id
stringlengths 1
4
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
5400 | [
"Together",
"with",
"our",
"recent",
"observation",
"that",
"a",
"third",
"even",
"more",
"severe",
"chondrodysplasia",
",",
"achondrogenesis",
"type",
"IB",
",",
"is",
"also",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"DTDST",
",",
"these",
"results",
"demonstrate",
"a",
"phenotypic",
"series",
"of",
"three",
"chondrodysplasias",
"of",
"increasing",
"severity",
"caused",
"by",
"lesions",
"in",
"a",
"single",
"sulfate",
"-",
"transporter",
"gene",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5401 | [
"The",
"severity",
"of",
"the",
"phenotype",
"appears",
"to",
"be",
"correlated",
"with",
"the",
"predicted",
"effect",
"of",
"the",
"mutations",
"on",
"the",
"residual",
"activity",
"of",
"the",
"DTDST",
"protein",
".",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5402 | [
"Haplotype",
"and",
"phenotype",
"analysis",
"of",
"six",
"recurrent",
"BRCA1",
"mutations",
"in",
"61",
"families",
":",
"results",
"of",
"an",
"international",
"study",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5403 | [
"Several",
"BRCA1",
"mutations",
"have",
"now",
"been",
"found",
"to",
"occur",
"in",
"geographically",
"diverse",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"families",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0
] |
5404 | [
"To",
"investigate",
"mutation",
"origin",
"and",
"mutation",
"-",
"specific",
"phenotypes",
"due",
"to",
"BRCA1",
",",
"we",
"constructed",
"a",
"haplotype",
"of",
"nine",
"polymorphic",
"markers",
"within",
"or",
"immediately",
"flanking",
"the",
"BRCA1",
"locus",
"in",
"a",
"set",
"of",
"61",
"breast",
"/",
"ovarian",
"cancer",
"families",
"selected",
"for",
"having",
"one",
"of",
"six",
"recurrent",
"BRCA1",
"mutations",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5405 | [
"Tests",
"of",
"both",
"mutations",
"and",
"family",
"-",
"specific",
"differences",
"in",
"age",
"at",
"diagnosis",
"were",
"not",
"significant",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5406 | [
"A",
"comparison",
"of",
"the",
"six",
"mutations",
"in",
"the",
"relative",
"proportions",
"of",
"cases",
"of",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"was",
"suggestive",
"of",
"an",
"effect",
"(",
"P",
"=",
".",
"069",
")",
",",
"with",
"57",
"%",
"of",
"women",
"presumed",
"affected",
"because",
"of",
"the",
"1294",
"del",
"40",
"BRCA1",
"mutation",
"having",
"ovarian",
"cancer",
",",
"compared",
"with",
"14",
"%",
"of",
"affected",
"women",
"with",
"the",
"splice",
"-",
"site",
"mutation",
"in",
"intron",
"5",
"of",
"BRCA1",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5407 | [
"For",
"the",
"BRCA1",
"mutations",
"studied",
"here",
",",
"the",
"individual",
"mutations",
"are",
"estimated",
"to",
"have",
"arisen",
"9",
"-",
"170",
"generations",
"ago",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5408 | [
"In",
"general",
",",
"a",
"high",
"degree",
"of",
"haplotype",
"conservation",
"across",
"the",
"region",
"was",
"observed",
",",
"with",
"haplotype",
"differences",
"most",
"often",
"due",
"to",
"mutations",
"in",
"the",
"short",
"-",
"tandem",
"-",
"repeat",
"markers",
",",
"although",
"some",
"likely",
"instances",
"of",
"recombination",
"also",
"were",
"observed",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5409 | [
"For",
"several",
"of",
"the",
"instances",
",",
"there",
"was",
"evidence",
"for",
"multiple",
",",
"independent",
",",
"BRCA1",
"mutational",
"events",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5410 | [
"Isolation",
"of",
"the",
"mouse",
"homologue",
"of",
"BRCA1",
"and",
"genetic",
"mapping",
"to",
"mouse",
"chromosome",
"11",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5411 | [
"The",
"BRCA1",
"gene",
"is",
"in",
"large",
"part",
"responsible",
"for",
"hereditary",
"human",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0
] |
5412 | [
"Here",
"we",
"report",
"the",
"isolation",
"of",
"the",
"murine",
"Brca1",
"homologue",
"cDNA",
"clones",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5413 | [
"In",
"addition",
",",
"we",
"identified",
"genomic",
"P1",
"clones",
"that",
"contain",
"most",
",",
"if",
"not",
"all",
",",
"of",
"the",
"mouse",
"Brca1",
"locus",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5414 | [
"DNA",
"sequence",
"analysis",
"revealed",
"that",
"the",
"mouse",
"and",
"human",
"coding",
"regions",
"are",
"75",
"%",
"identical",
"at",
"the",
"nucleotide",
"level",
"while",
"the",
"predicted",
"amino",
"acid",
"identity",
"is",
"only",
"58",
"%",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5415 | [
"A",
"DNA",
"sequence",
"variant",
"in",
"the",
"Brca1",
"locus",
"was",
"identified",
"and",
"used",
"to",
"map",
"this",
"gene",
"on",
"a",
"(",
"Mus",
"m",
".",
"musculus",
"Czech",
"II",
"x",
"C57BL",
"/",
"KsJ",
")",
"F1",
"x",
"C57BL",
"/",
"KsJ",
"intersubspecific",
"backcross",
"to",
"distal",
"mouse",
"chromosome",
"11",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5416 | [
"The",
"mapping",
"of",
"this",
"gene",
"to",
"a",
"region",
"highly",
"syntenic",
"with",
"human",
"chromosome",
"17",
",",
"coupled",
"with",
"Southern",
"and",
"Northern",
"analyses",
",",
"confirms",
"that",
"we",
"isolated",
"the",
"murine",
"Brca1",
"homologue",
"rather",
"than",
"a",
"related",
"RING",
"finger",
"gene",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5417 | [
"The",
"isolation",
"of",
"the",
"mouse",
"Brca1",
"homologue",
"will",
"facilitate",
"the",
"creation",
"of",
"mouse",
"models",
"for",
"germline",
"BRCA1",
"defects",
".",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0
] |
5418 | [
"Emerin",
"deficiency",
"at",
"the",
"nuclear",
"membrane",
"in",
"patients",
"with",
"Emery",
"-",
"Dreifuss",
"muscular",
"dystrophy",
"."
