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1 |
+
import pickle
|
2 |
+
import streamlit as st
|
3 |
+
import pandas as pd
|
4 |
+
import numpy as np
|
5 |
+
from PIL import Image
|
6 |
+
import sklearn
|
7 |
+
import pickle
|
8 |
+
|
9 |
+
import joblib as jb
|
10 |
+
|
11 |
+
import xgboost as xgb
|
12 |
+
|
13 |
+
# Esconder os menu padrao
|
14 |
+
hide_streamlit_style = """
|
15 |
+
<style>
|
16 |
+
#MainMenu {visibility: hidden;}
|
17 |
+
footer {visibility: hidden;}
|
18 |
+
</style>
|
19 |
+
"""
|
20 |
+
st.markdown(hide_streamlit_style, unsafe_allow_html=True)
|
21 |
+
|
22 |
+
|
23 |
+
# pipreqs . --force
|
24 |
+
# cat requirements.txt
|
25 |
+
# pip install -r requirements.txt
|
26 |
+
|
27 |
+
# DICIONARIO DE DADOS - ATRIBUTOS
|
28 |
+
# HeartDisease: Entrevistados que já relataram ter doença cardíaca coronária ou infarto do miocárdio.
|
29 |
+
#
|
30 |
+
# BMI: IMC.
|
31 |
+
# Smoking : Você fumou pelo menos 100 cigarros em toda a sua vida?
|
32 |
+
# AlcoholDrinking: Bebedores pesados.
|
33 |
+
# Stroke: Você teve um derrame?
|
34 |
+
# PhysicalHealth: Sua saúde física, que inclui doenças físicas e lesões, por quantos dias, nos últimos 30 dias.
|
35 |
+
# MentalHealth: Saúde mental, por quantos dias nos últimos 30 dias sua saúde mental não foi boa? (0-30 dias).
|
36 |
+
# DiffWalking: Você tem muita dificuldade para andar ou subir escadas?
|
37 |
+
# Sex: Sexo.
|
38 |
+
# AgeCategory: Categoria de idade de quatorze níveis.
|
39 |
+
# Race: Etinía.
|
40 |
+
# Diabetic: Se têm diabetes.
|
41 |
+
# PhysicalActivity: Adultos que relataram fazer atividade física ou exercício durante os últimos 30 dias fora do trabalho regular.
|
42 |
+
# GenHealth: Você diria que, em geral, sua saúde é.
|
43 |
+
# SleepTime: Em média, quantas horas você dorme em um período de 24 horas?
|
44 |
+
# Asthma: Você tem asma?
|
45 |
+
# KidneyDisease: Cálculos renais, infecção da bexiga ou incontinência, alguma vez lhe disseram que tinha doença renal?
|
46 |
+
# SkinCancer: Você teve câncer de pele?
|
47 |
+
|
48 |
+
dict_cat_ingles = {
|
49 |
+
'HeartDisease': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
50 |
+
'Smoking': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
51 |
+
'AlcoholDrinking': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
52 |
+
'Stroke': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
53 |
+
'DiffWalking': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
54 |
+
'Sex': {'Female': 0, 'Male': 1},
|
55 |
+
'PhysicalActivity': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
56 |
+
'Asthma': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
57 |
+
'KidneyDisease': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
58 |
+
'SkinCancer': {'No': 0, 'Yes': 1},
|
59 |
+
'Race': {'American Indian/Alaskan Native': 0,
|
60 |
+
'Asian': 1,
|
61 |
+
'Black': 2,
|
62 |
+
'Hispanic': 3,
|
63 |
+
'Other': 4,
|
64 |
+
'White': 5},
|
65 |
+
'Diabetic': {'No': 0,
|
66 |
+
'No, borderline diabetes': 1,
|
67 |
+
'Yes': 2,
|
68 |
+
'Yes (during pregnancy)': 3},
|
69 |
+
'GenHealth': {'Poor': 0,
|
70 |
+
'Fair': 1,
|
