בסיפור "הפלאשים משני העולמות", הפלאש מתור הכסף פגש במקבילו מתור הזהב. בסיפור זה נקבע כי ג'יי גאריק, כמו גם יתר חברי חברת הצדק, היו תושביו של יקום מקביל. פגישה היסטורית זו הפכה עד מהרה לאחד מסיפורי DC הקלאסיים של אותה תקופה. מכתבי מעריצים שנשלחו למערכת הביעו התלהבות מהחייאתו המחודשת של הפלאש מתור הזהב, הן מעריצים ותיקים שזכרו את הרפתקאות JSA הישנות, והן מעריצים חדשים שרצו לדעת יותר על הגיבורים החדשים. פגישות נוספות שכאלה התרחשו בסיפורים "סכנה כפולה בכדור הארץ" וכן "נקמתו של הנבל האלמותי". הסיפור הראשון הביא לאזכור ראשון של חברת הצדק בתור הכסף, ומתייחס ישירות להרפתקאתם האחרונה מחוברת "All-Star Comics #57", בעוד בסיפור השני חברת הצדק הוקמה מחדש.
סיפורים אלה היו יריית הפתיחה לאירועי "המשבר בארץ-1 ו"המשבר בארץ-2", הרפתקה בשני חלקים שבה חברת הצדק מתור הזהב חברה לליגת הצדק מתור הכסף כדי ללחום בקבוצת נבלי-על שהשיגה יכולת לערוך מסעות בין יקומים על ידי לכידתם של שני הפלאשים: לבצע פשעים ביקום אחד ולבזבז את הכסף אותו בזזו ביקום השני ללא כל חשד. בשנה שלאחר מכן, הוצג לראשונה קיומה של "ארץ-3". ביקום מקביל זה הופיעה גרסה מרושעת של ליגת הצדק, שידועה בשם "סינדיקט הפשע של אמריקה". חבריה כללו את אולטרה-מן (גרסה מרושעת של סופרמן), איש הינשוף (גרסה מרושעת של באטמן), סופרוומן (גרסה מרושעת של וונדר וומן), ג'וני קוויק (גרסה מרושעת של פלאש) ופאוור רינג (גרסה מרושעת של גרין לנטרן). סיפורים אלה היו לתחילתה של מסורת ציוותים ממושכת בין שתי קבוצות-העל, שהתרחשו בגליונות שנתיים עד לשנת 1985. פגישות אלו הביאו למספר נכבד של אירועים שנחקקו בהיסטוריה של חברת הצדק, ביניהם עזיבתה של הקנרית השחורה לטובת ליגת הצדק, חזרתה של קבוצת "שבעת חיילי הניצחון" מתור הזהב, יצירתם של "לוחמי החופש" (שכללה גיבורים מחברת Quality Comics, אשר נקנתה בידי DC), וכן הצגתם של יקומים מקבילים נוספים.
כמעט באופן ייחודי לקומיקס גיבורי-על מאותה תקופה, חברי ה-JSA תוארו כגרסאות מבוגרות וחכמות יותר ממקביליהם הצעירים יותר. תמה זו הוצגה כדי לאשרר את ההיסטוריה המוקדמת של חברת הצדק בהמשכיות יקום DC – התפתחות חדשה כשלעצמה בקומיקס של אותם ימים. מאוחר יותר, הדבר עזר בהרבה לפיתוח הדמויות.
תור הארד: חזרה לאול-סטאר קומיקס.
הפופולריות של חברת הצדק גדלה בהדרגה עד אשר הקבוצה קיבלה סדרה משלה. חברי הקבוצה חזרו כמורי דרך עבור גיבורי-העל הצעירים, בהרצה שנמשכה כ-16 חוברות, בנוסף להופעת אורח בחוברות "Adventure Comics #461-466". חזרה זו סימנה שלוש התפתחויות עיקריות – הצגתה של פאוור גירל, מותו של באטמן מתור הזהב, והצגתו לראשונה של סיפור מקור לקבוצה, לאחר כמעט 40 שנה. הרצה זו נכתבה בעיקר בידי ג'רי קונוויי ופול לויץ, עם אמנים כדוגמת וולי ווד, ג'ו סטאטון, קית' גיפן ובוב לייטון.
