החלק היחיד שהיצור חייב שיהיה לו הוא הפה. כנאמר, במידה וליצור אין רגליים, הוא יזחל על האדמה. ליצורים יש את היכול לדאות בעזרת הוספת כנפיים. זמן הדאייה תלוי בגורם אחד והגובה בחר, הערך המספרי שיש לו בתכונת הדאייה יקבע את משך זמן הדאייה והערך המספרי שיש לו בתכונת הקפיצה יקבע את גובהה של הקפיצה. ככל שערכים אלה גדולים יותר, כך היצור יכול לשהות יותר זמן באוויר ו/או לעוף בגובה גבוהה יותר.
בשלב זה, המטרה הבסיסית היא דומה: צוּד יצורים כדי להרוויח נקודות DNA, הִתְרבֶּה, והימנע מלהיטרף על ידי טורפים. בניגוד לרבייה אל-מינית בשלב התא, על השחקן לאתר בן/בת זוג. אחרי שיצור השחקן הטיל ביצה, היא לא בוקעת מיד. אוכלי נבלות ינסו לחטוף את הביצים ועל השחקן להגן עליהן (באופן דומה, השחקן יכול לגנוב ולאכול ביצים של יצורים אחרים, אם הוא יצליח לעבור את הוריהם העוינים). לפני שהביצה תבקע, ניתנת לשחקן הזדמנות 'לפתח' את היצור שלו בעזרת העורך, על ידי שימוש בנקודות DNA לקניית חלקים לגוף. כשהביצה בוקעת, המשחק יראה לשחקן את בקיעת יצורו בצורה ממוזערת, והשחקן יוכל ישחק בצאצא של היצור שאותו עיצב, אך בגרסה הבוגרת.
השלב יפתח את ההתנהגות החברתית של היצור, כשהיצור יכיר חברים וייצור עדר (אם היצור צמחוני) או להקה (אם היצור הוא טורף) משלו. ויל רייט התייחס לזה כאל גרסה מופשטת של מיני-המשחק שבו יוצרים חברים בסימס. הדרך ליצור חברויות כאלה היא בעזרת חיקוי התקשורת עם היצור השני, עד שמגיעים לרמה מספקת. ככל שליצור יש ערך מספרי גבוה יותר בתכונות החברתיות, כך יהיה לו קל יותר להתחבר עם יצורים. המטרה הסופית של שלב זה היא להעלות את היכולות השכליות של היצור לאט לאט בעזרת נקודות DNA. ברגע שהן התחזקו בצורה מספקת, היצור של השחקן הופך לבעל אינטליגנציה, והשחקן יתקדם לשלב השבט. קיימת גם אפשרות שהיצור יתחבר ליצורים ממינים אחרים במקום לתקוף אותם.
ניתן יהיה לכנות כל יצור בנפרד.
בדומה לשלב התא, נקודות DNA משמשות כמטבע בשביל להתפתח, הגברת גודל המוח, ומאפשרות לשחקן לעבור לשלב הבא.
בנוסף בשלב היצור קיימים יצורי ענק הנקראים "אפים" אשר תוקפים את היצור כל פעם שהם נתקלים בו, המשחק משתמש גם ביצורים שיצר השחקן בתור אפים.
שלב השבט.
אחרי שהשחקן פיתח מספיק את המוח של גזע היצורים שיצר, מתחיל שלב השבט. החל משלב זה לא ניתן לפתח יותר את הגזע מבחינה פיזית (והשחקן מפסיק לשלוט ביצור יחיד). השחקן מקבל לידיו בקתה, קבוצה של יצורים בוגרים, מפה קטנה של העולם ואפשרויות לכוחות מיוחדים (super powers), שנפתחים עבורו בהתאם להתנהגות הגזע של היצור בשלבים הקודם.
בשלב זה המשחק הופך להיות משחק אסטרטגיה בזמן אמת. השחקן יכול לתת ליצורים שלו כלים, כגון כלי נשק, כלי נגינה, מדורה לאוכל שהשבט ליקט או צד.
בשלב זה גם ניתנת ליצורים אפשרות ללבוש בגדים שיבידלו אותם לפי המקצוע שלהם (לדוגמה, איכרים ילבשו "בגדי איכרים").
