o abandono da cidade de Auburn serem detectados em regioes adjascentes. Apos uma nova analise do laboratorio Origin, detecta-se que a sincronia entre Fettel e Alma ocorreu novamente.Harlan Wade imediatamente convoca uma forca tarefa para investigar estas anomalias. Ele envia um cientista, Bill Moody, para a Estacao de Tratamento do Rio Sul, para estudar os niveis de contaminacao da agua subterranea. Ele atribui a sua outra filha, Alice Wade, e um rapaz chamado Aldus Bishop, a funcao de colher informacoes dos ultimos 20 anos de Auburn. Ele tambem concede a Chuck Habbeger e Marshall Disler a funcao de monitorar o programa Perseus, que e focado no treinamento dos soldados Replica e capitaes psiquicos. Outros membros da forca-tarefa incluiam Iain Hives um supervisor com conhecimento em ciencia e Norton Mapes, um engenheiro de software e expert tecnico.Um pouco mais tarde, Fettel tem uma visao da jovem Alma, que pede para que ele a encontre e liberte-a. Ele provoca uma rebeliao na base do projeto Perseus e leva consigo cerca de 1.000 soldados Replica fortemente armados, veiculos e equipamentos e que eram comandados por Fettel atraves de telepatia.Entao, Fettel interroga Chuck Habbeger, seu metodo de perguntar e comendo sua carne viva, acreditando que assim ele pode obter as respostas atraves de seu sentido. Habbeger diz nao saber quem Alma e, mas diz conhecer outras pessoas que poderiam guia-lo ate ela. Fettel entao ordena que seus soldados capturem tais pessoas, acreditando que elas poderiam leva-lo a Alma.Apos encontrar Habbeger comido vivo, Genevieve Aristide envia um relatorio ao senado norte-americano, mas insiste que a crise pode ser resolvida discretamente, eliminando Fettel, pois assim os soldados nao teriam comandos psiquicos, e cessariam atividades. O senador entao contacta a F.E.A.R. e a SFOD e lhes da acesso a sistemas de localizacao high-tech, para que encontrem e eliminem Fettel e seus soldados. Inicio do jogoO game comeca com Fettel tomando o comando de um batalhao de soldados Replica que destroem a matriz da ATC. As cameras mostram Fettel canibalizando suas vitimas.O jogador e apresentado como point man para a equipe da F.E.A.R., uma organizacao governamental secreta especializada em lidar com ameacas paranormais. O coordenador da equipe, Rowdy Betters, lhe apresenta os outros membros do time, Spen Jankowski e Jin Sun-Know. A equipe recebe a ordem de eliminar Fettel. Como uma medida de seguranca, a ATC implantou em todos os soldados Replica um dispositivo de rastreamento, assim a equipe foi capaz de seguir os passos de Fettel atraves do satelite espiao HANNIBAL-3.A busca por Paxton Fettel comeca em um predio abandonado em Auburn. Enquanto procura por pistas, voce acaba sendo atacado por Fettel e, antes de perder a consciencia escuta ele dizer uma enigmatica frase: Todos eles merecem morrer.O sinal de Fettel e perdido, no entanto, voce e o esquadrao SFOD-D sao enviados para investigar um grupo de soldados Replica no porto Sullivan e laboratorio de analise. A equipe SFOD-D e misteriosamente massacrada e voce e quase morto numa explosao provocada pela aparicao de uma garotinha de vestido vermelho: Alma Wade.A busca por Fettel continua na estacao de tratamento do