כתוצאה מלחץ שהופעל עליו על ידי מפקדי הצי, הקים לונג צוות ייעוץ קבוע לאחר המלחמה. מועצה זו, שהוקמה במרץ 1900, נועדה לאחד את פעולותיהם של משרד מודיעין הצי, של מכללת המלחמה של הצי של פיקוד הצי להכנת תוכניות למלחמה ולביצוע ההכנות הנדרשות לה, תכנון והקצאת משאבים ימיים כפי שהוגדר בתוכניות אלו. לאחר המלחמה קידם לונג תוכניות להקמת בסיס ימי בפיליפינים, אך המימון לתוכניות אלו הושהה על ידי הקונגרס, שביקש שוב ושוב לבחון את המיקומים האפשריים לבסיס באיים. הסוגיה נגעה גם ליריבות מול מחלקת המלחמה, שהתנגדה להקמת בסיס קבוע של הצי בפיליפינים שלא יהיה כפוף אליה. בנייתו של בסיס הצי במפרץ סוביק החלה רק לאחר סיום כהונתו של לונג כמזכיר הצי.
בוועידת המפלגה הרפובליקנית של 1900 הועלה שמו של לונג כמועמד אפשרי לתפקיד סגן הנשיא על ידי המשלחת ממסצ'וסטס והוא היה הבחירה שהועדפה על ידי הנשיא מקינלי. עם זאת, הנהגת המפלגה התנגדה למועמדתו בשל שיקולים גאוגרפיים, ולודג' (שעדיין היה מסוכסך עם לונג) ענד בחוסר כנות סרט תמיכה בלונג, אף על פי שהוא תמך ברוזוולט, שזכה בקלות במועמדות. מקינלי ורוזוולט ניצחו בבחירות לנשיאות שנערכו באותה שנה ולונג החליט להמשיך בתפקידו במחלקת הצי לתקופת הכהונה השנייה של מקינלי.
התפטרותו.
לאחר רצח הנשיא מקינלי בספטמבר 1901 הגיש לונג את התפטרותו לנשיא החדש רוזוולט ב-1 במאי 1902. הסיבות המדויקות לצעדו זה לא התבררו די צרכן, אך ככל הנראה היו לו כמה גורמים. ראשית, לרוזוולט היו יחסים קרובים עם לודג' יריבו משכבר הימים של לונג. שנית, במהלך החקירה בנוגע לפעולותיו של אדמירל וינפילד סקוט שליי בקרב סנטיאגו דה קובה ביולי 1898, התעוררה ביקורת משמעותית בנוגע לתפקודו של לונג במלחמה. שלישית, אחת מבנותיו של לונג נפטרה באוקטובר 1901, פחות מחודש לאחר רצח מקינלי. כל האירועים הללו גרמו ללונג לשקוע בדיכאון והמצב החמיר כאשר רוזוולט התעמת עמו בנוגע למהלכי הפתיחה של המלחמה ופרסם כמה מהמקרים בהם ביטל לונג את החלטותיו. ההיסטוריון ונדל גארט מציין שלרוזוולט היה עניין אישי רב בצי, והיה לו קושי לעבוד בשיתוף פעולה גם עם מזכירי הצי שכיהנו לאחר לונג.
שנותיו האחרונות.
לונג שב למסצ'וסטס, שם הוא חידש את עיסוקו בעריכת דין והמשיך לגלות עניין בפוליטיקה של המפלגה הרפובליקנית. הוא שימש כחבר בדירקטוריונים של כמה חברות. הוא המשיך לקדם את זכות הבחירה לנשים והיה חבר במועצות של כמה בתי ספר פרטיים, כולל אקדמיית הֶבּרוֹן שבה הוא למד בצעירותו. את רוב זמנו בשנים אלו הוא בילה במיין, לאחר שב-1882 הוא רכש בחזרה את בית משפחתו בבקפילד. באוגוסט 1915 הוא חלה ושב לביתו בהינגהאם. ג'ון לונג נפטר ב-28 באוגוסט 1915 בהינגהאם.
כתביו ומורשתו.
בנוסף ליומנו רחב היריעה, כתב לונג במגוון של נושאים. במהלך ניסיונו הבלתי מוצלח בעריכת דין בבקפילד, הוא פרסם מסמך בנוגע לסמכות הקונגרס והעבדות. בעת שהותו בבוסטון בראשית שנות ה-60 של המאה ה-19, הוא כתב מחזה שהוצג בעיר. ב-1878 הוא הוציא תרגום של הפואמה האפית אינאיס של ורגיליוס. ב-1903 הוא פרסם את "הצי האמריקאי החדש" (The New American Navy), היסטוריה של מלחמת ארצות הברית-ספרד ושל התפתחות הצי באותה תקופה.
