O sistema de governo presbiteriano significa que somos governados pelos presbiteros. Nao somos congregacionais (onde todos decidem pelo voto direto), nem episcopais (onde apenas um superior decide sobre os demais). Somos uma igreja regida representativamente pelos presbiteros escolhidos pela igreja local sob a autoridade da Escritura Sagrada.Segue abaixo os principios do nosso sistema de governo:[1]1. Cristo e a cabeca da sua Igreja e a fonte de toda a sua autoridade. 2. Esta autoridade encontra-se escrita na Escritura Sagrada, de modo que, todos tem acesso ao seu conhecimento.3. Todos os crentes devem estar unidos entre si e ligados diretamente a Cristo, assim como os diversos membros de um corpo, que se subordinam a direcao da cabeca.4. Cristo exerce a sua autoridade em sua Igreja, por meio da Palavra de Deus e do seu Espirito.5. O proprio Cristo determinou a natureza do governo de sua Igreja.6. Cristo dotou tanto a membros comuns como aos oficiais da sua Igreja com autoridade, sendo que os oficiais receberam adicional autoridade, por meio da ordenacao, como e requisito para realizacao dos seus respectivos deveres.7. Cristo estabeleceu apostolos para estabelecimento do seu fundamento, entretanto, eram de carater transitorio. O oficio de apostolo cessou, mas a sua autoridade e preservada pelos seus escritos, isto e, o Novo Testamento.8. Cristo providenciou para o especifico exercicio da autoridade por meio de representantes (os presbiteros docentes e regentes), a quem separou para a preservacao da doutrina, adoracao e disciplina na Igreja.9. O oficio de presbitero e o termo bispo [supervisor] possuem o mesmo significado.10. Os presbiteros tem a responsabilidade permanente de pastorear a Igreja de Cristo.11. A pluralidade de presbiteros numa igreja local e a lideranca normativa ate a segunda vinda de Cristo.12. Em cada igreja local precisa possuir uma pluralidade de diaconos, auxiliando os presbiteros, e exercendo o ministerio da misericordia.13. A selecao dos homens deve obedecer a prescricao divina da qualificacao dos oficiais (1 Tm 3:1-13 e Tt 1:5-9).14. A admissao ao oficio deve ser pela ordenacao, com oracao e imposicao de maos dos presbiteros.15. A forma de administracao em cada congregacao e pela representacao dos presbiteros eleitos pela igreja local.16. Em casos de dificuldades na igreja local quanto a doutrina, disciplina, culto e governo sao resolvidas administrativamente pela consulta ou intervencao dos concilios superiores. Os concilios superiores deverao se guiar pela autoridade final da Escritura Sagrada para promover a pureza e unidade na verdade, a fim de que a Igreja Visivel testemunhe a nossa comunhao com o nosso Cabeca, o Senhor Jesus Cristo, e o mundo saiba que somos um.Em suma, o nosso sistema de governo e formado pela pluralidade de presbiteros. Isto significa que a igreja e governada por um concilio de presbiteros, e nao por um homem ou por toda a comunidade. Por isso, o nosso sistema de governo tambem e chamado de conciliar, ou seja, ele possui uma estrutura formada de concilios menores, que federados formam concilios superiores. Todos os presbiteros tem a mesma autoridade em reuniao de conselho. Os pastores, que sao presbiteros docentes, em discussao e voto possuem igual poder de decisao que os demais