Datasets:

ncbi_disease

like 38

[ "A", "spectrum", "of", "different", "mutations", "has", "been", "reported", "in", "this", "disease", ",", "one", "missense", "mutation", "(", "Cys163Ser", ")", "being", "responsible", "for", "the", "majority", "of", "Finnish", "cases", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "were", "able", "to", "examine", "66", "Finnish", "AGU", "patients", "for", "changes", "in", "the", "oral", "mucosa", "and", "44", "of", "these", "for", "changes", "in", "facial", "skin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Biopsy", "specimens", "of", "16", "oral", "lesions", ",", "12", "of", "them", "associated", "with", "the", "teeth", ",", "plus", "two", "facial", "lesions", "were", "studied", "histologically", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Immunohistochemical", "staining", "for", "AGA", "was", "performed", "on", "15", "oral", "specimens", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Skin", "was", "seborrhoeic", "in", "adolescent", "and", "adult", "patients", ",", "with", "erythema", "of", "the", "facial", "skin", "already", "common", "in", "childhood", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Of", "44", "patients", ",", "nine", "(", "20", "%", ")", "had", "facial", "angiofibromas", ",", "tumours", "primarily", "occurring", "in", "association", "with", "tuberous", "sclerosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Oedemic", "buccal", "mucosa", "(", "leucoedema", ")", "and", "gingival", "overgrowths", "were", "more", "frequent", "in", "AGU", "patients", "than", "in", "controls", "(", "p", "<", "0", ".", "001", ")", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Of", "16", "oral", "mucosal", "lesions", "studied", "histologically", ",", "15", "represented", "fibroepithelial", "or", "epithelial", "hyperplasias", "and", "were", "reactive", "in", "nature", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Cytoplasmic", "vacuolisation", "was", "evident", "in", "four", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Immunohistochemically", ",", "expression", "of", "AGA", "in", "AGU", "patients", "mucosal", "lesions", "did", "not", "differ", "from", "that", "seen", "in", "corresponding", "lesions", "of", "normal", "subjects", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Thus", ",", "the", "high", "frequency", "of", "mucosal", "overgrowth", "in", "AGU", "patients", "does", "not", "appear", "to", "be", "directly", "associated", "with", "lysosomal", "storage", "or", "with", "alterations", "in", "the", "level", "of", "AGA", "expression", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Characterization", "of", "a", "germline", "mosaicism", "in", "families", "with", "Lowe", "syndrome", ",", "and", "identification", "of", "seven", "novel", "mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "oculocerebrorenal", "syndrome", "of", "Lowe", "(", "OCRL", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "disorder", "characterized", "by", "major", "abnormalities", "of", "eyes", ",", "nervous", "system", ",", "and", "kidneys", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", "have", "been", "associated", "with", "the", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "OCRL1", "encodes", "a", "phosphatidylinositol", "4", ",", "5", "-", "biphosphate", "(", "PtdIns", "[", "4", ",", "5", "]", "P2", ")", "5", "-", "phosphatase", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "examined", "the", "OCRL1", "gene", "in", "eight", "unrelated", "patients", "with", "OCRL", "and", "have", "found", "seven", "new", "mutations", "and", "one", "recurrent", "in", "-", "frame", "deletion", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Among", "the", "new", "mutations", ",", "two", "nonsense", "mutations", "(", "R317X", "and", "E558X", ")", "and", "three", "other", "frameshift", "mutations", "caused", "premature", "termination", "of", "the", "protein", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "missense", "mutation", ",", "R483G", ",", "was", "located", "in", "the", "highly", "conserved", "PtdIns", "(", "4", ",", "5", ")", "P2", "5", "-", "phosphatase", "domain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Finally", ",", "one", "frameshift", "mutation", ",", "2799delC", ",", "modifies", "the", "C", "-", "terminal", "part", "of", "OCRL1", ",", "with", "an", "extension", "of", "six", "amino", "acids", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Altogether", ",", "70", "%", "of", "missense", "mutations", "are", "located", "in", "exon", "15", ",", "and", "52", "%", "of", "all", "mutations", "cluster", "in", "exons", "11", "-", "15", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "also", "identified", "two", "new", "microsatellite", "markers", "for", "the", "OCRL1", "locus", ",", "and", "we", "detected", "a", "germline", "mosaicism", "in", "one", "family", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "observation", "has", "direct", "implications", "for", "genetic", "counseling", "of", "Lowe", "syndrome", "families", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0 ]

