本作では謀略の重要性が高く、忍者衆の重要性が飛躍的に増した。これまでよりも外交手段も多様化した。これまでの作品では、『覇王伝』においては対等同盟、従属同盟どちらも結ぶことができたが、『天翔記』から『烈風伝』までは対等同盟のみ、『嵐世記』では従属同盟のみしか結べなかった。本作では久しぶりに両方が結べるようになった。しかも対等同盟だけでも「不戦協定」「軍事同盟」「包囲網」の3種類を結ぶことができる。それ以外にも自家を自慢する、寝返りを約束する、盟主の風評を流すなどこれまでの作品にないことが可能になった。また軍略フェイズ中に偽伝令を敵だけではなく味方にも送ることで主君の他城主への評価を落とすこともできる。下剋上も条件が整えば可能だが、その際に悪評が立つことで他大名家との友好度や家臣の忠誠度が下がることがある。朝廷や幕府から大義名分をもらうことで悪評を抑えることができる。逆に、大名は『覇王伝』以来久々に処断が自分の家臣にも可能になった（シリーズの他作品では、ほとんどが敵の捕虜または捕虜と外交の使者のみ可能になっている）。たとえ謀反の意志が無くても、流言により大名に処断されることも多いため、城主や軍団長を選択した場合、大名との関係維持は重要である。処断される場合、城主・軍団長でプレイすると、大名に呼び出されて手討ちされる演出が入る（呼び出しを断れば、友好度は下がるが殺されることはない）。プレイヤー城主・軍団長が手討ちされると、謀反の意志の有無にかかわらず、後継城主は強制的に独立する。プレイヤーが大名ならば、切腹を申し付けることになる。同じ勢力の城主同士で足を引っ張り合うことも、逆に他の城主に根回しすることで、主君を隠居させ無血のうちに大名家を乗っ取ることも可能である。
『覇王伝』及び前作『嵐世記』同様に知行制が本作でも採り入れられている。これまでの2作品では知行は大名の元で一元管理されていたが、本作では城毎に割り当てられている。これは武将の移動や転封を行う際にも影響し、プレイヤー担当の武将が軍団長以上の場合で自身の居城であっても一部の家臣をあらかじめ移動させておかないと知行不足で転封コマンドが選べず、居城移動ができないことがある。しかしCOM武将が知行を上げる事は滅多にない為、このシステムのせいで自分が大名の時、城主や軍団長の知行が低いままになっている。なので低いままの武将の友好度がどんどん下がって行き、また、率いる兵士数が中々増えない為、使いにくくなった感がある。またPK版の場合、オリジナル武将をCOM大名家に入れるとどんなに武名が高く仕官年数が長くてもシナリオ開始時のCOM家オリジナル武将の知行は0となる。また、COM大名はオリジナル武将を軽んじる傾向にあり、知行0のままの場合が多い。さらに前作では家臣に知行を与えた後、それに応じて増加した最大兵数に達するまでの兵数は自然増加を待つしかなかったが、本作では（雇う兵数は調整できないが）募兵も可能になった。また勲功による知行の要求量も前作と比較して減少し、知行ではなく金銭を褒美に与えることが可能になるなど、前作のシステムが一部変更されている。
天保6年（1835年）2月に巨摩郡西野村の長百姓・幸蔵と佐次兵衛、同郡西花輪村（中央市西花輪）の長百姓・内藤清右衛門（景助）を中心とする有志により郷校設立が発起される。西野村幸蔵は「油屋」の屋号を持ち商業に携わった人物で、天保年間には清右衛門とともに伊予国西条藩産の塩の移入を計画している。内藤清右衛門は『甲斐国志』編さんに携わった内藤清右衛門（禹昌、正輔、1751年 - 1831年）の子で、父の清右衛門は「藤屋西」の屋号を持ち商業に携わる一方で、花輪村に時習館を創設した。子の清右衛門も父とともに『甲斐国志』編さんに携わり、後に清右衛門を襲名して時習館の経営に携わった。天保6年2月に市川代官所に提出した願書では郷校設立の社会的意義を訴え、幸蔵が身元確かな人物であることを村役人や村人が保証し、手習所設置を求める幸蔵の意見に賛同する添書を出した。さらに請書では手習所の建設・維持に関わる諸経費は各村の有志による募金で集め、建設予定地の小物成米は西野村が弁済することを明記した。設立資金は幸蔵と清右衛門が金20両、巨摩郡荊沢村（南アルプス市荊沢）の豪農・市川市右衛門が金10両を出資し、他の出資者とあわせて総額は140両と米4俵に及んだ。さらに西野村では13箇条の連印状を作成し、西野村の曹洞宗寺院・宝珠院を仮校舎として開校された。天保7年（1839年）4月には校舎が完成し、正式に開設する。この頃には就学者も増加し、学校名を西野手習所から「松聲堂」と改める。初代教授は松井渙斎（まつい かんさい、1806年 - 1854年）。渙斎は江戸出身の幕臣・儒学者で、甲府近郊の高室村（甲府市高室町）に居住し、西花輪村の私塾・時習館で教えた経歴を持つ。松井は徽典館学頭ほか、甲斐国内の多くの文人と交流している。現在の南アルプス市立白根東小学校には渙斎の肖像が所蔵されている。嘉永元年（1848年）に高齢により引退し、江戸へ戻る。後任は宮浦東谷が務めた。宮浦東谷は武蔵国葛飾郡早生田村（東京都）出身。旧姓は「雨宮」、通称は庄左衛門、諱は義房、旧伊予国大洲藩士。市川代官・小林藤之助の食客として市川大門村に滞在しており、明治4年（1871年）に死去。宮浦の後任は学制発布まで徽典館の根岸好太郎が務めた。嘉永元年（1848年）から元治元年（1864年）までの16年間の門人を記した門人帳には、門人の氏名、出身地、父母・兄弟の名が記されている。門人は200人を越えたという。女性の門人も存在した。授業は漢学中心で、水準は寺子屋に近かったという。著名な門人に漢詩人の青嶋貞賢、小野泉、竹内源蔵、斎藤文治、村松栄斎などがいる。松聲堂の設立願書、門人帳などの関連史料は『山梨県史』の編纂において発見された。個人所蔵。『山梨県史 資料編13近世6上』において一部翻刻されている。