הרצה זו תיארה את הגיבורים בשנות ה-50 לחייהם; האמנות שירטטה אותם עם שיער שיבה ופנים מבוגרות יותר. הדבר לא היה מקובל בקומיקס של אותם ימים, משום שמרבית חוברות הקומיקס מטשטשות את קו הזמן ומריצות מחדש את הסדרות כדי לשמור על מראה צעיר לדמויות המופיעות בהן. תיאור זה היה לנוכח העובדה שהגיבורים בחברת הצדק היו מקושרים ישירות לתקופת מלחמת העולם השנייה – דבר בעייתי כשלעצמו בשנות ה-80 של המאה ה-20, היכן שהגיוני שהגיבורים יהיו בשנות ה-60 לחייהם. הסבר לתופעה הובא בידי הכותב רוי תומאס, שציין כי חברי הקבוצה ספגו אנרגיה מיסטית מנבל-על בשם איאן קרקול, מה שהאט משמעותית את קצב הזדקנותם.
סדרה חדשה, "All-Star Squadron", התרחשה על רקע מלחמת העולם השנייה בשנות ה-40 וציוותה בין חברת הצדק לגיבורי-על נוספים מתור הזהב. את הסדרה כתב רוי תומאס באיוריהם של אמנים כריץ' באקלר, ג'רי אורדוויי וטוד מקפרלן בין היתר. הדבר הוביל לסדרת ספין אוף מודרנית בשם "Infinity Inc" (אינסופיות בע"מ), שבה כיכבו יורשיהם ובניהם של חברי חברת הצדק.
בשנת 1985, חברת DC קומיקס שכתבה פרטים רבים ביקום DC באירוע שנקרא המשבר בעולמות האינסופיים. בין השינויים הרבים, דמויותיהם של סופרמן, באטמן, וונדר וומן ורובין של ארץ-2 חדלו מלהתקיים, והדיכוטומיה בין "ארץ-1" ל"ארץ-2" נפתרה על ידי מיזוגם של היקומים הרבים ליקום אחד. המעשה גרם למספר בעיות המשכיות עבור חברת הצדק, שההיסטוריה שלה – במיוחד בקומיקסים של שנות ה-80 – הייתה מקושרת ביותר עם ארבעת החברים הללו.
הציוותים השונים בין חברת הצדק לליגת הצדק הסתיימו לנוכח המשבר בעולמות האינסופיים בחוברות "Justice League of America #244" ו-"Infinity Inc. #19".
העידן המודרני: לאחר המשבר וסדרות הסולו.
מאמציו של תומאס לפתור את בעיות ההמשכיות שלאחר המשבר הביאו להצגתן של דמויות אנלוגיות לסופרמן, באטמן ווונדר וומן בסדרת בת ליחידת אול-סטאר שנקראה "אול-סטאר הצעירים". זאת ועוד, חברת DC בחרה להוציא כמה מחברי חברי הצדק מההמשכיות. במהדורה המוגבלת "ימיה האחרונים של חברת הצדק", חברי ה-JSA לחמו בכוחות הרשע בשעה שהתמזגו לאלים האסגרדיים בממד לימבו דמוי ראגנארוק. רק פאוור גירל, הספקטר, דוקטור פיית והילד עטוף הכוכבים הצליחו להימלט מהתוהו ובוהו שהתרחש. בהמשך התברר כי הכל היה למעשה אשליה מעשה ידיו של אודין, שחיפש אחר דרך לבטל את הראגנארוק האמיתי.
תומאס שיכתב גם את סיפור מקורה של חברת הצדק בהמשכיות שלאחר המשבר בחוברת "Secret Origins Vol.3 #31".
התעניינות מצד המעריצים הביאה להחזרתה של חברת הצדק בתחילת שנות ה-90 של המאה ה-20. מיני סדרה בת שמונה חוברות מאפריל ועד נובמבר 1991 סיפרה את מאורעותיהם הבלתי כתובים של חברי ה-JSA בשנות ה-50. בגליונות האחרונים של אירועי "ארמגדון: אינפרנו", חברת הצדק חזרה ליקום DC של הזמנים המודרניים לאחר שווייבריידר שיגר שד לממד הלימבו בתמורה לחברי JSA.
