ブバスティスはネコ科の女神バスト崇拝の拠点であり、古代ギリシア人はそれをアルテミスに比定した。ネコは神聖にしてバステト特有の動物で、ネコまたは雌ライオンの頭部で表現され、記念碑の碑銘において、しばしば神柱プタハに付き従っている。従って、ブバスティスにおける墳墓は、ネコのミイラのエジプトにおける主要な保管所であった。ブバスティスの町とノモスのその最も顕著な特徴は、バストの神託とその女神の壮麗な神殿、彼女に敬意を表する例年の行進であった。神託は、ギリシア人定住者のデルタへの流入の後、バストのアルテミスとの比定が、現地のエジプト人も外国人もその殿堂に引き付けたため、人気を増し重きを加えた。ブバスティスの祭は、ヘロドトスによって描写されている通り、全てのエジプトの歳時記の中で最も楽しげで豪華なものだった。男女でいっぱいになり、ナイルに浮かべられてのんびりと下る全ての種類の艀や川舟。男たちはロートスの笛を吹き続けた。女たちはシンバルやタンバリン。そしてこのように、音楽に合わせて手拍子や踊り、その他の楽しげな身振りや、楽器を持たなかったりしたものはいなかった。彼らは河の上にいる間そのようにしたが、その土手にある町に差し掛かると艀は早められ、巡礼者たちは下船し、女たちは歌い、はしゃぎながらその町の女たちを冷やかし、服を頭の上にまでまくり上げる。彼らはブバスティスに着くと、驚くべきほど物々しい祝宴を開く。その年の残りの全ての期間におけるよりも多くの葡萄酒がこの日々に飲まれるのである。この祭の流儀はこのようなものなのである。そして、バストの饗宴を同時に祝するための巡礼者たちは、知られているだけでも70万の多数に上るのだと言われている。
エジプト語におけるブバスティスの名は“Pr-Bȝśt.t”で、通常は“Per-Bast”（ペル＝バスト）と転写される。“PR”は「家」を意味し、2番目の語“Bȝśt.t”は女神バストすなわちバステトの名である。一句で「バステトの家」を意味し、すなわち「バステトの神殿」という意味である。コプト語ボハイラ方言では、Ⲡⲟⲩⲃⲁⲥϯ（プバスティ）、またはⲠⲟⲩⲁⲥϯ（プアスティ）、Ⲃⲟⲩⲁⲥϯ（ブアスティ）となっている。
紀元前111年に前漢によって設置された日南郡の首府は、フエ近郊に位置すると推定されている。2世紀末に建国された林邑（チャンパ王国）の首都はフエ付近に存在したと推定されている。林邑の時代のフエは東南アジア内陸部の物品を中国に出荷する積出港として機能していた。中国の史料に現れるチャンパの地名「烏麗」「烏里」はフエに比定され、烏里には多くのチャム人が住んでいた。制氏、潘氏といったチャム人の名家は、フエがキン族化された後も名門の地位を保ち続けた。1307年に北ベトナムの陳朝とチャンパ王国の間に結ばれた協定によって、烏里は陳朝に割譲されて化州と改称された。1401年から1402年にかけて、胡朝は紅河デルタ地帯の住民をフエに移住させる。1407年に胡朝を滅ぼした明がベトナムを支配下に置いた後、陳朝の王族の生き残りはフエを拠点として、1413年まで明に抵抗を続けた。1558年の阮潢（グエン・ホアン）入城までにフエのキン族化はほぼ完了していた。15世紀末までのフエは北ベトナムの政権とチャンパ王国の国境に位置する都市に過ぎなかったが、16世紀から始まる南北抗争時代にフエは広南阮氏の本拠地とされ、1636年に富春（フースアン）都城が完成する。広南阮氏の時代のフエは南シナ海貿易の中心地として繁栄していた。西山党の乱の時代、1774年に鄭氏、1786年に西山阮氏の阮恵（阮文恵）がフエを占領した。フエを本拠地とした阮恵は北平王を称し、クアンビンからハイヴァン峠に至る地域を支配した。1801年に阮福暎（嘉隆帝、ザーロン帝）はフエを制圧し、町を阮朝の首都に定めた。ザーロン帝はヴォーバン様式に基づいた星型の城郭を持つ王城の建設を計画し、1805年にザーディンに置かれていた太和殿がフエに移されて王宮の建設が開始される。阮朝時代のフエは、中国的要素が強い北ベトナムで培われた文化に南ベトナムのチャンパ文化を取り入れて発展していく。阮朝第4代嗣徳帝（トゥドゥク帝）は広南阮氏の正史『大南寔録正編』を編纂させたことで知られるが、建築事業も大々的に行い、現存する市内の王宮及び郊外の帝陵は彼によって整備された。1883年にフエはフランスによって占領され、この地で2回にわたって条約が締結された。第二次フエ条約（パトノートル条約）によってベトナムがフランスの保護国とされた後も、阮朝の皇帝は第二次世界大戦末期までフエの宮殿に住み続けた。1945年8月24日に皇帝バオ・ダイは退位を宣言してフエを去り、阮朝は滅亡する（ベトナム八月革命）。1963年、ティエンムー寺（天姥寺）のティック・クアン・ドック、トゥーダム寺（慈曇寺）のティック・ティウ・ディウらの僧侶が民主化・伝統的仏教の弾圧を行うゴ・ディン・ジエム政権に抗議して焼身自殺を行った。1968年のテト攻勢では1月31日から2月24日にかけてフエで戦闘が展開され、町は多大な被害を被った。テト包囲戦の中で、およそ2,800人の官吏、警官、教師、学生が南ベトナム解放民族戦線の兵士によって殺害された（フエ虐殺）。