] | [
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] |
5419 | [
"Mutations",
"in",
"the",
"STA",
"gene",
"at",
"the",
"Xq28",
"locus",
"have",
"been",
"found",
"in",
"patients",
"with",
"X",
"-",
"linked",
"Emery",
"-",
"Dreifuss",
"muscular",
"dystrophy",
"(",
"EDMD",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
1,
0,
0
] |
5420 | [
"This",
"gene",
"encodes",
"a",
"hitherto",
"unknown",
"protein",
"named",
"emerin",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5421 | [
"To",
"elucidate",
"the",
"subcellular",
"localization",
"of",
"emerin",
",",
"we",
"raised",
"two",
"antisera",
"against",
"synthetic",
"peptide",
"fragments",
"predicted",
"from",
"emerin",
"cDNA",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5422 | [
"Using",
"both",
"antisera",
",",
"we",
"found",
"positive",
"nuclear",
"membrane",
"staining",
"in",
"skeletal",
",",
"cardiac",
"and",
"smooth",
"muscles",
"in",
"the",
"normal",
"controls",
"and",
"in",
"patients",
"with",
"neuromuscular",
"diseases",
"other",
"than",
"EDMD",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
1,
0
] |
5423 | [
"In",
"contrast",
",",
"a",
"deficiency",
"in",
"immunofluorescent",
"staining",
"of",
"skeletal",
"and",
"cardiac",
"muscle",
"from",
"EDMD",
"patients",
"was",
"observed",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0
] |
5424 | [
"A",
"34",
"kD",
"protein",
"is",
"immunoreactive",
"with",
"the",
"antisera",
"-",
"-",
"the",
"protein",
"is",
"equivalent",
"to",
"that",
"predicted",
"for",
"emerin",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5425 | [
"Together",
",",
"our",
"findings",
"suggest",
"the",
"specific",
"deficiency",
"of",
"emerin",
"in",
"the",
"nuclear",
"membrane",
"of",
"muscle",
"cells",
"in",
"patients",
"with",
"EDMD",
".",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0
] |
5426 | [
"Growth",
"retardation",
"and",
"tumour",
"inhibition",
"by",
"BRCA1",
"."
] | [
1,
2,
0,
1,
0,
0,
0,
0
] |
5427 | [
"Inherited",
"mutations",
"in",
"BRCA1",
"predispose",
"to",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
",",
"but",
"the",
"role",
"of",
"BRCA1",
"in",
"sporadic",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"has",
"previously",
"been",
"elusive",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5428 | [
"Here",
",",
"we",
"show",
"that",
"retroviral",
"transfer",
"of",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"BRCA1",
"gene",
"inhibits",
"growth",
"in",
"vitro",
"of",
"all",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"cell",
"lines",
"tested",
",",
"but",
"not",
"colon",
"or",
"lung",
"cancer",
"cells",
"or",
"fibroblasts",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0
] |
5429 | [
"Mutant",
"BRCA1",
"has",
"no",
"effect",
"on",
"growth",
"of",
"breast",
"cancer",
"cells",
";",
"ovarian",
"cancer",
"cell",
"growth",
"is",
"not",
"affected",
"by",
"BRCA1",
"mutations",
"in",
"the",
"5",
"portion",
"of",
"the",
"gene",
",",
"but",
"is",
"inhibited",
"by",
"3",
"BRCA1",
"mutations",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5430 | [
"Development",
"of",
"MCF",
"-",
"7",
"tumours",
"in",
"nude",
"mice",
"is",
"inhibited",
"when",
"MCF",
"-",
"7",
"cells",
"are",
"transfected",
"with",
"wild",
"-",
"type",
",",
"but",
"not",
"mutant",
",",
"BRCA1",
"."
] | [
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5431 | [
"Most",
"importantly",
",",
"among",
"mice",
"with",
"established",
"MCF",
"-",
"7",
"tumours",
",",
"peritoneal",
"treatment",
"with",
"a",
"retroviral",
"vector",
"expressing",
"wild",
"-",
"type",
"BRCA1",
"significantly",
"inhibits",
"tumour",
"growth",
"and",
"increased",
"survival",
".",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5432 | [] | [] |