End of training
Browse files- README.md +13 -94
- all_results.json +4 -9
- eval_results.json +4 -5
- model.safetensors +1 -1
- runs/Jul09_09-27-05_gpu-1-161.local/events.out.tfevents.1720513783.gpu-1-161.local.14727.0 +3 -0
- training_args.bin +1 -1
README.md
CHANGED
@@ -15,16 +15,20 @@ should probably proofread and complete it, then remove this comment. -->
|
|
15 |
|
16 |
# segformer-finetuned-biofilm_MRCNNv1
|
17 |
|
18 |
-
This model is a fine-tuned version of [nvidia/mit-b0](https://huggingface.co/nvidia/mit-b0) on the heroza/
|
19 |
It achieves the following results on the evaluation set:
|
20 |
-
-
|
21 |
-
-
|
22 |
-
-
|
23 |
-
-
|
24 |
-
-
|
25 |
-
-
|
26 |
-
-
|
27 |
-
-
|
|
|
|
|
|
|
|
|
28 |
|
29 |
## Model description
|
30 |
|
@@ -51,91 +55,6 @@ The following hyperparameters were used during training:
|
|
51 |
- lr_scheduler_type: polynomial
|
52 |
- training_steps: 10000
|
53 |
|
54 |
-
### Training results
|
55 |
-
|
56 |
-
| Training Loss | Epoch | Step | Validation Loss | Mean Iou | Mean Accuracy | Overall Accuracy | Accuracy Background | Accuracy Biofilm | Iou Background | Iou Biofilm |
|
57 |
-
|:-------------:|:-----:|:-----:|:---------------:|:--------:|:-------------:|:----------------:|:-------------------:|:----------------:|:--------------:|:-----------:|
|
58 |
-
| 0.3228 | 1.0 | 128 | 0.0937 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
59 |
-
| 0.0951 | 2.0 | 256 | 0.0420 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
60 |
-
| 0.0409 | 3.0 | 384 | 0.0170 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
61 |
-
| 0.0147 | 4.0 | 512 | 0.0113 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
62 |
-
| 0.0107 | 5.0 | 640 | 0.0076 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
63 |
-
| 0.0073 | 6.0 | 768 | 0.0067 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
64 |
-
| 0.0057 | 7.0 | 896 | 0.0031 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
65 |
-
| 0.0039 | 8.0 | 1024 | 0.0028 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
66 |
-
| 0.0033 | 9.0 | 1152 | 0.0026 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
67 |
-
| 0.0026 | 10.0 | 1280 | 0.0023 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
68 |
-
| 0.0021 | 11.0 | 1408 | 0.0017 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
69 |
-
| 0.0019 | 12.0 | 1536 | 0.0017 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
70 |
-
| 0.0016 | 13.0 | 1664 | 0.0015 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
71 |
-
| 0.0013 | 14.0 | 1792 | 0.0012 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
72 |
-
| 0.0011 | 15.0 | 1920 | 0.0009 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
73 |
-
| 0.0009 | 16.0 | 2048 | 0.0007 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
74 |
-
| 0.001 | 17.0 | 2176 | 0.0008 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
75 |
-
| 0.0007 | 18.0 | 2304 | 0.0008 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
76 |
-
| 0.0007 | 19.0 | 2432 | 0.0007 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
77 |
-
| 0.0007 | 20.0 | 2560 | 0.0007 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
78 |
-
| 0.0007 | 21.0 | 2688 | 0.0004 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
79 |
-
| 0.0005 | 22.0 | 2816 | 0.0005 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
80 |
-
| 0.0004 | 23.0 | 2944 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
81 |
-
| 0.0004 | 24.0 | 3072 | 0.0005 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
82 |
-
| 0.0004 | 25.0 | 3200 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
83 |
-
| 0.0004 | 26.0 | 3328 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
84 |
-
| 0.0003 | 27.0 | 3456 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
85 |
-
| 0.0003 | 28.0 | 3584 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
86 |
-
| 0.0003 | 29.0 | 3712 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
87 |
-
| 0.0002 | 30.0 | 3840 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
88 |
-
| 0.0003 | 31.0 | 3968 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
89 |
-
| 0.0002 | 32.0 | 4096 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
90 |
-
| 0.0002 | 33.0 | 4224 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
91 |
-
| 0.0002 | 34.0 | 4352 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
92 |
-
| 0.0002 | 35.0 | 4480 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
93 |
-
| 0.0002 | 36.0 | 4608 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
94 |
-
| 0.0001 | 37.0 | 4736 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
95 |
-
| 0.0001 | 38.0 | 4864 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
96 |
-
| 0.0001 | 39.0 | 4992 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
