nglaura/scielo-summarization huggingface dataset:
Objetivo: Diseñar y estandarizar un sistema de PCR para detectar un amplio espectro de tipos de VPH en una sola reacción utilizando como blanco la región E6 del genoma viral. Métodos: Utilizando secuencias del gen E6 de distintos tipos de VPH del NCBI y las herramientas informáticas Mult Alin versión 5.4.1. y Oligo Analyzer 1.1.2 se diseñaron oligonucleótidos degenerados que permitían la amplificación de un fragmento de aproximadamente 214 pb. Las muestras seleccionadas incluyen: 25 muestras de ADN, cada una positiva para un solo tipo de VPH tipificados por el sistema PCR-RFLP MY11/MY09 del gen L1. Resultados: Se obtuvieron amplificados de aproximadamente 214 pb de 25 tipos distintos de VPH, se detectaron amplificados de E6 en muestras negativas para el sistema MY09/MY11. Conclusiones: Se pudo determinar que el diseño de los oligonucleótidos degenerados fue altamente eficiente para la amplificación de por lo menos 25 tipos distintos de VPH lo que facilitaría la detección en muestras clínicas.

Objective: Design and standardize a PCR system to detect a broad spectrum of HPV types in a single reaction using target the E6 region of the viral genome. Methods: Using E6 gene sequences of different HPV types and NCBI tools Mult Alin Oligo Analyzer version 1.1.2 5.4.1. Degenerate oligonucleotides were designed that allowed amplification of a fragment of approximately 214 bp. Selected samples include: 25 DNA samples, each positive for a single HPV type typified by PCR-RFLP system MY11/MY09 L1 gene. Results: We obtained approximately 214 bp amplified from 25 different HPV types were detected in samples amplified from E6 negative MY09/MY11 system. Conclusions: It was determined that the design of degenerate oligonucleotides was highly efficient for amplification of at least 25 different HPV types which would facilitate detection in clinical samples.
Objetivo: Determinar el valor predictivo del índice de líquido amniótico en las complicaciones neonatales. Métodos: Se seleccionaron 120 embarazadas en las que se evaluó el valor del índice de líquido amniótico, complicaciones neonatales y eficacia diagnóstica. Las pacientes fueron divididas según el punto de corte del índice de líquido amniótico (grupo A: índice de líquido amniótico menor de 60 mm y grupo B índice de líquido amniótico igual o mayor a 60 mm). Ambiente: Servicio de Obstetricia y Ginecología. Hospital Central “Dr. Urquinaona”. Maracaibo. Estado Zulia. Resultados: Las pacientes del grupo A presentaron una duración mayor del trabajo de parto y recién nacidos con menos peso al nacer que las pacientes del grupo B (P < 0,05). Con respecto a las complicaciones perinatales, la frecuencia de recién nacidos con sufrimiento fetal y con puntuación de Apgar menor o igual de 6 puntos al minuto fue estadísticamente superior en las pacientes del grupo A comparado con aquellas del grupo B (P < 0,05). El valor de corte de 60 mm en la predicción de sufrimiento fetal tiene una sensibilidad del 22,2 %, especificidad del 96,4 %, valor predictivo positivo del 72,3 % y valor predictivo negativo del 74,3 %; en la predicción de puntuación de Apgar menor o igual de 6 puntos al minuto tiene una sensibilidad del 25,0 %, especificidad del 96,4 %, valor predictivo positivo del 69,2 % y valor predictivo negativo del 74,7 %. Conclusión: El índice de líquido amniótico tiene valor en la predicción de sufrimiento fetal y puntuación de Apgar.

