עומאר, נואש לנקום בארגון של בארקסדייל על מותו של בראנדון, הורג את אחד הסגנים בארגון בשם סטינקום ובסופו של דבר מחליט להעיד בבית המשפט נגד הרוצח האמיתי של חברו, חייל בארגון המכונה "בירד", במקרה הרצח של וויליאם גאנט (העד מהמשפט של דיאנג'לו שנרצח מאוחר יותר בהוראת סטרינגר). גם דיאנג'לו מתכוון להעיד אחרי שהוא מגלה על מותו של וולאס (זאת לאחר שביקש אישית מסטרינגר לעזוב את וולאס) - אך ביקור מאמו שמבקשת ממנו לשאת את גזר הדין שהוטל עליו בשביל המשפחה משנה את התמונה. אייבון נכנס לכלא ל-7 שנים, דיאנג'לו ל-20, ואילו ווי-ביי, חייל שאחראי על עשרות מקרי רצח נשפט למאסר עולם.
בסיום החקירה מקנולטי מועבר ליחידה הימית של משטרת בולטימור, כאשר גם הרק, קארבר ופריזבלוסקי עוברים ליחידות אחרות.
עונה 2.
במהלך פטרול שגרתי בים, מקנולטי מוצא גופה במים. המקרה מתקשר למקרה מוות נוסף בנמל בו נמצאו 13 גופות בתוך מכולה. תחילה המקרה נראה כמו התאבדות, אך אחרי שבדק את הנושא ביחד עם שוטרת מקומית בשם בידי ראסל, מקנולטי גורם למשטרה לסווג את המקרה כרצח. מקנולטי, פרימון ובאנק יוצאים לחגוג בבר על כך שהפילו 13 מקרי רצח על הבלש ריי קול אך יום לאחר מכן פרימון ובאנק מגלים ששניהם יאלצו לחקור את המקרה, במקום ריי קול.
בינתיים בכיר במשטרה בשם סטאן ואלצ'ק (חמיו של פרזבלוסקי) מסתכסך עם ראש ארגון העובדים בנמל, פרנק סובוטקה. ואלצ'ק מחליט להיעזר ביחידה לפשעים חמורים ומאלץ אותה לפתוח בחקירה נגד הארגון ונגד פרנק. במסגרת החקירה, מקנולטי חוזר ליחידה, ואילו באנק ופרימון מצליחים לשכנע את דניאלס לקחת על עצמו את מקרה הרצח במכולה.
בינתיים הארגון מתחיל לעסוק בפשע: בנו של פרנק, זיגי, ודודנו ניקי מתחילים להבריח כימיקלים מהם סמים מיוצרים לארצות הברית בשיתוף פעולה עם ארגון פשע יווני. הוא מסתבך עם סוחר סמים בשם צ'יז, בכיר בארגון הסמים של מזרח בולטימור בניהול "פרופוזישן" ג'ו. בזכות קשריו עם היוונים זיגי סוגר את הסכסוך עם צ'יז.
עניינים קודמים חוזרים לעלילה: ראשית, מקנולטי מחפש את עומאר כדי שיעיד במשפט של בירד. הוא שולח את באבלס למצוא אותו, ובסופו של דבר באבלס מצליח לאתר אותו. במשפט עומאר מפתיע את חבר המושבעים, עונה לשאלות בכנות, מתבדח ותוקף את עורך הדין של בירד, שמייצג את שאר אנשי הארגון של בארקסדייל, מוריס לוי: כשלוי מאשים אותו בכך שהוא שותה את הדם של אלו ששותים את הדם מהעיר, עומאר מטיח בו שהוא עושה את אותו הדבר - "לי יש את השוטגאן, לך יש את המזוודה". בירד מורשע בזכותו של עומאר, שנתן עדות שקר. שנית, משפחת בארקסדייל בכלא מנסה להתאקלם וכאשר סוהר עושה לאייבון ולווי-ביי בעיות אייבון רוקם תוכנית לפיה הוא יבריח לכלא סמים המהולים ברעל עכברים וכימיקלים אחרים, שיגרמו למספר מקרי מוות שיפעילו לחץ תקשורתי ופוליטי על הנהלת הכלא למצוא את מקור הברחת הסמים המקולקלים. בתמורה, אייבון יפליל את אותו סוהר בהפצת הסמים המקולקלים ובכך יגרום לשחרורו המוקדם. דיאנג'לו לא מעוניין לקחת חלק בתוכנית של אייבון, ומבין שהוא אחראי לכל מקרי המוות שאירעו לאחרונה בכלא, ביניהם של חלק מחבריו. התנהגותו זו של דיאנג'לו גורמת לסטרינגר לחשוד בו. אחרי שדיאנג'לו מחליט להתנער סופית מאייבון, סטרינגר שולח מתנקש שהורג אותו וגורם למותו להיראות כמו התאבדות. סטרינגר מנהל גם מערכת יחסים עם אשתו של דיאנג'לו, וכמנהל הארגון החדש, מחליט לאחד כוחות עם הארגון של מזרח בולטימור בהנהגת פרופוזישן ג'ו, דבר שמכעיס את אייבון שמחליט לשלוח אוכף מניו יורק המכונה "האח מוזון" כדי שיבריח את האנשים של ג'ו.
