המשטר העיראקי ומדיניות החוץ שלו השתנו לאחר ההפיכה ב-1958. כמו בעיראק, גם טורקיה עברה הפיכה ב-1960. הצבא השתלט על הממשלה, וחוקק חוקה חדשה, יותר דמוקרטית, ובעצם כונן מחדש את התהליך הדמוקרטי. יחסי טורקיה עם מדינות אחרות במזרח התיכון השפיעו על יחסיה עם עיראק בשנות ה-40 וה-50. לאחר ההפיכה עברה מדיניות החוץ הטורקית לעידן חדש, שאינו פרו-מערבי לחלוטין ונשלט מאוד על ידי נאט"ו. טורקיה התייחסה לדאגותיה של מדינות המזרח התיכון בקביעת מדיניות החוץ שלה בעידן זה וקיימה יחסים טובים יותר עם מדינות המזרח התיכון.
סחר הנפט.
אסטרטגיית מדיניות החוץ החדשה של טורקיה בשנות ה-60 וה-70 הראתה את יתרונותיה במהלך משבר הנפט של 1973. מדינות אופ"ק הצהירו כי אספקת הנפט של טורקיה לא תהיה מוגבלת. יתרה מזאת, באוגוסט 1973 החל פרויקט צינור נפט בין טורקיה לעיראק, כירכוכ – יומורטליק, והפרויקט אכן התגשם ב-3 בינואר 1977. הצינור סיפק 2/3 מהביקוש לדלק של טורקיה.
סכסוך מים.
סוגיית זכויות המים הפכה למחלוקת עבור שתי המדינות החל משנות השישים של המאה העשרים, כאשר טורקיה יישמה פרויקט עבודות ציבוריות (פרויקט GAP) שמטרתו לשאוב את המים מנחלי החידקל והפרת באמצעות בניית 22 סכרים, להשקיה ומטרות אנרגיה הידרואלקטרית. אף כי סכסוך המים בין טורקיה לסוריה היה בעייתי יותר, פרויקט ה-GAP נתפס כאיום גם על ידי עיראק. המתח בין טורקיה לעיראק בנושא עלה באמצעות השפעת השתתפות סוריה והשתתפות טורקיה באמברגו של האו"ם נגד עיראק, לאחר מלחמת המפרץ. עם זאת, הנושא מעולם לא הפך למשמעותי כמו סכסוך המים בין טורקיה לסוריה.
הבצורת בשנת 2008 בעיראק עוררה משא ומתן חדש בין עיראק לטורקיה על זרימת הנהר בגבול. אף על פי שהבצורת השפיעה גם על טורקיה, סוריה ואיראן, עיראק התלוננה באופן קבוע על זרימת מים מופחתת. עיראק התלוננה במיוחד על נהר הפרת בגלל כמות הסכרים הגדולה בנהר. טורקיה הסכימה להגדיל את הזרימה מספר פעמים, מעבר לאמצעיהן, על מנת לספק לעיראק מים נוספים. בעיראק חלה ירידה משמעותית באחסון המים ותפוקות השאיבה בגלל הבצורת. בנוסף, כדי להחמיר את המצב, תשתיות המים בעיראק סבלו משנים של סכסוך והזנחה.
בשנת 2008, טורקיה, עיראק וסוריה הסכימו להפעיל מחדש את הוועדה המשותפת לשלושת הצדדים למים עבור שלוש המדינות, כדי לנהל טוב יותר את מקורות המים. טורקיה, עיראק וסוריה חתמו על מזכר הבנות ב-3 בספטמבר 2009 במטרה לחזק את התקשורת בתוך אגן החידקל-פרת ולפתח תחנות פיקוח על זרימת מים משותפות. ב-19 בספטמבר 2009, טורקיה הסכימה רשמית להגדיל את זרימת נהר הפרת ל-450 עד 500 ס"מ עד 20 באוקטובר 2009. בתמורה, עיראק הסכימה לסחור בנפט עם טורקיה ולעזור לרסן את פעילות הטרור באזור הגבול שלהם. אחת מסכרי ה-GAP הגדולות האחרונות בטורקיה על חידקל, סכר איליסו מתנגד בתוקף על ידי עיראק והוא מקור המריבה הפוליטית.
מלחמת איראן–עיראק וטורקיה.