71 |
+
'Good': 2,
|
72 |
+
'Very good': 3,
|
73 |
+
'Excellent': 4}
|
74 |
+
}
|
75 |
+
|
76 |
+
dict_cat_portugues = {
|
77 |
+
'HeartDisease': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
78 |
+
'Smoking': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
79 |
+
'AlcoholDrinking': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
80 |
+
'Stroke': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
81 |
+
'DiffWalking': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
82 |
+
'Sex': {'Feminino': 0, 'Masculino': 1},
|
83 |
+
'PhysicalActivity': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
84 |
+
'Asthma': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
85 |
+
'KidneyDisease': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
86 |
+
'SkinCancer': {'Não': 0, 'Sim': 1},
|
87 |
+
'Race': {'Índio americano/nativo do Alasca': 0,
|
88 |
+
'Asiático': 1,
|
89 |
+
'Negro': 2,
|
90 |
+
'Hispânico': 3,
|
91 |
+
'Outros': 4,
|
92 |
+
'Branco': 5},
|
93 |
+
'Diabetic': {'Não': 0,
|
94 |
+
'Não, diabetes limítrofe': 1,
|
95 |
+
'Sim': 2,
|
96 |
+
'Sim (durante a gravidez)': 3},
|
97 |
+
'GenHealth': {'Ruim': 0,
|
98 |
+
'Razoável': 1,
|
99 |
+
'Boa': 2,
|
100 |
+
'Muito Boa': 3,
|
101 |
+
'Excelente': 4}
|
102 |
+
}
|
103 |
+
|
104 |
+
|
105 |
+
with open('DICT_CATEGORIAS_VALORES.pkl', 'rb') as f:
|
106 |
+
DICT_CATEGORIAS_VALORES = pickle.load(f)
|
107 |
+
|
108 |
+
with open('DICT_INVERSO_VALORES_CATEGORIAS_PORTUGUES.pkl', 'rb') as f:
|
109 |
+
DICT_INVERSO_VALORES_CATEGORIAS_PORTUGUES = pickle.load(f)
|
110 |
+
|
111 |
+
|
112 |
+
CHOICES = { **DICT_CATEGORIAS_VALORES, **dict_cat_portugues }
|
113 |
+
|
114 |
+
# Configuração da página
|
115 |
+
#st.set_page_config(page_title = "Precisão de Doenças Cardíacas", layout = "centered")
|
116 |
+
st.title('Sistema de Auxílio à Previsão de Problemas Cardíacos')
|
117 |
+
st.sidebar.title("Anamnese - Sintomas")
|
118 |
+
|
119 |
+
imagem = 'coracao01.jpeg'
|
120 |
+
image = Image.open(imagem)
|
121 |
+
st.image(image, width=500)
|
122 |
+
|
123 |
+
CHOICES = DICT_INVERSO_VALORES_CATEGORIAS_PORTUGUES.copy()
|
124 |
+
|
125 |
+
# inicializacao das variaveis
|
126 |
+
SleepTime = PhysicalHealth = MentalHealth = BMI = HeartDisease = Smoking = AlcoholDrinking = Stroke = 0
|
127 |
+
AgeCategory = DiffWalking= Sex= PhysicalActivity= Asthma= KidneyDisease= SkinCancer= 0
|
128 |
+
Race = Diabetic = GenHealth = 0
|
129 |
+
|
130 |
+
with st.sidebar:
|
131 |
+
|
132 |
+
with st.form(key='my_form'):
|
133 |
+
|
134 |
+
# retorna o mapeamento para Categoria Numérica da opção
|
135 |
+
# def format_func(option):
|
136 |
+
# return CHOICES[option]
|
137 |
+
|
138 |
+
def format_IMC(imc):
|
139 |
+
if (imc >= 0 and imc < 18):
|
140 |
+
imc_int = 17
|
141 |
+
elif (imc >= 18 and imc <= 24):
|
142 |
+
imc_int = 24
|
143 |
+
elif (imc > 24 and imc <= 30):
|
144 |
+
imc_int = 30
|
145 |
+
elif (imc > 30 and imc <= 35):
|
146 |
+
imc_int = 35
|
147 |
+
elif (imc > 35 and imc <= 40):
|
148 |
+
imc_int = 40
|
149 |
+
else:
|
150 |
+
imc_int = 41
|
151 |
+
|
152 |
+
return int(imc_int)
|
153 |
+
|
154 |
+
