במהלך חיו, ג'ון התחתן עם רופאה בשם ג'יל טאק שניהלה מרכז לגמילה מסמים בעיר. המוטו של מרכז הגמילה היה "תנצור את חייך", משפט שיופיע בהמשך בכל המלכודות שג'ון ייצר. במהלך הזמן, השניים תכננו להביא ילד לעולם ולקרוא לו בשם "גדעון". ג'ון גם קרא לבניין הראשון אותו הוא רכש "גדעון - תעשיות אריזת בשר". השם גדעון מקורו ביהדות ופירושו "גיבור" או "שופט". התינוק היה אמור להיוולד בשנת 1995, שעל פי לוח השנה הסיני הייתה שנת החזיר שסימלה לידה מחדש.
ג'ון פגש מספר מטופלים בקליניקה של ג'יל ומנע ריב אלים בין אחד המטופלים למטופל אחר בשם ססיל אדמס. בעקבות האירוע, ג'ון החל לפקפק בשיטות השיקום של הקליניקה של ג'יל, אך עדיין תמך בעבודתה. באירוע שנעשה בקליניקה, ג'ון פוגש בסוכן ביטוח בשם וויליאם אשטון והשניים מדברים על עבודתו של וויליאם - אישור או דחיה של פוליסות ביטוח. ג'ון מתנגד לשיטותיו של וויליאם לחזות אירועים ועל פיהם לאשר או לדחות את הביטוחים שלהם באומרו שוויליאם לא לוקח בחשבון את הרצון לחיות, שהוא היצר הכי חזק באדם.
עם הלידה שמתקרבת, ג'ון החל לבנות ולתכנן את חדר הילדים של גדעון ואיתו גם את האב טיפוס לבילי, הבובה האייקונית בה הוא ייעזר בעתיד. בנוסף, הוא וג'יל מתחילים לצלם סרטי וידאו עבור ילדם, מדיום שבו ג'ון ייעזר רבות בעתיד במלכודות שלו.
באחד הערבים, בשנת 1994, ססיל אדמס, מטופל בקליניקה תוקף את ג'יל בסיום עבודתה בזמן שג'ון מחכה לה בחוץ במכונית. ג'ון מבחין בססיל שבורח מהאזור ומבין שמשהו קרה, הוא מגלה את ג'יל הפצועה מדממת על הרצפה ומוביל אותה לבית החולים שם הם מתבשרים שהעובר מת מהתקיפה. בעקבות החוויה, ג'ון מתחיל לפתח תסמינים של פסיכופתיות: חוסר באמפתיה כלפי אחרים וחוסר חרטה על מעשיו. השינוי מתבטא כאשר ג'ון מפסיק לעודד את המטופלים בקליניקה ומאמין שהם אינם מסוגלים להיגמל ולהשתנות תחת שיטות הטיפול הרגילות ("את לא יכולה לעזור להם, הם צריכים לעזור לעצמם") מה שנוטע בו את היסודות להפיכה לג'יגסו (פאזל) בעתיד. ג'ון מחליט להפסיק את השותפות עם אמט ומתרחק ממנו ומג'יל, מרגיש שלמרות כל הידע וההון שצבר, הוא עדיין לא הצליח להציל את הבן העתידי שלו.
האירוע המחולל גורם לג'ון לקחת את המנטרה "הם צריכים לעזור לעצמם" שלב אחד קדימה ובעקבותיו ג'ון בונה את המלכודת הראשונה שלו שיועדה לססיל אדמס, האדם שהרג את התינוק שלו: ג'ון מאתר את ססיל בקרנבל שהתקיים לכבוד שנת החזיר, לובש מסיכת חזיר על פניו וחוטף את ססיל. ג'ון לוכד את ססיל בכיסא וממקם להבים מסביב לראשו, במטרה שססיל "יעבור" דרך מספר סכינים שיחתכו את פניו ולאחר מכן ילחץ על ידית והוא ישוחרר (המחשבה מאחורי המלכודת היא שפניו של ססיל ייראו מכוערים כמו הנשמה שלו). בכך ג'ון מקווה שססיל ילמד מהחוויה ויחליט לשנות את דרכיו. ססיל אמנם מצליח ללחוץ על הידית, אך מחליט לתקוף את ג'ון והאחרון מפיל אותו לערימת להבים נוספת שהורגת אותו. בכך ג'ון מבין שלמרות שהוא נתן לססיל הזדמנות שנייה, ססיל נכשל ובכך ג'ון לא מרגיש חרטה על שהרג אותו.
