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Sleeping
Sleeping
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app.py
CHANGED
|
@@ -59,7 +59,7 @@ def train_callback(
|
|
| 59 |
weight_decay,
|
| 60 |
batch_size,
|
| 61 |
epochs,
|
| 62 |
-
|
| 63 |
model_tag,
|
| 64 |
):
|
| 65 |
try:
|
|
@@ -70,7 +70,7 @@ def train_callback(
|
|
| 70 |
weight_decay=float(weight_decay),
|
| 71 |
batch_size=int(batch_size),
|
| 72 |
epochs=int(epochs),
|
| 73 |
-
|
| 74 |
model_tag=model_tag,
|
| 75 |
)
|
| 76 |
|
|
@@ -157,17 +157,17 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 157 |
with gr.Tab("1. Explorer le jeu de données"):
|
| 158 |
gr.Markdown("## Comprendre le jeu de données avant l’entraînement")
|
| 159 |
|
| 160 |
-
|
| 161 |
-
|
|
|
|
|
|
|
| 162 |
|
| 163 |
-
|
| 164 |
-
dataset_summary = gr.JSON(label="Résumé général du dataset")
|
| 165 |
|
| 166 |
-
|
| 167 |
-
|
| 168 |
-
|
| 169 |
-
|
| 170 |
-
)
|
| 171 |
|
| 172 |
gr.Markdown("## Visualisation des images")
|
| 173 |
|
|
@@ -189,7 +189,8 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 189 |
step=4,
|
| 190 |
label="Nombre d’images à afficher",
|
| 191 |
)
|
| 192 |
-
|
|
|
|
| 193 |
|
| 194 |
image_gallery = gr.Gallery(
|
| 195 |
label="Exemples d’images",
|
|
@@ -200,52 +201,64 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 200 |
with gr.Tab("2. Entraîner un modèle"):
|
| 201 |
gr.Markdown("## Entraînement avec ResNet18 pré-entraîné")
|
| 202 |
gr.Markdown(
|
| 203 |
-
"
|
| 204 |
-
"
|
| 205 |
-
"avec le backbone gelé."
|
| 206 |
)
|
| 207 |
|
| 208 |
with gr.Row():
|
| 209 |
with gr.Column():
|
| 210 |
dropout = gr.Slider(
|
| 211 |
-
0.0,
|
| 212 |
-
0.8,
|
| 213 |
-
value=0.
|
| 214 |
step=0.05,
|
| 215 |
label="Dropout",
|
| 216 |
)
|
|
|
|
| 217 |
fc_dim = gr.Dropdown(
|
| 218 |
choices=[64, 128, 256, 512],
|
| 219 |
value=256,
|
| 220 |
label="Dimension de la couche cachée",
|
| 221 |
)
|
|
|
|
| 222 |
learning_rate = gr.Number(
|
| 223 |
-
value=0.
|
| 224 |
label="Taux d’apprentissage",
|
| 225 |
)
|
|
|
|
| 226 |
weight_decay = gr.Number(
|
| 227 |
value=0.0001,
|
| 228 |
label="Weight decay",
|
| 229 |
)
|
|
|
|
| 230 |
batch_size = gr.Dropdown(
|
| 231 |
choices=[8, 16, 32, 64],
|
| 232 |
value=16,
|
| 233 |
label="Taille du batch",
|
| 234 |
)
|
|
|
|
| 235 |
epochs = gr.Slider(
|
| 236 |
-
1,
|
| 237 |
-
|
| 238 |
-
value=
|
| 239 |
step=1,
|
| 240 |
label="Nombre d’époques",
|
| 241 |
)
|
| 242 |
-
|
| 243 |
-
|
| 244 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 245 |
)
|
|
|
|
| 246 |
model_tag = gr.Textbox(
|
| 247 |
label="Nom court du modèle",
|
| 248 |
-
placeholder="ex.
