למרות כל זאת, פעילותו החשובה ביותר של הגולגולת הייתה להסרתו של קפטן אמריקה ממעמדו כגיבור-על והחלפתו בג'ינגואיסט בשם ג'ון ווקר, שהיה ידוע בשם הקוד "סוכן ארצות הברית". על אף שבתחילה ניסה ווקר לעמוד באידיאלים עליהם שמר קפטן אמריקה, הגולגולת ארגן את רציחתם של הוריו ובכך הטריף את דעתו לכדי שיגעון ולגרימת נפילתו למסעות הרג ולהכתמת שמו של קפטן אמריקה. אולם, כמו שאר מזימותיו שסוכלו בעבר, גם תוכנית זו נועדה להיכשל כאשר פרצופו האמיתי של הגולגולת עמד להיחשף בוועדה לפעילות על-אנושית. הוא ניסה לתמרן את ווקר כדי שיהרוג את קפטן אמריקה, וכשזה האחרון הביס אותו, הגולגולת נראה שבע רצון על מה שעשה לרוג'רס ולווקר ולמוניטין של קפטן אמריקה. הוא הסביר שכל זאת הוא חלק משיטת פעולתו החדשה דרך פרויקטים מרובים מאשר מזימות עקביות ורציפות אשר יגרמו לגיבורי-העל לרכז את כל מאמציהם לסכלם. בנוסף, פרויקטים אלה נוגעים לגרימת מותו של רוג'רס בזמן אותו הגולגולת יבחר לנכון, וכי רוג'רס אינו יכול לגעת בו משום הסטטוס שלו כאיש עסקים אמריקני אמיד. רוג'רס מבולבל ומלא תהיות על אותו אדם מסתורי שפניו דומות לו ואשר מתיימר להיות יריבו המת. הוא שם לב לכך שהגולגולת אינו שואף עשן מתוך מחזיק הסיגריות שבפיו, והתברר שהסיגריה הכילה מנה קטלנית של הרעל החביב על הגולגולת האדומה - "אבקת המוות", שיועדה לרוג'רס. אולם, המלכודת אותה טמן לו הגולגולת פעלה כנגד שמידט כאשר ווקר פגע בו מאחור עם המגן שלו. כתוצאה מכך, הגולגולת סבל מעיוות חמור בפניו הודות לאבקה, ופניו החלו להידמות לגולגולת אדומה חיה, חסר שיער, ועורו הצטמק וקמל ושינה את צבעו לאדום. חרף זאת, הגולגולת לא מת עקב השפעות נוסחת הסופר-חייל.
לאחר מכן, הגולגולת יזם קונפלינקט בין ארצות הברית לבין סימקריה, ארצה של המתנקשת סילבר סייבל. הוא הצטרף לקונספירציית "מעשי נקמנות", אולם הותקף בידי הטרוריסט המוטאנט מגנטו, שורד השואה אשר רצה להענישו על מעשיו במשטרו של היטלר. מגנטו קבר אותו חי עם כמות מים שמספיקה למספר חודשים. הגולגולת נותר לכוד ועל סף מוות, והבין את הפסול בדרכיו, עד אשר ניצל בידי אחד מחייליו, קרוסבונז.
מערכת יחסיו של הגולגולת עם נבלי-על אחרים הייתה בעייתית משום שהם גינו אותו בעקבות הרקע הנאצי שלו. בקשת הסיפור "רחובות הרעל", הגולגולת הציע ברית עם קינגפין כדי לייבא סוג של סם חדש לרחובות ניו יורק, אך הקינגפין סירב לצודד עצמו עם הנאצי והשניים פתחו במלחמת סמים. בעקבות כך, הוא הביס את הגולגולת, שהיה במצב רעוע וחלש, בקרב פנים אל פנים וחס על חייו בתנאי שכף רגלו לא תדרוך יותר בתחום שיפוטו של הקינגפין. החריג מכולם היה הנבל הנאצי ברון וולפגנג פון סטרוקר, מנהיג ארגון הידרה. לאחר שסוכני הגולגולת איפשרו לפון סטרוקר להיוולד מחדש, פון סטרוקר אסיר התודה איפשר לגולגולת להשתמש במשאבי הארגון שלו.
במנוסה.
