הוגו נאצ'יוס הפך ברבות הימים לשגריר יוון בארצות הברית. אלקטרה בת ה-19 החלה ללמוד באוניברסיטת קולומביה, ניו יורק, שם פגשה באיש אשר יהפוך לחברה, מאט מורדוק.
שנה לאחר מכן, אלקטרה ואביה נחטפו בידי טרוריסטים. מאט חבש מסיכה בפעם הראשונה ויצא למשימת חילוץ. אלקטרה ניצלה את הסחת הדעת ונלחמה בכמה מהטרוריסטים, אולם אחד מהם נפל מהחלון. המשטרה טעתה לחשוב שהטרוריסטים מתחילים לזרוק את בני הערובה מהחלון, ופתחו באש. הם הרגו את האדם שעמד קרוב יותר לחלון - הוגו נאצ'יוס, ממש לעיני בתו.
אלקטרה איבדה אמונה ותקווה. היא הפסיקה את לימודיה וחזרה לסין כדי ללמוד אמנויות לחימה. סטיק, חבר מובלעת טריטוריאלית בשם "הטיהור" (The Chaste), זיהה את האפלה השוכנת בנשמתה וניסה לאמן אותה בעצמו, אך היא צידדה עם ארגון "היד", פלג מיסטי של נינג'ות, שאימן אותה כמתנקשת. מאוחר יותר, היא עזבה אותם והחלה לפעול עצמאית, כאשר היא פגשה במורדוק בשנית - הפעם בזהותו כדרדוויל. היא נלחמה בו כדי שיעזור לה ללכוד פושע בשם אלריק ולנקוויסט, והוא בתורו הציל אותה ממוות בטוח. עד מהרה היא למדה על זהותו הכפולה, ולמרות שהשניים נלחמו יחדיו נגד ארגון "היד", הם מצאו עצמם גם מתעמתים זה מול זה. מלחמתם הראשונה הציבה את השניים מול נבל-העל גלדיאטור, שלאחריו אלקטרה נלחמה בקיריגי, מתנקש נינג'ה מארגון "היד" שהוחזר לחיים, וכעת הפך ליריב שקול וחזק.
אלקטרה הפכה למתנקשת הבכירה בשירותו של קינגפין, בוס העולם התחתון של ניו יורק. היא ניסתה להרוג את דרדוויל לאחר זה ניסה למנוע ממנה לרדוף אחר בן יוריק, עיתונאי חוקר ב"דיילי ביוגל". או אז, הקינגפין שכר אותה להרוג את חברו הטוב של מאט, פרנקלין "פוגי" נלסון. כשנלסון זיהה אותה כחברתו של מאט לספסל הלימודים, היא לא הייתה מסוגלת להורגו.
אלקטרה נדקרה באופן אנוש מהסאי שלה בקרב מול בולזאיי שנועד להכריע מי מהם יעמוד לשירותו של הקינגפין. אלקטרה הצליחה לזחול לביתו של דרדוויל בטרם מתה בזרועותיו, כאשר בולזאיי צופה בשניהם - חבוי בקהל אשר צפה במתרחש. מאוחר יותר, חברי ארגון "היד" גנבו את גופתה וניסו להחיותה. דרדוויל, בעזרתו של סטון - חבר מסדרו של סטיק - התערב והביס את הנינג'ות. הוא ניסה בעצמו להחיות אותה, אך נכשל, אם כי הצליח לטהר את נשמתה. בסופו של דבר, גופתה של אלקטרה נעלמה, כמו גם סטון.
שנים לאחר מכן, סטיק שלח אותה לעזור לחבר האקס-מן וולברין, בזמן בו הוא עבר רגרסיה לצורה חייתית יותר. היא נשארה איתו ועזרה לו לחשוב ולהתנהג שוב כאדם. זמן מה לאחר מפגשה עם וולברין, התגלה כי כאשר אלקטרה הוחזרה לחיים בידי סטון, אישיותה האפלה נפרדה ממנה והועברה לגוף גשמי כתוצאה מהריטואל אותו ביצע דרדוויל. חציה האפל, שכעת נקרא אריניס, לחם בה ונהרג בסופו של דבר על ידה, מה שהחזיר את צידה האפל לנשמתה.
