בפגרה שבין רבע הגמר לחצי הגמר בעקבות טורניר הקופה אמריקה 2016 שהתקיים, איבדה נסיונל את ויקטור איברבו שתקופת השאלתו הסתיימה, אבל החתימה את מלך שערי הליגה הקולומביאנית, מיגל בורחה מקורטולואה. בדיעבד, זו הייתה אחת ההחתמות הטובות אי פעם של המועדון. ארבעה שערים שכבר בורחה בצמד המשחקים מול סאו פאולו נתנו לנסיונל ניצחון כולל של 1–4 בסיכום ואת הכרטיס לגמר מול אינדפנדיינטה דל ואייה. לאחר תיקו 1-1 באקוודור, היה זה שוב בורחה שכבש את השער היחיד בגומלין במדיין ונתן לנסיונל ניצחון של 1–2 בסיכום הכלי וזכייה שנייה בהיסטוריה של המועדון בגביע ליברטדורס. נסיונל גם הפכה לקבוצה שהשיגה הכי הרבה נקודות במפעל, 33, נקודה יותר מבוקה ג'וניורס.
ההתמקדות של נסיונל בגביע הליברטדורס ובגביע סודאמריקנה הצריך ממנה את חלוקת הסגל לשניים: שחקני ההרכב הראשון שיתמודדו במפעלים הביניבשתיים ושחקנים הקו השני שישחקו בליגה בהרכבים מעורבים. כך יצא שנסיונל, שהייתה בעצם הטובה בקולומביה, נאלצה לזנוח את הליגה המקומית אם כי בסמסטר השני של 2016 הצליח ההרכב השני של המועדון לסיים במקום הראשון את הליגה עד לשלב הפלייאוף וכן לזכות שוב בקופה קולומביה. בינתיים בגביע הסודאמריקנה נסיונל שוב הצליחה להגיע לגמר המפעל אחרי שעברה בחצי הגמר את סרו פורטניו מפרגוואי בזכות שער חוץ. בגמר הייתה עתידה לפגוש את הפתעת המפעל, שאפקואנסה והייתה פייבוריטית להיות הקבוצה הראשונה שתזכה בגביע ליברטדורס ובגביע סודאמריקנה באותה השנה. המשחק הראשון נקבע להיות במדיין וב-28 בנובמבר 2016 עשתה שאפקואנסה את דרכה לקולומביה, אך בסמוך למדיין התרסק המטוס שעליו היו חברי הקבוצה. מבין 76 הנוסעים, רק 5 ניצלו. המשחקים בוטלו ונסיונל כאות סולידריות ביקשה מה-CONMEBOL להעניק את הגביע לשאפקואנסה, מה שאכן קרה בפועל. בתמורה לכך, קיבלה נסיונל אות כבוד מהקונפדרציה הדרום אמריקאי ואף הוכרזה כקבוצת הפייר פליי של 2016 על ידי פיפ"א.
הזכייה בליברטדורס הבטיחה לנסיונל השתתפות בגביע העולם למועדונים ולשם כך נאצלה לוותר לחלוטין על הליגה המקומית. אף על פי שסיימה ראשונה ועלתה לחצי הגמר, פגשה את אינדפנדיינטה סנטה פה. לאחר ניצחון 1–2, נסיונל נאלצה לשחק את הגומלין עם שחקני הנוער של המועדון, שכן כל הסגל של הקבוצה הבוגרת טס ליפן לשחק בגביע העולם. הרבה ביקורת הייתה בקולומביה על הדימיור שלא דחו את המשחק, שהסתיים בתוצאה 0–4 לסנטה פה, שבסוף גם זכתה באליפות. נסיונל עצמה קיוותה להעפיל לגמר גביע העולם מול ריאל מדריד, אבל נעצרה בחצי הגמר על ידי האלופה היפנית, קשימה אנטלרס והובסה 0–3. במשחק על המקום השלישי ניצחה בדו-קרב בעיטות הכרעה את קלוב אמריקה ממקסיקו.