בין פעולות הצדקה של לונג ניתן למנות את מימון וייסוד הספרייה הציבורית בבקפילד ב-1900, שכיום ידועה כ"ספריה החופשית על שם זיידוק לונג". צי ארצות הברית הנציח את לונג בקריאת משחתת על שמו, שנכנסה לשירות ב-1919 וטובעה במתקפת קמיקזה בינואר 1945.
זנגווארדן
זֶנְגְוָארְדֶן (בגרמנית: Sengwarden) הוא כפר באזור שטח השיפוט של העיר וילהלמסהאפן (Wilhelmshaven), בסקסוניה התחתונה שבגרמניה.
גאוגרפיה.
הכפר זנגווארדן גובל במספר מועצות אזוריות וכן בעיירות זילנשטדה והוקזיל  שבמחוז פריסלנד הסמוך ובעיר וילהלמסהאפן. הכפר נמצא באזור מישורי, בגובה של כ־5 מטר מעל פני הים.
היסטוריה.
הכפר זנגווארדן (הנדבך העתיק של הכנסייה שעליו נבנתה הכנסייה הנוכחית מתוארכים ארכאולוגית לשנת 1250), הוזכר במסמכים לראשונה בשנת 1168, הוא הפך לחלק מהעיר וילהלמסהאפן מאז 1972. בעבר הכפר היה שייך למחוז פריסלנד בזמן שהנהלת האזור הייתה בעיר יפר . בתחילת ימי הביניים היה הכפר זנגווארדן קהילה עצמאית לפני שהיא מוזגה עם אינהאוזן וקניפהאוזן . בעבר מושלי זנגווארדן, אינהאוזן וקניפהאוזן ששלטו באזור מטעם פריסלנד המזרחית, התגוררו בטירת אינהאוזן, שנבנתה על ידי אינו ט'רקסנה בסביבות שנת 1350.
עד היום, הכפר זנגווארדן שמר במידה רבה על אופיו הכפרי, בעיקר החקלאי.
זנגווארדן ופרשת אקסודוס.
פרשת אקסודוס.
"יציאת אירופה תש"ז - אקסודוס 1947" היא אחת מהידועות בספינות ההעפלה לארץ ישראל. בתום ליל קרב שהתקיים בתאריך 18 ביולי 1947 על סיפוניה בין המעפילים וחיילי מרינס בריטיים, מגיעה האקסודוס 1947 לנמל חיפה. המעפילים המותשים מורדים ממנה ועולים על 3 אניות מאסר וגירוש מדגם ליברטי המפליגות לדרום צרפת, בהתאם למדיניות הריפולמנט החדשה של ממשלת בריטניה וכחלק ממבצע אואזיס של הצבא הבריטי ועוגנות מחוץ לנמל הנפט פורט דה בוק. לאחר למעלה משלשה שבועות בעגינה מול נמל פורט דה בוק, הבריטים התייאשו מהמצב. אניות הגירוש קבלו פקודה להפליג לנמל המבורג שבאזור הכיבוש הבריטי בגרמניה.
בנמל המבורג אשר היה באזור הכיבוש הבריטי בגרמניה הורדו המעפילים בכוח והועברו למעצר בשני מחנות עקורים באזור ליבק (פפנדורף ואם שטאו [Am Stau]).
מחנות אם שטאו ופפנדורף לא התאימו למגורים בחורף. באמצע אוקטובר החליטו הבריטים להעביר את המעפילים למחנות "אמדן" (Emden) ו"זנגווארדן". תוך תאום ופיקוח של מזכירות המחנות של המעפילים בראשות מרדכי רוזמן.
בין 2 ל-5 בנובמבר 1947 הובאו מעפילי האקסודוס ממחנה אם שטאו (מאניית הגירוש אמפייר רייוול) למחנה הצי הנאצי לשעבר בווילהלמסהאפן-זנגווארדן – כיום קסרקטין הצי הגרמני – האדמירל ארמין צימרמן.
למחנה המעפילים זנגווארדן הגיעו כ-1,500 מעפילים אשר שוכנו בתנאים נוחים יחסית. כולל מיטות כיסאות ושלחנות בחדרים.
תוך שבועיים מהגעתם למחנה החלה בו פעילות של ארגון "אורט". ארגוני הסעד ג'וינט ואונרר"א סייעו במימון הפעילות של אורט. על פי עלון אורט מסתיו 1947: ב־17 בנובמבר החלו לפעול שיעורי כלכלה ומסחר במחנה. לצורך הכשרה מקצועית הגיעו מכונות, כלים וחומרי גלם בכמויות גדולות. כל זאת במטרה להכשיר את המעפילים לחיים יצרניים בארץ ישראל.