|
155 |
+
BMI = st.number_input('IMC', min_value=15.0, max_value=300.0, step=1.0)
|
156 |
+
BMI = format_IMC(BMI)
|
157 |
+
|
158 |
+
Smoking = st.selectbox('Fumante', options = CHOICES['Smoking'],
|
159 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Smoking'][x] )
|
160 |
+
|
161 |
+
AlcoholDrinking = st.selectbox('Alto Consumo de Alcool', options = CHOICES['AlcoholDrinking'],
|
162 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['AlcoholDrinking'][x] )
|
163 |
+
|
164 |
+
Stroke = st.selectbox('Você teve um AVC?', options = CHOICES['Stroke'],
|
165 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Stroke'][x])
|
166 |
+
|
167 |
+
PhysicalHealth = st.number_input('Saúde Física, por quantos dias neste mês',
|
168 |
+
min_value=0.0, max_value=30.0, step=1.0)
|
169 |
+
|
170 |
+
def converter_PhysicalHealth_categoria(PhysicalHealth):
|
171 |
+
if PhysicalHealth <= 4.0:
|
172 |
+
PhysicalHealth_cat = 4
|
173 |
+
elif (PhysicalHealth > 4.0 and PhysicalHealth <= 5.0):
|
174 |
+
PhysicalHealth_cat = 5
|
175 |
+
elif (PhysicalHealth > 5 and PhysicalHealth <= 6):
|
176 |
+
PhysicalHealth_cat = 6
|
177 |
+
elif (PhysicalHealth > 6 and PhysicalHealth <= 7):
|
178 |
+
PhysicalHealth_cat = 7
|
179 |
+
elif (PhysicalHealth > 7 and PhysicalHealth <= 8):
|
180 |
+
PhysicalHealth_cat = 8
|
181 |
+
else:
|
182 |
+
PhysicalHealth_cat = 9
|
183 |
+
|
184 |
+
return PhysicalHealth_cat
|
185 |
+
|
186 |
+
PhysicalHealth = converter_PhysicalHealth_categoria(PhysicalHealth)
|
187 |
+
|
188 |
+
MentalHealth = st.number_input('Saúde mental, por quantos dias não foi boa no mês',
|
189 |
+
min_value=0.0, max_value=30.0, step=1.0)
|
190 |
+
|
191 |
+
def converter_MentalHealth_categoria(MentalHealth):
|
192 |
+
if MentalHealth <= 0:
|
193 |
+
MentalHealth_cat = 0
|
194 |
+
elif (MentalHealth >= 3.0 and MentalHealth < 10.0):
|
195 |
+
MentalHealth_cat = 3
|
196 |
+
elif (MentalHealth >= 10 and MentalHealth < 20):
|
197 |
+
MentalHealth_cat = 20
|
198 |
+
else:
|
199 |
+
MentalHealth_cat = 30
|
200 |
+
|
201 |
+
return MentalHealth_cat
|
202 |
+
|
203 |
+
MentalHealth = converter_MentalHealth_categoria(MentalHealth)
|
204 |
+
|
205 |
+
DiffWalking = st.selectbox(
|
206 |
+
'Dificuldade de andar ou subir escadas', options = CHOICES['DiffWalking'],
|
207 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['DiffWalking'][x])
|
208 |
+
|
209 |
+
|
210 |
+
Sex = st.selectbox('Sexo', options = CHOICES['Sex'],
|
211 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Sex'][x])
|
212 |
+
|
213 |
+
AgeCategory = st.selectbox('Idade (categoria)', options = CHOICES['AgeCategory'],
|
214 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['AgeCategory'][x])
|
215 |
+
|
216 |
+
Race = st.selectbox('Etnia', options = CHOICES['Race'],
|
217 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Race'][x])
|
218 |
+
|
219 |
+
Diabetic = st.selectbox('Diabetes', options = CHOICES['Diabetic'],
|
220 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Diabetic'][x] )
|
221 |
+
|
222 |
+
PhysicalActivity = st.selectbox(
|
223 |
+
'Atividade Física nos últimos 30 dias', options = CHOICES['PhysicalActivity'],