באוגוסט 1992 החל פרסומו של הכרך השני, "Justice Society of America", שנמשך במקור כעשר חוברות עד למאי 1993 תחת כתיבתו של לן סטרזווסקי ואיורו של מייק פארובק, ובה חברי הקבוצה המקורית מסתגלים לחייהם לאחר שחזרו מהראגנארוק. אף על פי שסדרת הסולו הייתה מיועדת להפוך לסדרה בהמשכים והייתה פופולרית בקרב המעריצים, היא בוטלה לאחר שלוש חוברות בלבד. תגובת המעריצים הייתה חריפה בעקבות כך. לן הסביר כי הביטול הגחמני הגיע משום שהעורך מייק קארלין לא אהב את כתיבתו של סטרזווסקי או את איוריו ה"מונפשים" של פארובק, שאינם מתאימים לתקופה העכשווית. בנוסף הוא ציין כי קארלין לא האמין כי מקומם של גיבורי-על מבוגרים הוא בחוברות תחת פרסומה של החברה. למרבה האירוניה, סגנון הציור של פארובק נחשב לפורץ דרך עם שילובו עוד באותה שנה בבאטמן - הסדרה המצוירת. סדרת הסולו קצרת המועד הציגה לראשונה את דמותה של ג'סי קוויק, בתם של חברי יחידת אול-סטאר ליברטי בל וג'וני קוויק.
מרבית חברי הקבוצה יצאו מכלל פעולה או נהרגו באירוע משבר משנת 1994 שנקרא "". במהלך קרב בין חברת הצדק לנבל-על בשם אקסטנט, זה האחרון הסיר את האנרגיות אשר שמרו על חברי ה-JSA צעירים. כתוצאה מכך, אטום, דוקטור מידנייט ואיש השעה מתים מיידית. הוקמן והוקגירל התמזגו לכדי ישות חדשה בשם "אל הנץ" ומתו תוך כדי. דוקטור פיית מת מזקנה זמן קצר לאחר אירועי המשבר. גרין לנטרן נותר צעיר עקב האנרגיה המיסטית של לב הכוכב, אך מאבד את טבעת הכוח שלו ומשנה את שמו לסנטינל. שאר חברי הקבוצה גם הם אינם מסוגלים להמשיך ללחום בפשע עקב גילם המופלג, ופורשים. סטארמן פורש מתפקידו ומעביר את נטל הזהות לבניו. עקב כך, התפרסמה סדרת סולו חדשה לדמות, בכתיבתו של ג'יימס רובינסון.
חברת הצדק נותרה מחוץ לפעילות למשך זמן מה לאחר "משבר בזמן", אולם החברים ששרדו (פלאש, ויילדקאט ואלן סקוט) המשיכו בפעילות כחברי גיבוי של ליגת הצדק הבינלאומית.
כאשר סדרת הסולו JLA הוחיאה בידי הכותב גראנט מוריסון בשנת 1997, חברת הצדק וליגת הצדק שיתפו פעולה נגד האיום של קוויספ, יריב לשעבר של אקווהמן וישות מהממד החמישי בדומה למיסטר מיקסזפיטליק. הייתה זו הפעם היחידה מאז המשבר ששתי הקבוצות צוותו יחדיו – דבר שהשתנה כעשור לאחר מכן.
סדרה חודשית חדשה של הקבוצה, "JSA", נכתבה באוגוסט 1999 בידי ג'יימס רובינסון ודייוויד ס. גויר, ונמשכה כ-87 חוברות עד ליולי 2006. הקבוצה כללה את חבריה הוותיקים שנותרו יחד עם מקביליהם הצעירים יותר. גלגולה זו של הקבוצה התמקדה במורשת הדורות השונים והמשכתו של ההירואיזם מתור הזהב. בהמשך, גוייר המשיך לכתוב את הסדרה יחד עם ג'ף ג'ונס. בגרסתה החדשה קיבלה סדרת הקומיקס את פרס הקומיקס הטוב ביותר של "Comics Buyer's Guide" משנים 2001-2004.
במהלך אירועי "המשבר האינסופי", כמה מהדמויות מתור הזהב ששרדו כמו ויילדקאט ופלאש משתגרים ל"ארץ-2" החדשה, שנוצרה בידי אלכסנדר לות'ר הבן, ונזכרים במעומעם בקיומה של ארץ-2 המקורית.
בספטמבר 2005, הפופולריות הרבה של סדרת הסולו הביאה לפרסומה של סדרת ספין-אוף בשם "JSA: Classified", בכתיבתו של ג'ף ג'ונס ובאיורה של אמנדה קונר, המביאה את הרפתקאות הקבוצה בנקודות שונות במהלך שנות קיומה, ומתמקדת בחבריה השונים בסיפורי סולו. קשת הסיפור הראשונה מביאה את סיפור מקורה של פאוור גירל. סדרה זו התבטלה לאחר 39 גליונות ביוני 2008.
כרך שלישי.
לאחר אירועי הקרוסאובר של המשבר האינסופי ומלחמת העולם השלישית כפי שתוארה בחוברות 52, חברי ה-JSA ג'יי גאריק, אלן סקוט וטד גראנט החליטו להקים מחדש את חברת הצדק.