seus materiais suplementares. Os autores afirmam um percentual de substituicoes de nucleotideos de 1.44% em areas alinhadas, mas nao ofereceram nada que incluisse os indels. Enquanto esses foram omitidos da das semelhancas no alinhamento, os autores indicam que haviam 82.000 deles e proveram um histograma que mostra graficamente tamanho da distribuicao baseados em dados agrupados. Estranhamente, nenhum dado sobre o tamanho medio dos indels foi provido. Da mesma forma, foi dado o numero de lacunas da sequencia, mas nada sobre o tamanho acumulado destas. Baseados nos limitados e incompletos dados oferecidos, podemos estimar uma semelhanca genomica entre 80% a 85%.Um dos estudos mais ambiguos foi publicado por Nielson et al. Mantendo a inclinacao a ofuscante metodologia, apenas exons altamente alinhaveis foram utilizados e nenhum dado foi provido que permitisse um calculo real da similaridade total. DO total inicial de sequencias na analise (20.361) os pesquisadores acabaram deixando de lado 33% (6.630) em um ambigua afirmacao de controle de qualidade altamente conservativo. EM outras palavras, 1/3 dos dados geneticos primatas iniciais nao alinhavam aos dos humanos, sendo entao eliminados. De fato, nenhum substancial dado foi concedido para pelo menos avaliar os 2/3 finais que foram comparados. Os autores apenam reportam sobre a divergencias de sequencias substituidas entre as areas silenciosas. Essas sao areas onde os dados foram descartados, representando locais onde variacao genetica supostamente representa pouca ou nenhuma funcao no genoma. Nos ja vimos que mesmo areas nao codificadoras sao funcionalmente ativas. Dados sobre diferencas nos indels foram completamente omitidas._______________________________________________A publicacao mais marcante sobre comparacoes dos genomas foi o artigo da Nature de 2005 sobre o International Chimpanzee Genome Sequencing Consortium. Infelizmente, este trabalho seguiu a tendencia previamente estabelecida, onde a maioria dos dados comparativos foi dado em um formato altamente seletivo e ofuscado e informacoes detalhadas sobre os alinhamentos estavam ausentes. A maior parte do papel era principalmente preocupado com uma variedade de analises evolutivas hipoteticas para varias taxas de divergencia e as forcas selectivas. Assim, a questao critica da semelhanca geral foi cuidadosamente evitada. Contudo, com base nos numeros fornecidos no artigo, pode-se determinar uma grosseira semelhanca geral do genomas, incluindo informacoes simultaneas publicadas a partir do projeto genoma humano. No que diz respeito ao alinhamento geral, os autores declaram Os melhores alinhamentos de a nivel de nucleotideos reciprocos dos genomas de chimpanzes e humanos cobrem ~ 2,4 gigabases(GB) de sequencia de alta qualidade. A esta altura, a montagem eucromatica humana foi calculada em 99% completa em 2.85 Gb e teve uma taxa de erro de 1 em cada 100.000 bases. O autores do genoma chimp afirmam: As diferencas nos indels entre os genomas compoes total de ~ 90 MB. Diferenca que corresponde a ~3% de ambos genomas, e que sobrepuja os 1.23% de diferenca resultantes das substituicoes nos nucleotideos.Em suma, apenas 2.3 Gb da sequencia chimp alinhou-se no altamente apurado e completo genoma humano (2.85 Gb), uma operacao que incluiu o mascaramento de sequencias de baixa complexidade. Sobre a sequencia primata que alinhou-se, os dados para substituicoes e indels indaca uma semelhanca de 95.8%, uma figura distorcida que exclui as