কোলিসিন

কোলিসিন(Colicin) হল এক প্রকার ব্যাক্টেওসিন যা এশেরিকিয়া কোলাই-এর কিছু স্ট্রেইনের দ্বারা উৎপাদিত এবং বিষাক্ত জাতীয় প্রোটিন। অন্যান্য ব্যাকটেরিয়াল স্ট্রেন থেকে প্রতিযোগিতা কমাতে পরিবেশে কোলিসিনগুলিকে ছেড়ে দেওয়া হয়। কোলিসিনগুলি বাহ্যিক ঝিল্লি রিসেপ্টর এর সাথে আবদ্ধ হয়, তাদের ব্যবহার করে সাইটোসল বা সাইটোপ্লাজমিক ঝিল্লিতে ট্রান্সলোকেট ব্যবহার করে, যেখানে তারা সাইটোটোক্সিক প্রভাব প্রয়োগ করে, যার মধ্যে সাইটোপ্লাজমিক ডিপোলারাইজেশনও রয়েছে। ঝিল্লি, DNase কার্যকলাপ, RNase কার্যকলাপ, বা মুরামিন সংশ্লেষণের বাধা।কোলিসিন হল এক ধরনের ব্যাক্টেরিওসিন - পেপ্টাইড এবং প্রোটিন অ্যান্টিবায়োটিক যা ব্যাকটেরিয়া দ্বারা নির্গত হয় একই প্রজাতির অন্যান্য ব্যাক্টেরিয়াকে মেরে ফেলার জন্য, যাতে পুষ্টির অধিগ্রহণের জন্য প্রতিযোগিতামূলক সুবিধা প্রদান করা যায়। কোলিসিন অনেকটা মাইক্রোসিন নামক ব্যাক্টেরিওসিনের সমগোত্রীয় হয়ে থাকে।কোলিসিন নামক ব্যাক্টেরিওসিন বা অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপ্টাইডের রাসায়নিক সংকেত হলো (C₂₁H₂₄N₂O₆S₂)। চ্যানেল গঠনকারী কোলিসিন (কোলিসিন A, B, E1, Ia, Ib, এবং N) হল ট্রান্সমেমব্রেন প্রোটিন যা সাইটোপ্লাজমিক মেমব্রেনকে ডাইপোলারাইজ করে, যার ফলে সেলুলার শক্তির অপচয় হয়। এই কোলিসিনগুলি কমপক্ষে তিনটি ডোমেইন রয়েছে: একটি N-টার্মিনাল ট্রান্সলোকেশন ডোমেইন যা বাহ্যিক ঝিল্লি এবং পেরিপ্লাজমিক স্পেস (টি ডোমেইন) জুড়ে চলাচলের জন্য দায়ী; রিসেপ্টর স্বীকৃতির জন্য দায়ী একটি কেন্দ্রীয় ডোমেন (R ডোমেইন); এবং সাইটোপ্লাজমিক মেমব্রেনে চ্যানেল গঠনের জন্য দায়ী একটি সি-টার্মিনাল সাইটোটক্সিক ডোমেইন (সি ডোমেইন)। R ডোমেন লক্ষ্যকে নিয়ন্ত্রণ করে এবং সংবেদনশীল কোষের রিসেপ্টরের সাথে আবদ্ধ হয়। T ডোমেইন ট্রান্সলোকেশনের সাথে জড়িত, টার্গেট সেলের মেশিনারিকে কো-অপ্ট করে। সি ডোমেইন হল 'হত্যাকারী' ডোমেইন এবং লক্ষ্যবস্তুতে একটি ছিদ্র তৈরি করতে পারে কোষ ঝিল্লি, বা নিউক্লিয়াস হিসাবে কাজ করে ডিএনএ বা আরএনএ কাটার জন্য। টার্গেট সেল। বেশিরভাগ কোলিসিন দুই-রিসেপ্টর সিস্টেমের মাধ্যমে বাইরের ঝিল্লি স্থানান্তর করতে সক্ষম হয়, যেখানে একটি রিসেপ্টর প্রাথমিক বাঁধাইয়ের জন্য এবং দ্বিতীয়টি স্থানান্তরের জন্য ব্যবহৃত হয়। প্রাথমিক বাঁধাই হল কোষের পৃষ্ঠের রিসেপ্টর যেমন বাইরের ঝিল্লি প্রোটিন OmpF, FepA, BtuB, Cir এবং FhuA; কোলিসিনগুলি কোন রিসেপ্টরগুলির সাথে আবদ্ধ হয় সে অনুসারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। নির্দিষ্ট পেরিপ্লাজমিক প্রোটিনের উপস্থিতি, যেমন TolA, TolB, TolC, বা TonB, মেমব্রেন জুড়ে স্থানান্তরের জন্য প্রয়োজন৷ Cloacin DF13 হল একটি ব্যাক্টেরিওসিন যা একটি নির্দিষ্ট সাইটে 30S রাইবোসোমে 16S RNA হাইড্রোলাইজিং করে রাইবোসোমকে নিষ্ক্রিয় করে৷ যেহেতু তারা নির্দিষ্ট রিসেপ্টরকে টার্গেট করে এবং নির্দিষ্ট ট্রান্সলোকেশন যন্ত্রপাতি ব্যবহার করে, কোষগুলি এই প্রোটিনের জন্য জিনগুলিকে দমন করে বা মুছে ফেলে কোলিসিনের বিরুদ্ধে প্রতিরোধী করে তুলতে পারে। এই ধরনের প্রতিরোধী কোষগুলি মূল পুষ্টির (যেমন আয়রন বা বি ভিটামিন) এর অভাব ভোগ করতে পারে, কিন্তু নিহত না হয়ে উপকৃত হতে পারে। কোলিসিন একটি '1-হিট কিলিং কাইনেটিক' [যাচাই করার জন্য উদ্ধৃতি প্রয়োজন] প্রদর্শন করে যার অর্থ এই নয় যে একটি একক অণু হত্যা করার জন্য যথেষ্ট, তবে অবশ্যই এটি শুধুমাত্র একটি ছোট সংখ্যা নেয়। তার 1969 সালের নোবেল বিজয়ী বক্তৃতায়, সালভাডর ই. লুরিয়া অনুমান করেছিলেন যে কোলিসিনগুলি শুধুমাত্র একটি ডোমিনো প্রভাব সৃষ্টি করে যা কোষের ঝিল্লিকে অস্থিতিশীল করে এমন বিষাক্ত হতে পারে। তিনি সম্পূর্ণরূপে সঠিক ছিলেন না, কিন্তু ছিদ্র-গঠনকারী কোলিসিন ঝিল্লিকে ডিপোলারাইজ করে এবং এইভাবে কোষের শক্তির উৎসকে বাদ দেয় . কোলিসিনগুলি অত্যন্ত কার্যকর টক্সিন।[তথ্যসূত্র প্রয়োজন] কার্যত সমস্ত কোলিসিন প্লাসমিড-এ বহন করা হয়। কোলিসিনোজেনিক প্লাজমিডের দুটি সাধারণ শ্রেণি হল বড়, কম-কপি-সংখ্যার প্লাজমিড এবং ছোট, উচ্চ-কপি-সংখ্যার প্লাজমিড। বৃহত্তর প্লাজমিড অন্যান্য জিন বহন করে, সেইসাথে কোলিসিন অপেরন। কোলিসিন অপেরনগুলি সাধারণত কয়েকটি প্রধান জিন দিয়ে সংগঠিত হয়। এর মধ্যে রয়েছে একটি কোলিসিন স্ট্রাকচারাল জিন, একটি ইমিউনিটি জিন এবং একটি ব্যাক্টেরিওসিন রিলিজ প্রোটিন (বিআরপি), বা লাইসিস, জিন। অনাক্রম্যতা জিনটি প্রায়শই গঠনগতভাবে উৎপাদিত হয়, যখন BRP সাধারণত শুধুমাত্র কোলিসিন স্ট্রাকচারাল জিনের স্টপ কোডন রিড-থ্রু হিসাবে উৎপাদিত হয়। কোলিসিন নিজেই SOS প্রতিক্রিয়া দ্বারা দমন করা হয় এবং অন্যান্য উপায়েও নিয়ন্ত্রিত হতে পারে। কোলিসিন প্লাসমিড ধরে রাখা তাদের আত্মীয়দের সাথে বসবাসকারী কোষগুলির জন্য খুবই গুরুত্বপূর্ণ, কারণ যদি একটি কোষ অনাক্রম্যতা জিন হারায়, তবে এটি দ্রুত কলিসিন সঞ্চালনের মাধ্যমে ধ্বংসের বিষয় হয়ে ওঠে। একই সময়ে, কোলিসিন শুধুমাত্র লাইসিস প্রোটিন ব্যবহার করে একটি উৎপাদনকারী কোষ থেকে নিঃসৃত হয়, যার ফলে সেই কোষের মৃত্যু ঘটে। এই আত্মঘাতী উৎপাদন প্রক্রিয়াটি অত্যন্ত ব্যয়বহুল বলে মনে হবে, এটি এসওএস প্রতিক্রিয়া দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হওয়া ছাড়া, যা উল্লেখযোগ্য ডিএনএ ক্ষতির প্রতিক্রিয়া জানায়। সংক্ষেপে, কোলিসিন উৎপাদন শুধুমাত্র অপ্রত্যাশিত কোষে ঘটতে পারে। প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া এবং স্বীকৃতির বৈশিষ্ট্য নির্ধারণ এবং তদন্তের জন্য একটি মডেল সিস্টেম হিসাবে অক্সফোর্ড বিশ্ববিদ্যালয়-এর অধ্যাপক ক্লিনথাউস রিসার্চ গ্রুপ বিস্তৃতভাবে কোলিসিনগুলি অধ্যয়ন করে৷ ব্যাক্টিবেস(Bactibase) কোলিসিন বিবর্তনের আণবিক প্রক্রিয়া archive.org/web/20060224032938/http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/reprint/10/6/1380 pdf নতুন বৈশিষ্ট্যযুক্ত কোলিসিন ওয়াই ছিদ্র-প্রাক্তন কোলিসিন বৈচিত্র্যের ইতিবাচক নির্বাচনের প্রমাণ দেয় Colicin OPM ডাটাবেস 3D ইন্টারেক্টিভ পেজ কোলিসিন সম্পর্কে কোলিসিনের জন্য পরিবহন শ্রেণিবিন্যাস ডেটাবেস তালিকা প্রোটিন ডেটা ব্যাংক কোলিসিন তালিকা টেমপ্লেট:ইন্টারপ্রো সামগ্রী বিভাগ:ব্যাকটেরিওসিন শ্রেণি:বিষাক্তবিদ্যা বিভাগ:পেরিফেরাল মেমব্রেন প্রোটিন বিভাগ:এসচেরিচিয়া কোলি টেমপ্লেট:জার্নাল উদ্ধৃত করুন Cramer WA, Zakharov SD, Antonenko YN, Kotova EA (২০০৪)। "কোলিসিন ছিদ্র গঠনে লিপিডের ভূমিকার উপর"। 1666 (1): 239–49। ডিওআই:10.1016/j.bbamem.2004.07.001 । পিএমআইডি 15519318।  