2006年のJFAプリンスリーグU-18

JFAプリンスリーグU-18の2006年度の大会である。
北海道.
5月6日から7月23日にかけて開催。
出典：
<br>（敗れて降格）
東北.
4月15日から7月16日にかけて開催。
関東.
JFAプリンスリーグ U-18 関東 2006。2006年4月9日から2006年7月17日にかけて開催された。
参加チーム.
JFAプリンスリーグ U-18 関東 2006に参加したチームは次の表のとおり。昨2005年度本リーグに残留した12チームと、関東の都県から推薦された8チーム、計20チームが参加した。
出典: 
グループリーグ.
グループリーグの結果は、次のようになった。
出典: 
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順位決定戦.
2006年7月15日と17日に順位決定戦が行われた。その結果、横浜F・マリノスユースが優勝し、上位3チームの第17回高円宮杯U-18出場と、上位12チームの残留が決まった。なお、東京ヴェルディユースは、第30回日本クラブユース選手権準優勝により第17回高円宮杯U-18に出場した。また、下位8チームは都県ごとの参入戦を戦い、群馬県立前橋商業高校、山梨県立韮崎高校、埼玉県立浦和東高校の3校は参入戦勝利により、残留が決まった。
出典: 
北信越.
4月29日から7月9日にかけて開催。
東海.
4月15日から7月15日にかけて開催。
関西.
4月9日から7月23日にかけて開催。
中国.
3月18日から7月22日にかけて開催。
四国.
4月8日から7月22日にかけて開催。
九州.
4月8日から8月19日にかけて開催。