合理的設計 (生物工学)

合理的設計（ごうりてきせっけい、、ラショナルデザイン）とは化学生物学やの分野において、物理モデルを用いて分子の構造がどのように作用するかを予測し、特定の機能を備えた新しい分子を作り出す戦略を総称する用語である。これには、最初から作る場合と、既知の構造上に数理モデルで作る場合があり、通常、定向進化と対比される。
応用.
例えば、コラーゲンの安定性の解読、リガンドと受容体の相互作用のマッピング、タンパク質のフォールディングとダイナミクスの解明、フッ素化アミノ酸を用いた生体外構造の構築などに合理的設計が用いられている。癌（がん）の治療では、合理的設計により、細胞とその環境とのコミュニケーションを変更するようにタンパク質を設計する標的治療が行われる。また、複合体に結合し、その形成を阻害できるオーキシン類似体であるアルファ-アルキルオーキシン分子の合理的設計も行われている。
合理的設計の他の応用例は次のとおりである。