Objective: To determine the predictive value of amniotic fluid index in perinatal complications. Methods: One hundred and twenty patients were selected. Amniotic fluid index, perinatal complications and diagnostic accuracy was evaluated. Patients were divided according to cut-off point of amniotic fluid index (group A: amniotic fluid index less than 60 mm and group B amniotic fluid index same or higher than 60 mm). Setting: Servicio de Obstetricia y Ginecologia. Hospital Central “Dr. Urquinaona”. Maracaibo. Estado Zulia. Results: Patients in group A presented a longer labor and there newborns had less weight than those of patients in group B (P < 0.05). In relation to perinatal complications, the frequency of fetal distress and Apgar Score less than 6 points at minute was statically superior in patients of group A compared with those in group B (P < 0.05). The cut-off value of 60 mm for prediction of fetal distress has a sensivity of 22.2 %, specificity of 96.4%, positive predictive value of 72.3 % and negative predictive value of 74.3 %; in the prediction of Apgar score equal or less than 6 points at minute had a sensivity of 25.0 %, specificity of 96.4 %, positive predictive value of 69.2 % and negative predictive value of 74.7 %. Conclusion: Amniotic fluid index has a value for prediction of fetal distress and Apgar score.
Objetivo: Presentar un caso de ruptura de endometrioma de ovario durante el tercer trimestre del embarazo. Caso: Paciente de 35 años con embarazo activo de 34 semanas, acudió por presentar dolor abdominal y aumento súbito de volumen del abdomen. La ecografía demostró la presencia de un embarazo intrauterino, abundante cantidad de líquido libre en cavidad abdominal y del lado izquierdo del útero una tumoración compatible con endometrioma. Durante la laparotomía, el ovario izquierdo estaba adherido a la pared posterior del ligamento ancho y epiplón con la presencia del endometrioma roto. Tres días después de cirugía, el trabajo de parto se inicio en forma espontánea, por lo que se realizó la cesárea. La paciente presentó un posoperatorio sin complicaciones.

A 35 years-old patient with an active pregnancy of 34 weeks assisted for presenting abdominal pain and sudden increased of abdominal volume. Ultrasonography showed presence of intrauterine pregnancy, great amount of free fluid in abdominal cavity and in left side of uterus a tumor compatible with endometrioma. During laparotomy, left ovary was adhere to posterior wall of broad ligament and omentum with a ruptured endometrioma. Three days after surgery, labor began spontaneously so a cesarean section was done. Patients had a postoperative course without complications.
Este artículo de interés historiográfico se relaciona con el historiador y catedrático venezolano de inicios del siglo XX, Caracciolo Parra León, y plantea en un primer plano, la forma de la obra, que tiene que ver con el estilo, plan y método del autor; asimismo trata del contenido ideológico positivista que caracteriza su concepción dualista de la historia, llena de un flujo religioso o metafísico. El pensamiento de Parra león se forja al combinar criterios de dos escuelas historiográficas en un todo hábilmente construido según las últimas investigaciones histórico-sociales de su tiempo, avanzando en cuanto a su posición científica de la historia, pero retrocede a su vez por el espíritu religioso que incorporó a su obra. La concepción dualista tiene un fin especial: Establece la hispanidad como principio fundamental en la formación de la cultura nacional y latinoamericana.
Muchos fueron los aportes de diversos científicos, botánicos y estudiosos a las ciencias durante el siglo XIX. A continuación se presenta brevemente una visión general de diversos trabajos científicos realizados por el general e ingeniero Julián Churión, durante su participación como miembro de la Sociedad de Ciencias Naturales y Científicas de Caracas, así como un panorama general de su trabajo sobre Causas de la sequía y repoblación de los bosques, premiado por el Colegio de Ingenieros en 1877, y finalmente, la importancia del trigo en Venezuela. Un profesional con una visión de país imaginariamente adaptada a teorías extranjeras. A través de su formación y capacitación evidencia su espíritu progresista y liberal muy propio de la época.

Many were the contributions of various scientists, botanists and scholars to science during the nineteenth century. Then briefly present an overview of various scientific studies carried out by general Julian Churión engineer, while participating as a member of the Society of Natural History and Science of Caracas, as well as an overview of his work on causes of drought and restore forests, awarded by the College of Engineering in 1877, and finally, the importance of wheat in Venezuela. A professional with a vision of an imaginary country to foreign theories adapted. Through its education and training demonstrates its very liberal and progressive spirit of the times.
La intoxicación alimentaria estafilocócica es producida por el consumo de alimentos contaminados con enterotoxinas estafilocócicas producidas por cepas de Staphylococcus aureus, constituyéndose en una de las principales enfermedades alimentarias a nivel mundial. En este estudió se investigó la presencia de S. aureus y la producción de enterotoxinas estafilocócicas en muestras de queso blanco artesanal tipo “telita” expendidas en diferentes mercados de la ciudad de Caracas. Se analizaron 80 muestras y el recuento de S. aureus se efectuó según Norma Venezolana COVENIN 1292:89. La presencia de enterotoxinas tipo A, B, C y D de S. aureus se determinó con la prueba de aglutinación de látex en fase reversa (SET RPLA Oxoid). Se encontró carga microbiana de 10³-10(4) UFC/g de S. aureus en el 40,0% de las muestras. Se detectaron enterotoxinas estafilocócicas en 34,2% de las muestras, resultando la enterotoxina tipo A la más frecuente (80,7%). El queso blanco artesanal tipo “telita” expendido en mercados de la ciudad de Caracas revela deficientes medidas sanitarias en su expendio y la presencia de enterotoxinas representa un potencial riesgo para la salud de los consumidores.

