やがてクートンに代わってジョゼフ・フーシェ、コロー・デルボワらの派遣が決定された。コロー･デルボワは11月7日、フーシェは11月10日にぞれぞれリヨンに到着している。コロー・デルボワについては、彼がリヨンで俳優をしていた際、舞台で野次り倒されたことがあったため、リヨン市民に対する処罰にはもってこいとされたという説がある。彼らはクートンの処置を生ぬるいものとして、リヨンへの徹底的な報復を開始する。まず、処刑されたシャリエの遺体を担ぎ出し、彼を称えるパフォーマンスを行った。翌日には革命裁判所が設置され、12月4日から本格的な処刑が開始された。ギロチンによる処刑では「あまりにまだるっこい」として、大砲による処刑や、自分で墓穴を掘らせた上での銃殺などが行われた。フーシェにいたっては、都市人口の10%を処刑する、というノルマを己に課していたとも言われる。これにより、リヨンの反乱に関った人々は処刑され、プロトー平原には死体が溢れかえった。さらに、国民公会の宣言にのっとり、リヨンの街も徹底的に破壊される。それでも処刑が続いたため死体はローヌ川・ソーヌ川に沈められたが、一部はいかだに載せられて下流へと流された。これは、同じく王党派の反乱が起こったトゥーロンまで死体が流れ着けば、叛徒への脅しとなるというフーシェの指図によるものだった。トゥーロン奪還の報が届くと、その日の祝いとしてさらに200名もの叛徒の処刑を行った。3ヶ月にわたる虐殺で、2000人近くの人々が処刑されたといわれる。なお、フーシェはこの一件の後で「リヨンの霰弾乱殺者」と呼ばれるようになっている。
反乱終結後、クートンはリヨンに対する報復として建物の屋根から瓦をはがしたり、壁を槌で叩いて形ばかりの傷をつけたり、反乱指導者を数名処刑するだけなど、比較的寛容な処置しか行わなかった。彼は、フランス第2の都市であるリヨンを徹底的に破壊することは、現実離れしていると考えたからである。恐ろしい宣言の後で、思いもかけぬ穏便な処置に街の人々は安堵したが、これを不服とした議員達はクートンの罷免を求めた。
反乱を鎮圧し、街の主導権をシャリエ派のもとへと返すべく、約3万の共和国軍がリヨンへと派遣され、8月8日から同市を包囲した。リヨンは街の周囲を城壁に守られた城塞都市であったが、共和国軍は大砲を用いて直接市内に砲弾を撃ち込み、都市を破壊した。やがて市内でシャリエ派がリンチにあっているという情報が流れると、これを救出すべく共和国軍はリヨンに対して徹底的に砲撃を加え、街を沈黙させた。このときフランスでは徴兵制度が始まっており、共和国軍が容易に人員を補充できたことも、包囲されたリヨンにとっては不利に働いた。やがて、10月9日、リヨンは革命政府に対して停戦と開城を申し出る。なお、この包囲戦には、後に大陸軍元帥となる、ルイ＝ガブリエル・スーシェも参加していた。彼はこのリヨン出身であり、彼にとってこの作戦は自らの故郷に対する攻撃であった。彼は、砲撃の前に何度もリヨン市との交渉の持続を求めたという。また、リヨン包囲戦に参加した共和国軍は、その後同じく王党派の反乱が起こっていた港湾都市トゥーロンへの援軍として派遣され、同港の奪還作戦に参加した。
コミュニケーションネームは、「α-STATION FM KYOTO」。単にα-STATION、KYOTO α-STATIONと呼ばれることが多い。開局当初から翌年4月の改編前日までは「FM KYOTO」の名も前面に出しており、ジングルでも“エフエム京都”とうたわれていた。ここ最近は、FM KYOTOの名前も放送等で使われることもある。また α-STATIONは“ALpha-STATION”とも書かれる。開局から数年間は「α」=「心地よさ」をコンセプトに24時間ワンフォーマット編成を採用しており、一定時間毎の番組は存在しなかった。ただし一定時間帯毎に「ゾーン」(後述)を設けており、新聞のラジオ欄にはこれが番組であるかのように掲載されていたが、実際にはゾーンの切れ目をまたいで音楽がかかるのが常態であるほど通過点にすぎず、時間通り放送されることはなかった。当時はDJのことも“エアパートナー”と呼んでいた。かつては宮津市にある複合商業施設宮津シーサイドマートミップルにスタジオを持っており、不定期で週末番組の公開生放送も行っていたが、2016年7月16日の『J-AC TOP40』公開生放送をもって終了し、スタジオは撤去された。2005年度までは京丹後市の京都府農業公園丹後あじわいの郷（当時）からも定期的に公開生放送を行っていた。放送時間は日曜深夜（月曜未明） 24:00 - 5:00のメンテナンスタイム(放送休止)（2010年9月 - 2011年6月は日曜深夜（月曜未明） 1:00 - 5:00）を除いて、5:00の24時間放送（2010年3月以前は2:00 - 5:00だった。ただし、1993年4月 - 1995年3月は3:00 - 6:00だった）。旧社屋の北山時代は「OPTIMOD8100A」というアナログ機を使用していたためその機器独特の音質だったが、烏丸四条（COCON KARASUMA）移転に伴って「OMNIA-6FM」というデジタル機に更新された。多少音質の変化はあるものの、以前の機器の設定を引き継いだ音質になっている。開局当初はノルウェーの歌手・SILJEが歌う『Kyoto Wind』という曲をステーションソングとしていた。その後、2年目は有希YUKI/『生まれかわる瞬間（とき）～BELIEVE MY DREAM～』、3年目には中西保志の『言葉でいえる愛』と続き、後に編成されるα-IMAGE ARTIST PROGRAMへと繋がっていく。独自に番組を制作し11年連続で京都・滋賀エリアで聴取率シェアが第1位である（2004年12月時点）。ただし、同局の聴取率調査は他局とは異なった調査方法を用いているため、他局の調査結果と単純比較をすることは注意を要する。また、「京都三条ラジオカフェ」を運営するNPO法人「京都コミュニティ放送」が2005年4月に行った調査では、京都府内民放局のみを対象にした聴取率は32.9%を計上し、2位のKBS京都ラジオの約3倍を記録した。