Cicero a diocese formou uma comissao de padres e profissionais da area da saude para investigar o suposto milagre. A comissao tinha como presidente o padre Clicerio da Costa e como secretario o padre Francisco Ferreira Antero, contava, ainda, com a participacao dos medicos Marcos Rodrigues Madeira e Ildefonso Correia Lima, alem do farmaceutico Joaquim Secundo Chaves. Em 13 de outubro de 1891, a comissao encerrou as pesquisas e chegou a conclusao de que nao havia explicacao natural para os fatos ocorridos, sendo portanto um milagre.Insatisfeito com o parecer da comissao, o bispo Dom Joaquim Jose Vieira nomeou uma nova comissao para investigar o caso, tendo como presidente o padre Alexandrino de Alencar e como secretario o padre Manoel Candido. A segunda comissao concluiu que nao houve milagre, mas sim um embuste.Dom Joaquim se posicionou favoravel ao segundo parecer e, com base no mesmo, suspendeu as ordens sacerdotais de padre Cicero e determinou que Maria de Araujo fosse enclausurada.01.03.1889: Primeira transformacao da hostia em sangue na boca da beata Maria de Araujo.07/07/1889: Primeira romaria ao Juazeiro, organizada pelo vigario de Crato, monsenhor Francisco Monteiro, que anunciou o milagre para tres mil pessoas na igreja de Nossa Senhoras das Dores, deixando Padre Cicero contrariado.19.08.1889: Maria de Araujo disse que Jesus lhe havia aparecido na capela de Nossa Senhora das Dores. Padre Cicero deu a comunhao a Maria de Araujo, em cuja boca a hostia se transformou em sangue.21.08.1889: Na missa celebrada pelo Padre Cicero, Jesus teria dito a Maria de Araujo que faria de Juazeiro porta do ceu "para os puros e os justos". Mons. Monteiro declarou que Maria de Araujo era santa.04.11.1889: O bispo do Ceara, Dom Joaquim Jose Vieira, pediu ao Padre Cicero explicacoes sobre os fatos de Maria de Araujo.07.01.1890: O Padre Cicero respondeu ao bispo sobre os fenomenos verificados em Maria de Araujo.27.04.1890: O Padre Sother teria dado crucifixo de bronze a Maria de Araujo para ela rezar, e o crucifixo sangrou. (Ver 27.09.1891.)26.03.1891: O Medico Marcos Rodrigues Madeira fez exame da hostia em sangue e na forma de coracao naboca da beata Maria de Araujo.29.04.1891: Em rede, a beata Maria de Araujo estava em sangue e com as feridas de Jesus no corpo.15.05.1891: O juiz de direito de Barbalha, Joao Firmino de Holanda, veio ver uma transformacao da hostia.19.07.1891: Comissao de inquerito (Padre Clycerio da Costa Lobo e Padre Francisco Ferreira Antero) constituida por Dom Joaquim Jose Vieira para verificar os fatos em Juazeiro.09.09.1891: Maria de Araujo e mais 19 testemunhas foram ouvidas pela Comissao.10.09.1891: Na igreja. Padre Clycerio convocou 23 testemunhas (padres, leigos) da comunhao reservada a Maria de Araujo. Tres comunhoes. Tres transformacoes da hostia em sangue.10.09.1891: Na casa do Padre Cicero. A beata Maria de Araujo estava em rede, e o corpo sangrava.11.09.1891: A hostia transformou-se em sangue.12.09.1891: A hostia transformou-se em carne viva.24.09.1891: O Padre Clycerio deu a comunhao a Maria de Araujo. A hostia sangrou.Os medicos Ignacio de Sousa Dias e Marcos Rodrigues Madeira deram atestado do fato como sobrenatural.27.09.1891: O Padre Quintino (de Crato) mostrou-se propenso a acreditar nos fenomenos como milagres.