[ "MEFV", "-", "Gene", "analysis", "in", "armenian", "patients", "with", "Familial", "Mediterranean", "fever", ":", "diagnostic", "value", "and", "unfavorable", "renal", "prognosis", "of", "the", "M694V", "homozygous", "genotype", "-", "genetic", "and", "therapeutic", "implications", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessively", "inherited", "disorder", "that", "is", "common", "in", "patients", "of", "Armenian", "ancestry", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "date", ",", "its", "diagnosis", ",", "which", "can", "be", "made", "only", "retrospectively", ",", "is", "one", "of", "exclusion", ",", "based", "entirely", "on", "nonspecific", "clinical", "signs", "that", "result", "from", "serosal", "inflammation", "and", "that", "may", "lead", "to", "unnecessary", "surgery", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Renal", "amyloidosis", ",", "prevented", "by", "colchicine", ",", "is", "the", "most", "severe", "complication", "of", "FMF", ",", "a", "disorder", "associated", "with", "mutations", "in", "the", "MEFV", "gene", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "evaluate", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "-", "gene", "analysis", ",", "we", "investigated", "90", "Armenian", "FMF", "patients", "from", "77", "unrelated", "families", "that", "were", "not", "selected", "through", "genetic", "-", "linkage", "analysis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Eight", "mutations", ",", "one", "of", "which", "(", "R408Q", ")", "is", "new", ",", "were", "found", "to", "account", "for", "93", "%", "of", "the", "163", "independent", "FMF", "alleles", ",", "with", "both", "FMF", "alleles", "identified", "in", "89", "%", "of", "the", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "several", "instances", ",", "family", "studies", "provided", "molecular", "evidence", "for", "pseudodominant", "transmission", "and", "incomplete", "penetrance", "of", "the", "disease", "phenotype", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "M694V", "homozygous", "genotype", "was", "found", "to", "be", "associated", "with", "a", "higher", "prevalence", "of", "renal", "amyloidosis", "and", "arthritis", ",", "compared", "with", "other", "genotypes", "(", "P", "=", ".", "0002", "and", "P", "=", ".", "006", ",", "respectively", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "demonstration", "of", "both", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "analysis", "and", "particular", "modes", "of", "inheritance", "should", "lead", "to", "new", "ways", "for", "management", "of", "FMF", "-", "including", "genetic", "counseling", "and", "therapeutic", "decisions", "in", "affected", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Noninvasive", "test", "for", "fragile", "X", "syndrome", ",", "using", "hair", "root", "analysis", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Identification", "of", "the", "FMR1", "gene", "and", "the", "repeat", "-", "amplification", "mechanism", "causing", "fragile", "X", "syndrome", "led", "to", "development", "of", "reliable", "DNA", "-", "based", "diagnostic", "methods", ",", "including", "Southern", "blot", "hybridization", "and", "PCR", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Both", "methods", "are", "performed", "on", "DNA", "isolated", "from", "peripheral", "blood", "cells", "and", "measure", "the", "repeat", "size", "in", "FMR1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Using", "an", "immunocytochemical", "technique", "on", "blood", "smears", ",", "we", "recently", "developed", "a", "novel", "test", "for", "identification", "of", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "This", "method", ",", "also", "called", "\"", "antibody", "test", ",", "\"", "uses", "monoclonal", "antibodies", "against", "the", "FMR1", "gene", "product", "(", "FMRP", ")", "and", "is", "based", "on", "absence", "of", "FMRP", "in", "patients", "cells", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", "we", "describe", "a", "new", "diagnostic", "test", "to", "identify", "male", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ",", "on", "the", "basis", "of", "lack", "of", "FMRP", "in", "their", "hair", "roots", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Expression", "of", "FMRP", "in", "hair", "roots", "was", "studied", "by", "use", "of", "an", "FMRP", "-", "specific", "antibody", "test", ",", "and", "the", "percentage", "of", "FMRP", "-", "expressing", "hair", "roots", "in", "controls", "and", "in", "male", "fragile", "X", "patients", "was", "determined", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Control", "individuals", "showed", "clear", "expression", "of", "FMRP", "in", "nearly", "every", "hair", "root", ",", "whereas", "male", "fragile", "X", "patients", "lacked", "expression", "of", "FMRP", "in", "almost", "all", "their", "hair", "roots", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mentally", "retarded", "female", "patients", "with", "a", "full", "mutation", "showed", "FMRP", "expression", "in", "only", "some", "of", "their", "hair", "roots", "(", "<", "55", "%", ")", ",", "and", "no", "overlap", "with", "normal", "female", "controls", "was", "observed", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "advantages", "of", "this", "test", "are", "(", "1", ")", "plucking", "of", "hair", "follicles", "does", "no", "appreciable", "harm", "to", "the", "mentally", "retarded", "patient", ",", "(", "2", ")", "hairs", "can", "be", "sent", "in", "a", "simple