eficacia do seu metodo ao sequenciar o genoma do organismo modelo mais classico da genetica: a mosca-das-frutas (Drosophila melanogaster) [3]. A tabela 2 do paper que descreve o genoma da mosca-das-frutas [2]. A tabela mostra o tamanho das 3 bibliotecas produzidar e o numero de clones sequenciados. O sequenciamento de extremidades de clones contendo grandes insertos facilita a posterior montagem dos segmentos atraves de tecnicas de bioinformatica.O segredo que Venter encontrou para sequenciar genomas grandes era, ao inves de realizar o chamado whole-genome shotgun -- onde o genoma era todo partido em pedacos do mesmo tamanho e sequenciados a partir de primers localizados no vetor de clonagem -- usar uma estrategia similar. Entao, ao inves de clonar todos os fragmentos do mesmo tamanho, Venter clonou fragmentos de tamanhos diferentes e seu braco direito Mark Adams, criou programas de bioinformatica capazes de levar em consideracao diferentes tamanhos de fragmentos entre duas sequencias de forma a montar o genoma com eficacia.Com a publicacao do genoma de Drosophila, Venter mostrou que tinha know-how para produzir genomas ainda maiores e mais complexos, como o genoma humano. De fato, o rascunho do genoma humano foi publicado em 2001 numa publicacao conjunta dos dados publicos (na Nature) e dos dados da Celera (publicados na Science)..: Mated-pairs X Paired-ends :.A ideia de produzir entao bibliotecas genomicas de diferentes tamanhos e sequenciar extremidades de insertos inseridos nestas bibliotecas para depois monta-los -- esperando que insertos de diferentes clones se sobreponham -- parece ter vindo da aventura de Venter et al. (2000) ao sequenciar o genoma de Drosophila, mostrando ao mundo que o caminho estava aberto para a sequencia completa do genoma humano. De fato, a estrategia era bastante logica e elegante; e a montagem do genoma parece ter sido mais facil do que se supunha anteriormente.O conceito dos mated-pairs ou pair-ends, portanto, tem a ver com o fato de que gera-se fragmentos (insertos) de bibliotecas genomicas com diferentes tamanhos e assim sequencia-se-os de um lado e do outro. Na figura mostrada, vemos que para montar o genoma de drosofila, Venter utilizou tres bibliotecas e sequenciou clones da extremidade de insertos contendo 2Kb, 10Kb e 130Kb. A ideia embutida neste processo esta relacionada ao fato de que existem repeticoes nos genomas de eucariotos e as vezes convem ter uma sequencia cuja distancia de uma primeira e conhecida; assim, no caso desta primeira mapear em uma regiao de repeticao, seria agora possivel ancorar a sequencia do outro lado do clone em algum lugar conhecido e de copia unica no genoma. Como tambem o sequenciamento dos reads acontece de forma aleatoria com relacao a posicao deles no genoma, a utilizacao de bibliotecas de diferentes tamanho pode funcionar como um controle positivo do estudo, garantindo que sequencias montadas em 2Kb estao a 10Kb quando observadas aquelas oriundas da segunda biblioteca. De fato, esta e uma tecnica elegante e eficiente para facilitar a montagem do genoma. E claro, entretanto, que ela necessita de algoritmos mais elaborados de montagem genomica. Adams certamente nao deixa por menos.Hoje em dia existem diversos programas que montam genomas baseando em