complexa do mar de Sargacos, Venter fez coletas que geraram estudos de metatranscriptomica em diferentes profundidades em seu ambiente de estudo. Assim, haviam informacoes sobre bacterias coletadas na superficie e em cinco profundidades abaixo da superficie. O que Bork fez foi entao jogar todos os genes expressos obtidos nessas cinco profundidades e mapea-los para vias bioquimicas (fornecidas pelo sitio japones KEGG, a enciclopedia Kyoto para genes e genomas). O pesquisador observou, de forma interessante e inedita, que as bacterias presentes na superficie do mar expressavam mais genes relacionados a via de fotossintese enquanto mais para o fundo, genes diversos eram expressos. Embora a posteriori seja obvio supor que, devido a maior presenca de luz haveriam mais genes de vias biossinteticas de bacterias fotossintetizantes sendo expressas na superficie do mar, ninguem havia evidencias reais desses dados antes. Acredito tambem que este tipo de estudo abre caminho para novas questoes biologicas onde os organismos presentes em determinado ambiente nao sao importantes para observarmos caracteristicas do mesmo; mas torna-se importante apenas saber quais genes sao expressos num determinado ambiente, a despeito dos organismos que os transcrevem (como parece ter sido analisado por Gianoulis et al., 2009). Assim, neste mundo comandado por genes e proteinas, mesmo a ideia organismos deixa de ser relevante e e possivel vislumbrar um mundo dawkiniano onde a verificacao de genes expressos seja a principal forma de compreensao da forma de operacao de um determinado ambiente; sem que seja necessario identificar os organismos que os expressam. Peer Bork foi pioneiro neste tipo de estudo e neste trabalho pretendemos, a luz de seus desenvolvimentos, desenvolver ferramentas que facilitem a analise e interpretacao de dados em metatranscriptomica para a compreensao basica do metabolismo associado a determinado ambiente de forma organismo-independente.Finalmente, vale notar que a metagenomica recentemente teve e tem tido um papel importante na validacao experimental e cientifica dos novos metodos de sequenciamento em larga-escala (NGS). Enquanto ainda muitos duvidavam da eficiencia das novas plataformas de sequenciamento genomico -- pricipalmente produzidas pela maquina sequenciadora da empresa 454 Life Sciences, lancado em 2005 -- muitos pesquisadores em metagenomica apostaram nos bonus dessas novas metodologias ao inves de enfatizarem o onus de terem sequencias de DNA de tamanho menor ou analises de dados mais complexas. Ja no ano seguinte a publicacao original de Margulies ee colaboradores (2005) mostrando a eficiencia da tecnica 454 em sequenciar genomas bacterianos, em 2006 novos trabalhos publicados principalmente na area da genomica ambiental demonstravam a versatilidade e eficacia da nova tecnica de sequenciamento ao amostrar a diversidade microbiana observada em uma mina (Edwards et al, 2006) ou nas profundezas do mar (Sogin et al., 2006), alem de genomas virais observados em oceanos (Angly et al., 2006). Alem disso, ao longo dos ultimos anos, a tecnologia de pirosequenciamento ou de sequenciamento por sintese tem evoluido e a cada dia que passa o tamanho medio das sequencias NGS tem alcancado o tamanho medio conseguido por reads baseados na tecnica de Sanger. A influencia, portanto, destes pesquisadores inovadores da area da metagenomica tem ajudado a melhorar a tecnica NGS e valida-la atraves de interessantes