Agroecologia representa um poderoso instrumento e uma necessidade para a ruptura com a tradicao epistemologica nascida no empirismo, no racionalismo e no positivismo. No entanto, a Agroecologia pode representar um avanco paradigmatico somente para aqueles que estao em busca do novo, o que infelizmente ainda representa uma minoria nas academias e instituicoes de pesquisa contemporaneas. Na Agroecologia, vista como disciplina ou principio cientifico, as premissas teoricas sao radicalmente diferentes de alguns principios oriundos de correntes filosoficas que moldaram a producao do conhecimento e ate o arranjo social na moderna sociedade ocidental. A base epistemologica da Agroecologia incorpora a complexidade; a duvida, a incerteza, e pretende ser inter ou transdisciplinar; sua pauta e a tematica e nao a disciplina; alem de reconhecer os saberes tradicionais e cotidianos como tambem validos.A segunda grande questao proposta pela Agroecologia e a necessidade de uma revisao metodologica que permita superar a aplicacao linear da estrutura metodologica das ciencias naturais, incorporando tambem a das ciencias sociais. Ou ao menos que se possa trabalhar na perspectiva de um pluralismo metodologico, o que ja vem sendo praticado em alguns casos. Se agora nao mais importa apenas o dominio humano sobre a natureza, se o que interessa e a promocao de uma relacao mais harmoniosa entre a sociedade e a natureza, entao ha que se trabalhar com os metodos que explicam a sociedade e nao so com os que ensinam a explicar e a dominar a natureza (e o que Prigogine & Stengers[10], denominam "Nova Alianca"), ja que nao ha mais como desconhecer que sociedade e natureza mantem mutua determinacao onde uma conforma a outra.A tradicao de pesquisa fundada no empirismo, no racionalismo e no positivismo fez da parcela experimental e do laboratorio o locus preferencial de sua acao cotidiana. Isto ajudou a aperfeicoar um dos ritos sagrados da pesquisa cientifica, o controle das variaveis e o rigor experimental, ambos importantes para a aplicacao de testes estatisticos, por exemplo. Mas, por outro lado, tambem teve como resultado o distanciamento entre os pesquisadores e o meio real onde operam agricultores e produtores rurais. Ou seja, provocou uma dissociacao entre a producao e a aplicacao do conhecimento. Mas nao so isso: provocou tambem a adocao de uma falsa concepcao de que existe certa linearidade nas necessidades e demandas de pesquisa, o que, por sua vez, provocou o quase completo esquecimento de alguns publicos, que tem tido escasso acesso as politicas publicas.O que se pretende e que a incorporacao de estruturas metodologicas ate entao pouco usadas na pesquisa agropecuaria permita reforcar uma pratica cientifica que prime nao so pelo rigor, mas que promova a democratizacao do conhecimento via aplicacao de tecnicas e metodos de pesquisa. A adocao dos principios da pesquisa participativa, da pesquisa-acao, a utilizacao de metodologias como diagnostico participativo, leitura de paisagem etc. permitem o re-encontro de produtores e usuarios de conhecimento, de forma abrangente e democratica. A relacao entre sujeitos com conhecimentos diferentes capazes de articular um terceiro nivel de conhecimento e o que Paulo Freire[11] propunha com o metodo dialogico.Ou seja, os principios da Agroecologia tambem constituem instrumento para organizar