作戦打ち合わせのためトラックに到着した機動部隊参謀長草鹿龍之介少将は、戦略的に重要な割にトラックの防備は不十分で落ち着かなかったと回想している
また草鹿が第四艦隊司令部を訪問すると、井上は「真珠湾作戦の水際だった腕前にはひと言もない
ただ頭をさげる」と喜んだ
軍令部時代に井上から叱られてきた草鹿は井上に良い印象を持っていなかったが、この件で感激している
南洋部隊と南雲機動部隊の圧倒的戦力により、ラバウルとカビエンはすぐに陥落した
開戦前から第四艦隊に編入されていた基地航空部隊の第24航空戦隊は、1942年（昭和17年）4月10日の基地航空兵力戦時編制の改編で外され、第十一航空艦隊（11航艦）の指揮下に移され、第四艦隊の戦力は減少した
開戦後に新編成され、ラバウル・ソロモン方面に展開し、MO作戦に参加した第25航空戦隊も、第四艦隊の指揮下であった
同時期、南洋部隊（第四艦隊）が各方面に配備を要請していた空母祥鳳が南洋部隊（指揮官第四艦隊司令長官）に編入された

井上の甲種学生選考試験での筆記試験成績は60番で、本来なら落第だったが、海外勤務が長かったことを考慮して特例で口頭試験の受験を許され、口頭試験では1番で合格した
1924年（大正13年）12月1日、海軍大学校甲種学生卒業、海軍省軍務局第一課B局員
井上は海軍書記官・榎本重治と親友となった
1925年（大正14年）、榎本重治海軍書記官に「治安維持法が近く成立するが、共産党を封じ込めずに自由に活動させる方がよいと思うが」と問われた井上は無言であった
それから二十数年が経った戦後のある日、横須賀市長井の井上宅を初めて訪ねてきた榎本の手を握って、井上は「今でも悔やまれるのは、共産党を治安維持法で押さえつけたことだ
いまのように自由にしておくべきではなかったか
そうすれば戦争が起きなかったのではあるまいか」と語った
1925年（大正14年）12月1日、中佐に進級
1927年（昭和2年）10月1日、海軍軍令部出仕
11月1日、在イタリア日本大使館附海軍駐在武官兼艦政本部造船造兵監督官兼航空本部造兵監督官
横浜港から渡欧
ローマに着任した井上はイタリア人やイタリア軍についてネガティブな経験を重ねた
これは、井上が軍務局長時代に日独伊三国同盟に反対する理由の一つとなった
1929年（昭和4年）11月30日、海軍大佐となり12月に帰国した
帰国した井上は妻・喜久代の肺結核が悪化して看護が必要であるため、海軍人事当局に陸上勤務を願い出て1930年（昭和5年）1月10日、海軍大学校教官に補された
井上は人事当局の配慮に感謝し、空気の良い鎌倉に家を借りて喜久代の療養を優先した
井上は海大教官として甲種学生への戦略教育を担当した
井上の戦略教育は理詰めであり「戦訓を基礎としない兵術論は卓上の空論に過ぎない」「精神力や術力（技量）を加味しない純数学的な（戦略）講義をすることは、士気に悪影響を及ぼす」という批判も受けた

2012年から2015年までタンパベイ・レイズ傘下のマイナーでプレーし、先発・リリーフで計53試合に登板、6勝10敗、防御率3.48。2016年には母国・ドミニカ共和国でカープアカデミーの一員として、広島カープのユニフォームを着て約1年間プレーした。読売ジャイアンツの海外トライアウトで合格し、2017年に育成契約で入団、ホルヘ・マルティネスと共に来日した。背番号は026。同年は二軍で18試合に登板し、2勝3敗、防御率3.29。2018年7月4日のイースタン・楽天戦で8回2安打無失点と好投するなど主に先発で6試合に登板し防御率2.05と活躍し、7月8日に支配下選手契約を結び、背番号95に変更された。7月10日のヤクルト戦で一軍先発デビューし、5回5安打無失点で勝利投手となった。育成出身の初登板・初勝利は2017年4月19日に篠原慎平がリリーフでマークしたのに次いで2人目で、先発勝利はメルセデスが史上初だった。7月18日の阪神戦で7回無失点で2勝目を挙げた。巨人の外国人投手で初登板から2戦2勝はビル・ガリクソン、鄭珉哲、テイラー・ヤングマンに次いで4人目で、また、巨人の投手のデビューから2試合連続無失点勝利は日本人を含めても球団史上初だった。7月24日に左打ちから両打ちへ登録を変更した。シーズン終了まで先発ローテーションの一角を担い5勝を記録。チームのクライマックスシリーズ出場に貢献した。クライマックスシリーズではファーストステージでは出番がなかったがファイナルステージ（広島戦）の第1戦で先発を任された。だが、制球が甘く4回途中4失点でKOされ敗戦投手となり期待に応えられなかった。チームもCS敗退を喫している。2019年は4年ぶりに復帰した原辰徳監督の下、開幕から先発ローテーション入りした。安定した投球を見せていたが7月19日に登録を抹消された。8月1日に再登録後は失点数は少なかったが6回未満で降板する試合が目立ち、9月3日の中日戦では3回途中2失点で降板して敗戦投手になると翌日登録を抹消された。9月19日に再登録され、同日の中日戦に先発し、勝ち星は付かなかったが6回1失点と好投した。9月22日に登録抹消後はそのまま出番がなかった。最終的に22試合に登板して8勝8敗、防御率3.52の成績を残したが、5回や6回で降板する試合が多かったことからスタミナ面で課題を残し、規定投球回への到達はならなかった。