ローマ帝国時代の集落が発掘されており、旧市街（Het Oude Dorp）には当時の道路のパターンが現在でも残っている。中世の暗黒時代にはこの地域の中での中心的集落が置かれていたようである。集落は幾つかの地区に分かれていて、現在でもSchonauwen, Wulven, Waijen, Heemstedeといった地区名が残っている。旧市街には1884年に建てられたカトリック教会や、1563年に建てられたプロテスタント教会がある。教会は9世紀頃に最初に建てられた模様で、現存する最古の部分は11世紀頃のものである。また、16世紀に食堂として造られた建物が、現在でもレストランDe Engelとして使われている。現代のハウテンは、20世紀の第4四半期の1966年から1993年にかけて形成された。急速に人口が増えつつあったユトレヒトの住宅事情を満たすため、1979年には1万軒の住宅が建設が開始され、それまで4000人ほどであった人口が、1990年代には3万人に急増した。1995年から2008年にかけて第2期の市街地拡張が行われ、ハウテン南地区に7000軒の住宅が建設された。ハウテン南地区は、それまであったハウテン北地区とほぼ同じ都市計画により建設されたが、ハウテン南地区の東側には大きな池が建設され、中央部には広い緑地が残されたところがハウテン北地区と違っていた。また、ハウテン南地区の一部では自転車専用レーンが作られていない場所もある。
2008年（平成20年）8月29日深夜に発生した岡崎市内の集中豪雨、気象庁のいう平成20年8月末豪雨では、伊賀川の氾濫で周辺地域に水害が発生した。豪雨後、愛知県と岡崎市は早急に河川改修に着手した。そこで犠牲になったのが伊賀川の桜並木であった。三清橋（西魚町）から猿橋（石神町）までの約2.4キロメートル区間の桜481本のうち約45パーセントにあたる220本が改修工事に支障があるとして、伐採・移植の対象となった。この動きに対し、伊賀川桜保存会（市民団体）がたちあがり、伊賀川の美しい桜が保存されるよう署名活動が行われた。愛知県は「桜を1本でも多く残せるよう」に床上浸水対策特別緊急事業を進めると述べ、桜保全計画マップを作成した。豪雨により氾濫した伊賀川、鹿乗川、広田川、砂川、占部川の市内5河川の緊急改修工事は2015年度（平成27年度）末で完了した。
明治までの伊賀川の流れは、現在の国道248号を越えて早川の流れに沿って南へ菅生川に合流していた。大雨が降ると菅生川から逆流する水勢に押され、堤防がたびたび押し流される状況にあった。1912年（明治45年）に浅井浅次郎をはじめその他の有志らにより、伊賀川の改修工事が実施された。当初は伊賀川を西に直進させて矢作川に直結する計画もあったが、結局は現在のように広幡あたりから南流させて、岡崎城西側の外濠を通して菅生川に合流した。
伊賀川の桜並木は、町の花咲かじいさんと呼ばれた伊賀町の石油販売業・佐々木今朝吉が、伊賀川に桜を植えようと思い立ったところから生まれた。戦前の1939年（昭和14年）、その次の年が紀元二千六百年になる年であるので、記念事業にと、佐々木今朝吉の次男・佐々木博と親類・稲垣和夫と話し合って決めた。その後、すぐさま京都の苗木商から若木を取り寄せた。伊賀川を管理する愛知県の河川課の許可を取って、伊賀川の土手へ、取り寄せた吉野桜・右近桜、ほかに楓も植えた。2年がかりの作業で伊賀橋から稲熊までの伊賀川堤防約2キロメートル間に2600本の若木が植えられた。しかし、もともと桜に関する知識があったわけではなかったので、桜を成長させるのに苦労したという。市から生ゴミをもらって堆肥をつくり、近所からイワシなどを譲り受けて肥料として桜の根元に埋めるなど、根気強く取り組んだ。戦後の1950年（昭和25年）頃には伊賀川に見ごとに咲くようになっており、以後ずっと、伊賀川桜堤は岡崎市の桜の名所として、岡崎公園周辺の桜と並んで親しまれている。
天武天皇は、宗教や超自然的力に関心が強く、神仏への信仰も厚かった。『日本書紀』には天文遁甲をよくするとあり、壬申の乱では自ら式をとって将来を占ったが、これらは道教的な技能である。『古事記』は、天武天皇が夢の中の歌を解き、夜の水に投じて自分が皇位につくことを知ったと記す。『日本書紀』では、壬申の乱のときに式をとって占い天下二分の兆しと解き、また天神地祇に祈って雷雨を止ませたという。占いも神助も現代の学者のとるところではないから、諸学者はこれらを天皇の権謀とみたり、偶然の関与とみたりするが、このような予言者的能力によって天皇は神と仰がれるカリスマ性を身に帯びた。即位後の政治にも宗教・儀式への関心が伺えるが、占いの活用や神仏への祈願で自らの目的を達しようとする姿勢が強い。天武天皇の和歌は、蒲生野で額田王と交わした恋の歌、藤原夫人と交わしたからかい交じりの歌、吉野の「よし」を繰り返す歌、そして吉野の道の寂しさを歌う暗い歌が伝わる。漢詩を作ったとする史料はない。学者には伝えられていないだけとする人もいるが、ここに彼の趣味嗜好を見る人もいる。天武天皇の趣味は無端事（なぞなぞ）のように庶民的なものがあり、天武天皇14年（674年）9月18日に大安殿で博戯（ばくち）の大会を開くといった遊侠的なものさえあった。「#文化政策」で挙げた各種芸能者への厚遇も、天皇の好みと無関係ではないだろう。こうした側面に、民衆（より具体的には地方豪族層）の心をとらえるものがあったかもしれない。文暦2年（1235年）の盗掘後の調査『阿不之山陵記』に、天武天皇の骨について記載がある。首は普通より少し大きく、赤黒い色をしていた。脛の骨の長さは1尺6寸（48センチメートル）、肘の長さ1尺4寸（42センチメートル）あった。ここから身長175センチメートルくらい、当時としては背が高いほうであったと推定される。藤原定家の日記『明月記』によれば、白髪も残っていたという。