|
| 249 |
)
|
| 250 |
|
| 251 |
train_btn = gr.Button("Lancer l’entraînement", variant="primary")
|
|
@@ -260,23 +273,20 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 260 |
|
| 261 |
gr.Markdown("## Résultats sur le test set")
|
| 262 |
|
| 263 |
-
|
| 264 |
-
|
| 265 |
-
|
| 266 |
-
|
| 267 |
-
)
|
| 268 |
|
| 269 |
-
|
| 270 |
-
|
| 271 |
-
|
| 272 |
-
|
| 273 |
-
)
|
| 274 |
|
| 275 |
-
|
| 276 |
-
|
| 277 |
-
|
| 278 |
-
|
| 279 |
-
)
|
| 280 |
|
| 281 |
with gr.Tab("3. Tester et analyser un modèle"):
|
| 282 |
gr.Markdown("## Sélectionner un modèle sauvegardé")
|
|
@@ -288,29 +298,32 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 288 |
value=initial_models[0] if initial_models else None,
|
| 289 |
label="Modèle sauvegardé",
|
| 290 |
)
|
|
|
|
| 291 |
refresh_btn = gr.Button("Actualiser la liste des modèles")
|
| 292 |
load_info_btn = gr.Button("Afficher les informations du modèle")
|
| 293 |
model_info = gr.JSON(label="Métadonnées du modèle")
|
| 294 |
|
| 295 |
with gr.Column():
|
| 296 |
-
evaluate_btn = gr.Button(
|
| 297 |
-
|
| 298 |
-
|
| 299 |
-
label="Rapport de classification",
|
| 300 |
-
interactive=False,
|
| 301 |
)
|
|
|
|
| 302 |
|
| 303 |
-
|
| 304 |
-
|
| 305 |
-
|
| 306 |
-
|
| 307 |
-
)
|
| 308 |
|
| 309 |
-
|
| 310 |
-
|
| 311 |
-
|
| 312 |
-
|
| 313 |
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 314 |
|
| 315 |
gr.Markdown("## Prédiction sur une image importée")
|
| 316 |
|
|
@@ -318,14 +331,14 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 318 |
with gr.Column():
|
| 319 |
upload_image = gr.Image(type="pil", label="Importer une image")
|
| 320 |
predict_btn = gr.Button("Prédire la classe", variant="primary")
|
|
|
|
| 321 |
with gr.Column():
|
| 322 |
predict_text = gr.Textbox(label="Résultat de la prédiction", lines=7)
|
| 323 |
predict_probs = gr.Label(label="Probabilités par classe")
|
| 324 |
|
| 325 |
gr.Markdown("## Test sur un échantillon aléatoire du test set")
|
| 326 |
|
| 327 |
-
|
| 328 |
-
random_test_btn = gr.Button("Tester un échantillon aléatoire")
|
| 329 |
|
| 330 |
with gr.Row():
|
| 331 |
random_sample_image = gr.Image(type="pil", label="Image test aléatoire")
|
|
@@ -353,7 +366,7 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 353 |
weight_decay,
|
| 354 |
batch_size,
|
| 355 |
epochs,
|
| 356 |
-
|
| 357 |
model_tag,
|
| 358 |
],
|
| 359 |
outputs=[
|
|
@@ -398,7 +411,7 @@ with gr.Blocks(title="Classification d’images microscopiques") as demo:
|
|
| 398 |
|
| 399 |
random_test_btn.click(
|
| 400 |
fn=test_random_sample_callback,
|
| 401 |
-
inputs=
|
| 402 |
outputs=[random_sample_image, random_sample_text, random_sample_probs],
|
| 403 |
)
|
| 404 |
|
|
|
|
| 59 |
weight_decay,
|
| 60 |
batch_size,
|
| 61 |
epochs,
|
| 62 |
+
fine_tune_mode,
|
| 63 |
model_tag,
