本エピソードはミソロジーとは関係のないものではあったが、シリーズにとって重要な1作となった。「序章」と「ディープ・スロート」において、スカリーはモルダーを救出するために軍の職員と言い争ったり、モルダーを不当な批難から守るために言葉を注意深く選んだ上で報告書を書いたりしていた。しかし、本エピソードにおいて、スカリーはかつての同僚トム・コルトンを前にして、モルダーを支持するか組織内での保身のために行動するかのどちらかを選ばざるを得なくなった。これ以降のエピソードでは、スカリーがモルダーと自身のキャリアのどちらを取るべきかで逡巡する姿が描かれることになった。なお、スカリーを馬鹿にする同僚たちは現実世界における組織に従順な人間の象徴となっている。スカリーに向けられる敵意はFBIという組織内の力学が真実の探求を阻むものになっているということを示唆するものである。スカリーは真実を追うための調査と犯罪を立証するための捜査をバランスよく行わなければならない立場に立たされた。FBI自体は（建前上）犯罪の立証のみを行う組織である。陰謀の真実を追求する任務はFBI捜査官にはない。このことが視聴者を苛立たせるのである。なぜなら、視聴者はFBIや裁判所が真実を明らかにするための組織だと信じているからである。
2011年10月1日、現金約90万円を盗まれるスリ被害に遭ったことが明らかになった。警察には被害届を出しているが「返しにくるお人よしはいないでしょう。しょうがないです」とあきらめている。被害に遭ったのは秋場所中で、給料を入れた袋を付け人に預けたが、両国国技館内か、その付近で何者かにすられたという。
教会論のいくつかの側面に関する問いに対する回答（きょうかいろんのいくつかのそくめんにかんするといにたいするかいとう、英: Responses to Some Questions Regarding Certain Aspects of the Doctrine on the Church）は、ローマ教皇庁教理省が2007年7月10日に発表した文書である。原文はラテン語で、各国語に翻訳されている。それによると、第2バチカン公会議によってカトリック教会に関する教えは変化しておらず、「キリストは唯一の教会を地上に設立し、この教会は、ペトロの後継者と彼と交わりのある諸司教によって治められているカトリック教会のうちに存在する」としてカトリック教会が唯一の教会であるとしている。また、使徒継承のある東方教会（正教会など）は『部分教会すなわち地方教会』ではあるが、ローマ司教であるローマ教皇との交わりにないために部分教会としての条件の一部を欠いており、さらに16世紀の宗教改革から生まれたキリスト教共同体（プロテスタント）は、使徒継承による司祭職の秘跡を欠くため「カトリックの教えによれば、固有の意味で『教会』と呼ぶことはできない」としている。この文書は一部のプロテスタント教会などキリスト教の他の教派から批判され、カトリック中央協議会では「この文書はカトリックの立場をあらためて明らかに示したものであり、カトリック教会が今後もエキュメニカル対話を積極的に進めていこうとする姿勢に変わりはない」というコメントを発表した。
路線は大曲駅から十和田市駅までほぼ稲生川に沿うように敷設されていたが、建設時に三本木開墾株式会社より線路用地として堤防上の提供を受けたことによる。駅は十和田市駅と三沢駅以外は無人駅で、無人駅には出札・改札がなくホームがあるのみであった。列車はワンマン運転を行っていたため、無人駅から乗車する際は路線バス同様に乗車時に整理券を受け取って、降車時に整理券と運賃を支払うようになっていた。十和田市駅・三沢駅から乗車する場合は乗車券を購入して改札を通り、降車時に切符を回収する（集札）。無人駅での集札は1両目の運転士席から近い進行方向一番前の出口で運賃箱を用いて行う。このため、混雑時をのぞいて十和田市駅・三沢駅以外では進行方向一番前のドアしか開かなかった（ただし、定期券利用客以外は混雑時にすべてのドアが開くときでも一番前のドアから乗降しなければならない）。柳沢駅と七百駅との間で、地下を通る東北新幹線と交差するがどちらの路線にも駅は設置されていなかった。1970年（昭和45年）度に年間165万人が利用してピークとなったがその後は乗客が減少し、2010年（平成22年）12月4日に東北新幹線・七戸十和田駅が開業すると、十和田湖周辺への観光客を中心に乗客減に拍車がかかり同年度は年間46万人にまで低下した。さらに2011年（平成23年）3月11日に発災した東日本大震災の影響で、鉄道事業の赤字を補っていた同社のホテルやバス事業の収入も減ったため、同社は沿線の三沢市、六戸町、十和田市にその後10年間で約5億円の資金援助を要請したが、自治体側は10月上旬に「経営改善が見込めない」と要請を拒否した。そのため、10月7日の十和田観光電鉄の臨時取締役会にて2012年（平成24年）3月末をもって廃線にし、バス転換する方針が決定、10月11日に十和田観光鉄道活性化協議会の臨時総会で発表された。2012年1月24日に、十和田観光電鉄は国土交通省（東北運輸局）に対し、十和田市駅が4月以降使用不能になる（詳細は「十和田市駅#駅ビル再開発計画」を参照）ことを理由とした休止届及び採算性悪化や前記設備更新の費用調達困難を理由に2013年1月31日を以て廃線とする廃止届を提出した。これを受けて東北運輸局が同年2月20日に地元2市1町に対し実施した意見聴取に於いて、廃止日を2012年4月1日に繰り上げても支障なしとの判断がされた。このため十和田観光電鉄は休止届を取り下げるとともに廃止日を2012年4月1日とする廃止日繰り上げの届出を行った。廃止日の前日である3月31日の運行で営業を終了した。4月1日より同社により鉄道代替バス十和田三沢線（三高正門前 - 十和田中央 - 三沢駅 - 三沢高校前）が運行されている（本記事の「鉄道廃止代替バスについて」の節も参照）。