97 |
-
| 0.0001 | 40.0 | 5120 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
98 |
-
| 0.0001 | 41.0 | 5248 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
99 |
-
| 0.0002 | 42.0 | 5376 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
100 |
-
| 0.0001 | 43.0 | 5504 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
101 |
-
| 0.0001 | 44.0 | 5632 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
102 |
-
| 0.0001 | 45.0 | 5760 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
103 |
-
| 0.0001 | 46.0 | 5888 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
104 |
-
| 0.0001 | 47.0 | 6016 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
105 |
-
| 0.0001 | 48.0 | 6144 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
106 |
-
| 0.0001 | 49.0 | 6272 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
107 |
-
| 0.0001 | 50.0 | 6400 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
108 |
-
| 0.0001 | 51.0 | 6528 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
109 |
-
| 0.0001 | 52.0 | 6656 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
110 |
-
| 0.0001 | 53.0 | 6784 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
111 |
-
| 0.0001 | 54.0 | 6912 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
112 |
-
| 0.0001 | 55.0 | 7040 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
113 |
-
| 0.0001 | 56.0 | 7168 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
114 |
-
| 0.0001 | 57.0 | 7296 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
115 |
-
| 0.0001 | 58.0 | 7424 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
116 |
-
| 0.0001 | 59.0 | 7552 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
117 |
-
| 0.0001 | 60.0 | 7680 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
118 |
-
| 0.0001 | 61.0 | 7808 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
119 |
-
| 0.0001 | 62.0 | 7936 | 0.0039 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
120 |
-
| 0.0003 | 63.0 | 8064 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
121 |
-
| 0.0001 | 64.0 | 8192 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
122 |
-
| 0.0001 | 65.0 | 8320 | 0.0000 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
123 |
-
| 0.0001 | 66.0 | 8448 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
124 |
-
| 0.0001 | 67.0 | 8576 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
125 |
-
| 0.0001 | 68.0 | 8704 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
126 |
-
| 0.0001 | 69.0 | 8832 | 0.0001 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
127 |
-
| 0.0001 | 70.0 | 8960 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
128 |
-
| 0.0001 | 71.0 | 9088 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
129 |
-
| 0.0001 | 72.0 | 9216 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
130 |
-
| 0.0001 | 73.0 | 9344 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
131 |
-
| 0.0001 | 74.0 | 9472 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
132 |
-
| 0.0001 | 75.0 | 9600 | 0.0002 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
133 |
-
| 0.0001 | 76.0 | 9728 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
134 |
-
| 0.0001 | 77.0 | 9856 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
135 |
-
| 0.0001 | 78.0 | 9984 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
136 |
-
| 0.0001 | 78.12 | 10000 | 0.0003 | 0.0 | nan | nan | nan | nan | 0.0 | 0.0 |
|
137 |
-
|
138 |
-
|
139 |
### Framework versions
|
140 |
|
141 |
- Transformers 4.38.0.dev0
|
|
|
15 |
|
16 |
# segformer-finetuned-biofilm_MRCNNv1
|
17 |
|
18 |
+
This model is a fine-tuned version of [nvidia/mit-b0](https://huggingface.co/nvidia/mit-b0) on the heroza/biofilm_MRCNNv1_validation dataset.
|
19 |
It achieves the following results on the evaluation set:
|
20 |
+
- eval_loss: 0.7031
|
21 |
+
- eval_mean_iou: 0.0
|
22 |
+
- eval_mean_accuracy: nan
|
23 |
+
- eval_overall_accuracy: nan
|
24 |
+
- eval_accuracy_background: nan
|
25 |
+
- eval_accuracy_biofilm: nan
|
26 |
+
- eval_iou_background: 0.0
|
27 |
+
- eval_iou_biofilm: 0.0
|
28 |
+
- eval_runtime: 144.7654
|
29 |
+
- eval_samples_per_second: 8.794
|
30 |
+
- eval_steps_per_second: 1.105
|
31 |
+
- step: 0
|
32 |
|
33 |
## Model description
|
34 |
|
|
|
55 |
- lr_scheduler_type: polynomial
|
56 |
- training_steps: 10000
|
57 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
58 |
### Framework versions
|
59 |
|
60 |
- Transformers 4.38.0.dev0
|
all_results.json
CHANGED
@@ -1,18 +1,13 @@
|
|
1 |
{
|
2 |
-
"epoch": 78.12,
|
3 |
"eval_accuracy_background": NaN,
|
4 |
"eval_accuracy_biofilm": NaN,
|
5 |
"eval_iou_background": 0.0,
|
6 |
"eval_iou_biofilm": 0.0,
|
7 |
-
"eval_loss": 0.