|
| 64 |
):
|
| 65 |
try:
|
|
|
|
| 70 |
weight_decay=float(weight_decay),
|
| 71 |
batch_size=int(batch_size),
|
| 72 |
epochs=int(epochs),
|
| 73 |
+
fine_tune_mode=str(fine_tune_mode),
|
| 74 |
model_tag=model_tag,
|
| 75 |
)
|
| 76 |
|
|
|
|
| 157 |
with gr.Tab("1. Explorer le jeu de données"):
|
| 158 |
gr.Markdown("## Comprendre le jeu de données avant l’entraînement")
|
| 159 |
|
| 160 |
+
load_dataset_btn = gr.Button(
|
| 161 |
+
"Charger les informations du dataset",
|
| 162 |
+
variant="primary",
|
| 163 |
+
)
|
| 164 |
|
| 165 |
+
dataset_summary = gr.JSON(label="Résumé général du dataset")
|
|
|
|
| 166 |
|
| 167 |
+
class_distribution = gr.Dataframe(
|
| 168 |
+
label="Distribution des images par split et par classe",
|
| 169 |
+
interactive=False,
|
| 170 |
+
)
|
|
|
|
| 171 |
|
| 172 |
gr.Markdown("## Visualisation des images")
|
| 173 |
|
|
|
|
| 189 |
step=4,
|
| 190 |
label="Nombre d’images à afficher",
|
| 191 |
)
|
| 192 |
+
|
| 193 |
+
refresh_gallery_btn = gr.Button("Afficher des exemples")
|
| 194 |
|
| 195 |
image_gallery = gr.Gallery(
|
| 196 |
label="Exemples d’images",
|
|
|
|
| 201 |
with gr.Tab("2. Entraîner un modèle"):
|
| 202 |
gr.Markdown("## Entraînement avec ResNet18 pré-entraîné")
|
| 203 |
gr.Markdown(
|
| 204 |
+
"Paramètres par défaut recommandés : fine-tuning de la dernière couche convolutionnelle "
|
| 205 |
+
"du ResNet18, faible taux d’apprentissage, augmentation légère des données."
|
|
|
|
| 206 |
)
|
| 207 |
|
| 208 |
with gr.Row():
|
| 209 |
with gr.Column():
|
| 210 |
dropout = gr.Slider(
|
| 211 |
+
minimum=0.0,
|
| 212 |
+
maximum=0.8,
|
| 213 |
+
value=0.4,
|
| 214 |
step=0.05,
|
| 215 |
label="Dropout",
|
| 216 |
)
|
| 217 |
+
|
| 218 |
fc_dim = gr.Dropdown(
|
| 219 |
choices=[64, 128, 256, 512],
|
| 220 |
value=256,
|
| 221 |
label="Dimension de la couche cachée",
|
| 222 |
)
|
| 223 |
+
|
| 224 |
learning_rate = gr.Number(
|
| 225 |
+
value=0.00001,
|
| 226 |
label="Taux d’apprentissage",
|
| 227 |
)
|
| 228 |
+
|
| 229 |
weight_decay = gr.Number(
|
| 230 |
value=0.0001,
|
| 231 |
label="Weight decay",
|
| 232 |
)
|
| 233 |
+
|
| 234 |
batch_size = gr.Dropdown(
|
| 235 |
choices=[8, 16, 32, 64],
|
| 236 |
value=16,
|
| 237 |
label="Taille du batch",
|
| 238 |
)
|
| 239 |
+
|
| 240 |
epochs = gr.Slider(
|
| 241 |
+
minimum=1,
|
| 242 |
+
maximum=80,
|
| 243 |
+
value=30,
|
| 244 |
step=1,
|
| 245 |
label="Nombre d’époques",
|
| 246 |
)
|
| 247 |
+
|
| 248 |
+
fine_tune_mode = gr.Dropdown(
|
| 249 |
+
choices=["frozen", "layer4", "full"],
|
| 250 |
+
value="layer4",
|
| 251 |
+
label="Mode de fine-tuning",
|
| 252 |
+
info=(
|
| 253 |
+
"frozen = seul le classifieur est entraîné ; "
|
| 254 |
+
"layer4 = dernière partie du ResNet18 + classifieur ; "
|
| 255 |
+
"full = tout le réseau est ajusté."
