Concilio Vaticano II. Foi membro de onze congregacoes no Vaticano.Sua vida apostolica foi marcada pela defesa da ortodoxia catolica. Combateu com firmeza a esquerda catolica, a Teologia da Libertacao e o engajamento politico das Comunidades Eclesiais de Base.Por outro lado, assumiu a defesa de refugiados politicos dos regimes militares latino-americanos entre 1976 e 1982. Montou uma rede de apoio a estes refugiados juntamente com a Caritas brasileira e o Alto Comissariado das Nacoes Unidas para os Refugiados, que consistia em abriga-los, inicialmente na Sede Episcopal (Palacio Sao Joaquim) e posteriormente em apartamentos alugados para tal finalidade. Alem disto, financiou a estadia destes refugiados ate conseguir-lhes asilo politico em paises europeus. Foram asiladas mais de quatro mil pessoas. Usou sua autoridade para este fim, inclusive enfrentando os militares por diversas vezes. Ao assumir tal tarefa, telefonou para o General Silvio Frota e disse-lhe: "Frota, se voce receber comunicacao de que comunistas estao abrigados no Palacio Sao Joaquim, de que eu estou protegendo comunistas, saiba que e verdade, eu sou o responsavel. Ponto final, ponto final". Tambem atuou junto aos militares na libertacao de diversos acusados de subversao.[3]Tambem recusou-se a celebrar missa pelo aniversario do Ato Institucional Numero Cinco, pedida pelo General Abdon Sena, de Salvador. Foi um dos brasileiros que mais ocupou cargos no Vaticano: foram 11 cargos nas congregacoes, conselhos e comissoes.Sua acao social abrangeu a criacao de centros de atendimento a portadores de AIDS, a pastoral carceraria, um nucleo de formacao de lideres na residencia do Sumare.Sua renuncia foi solicitada em 1997, quando ja completara 75 anos. Mas por indulto especial do Papa Joao Paulo II, seu amigo pessoal, foi autorizado a permanecer a frente da arquidiocese ate completar 80 anos. Sua aposentadoria foi finalmente aceita no dia 25 de julho de 2001, quando Dom Eusebio Oscar Scheid, entao Arcebispo de Florianopolis, foi nomeado o seu sucessor. Dom Eugenio permaneceu de 25 de julho ate 22 de setembro de 2001 como administrador apostolico do Rio, nomeado por Joao Paulo II.Em 22 de setembro, na presenca de grande numero de bispos e sacerdotes, entregou o governo da arquidiocese, atraves da passagem do baculo (cajado simbolico do pastoreio do povo de Deus, utilizado pelos bispos) a Dom Eusebio, ate entao nao revestido da dignidade cardinalicia, que so viria a obter em 2003. Ainda permaneceu residindo no Rio de Janeiro, no Palacio Apostolico do Sumare, e permaneceu em funcoes no Vaticano. Possuiu os titulos de Cardeal Protopresbitero (o mais antigo em idade e/ou nomeacao entre os Cardeais Presbiteros) e Arcebispo Emerito (aposentado) da Arquidiocese de Sao Sebastiao do Rio de Janeiro.Dom Eugenio, ao lado do irmao, na comemoracao dos 50 anos de ordenacao episcopal, em missa solene realizada na Igreja Matriz de Acari-RN. Ordenacoes episcopais Foi o principal sagrante dos seguintes bisposDom Nivaldo MonteDom Valfredo Bernardo Tepe, O.F.M.Dom Miguel Fenelon Camara FilhoDom Silverio Jarbas Paulo de Albuquerque, O.F.M.Dom Alair Vilar Fernandes de MeloDom Eduardo KoaikDom Karl Josef RomerDom Carlos Alberto Etchandy Gimeno NavarroDom Celso Jose Pinto da SilvaDom Heitor de Araujo SalesDom Romeu BrigentiDom Affonso Felippe GregoryDom Joao dAvila Moreira LimaDom Jose Palmeira LessaDom