Sem a pretensao deabordar de forma sistematica e metodologica a questaoepistemologica da ciencia, este texto trata de alguns pontossimples - de certo direcionados a um leigo -, porem essenciais no que diz respeito a forma como quequalquer interessado deve compreender a ciencia. Mesmo nao tocandonos fundamentos do metodo cientifico ou na complexa relacao entreo observador e a materia, acredito que acompreensao dos conceitos de alguns adjetivos como Modelo Teorico,Simulacao Computacional, Realidade, Modelo Matematico e etc., japroduzem uma visao diferente da ciencia quanto ferramentainvestigativa, e ainda, dando um sentido real quanto Verdade que umateoria ou modelo cientifico se propoe a ser.Segue um compilado traduzido e adaptado das partes essenciais contidas na introducaodo livro Molecular Dynamics Simulation: elementary methods de J. M.Haile da Universidade Clemson na California do Sul, este que fornece uma introducao basica para um conhecimento mais profundo desta disciplina filosofica e metodologica. E possivel dentro da discussao sobre modelos computacionais teoricos de sistemas moleculares, extrair conceitos fundamentais da visao cientifica, inclusive para outras areas da ciencia que, tanto utilizam o formalismo descritivo dos fenomenos da natureza, como tambem subsidiam a iniciativa experimental de igualmente tentar descrever a materia sensivel.Introducao(...)A simulacao computacional emdinamica molecular e a realizacao de uma velha, e antiquada,ideia cientifica; (...) o comportamento de um sistema pode sercalculado se nos temos - para cada parte do sistema - um conjuntoinicial de condicoes somadas as forcas de interacao. Da epocade Newton ate os dias atuais, esta interpretacao mecanicodeterministica da natureza tem dominado a ciencia.Em 1814, cerca de umseculo depois de Newton, Laplace escreveu:(...) umainteligencia na qual poderia compreender todas as forcas pelas quaisa natureza e animada, e a respectiva situacao dos seres que acompoem uma inteligencia suficientemente vasta que poderiasubmeter estes dados para analise abracaria da mesma forma omovimento de corpos maiores do universo ate os atomos mais leves.Para isto, nada poderia ser incerto, e o futuro, como o passado,estaria presente a estes olhos.Se esta aproximacao eimpedida pela complexidade da realidade, entao, nos substituimos arealidade por um modelo. Em uma de suas palestras, cerca de umseculo depois de Laplace, Thompson observou:parece para mim que oteste da pergunta entendemos ou nao um problema particular emfisica? e, na verdade, podemos fazer um modelo mecanicodisto?Hoje, cerca de umseculo depois de Thompson, nos permanecemos incontidos do sonho deLaplace: o requisito da inteligencia e suprido por umcomputador digital, e a respectiva situacao e um conjuntoinicial de posicoes e velocidades [no caso da Dinamica Molecular].Agora, modelos matematicos deterministicos permeiam nao somente asciencias fisicas e engenharia, mas a vida e as ciencias sociaistambem.Este determinismo eantiquado no sentido de que, enquanto que frequentemente e bemsucedido, no entanto, ainda e simplista. A despeito daafirmacao de Laplace, nos podemos identificar sistemas que aindasao imprevisiveis o mercado de acoes e o clima, por exemplo.Por que deveria ser assim? Se o modelo matematico deterministicopode nos ajudar com sucesso a lancar a Apolo XI a lua, por que naopode nos ajudar a preve o clima na terra nos proximos meses?A resolucao desdeproblema e baseada no tipo de forca agindo entre os componentes dosistema: quando o sistema contem objetos que interagem naolinearmente, o comportamento