", "envelope", "to", "a", "diagnostic", "center", ",", "and", "(", "3", ")", "the", "result", "of", "the", "test", "is", "available", "within", "5", "h", "of", "plucking", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "this", "test", "enabled", "us", "to", "identify", "two", "fragile", "X", "patients", "who", "did", "not", "show", "the", "full", "mutation", "by", "analysis", "of", "DNA", "isolated", "from", "blood", "cells", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", ",", "linkage", "to", "the", "HPC1", "locus", "on", "chromosome", "1q24", "-", "25", "is", "restricted", "to", "families", "with", "early", "-", "onset", "prostate", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Prostate", "cancer", "clusters", "in", "some", "families", ",", "and", "an", "estimated", "5", "%", "-", "10", "%", "of", "all", "cases", "are", "estimated", "to", "result", "from", "inheritance", "of", "prostate", "cancer", "-", "susceptibility", "genes", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "previously", "reported", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "1q24", "-", "25", "region", "(", "HPC1", ")", "in", "91", "North", "American", "and", "Swedish", "families", "each", "with", "multiple", "cases", "of", "prostate", "cancer", "(", "Smith", "et", "al", ".", "1996", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "the", "present", "report", "we", "analyze", "40", "(", "12", "original", "and", "28", "newly", "identified", ")", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", "(", "HPC", ")", "that", ",", "on", "the", "basis", "of", "40", "markers", "spanning", "a", "25", "-", "cM", "interval", "within", "1q24", "-", "25", ",", "have", "evidence", "of", "linkage", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "the", "complete", "set", "of", "families", ",", "a", "maximum", "two", "-", "point", "LOD", "score", "of", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "10", "was", "observed", "at", "D1S413", "(", "at", "a", "recombination", "fraction", "[", "theta", "]", "of", ".", "1", ")", ",", "with", "a", "maximum", "NPL", "(", "nonparametric", "linkage", ")", "Z", "score", "of", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "64", "at", "D1S202", "(", "P", "=", ".", "05", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "evidence", "of", "linkage", "to", "this", "region", "originated", "almost", "exclusively", "from", "the", "subset", "of", "12", "early", "-", "onset", "(", "age", "<", "65", "years", ")", "families", ",", "which", "yielded", "a", "maximum", "LOD", "score", "of", "2", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "38", "at", "D1S413", "(", "straight", "theta", "=", "0", ")", "and", "an", "NPL", "Z", "score", "of", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "95", "at", "D1S422", "(", "P", "=", ".", "03", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Estimates", "from", "heterogeneity", "tests", "suggest", "that", ",", "within", "Sweden", ",", "as", "many", "as", "50", "%", "of", "early", "-", "onset", "families", "had", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "HPC1", "region", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "results", "are", "consistent", "with", "the", "hypothesis", "of", "linkage", "to", "HPC1", "in", "a", "subset", "of", "families", "with", "prostate", "cancer", ",", "particularly", "those", "with", "an", "early", "age", "at", "diagnosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Molecular", "basis", "of", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", ":", "an", "animal", "model", "of", "mucopolysaccharidosis", "VII", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "A", "family", "of", "domestic", "cats", "was", "found", "that", "exhibited", "clinical", "and", "biochemical", "abnormalities", "consistent", "with", "mucopolysaccharidosis", "VII", ",", "an", "autosomal", "recessive", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0 ]

[ "beta", "-", "Glucuronidase", "activity", "was", "undetectable", "in", "affected", "cat", "fibroblasts", "and", "restored", "by", "retroviral", "gene", "transfer", "of", "rat", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "beta", "-", "Glucuronidase", "mRNA", "was", "normal", "in", "affected", "cat", "testis", "by", "Northern", "blot", "analysis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Normal", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", "was", "cloned", "and", "characterized", ",", "and", "amplified", "from", "affected", "cat", "fibroblasts", "by", "reverse", "transcription", "coupled", "polymerase", "chain", "reaction", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "There", "was", "a", "G", "-", "to", "-", "A", "transition", "in", "the", "affected", "cat", "cDNA", "that", "predicted", "an", "E351K", "substitution", ",", "destroyed", "a", "BssSI", "site", ",", "and", "eliminated", "GUSB", "enzymatic", "activity", "in", "expression", "studies", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Multiple", "species", "comparison", "and", "the", "crystal", "structure", "of", "human", "beta", "-", "glucuronidase", "indicated", "that", "E351", "is", "a", "highly", "conserved", "residue", "most", "likely", "essential", "in", "maintenance", "of", "the", "enzymes", "conformation