AFCチャンピオンズリーグ2016 決勝トーナメント

本記事ではAFCチャンピオンズリーグ2016の決勝トーナメント（knockout phase）について述べる。
トーナメント表.
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ラウンド16.
ラウンド16では各グループの1位が同ゾーン他グループの2位とホーム・アンド・アウェー方式で対戦する。各グループ1位のチームは第二戦をホームで戦う。
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!colspan=5|西地区
!colspan=5|東地区
西地区.
"二試合合計スコア 2 - 1でロコモティフ・タシュケントが準々決勝進出"
"二試合合計スコア 5 - 4でアル・ナスル・ドバイが準々決勝進出"
"二試合合計スコア 3 - 1でアル・アインが準々決勝進出"
"二試合合計スコア 6 - 4でアル・ジャイシュSCが準々決勝進出"
東地区.
"二試合合計スコア 3 - 2で全北現代モータースが準々決勝進出"
"二試合合計スコア 2 - 2、アウェーゴール差で上海上港が準々決勝進出"
"二試合合計スコア 3 - 3、PK戦 7 - 6でFCソウルが準々決勝進出"
"二試合合計スコア 3 - 3、アウェーゴール差で山東魯能が準々決勝進出"
準々決勝.
<section begin=準々決勝 />
準々決勝から決勝までの組み合わせ抽選会は、2016年6月9日に行われた。この抽選では、異なるゾーンのチームは決勝まで対戦することはなく、「カントリー・プロテクション (同一協会所属で2チーム以上が勝ち残った場合、当該チーム間の対戦を避ける)」は適用されない。
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!colspan=5|東地区
西地区.
"二試合合計スコア 1 - 0でアル・アインが準決勝進出"
(注) 試合は0 - 3でアル・ナスル・ドバイが勝利したものの、この試合に出場したヴァンデルレイがアジア枠での起用を可能にするために虚偽のパスポート (インドネシア国籍)を使用していたことが発覚したため、没収試合 (アル・ジャイシュの3-0での勝利扱い) とされた。アル・ナスル・ドバイは罰金ならびにAFCチャンピオンズリーグ2018の出場禁止処分を科された。
"二試合合計スコア 4 - 0でアル・ジャイシュが準決勝進出"
東地区.
"二試合合計スコア 0 - 5で全北現代モータースが準決勝進出"
"二試合合計スコア 4 - 2でFCソウルが準決勝進出"
準決勝.
<section begin=準決勝 />
!colspan=5|西地区
!colspan=5|東地区
西地区.
"二試合合計スコア 5 - 3でアル・アインが決勝進出"
東地区.
"二試合合計スコア 5 - 3で全北現代モータースが決勝進出"
決勝.
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"二試合合計スコア 3 - 2で全北現代モータースが優勝"
<section end=決勝 />