Staphylococcal food intoxication is produced by eating food contaminated with staphylococcal enterotoxins produced by Staphylococcus aureus, constituting one of the main diseases produced by food at a worldwide level. In this study we investigated S. aureus presence in white artisan “telita” type” cheese sold at various markets in Caracas city. Eighty samples were analyzed and the bacterial counts were done according to COVENIN Venezuelan guidelines 1292:89. Presence of S. aureus enterotoxins type A, B, C, and D was determined by the reverse phase latex agglutination test (SET RPLA Oxoid). We found S. aureus bacterial loads between 10³ - 10(4) CFU/g in 40.0% of the samples. We detected staphylococcal enterotoxins in 34.2% of the samples, enterotoxin type A being the most frequent (80.7%). The white artisan “telita” type cheese being sold at markets in Caracas city reveals deficient sanitary measures for its sale, and the presence of enterotoxins represents a potential health risk for consumers.
Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC), es un patógeno transmitido por alimentos. El serotipo O157:H7 se considera clínicamente el más importante, pero un 50% de las infecciones por STEC corresponden a serotipos no O157. En Venezuela, la presencia de cepas STEC no O157 en productos cárnicos no ha sido reportada, lo que motivó este trabajo. Se analizaron 70 muestras de carne molida (35 bovinas y 35 porcinas). El aislamiento de E. coli se llevó a cabo en agar MacConkey sorbitol, suplementado con cefixima y la identificación bioquímica según pautas de la FDA. Se realizó la extracción del ADN y ensayos de PCR para la identificación de cepas STEC O157:H7 y STEC no O157. De 70 muestras analizadas, 50 (71,4%) resultaron positivas al aislamiento de E. coli, lográndose identificar 47 cepas sorbitol positivas y 3 cepas sorbitol negativas. La PCR demostró ausencia de STEC O157:H7 y presencia de STEC no O157 productor de toxina Shiga Stx1 y Stx2 en el 4,3% de las muestras analizadas. Se demuestra, por primera vez en el país, la circulación de cepas STEC no O157 en productos cárnicos, lo que permite sugerir el establecimiento de estrategias de prevención asociadas a este patógeno.

Shiga toxin producing Escherichia coli (STEC) is a food-transmitted pathogen. Serotype O157:H7 is considered the most clinically important, but 50% of STEC infections correspond to non-O157 serotypes. In Venezuela, presence of non-O157 STEC strains in meat products has not been reported, which was the reason for this study. Seventy ground meat samples were analyzed (35 bovine and 35 porcine). E. coli isolation was done in MacConkey sorbitol agar, supplemented with cefixim, and the biochemical identification was done according to FDA guidelines. DNA extraction and PCR assays were used for the identification of STEC O157:H7 and not O157 strains. Of the 70 samples analyzed, 50 (71.4%) were positive for E. coli isolation, and 47 sorbitol positive and 3 sorbitol negative strains were identified. PCR showed absence of STEC O157:H7 and presence of non-O157 STEC Shiga toxin Stx1 and Stx2 producers in 4.3% of the samples analyzed. This is the first time that the circulation of non-O157 STEC strains in meat products is demonstrated in this country, which suggests that prevention strategies associated to this pathogen should be established.
La rápida emergencia de la resistencia antimicrobiana debida a las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) tiene un impacto clínico significativo, lo cual se considera un problema de salud pública. El objetivo de este estudio fue determinar si existe diseminación clonal de K. pneumoniae productora de BLEE, en pacientes adultos hospitalizados en el Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” (CHRP), Ciudad Bolívar, Venezuela. Se evaluaron 13 cepas de K. pneumoniae aisladas de pacientes adultos con infección intrahospitalaria. La confirmación fenotípica de la producción de BLEE, fue realizada por los métodos de sinergia de doble disco y del disco combinado. Se realizó la tipificación molecular de los aislados mediante electroforesis de campo pulsante (ECP). Todas las cepas presentaron resistencia asociada a las fluoroquinolonas y 9 fueron resistentes a los aminoglucósidos. Se encontraron 12 fenotipos de susceptibilidad; el fenotipo I prevaleció en dos cepas. La ECP reveló que la mayoría de las cepas presentaron pulsotipos distintos, descartando una posible relación clonal entre ellas, a excepción de dos aislados que presentaron pulsotipos indistinguibles entre sí, ambos del mismo servicio de hospitalización. Se puede concluir que en el CHRP para el período marzo-junio de 2011, no hubo diseminación clonal de K. pneumoniae productoras de BLEE.