|
| 256 |
+
),
|
| 257 |
)
|
| 258 |
+
|
| 259 |
model_tag = gr.Textbox(
|
| 260 |
label="Nom court du modèle",
|
| 261 |
+
placeholder="ex. charbon_resnet18_layer4",
|
| 262 |
)
|
| 263 |
|
| 264 |
train_btn = gr.Button("Lancer l’entraînement", variant="primary")
|
|
|
|
| 273 |
|
| 274 |
gr.Markdown("## Résultats sur le test set")
|
| 275 |
|
| 276 |
+
train_report = gr.Dataframe(
|
| 277 |
+
label="Rapport de classification",
|
| 278 |
+
interactive=False,
|
| 279 |
+
)
|
|
|
|
| 280 |
|
| 281 |
+
train_confusion_matrix = gr.Dataframe(
|
| 282 |
+
label="Matrice de confusion",
|
| 283 |
+
interactive=False,
|
| 284 |
+
)
|
|
|
|
| 285 |
|
| 286 |
+
train_confusion_matrix_image = gr.Image(
|
| 287 |
+
label="Matrice de confusion - figure",
|
| 288 |
+
type="filepath",
|
| 289 |
+
)
|
|
|
|
| 290 |
|
| 291 |
with gr.Tab("3. Tester et analyser un modèle"):
|
| 292 |
gr.Markdown("## Sélectionner un modèle sauvegardé")
|
|
|
|
| 298 |
value=initial_models[0] if initial_models else None,
|
| 299 |
label="Modèle sauvegardé",
|
| 300 |
)
|
| 301 |
+
|
| 302 |
refresh_btn = gr.Button("Actualiser la liste des modèles")
|
| 303 |
load_info_btn = gr.Button("Afficher les informations du modèle")
|
| 304 |
model_info = gr.JSON(label="Métadonnées du modèle")
|
| 305 |
|
| 306 |
with gr.Column():
|
| 307 |
+
evaluate_btn = gr.Button(
|
| 308 |
+
"Évaluer le modèle sur le test set",
|
| 309 |
+
variant="primary",
|
|
|
|
|
|
|
| 310 |
)
|
| 311 |
+
eval_summary = gr.JSON(label="Résumé des métriques")
|
| 312 |
|
| 313 |
+
eval_report = gr.Dataframe(
|
| 314 |
+
label="Rapport de classification",
|
| 315 |
+
interactive=False,
|
| 316 |
+
)
|
|
|
|
| 317 |
|
| 318 |
+
eval_confusion_matrix = gr.Dataframe(
|
| 319 |
+
label="Matrice de confusion",
|
| 320 |
+
interactive=False,
|
| 321 |
+
)
|
| 322 |
+
|
| 323 |
+
eval_confusion_matrix_image = gr.Image(
|
| 324 |
+
label="Matrice de confusion - figure",
|
| 325 |
+
type="filepath",
|
| 326 |
+
)
|
| 327 |
|
| 328 |
gr.Markdown("## Prédiction sur une image importée")
|
| 329 |
|
|
|
|
| 331 |
with gr.Column():
|
| 332 |
upload_image = gr.Image(type="pil", label="Importer une image")
|
| 333 |
predict_btn = gr.Button("Prédire la classe", variant="primary")
|
| 334 |
+
|
| 335 |
with gr.Column():
|
| 336 |
predict_text = gr.Textbox(label="Résultat de la prédiction", lines=7)
|
| 337 |
predict_probs = gr.Label(label="Probabilités par classe")
|
| 338 |
|
| 339 |
gr.Markdown("## Test sur un échantillon aléatoire du test set")
|
| 340 |
|
| 341 |
+
random_test_btn = gr.Button("Tester un échantillon aléatoire")
|
|
|
|
| 342 |
|
| 343 |
with gr.Row():
|
| 344 |
random_sample_image = gr.Image(type="pil", label="Image test aléatoire")
|
|
|
|
| 366 |
weight_decay,
|
| 367 |
batch_size,
|
| 368 |
epochs,
|
| 369 |
+
fine_tune_mode,
|
| 370 |
model_tag,
|
| 371 |
],
|
| 372 |
outputs=[
|
|
|
|
| 411 |
|
| 412 |
random_test_btn.click(
|
| 413 |
fn=test_random_sample_callback,
|
| 414 |
+
inputs=model_selector,
|
| 415 |
outputs=[random_sample_image, random_sample_text, random_sample_probs],
|
| 416 |
)
|
| 417 |
|