Datasets:

ncbi_disease

like 38

[ "METHODS", "." ]

[ 0, 0 ]

[ "We", "studied", "80", "women", "in", "whom", "breast", "cancer", "was", "diagnosed", "before", "the", "age", "of", "35", ",", "and", "who", "were", "not", "selected", "on", "the", "basis", "of", "family", "history", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Genomic", "DNA", "was", "studied", "for", "BRCA1", "mutations", "by", "analysis", "involving", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphisms", "and", "with", "allele", "-", "specific", "assays", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Alterations", "were", "defined", "by", "DNA", "sequencing", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "RESULTS", "." ]

[ 0, 0 ]

[ "Germ", "-", "line", "BRCA1", "mutations", "were", "identified", "in", "6", "of", "the", "80", "women", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Four", "additional", "rare", "sequence", "variants", "of", "unknown", "functional", "importance", "were", "also", "identified", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "of", "the", "mutations", "and", "three", "of", "the", "rare", "sequence", "variants", "were", "found", "among", "the", "39", "women", "who", "reported", "no", "family", "history", "of", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0 ]

[ "None", "of", "the", "mutations", "and", "only", "one", "of", "the", "rare", "variants", "was", "identified", "in", "a", "reference", "population", "of", "73", "unrelated", "subjects", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "CONCLUSIONS", "." ]

[ 0, 0 ]

[ "Alterations", "in", "BRCA1", "were", "identified", "in", "approximately", "10", "percent", "of", "this", "cohort", "of", "young", "women", "with", "breast", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "risk", "of", "harboring", "a", "mutation", "was", "not", "limited", "to", "women", "with", "family", "histories", "of", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0 ]

[ "These", "results", "represent", "a", "minimal", "estimate", "of", "the", "frequency", "of", "BRCA1", "mutations", "in", "this", "population", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Comprehensive", "methods", "of", "identifying", "BRCA1", "mutations", "and", "understanding", "their", "importance", "will", "be", "needed", "before", "testing", "of", "women", "in", "the", "general", "population", "can", "be", "undertaken", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Novel", "inherited", "mutations", "and", "variable", "expressivity", "of", "BRCA1", "alleles", ",", "including", "the", "founder", "mutation", "185delAG", "in", "Ashkenazi", "Jewish", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Thirty", "-", "seven", "families", "with", "four", "or", "more", "cases", "of", "breast", "cancer", "or", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "were", "analyzed", "for", "mutations", "in", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Twelve", "different", "germ", "-", "line", "mutations", ",", "four", "novel", "and", "eight", "previously", "observed", ",", "were", "detected", "in", "16", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Five", "families", "of", "Ashkenazi", "Jewish", "descent", "carried", "the", "185delAG", "mutation", "and", "shared", "the", "same", "haplotype", "at", "eight", "polymorphic", "markers", "spanning", "approximately", "850", "kb", "at", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Expressivity", "of", "185delAG", "in", "these", "families", "varied", ",", "from", "early", "-", "onset", "breast", "cancer", "without", "ovarian", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Mutation", "4184delTCAA", "occurred", "independently", "in", "two", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "one", "family", ",", "penetrance", "was", "complete", ",", "with", "females", "developing", "early", "-", "onset", "breast", "cancer", "or", "ovarian", "cancer", "and", "the", "male", "carrier", "developing", "prostatic", "cancer", ",", "whereas", ",", "in", "the", "other", "family", ",", "penetrance", "was", "incomplete", "and", "only", "breast", "cancer", "occurred", ",", "diagnosed", "at", "ages", "38", "-", "81", "years", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "novel", "nonsense", "mutations", "led", "to", "the", "loss", "of", "mutant", "BRCA1", "transcript", "in", "families", "with", "10", "and", "6", "cases", "of", "early", "-", "onset", "breast", "cancer", "and", "ovarian", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0 ]