בעקבות זאת, ג'ון מחליט "לעזור" לעוד אנשים ומתחיל ביצירת מלכודות שונות. ג'יל, שמבחינה שססיל נעלם מגיעה אל הסדנה של ג'ון ומגלה בה תמונות של ססיל. לאחר עימות ביניהם השניים מתגרשים וג'יל חוזרת לשם נעוריה: טאק.
בזמן בדיקה שגרתית, ג'ון מאובחן עם גידול סרטני בראשו. ההתמודדות עם הגירושים והגידול הסרטני הביאו את ג'ון לנסות לשים קץ לחיו בעזרת קפיצה עם מכוניתו מצוק. אולם, הניסיון נכשל וג'ון שורד את ההתרסקות, אך האירוע גרם לו להעריך מחדש את חיו. בזמן הזה ג'ון מתחיל לעבור הקרנות כדי להיפטר מהגידול בראשו וזוכה ליחס מחפיר מהצוות הרפואי. מתגלה לנו שרופא בשם לוגאן נלסון החליף בטעות את תוצאות הבדיקות של ג'ון, מה שגרם לרופאים לפספס את הגידול בהתחלה ובכך הוא גדל וכעת בלתי ניתן לריפוי. בנוסף, רופאים כמו דוקטור לין דנלון ודוקטור לורנס גורדון מתייחסים אליו בקרירות, מה שגורם לג'ון לחשוב עליהם כעל קורבנות עתידיים במשחקים שלו. במהלך השנים הבאות ג'ון יכיר יותר ויותר אנשים שלפי השקפתו "לא מעריכים את חייהם" ובכך ידרבן אותו להפוך אותם לקורבנות. בידיעה שלא נשאר לו הרבה זמן לחיות, ג'ון רוצה לייצר אחריו מורשת שבעקבותה אנשים יתחילו להעריך את החיים שלהם יותר ובכך הוא חושב שהוא מסייע לאנושות.
אלמנטים רבים שג'ון נעזר בהם כוללים שימוש בסרטי וידאו בהם מופיעה בילי הבובה שדרכה הוא מתקשר עם קורבנותיו, חלוק שחור המעניק לו מעין מראה של כומר דתי, מסיכת החזיר הלקוחה משנת החזיר הסינית המסמלת "לידה מחדש" והמחשבה שהשיטה שלו עובדת ובעזרתה הוא יהפוך את העולם למקום טוב יותר. ג'ון מאמין שאנשים צריכים לעבור חוויה טראומתית וכואבת על מנת שיוכלו להעריך את חייהם, והוא מאמין שהוא מעין "משיח" שבא לגאול את העולם מאנשים רעים, תוך רצון שאחרים ימשיכו את מורשתו לאחר שימות.
המשחק המשמעותי הראשון שג'ון יצר התקיים בחוות חזירים נטושה ששייכת למשפחתה של ג'יל, אליה הוא חטף מספר קורבנות שהוא הכיר שלדעתו "לא העריכו את חייהם" או פגעו באחרים. אחד מהאנשים הללו היה לוגן נלסון, הרופא שבטעות בלבל את תוצאות הבדיקות של ג'ון עם אדם אחר. המשחק החל כמתוכנן, אך ג'ון הבחין שלוגן לא התעורר בזמן בגלל השפעת חומרי ההרדמה, עצר את המשחק והציל את לוגן כי לא רצה שהוא ימות בגלל כשל טכני שלו (ובכך לא יקבל הזדמנות הוגנת להילחם על חיו). ג'ון טיפל בפציעות של לוגן והאחרון הפך לשוליה הראשונה שלו, בנה איתו מלכודות ולמד מג'ון את פילוסופיית החיים שלו והיכולת לחזות פעולות של אנשים. המלכודת האייקונית שהשניים בונים ביחד היא "מלכודת הדובים ההפוכה" בה ג'ון ישתמש בעתיד. אולם, השותפות התפרקה במהרה כאשר לוגן גויס למלחמה באפגניסטן בתור רופא צבאי.