זמנו של הגולגולת בוושינגטון הגיע לסיומו עם לכידתו בידי האופטמן דוטשלנד (קפטן גרמניה) ונלקח לארץ מולדתו לעמוד למשפט על הפשעים נגד האנושות אותם ביצע, שנבעו עקב זמן שירותו כסוכן הרייך השלישי. הגולגולת ניצל בעור שיניו בעזרתו של ארנים זולא, ואולץ לביים את מותו ולהסתתר במקום מחבוא בהרי הרוקי. הוא גייס לשורותיו את וייפר הסוציופטית, דבר אשר ניכר אותו מחייליו וטלטל אותו בעקבות חטיפתה של חברתו של קפטן אמריקה, דיימונדבק, בידי קרוסבונז, וגילויו של רוג'רס את מקום מחבואו. הגולגולת פיטר את קרוסבונז, ווייפר הובסה בידי קפטן אמריקה לאחר שהיא השתמשה בכספיו של הגולגולת כדי להשתמש במדיום הטלוויזיוני ברחבי אמריקה במטרה לעוור צופי טלוויזיה.
הגולגולת הופיע מחדש בזמן קשת הסיפור "מבצע: אי A.I.M", בו הוא מגלה כי הוא נחשף לאותו שיתוק קבוע שקפטן אמריקה נחשף אליו הודות לנוסחת הסופר-חייל. כאשר המדענית המרושעת סופריה הציעה לקפטן אמריקה תרופה, הוא סירב להצעה לאחר שהרגיש שבכך הוא יהיה "חייב לה". הגולגולת לקח לעצמו את התרופה וככל הנראה הרג את סופריה, וארגן את חטיפתו של קפטן אמריקה בידי סוכניו כדי לקחת ממנו עירוי דם שריפא אותו מהשיתוק.
בני ברית בעל כורחם.
ריפויו של קפטן אמריקה מביא בסופו של דבר לשיתוף פעולה הכרחי עם הגולגולת האדומה - כת נאצית שהעריצה את אדולף היטלר כאל גילתה קובייה קוסמית אשר הכילה את מוחו של היטלר, אשר הונח שם בידי הגולגולת עצמו. השניים פעלו לעצור את הכת מלהפעיל את הקוביה, והגולגולת הציע לשלוח את קפטן אמריקה (כנגד רצונו) וללכוד את היטלר בתוך הקוביה בשעה שהגולגולת ישתמש בה כדי לכבוש את האנושות. קפטן אמריקה נמלט ופצע את הגולגולת בזרועו בעזרת מגנו, מה שגרם לזה האחרון לשמוט מידו את הקוביה. או אז, הקוביה הפכה לבלתי יציבה והשמידה את הגולגולת האדומה.
תחיה קוסמית.
העובדה כי הרוע אינו מסוגל למות היא נכונה, וזה נכון גם במקרה של הגולגולת האדומה. הגולגולת היה לכוד בממד סיוט גיהנום ונאלץ לשרת עולם של מהגרים כנער מעלית, אולם הרוע הנצחי שלו היה כה עוצמתי, עד אשר הוא הצליח לברוח מכלאו. כתוצאה מכך, הגולגולת כעת הוא בעל כוחות מוגבלים לשינוי מרקם המציאות, מה שהופך אותו לאיום קוסמי אמיתי. בנוסף, עזר לו הנבל קורבאק, שהתחזה לקאנג הכובש. הוא נשלח לספינתו של גלקטוס כדי לגנוב ממנו כוח אשר בסופו של דבר יבטל את מגבלות כוחותיו של הגולגולת. בהמשך, קורבאק ארב לו והצליח לגנוב ממנו את כוחותיו ולגרש אותו חזרה לכדור הארץ.
מאוחר יותר, הגולגולת קידם את עצמו למעמד של שר הביטחון כדל ראסק (אנגרמה ל"גולגולת אדומה") כדי לפתח נשק ביולוגי בו ערך ניסויים בהר ראשמור. הוא נחשף והובס בידי האוונג'רס.
אלכסנדר לוקין וחייל החורף.
