O software Sequence Scanner e um software gratuito para analise de dados de sequenciamento. Atraves deste software e possivel visualizar, editar, imprimir e exportar os dados analisados. O software gera ainda uma serie de relatorios atraves dos quais e possivel checar, rapidamente, a qualidade geral das sequencias analisadas. E possivel ainda:Visualizar todas as miniaturas dos dados brutos das amostras e organizar os dados por qualidadeVisualizar simultaneamente o dado analisado e o dado bruto de uma mesma amostraExportar os eletroferogramas em formatos .pdf e .jpgEtcDados gerados em qualquer uma das plataformas de sequenciamento Life Technologies podem ser abertos no Sequence Scanner, para isto, basta que os arquivos tenham sido pre-analisados no software Sequencing Analysis ou no proprio software Data Collection do sequenciador, a medida que os dados vao sendo gerados.Leia mais sobre o software e faca o download no link: Software Sequence ScannerConheca e faca o download de outros programas da Life Technologies: Life Technologies softwares. Voce ja trabalha ougostaria de trabalhar com analises de transcriptoma? O Transcriptoma e oconjunto total de RNAs transcritos em uma celula, um tecido, uma condicaofisiologica, etc. Em um primeiroinstante voce pode se assustar com o termo transcriptoma, ou se deparar com afalta de informacoes na literatura, pois as analises de expressao genicaglobal usando o Sequenciamento de Nova Geracao sao um campo de pesquisa ainda em desenvolvimento dentro da biologia molecular. Por outro lado, nao ha duvidas que seu usosera cada vez mais abrangente. Suas vantagens em relacao a metodologiastradicionais de analise da expressao genica em larga escala sao enormes, poisalem de identificar os diferentes niveis de expressao, podemos:a) Identificartranscritos raros e ainda nao conhecidosb) Identificarnovas variantes de splicingc) Identificareventos de fusao genica e quimerasd) GenotiparSNPsApenas para citaralguns.Fig. 1 Diferentestipos de RNAs expressos em uma celula. Em mamiferos, em torno de 98% dos RNAsexpressos nao codificam proteinas. Fonte:Interna.Mas para alcancarestes beneficios, existem alguns detalhes importantes ao trabalhar com amostrasde RNA. Nesta serie de postsque faremos, gostaria de compartilhar com voces os principais passos para sechegar num bom resultado nos trabalhos com RNA.1. Qualidadeda AmostraNao ha duvida que,assim como para os trabalhos com DNA, a qualidade das amostras de RNA e oprimeiro passo para um bom resultado e uma analise confiavel. Para obter um RNAde qualidade e indispensavel escolher a metodologia de extracao que mais se adequa as condicoes da suaamostra, podem ser kits comerciais, solucoes caseiras, nao importa, o queimporta e a qualidade do material extraido, que alem de nao estar degradado,precisa estar livre de inibidores, como proteinas e solventes organicos, quepodem influenciar as etapas posteriores.As moleculas de RNAsao por natureza muito mais instaveis que o DNA, e sofrem degradacao bastanteacelerada se nao preservadas da forma adequada. Preservar a integridade do RNA e extremamente critico para construir uma boa bibliotecae produzir resultados confiaveis. Neste ponto epraticamente indispensavel o uso do Bioanalyzer (ou equipamento similar) paraverificar a integridade do RNA, o tao conhecido RIN (RNA Integraty Number).Para uma analise de RNAs mensageiros e outros RNAs longos (ao que normalmentenos referimos como Transcriptoma) e ideal que as amostras tenham um RIN igualou superior a 8, enquanto que para analises de