אם היה נראה שאחרי שנת 2016 תגיע ירידה טבעית, הרי שנסיונל שברה עוד כמה שיאים בטורניר האפרטורה של 2017. הקבוצה צירפה את אחד משחקני החיזוק המשמעותיים, החלוץ דיירו מורנו ויצאה להגין על תוארה כאלופת היבשת. בטורניר היבשתי הכל הלך הפוך ונסיונל סיימה אחרונה והפכה לקבוצה הרביעית בהיסטוריה שלא מצליחה לעבור את שלב הבתים שנה לאחר זכייה, אבל בליגה המקומית הכל עבד מצוין. הקבוצה שיחקה עם כל מיני מערכים שונים של שחקנים אבל פשוט הייתה גדולה על הליגה. שברה שיא נקודות לטורניר קצר (49) עם הפסד אחד בלבד ב-20 משחקים, כאשר הפסידה 3–4 בדרבי לאינדפנדיינטה מדיין וכן שברה את שיא הנקודות בכללי עם 62. הקבוצה הגיעה עד למשחק הגמר, שם פגשה את דפורטיבו קאלי. לאחר הפסד 0–2 בקאלי, במשחק שהיה צריך להיגמר בתוצאה גבוהה יותר. בגומלין במדיין, לנסיונל הייתה את כל הכוונה למחוק את הפיגור והיא אכן כבשה צמד תוך רבע שעה. לאחר גול מצמק של ג'פרסון דוקה והחזרת היתרון הגלובלי לקאלי, נסיונל כבשה עוד שלושה שערים, מחקה את הפיגור מהמשחק הראשון וזכתה באליפות ה-16 בתולדותיה.
ב-2018 החתימה הקבוצה את המאמן הארגנטינאי הצעיר, חורחה אלמירון ובנתה קבוצה כמעט חדשה לאחר שרוב כוכבי הזכייה של גביע הליברטדורס עזבו למועדונים אחרים. נסיונל לא כל כך הרשימה בצורת משחקה, אבל הצליחה להשיג את התוצאות הדרושות. היא שמרה על מאזן מושלם בביתה בליגה ועוד מבלי לספוג שער חובה. את הליגה הסדירה סיימה במקום הראשון אבל בפלייאוף זה הלך קשה יותר. ניצחון על דפורטיבו קאלי 1-2 בסיכום שני המשחקים וניצחון בפנדלים על אתלטיקו וילה אחרי תיקום מאופס ב-180 דקות, הביאו את הקבוצה למרחק של שני משחקים מעוד אליפות. היריבה בגמר הייתה דפורטס טולימה. נסיונל הצליחה לנצח בחוץ 0–1 ובגומלין התוצאה הייתה 1-1, שתי דקות לסיום. אז ביצע המגן הוותיק, חואן קאמילו סונייגה עבירה מיותרת על סבסטיאן וייה וראה את הכרטיס האדום. בתוספת הזמן כבשה טולימה את שער הניצחון במשחק, שהישווה את התוצאה ל-2-2 בסיכום ושלח את המשחק לדו-קרב פנדלים. למרות דחיפת הקהל, נסיונל לא הצליחה להתאושש מהגול המאוחר שספגה והפסידה גם בפנדלים.
הסמסטר השני התחיל בצורה גרועה הרבה יותר, כשנסיונל הודחה בשמינית גמר הליברטדורס על ידי אתלטיקו טוקומאן, כישלון גדול ללא ספק. בליגה נכשלה הקבוצה גם כן, כאשר במרבית הסמסטר אימן הרנן דריו הררה, שהחליף את אלמירון שפוטר. בסופו של דבר לא בצליחה נסיונל להעפיל לפלייאוף לראשונה מאז שנת 2012, אחרי תיקו 2-2 בחוץ מול איטגווי לאונס. ולמרות זאת, דווקא בגביע הצליחה נסיונל בצורה טובה יותר. המועדון הצטרף לסבב המשחקים בשמינית הגמר, שם ניצחון את פטריוטס 0-2 בסיכום. ברבע הגמר פגשה את ג'וניור ושער של דניאל בוקנגרה נתן להם את הכרטיס לחצי הגמר. מול לאונס בחצי, נסיונל הפגינה את העליונות שלה והצליחה לנצח בסיכום 1–4 כדי להעפיל לגמר מול אונסה קלדס. במשחק הראשון באצטדיון פלוגרנדה הצליחה נסיונל להוציא תיקו 2-2, מה שהעביר את ההכרעה אל אצטדיון אטנאסיו חירארדוט למשחק הגומלין. במצב של 1-1 וכאשר המשחק נכנס לדקה ה-90, הצליח בוקנגרה לכבוש בבעיטה חופשית את השער שהעניק לנסיונל את הגביע הרביעי בתולדותיה.
זכייה בתואר לאחר שלוש שנים.