|
8 |
"eval_mean_accuracy": NaN,
|
9 |
"eval_mean_iou": 0.0,
|
10 |
"eval_overall_accuracy": NaN,
|
11 |
-
"eval_runtime":
|
12 |
-
"eval_samples_per_second":
|
13 |
-
"eval_steps_per_second": 1.
|
14 |
-
"train_loss": 0.005610336132813245,
|
15 |
-
"train_runtime": 9371.2884,
|
16 |
-
"train_samples_per_second": 8.537,
|
17 |
-
"train_steps_per_second": 1.067
|
18 |
}
|
|
|
1 |
{
|
|
|
2 |
"eval_accuracy_background": NaN,
|
3 |
"eval_accuracy_biofilm": NaN,
|
4 |
"eval_iou_background": 0.0,
|
5 |
"eval_iou_biofilm": 0.0,
|
6 |
+
"eval_loss": 0.7031151056289673,
|
7 |
"eval_mean_accuracy": NaN,
|
8 |
"eval_mean_iou": 0.0,
|
9 |
"eval_overall_accuracy": NaN,
|
10 |
+
"eval_runtime": 144.7654,
|
11 |
+
"eval_samples_per_second": 8.794,
|
12 |
+
"eval_steps_per_second": 1.105
|
|
|
|
|
|
|
|
|
13 |
}
|
eval_results.json
CHANGED
@@ -1,14 +1,13 @@
|
|
1 |
{
|
2 |
-
"epoch": 78.12,
|
3 |
"eval_accuracy_background": NaN,
|
4 |
"eval_accuracy_biofilm": NaN,
|
5 |
"eval_iou_background": 0.0,
|
6 |
"eval_iou_biofilm": 0.0,
|
7 |
-
"eval_loss": 0.
|
8 |
"eval_mean_accuracy": NaN,
|
9 |
"eval_mean_iou": 0.0,
|
10 |
"eval_overall_accuracy": NaN,
|
11 |
-
"eval_runtime":
|
12 |
-
"eval_samples_per_second":
|
13 |
-
"eval_steps_per_second": 1.
|
14 |
}
|
|
|
1 |
{
|
|
|
2 |
"eval_accuracy_background": NaN,
|
3 |
"eval_accuracy_biofilm": NaN,
|
4 |
"eval_iou_background": 0.0,
|
5 |
"eval_iou_biofilm": 0.0,
|
6 |
+
"eval_loss": 0.7031151056289673,
|
7 |
"eval_mean_accuracy": NaN,
|
8 |
"eval_mean_iou": 0.0,
|
9 |
"eval_overall_accuracy": NaN,
|
10 |
+
"eval_runtime": 144.7654,
|
11 |
+
"eval_samples_per_second": 8.794,
|
12 |
+
"eval_steps_per_second": 1.105
|
13 |
}
|
model.safetensors
CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
-
oid sha256:
|
3 |
size 14884776
|
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:cb09d06c093e3554312be844df33cd6d39319e3fabe30d943e3f7091d1f3b8bf
|
3 |
size 14884776
|
runs/Jul09_09-27-05_gpu-1-161.local/events.out.tfevents.1720513783.gpu-1-161.local.14727.0
ADDED
@@ -0,0 +1,3 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:e7de31ce042e30dbd73279897455fa83bc56535153a17e55bf7debf1b869f4a6
|
3 |
+
size 681
|
training_args.bin
CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
-
oid sha256:
|
3 |
size 4411
|
|
|
1 |
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:d8eefbb2fad228b7ed7de5aa7263b3db88f4432bce4eb8cfef1cf4c0db6ba48c
|
3 |
size 4411
|