The rapid emergence of antimicrobial resistance to extended spectrum ß-lactamases (ESBL) has a significant clinical impact, and is considered a public health problem. The purpose of this study was to determine if there is clonal dissemination of ESBL producer K. pneumonia in adult patients hospitalized at the Complejo Hospitalario “Ruiz y Paez” (CHRP) of Ciudad Bolivar, Venezuela. Thirteen K. pneumoniae strains isolated from adult patients with intra-hospital infections were evaluated. The phenotypic confirmation of ESBL production was done with the double disk synergy and combined disk methods. The molecular typing of the isolates was done through pulse field electrophoresis (PFE). All the strains presented fluoroquinolone-associated resistance and 9 were aminoglucoside resistant. Twelve susceptibility phenotypes were found; phenotype I prevailed in 2 strains. PFE revealed that most of the strains presented different pulsetypes, discarding a possible clonal relationship among them, except for 2 isolates which presented undistinguishable pulsetypes, both from the same hospitalization service. It can be concluded that at the CHRP there was no clonal dissemination of ESBL producer K. pneumoniae during the March-June 2011 period.
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) está asociado a diversos procesos infecciosos y su creciente resistencia representa un grave problema de salud publica. Los objetivos de este trabajo fueron: detectar fenotípica y genotípicamente la resistencia a meticilina y eritromicina en 60 cepas SARM y confirmar la resistencia a meticilina. Ésta última fue confirmada por concentración inhibitoria mínima (CIM), prueba de descarte, resistencia a cefoxitina (FOX), detección de PBP2a, producción de β-lactamasa y detección del gen mecA (PCR). Para la resistencia a eritromicina se utilizó el método de difusión en disco, CIM, resistencia inducible a clindamicina (D-test) y detección de los genes ermA, ermB, ermC y msrA (PCR). Los métodos de CIM, descarte, FOX y PBP2a, mostraron en cada prueba una sensibilidad y valor predictivo de 100% y 98,3% respectivamente. Una cepa fue mecA negativo, negativa para PBP2a y β-lactamasa positiva y se consideró “borderline”. Treinta y cinco (58,3%) SARM fueron resistentes a eritromicina y mostraron los fenotipos MS B (6/17,1%), cMLS B (25/71,4%) y iMLS B (4/11,4%), siendo estas últimas D-test positivo. El gen ermA fue el más frecuente. La resistencia a eritromicina encontrada constituye un problema serio, por ser una de las alternativas para su tratamiento.

Methicillin resistant Staphylococcus aureus strains (MRSA) are associated to diverse infectious processes and their growing resistance represents a serious public health problem. The objectives of this study were to detect methicillin and erythromycin resistance of 60 MRSA strains phenotypically and genotypically, and confirm methicillin resistance. This last one was confirmed by the minimal inhibitory concentration (MIC) method, screening test, cefoxitin resistance (FOX), PBP2a detection, β-lactamase production, and mecA gene detection (PCR). For erythromycin resistance, the disk diffusion method, MIC, inducible clindamycin resistance (D-test), and ermA, ermB, ermC, and msrA gene detection (PCR) were used The MIC, discard test, FOX, and PBP2a methods showed in each test a sensitivity and predictive value of 100% and 98% respectively. One strain was mecA negative, PBP2a negative, and β-lactamase positive and it was considered “borderline”. Thirty five (58.3%) were erythromycin resistant and showed MS B (6/17.1%), eML.S B (25/71.4%) and iML.S B (4/11.4%); these last ones were D-test positive. ermA gene was the most frequent. The erythromycin resistance found contitutes a serious problem since it is one of the treatment alternatives.
Con el fin de detectar la presencia de hongos y aflatoxinas, en harina de maíz precocida distribuida en el estado Aragua, Venezuela, se muestrearon cuatro presentaciones comerciales durante cinco semanas. La cuantificación de hongos se realizó por el método de contaje por incorporación en placa, utilizando agar extracto de malta e incubación durante ocho días a 27± 2 ºC. La determinación de las aflatoxinas se realizó por la prueba de ELISA. El ensayo fue conducido bajo un diseño completamente aleatorio y todos los resultados fueron sometidos a la prueba estadística no paramétrica de Kruskal-Wallis y a pruebas de medias no paramétricas. Los contajes de hongos oscilaron entre 1,79 a 4,7x10UFC de hongos/g de muestra, encontrándose por debajo del nivel establecido por la Norma Covenin 1337-90 de 10(4) UFC/g de harina. Las especies fúngicas identificadas fueron: Aspergillus spp., A. flavus, A. niger, A. terreus y Penicillium spp. Los contenidos de aflatoxinas cumplieron con el nivel de tolerancia permitido para el maíz (20 ng/g).

