אליס צ'אפל (באנגלית: Ellise Chappell; נולדה ב-21 במרץ 1992) היא שחקנית אנגלייה. היא ידועה בעיקר מהופעתה בתפקיד מורוונה צ'ינוות' בסדרת הטלוויזיה "פולדארק", ובתפקיד ג'ניפר סטריינג' בסרט הטלוויזיה "The Last Dragonslayer".
ביוגרפיה.
צ'אפל נולדה וגדלה בווריקשייר. היא למדה בבית הספר לבנות "The King's High School for Girls" בווריק. אחרי סיום הלימודים בתיכון נסתה להתקבל לאקדמיה המלכותית לאמנות הדרמה ולבית הספר גילדהול למוזיקה ודרמה, אבל לא התקבלה בשניהם. במקום זה התחילה ללמוד ספרות אנגלית באוניברסיטת שפילד. בהמשך למדה דרמה באוניברסיטת אקסטר, וסיימה את התואר בשנת 2014. צ'אפל למדה במשך תשעה חודשים משחק, ואחר כך עברה לגור בלונדון. שם הצטרפה לתיאטרון הלאומי לנוער והופיעה בווסט אנד.
ב-2015 הייתה צ'אפל חברה בתיאטרון הרפרטוארי לנוער, וכיכבה במחזות "אנקת גבהים" מאת אמילי ברונטה, "הסוחר מוונציה" מאת ויליאם שייקספיר, וב-"Consensual" מאת איוואן פלייסי. ב-2016 שיחקה בתפקיד ג'ניפר סטריינג' בסדרת הטלוויזיה "The Last Dragonslayer" של רשת Sky TV. עוד באותה שנה השתתפה בסדרה "דם חדש" מאת אנתוני הורוביץ בתפקיד ונדי רוברטס. צ'אפל שיחקה בתפקיד קבוע בסדרה "פולדארק" החל מהעונה השלישית, וגילמה את מורוונה צ'ינוות'. ב-2019 שיחקה בתפקיד לוסי בסרט "יסטרדיי". ב-2020 הופיעה בתפקיד מונה בסדרה "ולאנדר הצעיר" של נטפליקס.
שאול לוונשטם
התקפה בצבע
התקפה בצבע היא סוג של מחאה, פרובוקציה או תקיפה אלימה, המוגדרת כפעולה של השלכת צבע ירוק מבריק, צבע חיטוי משולש, על גופו (בדרך כלל פנים) של קורבן. הצבע אמנם אינו גורם נזק מתמשך, אך קשה מאוד להסירו במהירות; ההסרה הטבעית המלאה עשויה להימשך עד שבוע. בעשור הראשון של המאה ה-21, התקפות נפוצו ברוסיה ובאוקראינה על ידי פעילים תומכי ממשלה נגד אישים פוליטיים המתנגדים לממשלה.
הצבע.
הצבע הוא צבע חיטוי, שהיה בשימוש נרחב מבחינה רפואית עד לתקופת ברית המועצות. הצבע, המשמש לעיתים קרובות כאלטרנטיבה מתונה יותר ליוד, עדיין זמין בבתי מרקחת וחנויות תרופות רוסיות. קשה מאוד לשטוף את הצבע ויכול להשאיר כתם במשך ימים לאחר מכן ודורש חומצה להסרה מלאה. עם זאת, אלא אם הצבע מעורבב עם חומרים אחרים (למשל כמו בהתקפה השנייה על אלכסיי נבלני), זה לא משאיר נזק לטווח הארוך ולכן הקורבנות אינם נוקטים בהליך משפטי.
קורבנות והשפעה.
השימוש בצבע נקשר לפעילים תומכי הקרמלין, אם כי מעולם לא היה קשור ישירות לממשלת רוסיה. הקורבנות של תקריות היו כמעט תמיד מנהיגי האופוזיציה הרוסית: כולל סרגיי מיטרוחין, מיכאיל קסיאנוב, אלכסיי נבלני - ופוליטיקאים אוקראינים (ארסן אבקוב, ארסני יאצניוק, אולג ליאשקו).
כתוצאה מהתקפות רבות, חלק ממנהיגי האופוזיציה הרוסית החלו להשתמש בצבע ירוק כ"תג של כבוד". לאחר שהותקף נבלני בברנאול, עשרות מתומכיו פרסמו תמונות מקוונות שלהם "בירוק" (#GreenNavalny) והבלוגר ניקולאי דנילוב, שהגיע לכיכר האדומה עם פנים מכוסות בצבע ירוק, עוכב על ידי משטרת הפדרציה הרוסית. כשקאסיאנוב הותקף בצעדת הזיכרון לנמצוב, החלו המפגינים לזעוק: "לא תשפכו עלינו צבע ירוק!"
