DNA metagenomico, metagenomas e metatranscriptomasA area da metagenomica surgiu recentemente quando um dos maiores e mais controvertidos icones da ciencia moderna decidiu investir realmente neste tipo de analise (Venter et al., 2004). John Craig Venter, o magnata da Celera Genomics e um dos unicos humanos a possuir hoje seu genoma completamente sequenciado, saiu a navegar em seu veleiro Sorcerer no mar de Sargacos e realizou coletas importantes que abriram as portas e demonstraram as enormes potencialidades dos estudos da assim chamada genomica ambiental (Bertin et al., 2008; Ward et al., 2007; Rodriguez-Valera, 2004).J Craig Venter em seu veleiro Sorcerer fazendo coletas de amostras ambientais com o objetivo de amostrar comunidades bacterianas presentes no mar de sargacos. O estudo da genomica ambiental tem se mostrado cada vez mais interessante e revelador das caracteristicas dos mais diversos ambientes e mostra com a microbiota influencia e e influenciada por fatores ambientais.Um dos grandes papas da teoria evolutiva, Stephen Jay Gould, descreve em seu livro "Fullhouse" ("Jogo de dados", na traducao em portugues) a ideia da bacteria-modal. De acordo com Gould a bacteria e o organismo mais abundante na face de nosso planeta e se apenas um organismo devesse ser pego como representativo da vida na Terra, ele deveria ser uma bacteria (Gould, 1996). A despeito de visoes poeticas ou fugas do antropocentrismo, a bacteria modal de Gould reflete a grande importancia da comunidade bacteriana nos mais diversos biomas existentes em nosso planeta. De fato, com os avancos dos estudos em metagenomica ambiental ao verificarmos as comunidades microbiologicas presente nos rios, mares e solos esta se tornando cada vez mais clara a enorme influencia das bacterias e outros organismos unicelulares para o fenotipo ambiental e para o desenvolvimento de outras formas de vida a eles associados.O estudo de metagenomas e metatranscriptomas consiste em uma diversidade de analises complementares sobre determinado ambiente do qual tenham sido extraidas amostras de DNA ou RNA. Esta tecnica tem a incrivel vantagem de permitir a amostragem de bacterias e outros microorganismos incapazes de crescer em cultura e permite avaliar um potencial biotecnologico que estava ate hoje escondido, sendo considerado uma mina de ouro biotecnologica (Handelsman, 2004; Streit e Schmitz, 2004). No estudo mais basico de DNA metagenomico, sao extraidas amostras de DNA do ambiente que se deseja trabalhar e sao amplificadas regioes relacionados ao chamado rRNA 16S. Esta molecula funciona como um marcador de grandes grupos bacterianos e permite a classificacao atraves de comparacao com sequencias de bancos de dados de DNA ribossomal (Cole et al., 2009; Cole et al., 2007; Cole et al., 2005; Cole et al., 2003) - de grandes grupos bacterianos presentes na amostra. Assim, e possivel ao pesquisador verificar exatamente quais grupos bacterianos estao presentes em uma amostra de solo (por exemplo) e assim poder inferir a relevancia da presenca de determinados grupos com relacao a um chamado "fenotipo" ambiental. Analises multivariadas tem sido realizadas e pipelines de analise de dados tem sido aos poucos implementados por bioinformatas para serem executadas automaticamente de forma a permitir a relacao estatistica de correlacao entre a presenca de determinado grupo