[ "A", "665", "-", "nt", "segment", "of", "the", "BRCA1", "3", "-", "UTR", "and", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "kb", "of", "genomic", "sequence", "including", "the", "putative", "promoter", "region", "were", "invariant", "by", "single", "-", "strand", "conformation", "analysis", "in", "13", "families", "without", "coding", "-", "sequence", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Overall", "in", "our", "series", ",", "BRCA1", "mutations", "have", "been", "detected", "in", "26", "families", "16", "with", "positive", "BRCA1", "lod", "scores", ",", "7", "with", "negative", "lod", "scores", "(", "reflecting", "multiple", "sporadic", "breast", "cancers", ")", ",", "and", "3", "not", "tested", "for", "linkage", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Three", "other", "families", "have", "positive", "lod", "scores", "for", "linkage", "to", "BRCA2", ",", "but", "13", "families", "without", "detected", "BRCA1", "mutations", "have", "negative", "lod", "scores", "for", "both", "BRCA1", "and", "BRCA2", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "new", "glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "variant", ",", "G6PD", "Orissa", "(", "44", "Ala", "-", "-", ">", "Gly", ")", ",", "is", "the", "major", "polymorphic", "variant", "in", "tribal", "populations", "in", "India", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Deficiency", "of", "glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "(", "G6PD", ")", "is", "usually", "found", "at", "high", "frequencies", "in", "areas", "of", "the", "world", "where", "malaria", "has", "been", "endemic", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "frequency", "and", "genetic", "basis", "of", "G6PD", "deficiency", "have", "been", "studied", "in", "Africa", ",", "around", "the", "Mediterranean", ",", "and", "in", "the", "Far", "East", ",", "but", "little", "such", "information", "is", "available", "about", "the", "situation", "in", "India", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "determine", "the", "extent", "of", "heterogeneity", "of", "G6PD", ",", "we", "have", "studied", "several", "different", "Indian", "populations", "by", "screening", "for", "G6PD", "deficiency", ",", "followed", "by", "molecular", "analysis", "of", "deficient", "alleles", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "frequency", "of", "G6PD", "deficiency", "varies", "between", "3", "%", "and", "15", "%", "in", "different", "tribal", "and", "urban", "groups", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Remarkably", ",", "a", "previously", "unreported", "deficient", "variant", ",", "G6PD", "Orissa", "(", "44", "Ala", "-", "-", ">", "Gly", ")", ",", "is", "responsible", "for", "most", "of", "the", "G6PD", "deficiency", "in", "tribal", "Indian", "populations", "but", "is", "not", "found", "in", "urban", "populations", ",", "where", "most", "of", "the", "G6PD", "deficiency", "is", "due", "to", "the", "G6PD", "Mediterranean", "(", "188", "Ser", "-", "-", ">", "Phe", ")", "variant", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "KmNADP", "of", "G6PD", "Orissa", "is", "fivefold", "higher", "than", "that", "of", "the", "normal", "enzyme", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "may", "be", "due", "to", "the", "fact", "that", "the", "alanine", "residue", "that", "is", "replaced", "by", "glycine", "is", "part", "of", "a", "putative", "coenzyme", "-", "binding", "site", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Evidence", "for", "linkage", "of", "bipolar", "disorder", "to", "chromosome", "18", "with", "a", "parent", "-", "of", "-", "origin", "effect", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "susceptibility", "gene", "on", "chromosome", "18", "and", "a", "parent", "-", "of", "-", "origin", "effect", "have", "been", "suggested", "for", "bipolar", "affective", "disorder", "(", "BPAD", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "We", "have", "studied", "28", "nuclear", "families", "selected", "for", "apparent", "unilineal", "transmission", "of", "the", "BPAD", "phenotype", ",", "by", "using", "31", "polymorphic", "markers", "spanning", "chromosome", "18", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Evidence", "for", "linkage", "was", "tested", "with", "affected", "-", "sib", "-", "pair", "and", "LOD", "score", "methods", "under", "two", "definitions", "of", "the", "affected", "phenotype", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "affected", "-", "sibpair", "analyses", "indicated", "excess", "allele", "sharing", "for", "markers", "on", "18p", "within", "the", "region", "reported", "previously", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "greatest", "sharing", "was", "at", "D18S37", "64", "%", "in", "bipolar", "and