しかし、神獣は枯渇したマナを回復させられる唯一の存在
ポポイはマナの減少の影響により身体に変調をきたしており、消滅の危機が迫っていた
神獣を倒すことはできないと悲しみに暮れるランディだが、ポポイの言葉によって奮起
タナトスが倒れたことでドリアードの力も復活し、プリムとポポイの魔法によってマナの聖剣は完全に蘇った
こうして神獣は聖剣の勇者によってその身を砕かれ、世界は救われた
神獣を狂わせ世界を危機に陥れたのは、マナの力に魅入られた人間たち
しかし、邪悪な野望を打ち砕き、神獣を討ち滅ぼしたのもまた勇気と知恵と愛を胸に成長を果たし、手を取り合った人の子たちであった
崩壊した神獣の破片が雪となって降り注ぐ中、ランディたちはポポイの姿を探す
しかし、仲間の姿はどこにもない
歴史は繰り返されたものの、ポポイとディラックの犠牲の末に世界の滅亡は避けられた
ランディとプリムは、ポポイのことは決して忘れないと誓い、世界を回り、戦いの終わりを仲間たちに報告
プリムとパメラはパンドーラ王国へ、ランディはポトス村へと、それぞれあるべき場所へと帰って行った
役目を果たした聖剣はランディの手により、再びポトス村の滝へと戻された
そして、ポポイもまた故郷へ戻ってきていた
マナが消えたことで世界は二つに別れ、ポポイは姿こそ見えなくなってしまったが確かにそこに存在していた

敵を倒すと宝箱を落とすことがある。また、ダンジョン内に宝箱が落ちていることもある。宝箱を振って開けることでアイテムを入手することができるが、中には罠が仕掛けられているものもある。終盤のダンジョンでは、宝箱から最強防具や武器のパワーなどが入手できる。一度クリアしてしまうと侵入不可となるダンジョンもあるため、防具で二度と入手できなくなるものもある。
1971年10月25日15時37分頃、近鉄大阪線の西青山駅 - 東青山駅（両駅は現在とは別の場所にあった）間の青山トンネル東口手前200m地点で、上本町発近鉄名古屋行き特急114列車（12200系12202F・12000系12001Fの4両編成、主要駅停車の通称「乙特急」）が、自動列車停止装置 (ATS) 故障のため誤停止した。当日該当事故が発生する1時間ほど前から青山トンネル内で事故列車以前に現場を通過した上り5本、下り1本の列車が同様に緊急停止する事象が起こっていた。原因究明のために現場に派遣された信号保守要員が地上子関連の検査を行ったが、故障原因が特定できなかったため、信号保守要員や東青山駅の助役が中川信号区に計測器その他を持ってくるように電話で連絡を行った。運転士はATS解除操作を行ったがブレーキが解除できず、停止地点は下り33‰の急勾配であったため、運転士は止むを得ず車輪に手歯止め（ハンドスコッチ）を挟み、各車輌の供給コック（ブレーキ装置からブレーキシリンダーにエアを供給するコック）をカットし、ブレーキシリンダーのエアを全部抜くという非常措置（制動不緩解故障の際の基本手順通り）を行った。しかし列車停止を聞いて東青山駅から駆けつけた助役が、運転士との何らかのやりとりの後に手歯止めを外してしまい、運転士は供給コックのカット解除を怠って運転室に戻ってブレーキを解除した。その結果114列車は走り出し、また供給コックがカットされていたことからエアの再充填も出来ず、ブレーキが効かない状態で連続33‰の下り坂を暴走し始める。この時、114列車の乗客は乗務員から後部車両へ避難するよう指示された、と証言している。15時58分頃、114列車は東青山 - 榊原温泉口間にあった垣内（かいと）東信号場の安全側線を、推定速度120km/h以上で突破し脱線転覆、左カーブであったため本線の切り通しへ転落した。3両目以降は総谷トンネル入口付近の壁に激突して止まったが、先頭の2両が横転した状態でトンネル内へ突入。直後に対向してきた賢島発京都・近鉄難波行き特急1400N(1400K)列車（12200系12226F・10100系C編成10118F・18200系18205Fの7両編成）が前方の異変を察知して非常制動をかけるも間に合わず、両列車は正面衝突した。これにより死者25名（1400N・1400K列車と114列車の運転士・車掌と114列車に乗っていた東青山駅助役の計5名および乗客20名）、重軽傷者227名を出す大惨事となった。対処した助役や乗務員が死亡したため、助役や運転士・車掌から事情聴取あるいは逮捕しての取り調べをすることができず、供給コックをカットしたまま運転士が運転室に戻った理由や、手歯止めを外すに当たって運転士と助役の連絡状況などは解明できなかった。なお、京都・難波行き列車は先頭5両が難波行き編成であったが、折しも京都で行われることになっていた医療関係者の学会のため、複数の医師が後部の京都行き編成（18200系2両のみ京都行き）に乗車しており、その医師等により一部の乗客に対して応急治療が行われた。事故直後の模様は、事故現場に唯一直接辿り着くことのできた報道機関であったNHKのテレビ取材クルーによって全国に報道された。その後の調査では、事故の発端となったATSの故障の原因は、ATS電源装置のヒューズの端子締め付けナットの緩みからくる接触不良によるものと判明した。事故当日は停止した7本の列車以外にも現場を通過した列車は多数あったが、接触不良の間欠性によって通電している時としていない時があり、列車によっては正常に通電していたのでATSの誤作動が発生せずに現場を通過できていたと推測されている。