בסרט השני, מגהטרון חוזר לחיים בידי הטרקטוריקים בעזרת רסיס מהניצוץ, ומתברר שהוא חסידו של "הנופל" ומנהיגו השני של צבא השקרניקים לאחריו. נודע לו שהידע הקולקטיבי מהניצוץ - שנמצא במוחו של סאם ויטוויקי - הוא המפתח למציאתו של אנרג'ון ולהערתו של צבא השקרניקים. הוא חוטף את סאם ומאיים לחלץ את המידע ממוחו אך אופטימוס פריים מציל את סאם. בקרב ביניהם, מגהטרון הורג את פריים לפני שתגבורת הרובוטריקים מגיעה. הוא מודיע לסטארסקרים שעליהם לחשוף את עצמם בפני הציבור כדי להוציא את סאם מהמחבוא. השקרניקים מגיעים למצרים וצורתם המשולבת של הטרקטוריקים לדווסטייטור משמידה את חלקה העליון של הפירמידה הגדולה של גיזה וחושפת מתקן חייזרי שבו מתכוון הנופל להשתמש כדי להשמיד את השמש. סאם משתמש בניצוץ שבמטריקס המנהיגות כדי להחיות את פריים, וזה האחרון נעזר בחלקיו המשולבים של הרובוטריק העתיק ג'טפייר כדי להביס את מגהטרון.
בסרט השלישי מתברר שמגהטרון התחבא במשך שלוש שנים ביערות אפריקה והחלים מפצעיו. הוא כרת ברית עם הרובוטריק סנטינל פריים במאמץ להפיח חיים מחדש בסייברטרון. הוא מגיע לוושינגטון הבירה וחוזה בסנטינל פריים כשהוא מפעיל את עמודי התמיכה האימתניים שלו, שנועדו לקרב את סייברטרון לכדור הארץ. מגהטרון מציע בפני סנטינל פריים שעל שניהם לשלוט ביחד בסייברטרון החדש, אך סנטינל פריים מתעלם מדבריו. כאשר הכוכב סייברטרון נכנס לאטמוספירה של כדור הארץ, מגהטרון מפגין רגשות נדירים של עצבות וחרטה, ומשתכנע שסנטינל פריים רוצה לקחת את כל הכוח והתהילה לעצמו. הוא עובד במשותף לצד אופטימוס פריים כדי לעצור את סנטינל פריים, ומציע ליריבו הוותיק שביתת נשק כל עוד הוא עדיין ישאר בפיקוד על השקרניקים. אולם, אופטימוס מודע למזימותיו של מגהטרון. הוא מסרב להצעתו ועורף את ראשו בעזרת גרזן. בעזרת תותח הקנה של מגהטרון, אופטימוס מחסל את סנטינל פריים.
בסרט הרביעי, ראשו של מגהטרון נשמר במעבדתה של חברת הטכנולוגיה KSI, אשר מתכננת את פיתוחו של זן רובוטריקים מעשי ידי אדם. בעזרתו של רובוטריק כלוא, החברה מבקשת להעביר מידע מראשו של מגהטרון לגוף חדש, שנקרא "גלבטרון". אולם, מתברר שמוחו של מגהטרון עדיין חי, והוא מעמיד פנים שהוא מציית לפקודות אך למעשה משתלט על גופו החדש ולמעשה "נולד מחדש".
רובוטריקים אנימייטד.