הקמת משטרים המגובים על ידי צבא בטורקיה ובעיראק עד 1980, סייעה לחיזוק היחסים בכמה סוגיות עיקריות, שכן שתי הממשלות תמכו במדיניות חילונית ואנטי-רדיקלית, בגבולות יציבים ובקשר הדוק יותר עם המערב, שהיה נחוץ לעיראק לצורך הסכסוך עם איראן, ולטורקיה ברצונה להצטרף לאיחוד האירופי. במהלך מלחמת איראן–עיראק נותרה טורקיה נייטרלית רשמית ושמרה על היחסים הפוליטיים והכלכליים עם שתי המדינות. עם זאת, כמו כל העולם המערבי, בעקיפין תמכה טורקיה בעיראק במהלך מלחמת איראן–עיראק. בזמן שטורקיה שילמה עבור הדלק במזומן, עיראק קנתה סחורות מטורקיה באשראי שניתן לה מטורקיה. המשמעות היא שטורקיה תמכה כלכלית בעיראק במהלך שנות השמונים.
1990–2003: מלחמת המפרץ הראשונה ואחריה.
בעקבות העידן המייצב יחסית משנת 1960 עד 1990, הפלישה העיראקית לכווית ב-2 באוגוסט 1990 שינתה באופן קיצוני את יחסי טורקיה ועיראק. לאחר החלטה 665 של האו"ם, התירה טורקיה לכוחות האו"ם להטיס משימות מבסיסי האוויר שלה. הקואליציה של בעלות הברית השיגה את מטרתה ולא היה לה מנדט ולא רצון רב להמשיך לעיראק עצמה. הסכם הפסקת אש נחתם בספוואן ב-28 בפברואר 1991.:246 עם זאת, לאחר הפסקת האש פתחו גם השיעים בדרום וגם הכורדים בצפון עיראק במרד. כוחות כורדים כבשו את כירכוכ ב-19 במרץ 1991, אך כוחות משמר הרפובליקה של עיראק כבשו את העיר מחדש, ומאות אלפי כורדים ברחו לגבולות איראן וטורקיה כמקומות בטוחים יחסית. בעקבות התקרית ההיא, התקבלה החלטה 688 של האו"ם, שקראה לעיראק לסיים את דיכוי האוכלוסייה שלה, וסללה את הדרך ליצירתן של אזור אסור לטיסה צפונית לקו הרוחב ה-36 בעיראק (דרומית לארביל). מקלט בטוח זה הפך למקום מאוד מתאים עבור ה-PKK, אשר מופיע כארגון טרור בינלאומי על ידי מספר מדינות וארגונים, כולל ארצות הברית, נאט"ו, ואת האיחוד האירופי.
במהלך חוסר הסמכות בעיראק, היחס של טורקיה עם עיראק היה במצב ייחודי. השלטון המרכזי בבגדאד לא היה בעל כוח בצפון עיראק, אך נושא הליבה של טורקיה בנושא עיראק היה בצפון עיראק - כורדיסטן העיראקית. לכן, שלא ברצונה, ממשלת טורקיה יצרה יחסים פוליטיים עם הכורדים העיראקים, טלבאני וברזאני. כורדיסטן עצמאית וחלוקת היושרה בעיראק היו גם איום על ממשלת טורקיה. לכן, בזמן שטורקיה כוננה יחסים פוליטיים עם מנהיגים פוליטיים כורדים, היא גם חתמה על הסכם מרדף חם עם סדאם חוסיין, וביצעה כמה פעולות צבאיות בכורדיסטן העיראקית נגד מחנות PKK. 'חוזה ביטחון ושיתוף פעולה עם גבולות' נחתם בין טורקיה לעיראק בפברואר 1983, והמבצע הצבאי הראשון בוצע באותה שנה על ידי הכוחות המזוינים של טורקיה. לאחר מכן פעולות צבאיות אלה חזרו על עצמם מספר פעמים בשנות השמונים, התשעים והאלפיים. טורקיה פתחה ב-24 פעולות צבאיות בעיראק בין 1983 ל-2008. בכך טורקיה תרגלה את כוחה הפיזי בעיראק, מאיימת ומאזנת את הכוח הפוליטי הכורדי העיראקי כמו גם נלחמת נגד ה-PKK. טורקיה מצאה פתרון פרגמטי לבעיית הביטחון שלה במצב ייחודי זה, אך מצב זה היה תקופה קצרה בלבד והוא השתנה לאחר מלחמת המפרץ השנייה והפלישה לעיראק.
פלישה לשנת 2003.
