ב-29 באוקטובר 2002, יצא האלבום השני שנקרא: Stripped. ב-16 בספטמבר יצא לאור הסינגל הראשון מתוך האלבום: "Dirrty". הסינגל עצמו נכשל במצעד הסינגלים באמריקה, אולם ברחבי העולם הוא זכה להצלחה כאשר הגיע למקום הראשון במצעד הבריטי.
ב-16 בנובמבר, יצא הסינגל השני מתוך האלבום: "Beautiful", שהצליח מאוד ברחבי העולם והיגיע במצעדים רבים למקום ראשון וזכה לפרס גראמי לשנת 2004.
בהמשך יצאו הסינגלים: "Fighter" ,"Can't Hold Us Down", "The Voice Within".
ב-4 ביוני 2003, אגילרה וג'סטין טימברלייק יצאו לסיבוב הופעות יחד ששמו: "Justified &amp; Stripped Tour". סיבוב ההופעות נחשב להצלחה גדולה באותו שנה. במקביל, היא הפכה לדוגמנית הבית של מעצבת האופנה: "ורסצ'ה".
2004–2005: שיתופי פעולה וקמפיינים.
במהלך 2004 בזמן הבחירות לנשיאות ארצות הברית, אגילרה השתתפה בקמפיין שנקרא: "הצהר עצמך" ובו הסלוגן: "רק אתה יכול להשתיק את עצמך". הקמפיין היה למען הגברת מודעות ההצבעה. בתמונות שצולמו על ידי המעצב דייוויד לה-שאפל, נראתה אגילרה עם פה תפור ודמעה זולגת מעיניה, במטרה לסמל את המעמד של אדם לא מצביע. באותה עת, הקליטה עבור קמפיין חברת המכוניות: "מרצדס" סינגל בשם: "Hello".
לקראת סוף 2004, השתתפה בפסקול הסרט: "תפוס ת'כריש" והקליטה יחד עם מיסי אליוט, את השיר: "Car Wash", שהוא חידוש לשיר של רוס רויס דיסקו. בהמשך השתתפה בסינגל עם הראפר נלי בשיר: "Tilt Ya Head Back". אחרי הפסקה יחסית ארוכה, אגילרה הוציאה את ה-DVD של סיבוב הופעות הראשון שלה; "Stripped Live in the UK" בנובמבר 2004. בסוף דצמבר, היא השיקה בושם בשם: "Xpose".
בתחילת שנת 2005, אגילרה שיתפה פעולה יחד עם הרבי האנקוק בשיר: "A Song for You", שנכלל באלבומו: "Possibilities". באותה השנה שיתפה פעולה עם: אנדריאה בוצ'לי בשיר: "Somos Novios".
באותה השנה הופיעה באירוע הצדקה להגברת המודעות בתופעת הרעב בדרום אפריקה בשם: "איחוד הכוכבים", עם השיר: "When You Wish upon a Star" יחד עם: דיאנה רוס ולהקת: ווסטלייף.
2006–2007: Back to Basics.
ב-15 באוגוסט 2006, השיקה אגילרה את אלבומה השלישי והכפול, Back to Basics. הסינגל הראשון מהאלבום הוא: "Ain't No Other Man". הסינגל זכה להצלחה כאשר הגיע אל המקום השישי במצעד הבילבורד האמריקאי, ואל המקום השני בבריטניה.
ב-12 בספטמבר, יצא הסינגל השני: "Hurt", הסינגל הפך ללהיט גדול. בתחילת נובמבר, נערך טקס פרסי המוזיקה של MTV אירופה, שבו אגילרה זכתה בפרס: "זמרת הפופ של השנה".
באותו חודש קיבלה בובת שעווה בדמותה במוזיאון: "מאדאם טוסו".
ב-7 בנובמבר, יצא לאור סינגל לזמר: פאף דאדי בשם: "Tell Me" בשיתוף: לאגילרה, אגילרה קיבלה ביקורות טובות על הווקאליות שלה.
ב-17 בנובמבר, יצאה אגילרה לסיבוב הופעות שנקרא: "Back to Basics Tour". סיבוב הופעות זה נמשך עד 24 באוקטובר 2008.
ב-20 בפברואר 2007, יצא הסינגל השלישי: "Candyman", הסינגל נכנס בבכורה למקום ה-99 במצעד ההוט 100 בבילבורד שבארצות הברית, כשהוא מבוסס על מכירות הורדות חוקיות ברשת האינטרנט, כפי שחברת התקליטים רצתה ולא שלחה אותו לתחנות הרדיו.