With the purpose of detecting presence of fungi and aflatoxins in pre-cooked corn flour in Aragua State, Venezuela, we sampled four commercial presentations during five weeks. Quantification of fungi was done by the plate incorporation counting method, using malt extract agar and incubation during 8 days at 27 ± 3ºC. Aflatoxin determination was done by the ELISA test. The assay was conducted under a completely random design and all results were submitted to the Kruskal-Wallis non parametric statistical test, as well as to non parametric means tests. Fungi counts varied between 1.79 and 4.7 x 10 CFU of fungi/g of sample, indicating that they were under the level established by the COVENIN Guideline 1337-90 of 10(4) CFU/g of flour. The fungal species identified were Aspergillus spp., A. flavus, A. niger, A. terreus, and Penicillium spp. The aflatoxin content complied with the tolerance level allowed for corn (20 ng/g).
Se aislaron e identificaron los hongos presentes en granos de arroz manchados, de la variedad INCA LP-5, cosechados durante las épocas lluviosas de los años 2003 y 2005, en áreas de la Estación Experimental del Arroz “Los Palacios”, Pinar del Río, perteneciente al Instituto Nacional de Ciencias Agrícolas (INCA). Se determinó la incidencia y se realizaron las pruebas de patogenicidad mediante los postulados de Koch. Se identificaron 35 especies, correspondientes a 19 géneros de hongos asociados a granos manchados de la variedad INCA LP-5, y entre ellas se señalaron, como nuevos registros asociados al manchado del grano de arroz para Cuba a: Bipolaris maydis, Fusarium merismoides, F. solani, F. subglutinans, Penicillium itallicum, Phoma medicaginis var. pinodella y Syncephalastrum racemosum. Los hongos de mayor incidencia fueron Bipolaris oryzae, Sarocladium oryzae y especies de los géneros Alternaria, Fusarium, Curvularia y Phoma. Se confirmó que los hongos F. subglutinans, B. oryzae, A. padwickii, Alternaria sp., F. verticillioides, C. lunata, C. lunata var. aeria, C. pallescens, C. senegalensis, Curvularia sp., Phoma sp. y S. oryzae, son agentes causales del manchado del grano de arroz.

Isolation and identification of the fungi present in spotted rice grains of the INC LP-5 variety, harvested during the rainy seasons of the years 2003 and 2005, was done at sites of the Experimental Rice Station “Los Palacios”, Pinar del Río, belonging to the Instituto Nacional de Ciencias Agrícolas (INCA). Incidence was determined, and pathogenicity tests were carried out according to Koch’s postulates. Thirty-five species corresponding to 19 fungi genus associated to spotted grains of the INCA-LP-5 variety were identified, and among them, the following strains were indicated as new registrations associated to spotting of rice grains in Cuba: Bipolaris maydis, Fusarium merismoides, F. solani, F. subglutinans, Penicillium itallicum, Phoma medicaginis var. pinodella and Syncephalastrum racemosum. The fungi with the highest incidence were Bipolaris oryzae, Sarocladium oryzae and species of the genus Alternaria, Fusarium, Curvularia and Phoma. It was confirmed that the fungi F. subglutinans, B. oryzae, A. padwickii, Alternaria sp., F verticilloides, C. lunata, C.lunata var. aeria, C. pallescens, C. senegalensis, Curvularia sp., and S. oryzae, are causative agents of the spotting of rice grains.