ב־4 במאי 2017, אלכסיי נבאלני הצהיר כי האירועים בהם היו מעורבים צבע ירוק עזרו לגייס כסף לקרן שלו. באותו יום פרסם המשורר הרוסי דמיטרי ביקוב שיר "הלאה, רוסיה הירוקה!", שבו צבע ירוק נקרא כצבע של "המהפכה הרוסית".
ההתקפות הרבות על אישים פוליטיים ותקשורתיים רוסים שמבקרים את השלטון, בליווי תצלומים של אנשים שנצבעו בצבע, אילצו את התקשורת הרוסית להסביר לקוראיהם, שרובם לא מכירים את הצבע הירוק המבריק, מה הוא בדיוק אותו צבע ומשמעותו.
Phred quality score
ציון Phred (פרד) להערכת איכות הוא מדד איכותי לזיהוי הבסיסים (נוקליאוטידים) שמוצגים כפלט בתהליך ריצוף DNA.
ציון זה פותח במקור עבור תוכנת המחשב ששימשה לריצוף ה-DNA במסגרת פרויקט גנום האדם.
ציון פרד ניתן לכל נוקליאוטיד בפני עצמו, בהתאם לקריאתו ולזיהויו במהלך ריצוף ה-DNA.
פורמט ה-FASTQ (פורמט נפוץ להצגת רצפי DNA) מקודד את ציון פרד כתווי ASCII ומציג אותם לצד הרצפים שהתקבלו.
ציוני פרד מהווים מדד מקובל בעולם הריצוף לאפיון איכות רצפי ה-DNA, ומאפשרים להשוות את טיב התוצרים המתקבלים משיטות ריצוף שונות.
אחד מהשימושים החשובים ביותר בציוני פרד הם קביעה אוטומטית ואיכותית של רצפי קונצנזוס, באופן מדויק.
הגדרה.
ציון פרד Q קשור קשר לוגריתמי להסתברות לטעות בזיהוי הנוקליאוטיד, P.
הנוסחה לחישוב Q או P:
formula_1
formula_2
היסטוריה.
את הרעיון לייצג איכות של ריצוף על ידי ציונים ניתן לייחס ל שנוצרו על ידי Staden's grpup בשנת 1992. בשנת 1995, Staden's grpup הציגו שיטה לשיפור הנכונות של רצפי הקונצנזוס שפוענחו בפרויקט הגנום האנושי. עם זאת, הניסיונות הראשונים לכך זכו להצלחה חלקית בלבד.
התכנית הראשונה לפיתוח ציוני איכות מדויקים ומבוססים הייתה תוכנית Phred, שהצליחה לחשב ציוני איכות מדויקים יותר בזכות הקישור הלוגריתמי להסתברות לטעות. ציון פרד אומץ על ידי כל המרכזים שעסקו בריצוף הגנום האנושי, כמו גם מעבדות רבות אחרות. הרוב המכריע של רצפי ה-DNA שהופקו במהלך הפרויקט עובדו באמצעות המדד של ציון פרד.
לאחר שציוני פרד הפכו לסטנדרט הנדרש בריצוף DNA, יצרנים שונים של מכשירי ריצוף (כולל Li-Cor ו-ABI) פיתחו מדדי איכות דומים עבור התוכנות שלהם.
שיטה.
כדי לקבוע את ציוני האיכות, פרד מחשב תחילה מספר פרמטרים הקשורים ל"פיק" בקריאת כל בסיס - הן מבחינת צורת הפיק והן מבחינת הרזולוציה שלו. לאחר מכן, פרד משתמש בפרמטרים הללו כדי להתאים להם את ציון האיכות, תוך שימוש בטבלאות בדיקה גדולות. הטבלאות הללו נוצרו על ידי רצפים ידועים שהותאם להן ציון פרד, כאשר טבלאות שונות מושמשות עבור שיטות ריצוף שונות.
המכונות הראשונות עבורן פותח ציון פרד היו מסוג "slab gel" (למשל, מכונת ABI373).
במקור, התוצאות שנתן פרד היו מדויקות יותר מאלה שהתקבלו על ידי התוכנה שהוטמעה במכונה, ולכן השימוש בהן היה רב. בהמשך, יצרני מכשירים כמו ABI עמלו על פיתוח תוכנות דומות, שסיפקו ציוני איכות מדויקים יותר על ידי התאמה מרבית למכונות עצמן, כך שהצורך בשימוש בציוני פרד פחת.
יישומים.
ציוני Phred משמשים להערכת איכות הרצף, זיהוי והסרה של רצף באיכות נמוכה (end clipping), וקביעת רצפי קונצנזוס מדויקים.