בחודש אוקטובר, השיקה אגילרה בושם שני לנשים, שנושא את שמה. לצד פרסומת טלוויזיה פרובוקטיבית בה היא מצולמת בעירום. נכון ל-2016 הבשמים עדיין מבוססים כבשמים הנמכרים והטובים ביותר.
2008–2009: Keeps Gettin' Better: A Decade of Hits.
אגילרה כיכבה בסרט קולנוע הדוקומנטרי: "Shine a Light" של הרכב הרוק: הרולינג סטונז. הסרט יציג הופעה בלעדית שלה יחד עם ההרכב. הקרנת הבכורה של הסרט הייתה ב-4 באפריל 2008.
ב-7 בספטמבר 2008, הופיעה אגילרה בטקס ה-VMA. באותו הטקס שרה גרסה חדשה לשיר אשר איתו פרצה: "Genie In a Bottle" ובנוסף שרה את השיר: "Keeps Gettin' Better", שהוא הסינגל החדש מתוך אלבום הלהיטים שלה.
ב-7 בנובמבר, יצא אלבום להיטים: . ובו מיטב להיטיה, שני שירים חדשים.
2010: Burlesque.
אגילרה כיכבה בתפקיד הראשי לצד שר בסרט "בורלסק". אגילרה משחקת את אלי רוז, נערה מעיירה קטנה באיווה. לאחר שמנהל עבודתה לא משלם לה משכורת כמה חודשים אלי מחליטה לעזוב ללוס אנג'לס ששם בהתחלה היא לא מצליחה למצוא עבודה. לאחר זמן מה היא מגיעה למועדון בורלסק, בו מופיעות זמרות ורקדניות עם פלייבק. אלי מתחננת בפני מנהלת המועדון, טס שר, שתקבל אותה למועדון. בהתחלה טס מסרבת, אך כשצצות בעיות עם זמרת המועדון, ניקי (קריסטן בל), היא מחליפה אותה באליס. ניקי מחליטה להתנקם באליס ובאמצע ההופעה היא מנתקת את החשמל. אך אליס מתחילה לשיר ללא פלייבק והיא מצליחה להפתיע את הקהל. ובעקבות כך טס מחליטה להקים מופע עם אליס. בהמשך המועדון נקלע לקשיים כלכליים ואליס עוזרת לטס להתגבר עליהם.
אגילרה שרה את כל פסקול הסרט יחד עם שני שירים ששר שרה.
בשבוע הראשון לצאתו הסרט הכניס כ-17.6 מיליון דולר, מה שדירג אותו כסרט הרביעי המכניס ביותר. נכון להיום ההכנסות מהסרט ומהמוזיקה עומדים על כ-209 מיליון דולר.
השיר "Bound to You", של אגילרה היה מועמד לפרס גלובוס הזהב לשיר הנושא הטוב ביותר.
2010–2011: Bionic.
ב-8 ביוני 2010 יצא האלבום "Bionic". הסינגל הראשון מהאלבום ששמו "Not Myself Tonight" השיר הוא בסגנון פופ אלקטרוני. מילות השיר מדברות על שחרור עצמי וחופש הביטוי. השיר יצא לאור לתחנות הרדיו ב-30 במרץ ולהורדה דיגיטלית ב-14 באפריל 2010. השיר קיבל ביקורות מעורבות אך בעיקר טובות ממבקרים ששיבחו את היכולות הווקליות של אגילרה. השיר זכה להצלחה יחסית במצעדים כאשר הגיע ל-40 הראשונים במדינות כמו: אוסטרליה, ניו זילנד, שוודיה וארצות הברית ול-20 הראשונים בקנדה, יוון, סלובקיה, הולנד ובריטניה. השיר לווה בקליפ נועז שהכיל מוטיבים של BDSM. בקליפ נראית אגילרה מתנשקת גם עם גבר וגם עם אישה ולבושה בבגדים פרובוקטיביים. הקליפ היה מחווה לקליפ של מדונה "Express Yourself". הקליפ זכה לביקורות מעורבות ממבקרים שחשבו שהוא לא מקורי מספיק.
הסינגל השני מתוך האלבום יצא ב-18 במאי: "You Lost Me". השיר הצליח מסחרית ברחבי העולם והגיע למקום 20 במצעד בילבורד הוט 100.
בחודש ספטמבר יצא הבושם החדש של אגילרה בשם: "Royal Desire". ב-19 בנובמבר יצא לאור הפסקול הרשמי של הסרט: "ברולסק" בשיתוף הזמרת שר. האלבום נכנס ישירות למקום הראשון במכירות ב-iTunes.
