמקביל לתחילת אירועי "היום הבהיר ביותר". בארי אלן משתקע מחדש לחייו בסנטרל סיטי, ומשתמש באמתלה של תוכנית להגנת עדים כדי לחזור לעבודתו במעבדה. לאחר מספר הרפתקאותיו המערבות את נבלי-העל מאסטר המראות וקפטן בומרנג ומעבר למאה ה-25, בארי נעשה למארחו של פאראלקס לאחר שהוא מצטרף לג'ורדן בחיפוש אחר ישויות הרגש של הספקטרום הרגשי, והודבק בישות הפחד מתוך חשש לביטחונו של ג'ורדן. הוא לבסוף משוחרר מהשפעתה של הישות לאחר שפרוסליט, ישות החמלה הכחולה, מראה לו את מעלותיו החיוביות.
כוחות ויכולות.