貨客混在機。747-400 Combiとも呼ばれる。後部（主翼より後ろ）はほぼ全体が貨物室になっており、胴体後部側面に貨物用のドア（SCD）が付く仕様。1989年6月30日に初飛行。ローンチカスタマーはKLMオランダ航空。2002年4月10日にKLMオランダ航空に引き渡したのを最後に生産終了となっている。ほかにアシアナ航空、ルフトハンザ航空、エールフランス、大韓航空、中国国際航空、エバー航空などが導入したが、2015年1月5日をもってエバー航空からは引退。貨物スペースが機体の半分近くを占めていることから、座席数は通常の747よりも遥かに少なく、例えばKLMオランダ航空の-400通常型の定員が408名なのに対し、-400 M型の定員は268名となっている。これは、中型機のエアバスA330-200とほぼ同じ座席数であることを意味している。
基本的な外形は747-300と変わらないが、アビオニクスや主翼、エンジン、客室内装備に変更が加えられている。主翼端の延長とウィングレットの追加、主翼根元のフェアリングの改良により空気抵抗を減らした （形状変更によるボーディングブリッジおよびタラップ車など車両の衝突防止のために“I”字状のラインが引かれている）うえ、水平尾翼への燃料タンクの追加設置と最大離陸重量の増加によって、搭載できる燃料も増やされた。また、エンジンもより新しい高バイパス比ターボファンであるゼネラル・エレクトリック（GE）製のCF6-80やプラット・アンド・ホイットニー（P&W）社製のPW4000、ロールス・ロイス社製のRB211-524Hへ換装され、燃費・推力とも向上。これらの改良により、航続距離で -200型を上回る性能を備えた。そして何より、機内におけるクラシック型（-100・-200・-300）との最大の違いはコクピットにある。それまでほとんどアナログ式だった計器類は大幅に電子化（デジタル化）したほか、大型機でありながらそれまで乗務していた航空機関士も不要となり、機長・副操縦士の2名で運航が可能になった。大型ワイドボディ旅客機および4発機としては初の2人乗務機である。
高校3年時の2010年沖縄インターハイ5000mで3位入賞（日本人2位）。同年10月には5000m高校歴代7位（当時）となる13分50秒38を記録し、5000mで同世代の最高記録保持者となる。しかし、この1ヵ月後に、翌年から駒澤大学でチームメイトとなる村山謙太が中村の記録を上回る13分49秒45を記録した。駒澤大学入学後しばらくは同級生の村山らの影に隠れ目立った活躍はなかった。しかし、着実に力を付けていき3年時の2013年関東インカレでは2部10000mで優勝。同年の日本選手権でも10000mに出場し5位入賞を果たした。また、同年のユニバーシアードにハーフマラソン代表選手として出場し、銅メダルを獲得。2014年3月に開催された世界ハーフマラソンにもチームメイトの村山とともに日本代表として出場した。駅伝においても大学三大駅伝のうちの2つ、出雲駅伝・全日本大学駅伝でともに1区を走り区間賞獲得の活躍。三大駅伝残りの1つである箱根駅伝でも1区を走り区間賞はならなかったものの、区間賞を獲得した日本体育大学・山中秀仁から11秒差の区間2位であった。このように大学3年生の1年間は、個人のトラック・ロードレース、また駅伝と多くの場で無類の強さを見せた1年であった。大学4年時にはチームの主将を務めるが、好調だった3年時とは打って変わって不調に悩まされ、レースへの出場も少なかった。それでも秋口からは調子を上げ、全日本大学駅伝では4区を走り区間賞。駒澤大学の同駅伝4連覇に貢献した。4年間の集大成となる第91回東京箱根間往復大学駅伝競走では再び1区を任せられる。終盤何度か先頭集団から振り放されそうになるも、そのたびに粘りの走りで先頭に追いつき、最終的に自らスパートを仕掛けトップで盟友・村山にタスキをつないだ（区間賞）。この区間賞獲得で、中村は三大駅伝のすべてで1区区間賞を獲得したことになった。大学卒業後は富士通に入社して同社陸上部に所属。入社1ヶ月後の2015年ゴールデンゲームズinのべおかで5000mA組に出場し、13分43秒41の記録で高校以来の自己ベストを塗り替えた。同年9月の第63回全日本実業団対抗陸上競技選手権大会では5000mに出場し、日本人最高位となる6位に入賞した。2016年元日のニューイヤー駅伝では大学時代から得意としていた1区に出走し、先頭から5秒差の区間6位でタスキリレーした。同年2月の第44回全日本実業団ハーフマラソンでは6位入賞し日本人トップとなり、翌3月に開催された世界ハーフマラソン日本代表に2大会連続で選出された。同年9月の第64回全日本実業団対抗陸上競技選手権大会では5000mに出場し、前年と同じく日本人最高の記録で走り5位入賞した。2018年3月の第73回びわ湖毎日マラソンへ初マラソンに挑戦。気温15～20度と季節外れな高温の悪条件だったが、27km付近まで先頭集団についていった。その後優勝争いから後退するも、レース終盤から追い上げる。37Km過ぎで日本人暫定首位ながら極端にペースダウンした窪田忍（トヨタ自動車）を追い越し、38Km付近で並走していた今井正人（トヨタ自動車九州）を突き放す。結果総合7位ながらも日本人ではトップとなり、ゴールタイムは2時間10分51秒と、辛うじてマラソングランドチャンピオンシップ（2020年東京オリンピック男子マラソン選考会）の出場権を獲得した。2018年9月のベルリンマラソン（ドイツ）へ2度目のフルに挑戦。同大会で2時間1分39秒の世界新記録で優勝した、エリウド・キプチョゲ（ケニア）の超ハイペースには号砲直後からついていかず、15分丁度前後のイーブンペースを維持。30Km以降はペースダウンしたものの、ゴールタイムは2時間8分16秒と自己記録を2分35秒更新、日本男子トップの4位に入った。2019年9月15日のマラソングランドチャンピオンシップに出場、最終盤まで大迫傑（ナイキ）、服部勇馬（トヨタ自動車）と激しく競り合う中から抜け出し、1位でゴールへ入線して2020年東京オリンピック男子マラソン日本代表の切符を獲得した。