|
224 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['PhysicalActivity'][x] )
|
225 |
+
|
226 |
+
GenHealth = st.selectbox('Estado Geral de Saúde', options = CHOICES['GenHealth'],
|
227 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['GenHealth'][x])
|
228 |
+
|
229 |
+
SleepTime = st.number_input('Quantas horas você dorme por dia',
|
230 |
+
min_value=1.0, max_value=24.0, step=1.0)
|
231 |
+
|
232 |
+
def converter_sleepTime_categoria(SleepTime):
|
233 |
+
if SleepTime <= 4:
|
234 |
+
sleep_cat = 4
|
235 |
+
elif (SleepTime > 4 and SleepTime <= 5):
|
236 |
+
sleep_cat = 5
|
237 |
+
elif (SleepTime > 5 and SleepTime <= 6):
|
238 |
+
sleep_cat = 6
|
239 |
+
elif (SleepTime > 6 and SleepTime < 8):
|
240 |
+
sleep_cat = 7
|
241 |
+
elif (SleepTime >= 8 and SleepTime < 9):
|
242 |
+
sleep_cat = 8
|
243 |
+
elif (SleepTime >= 9 ):
|
244 |
+
sleep_cat = 9
|
245 |
+
|
246 |
+
return sleep_cat
|
247 |
+
|
248 |
+
SleepTime = converter_sleepTime_categoria(SleepTime)
|
249 |
+
|
250 |
+
|
251 |
+
Asthma = st.selectbox('Você tem asma?', CHOICES['Asthma'],
|
252 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['Asthma'][x])
|
253 |
+
|
254 |
+
KidneyDisease = st.selectbox('Doença renal (cálculo, incontinência, etc.',
|
255 |
+
options = CHOICES['KidneyDisease'],
|
256 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['KidneyDisease'][x])
|
257 |
+
|
258 |
+
SkinCancer = st.selectbox('Câncer de pele', options = CHOICES['SkinCancer'],
|
259 |
+
format_func=lambda x: CHOICES['SkinCancer'][x])
|
260 |
+
|
261 |
+
|
262 |
+
predict_button = st.form_submit_button(label='Prever')
|
263 |
+
|
264 |
+
|
265 |
+
# Pagina pricipal
|
266 |
+
|
267 |
+
import xgboost
|
268 |
+
from xgboost import Booster
|
269 |
+
|
270 |
+
def previsao_doenca_cardiaca(Smoking, AlcoholDrinking, Stroke, DiffWalking, Sex, Race,
|
271 |
+
Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, Asthma, KidneyDisease,
|
272 |
+
SkinCancer, AgeCategory, SleepTime, PhysicalHealth,
|
273 |
+
MentalHealth, BMI):
|
274 |
+
|
275 |
+
# Colocar em escala (Padronizacao)
|
276 |
+
sc = jb.load('std_scaler.bin')
|
277 |
+
|
278 |
+
X = np.array([Smoking, AlcoholDrinking, Stroke, DiffWalking, Sex, Race,
|
279 |
+
Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, Asthma, KidneyDisease,
|
280 |
+
SkinCancer, AgeCategory, SleepTime, PhysicalHealth,
|
281 |
+
MentalHealth, BMI]).reshape(1, -1)
|
282 |
+
|
283 |
+
scaler_X = sc.transform(X)
|
284 |
+
print(scaler_X)
|
285 |
+
|
286 |
+
|
287 |
+
#file = "modeloXGBoostv50.pkl"
|
288 |
+
#xgb = joblib.load(file)
|
289 |
+
|
290 |
+
# PREDICT
|
291 |
+
# file = 'modeloXGBoostv50.pkl'
|
292 |
+
# # # load
|
293 |
+
|
294 |
+
#file = "modeloXGBoostv50.pkl"
|
295 |
+
# clf = True
|
296 |
+
# with open(file, 'rb') as f:
|
297 |
+
# clf = pickle.load(f)
|
298 |
+
|
299 |
+
# model = clf
|
300 |
+
|
301 |
+
|
302 |
+
#file = 'modeloXGBoostv50.json'
|
303 |
+
|
304 |
+
#load saved model
|
305 |
+
#model = xgbst = jb.load(file)
|
306 |
+
|
307 |
+
|
308 |
+
# booster = Booster()
|
309 |
+
# model = booster.load_model(file)
|
