mar3 / app.py
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a8b8e57
import streamlit as st
from PIL import Image
import numpy as np
import cv2
from huggingface_hub import from_pretrained_keras
st.header("Segmentaci贸n de dientes con rayos X")
st.markdown('''
Hola estudiantes de Platzi 馃殌. Este modelo usan UNet para segmentar im谩genes
de dientos en rayos X. Se utila un modelo de Keras importado con la funci贸n
`huggingface_hub.from_pretrained_keras`. Recuerda que el Hub de Hugging Face est谩 integrado
con muchas librer铆as como Keras, scikit-learn, fastai y otras.
El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net).
''')
model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
model=from_pretrained_keras(model_id)
## Si una imagen tiene m谩s de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal)
def convertir_one_channel(img):
if len(img.shape)>2:
img= cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
return img
else:
return img
def convertir_rgb(img):
if len(img.shape)==2:
img= cv2.cvtColor(img,cv2.COLOR_GRAY2RGB)
return img
else:
return img
image_file = st.file_uploader("Sube aqu铆 tu imagen.", type=["png","jpg","jpeg"])
if image_file is not None:
img= Image.open(image_file)
st.image(img,width=850)
img=np.asarray(img)
img_cv=convertir_one_channel(img)
img_cv=cv2.resize(img_cv,(512,512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
img_cv=np.float32(img_cv/255)
img_cv=np.reshape(img_cv,(1,512,512,1))
prediction=model.predict(img_cv)
predicted=prediction[0]
predicted = cv2.resize(predicted, (img.shape[1],img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
mask=np.uint8(predicted*255)#
_, mask = cv2.threshold(mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY+cv2.THRESH_OTSU)
kernel =( np.ones((5,5), dtype=np.float32))
mask=cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel,iterations=1 )
mask=cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel,iterations=1 )
cnts,hieararch=cv2.findContours(mask,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0) , 3)
if output is not None :
st.subheader("Segmentaci贸n:")
st.write(output.shape)
st.image(output,width=850)