parte do seculo passado e especialmente desde a descoberta do DNA como molecula que carrega informacoes fisicas hereditarias , as mutacoes foram o conceito dominante da evolucao neodarwinista tido como o gerador central de informacoes novas e uteis. Assim, as mutacoes, se fossem selecionadas naturalmente, teriam o poder de conduzir a evolucao de todas as coisas vivas na direcao da melhoria positiva.As moscas da fruta, com seu tempo curto de uma geracao a outra e apenas quatro pares de cromossomos, representaram excelente campo de testes para a evolucao. Em laboratorios de todo o mundo, elas foram submetidas a todo tipo de mutacao, induzindo fenomenos, incluindo produtos quimicos e tratamentos de radiacao, para tentar acelerar as mutacoes na tentativa de imitar a evolucao. Depois de tudo isso, era de se esperar que as moscas da fruta de fato exemplificassem a evolucao. Mas eles nao fizeram isso.Assim, nao tendo conseguido a progressao evolutiva em moscas da fruta por esses meios aleatorios, os pesquisadores mudaram o foco de inumeras pesquisas para a manipulacao intencional dos genes. As mais populares, a partir de uma perspectiva evolucionista, foram as experiencias com os genes chamados HOX.HOX (uma abreviacao de Homeobox) sao genes utilizados pelo organismo durante o desenvolvimento embrionario. Muitos argumentaram que seria mais simples para a evolucao operar atraves da mutacao desses genes, uma vez que uma pequena alteracao pode produzir grande efeito no corpo da mosca. No entanto, isso foi antes de os estudos recentes mostrarem que o desenvolvimento embrionario e mais influenciado pelo DNA regulador, e nao por genes. E mutacoes (atraves da substituicao, exclusao ou duplicacao) de genes de desenvolvimento como o HOX sempre resultaram apenas em moscas mortas, moscas normais (se a mutacao aconteceu sem ter nenhum efeito notavel) ou em pequenos monstros. Nenhum desses resultados corresponde a melhoria positiva esperada da evolucao darwiniana.Segmentos corporais extras, um conjunto extra de asas ou pernas no lugar das antenas caracterizam as formas estranhas que foram geradas. Tres geracoes de alteracoes especificas no DNA produziram moscas com quatro asas mas elas nao conseguiram voar. As asas extras nao tinham musculos e representaram peso morto. Stephen Meyer conclui: Moscas mutantes que produzem quatro asas sobrevivem hoje apenas em um ambiente cuidadosamente controlado e somente quando pesquisadores qualificados meticulosamente orientam seus estudos por meio de um estagio nao-funcional apos o outro. Essa experiencia cuidadosamente controlada nao nos diz muito sobre o que mutacoes nao direcionais podem produzir na natureza (Stephen C. Meyer, Explore Evolution: The Arguments for and Against Neo-Darwinism, p. 105).Em seu livro Evolution, Colin Patterson resumiu a esperanca perdida de encontrar a evolucao nas pesquisas com o HOX: Os efeitos espetaculares das mutacoes do gene homeobox foram vistos pela primeira vez na Drosophila, no inicio da historia da genetica. Portadoras de algumas dessas mutacoes com certeza podem ser qualificadas como monstros embora sem muita esperanca (Colin Patterson, Evolution, p. 114).Considerando que os estudos com as moscas da fruta tem fornecido informacoes importantes sobre como genes, nervos, longevidade e outras maquinas e processos biologicos funcionam, nenhum progresso foi feito na tentativa de acelerar a evolucao desses insetos