בחזרה לנמל, היחידה מבצעת מעקב אחרי המכולות הנכנסות לנמל. פרנק מגלה שחשבון הטלפון שלו "סומן", הופך לפרנואידי וכדי לבדוק אם הוא תחת מעקב מכניס מכולה ריקה ומוצא שהמשטרה מעכבת גם אותה. זיגי ממשיך להסתבך, הפעם בעסקי הברחת מכוניות, ונשדד על ידי גליקאס - סוחר יווני, שמכנה אותו טיפש ולועג לו. זיגי מתמלא בכעס, נכנס לחנות של גליקאס והורג אותו ואת עוזרו. הוא לא מסוגל לעכל את מעשיו, ומסגיר את עצמו למשטרה. ניקי לומד על מעצרו ומודיע על כך לפרנק. אחרי פגישה עם היוונים ניקי מבין שקיימת דרך בה האישומים יימחקו, ומודיע גם על כך לפרנק, שבינתיים נעצר על הברחת נערות ליווי לארצות הברית - שהוברחו ביחד עם הנשים המתות במכולה.
פרנק מחליט להיכנס לתוכנית להגנת עדים, אך מנסה להגיע להבנות גם עם היוונים. כשהם מקבלים מידע משותף שלהם בFBI שפרנק מתכוון להעיד נגדם, הם קובעים איתו פגישה ובה הורגים אותו. ניקי נעצר גם הוא, ונכנס גם הוא לתוכנית להגנת עדים ביחד עם משפחתו. ניקי בניגוד לפרנק מצליח לשרוד.
סטרינגר רוצה להוציא את האח מוזון מהעסקים ולכן נפגש עם עומאר ומסית אותו נגד מוזון, בטענה שהוא רצח את בראנדון. עומאר יורה במוזון, אך מבין שהוא לא הרג את בראנדון ומתקשר לבית החולים. היוונים מצליחים להימלט בזמן ולהימנע ממעצר, עומאר נשבע לנקום בסטרינגר, ובאבלס נתפס עם סמים ונעצר. כדי להשתחרר באבלס נותן לקימה ומקנולטי מידע על היחסים בין סטרינגר בל לפרופוזישן ג'ו, מה שגורם לפתיחתה של חקירה נוספת. במשטרה מחליטים הרק וקארבר לעבור למחוז המערבי ולשרת תחת פיקודו של "באני" קולבין.
עונה 3.
אחרי תקופה ארוכה בה היחידה לפשעים חמורים עקבה אחרי סוחרי הסמים של פרופוזישן ג'ו בעזרת האזנת סתר, היא לא הצליחה להשיג שום מידע מפליל. זה משתנה כשאחד מסוחרי הסמים של ג'ו, צ'יז, מהמר על הכלב שלו בקרבות הכלבים ורואה אותו נפצע בצורה קשה. צ'יז נאלץ להרוג אותו, ולאחר מכן מספר על כך בטלפון לחבריו. הוא נעצר ונחקר על ידי באנק ומקנולטי שלא יודעים שצ'יז דיבר על הכלב שלו, וכשהם מבינים את זה הם נאלצים לבטל את ההאזנה שהתגלתה. בינתיים בעיר המגדלים בהם עבדו אנשיו של בארקסדייל נהרסים בפיצוץ מבוקר, ושחקנים חדשים מנסים להשתלט על פינות בעיר. סטרינגר ששומע על סוחר בשם מרלו שהשתלט על טריטוריה במערב העיר מבקש מבודי למצוא אותו.