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "BssSI", "digestion", "of", "polymerase", "chain", "reaction", "products", "amplified", "from", "genomic", "DNA", "indicated", "that", "affected", "cats", "were", "homozygous", "and", "cats", "with", "half", "-", "normal", "beta", "-", "glucuronidase", "activity", "were", "heterozygous", "for", "the", "missense", "mutation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Carriers", "identified", "in", "this", "manner", "produced", "affected", "kittens", "in", "prospective", "breedings", ",", "and", "a", "feline", "MPS", "VII", "breeding", "colony", "has", "been", "established", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "common", "molecular", "basis", "for", "rearrangement", "disorders", "on", "chromosome", "22q11", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "chromosome", "22q11", "region", "is", "susceptible", "to", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", "and", "malignant", "tumors", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Three", "congenital", "anomaly", "disorders", ",", "cat", "-", "eye", "syndrome", ",", "der", "(", ")", "syndrome", "and", "velo", "-", "cardio", "-", "facial", "syndrome", "/", "DiGeorge", "syndrome", "(", "VCFS", "/", "DGS", ")", "are", "associated", "with", "tetrasomy", ",", "trisomy", "or", "monosomy", ",", "respectively", ",", "for", "part", "of", "chromosome", "22q11", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "VCFS", "/", "DGS", "is", "the", "most", "common", "syndrome", "associated", "with", "22q11", "rearrangements", "." ]

[ 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "order", "to", "determine", "whether", "there", "are", "particular", "regions", "on", "22q11", "that", "are", "prone", "to", "rearrangements", ",", "the", "deletion", "end", "-", "points", "in", "a", "large", "number", "of", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "were", "defined", "by", "haplotype", "analysis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Most", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "have", "a", "similar", "3", "Mb", "deletion", ",", "some", "have", "a", "nested", "distal", "deletion", "breakpoint", "resulting", "in", "a", "1", "." ]

[ 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "5", "Mb", "deletion", "and", "a", "few", "rare", "patients", "have", "unique", "deletions", "or", "translocations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "high", "prevalence", "of", "the", "disorder", "in", "the", "population", "and", "the", "fact", "that", "most", "cases", "occur", "sporadically", "suggest", "that", "sequences", "at", "or", "near", "the", "breakpoints", "confer", "susceptibility", "to", "chromosome", "rearrangements", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "investigate", "this", "hypothesis", ",", "we", "developed", "hamster", "-", "human", "somatic", "hybrid", "cell", "lines", "from", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "with", "all", "three", "classes", "of", "deletions", "and", "we", "now", "show", "that", "the", "breakpoints", "occur", "within", "similar", "low", "copy", "repeats", ",", "termed", "LCR22s", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "support", "this", "idea", "further", ",", "we", "identified", "a", "family", "that", "carries", "an", "interstitial", "duplication", "of", "the", "same", "3", "Mb", "region", "that", "is", "deleted", "in", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0 ]

[ "We", "present", "models", "to", "explain", "how", "the", "LCR22s", "can", "mediate", "different", "homologous", "recombination", "events", ",", "thereby", "generating", "a", "number", "of", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "We", "identified", "five", "additional", "copies", "of", "the", "LCR22", "on", "22q11", "that", "may", "mediate", "other", "rearrangements", "leading", "to", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Functional", "consequences", "of", "mutations", "in", "the", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "correlate", "with", "severity", "of", "human", "myelinopathies", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "The", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "is", "a", "Cys2His2zinc", "finger", "transcription", "factor", "which", "is", "thought", "to", "play", "a", "role", "in", "the", "regulation", "of", "peripheral", "nervous", "system", "myelination", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "idea", "is", "based", "partly", "on", "the", "phenotype", "of", "homozygous", "Krox20", "(", "Egr2", ")", "knockout", "mice", ",", "which", "display", "hypomyelination", "of", "the", "PNS", "and", "a", "block", "of", "Schwann", "cells", "at", "an", "early", "stage", "of", "differentiation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutations", "in", "the", "human", "EGR2", "gene", "have", "recently", "been", "associated", "with", "the", "inherited", "peripheral", "neuropathies", "Charcot", "-", "Marie", "-", "Tooth", "type", "1", ",", "Dejerine", "-", "Sottas", "syndrome", "and", "congenital", "hypomyelinating", "neuropathy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "Three", "of", "the", "four", "EGR2", "mutations", "are", "dominant", "and", "occur", "within", "the", "zinc", "finger", "DNA", "-", "binding", "domain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "fourth", "mutation", "is", "recessive", "and", "affects", "the", "inhibitory", "domain", "(", "R1", ")", "that", "binds", "the", "NAB", "transcriptional", "co", "-", "repressors", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "combination", "of", "DNA", "-", "binding", "assays", "and", "transcriptional", "analysis", "was", "used", "to", "determine", "the", "functional", "consequences", "of", "these", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "zinc", "finger", "mutations", "affect", "DNA", "binding", "and", "the", "amount", "of", "residual", "binding", "directly", "correlates", "with", "disease", "severity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "R1", "domain", "mutation", "prevents", "interaction", "of", "EGR2", "with", "the", "NAB", "co", "-", "repressors", "and", "thereby", "increases", "transcriptional", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "data", "provide", "insight", "into", "the", "possible", "disease", "mechanisms", "underlying", "EGR2", "mutations", "and", "the", "reason", "for", "varying", "severity", "and", "differences", "in", "inheritance", "patterns", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Autosomal", "recessive", "familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "with", "continued", "secretion", "of", "mutant", "weakly", "active", "vasopressin", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "characterized", "by", "post", "-", "natal", "development", "of", "arginine", "vasopressin", "(", "AVP", ")", "deficiency", "due", "to", "mutations", "in", "the", "AVP", "gene", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "All", "published", "mutations", "affect", "the", "signal", "peptide", "or", "the", "neurophysin", "-", "II", "carrier", "protein", "and", "are", "presumed", "to", "interfere", "with", "processing", "of", "the", "preprohormone", ",", "leading", "to", "neuronal", "damage", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "We", "studied", "an", "unusual", "Palestinian", "family", "consisting", "of", "asymptomatic", "first", "cousin", "parents", "and", "three", "children", "affected", "with", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", ",", "suggesting", "autosomal", "recessive", "inheritance", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "All", "three", "affected", "children", "were", "homozygous", "and", "the", "parents", "heterozygous", "for", "a", "single", "novel", "mutation", "(", "C301", "-", ">", "T", ")", "in", "exon", "1", ",", "replacing", "Pro7", "of", "mature", "AVP", "with", "Leu", "(", "Leu", "-", "AVP", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Leu", "-", "AVP", "was", "a", "weak", "agonist", "with", "approximately", "30", "-", "fold", "reduced", "binding", "to", "the", "human", "V2", "receptor", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Measured", "by", "radioimmunoassay", "with", "a", "synthetic", "Leu", "-", "AVP", "standard", ",", "serum", "Leu", "-", "AVP", "levels", "were", "elevated", "in", "all", "three", "children", "and", "further", "increased", "during", "water", "deprivation", "to", "as", "high", "as", "30", "times", "normal", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "youngest", "child", "(", "2", "years", "old", ")", "was", "only", "mildly", "affected", "but", "had", "Leu", "-", "AVP", "levels", "similar", "to", "her", "severely", "affected", "8", "-", "year", "-", "old", "brother", ",", "suggesting", "that", "unknown", "mechanisms", "may", "partially", "compensate", "for", "a", "deficiency", "of", "active", "AVP", "in", "very", "young", "children", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "X", "inactivation", "and", "somatic", "cell", "selection", "rescue", "female", "mice", "carrying", "a", "Piga", "-", "null", "mutation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "somatic", "mutation", "in", "the", "X", "linked", "PIGA", "gene", "is", "responsible", "for", "the", "deficiency", "of", "glycosyl", "phosphatidylinositol", "(", "GPI", ")", "-", "anchored", "proteins", "on", "blood", "cells", "from", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "No", "inherited", "form", "of", "GPI", "-", "anchor", "deficiency", "has", "been", "described", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Because", "conventional", "Piga", "gene", "knockout", "is", "associated", "with", "high", "embryonic", "lethality", "in", "chimeric", "mice", ",", "we", "used", "the", "Cre", "/", "loxP", "system", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "generated", "mice", "in", "which", "two", "loxP", "sites", "flank", "part", "of", "Piga", "exon", "2", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "After", "crossbreeding", "with", "female", "mice", "of", "the", "EIIa", "-", "cre", "strain", ",", "the", "floxed", "allele", "undergoes", "Cre", "-", "mediated", "recombination", "with", "high", "efficiency", "during", "early", "embryonic", "development", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Because", "of", "X", "chromosome", "inactivation", ",", "female", "offspring", "are", "mosaic", "for", "cells", "that", "express", "or", "lack", "GPI", "-", "linked", "proteins", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]