atraves de uma variedade de metodos que medem as taxas/niveis de reassociacao. O porem nisso e que apenas as fracoes de cadeia unica do genoma humano e dos chimpanzes foram utilizados para obter estimativas iniciais de similaridade. Cientistas focaram na fracao de cadeia unica por causa do elevada concentracao de genes. No entanto, muitos genes estao localizados nas outras porcoes do genoma e assim foram deixados de fora da analise. Outro problema e que praticamente todo o genoma e agora conhecido ser funcional em algum aspecto e as regioes nao-codificadoras foram provadas serem essenciais para fornecer muitas caracteristicas do controle critico e moldagem dos nucleotideos.ReferenciaTotal de bases genomicas analizadasBases alinhadasAclamada semelhanca nos DNASimilaridade ADN real *Britten, 2002846,016779,13295.2%~ 87%Ebersberger et al., 20023,000,2861,944,16298.8%< 65%Liu et al., 200310,600,000 (total para humanos, chimpanzes, babuinos, e sagui)4,968,069 (humanochimp)98.9% sem indels?Wildman et al., 2003~90,000 (exons de 97 genes)?98.499.4%?Chimp. Chrom. 22 Consort.32,799,845?98.5% excluindo indels8085% incluindo indelsNielson et al., 2005??99.4% regioes geneticas selecionadas?Chimp. Seq. Consort. 2005Inteiro genoma (5X cobertura redundante)2.4 Gb95.8%81%**Tabela . Resumo da comparacao entre os genomas em diversos artigos. Quando fora possivel, dados omitidos dos alinhamentos foram usados para produzir uma mais fidedigna comparacao real entre os DNAs.* Baseado na quantidade de sequencias omitidas do DNA durante os alinhamentos** Comparado a dados do The International Human Genome Sequencing Consortium (2004)((.9577 x 2.4 Gb) / 2.85 Gb) x 100? Nao foi possivel calcular a semelhancas genomica real devido aos dados nao serem providosUm dos primeiros trabalhos de sequencias de DNA que apareceram no inicio do projeto genoma do chimpanze foi talvez um dos mais objetivos. Roy Britten, um dos pioneiros na cinetica de reassociacao de DNA, ele comparou a sequencia genomica de cinco clones de DNA chimpanze de grande insercao (cromossomos bacteriais artificiais ou BAC) sequencia genomica humana, utilizando um atipico programa de computador baseado em Fortran que nao era/esta disponivel publicamente. Estas cinco sequencias BAC de chimpanzes foram escolhidas porque eram as unicas ate entao disponiveis. Os pesquisadores geralmente escolhem BAC iniciais para o sequenciamento do genoma devido ao seu conteudo de DNA de copia-unica, o que os torna mais faceis de se montar e comparar com outras especies. O tamanho total da sequencia de DNA para todos os 5 BACs era 846.016 bases. No entanto, apenas 92% deste era alinhaveis ao ADN humano, pelo que as estatisticas finais contaram apenas as 779.132 bases. A seu favor Britten incluiu os dados das insercoes e delecoes (indels) e dai relatou uma semelhanca de ~ 95%. No entanto, um numero mais realista incluiria a sequencia de alta qualidade completa de todos os cinco BACs, tao legitimos como os indels dentro dos alinhamentos, dando uma semelhanca de DNA final de 87%!Ilustracao de uma regiao alinhada mostrando possiveis substituicoes e indels (delecoes) que podem variar de uma a milhares de bases pareadas. As insercoes e delecoes (indels) representam a adicao ou perda de sequencia de ADN na comparacao de sequencia com a outra. Indels podem variar em tamanho de uma unica base para mais de milhares.Outro estudo notavel publicado por Ebersberger et al., publicado no mesmo ano que artigo de Britten, utilizou