1999年の全日本F3選手権

1999年の全日本F3選手権は、1999年（平成11年）3月20日 - 21日に鈴鹿サーキットで開幕し、同年11月13日 - 14日に鈴鹿サーキットで閉幕した全10戦のシーズンである。シリーズチャンピオンはダレン・マニング（イギリス）が獲得した。