5-Metilsitozin sitozin'in numaralı karbonuna bir metil grubunun eklenmiş halidir. Sitozinin bu metillenmiş hali onun baz eşleşme özelliklerini etkilemez. In vivo 5-Metilsitozin DNA metiltransferazların etkisiyle meydana gelen bir epigenetik değişimdir. DNA metilasyonunun en sık görülen ürünüdür. Canlılardaki işlevi büyük çeşitlilik gösterir Bakterilerde 5-metilsitozin pek çok DNA dizisinde bulunabilir genelde DNA'nın metilasyona duyarlı restriksiyon enzimleri tarafından kesilmesine karşı korur. Bitkilerde 5-metilsitozin CpG CpNpG and CpNpN dizilerinde görülür veya Mantar ve hayvanlarda 5-metilsitozin başlıca CpG dinükleotitlerinde bulunur. Çoğu ökaryotta bu bölgelerin ufak bir yüzdesini metillense de omurgalılarda CpG sitozinlerinin 70,80 metillenir.Sitozinin spontan deaminasyonu sonucu urasil meydana getirir bu urasil DNA tamir enzimleri tarafından tanınır ve DNA'dan çıkartılır buna karşın 5-metilsitozin deaminasyonu timin oluşturur. DNA'daki bir sitozinin timine dönüşmesi bir transisyon mutasyonuna neden olur. In vitro 5-metilsitozin nitröz asit gibi reaktifler aracılığıyla deamine olup timin meydana getirir benzer şartlarda sitozin deamine olup urasil oluşturur. Bisülfit etkisiyle sitozin deamine olur ama 5-metilsitozin bisülfit etkisiyle deaminasyona dayanıklıdır bu özellik bisülfit dizilemesi ile DNA sitozin metilasyon örüntülerini analizinde kullanılır. Ek resimler Notlar Kaynakça Griffiths Anthony J. F. 1999. An Introduction to genetic analysis. San Francisco W.H. Freeman. ss. Chapter 15 Gene Mutation. ISBN 0-7167-3520-2. Şubat 2005 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi Ağustos 2009.