Гаплогруппа U4a1 — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека. U4a1 возможно, может быть прослежена до неолита в Восточной Европе и на Кавказе. Эти линии мтДНК, вероятно, были вовлечены в позднеледниковую экспансию из восточноевропейских рефугиумов (мест выживания) после LGM (ледниковых периодов), (примерно за 12 000–19 000 лет до настоящего времени) .
 Гаплогруппа U4a1 в значительной степени характеризуется восточноевропейским и западносибирским распространением, обнаруживаемым с наибольшей частотой 7–21% в таких популяциях, как марийцы, чуваши и кеты. 4,5% в Волго-Уральском регионе (марийцы, коми-зыряне, коми-пермяки, мордвины, удмурты, чуваши, татары и башкиры); 1% в центральной и восточной Европе (русские, белорусы, украинцы, поляки и словаки); 0,9% в северной Европе (финны, карелы, эстонцы, латыши и литовцы); 0.5% в центральной и западной Европе (британцы, немцы, чехи, австрийцы, швейцарцы, боснийцы, словенцы, итальянцы, французы, испанцы и португальцы).
Интересно, что среди восточных славян (русских и белорусов) выявлен единственный специфический субклад U4a1a1, тогда как у западных славян обнаружены остальные субклады. Оценка времени слияния полных геномов U4a1 составила 14 650 ± 2 400 YBP. Это значение близко к значениям (около 10 000–14 000 YBP), рассчитанным на основе данных первого гипервариабельного сегмента (HVS1) для центральноевропейского (германоязычного) населения, но не для балтийских финно-угров и поволжских народов (около 20 000–22 000 YBP)(Tambets et al. 2003). По результам исследований мтДНК калашей Долины Калаш, в их генетическом составе гаплогруппа U4a1 составляет 21,6% — Читрал (округ), Хайбер-Пахтунхва, Пакистан.
 Веретье, Бутовская культура Восточноевропейские охотники-собиратели (EHG)
 Примерно, 15–13 тыс. лет назад предки западных охотников-собирателей (WHG) впервые появились в Центральной Европе, что совпадает с периодом Бёллингского потепления. Это повышает вероятность того, что формирование кластера "Сиделькино" могло быть результатом расширения и смешения популяций под влиянием резкого потепления.
Кластер "Сиделькино" (Posth 2023 et.al) включает могильники Песчаница, Попово, Сиделькино, Минино, Оленеостровcкий, Васильевка I, Караваиха, Языково I.
 Скандинавские охотники и собиратели
 Кундская культура
 Каргопольская культура
 MUR002 (ок. 4628 лет до н. э.) могильник Мурзихинский II, Алексеевский район (Татарстан), Россия
 Примерно 8 тыс. лет назад, когда анатолийские неолитические фермеры (ANF) начали распространяться по Европе, максимально увеличилось составляющая часть ANF среди секвенированный геномов охотников-собирателей этого периода. 
 Нарвская культура
 Днепро-донецкая культура
 Культура ямочной керамики
 Культура ямочно-гребенчатой керамики
 Льяловская культура, локальный вариант культуры ямочно-гребенчатой керамики
 Средне-Иртышская культура
 Культура Триполье-Кукутень
 Восточноевропейские охотники-собиратели
 Ботайская культура
 Афанасьевская культура
 В U4a1* были обнаружены три дополнительные подветви со времени расхождения 5320-6519 лет назад, охватывающие в основном 
 которые могут быть связаны с миграцией западных степных скотоводов (WSH) в Среднюю Азию, северную Индию/Пакистан и западную Монголию в эпоху бронзы .
 Фатьяновская культура 
 Абашевская культура
 Ямная культура 
 Чемурчекская культура
 Степной средний-поздний бронзовый век  Андроновская культура
 Гаплогруппа U4a1 имела высокую частоту в андроновской популяции (19%) .
 Бронзовый век Таиланда
 Скифо-сибирский мир 
 Пазырыкская культура
 Япиги Гунно-сарматская эпоха 
 Хунну
 Саглыбажинская культура  Алды-бельская культура  Венгерские Авары
 Венгерское завоевание Паннонской равнины
 Ранняя Венгрия
 Эпоха викингов
 
Северо-Восточная Иберия  Средневековая Польша
 Древо гаплогрупп мтДНК человека