השחקן יוכל בנוסף לאלף יצורים לא תבונתיים, ואף להשתמש בהם בתור מרעה, ובכך בתור מקור למזון.
בשלב זה יכולה להתרחש אינטראקציה ידידותית או עוינת בין שבטים. בשלב זה גם יצורים לומדים לדבר, כאשר השפה שבה הם מדברים תלויה בסוג הפה שלהם. פּיות דמויי-פרימטים, לדוגמה, ידברו ב"שפת סים". השפה תתבצע בעזרת בלוני-דיבור, שבהם מופיע צלמית המתארת את נושא השיחה.
לשחקן ניתנת האפשרות לחלק תפקידים לחברי השבט, כגון דיג, ליקוט או ציד. אופי והתנהגות היצורים תושפע מהדרך שבה השחקן משתמש בהם. אם השחקן משתמש בהם בצורה אגרסיבית, הם יתנהגו יותר בצורה זו. ולהפך, אם השחקן משתמש בהם בצורה שלווה (לדוגמה, יתחבר לשבט בעזרת מוזיקה), התנהגות היצורים תהיה ידידותית יותר. גם ההתנהגות בזמן שהשחקן לא משתמש ביצורים תושפע מכך: שבטים תוקפניים יתאמנו בלחימה בעוד שבטים שלווים יתאמנו בנגינה ובחגיגות.
עבור כל שבט שנכבש או מתחבר לשבט של השחקן, הטוטם של השבט יקבל חלק נוסף. כאשר הטוטם יכיל חמישה חלקים, השחקן יוכל לעבור לשלב הציוויליזציה.
בשלב זה האוכל מחליף את נקודות ה-DNA מבחינת מטבע.
שלב הציוויליזציה.
בתחילה, שלב עיר היה אמור לבוא ישר אחרי שלב השבט, אך שלב זה אוחד לשלב הציוויליזציה. השבט של השחקן גדל להיות עיר, שיש לדאוג לה. לשחקן כעת יש גישה לעורך המבנים בשביל לערוך את המראה של המבנים או ליצור חדשים. המשחק ינסה לזהות איזה סגנון בנייה השחקן מעדיף, יוריד תוכן דומה שנוצר על ידי שחקנים אחרים ויוסיף את זה לתפריט הרכישה. בנוסף, השחקן יוכל להשתמש בעורך כלי הרכב, שיאפשר להם ליצור כלי רכב לאדמה, כלי טיס וכלי שיט.
לכל עיר יש שלושה מדדים:
מלבד המבנה הראשי של כל עיר שאותה השחקן מעצב בתחילת השלב, לכל עיר קיימים שלושה סוגי מבנים נוספים:
ניתן לשנות את מראה כל אחד מארבעת המבנים במהלך השלב, והם יתעדכנו עבור כל ערי השחקן.
לרשות השחקן עומדים כלי רכב הניתנים לעיצוב והם עוזרים לו בהשתלטות על גייזרים של תבלין, אשר הוא מקור חיוני לפיתוח נוסף של בניינים וצי של כלי רכב נוספים.
כלי הרכב במשחק מחולקים לשלוש קטגוריות:
לכלי הרכב מגבלה מסוימת אשר נקבעת לפי מספר הערים ועלה באחד על כל בניין מגורים נוסף. המגבלה היא נפרדת לכל סוג של כלי רכב.
קטגוריות אלו משתלבות עם שלוש נוספות וכך יוצרות תשע אפשריות שונות
צי הרכבים יכול להיות:
ברגע שהשחקן מגיע לשלב זה, ניתן לראות את מלוא כוכב הלכת. כשהשחקן מתרחק בעזרת העכבר מעבר לנקודה מסוימת, הפרטים הריאליסטים של העולם מיטשטשים ומצוירים בהגזמה. לדוגמה, הערים שבכוכב הופכים מערים בקנה מידה רגיל לצלמית ייצוגית של העיר.
המטרה בשלב זה היא להשתלט על כל הכוכב, והשחקן יכול לבחור האם לכבוש את הכוכב בכוח הזרוע, או לאחד אותו באמצעים דיפלומטיים. ברגע שהשחקן הרוויח מספיק נקודות בשלב זה, הוא פותח את אפשרות יצירת העב"מ ואת עורך העב"מ.
