2016年Billboard Japan Hot 100シングル1位の一覧

以下は、2016年のBillboard Japan Hot 100チャートシングル1位の一覧である。Billboard Japan Hot 100（以下Japan Hot 100）は、日本におけるシングルのヒットをランク付けした音楽チャートの一つである。Japan Hot 100は、CDセールスのみでは捉えられない世間のヒット感覚をチャートに反映させるため、CDセールスに加えてデジタルセールス、ストリーミング、動画再生回数、ラジオ・エアプレイ、ルックアップ、ツイート数からなる7つのデータを複合した総合チャートとして公開されている。
2016年は、48曲がJapan Hot 100において首位を獲得している。特に星野源の「恋」は、2016年だけで5週間にわたり首位を記録。翌年2017年のJapan Hot 100においても首位を記録し続け、2017年2月時点で7週連続、通算11週間にわたってチャート首位を記録している。2016年のJapan Hot 100年間チャートでも第3位を記録している。RADWIMPSは、映画『君の名は。』の映画音楽として使用された「前前前世」が週間1位を獲得。週間チャートこそ1週のみの首位に留まったが、年間ベースではポイントを積み上げ、同年間チャートで第2位を記録している。AKB48は、「君はメロディー」、「翼はいらない」、「LOVE TRIP」、「ハイテンション」の4曲が2016年のJapan Hot 100首位を獲得している。特に「翼はいらない」は『AKB48 45thシングル選抜総選挙』の投票券がCD盤『翼はいらない』に封入された影響もあり、発売初週のみでサウンドスキャンジャパン調べで241.7万枚を売上、CDセールスが牽引する形で年間チャートにおいても第1位を記録した。
その他週間1位を獲得した楽曲としては、5月に首位を記録した嵐「I seek」が年間チャートで16位を記録。乃木坂46は2016年に「ハルジオンが咲く頃」、「裸足でSummer」、「サヨナラの意味」の3曲を週間チャート首位に送り込み、年間チャートでも「ハルジオンが咲く頃」が19位、「裸足でSummer」が15位、「サヨナラの意味」が13位となった。1月に首位を記録した西野カナの「トリセツ」は年間チャートでも11位を記録した他、ピコ太郎の「PPAP ペンパイナッポーアッポーペン」は、YouTubeから生まれたヒットとして11月に週間チャート首位を獲得し、年間チャートにおいても第6位を記録。米ビルボードによる全米シングルチャートBillboard Hot 100でも「PPAP」は週間77位を記録している。欅坂46は、「サイレントマジョリティー」、「世界には愛しかない」、「二人セゾン」の3曲をJapan Hot 100チャートに週間首位として送り込んでいる。特に「サイレントマジョリティー」は他のアイドルとは一線を画したメッセージ性の強い歌詞とダンスが注目を浴び、年間チャートでも10位を記録する大ヒットとなり、多くの記録を生み出した。