היא נשכרה בידי מנהיג סוכנות S.H.I.E.L.D, ניק פיורי, כדי להתנקש בחייו של מנהיג עיראק אשר כרת ברית עם הארגון המרושע הידרה ולהשיג את מפתח סקורפיו ממנו. זאת הוא עשה כדי להימנע מלתת דין וחשבון בחוגים פוליטיים מסוימים. לאורך הדרך, ארגון הידרה ניסה לשכור את שירותיה, אך היא סירבה. הארגון שלח בעקבותיה את הסמוראי הכסוף, ונראה כי היא הרגה אותו, אם כי הוא מופיע בריא ושלם בחוברות קומיקס אחרות. כאשר היא השיגה את מפתח סקורפיו, היא סירבה לתת אותו לפיורי, משום שהאמינה כי לא ניתן יהיה לסמוך עליו כשברשותו נשק עוצמתי שכזה. במקום זאת, היא נתנה את המפתח לשוטר אשר הרג את אביה והיא ציינה בפניו שיש לו חוב כלפיה וכי נאסר עליו לאכזב אותה.
וולברין: אויב המדינה.
כאשר הידרה וארגון "היד" איחדו כוחות והרגו מספר גיבורי-על כדי להחיותם כלוחמים משלהם - כולל את וולברין, שהפך למכונת ההריגה המושלמת שלהם - ניק פיורי גייס את אלקטרה לעזרת ארגון S.H.I.E.L.D בהתבסס על מערכת היחסים שלה עם וולברין ועל עברה עם ארגון "היד". היא ניסתה למנוע מוולברין להרוג אחרים ולשנות אותו חזרה למצבו הקודם. במהלך קרב עם "היד", אלקטרה נהרגה והוחייתה מחדש כלוחמת הארגון, ובסופו של דבר הפכה למנהיגתו. ביחד עם גיבורי-על אחרים שהוסוו ללוחמי "היד", היא התקיפה את כוחותיו של פיורי, פצעה אותו אנושות וגרמה להשמדת נושאת המטוסים המרחפת, שמשמשת כמפקדת סוכנות S.H.I.E.L.D.
הודות לסוכנות "המגן", וולברין שב לאיתנו ודרש נקמה. בזמן קרב עם אלקטרה, היא דיברה אליו מנטלית הודות לכוחותיה החדשים שניתנו לה מארגון "היד". היא הסבירה לו שהריגתה בידי "היד" הייתה חלק מתוכניתה כל אותה עת. תחייתה המחודשת והסתננותה לארגון גרמה להם לחשוב כי הצליחו להחזירה לחיים כלוחמת שטופת מוח משלהם. בנוסף, היא אמרה לו ששניהם יפילו את "היד" ואת הידרה יחדיו. הם נלחמו נגד נינג'ות הארגון ויצאו כשידם על העליונה. אולם, המוטאנט גורגון התקיף את אלקטרה ועקף את חסימותיה המנטליות, מה שאיפשר לו לגלות היכן מטופל פיורי על פציעותיו. הוא השתגר יחד עם אלקטרה למקום הימצאו של פיורי כדי להורגו, אך הוא הובס לבסוף בידי וולברין, שהשתמש בכוחותיו כנגדו.
עקבותיה של אלקטרה נעלמו, וככל הנראה היא עברה למזרח אירופה, שם הקימה גרסה מיליטנטית משלה לארגון "היד". הלכה למעשה, באותה תקופה היא נחטפה בידי גזע הסקרול והוחלפה במתחזה.
פלישה סודית.
אלקטרה צצה מחדש, ונדמה שהיא הושחתה בידי ארגון "היד". היא הורגת, מחייה מחדש ולוכדת את פורעת החוק מיה לופז, בהתכוונה להשתמש בה כנשק. האוונג'רס החדשים מצילים את לופז, והיא דוקרת את אלקטרה למוות. אולם, בעת מותה מתברר כי מדובר במתחזה מגזע הסקרול משני הצורה. מותה מביאם למסקנה שהסקרול בלתי ניתנים לגילוי על ידי בעלי החישה המוגברת של הקבוצה, כמו ספיידרמן, וולברין ודוקטור סטריינג'. הגופה ניתנת לאיירון מן בידי ספיידרוומן.
אלקטרה האמיתית התבררה כבריאה ושלמה על אחת מספינותיהם של הסקרול והשתחררה מכלאה בקרב האחרון בין גיבורי-העל לסקרול הפולשים. איירון מן מיד מורה על החזקתה במעצר הגנתי במתקני S.H.I.E.L.D.
שלטון אפל.
