フェナリナーサのプリンセスが果たせなかった使命を果たすため、海の底に沈んだ夢の国、マリンナーサのプリンセスがミンキーモモ（以下モモ。特に断りがないかぎり本作品のミンキーモモを指す）の名を継ぎ地上に派遣される。モモは、まだ夢を持つ人が多く残っている、あそこの国のあそこの町にやってきて、妖精が隠れ住む公園に建つホテルの管理人夫婦の子供となる（第1話）。毎回の話は、「むかし、むかし、といっても、ほんのすこしだけ明日に想えるかもしれない昔」という決まり文句で始まる。物語の前半においては前作と同様にモモが事件に遭遇し、大人に変身して活躍する。前作との相違点としては、本作のモモは使命のことよりも地上で楽しく遊ぶことを第一の目的に行動しているため、使命を遂行していることを示す明確な演出が物語前半の時点では存在しないことが挙げられる。物語後半では、宇宙に浮かぶ夢のエネルギーの不足によって魔法の力が弱まり、夢の国とその住人の消滅が起こりうる危機的な状況になっていく。人間に生まれ変わったフェナリナーサのモモと出会うことで、モモは「夢を取り戻す」という使命をようやく自覚し、世界中に散った夢のかけらの力を借りながら世界に夢と希望を取り戻そうとするが、魔法で夢を叶えることはできないという現実に直面する（第59話、第60話）。最終回（第62話）ではとうとう夢や希望が失われ、夢の国の住人達も他の惑星へと旅立ち、地上に残った最後の夢の国であるマリンナーサも地球から離れることを決断する。その一方、パパとママが不治の病（AIDS）を患っていたために子供ができなかったこと、そんな2人にとって、モモの存在こそが叶わぬはずの夢そのものであったことを、モモは知ることになる。地球から離れるか残るか迷うモモに、人間に生まれ変わった前作のモモは「モモちゃんに自分の夢を見守っていて欲しい。そう思う子がいる限り、モモちゃんは消えない」と伝え励ます。その言葉を聞き、パパとママの夢を守るため、そして誰かが望む限り夢がなくなることはないと信じて、人々の夢を見守るためにモモは地球に残る道を選ぶ（第62話）。この物語には夢を持ちつづけてほしいというメッセージが込められていた。
福引で1等賞の南極旅行ペアチケットを当てたパパとママを送り出したモモは、ゆっくり羽を伸ばせると大喜びなものの、慣れない家事に苦戦一方。そんな折、パパとママの乗った旅客機が “南の真ん中島” 上空で墜落してしまったとのニュースが入ってくる。モモはすぐさまパパとママの救出に向かうが、島に近づいた途端、なぜかグルメポッポも夢のエネルギーを失って墜落し、海に沈んでしまう。なんとか島に上陸するモモたちだが、時を同じくして、島の上空に存在する謎の莫大なエネルギーを狙って、世界中のスパイやら秘密組織やらがぞくぞく集結して来る。山の頂を覆い隠す雲の中に隠されていたもの。それは大人になりたくない子供たち、子供に還りたい大人たちが集まる「子供の国」だった。そして、モモはこの国の主である永遠の少年ペーターに出会い、「大人になることに夢などない」と言い切る彼のそんな価値観に疑問を抱く。その一方、世界各国の大人たちが子供の国を支える莫大なエネルギーを軍事利用しようと目論み、軍隊を派遣してくる。子供の国が爆撃に晒される中、モモはペーターに助太刀して大人たちと戦うことを決意し、攻め込んできた大人たちをこの国を支える夢のエネルギーを利用して子供の姿に還してしまうことで、事態を収拾する。全てが終わった後、「大人になるからこそ夢を持てる」と語るモモに対し、相変わらず自分の意見を崩そうとしないペーター。そんな相容れることの無い価値観の対立の末、ペーターは今まで子供の国に集めた子供たちを大人に戻して元いた時代に帰し、新たな子供の国を作るべくモモに別れを告げて、どこか別の星へと旅立っていくのだった。
宇宙艦隊の優れた設計技師として提督までつとめた父を持つ。宇宙艦隊アカデミーでは科学士官として学び、任官したが、トム・パリスの父であるパリス提督の勧めによって司令部門へと転属。2371年、ヴォイジャーの艦長に大佐として着任した。バッドランドで行方不明となったマキの宇宙船を捜索する任務中、異星人のテクノロジーによって7万光年離れたデルタ宇宙域に飛ばされ、副長、操舵士、主任医師らクルーの半数近くを失うが、先に飛ばされていたマキ船のチャコティらをクルーとして迎え、アルファ宇宙域への帰還の道を探る旅を始める。自分の信念に一途で頑固な所もあり、時にそれは独善的と言えるほどだが、冷静な判断力と優れた知性、多様な出自のクルーを束ねる強い統率力とカリスマ性を持つ優秀な指揮官である。意見を聞くべきタイミングを熟知している為、クルーも自身の持つ能力を余すところ無く発揮できるなど、部下の教育が得意。それ故、部下とも厚い信頼関係を構築できた。科学技術の知識が豊富で、専門クルーへの意見も適切。物的、人的共に資源の乏しいヴォイジャーの航行において、豊富な知識に裏付けられた戦術的、戦略的判断は幾度も船の危機を救い、無事地球への帰還を果たせた。宇宙艦隊ではそれまでほとんど情報のなかったデルタ宇宙域の航行記録も大きな実績であった。少女時代は言わば引き篭もりがちなガリ勉少女タイプだったが、大自然に囲まれたインディアナ州・ブルーミントンで育った為か、決して運動神経は悪くはない。ヴェロシティの実力はセブンを超える。尊敬する人物はレオナルド・ダ・ヴィンチ。地球には、結婚を約束した男性マーク・ジョンソンがいた。しかし、ヒロージェンのステーションを使って艦隊から受け取った彼の手紙には、4か月前に別の女性と結婚したことが記されていた。歴代艦長、司令官の中でも猪突猛進する傾向は一番かもしれない。艦の運命を左右する決断を迫られる局面が多いヴォイジャーの中で、ドクターやチャコティの制止を振り切り、無理をする場面も多く、チャコティからは「時々意固地になる」、トゥボックから「無謀をはるかに通り越している」と言われたこともあった。コーヒーを摂取することで、長時間集中力を持続させているようで、危機的状況下ではとくに好んで摂取し、打開策を発見している（『第１１４話　頭脳集団クロスの陰謀』）。宇宙暦上ではヴォイジャーの地球帰還以降のエピソードとなる劇場版『ネメシス/S.T.X』にカメオ出演した。艦長から提督に昇進しており、亜空間通信でジャン＝リュック・ピカード艦長にU.S.S.エンタープライズEのロミュラス星への針路変更を命じている。