במקור, ציוני האיכות של Phred שימשו בעיקר את תוכנת Phrap להרכבת הרצפים.
התוכנה שימשה את החוקרים בכמה מפרויקטי הריצוף הגדולים ביותר (ביניהם, פרויקט ריצוף הגנום האנושי) וכיום היא אחת מהתוכנות הנפוצות להרכבת רצפי DNA בתעשיית הביוטכנולוגיה.
Phrap משתמשת בציוני איכות Phred כדי לקבוע רצפי קונצנזוס מדויקים ביותר, וכדי לאמוד את איכות רצפי הקונצנזוס. בנוסף, התוכנה מבצעת שימוש בציוני פרד כדי להעריך את חוסר התאמה בין רצפים חופפים, במטרה לקבוע האם מדובר בשגיאה בקריאה או שחל שינוי בין הרצפים.
במסגרת פרויקט הגנום האנושי, השימוש החשוב ביותר בציוני האיכות של Phred היה לקביעת אוטומטית של רצפי קונצנזוס. לפני כן, המדענים נאלצו לבצע קביעה ידנית של איכות הרצף ועריכה ידנית של כל שגיאה. השימוש בתוכנת Phrap גרם לכך שהיה ניתן באופן אוטומטי לקבוע את רצף הקונצנזוס האיכותי ביותר - דבר שהוביל, ברוב המקרים, לביטול הצורך בעריכה ידנית. על כן, שיעור השגיאות המשוער ברצפים שחושבו באופן אוטומטי על ידי Phred ו- Phrap, היה ברובו ממוך משמעותית משיעור השגיאות של הרצפים שערכו באופן ידני.
דחיסה.
ציוני האיכות נשמרים בדרך כלל יחד עם רצף הנוקליאוטידים בפורמט FASTQ המקובל. הם מהווים כמחצית משטח הדיסק הנדרש בפורמט FASTQ (לפני דחיסה), ולכן דחיסת ערכי האיכות יכולה להפחית משמעותית את גודל האחסון הדרוש, ובכך להאיץ את האנליזה ואת העברת נתוני הרצף. בספרות ניתן למצוא גם שיטות המבצעות דחיסה ללא איבוד נתונים, וגם שיטות דחיסה בהן יש איבוד נתונים מסוים.
לדוגמה, האלגוריתם QualComp מבצע דחיסה עם אחוז איבוד בהתאם להגדרת המשתמש;
הוא מקצה את מספר הביטים מראש כדי למזער את ה- MSE (שגיאת ריבוע ממוצעת) בין ערכי האיכות המקוריים (הלא דחוסים) לבין המשוחזרים (לאחר דחיסה).
ישנם אלגוריתמים אחרים לדחיסת ערכי איכות שאינם כוללים אובדן נתונים, כמו SCALCE Fastqz, QZV, MPEG-G ו-AQUa.
לדוגמה, SCALCE משתמש בהקטנת גודל האלף-בית, וזאת על סמך ההבנה כי ערכי איכות "שכנים" בערכם, ניתן לייצג גם בטווח אותיות קטן יותר.
פר (פרעה)
פר היה שליט מצרי במצרים העליונה בתרופה הקדם-שושלתית, בסביבות שנת 3250 לפנה"ס, והוא כלול בקבוצת השליטים הקדומים שקיומם מוטל בספק.
שמו.
השם "פר" הוא שם זמני, בהתבסס על דמות של פר המופיעה בשמו של המלך, שעדיין אין הסכמה על הגייתה. השם מוכר בעיקר מלוחות שנהב שנמצאו בקבר המכונה U-j באום אל געב ומתחריט בסלע מגבל ג'אוטי (הר באזור המדבר בין נקאדה לאבידוס, מערבית לתבי).
זיהויו.
האגיפטולוג גינטר דרייר הסיק את קיומו מחריטות על פסל של האל מין שהוא פענח כשמות שליטים. הוא גם שיער שכלי קבורה שנמצאו בקבר U-j, קברו של המלך עקרב הראשון, הגיעו מאזור בשליטתו של "פר", מאחר שסמלי הפר הופיעו עליהם. לממצאים אלו נוסף ב-1995 תחריט הסלע בגבל ג'אוטי שמציג ניצחון צבאי, ואת הסימנים בו ניתן לפרש כניצחון של המלך עקרב הראשון על המלך פר. ייתכן שהעימות בין השניים היה חלק מההמאבק הכללי לריכוז הכוח במצרים הפרהיסטורית, ובמסגרתו המלך עקרב הראשון מתיניס כבש את נקאדה שהייתה בשליטתו של המלך פר.
ביקורת על הזיהוי.