לאחר עשור שהיה ברובו עשיר בתארים למועדון, נכנסה הקבוצה לתקופה שהיא לא רגילה ולא הצליחה לזכות בשום תואר מאז הגביע ב-2018. לקראת סוף שנת 2021 הוסיף המועדון גביע חמישי בהיסטוריה, שביסס אותו כמועדון עם מירב הזכיות הכוללות לקבוצה קולומביאנית - 30 תארים. נסיונל החלה את דרכה בגביע בשמינית הגמר כשהוגרלה מול פטריוטאס בויאקה וניצחה אותה 1-5 בסיכום שני המשחקים. ברבע הגמר פגשה נסיונל את אינדפנדיינטה סנטה פה. הפסד 1-2 באצטדיון אל קמפין וניצחון 0-1 בבית שלחו את המשחק לדו-קרב פנדלים שבו ניצחה נסיונל 1-3. בחצי הגמר התמודדה הקבוצה מול דפורטיבו קאלי. במשחק הראשון בחוץ פיגרה כבר 0-2, אבל הצליחה לחזור ולהשוות ל-2-2. במשחק הגומלין ניצחה נסיונל 0-1 והעפילה למשחק הגמר מול דפורטיבו פריירה המפתיעה. דווקא בגמר הכל הוכרע כבר במפגש הראשון באצטדיון אטנאסיו חירארדוט, כאשר נסיונל לא התקשתה להביס את יריבתה 0-5. הגומלין בפריירה היה בעצם לפרוטוקול ולמרות שנסיונל הפסידה 0-1, היא ניצחה 1-5 בסיכום וחגגה זכייה בגביע.
הוספת גביע הרקופה לארון הגביעים.
ב-10 במאי 2017 הוסיפה הקבוצה תואר בינלאומי נוסף וה-27 במספר התארים הכללי, לאחר שזכתה בגביע רקופה סודאמריקנה אחרי ניצחון על שאפקואנסה והפכה לקבוצה הקולומביאנית הראשונה שזוכה בתואר זה. במשחק הראשון הפסידה נסיונל בברזיל 1-2, אבל כעבור חודש בגומלין שנערך באצטדיון אטנאסיו חירארדוט, הביסה את שאפקואנסה 1–4 וניצחה בסיכום שני המשחקים 3-5.
סמל המועדון.
סמל המועדון עבר מספר שינויים מאז הקמתו ועד היום. תחילה היה זה מחומש שכולל בתוכו את הצבעים ירוק-לבן, צבעי הדגל של מחוז אנטיוקיה, עם השנים נכנס גם הכיתוב. בתחילה נכתב בתוך המחומש "מועדון אתלטיקו נסיונל", אבל ככה שעברו השנים הכיתוב השתנה לראשי התיבות של המועדון בלבד, האותיות A ו-N, על גבי משולש ירוק ומשולש לבן.
יריבויות.
בקולומביה נחשבת נסיונל למועדון הגדול ביותר והיא זו שעד כה זכתה במספר האליפויות הרב ביותר וכן במספר התארים הכולל הגדול ביותר, כאשר הרחק מאחור נמצאות מיונאריוס ואמריקה קאלי. מפגש של נסיונל עם קבוצות אלו זוכה לכינוי "הקלאסיקו קולומביאנו", המשחק הגדול ביותר בקולומביה בין הקבוצות המעוטרות ביותר ועם הקהל הרב ביותר. לנסיונל יש גם יריבות עירונית עם הקבוצה השנייה של העיר מדיין, אינדפנדיינטה מדיין. משחק הדרבי ביניהן קרוי גם "אל קלאסיקו פאיסה" (בספרדית El Clásico Paisa). פאיסה קרוי כל אחד שמגיע מאזור צפון מערב קולומביה וכולל את המחוזות: אנטיוקיה, ריסרלדה, קלדס וקינדיו.
אצטדיון.
הקבוצה משחקת את משחקיה הביתיים באצטדיון אטנאסיו חירארדוט וחולקת אותו עם יריבתה העירונית, אינדפנדיינטה מדיין. האצטדיון הוקם ב-19 במרץ 1953 ותכולתו 45,943 מקומות. הוא נחנך בטורניר ידידות שהתקיים בין נסיונל, דפורטיבו קאלי, אליאנסה לימה ופלמנגו.
על הצדיקים
על הצדיקים היא הברכה ה-13 בתפילת שמונה עשרה, והיא מופיעה בין ברכת המינים לברכת ירושלים. ברכה זו היא אחת מ-13 ברכות הבקשה של תפילת שמונה עשרה. הברכה מבקשת את הרמת קרנם של הצדיקים, וכן בקשה של היחיד להכלל בתוכם. כמו כן יש בה תפילה מיוחדת לגרים.
נוסח הברכה.