אלקטרה היא היחידה שעברה ניסויים ועינויים רבים כאשר הייתה שבויה בידי הסקרול, והיא נחלשה בעקבות מספר רב של פציעות. נורמן אוסבורן פוקד על לקיחתה למחקר ולניטור כדי להבין כיצד קרה הדבר. שכיר החרב פלדין פורץ לתוך ארגון H.A.M.M.E.R (לשעבר S.H.I.E.L.D) ומתכוון להרוג את אלקטרה בעקבות פרס על ראשה. היא מתגברת עליו ומאלצת אותו למסור לה את המפתחות לשחרורה. לפני שהיא עוזבת, היא רוצחת את החוקר שגרם לעינוייה הרבים. במנוסתה לעבר משרדו של מאט מורדוק כדי להשיג ציוד רפואי, היא מתגברת על סוכנים רבים של ארגון H.A.M.M.E.R. פוגי נלסון מגלה אותה, והיא מתמוטטת מרוב איבוד דם.
אלקטרה מתעוררת כשהיא כבולה למיטת חולים בקליניקה. האחות אשר במשמרת לילה אומרת לה שהיא כבלה אותה לביטחונה שלה, אך אלקטרה משתחררת מכבלה בקלות. שיחתן מופרעת כאשר מתנקשת בשם ניקו פורצת פנימה ומנסה להרוג את שתיהן. אלקטרה שולחת את ניקו החוצה מהחלון ומחמשת את עצמה בכלי הנשק שלה. היא קופצת לסמטה ונלחמת בניקו, רק כדי לגלות שמתנקש נוסף בשם קרמיין נשלח לחסל אותה בעזרת רובה צלפים מאחד הגגות. היא מצליחה להביס את ניקו תוך שהיא מתחמקת מיריותיו של קרמיין, ומשיגה מניקו מידע אודות הסיבות לניסיון חיסולה. על הגג, קרמיין נרצח בידי בולזאיי - המחופש להוקאיי, שנשלח בידי אוסבורן להרוג את אלקטרה.
אלקטרה מטפסת לראש הבניין כדי להתעמת מול המתנקש השלישי, ומופתעת לגלות שמדובר בבולזאיי. למרות שהיא מהססת בתחילה, היא מחליטה להתמודד מול רוצחה. השניים מתחילים להילחם כאשר ניקו מגיעה לגג כדי לבדוק את שלומו של קרמיין. בולזאיי מנסה להרוג אותה בעזרת חץ תכסיס מלא בסם, אך היא ניצלת בידי אלקטרה, שנפגעת מהחץ בעצמה והסם מוחדר למערכת העצבים שלה. או אז, בולזאיי בועט באלקטרה המורדמת מהגג, אך היא נוחתת בשלום. הוא דולק בעקבותיה ומנסה לפגוע בה בעזרת הסאי שלה, בדומה לפעם הראשונה בה הצליח להרגה, אך הפעם היא מצליחה לפגוע בגבו בעזרת אחד מחיציו. ניקו מפריעה לקרב פעם נוספת ומנסה לירות בבולזאיי תוך כדי מנוסתו, ומתעמתת מול אלקטרה המסוממת וחסרת האונים. סוכני H.A.M.M.E.R מגיעים ויורים בניקו, אך הם נהרגים בידי וולברין בטרם הם מצליחים לחסל את אלקטרה.
לאחר שהם נמלטים מהארגון הרודף אחריהם, אלקטרה מנסה להתעמת מול אלה המאיימים לחסלה ולסיים את העניין בדרכי שלום. היא מגלה שסוכן S.H.I.E.L.D לשעבר בשם בראדרס הוא זה ששם פרס על ראשה. הוא אומר לה שהיא אחראית למותם של סוכנים רבים במהלך . אלקטרה אינה זוכרת את אשר התרחש ומבקשת לפתור את הסכסוך ללא כל שפיכות דמים. היא אומרת לניקו ולבראדרס שהאחראית למעשה הייתה המתחזה מגזע הסקרול. נורמן אוסבורן מופיע, ומגלה כי היא נחטפה לאחר המתקפה על נושאת המטוסים המרחפת. היא אינה זוכרת דבר משום שהשתמשה בתכסיס מחשבתי על-מנת לדחוק החוצה את המאורעות הסובבות את החייאתה כדי למנוע מהסקרול להשיג ידם על המידע. אוסבורן מתעמר באלקטרה כדי שתבטל את התכסיס, והיא מסכימה. מתברר כי למעשה היא אכן אשמה בפשעים אשר יוחסו לה. בסופו של דבר היא הורגת את ניקו ואת בראדרס.
דרדוויל: ארץ הצל.
בטרם החלה קשת הסיפור העוסקת ב, אלקטרה הצטרפה לצוות "קוד אדום" של הענק האדום, ונלחמה בקבוצת "אקס פורס" ובנבלת-על חדשה בשם הענקית האדומה. בתוך הקבוצה, לאלקטרה היו סכסוכים רבים עם דדפול והמעניש.