המטבע העיקרי של השלב הוא "תבלין".
שלב החלל.
אחרי שלב הציוויליזציה, מגיע שלב החלל. במהלך שלב זה, השחקן יוכל לשוטט ביקום, ויתווספו אליו משימות.
השחקן יוכל כעת לטוס לכוכבים לא מיושבים שכנים, להאריץ אותם וליישב אותם בעזרת כלים מיוחדים (כלי יצירת מים, כלי יצירת הרי געש וכו') שהשחקן יכול לרכוש אותם. הכלי האולטימטיבי בשלב זה הוא טכנולוגיה הנקראת "מטה החיים" (Staff of Live) אשר מטרתה להפוך עולם מת לעולם המסוגל להכיל חיים תוך מספר דקות. וויל רייט כינה את הטכנולוגיה הזו לפני ההפצה בתור "מכשיר בראשית", שנקרא על שם מכשיר דומה מ-, בעל מטרה דומה.
קיימים מספר דרכים שונות בהן ניתן להשפיע על כוכבי לכת. ניתן להזרים פחמן דו-חמצני לאטמוספירה כדי להגביר את כמות גזי החממה, דבר שבמהלך הזמן גרם לעליית מפלס האוקיינוסים ולהצפת ערי חוף, עד שלבסוף התאדו והפכו את הכוכב לכוכב מדברי. השחקן יכול גם לגרום לשביטים קרחוניים להתנגש בכוכב על מנת ליצור מים, או להכריח הרי געש להתפרץ כדי להוסיף גזים לאטמוספירה.
שחקנים יכולים לבנות ערים על כוכבים שלא ניתן ליישב אותם, ברגע שהם מקבלים את האפשרות ליצור ערי-בועה, הדומים בתפקודם לארקולוגים המספקים את עצמם. כאשר העולם הופך ניתן ליישוב, הערים מאבדים את הבועה שמסביבם וניתן להתחיל לפתח אותם בדומה לשלב הציווילזציה, אך בגרסה מנוונת יותר.
במהלך מסעות לכוכבים אחרים, השחקן יכול לסרוק פריטים ולהוסיף את המידע עליהם לבסיס נתונים, המעוצב כמו משחק קלפים, שנקרא Sporepedia. השחקן יכול גם לחטוף יצורים ולהעביר אותם לכוכבים אחרים, כדי ליישבם ולייצב את המערכת האקולוגית שלהם. השחקן יכול גם להכליא זנים שונים באופן גנטי, או למקם בכוכב מוֹנוֹלִית (בסגנון ), דבר שיגרום להיווצרות חיים תבונתיים, ולחזור מאוחר יותר כדי לראות מה התפתח מכך. בכוכבים שונים, השחקן יכול למצוא חפצים מוזרים, אשר משלימים אוספים של המתארים היסטוריות של עמים או תופעות טבע. ברחבי הגלקסיה פזורים עשרה מבנים שונים של מערכות שמש (לדוגמה, מבנה של ענק כחול או ננס צהוב). כאשר השחקן מגיע למבנה מערכת שמש שכזאת, הוא יוכל לקרוא עליו מידע קצר.
ברגע שהשחקן חקר את הכוכבים השכנים, מסע בין כוכבי הופך לזמין. יש יותר מ-4 מיליארד כוכבים בגלקסיה של המשחק. במהלך ועידת TED ב-2007, וויל רייט השתמש בהשהיית זמן מואצת בזמן שהראה את הגלקסיה כולה, כדי להציג את הדינמיות שלה. ניתן היה לראות סופרנובה מתפוצצת לנקודות זוהרות של אור. הוא הראה כי הערפילית, שהמשחק כולל בתוכו קטגוריות נפרדות עבור שני המונחים שמשתמשים בהם כיום, ערפילית פלנטרית וערפילית הֵחְזרה, אכן מבצעות את התפקודים האמיתיים שלהן. רייט גם קירב את העב"מ שלו קרוב לחור שחור, ושמר על מרחק ביטחון מהסינגולריות הכבידתית שלו. במשחק עצמו, אחרי שמגלים את הטכנולוגיה המתאימה, ניתן לעבור דרך חורים שחורים לאזור אחרים בגלקסיה.