ב-21 ביוני 2011, יצא סינגל של להקת "מארון 5" בשיתוף אגילרה בשיר: "Moves Like Jagger". אשר הגיעה מיד לאחר צאתו למקום הראשון בבילבורד הוט 100, ושהה שם למשך ארבעה שבועות. הסינגל סומן כהצלחה אדירה אצל אגילרה, מכיוון שזהו הסינגל הראשון שכובש את המקום הראשון בבילבורד מאז "ליידי מרמלד" בשנת 2001.
השיר, היה מועמד לפרס גראמי על שיתוף פעולה הטוב ביותר.
אגילרה הצטרפה למארון 5 על בימת טקס ה-AMA באותה שנה, והצליחה לצבור ביקורות מעורבות על משקלה והופעתה באותה שנה - כאשר הופעה הזו והקודמת לה (מופע המחווה למייקל ג'קסון) סימנו את תחילתה של התעסקות עיתונאית בלתי פוסקת במשקלה של אגילרה.
בשנת 2011 הצטרפה אגילרה לתוכנית "The Voice" בתור שופטת. התוכנית עלתה לשידור ב-26 באפריל, התוכנית זכתה להצלחה רבה כשהיא עוברת את נתוני הרייטינג של "אמריקן איידול", "X פקטור" ו-"Glee" ששודרו באותו ערב עם הפרימיירה של "The Voice".
2012–2015:Lotus ו-The Voice.
בדצמבר 2011 החלו שמועות על שיתוף פעולה בין אגילרה והמפיק השוודי מקס מרטין, ותחנות רדיו אמריקאיות פרסמו שסינגל חדש אגילרה בשם "Love Your Body" עתיד להשתחרר בפברואר 2012 והוא הוגדר כ"להיט מועדנים וחביב רדיו". עם עלייתה של העונה הרביעית של "The Voice" שחרור הסינגל (שלא אושר רשמית מההתחלה) נדחה עד לסוף אוגוסט 2012, כאשר הדמו לשיר "Your Body", דלף. ב-17 בספטמבר 2012, יצא לאור הסינגל הראשון "Your Body", שיר המקדם סטוצים ואהבה חד פעמית, מתוך האלבום "Lotus", הקליפ הפרובוקטיבי לשיר בו נראית אגילרה הורגת גברים עורר רעש רב.
האלבום "Lotus" יצא לאור בנובמבר באותה השנה, והוא נחל כישלון. הוא מכר כ-70 אלף עותקים בשבוע הראשון, והתמקם במקום השביעי במצעד הבילבורד 200. ב-4 בדצמבר, יצא הסינגל השני והאחרון מתוך האלבום: "Just a Fool", בשיתוף עם בלייק שלטון. רצועה זו זכתה לאהבה רבה מצד המעריצים, מאזינים ומבקרים שסימנו אותה כבלדת חורף מרגשת וכובשת, אך לסינגל לא צולם קליפ ולא היה קידום כלל.
בינואר 2013 שיתפה אגילרה פעולה עם הראפר פיטבול בשיר "Feel This Moment", שזכה להצלחה - מקום שמיני בבילבורד ומכירה של כ-3 מיליון עותקים בארצות הברית. ביולי 2013 אגילרה הוציאה לאור קליפ נוסף מהאלבום - "Let There Be Love" עם הקדשה למעריצים, ומאוחר יותר, בספטמבר באותה השנה, השתחרר שיר מיוחד מהפסקול לסרט ההמשך של משחקי הרעב "We Remain" בביצועה של אגילרה.
במקביל הודיעה אגילרה על כך שלא תשתתף בעונה הנוכחית כמנטורית בתוכנית "The Voice" עקב לוח זמנים צפוף של הופעות (כאשר סיבוב ההופעות לכבוד אלבומה החדש בוטל). בשנת 2013, חזרה אגילרה כרגיל להשתתף בתוכנית בעונה החמישית ועוררה רעש תקשורתי חיובי סביבה בעקבות ירידתה במשקל וכאשר אימצה מראה טבעי ונקי יותר.
במהלך העונה החמישית של "The Voice" יצא לאור סינגל, פרקי שיתוף הפעולה בין אגילרה לבין הצמד "A Great Big World" בשם "Say Something". הסינגל זכה להצלחה רבה כאשר מכר כ-3 מיליון עותקים בארצות הברית והתמקם במקום הרביעי במצעד הבילבורד.
2016–הווה: Liberation.
בפברואר- מאי 2016 אגילרה שפטה בעונה ה-10 של "The Voice" לאחר 2 עונות הפסקה שלקחה לאחר לידת ביתה.