Recentemente na Historia desta federacao a Policia Militar do Estado de Goias, sofreu operacoes de outras instituicoes, Ministerio Publico, Policia Federal, Policia Civil, segundo elas legitimas, em cumprimento de prisoes por crimes como homicidios, etc. em consequencia destas operacoes, policiais militares, entre eles oficias, foram presos e transferidos, em fase de investigacao, para prisao de seguranca maxima no estado do Mato Grosso do Sul.Imperioso relembrar que em uma destas operacoes 07 (sete) Policiais Militares foram presos e transferidos para a Prisao de seguranca maxima em Mato Grosso do Sul no ano de 2008. Estes Policiais ficaram presos por 03 anos naquela unidade de seguranca maxima. Em 2011 o Juri Popular absolveu por unanimidade 05 deles, por falta de prova.Outro ataque as prerrogativas dos Policiais Militares ocorreu com a Operacao Sexto Mandamento quando foram cumpridos 19 mandados de prisao preventiva e oito mandados de prisao temporaria, bem como mandados de busca e apreensao. Cumpre salientar que os Policiais ja respondiam a processos em relacao aquelas condutas (juiz natural) e a operacao sexto mandamento as tratou como fato novo.O ex-subcomandante da corporacao em Goias na epoca foi preso e passou sete meses detido no Complexo Prisional de Campo Grande (MS), penitenciaria para onde foram levados outros 16 detidos na operacao da PF. A repercussao da prisao do segundo homem na hierarquia da instituicao e de varios outros policiais causou prejuizo moral irreparavel a Corporacao. O desfecho da operacao pode ser observado na noticia datada de 18/set/2012 no site do TJGC) afirma que: Juiz absolve 17 acusados da Operacao Sexto Mandamento. A informacao e que o Douto Juiz Fernando Cesar Rodrigues Salgado, da 2a Vara Criminal de Rio Verde, absolveu 17 dos acusados da operacao Sexto Mandamento, deflagrada pelo Ministerio Publico estadual (MP-GO). Para o magistrado, o MP-GO nao conseguiu provar que os policiais capturaram e mataram deliberadamente as vitimas. Pelo contrario, a prova inquisitorial e a sindicancia, os laudos de exames cadavericos, assim como as declaracoes dos proprios acusados e das testemunhas inquiridas em juizo, formam conjunto probatorio que demonstra, de forma irrefutavel, que os acusados, na qualidade de policiais militares, agiram no exercicio do dever legal, nao existindo duvidas a esse respeito, (grifo nosso) ressaltou. Neste caso os policiais militares foram absolvidos, porem eternamente conspurcados. Sem se incomodar em macular mais uma vez a imagem desta instituicao, e em evidente afronta aos Direitos e Prerrogativas dos Policiais Militares, em seis meses de atuacao em Rio Verde, no sudoeste de Goias, a Forca Nacional de Seguranca concluiu 30 dos 43 inqueritos repassados a equipe. Ao todo, 19 pessoas foram presas, dentre elas 09 policiais militares.O Delegado da Forca Nacional encarregado de Inquerito Rio Verde, ainda requisitou a transferencia um Soldado lotado no 2 BPM para o presidio de seguranca maxima do MS, mais uma vez, ainda em fase de inquerito, Policial Militar sofre violacao de suas prerrogativas. As argumentacoes para requerer a transferencia seria a fragilidade no sistema de seguranca do presidio militar do Batalhao Anhanguera, em Goiania. O que curiosamente nao se explica e que em 2011 o Centro de Custodia da Policia