", "recurrent", "unipolar", "(", "RUP", ")", "sib", "pairs", "(", "P", "=", ".", "0006", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "excess", "sharing", "of", "the", "paternally", ",", "but", "not", "maternally", ",", "transmitted", "alleles", "was", "observed", "at", "three", "markers", "on", "18q", "at", "D18S41", ",", "51", "bipolar", "and", "RUP", "sib", "pairs", "were", "concordant", "for", "paternally", "transmitted", "alleles", ",", "and", "21", "pairs", "were", "discordant", "(", "P", "=", "0004", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "evidence", "for", "linkage", "to", "loci", "on", "both", "18p", "and", "18q", "was", "strongest", "in", "the", "11", "paternal", "pedigrees", ",", "i", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "e", "e", ".", ",", "those", "in", "which", "the", "father", "or", "one", "of", "the", "fathers", "sibs", "is", "affected", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "these", "pedigrees", ",", "the", "greatest", "allele", "sharing", "(", "81", "%", ";", "P", "=", ".", "00002", ")", "and", "the", "highest", "LOD", "score", "(", "3", ".", "51", ";", "phi", "=", "0", ".", "0", ")", "were", "observed", "at", "D18S41", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Our", "results", "provide", "further", "support", "for", "linkage", "of", "BPAD", "to", "chromosome", "18", "and", "the", "first", "molecular", "evidence", "for", "a", "parent", "-", "of", "-", "origin", "effect", "operating", "in", "this", "disorder", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "number", "of", "loci", "involved", ",", "and", "their", "precise", "location", ",", "require", "further", "study" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "prevalent", "mutation", "for", "galactosemia", "among", "black", "Americans", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "OBJECTIVE", "To", "define", "the", "mutation", "causing", "galactosemia", "in", "patients", "of", "black", "American", "origin", "who", "have", "no", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyltransferase", "(", "GALT", ")", "activity", "in", "erythrocytes", "but", "good", "clinical", "outcome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "METHODS", "We", "discovered", "a", "mutation", "caused", "by", "a", "C", "-", "-", ">", "T", "transition", "at", "base", "-", "pair", "1158", "of", "the", "GALT", "gene", "that", "results", "in", "a", "serine", "-", "to", "-", "leucine", "substitution", "at", "codon", "135", "(", "S135L", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "developed", "a", "method", "with", "which", "to", "screen", "populations", "for", "its", "prevalence", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "compared", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyltransferase", "among", "erythrocytes", ",", "leukocytes", ",", "and", "transformed", "lymphoblasts", ",", "as", "well", "as", "total", "body", "oxidation", "of", "D", "-", "(", "13C", ")", "-", "galactose", "to", "13CO2", "among", "three", "genotypes", "for", "GALT", "(", "S135L", "/", "S135L", ",", "Q188R", "/", "Q188R", ",", "and", "Normal", "/", "Normal", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "RESULTS", "We", "found", "a", "48", "%", "prevalence", "of", "the", "S135L", "mutation", "among", "17", "black", "American", "patients", "with", "classic", "galactosemia", "and", "a", "1", "%", "prevalence", "in", "a", "population", "of", "50", "black", "Americans", "without", "galactosemia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "The", "S135L", "mutation", "was", "not", "found", "in", "84", "white", "patients", "with", "G", "/", "G", "galactosemia", "nor", "in", "87", "white", "control", "subjects", "without", "galactosemia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "We", "found", "normal", "whole", "body", "oxidation", "of", "D", "-", "(", "13C", ")", "-", "galactose", "by", "the", "patient", "homozygous", "for", "S135L", "and", "various", "degrees", "of", "enzyme", "impairment", "among", "different", "tissues", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "CONCLUSIONS", "The", "S135L", "mutation", "in", "the", "GALT", "gene", "is", "a", "prevalent", "cause", "of", "galactosemia", "among", "black", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Because", "GALT", "activity", "varies", "in", "different", "tissues", "of", "patients", "homozygous", "for", "S135L", ",", "they", "may", "have", "a", "better", "clinical", "outcome", "than", "patients", "who", "are", "homozygous", "for", "Q188R", "when", "both", "are", "treated", "from", "infancy", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "high", "incidence", "of", "BRCA1", "mutations", "in", "20", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0 ]