חייל החורף המסתורי התנקש בחייו של הגולגולת האדומה, תחת פקודותיו של הגנרל הסובייטי לשעבר אלקסנדר לוקין, אשר רצה להשיג את ידו על הקוביה הקוסמית החדשה אותה יצר הגולגולת. כאשר הגולגולת נורה, הוא ניסה להשתמש בקוביה כדי להחליף גופות עם אלקסנדר לוקין כדי לשרוד, אך משום שהקוביה הייתה חלשה הוא הצליח רק להעביר את מוחו לגופו של לוקין, מה שלכד את שתי האישויות יחדיו בגוף אחד, והשניים ניהלו מלחמת שליטה - מלחמה שהגולגולת נראה שמנצח בה. במהלך מזימה כדי למשוך את קפטן אמריקה, הגולגולת/לוקין גייס לעזרתו מספר גלוחי ראש גרמניים והפך אותם לממשיכי דרכו של מאסטר מן. הוא גרם לקבוצה, לה קרא "גזע העל" (Master Race), להנחיל מתקפה על לונדון, אך מתקפה זו נבלמה בידי קפטן אמריקה, ספיטפייר ויוניון ג'ק. לאחר מכן, הגולגולת/לוקין הפעיל "רדום", רובוט המתוכנת להשמדה המונית ואשר נוצר לכאורה בידי דוקטור דום. הרובוט פגע בחלק נכבד של מפקדת קרונס החדשה בלונדון, אך הושמד בידי קפטן אמריקה ובאקי. בעקבות מאורע זה, הגולגולת האדומה שלח הודעה תקשורתית המודיעה על שובו, בעוד לוקין גינה את מעשיהם של הגולגולת האדומה ושל קפטן אמריקה, ותמך בחוק רישום העל-אנושיים. לאחר מכן, הגולגולת הציג בפני לוקין את שותפיו, קרוסבונז וסין.
עם פילוגם של גיבורי-העל בעקבות הצעת חוק רישום העל-אנושיים, הגולגולת מתמרן את האירועים לתועלתו בעזרתם של דוקטור פאוסטוס, ארנים זולא ודוקטור דום. תוכניתו כוללת את איחודם של קפטן אמריקה עם אהובתו שרון קרטר, שמהופנטת בידי דוקטור פאוסטוס. לאחר מלחמת האזרחים, הגולגולת מנחיל את תוכניתו, ומארגן את הירי בקפטן אמריקה בידי קרוסבונז בשעה שהוא מוכנס לבית המשפט להישפט על מעשיו החתרניים. במהומה המתחוללת, קרטר - הנשלטת בידי פאוסטוס - מתנקשת בחייו של קפטן אמריקה. זהו רק השלב הראשון בתוכניתו הזדונית של הגולגולת. עם גילוי זהותו כלוקין, הוא מביים את מותו ומנחיל את השלב השני בתוכניתו - להשתמש בהחזקותיה הרבים של חברת קרונס כדי לשתק כלכלית את ארצות הברית, ולשטוף את מוחם של סוכני S.H.I.E.L.D כדי שיפתחו באש על קהל מפגינים מול הבית הלבן. הוא ממשיך את מתקפתו בכך שהוא יוזם מהומה על ידי שימוש בכוחות אבטחה מקרונס ומים שעורבבו עם סמים באנדרטת לינקולן.
כל מעשיו אלו נוצרו בסופו של דבר כדי לקדם את מעמדו הציבורי של הפוליטיקאי גורדון רייט, שהיה נתון לשליטתו של הגולגולת, ואשר "פעל" לישב את הסכסוך. רייט שרד ניסיון התנקשות מבוים בידי פלוגת הנחשים (Serpent Squad). עם היבחרו, רייט יוביל להפעלת מדינת משטרה אשר תנוהל בחשאי בידי הגולגולת האדומה. כמו כן, הגולגולת מתכנן להעביר את תודעתו לבנה של קרטר שטרם נולד, שככל הנראה הוא בנו של רוג'רס ואשר יש בו את מאפייני נוסחת הסופר-חייל.
שתי המזימות נכשלות עקב חוסר הסבלנות וחוסר היעילות אותה מפגינה בתו של הגולגולת - סין, העומדת בראש פלוגת הנחשים. התקפתה על קרטר גורמת להפלת התינוק, וכן מנסה להכשיל את התנקשותו המבוימת של רייט על ידי כך שהיא מנסה להורגו באמת. קרטר - המופעלת מרחוק בידי פאוסטוס - מצליחה להתמרד, ולפני הימלטותה יורה בלוקין למוות. זהו אינו סופו של הגולגולת האדומה, שכן שניות לאחר מכן, ארנים זולא העביר את תודעתו לאחת מגופות הרובוטים שלו. זאת ועוד, הוא אינו יכול לחזור לגופתו המקורית, כיוון שהיא הושחתה בידי קפטן אמריקה מתחזה, וכך הוא לכוד בגוף הרובוטי לעת עתה.
קפטן אמריקה: נולד מחדש.