অজানা প্যারামিটার |জার্নাল= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) Cascales et al. (2007)। "কোলিসিন জীববিজ্ঞান"। মাইক্রোবায়ো। এবং মোল। বায়ো রেভ. 71(1), 158-229। বিমূর্ত pdf Wiener, Michael; Freymann, Douglas; Ghosh, Partho; Stroud, Robert M. (জানুয়ারী ১৯৯৭)। "কোলিসিন Ia এর ক্রিস্টাল গঠন"। Nature (ইংরেজি ভাষায়)। 385 (6615): 461–464। আইএসএসএন 1476-4687। ডিওআই:10.1038/385461a0। উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) Cao Z, Klebba PE (২০০২)। "বাইরের মেমব্রেন পোরিনের মাধ্যমে কোলিসিন বাঁধাই এবং পরিবহনের প্রক্রিয়া"। Biochimie। 84 (5–6): 399–412। ডিওআই:16. /S0300-9084(02)01455-4 |doi= এর মান পরীক্ষা করুন (সাহায্য)। পিএমআইডি 12423783। উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) van den Elzen PJ, Gaastra W, বানান CE ., de Graaf FK, Veltkamp E, Nijkamp HJ শিরোনাম = অনাক্রম্যতা জিনের আণবিক গঠন এবং ব্যাক্টেরিওসিনোজেনিক প্লাজমিডের অনাক্রম্যতা প্রোটিন Clo DF13 জার্নাল = নিউক্লিক অ্যাসিড রেস। (অক্টোবর ১৯৮০)। : 4349–63। ডিওআই:10.1093/nar/8.19.4349। পিএমআইডি 6253914। পিএমসি 324244  //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC324244।  অজানা প্যারামিটার |সমস্যা= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য); অজানা প্যারামিটার |আয়তন= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য); ভ্যানকুভার শৈলীতে ত্রুটি: punctuation (সাহায্য); |শিরোনাম= অনুপস্থিত বা খালি (সাহায্য) টেমপ্লেট:Cite joursnal" ডেন এলজেন পিজে, ভেল্টক্যাম্প ই, নিজক্যাম্প এইচজে, ওয়াল্টারস এইচ nobel_prizes/medicine/laureates/1969/luria-lecture.html লুরিয়া, এস.ই. (1969) নোবেল বক্তৃতা Mader, Andreas; von Bronk, Benedikt; ইওয়াল্ড, Benedikt; Kesel, Sara; Schnetz, Karin; Frey, Erwin; Opitz, Madeleine (2015-03=Amounti)। PLoS ONE। 10: e0119124। আইএসএসএন 1932-6203। ডিওআই:10.1371/journal.pone.0119124। পিএমআইডি 25751274। পিএমসি 4353708  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4353708/।  অজানা প্যারামিটার |1= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য); অজানা প্যারামিটার |ইস্যু= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য); এখানে তারিখের মান পরীক্ষা করুন: |তারিখ= (সাহায্য); |শিরোনাম= অনুপস্থিত বা খালি (সাহায্য)উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) "Kleanthous Research Group"। ৬ মে ২০১৭ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। সংগ্রহের তারিখ ২৩ মে ২০১৭। উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) Hammami R, Zouhir A, Ben Hamida J, Fliss I (২০০৭)। "BACTIBASE: ব্যাক্টেরিওসিন ক্যারেক্টারাইজেশনের জন্য একটি নতুন ওয়েব অ্যাক্সেসযোগ্য ডাটাবেস"। BMC মাইক্রোবায়োলজি: 89। ডিওআই:10.1186/1471-2180-7-89। পিএমআইডি 17941971। পিএমসি 2211298 ।  অজানা প্যারামিটার |Volume= উপেক্ষা করা হয়েছে (|volume= ব্যবহারের পরামর্শ দেয়া হচ্ছে) (সাহায্য)উদ্ধৃতি টেমপ্লেট ইংরেজি প্যারামিটার ব্যবহার করেছে (link) টেমপ্লেট:রিফ্লিস্ট