[ "We", "have", "analyzed", "20", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", ",", "the", "majority", "of", "which", "show", "positive", "evidence", "of", "linkage", "to", "chromosome", "17q12", "for", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "BRCA1", "mutations", "cosegregating", "with", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "were", "identified", "in", "16", "families", ",", "including", "1", "family", "with", "a", "case", "of", "male", "breast", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "Nine", "of", "these", "mutations", "have", "not", "been", "reported", "previously", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "majority", "of", "mutations", "were", "found", "to", "generate", "a", "premature", "stop", "codon", "leading", "to", "the", "formation", "of", "a", "truncated", "BRCA1", "protein", "of", "2", "%", "-", "88", "%", "of", "the", "expected", "normal", "length", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "mutations", "altered", "the", "RING", "finger", "domain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Sequencing", "of", "genomic", "DNA", "led", "to", "the", "identification", "of", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "of", "BRCA1", "in", "12", "families", ",", "and", "cDNA", "analysis", "revealed", "an", "abnormal", "or", "missing", "BRCA1", "transcript", "in", "4", "of", "the", "8", "remaining", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "total", "of", "eight", "mutations", "were", "associated", "with", "a", "reduced", "quantity", "of", "BRCA1", "transcript", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "were", "unable", "to", "detect", "BRCA1", "mutations", "in", "4", "of", "the", "20", "families", ",", "but", "only", "1", "of", "these", "was", "clearly", "linked", "to", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "It", "is", "expected", "that", "the", "majority", "of", "clear", "examples", "of", "the", "breast", "-", "ovarian", "syndrome", "will", "be", "associated", "with", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "coding", "region", "of", "BRCA1", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Brca1", "deficiency", "results", "in", "early", "embryonic", "lethality", "characterized", "by", "neuroepithelial", "abnormalities", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", ",", "BRCA1", ",", "has", "been", "cloned", "and", "shown", "to", "encode", "a", "zinc", "-", "finger", "protein", "of", "unknown", "function", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutations", "in", "BRCA1", "account", "for", "at", "least", "80", "%", "of", "families", "with", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ",", "as", "well", "as", "some", "non", "-", "familial", "sporadic", "ovarian", "cancers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "loss", "of", "wild", "-", "type", "BRCA1", "in", "tumours", "of", "individuals", "carrying", "one", "nonfunctional", "BRCA1", "allele", "suggests", "that", "BRCA1", "encodes", "a", "tumour", "suppressor", "that", "may", "inhibit", "the", "proliferation", "of", "mammary", "epithelial", "cells", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "examine", "the", "role", "of", "BRCA1", "in", "normal", "tissue", "growth", "and", "differentiation", ",", "and", "to", "generate", "a", "potential", "model", "for", "the", "cancer", "susceptibility", "associated", "with", "loss", "of", "BRCA1", "function", ",", "we", "have", "created", "a", "mouse", "line", "carrying", "a", "mutation", "in", "one", "Brca1", "allele", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Analysis", "of", "mice", "homozygous", "for", "the", "mutant", "allele", "indicate", "that", "Brca1", "is", "critical", "for", "normal", "development", ",", "as", "these", "mice", "died", "in", "utero", "between", "10", "and", "13", "days", "of", "gestation", "(", "E10", "-", "E13", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Abnormalities", "in", "Brca1", "-", "deficient", "embryos", "were", "most", "evident", "in", "the", "neural", "tube", ",", "with", "40", "%", "of", "the", "embryos", "presenting", "with", "varying", "degrees", "of", "spina", "bifida", "and", "anencephaly", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "the", "neuroepithelium", "in", "Brca1", "-", "deficient", "embryos", "appeared", "disorganized", ",", "with", "signs", "of", "both", "rapid", "proliferation", "and", "excessive", "cell", "death", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Identification", "of", "mutations", "in", "the", "ALD", "-", "gene", "of", "20", "families", "with", "adrenoleukodystrophy", "/", "adrenomyeloneuropathy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0 ]