במשטרה הניצב אירבין בורל וסגנו ביל רולס דורשים מהמפקדים ירידה משמעותית באחוזי הפשע, ובורל נפגש עם חבר מועצה שאפתני בשם טומי קרקטי ששואף להפוך לראש העיר, וגם הוא לוחץ עליו להוריד את אחוזי הפשיעה. כדי לשרוד בשנה האחרונה שלו בתפקיד מחליט קולבין על פתרון יצירתי: לגליזציה דה פקטו של סמים. סוחרים ומשתמשים יוכלו להמשיך בעיסוקם ללא הפרעה באזור נטוש במערב העיר בתנאי שיעזבו את הטריטוריה הנוכחית שלהם. מקנולטי חושד שדיאנג'לו לא התאבד אלא נרצח, ומצליח להוכיח את זה.
בכלא, אייבון מתכונן לשחרורו המוקדם ורואה את חברו דניס "קאטי" משתחרר אחרי 14 שנים. קאטי מתקשה להתאקלם בחיים שאחרי הכלא: הוא מקבל חבילת סמים במתנה מבארקסדייל כדי שיוכל למכור אותה ולעשות קצת כסף אך סוחר של מרלו בשם פרויט מרמה אותו. קאטי עובד תחילה כגנן אך מאוחר יותר מצטרף חזרה לארגון של בארקסדייל.
לאחר שחרורו של אייבון מהכלא הוא מגלה על הרפורמה שערך סטרינגר בעסקים. סטרינגר מנסה להפוך ללגיטימי באמצעות הלבנת כספים והשקעה בהון, ולומד כלכלה. סטרינגר נהפך ל"בנק": למשטרה אין סיכוי לתפוס אותו משום שהוא הלבין את רוב כספו והתרחק מעסקי הסמים. כתוצאה מכך סטרינגר מנסה לפתור את הסכסוך עם מרלו באמצעות הסכם, ואילו אייבון מחליט לצאת למלחמה. גם עם עומאר המקרה זהה: אחרי שוד נוסף אייבון מחליט לתקוף את עומאר. הוא נורה בבוקר יום ראשון בדרך לכנסייה עם סבתא שלו, באישורו של סטרינגר, במה שהפר את "חוק יום ראשון" - קוד של סוחרי הסמים לפיו אסור לתקוף בבוקר יום ראשון. עומאר הזועם מחליט שאייבון וסטרינגר צריכים להיות מחוסלים.
קולבין מצליח למשוך לאזור הסחר שמכונה "האמסטרדם" סוחרי סמים מדרג בינוני, כאשר גם נרקומנים כמו באבלס וחברו הטוב ג'וני מגיעים לאזור. הלגיטימציה של הסחר מעודדת את סטרינגר לסגור את הסכסוך עם מרלו: הוא מקים קו-אופ לסוחרי הסמים של העיר, נפגש עם מרלו ובכל זאת לא מצליח למשוך אותו ולסכם איתו על הפסקת אש. לאחר סירובו של מרלו אייבון מגביר את הקצב וכאשר קאטי וחייל נוסף של אייבון, סלים צ'ארלס, תוקפים את סוחריו של מרלו קאטי מתכונן להרוג את פרויט. הוא לא מסוגל ללחוץ על ההדק, ולאחר מכן מודיע לאייבון שהוא לא מסוגל להישאר במשחק. אייבון מקבל את דבריו ומאחל לו בהצלחה. כשסלים צ'ארלס אומר לאייבון שקאטי "היה גבר בזמנו", אייבון משיב שקאטי הוא "גבר היום".
בפוליטיקה קרקטי מצליח לשכנע את חברו הטוב טוני גריי להיכנס למרוץ על ראשות העירייה כדי לחלק את הקולות השחורים. הוא לוחץ על ראש העיר הנוכחי רויס בנוגע לעדים שנרצחים שוב ושוב.
בחקירה, מקנולטי וגרגס נאלצים ללכת מאחורי גבו של דניאלס מפקדם כדי לעקוב אחרי סטרינגר. דניאלס מגלה על כך ומודיע למקנולטי שזו החקירה האחרונה שלו ביחד איתו. היחידה מגלה שאנשיו של בארקסדייל משתמשים בטלפונים חד פעמיים ומצליחים לצותת להם. בריאנה בארקסדייל, אמו של דיאנג'לו, נפגשת עם מקנולטי שמספר לה למה הוא לא מאמין שדיאנג'לו התאבד. בקרב יריות, אייבון נפצע ומחליט שוב להגביר את מאמצי המלחמה מול מרלו. קאטי מחליט להקים מכון כושר וחוג לאיגרוף, ומקבל מאייבון עזרה כספית. הוא נעזר בשוטר קארבר לגייס את ילדי מערב בולטימור כדי שיגיעו להתאמן ולמרות קשיים מצליח להפוך את המכון לרווחי.