310 |
+
|
311 |
+
file = 'modeloXGBoostv50.bin'
|
312 |
+
booster = xgb.Booster()
|
313 |
+
booster.load_model(file)
|
314 |
+
model = booster
|
315 |
+
|
316 |
+
|
317 |
+
#model = xgbst.Booster(file)
|
318 |
+
#model.predict(new_data)
|
319 |
+
|
320 |
+
drow = xgb.DMatrix(scaler_X, label=[0, 1]) #, feature_names=X_test.columns)
|
321 |
+
prob = model.predict(drow)
|
322 |
+
if prob > 0.5:
|
323 |
+
pred = ':red[Doença Cardíaca]'
|
324 |
+
else:
|
325 |
+
pred = ':blue[Normal]'
|
326 |
+
prob = 1 - prob
|
327 |
+
# pred = ['Normal' if model.predict(drow) > 0.5 else 'Doença Cardíaca']
|
328 |
+
# pred = pred[0]
|
329 |
+
print(pred)
|
330 |
+
print(type(pred))
|
331 |
+
print(prob)
|
332 |
+
|
333 |
+
|
334 |
+
# if pred == 0:
|
335 |
+
# diagnostico_doenca_cardiaca = "Normal"
|
336 |
+
# image = 'saudavel.jpg'
|
337 |
+
# elif pred == 1:
|
338 |
+
# diagnostico_doenca_cardiaca = "Doença Cardíaca"
|
339 |
+
# image = 'diabetes02.jpg'
|
340 |
+
# else:
|
341 |
+
# diagnostico_doenca_cardiaca = "Sem Diagnóstico"
|
342 |
+
|
343 |
+
return pred, prob[0] #, image
|
344 |
+
|
345 |
+
|
346 |
+
if predict_button:
|
347 |
+
print('ok')
|
348 |
+
print('\n')
|
349 |
+
|
350 |
+
print(Smoking, AlcoholDrinking, Stroke, DiffWalking, Sex, Race,
|
351 |
+
Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, Asthma, KidneyDisease,
|
352 |
+
SkinCancer, AgeCategory, SleepTime, PhysicalHealth,
|
353 |
+
MentalHealth, BMI)
|
354 |
+
|
355 |
+
atributos = [ Smoking, AlcoholDrinking, Stroke, DiffWalking, Sex, Race,
|
356 |
+
Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, Asthma, KidneyDisease,
|
357 |
+
SkinCancer, AgeCategory, SleepTime, PhysicalHealth,
|
358 |
+
MentalHealth, BMI ]
|
359 |
+
|
360 |
+
|
361 |
+
|
362 |
+
|
363 |
+
diagnostico_doenca_cardiaca, prob = previsao_doenca_cardiaca(Smoking, AlcoholDrinking,
|
364 |
+
Stroke, DiffWalking, Sex, Race,
|
365 |
+
Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, Asthma, KidneyDisease,
|
366 |
+
SkinCancer, AgeCategory, SleepTime, PhysicalHealth,
|
367 |
+
MentalHealth, BMI)
|
368 |
+
|
369 |
+
|
370 |
+
string_saida = '### Previsão: ' + diagnostico_doenca_cardiaca + \
|
371 |
+
' - Probabilidade: ' + str(int(round(prob * 100, 0))) + "%"
|
372 |
+
st.markdown(string_saida)
|
373 |
+
# st.markdown('## Previsão: ' + diagnostico_doenca_cardiaca)
|
374 |
+
# st.markdown('## Probabilidade: ' + str(int(round(prob * 100, 0))) + "%")
|
375 |
+
|
376 |
+
# )
|
377 |
+
|
378 |
+
|
379 |
+
|
380 |
+
|
381 |
+
# BMI, Smoking, AlcoholDrinking, Stroke, PhysicalHealth, MentalHealth, DiffWalking, Sex, AgeCategory,
|
382 |
+
# Race, Diabetic, PhysicalActivity, GenHealth, SleepTime, Asthma, KidneyDisease, SkinCancer
|
383 |
+
|
384 |
+
|
385 |
+
#st.write(Diagnostico_Diabetes)
|
386 |
+
# image = Image.open('diabetes/' + imagem)
|
387 |
+
# st.markdown('## Diagnóstico: ' + '__' + Diagnostico_Diabetes + '__')
|
388 |
+
# #st.write('Diagnóstico:' + Diagnostico_Diabetes)
|
389 |
+
# st.image(image, width=250)
|
390 |
+
|
391 |
+
# else:
|
392 |
+
# Diagnostico_Diabetes = 'Sem Previsão'
|
393 |
+
|