[ "Adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", ",", "an", "X", "-", "linked", "inherited", "metabolic", "disorder", ",", "is", "the", "most", "frequent", "inborn", "peroxisomal", "disease", "." ]

[ 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "It", "leads", "to", "demyelination", "in", "the", "central", "and", "peripheral", "nervous", "system", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Defective", "beta", "-", "oxidation", "of", "saturated", "very", "long", "chain", "fatty", "acids", "(", "VLCFAs", ";", "C22", "0", "-", "C26", "0", ")", "in", "peroxisomes", "has", "been", "shown", "to", "lead", "to", "an", "accumulation", "of", "VLCFAs", "in", "leukoid", "areas", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "peripheral", "nerves", ",", "adrenal", "gland", ",", "and", "blood", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "ALD", "gene", "has", "been", "recently", "identified", "and", "encodes", "a", "745", "-", "amino", "-", "acid", "protein", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "screened", "patients", "with", "adrenoleukodystrophy", "/", "adrenomyeloneuropathy", "(", "ALD", "/", "AMN", ")", "from", "20", "kindreds", "for", "mutations", "in", "the", "ALD", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "Eleven", "missense", "and", "two", "nonsense", "mutations", ",", "five", "deletions", ",", "and", "one", "insertion", "were", "detected", "by", "direct", "sequencing", "of", "eight", "reverse", "transcribed", "fragments", "of", "the", "ALD", "-", "gene", "mRNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Four", "mutations", "could", "be", "shown", "to", "be", "de", "novo", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "All", "mutations", "could", "be", "confirmed", "in", "carriers", "by", "sequencing", "genomic", "DNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "No", "correlation", "between", "the", "type", "of", "mutation", "and", "the", "severity", "of", "the", "phenotype", "could", "be", "observed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutations", "were", "not", "detected", "in", "the", "ALD", "gene", "of", "30", "healthy", "persons", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "murine", "homolog", "of", "the", "human", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", "Brca1", "maps", "to", "mouse", "chromosome", "11D", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "recently", "cloned", "human", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", ",", "BRCA1", ",", "is", "located", "on", "human", "chromosome", "17q21", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "isolated", "murine", "genomic", "clones", "containing", "Brca1", "as", "a", "first", "step", "in", "generating", "a", "mouse", "model", "for", "the", "loss", "of", "BRCA1", "function", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "mouse", "genomic", "library", "was", "screened", "using", "probes", "corresponding", "to", "exon", "11", "of", "the", "human", "BRCA1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "overlapping", "mouse", "clones", "were", "identified", "that", "hybridized", "to", "human", "BRCA1", "exons", "9", "-", "12", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Sequence", "analysis", "of", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "4", "kb", "of", "the", "region", "of", "these", "clones", "corresponding", "to", "part", "of", "human", "exon", "11", "revealed", "72", "%", "nucleic", "acid", "identity", "but", "only", "50", "%", "amino", "acid", "identity", "with", "the", "human", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "longest", "of", "the", "mouse", "Brca1", "genomic", "clones", "maps", "to", "chromosome", "11D", ",", "as", "determined", "by", "two", "-", "color", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "synteny", "to", "human", "chromosome", "17", "was", "confirmed", "by", "cohybridization", "with", "the", "mouse", "probe", "for", "the", "NF1", "-", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "comparative", "study", "confirms", "that", "the", "relative", "location", "of", "the", "BRCA1", "gene", "has", "been", "conserved", "between", "mice", "and", "humans", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Atelosteogenesis", "type", "II", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "-", "transporter", "gene", "(", "DTDST", ")", ":", "evidence", "for", "a", "phenotypic", "series", "involving", "three", "chondrodysplasias", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "Atelosteogenesis", "type", "II", "(", "AO", "II", ")", "is", "a", "neonatally", "lethal", "chondrodysplasia", "whose", "clinical", "and", "histological", "characteristics", "resemble", "those", "of", "another", "chondrodysplasia", ",", "the", "much", "less", "severe", "diastrophic", "dysplasia", "(", "DTD", ")", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "The", "similarity", "suggests", "a", "shared", "pathogenesis", "involving", "lesions", "in", "the", "same", "biochemical", "pathway", "and", "perhaps", "the", "same", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "DTD", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "recently", "identified", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "-", "transporter", "gene", "(", "DTDST", ")", "." ]

[ 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "report", "that", "AOII", "patients", "also", "have", "DTDST", "mutations", ",", "which", "lead", "to", "defective", "uptake", "of", "inorganic", "sulfate", "and", "insufficient", "sulfation", "of", "macromolecules", "by", "patient", "mesenchymal", "cells", "in", "vitro", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]