לאחר שהסרטן מחמיר, ג'ון מנסה לקבל כסף מחברת הביטוח שלו, אותה מנהל וויליאם אשטון. אולם, אשטון מסרב לאשר לג'ון את הטיפול היקר תחת ההנחה שהגידול נמצא כבר בשלב מתקדם ולכן לא שווה להשקיע כספית בטיפול. בזמן הזה הגידול התפשט לאזורים אחרים בגופו וג'ון הבין שזמנו הולך ואוזל. ג'ון החליט להשקיע את זמנו ביצירת מלכודות ובמהרה החל להיקרא במדיה ובציבור "ג'יגסו" (או "פאזל" בעברית על שם חתיכות בצורת פאזל שהוא חותך מעורות הקורבנות שלו לאחר המשחקים. ההסבר שהוא מעניק לכך הוא שהוא מרגיש שהקורבנות שלו פספסו משהו שגרם להם לא להעריך את חייהם - חתיכת הפאזל החסרה).
במהרה, ג'ון מגלה שאדם בשם סת' בקסטר נהרג על ידי מלכודת של ג'יגסו שהיא לא שלו. ג'ון מבין שהאדם שיצר את המלכודת הוא הבלש הופמן, שרצה להעניש את בקסטר לאחר שהאחרון רצח את אחותו ולכן יצר עבורו מלכודת שבלתי אפשרי לנצח אותה. ג'ון לא אוהב את הרעיון וחוטף את הופמן, מסביר לו שהוא יודע עליו ושאם הוא לא יסכים לעבוד איתו ביחד הוא יספר לעולם שהוא הרג את בקסטר, הופמן מסכים בחוסר ברירה. במהלך הזמן השניים יבנו מלכודות ביחד והופמן יילמד מג'ון איך לחזות התנהגויות של אנשים סביבו וכן את פילוסופיית החיים שלו לפיה המלכודות שלו נועדו לעזור לבני אדם להעריך את חייהם יותר. השניים בהמשך חוטפים ביחד קורבנות נוספים והופמן מתפקד בתור השולייה של ג'ון.
בזמן הזה, שני בלשים בשם סינג וטאפ מתחילים לחקור את עבודותיו של ג'יגסו וג'ון מבקש מהופמן שישתול באחת מזירות הרצח עט ששייך לדוקטור לורנס גורדון על מנת שזה יעורר את חשדם של הבלשים. זה מצליח ודוקטור גורדון נחקר על ידי הבלשים. במקביל, ג'ון בוחן נרקומנית בשם אמנדה בעזרת מלכודת הדובים ההפוכה והיא מצליחה לברוח, בכך היא מבינה שהמשחק של ג'יגסו שינה את חייה ומחליטה להפוך בעצמה לשוליה של ג'ון. הופמן בינתיים מעדכן את ג'ון שטאפ וסינג קרובים לגלות מיהו ג'יגסו וג'ון מצליח בעזרת תוכנית מחוכמת להרוג את השניים ולהסיר מעליו את האיום.
לאחר מכן, ג'ון סיים לתכנן את חדר נסתר בשם "חדר השירותים" למשחק הבא שלו: הוא חוטף את דוקטור לורנס גורדן וצלם בשם אדם (שנשכר לעקוב אחרי דוקטור גורדון תחת הוראה מהבלש טאפ כיוון שגורדון בזמנו נחשד כג'יגסו) ושם את השניים בחדר השירותים. ג'ון, שרוצה להיות קרוב למשתתפים ולבחון את האסטרטגיה שלהם מזריק לעצמו מרפה שרירים ומעמיד פנים שהוא גופה בחדר. בסוף המשחק לורנס כורת לעצמו את הרגל בעזרת מסור ידני במטרה להציל את אשתו. ג'ון קם ומשאיר את אדם למות בחדר השירותים. ביציאה משם הוא מגלה את לורנס המעולף, מטפל בו ובעקבות זאת לורנס מחליט להפוך לשולייה של ג'ון ומסייע לו במשחקים שדורשים התערבות רפואית. כמה חודשים לאחר מכן ג'ון מבחין בריאיון טלוויזיוני עם אישה בשם ג'ואן, קורבן לשעבר של ג'יגסו שלאחר המשחק שלה החלה להעריך את החיים שלה יותר ובכך ג'ון מבין שהוא מצליח לבצע שינוי בעולם לטובה. אדם בשם בובי דיגן צופה גם הוא בריאיון ובעקבות כך מחליט להעמיד פנים שגם הוא קורבן של ג'יגסו שניצל וכותב ספר על "החוויה שלו". ג'ון (שיודע שבובי מעולם לא נבחן על ידיו) לא אוהב את זה ובאירוע חתימות על הספר הוא מגיע ונפגש עם בובי, רומז לו שהוא ג'יגסו והולך משם, אך בובי לא מייחס לכך חשיבות.