בסדרת ההנפשה "רובוטריקים אנימייטד", מגהטרון לא היה האנטגוניסט הראשי במרבית העונה הראשונה, אלא רק החל מעונה שנייה. עיצובו הסייברטרוני מזכיר את הגרסה הקולנועית אך גם כולל אלמנטים אנושיים. הוא נושא את תותח ההיתוך המפורסם שלו וכן זוג חרבות. מצב שינוי הצורה שלו הוא כלי רכב סייברטרוני בתחילה, שמשתנה לאחר מכן למטה רוטור ברגע שהוא נבנה מחדש כדי להשתלב עם כלי הרכב הארציים. בסדרה זו, למגהטרון יש אמרת כנף משלו - "שקרניקים, שנו צורה והתעלו!", שעומדת בניגוד גמור לאמרת הכנף הידועה של אופטימוס פריים "רובוטריקים, שנו צורה והתגלגלו". בהבדל מסדרות קודמות של הזיכיון, היריבות בין מגהטרון לאופטימוס היא אינה אישית. הם מעולם לא נפגשו מעבר לקרב הראשון ביניהם, והם ממשיכים להתעמת אחד מול השני על בסיס של שני צדדים מנוגדים מאשר שנאה אישית. מגהטרון אפילו לא טורח לזכור את שמו של אופטימוס עד לסוף העונה הראשונה. בנוסף, מגהטרון אינו הופך לגלבטרון למשך כל שלוש העונות של הסדרה.
לפי עלילת הסדרה, מגהטרון העביר את ארבעת מיליוני המחזורים הסולאריים האחרונים בחיפוש אחר הניצוץ. על אף שהוא מצא אותו לבסוף, הוא נבגד על ידי סטארסקרים, שהניח פצצה על גבו. וכך, גופו חסר החיים של מגהטרון התרסק על כדור הארץ, בו בעת שראשו נמצא במישיגן בידי אייזק סאמדק הצעיר. בהמשך, ראשו של מגהטרון הפך למפתח רוב המצאותיו הרובוטיות של סאמדק, שעזרו להפוך את דטרויט למטרופולין טכנולוגי במשך חמישים השנים הבאות.
גרסה זו של מגהטרון פחות סבלנית לבוגדנותו של סטארסקרים. אחרי שהוא השיג את גופו החדש, הוא השתמש במפתח של סארי סאמדק כדי לשחוט את סטארסקרים, וחש תענוג גדול לשחוט אותו בכל פעם מחדש ברגע שנודע לו שסטארסקרים הפך לאלמותי כתוצאה מהניצוץ שתקוע בפניו. בהמשך הוא השמיד את גופו התחליפי של סטארסקרים מעט לאחר שקיבל אותו. גרסה זו של מגהטרון היא גם השקולה והמחושבת ביותר מכל שאר הגרסאות שלו, אם כי היא עדיין יהירה כמותם. הוא אינו מחשיב את אופטימוס לאיום ממשי עליו אלא עד לקרב האחרון ביניהם בכדור הארץ.
רובוטריקים פריים.
מגהטרון הוא מנהיג קבוצת השקרניקים בסדרת הגרפיקה התלת ממדית משנת 2010, "רובוטריקים פריים". כמו הדמות המיתולוגית בהיסטוריה של סייברטרון, מגהטרון היה פועל חסר שם שנטל את השם מגהטרונוס במהלך שנותיו בזירת הגלדיאטורים, ושמו קוצר למגהטרון בעקבות קריאות הקהל מאחד הקרבות. עם תחילת המרד הסייברטרוני, מגהטרון הפך למדריכו של אוריון פקס הצעיר. המועצה העליונה של סייברטרון העדיפה את דרכי השלום של אוריון מאשר את דרכיו האלימות של מגהטרון. ברואו זאת, מגהטרון ניתק את קשריו עם אוריון והחל במלחמה הגדולה יחד עם השקרניקים שלו. מעשיו השחיתו לבסוף את סייברטרון והפכו אותו לבלתי כשיר למחיה. לאחר ניסיונות כושלים רבים להתנקש בחייו של אוריון - שקיבל את מטריקס המנהיגות - מגהטרון נשבע לסיים את חייו של אופטימוס פריים באופן אישי. הוא מאמין שצורות חיים שמבוססות בכדור הארץ הן נחותות ממנו, והוא מעדיף לשמור על שינוי הצורה הסייברטרוני שלו. אחרי שהזריק למערכת שלו אנרג'ון אפל, עיניו של מגהטרון משתנות ללא הרף מסגול לאדום. לאחר קרב מתיש בינו לבין אופטימוס פריים בכדור הארץ, מגהטרון עוזב את הכוכב למשימה בחלל שנמשכת שלוש שנים.