מערכת היחסים של טורקיה עם עיראק עברה לעידן חדש לאחר הפלישה לעיראק. בעידן זה, שלמותה של עיראק חשובה לא פחות מבעיית PKK ביחסי טורקיה-עיראק. מעמדן של זכויות האוכלוסיות בכירכוך וטורקומן הם עיקרי המחלוקות. לפני הפלישה התבקשה טורקיה לסייע לפלישה על ידי ארצות הברית, אולם ב-1 במרץ 2003 דחה הפרלמנט הטורקי את היותו חבר פעיל בכוחות הקואליציה בהנהגת ארצות הברית בעיראק. החלטה זו של הפרלמנט הטורקי נתפסה כתגובה כנגד הפעולה החד-צדדית של ארצות הברית במזרח התיכון, והן כרצון להרחיק את טורקיה ממלחמת עיראק. : 3–4 בזמן שטורקיה לא יצאה מתוכניות ארצות הברית על עיראק, מנהיגי כורדיסטן העיראקית קיבלו כוח רב יותר על ידי ברית עם ארצות הברית במהלך המלחמה. הממשלה האזורית של כורדיסטן (KRG), שמתנהגת כמו יחידה עצמאית למחצה, הגיחה בסופו של דבר, ומדיניות החוץ האגרסיבית שלה הפריעה למנגנוני מדיניות החוץ הטורקית. לאחר שנת 2003 נראו מפות פוליטיות של כורדיסטן הגדולה, המכסות את אדמות טורקיה, על קירות מבני המדינה של KRG. יתר על כן, מסעוד ברזאני דיבר לעיתים קרובות על בעיותיהם של הכורדים בטורקיה והשתמע מדבריו כי יוכל לגייס את העם הכורדי כנגד ממשלת טורקיה. לבסוף התנגד ברזאני להצעותיה של טורקיה בדבר פתרון קבוע של בעיית המעמד של קירקוק, והוא התעלם מהרגישות של טורקיה ביחס לזכויות הבסיסיות של אוכלוסיית הטורקמנים בעיראק. : 4 עמדות כאלה של ברזאני פירושו פשוט כי ה- KRG התכונן להיות מדינת לאום עצמאית וממשל ברזאני היה פתוח לשימוש בכל כלי באופן פרגמטי כדי להגן על ריבונותו.
כמו כן, הפעולות הצבאיות של טורקיה הוגבלו כתוצאה מהפלישה. שטחי עיראק היו תחת שליטה אמריקנית, וטורקיה תמיד הייתה זקוקה לאישור של ארצות הברית כדי לפתוח במבצע צבאי בעיראק. יחסים מוגבלים עם מנהיגים כורדים עיראקיים, פעולות צבאיות ויחסים מוגבלים מאוד עם השלטון המרכזי בשנות התשעים הפכו ללא מועילים, ובעקבות כך הייתה טורקיה זקוקה לאסטרטגיה חדשה שונה מזו של שנות התשעים.
אחרי 2008, טורקיה הציגה אסטרטגיה חדשה: תקשורת עם כל הקבוצות בעיראק. עבור הערבים הסונים והשיעים כאחד, שרוצים לשמור על איחוד עיראק, טורקיה היא שחקן חיוני. היחס של טורקיה לעתידם של מחלוקות כורדיסטן העיראקית וכירכוכ יכול להגביל את מנהיגי הכורדים. אז בעידן החדש, טורקיה מנהלת מערכות יחסים עם קבוצות פוליטיות נוספות בעיראק.
נוכחות צבאית טורקית בעיראק.
בהתבסס על הסכמים מהשנים 1995 ו-1997 הנוגעים לפעילות אנטי טרוריסטית של טורקיה נגד ה-PKK, טורקיה מחזיקה כוח צבאי של כ-2,000 חיילים בבסיסים כ-30–40 ק"מ בתוך עיראק. הבסיסים ממוקמים במקומות שונים לאורך הגבול הטורקי במחוז דוהוק. לאחר הפריסה הראשונית לשדה התעופה הצבאי לשעבר העיראקי בבמארני, השליטה הצבאית הטורקית התרחבה מערבה מבמארני לעבר באטיפה וממזרח סמוך לעיירה של קאנימאסי במחוז חמדיה. בטורקיה יש גם כ-150 חיילים ו-20 טנקים באזור מוסול בשיקה, חלק מהפעולות נגד המדינה האיסלאמית האחראיות על הכשרת חיילים עיראקיים.
ב-25 באפריל 2017 נהרגו 5 לוחמי פשמרגה במהלך מתקפה טורקית על סינג'אר בעיראק. טורקיה טענה כי הרסה את "מרכז הטרור"; ואילו עיראק הוקיעה את התקיפה כ"הפרה של ריבונותה".
יחסים עכשוויים.