Update PFCapp.qmd

PFCapp.qmd

@@ -356,14 +356,10 @@ output$sp_gene_plot <- renderPlot({
 })
 
 output$sp_target_plot <- renderPlot({
-  seu <- sp.PFC
-  seu$`ITi-M1`[is.na(seu$`ITi-M1`)] <- 0
-  seu$`ITi-M2`[is.na(seu$`ITi-M2`)] <- 0
-  seu$`ITc-M3`[is.na(seu$`ITc-M3`)] <- 0
   df <- data.frame(
-    X = seu$ML_new,
-    Y = seu$DV_new,
-    Zscore = scale(log1p(seu@meta.data[,input$sp_target]))
+    X = sp.PFC$ML_new,
+    Y = sp.PFC$DV_new,
+    Zscore = scale(log1p(sp.PFC@meta.data[,input$sp_target]))
   )
   df <- df[which(seu$slice==input$sp_slice),]
   df$Zscore[df$Zscore<0] <- 0