בתחילת הסדרה, מגהטרון חוזר ממשימתו בחלל והוא מביא עמו אנרג'ון אפל, שמסוגל להחזיר מהמתים לוחמים נופלים. בחפשו אחר דרכים לשלוט באנרג'ון האפל, מגהטרון מסכן את חייו ודוקר את עצמו עם רסיס ממנו. תוכניתו כוללת להשתמש בצבא המתים בסייברטרון בתור חיילים טרורניקים שיעזרו לו להביס את הרובוטריקים ולהשתלט על כדור הארץ. למרות שהוא מצליח לזרוע אנרג'ון אפל בכדור הארץ, הרובוטריקים מצליחים להרוס את גשר החלל שמחבר בין כדור הארץ לסייברטרון. מגהטרון שורד את הפיצוץ, ואף ניסיון התנקשות של סטארסקרים, שנשלח לחפש אותו. הוא מובא אל ספינת השקרניקים ומוחזק בתא הקפאה לצורך טיפול. מאמציו של מגהטרון לחזור למצב תפקודי מצליחים בסופו של דבר באמצעות השתלטות על גופו של הרובוטריק באמבלבי.
בחיפושו אחר אספקה נוספת של אנרג'ון אפל, מגהטרון חזה בנבואה שתוארה ב"אמנתו של פרימוס" אודות אפלה מתקרבת, וקיבל את מחשבותיו של יוניקרון דרך חיבור מחשבתי עם האנרג'ון האפל. מגהטרון הגיע להר געש פעיל וכמעט הפסיד בקרב לאופטימוס עד אשר הר הגעש - שמכיל אנרג'ון אפל - התפרץ. יוניקרון התגלה כישות שהרכיבה למעשה את גלעין כדור הארץ, ומגהטרון הכריז על נאמנותו אליו. אולם, יוניקרון קבע כי מגהטרון הוא משרת לא ראוי ויצא בעקבותיו של אופטימוס. מונע בידי דחף לכבוש את כדור הארץ, מגהטרון הציע שביתת נשק עם הרובוטריקים, מאחר שלא יכול היה לעשות זאת כשיוניקרון שולט. לפי הצעתו, הוא יוביל את הרובוטריקים לניצוץ של יוניקרון כדי שאופטימוס ישתמש במטריקס המנהיגות כדי להביסו.
לאחר ששרד מספר ניסיונות הפיכה נגדו בידי סטארסקרים וכפיליו וכן אייראכניד ונחיל חרקניקים אותו מצאה במכרות אנרג'ון, מגהטרון הורה לכוחות השקרניקים לחפש אחר ממצאים וטכנולוגיה עתיקה מסייברטרון, שקבורים בכדור הארץ. בין הממצאים האלה נמנים מפתחות אומגה, שמסוגלים להפעיל מכונה שתאפשר את תחייתו המחודשת של סייברטרון. בנוסף, הוא התעמת עם סילאס, מנהיגו המושחת של ארגון אנושי שהיה אובססיבי לרובוטריקים ושקרניקים כאחד. מבין הממצאים העתיקים, השקרניקים הצליחו למצוא את הסטאר סייבר האגדי, חרב אימתנית שאותה יכול להחזיק רק מי שנבחר לשושלת פריים. מגהטרון תאב הכוח צפה בתדהמה כשאופטימוס שלף את החרב מכנה, והחל לחפש תחליף משלו לממצא העתיק. הוא מצא מקבת מיסטי בשם "מחצבו של סולוס פריים", ולאחר שפתח קבר של הפריימים בסייברטרון הסיר את זרועו של פריים קדום. הוא הורה לכוחותיו לחבר את הזרוע במקום זרועו שלו וחישל באמצעות הממצא העתיק נשק מאנרג'ון אפל.
שירי מכות מצרים