Apos Machete (Danny Trejo) se envolver com um traficante de drogas , ele aceita uma oferta para cometer um assassinato. O Dr. Benz (Jeff Fahey) contrata o assassino para matar um senador corrupto (Robert De Niro). Para a missao, Machete conta com a ajuda de Luz (Robert Rodriguez), Padre (Chech Marin) e April (Lindsay Lohan), uma socialite que possui habilidade com armas. Enquanto se prepara, ele e perseguido pela agente Sartana (Jessica Alba). Estranhas mortes comecam a ocorrer num mosteiro beneditino localizado numa fortaleza, na Italia durante a baixa idade media. As vitimas aparecem sempre com um traco em comum, os dedos e a lingua roxos. O mosteiro guarda uma imensa biblioteca escondida dentro de uma especie de labirinto, onde so uns poucos monges escolhidos, tem acesso as publicacoes sacras e profanas. A intencao e ocultar o conhecimento ate da maioria dos monges, com a finalidade de manter o poderio da igreja catolia sobre todo o povo. A chegada de um monge franciscano (Sean Conery), incumbido de investigar os casos, apos um exaustivo trabalho, ira descobrir o verdadeiro motivo dos crimes, resultando na instalacao do tribunal da santa inquisicao.Em 1327 Willian de Baskerville, um monge franciscano e Adson Von Melk, um novico que o acompanha, chegam ao remoto mosteiro no norte da Italia. Willian de Baskerville pretende participar de um conclave para decidir se a igreja deve doar parte de suas riquezas, mas sua atencao e desviada por varios assassinatos que ocorreram recentemente no mosteiro. Willian de Baskerville comeca a investigar os casos, o problema se mostra bastante complexo. Alem disso, os mais religiosos acreditam que e obra do Demonio. Willian de Baskerville nao acredita nisso, mas antes que ele conclua as investigacoes, um novo personagem chega ao mosteiro.Bernardo Gui, o Grao-inquisitor, chega ao local e esta pronto para torturar qualquer pessoa, suspeita de heresia, que tenha cometido assassinatos em nome do Diabo. Considerando que Bernardo Gui nao gosta de Baskerville, ele e inclinado a coloca-lo encabecando a lista dos que sao diabolicamente influenciados. Fica bem claro a rivalidade entre os dois. Esta batalha, junto com uma guerra ideologica entre franciscanos e dominicanos, e travada enquanto o motivo dos assassinatos esta sendo investigado.Linguagem epica e citacoes teologicas, conflitos dos movimentos hereticos, luta contra a mistificacao da fe e o poder, sao elementos trabalhados pelo filme. Elza Baskin desempenha o unico papel feminino do filme que mostra tambem um pouco da violencia sexual ocorrida na epoca. O Nome da Rosa ainda alude a questao das mulheres se sujeitarem ao sexo em troca de comida. Em outro aspecto aborda a sensualidade de uma mulher em um intenso e curto romance da personagem e o novico Adson Von Melk, que acompanha o monge franciscano Willian de Baskerville.O humanista racionalista monge Willian de Baskerville consegue ao longo do filme ajudar seu seguidor, o jovem Adson Von Melk, em sua evolucao progressiva de conhecimentos. Estao sempre proximos e juntos descobrem a biblioteca do mosteiro, em busca do saber. Ao entrarem o monge se regozija de prazer, em ver tamanha obra de construcao, ou seja, o labirinto, com