בסוף 1947 למדו בבית הספר "אורט" בזנגווארדן למעלה מ-400 תלמידים, שנרשמו לקורסים בנגרות, ריתוך, אלקטרוטכנולוגיה, טכנולוגיית רדיו, מכונאות רכב, לבנים וביגוד.
התנועה חופשית אשר ניתנה למעפילים, אפשרה רכישה ואפיית לחם במאפיית הכפר זנגווארדן אשר הייתה בבעלות של משפחת ריס (Reese). מאפייה זאת שכנה ליד טחנת הקמח. בבית המשפחה בפינת הרחובות הדו (Hedostrasse) והרחוב הראשי (האופטשטראסה, Hauptstrasse), במרחק הליכה של כ־800 מטרים משער מחנה המעפילים.
בשבועות הראשונים במחנה הייתה חשדנות בין המעפילים ותושבי הכפר. במיוחד בנושאי כשרות המאפייה והתוצרת החקלאית שנרכשה מהאיכרים. בהמשך חשדנות זו נעלמה ובנוסף, המעפילים התקבלו לעבודה ולהתפרנס מהעבודה במשקי האיכרים.
בראיונות עם מעפילי האקסודוס שהיו ילדים כששהו במחנה המעפילים בזנגווארדן הם דווחו והעידו מול המצלמה שבשעה ששיחקו במשחקי מחבואים הסתתרו בעיר תת-קרקעית עם רחובות מערכות חשמל וטלפונים שהייתה בנויה מתחת למחנה. בביקור נציגי צוות שימור מורשת האקסודוס ב-6 בספטמבר 2019, בבסיס הצי קסרקטין האדמירל ארמין צימרמן Kaserene, נבדק ה"סיפור" עם מפקדת המחנה ואושר.
בית הספר במחנה נסגר באוקטובר 1948 לאחר שכל המעפילים עזבו את המקום ועלו לארץ ישראל.
הנצחת האקסודוס בזנגווארדן.
בחודש מאי 2018, במסגרת ביקור ד"ר צבי חטקביץ ונציגים מצוות שימור מורשת הגבורה של מעפילי האקסודוס בזנגווארדן, הם נפגשו עם נציגי הכפר, הקואורדינטור קארל טיילן והבישופ של הכנסייה הלותרנית האוונגלית, יאן יאנסן . בפגישה הם העלו את הרעיון להקים בכפר לוח זיכרון לשימור מורשת האקסודוס ומעפיליה. רעיון זה קרם עור וגידים במשך למעלה משנה במעורבותם של ראש עיריית וילהלמסהאפן אנדראס ואגנר , ראש הכפר זנגווארדן מרטין בורקרדט, הקואורדינטור קארל טיילן, הכומר ווקר לנדיג ונציג צוות שימור מורשת האקסודוס, ד"ר צבי חטקביץ. כתוצאה מפעילותם הנמרצת, נערכו טקסי הסרת הלוט מעל 2 לוחות זיכרון בשישי בספטמבר 2019, לזכרם של מעפילי האקסודוס ששהו במחנה זנגווארדן בין התאריכים אוקטובר 1947 ליולי 1948. לוח אחד הוצב במרכז זנגווארדן בפינת הרחובות הדו (Hedostrasse) והרחוב הראשי (האופטשטראסה, Hauptstrasse). השני הוצב באתר מחנה המעפילים לשעבר הסמוך לזנגווארדן, על בנין מרכזי בבסיס הצי הגרמני Admiral Armin Zimmerman Kaserne. לטקסים הגיעו במיוחד ונכחו כ-50 ממעפילי האקסודוס ובני משפחותיהם שהוזמנו על ידי ראש העיר של וילהלמסהאפן וראש הכפר של זנגווארדן . לוחות הזיכרון עוצבו בגודל ובגובה, דמות אדם. הלוח במרכז הכפר הוצב באמצע מדרכה מרכזית כדי להביע את נוכחות מעפילי האקסודוס בכפר זנגווארדן כל הזמן.
ב-22 בספטמבר 2021 מנהלי המוזיאון והקהילה של זנגוורדן ערכו טקס זיכרון ליד לוח הזיכרון שבמדרכה הראשית בכפר לזכר הימים בהם הגיעו מעפילי האקסודוס לגרמניה ומאוחר יותר גם הגיעו לזנגוורדן.
אתרים תיירותיים.
בכפר קיימים מספר אתרים תיירותיים כאשר הבולטים מתוכם הם טחנת הקמח, וכנסיית סנט גאורג.