しかし北田らは諦めず、今度は旧寄宿舎を含む、京大全体の気風革新を目指す学生運動を始めた。彼らは最初に運動の母体となる新しい学生団体「自彊会（じきょうかい）」を結成した。自彊とは易経の中の言葉で「みずから励まして努力する」の意である。自彊会の目的は、一つは会員同士が助け合い、切磋琢磨して終生の「正義の人」となること、もう一つはもちろん学内外の気風を革新することだった。自彊会は12月4日の発起人熟談会には36名、10日の発会式には42名を集め、順調な滑り出しを見せた。発会式には木下総長や石川学生監、荒木寅三郎、新渡戸稲造、仁保亀松などの教職員も訪れた。
1886年、文部省は大阪にあった第三高等中学校を京都府下愛宕郡吉田村に移転することを決定した。翌1887年、文部省の技師の山口半六と久留正道が同地域で測量調査を行い、第三高等中学校の工事が始まった。1889年7月、山口半六と久留正道の設計と山本治兵衛の現場管理の下、第三高等中学校寄宿舎と付設の食堂、便所、厨房、浴室等が次々と竣工した。なお、付設の食堂とは吉田寮食堂のことである。第三高等中学校寄宿舎は現在の吉田キャンパス本部構内、附属図書館の北東付近にあり、百万遍智恩寺と土手を隔てて隣接していた。傾斜のある瓦ぶき屋根のある木造建築で、外からは2階建てに見えたが、実際は広い屋根裏部屋があり3階建てだった。中廊下を挟んで、1階に自修室（自習室）が15室、2階に寝室が16室あり、4 - 5人の相部屋だった。1894年（明治27年）6月23日、第一次高等学校令に基づき第三高等中学校は第三高等学校（旧制三高）に改組された。第三高等中学校は廃止され、旧制三高は（高等中学校に匹敵する）大学予科を持たなかったため、学生の大半は京都を去った。これに伴って、第三高等中学校寄宿舎の建物は旧制三高寄宿舎に引き継がれた。
吉田下阿達町の薬学部構内に存在していた。木造2階建てのⅠ～Ⅲ棟が並列し、Ⅳ棟と大広間棟に近接する構造。1部屋15畳、6人2部屋で60名収容。京都織物の女工用宿舎として竣工し、1959年に「京都大学学生寄宿舎吉田寮西寮」として吉田寮に編入され、1, 2回生の住居として使われた。1965年にⅢ棟が、1988年にⅣ棟が、1989年にⅠ・Ⅱ棟が撤去され無くなった。
西寮は木造3階建ての2棟と鉄筋コンクリート造3階建て（地下1階）1棟からなる混構造である。収容定員94名。2015年4月に現棟と食堂の西側の空き地に建設された。吉田寮自治会によれば西寮は現棟の代替施設ではなく、（薬学部付近にあり、1989年に老朽化を理由に撤去された）旧吉田西寮の代替施設である。現在、京大は現棟のみならず新棟に居住する寮生の退寮も要求している。
第70回（2010年4月20日初回放送）では、森永の誕生日が間近だった事もあり、誕生日企画として、森永の「30までに結婚する」発言を鵜呑みにしたアウトロースタッフが結婚披露宴を開催。新郎を連れてこなかった森永にウェディングドレスを着させ、ウェディングケーキ入刀や能登麻美子（音声のみ）、小林ゆう、喜多村英梨、豊崎愛生と言った超!A&G+のパーソナリティーが動画（一部音声のみ）で祝辞コメントの紹介など、盛大に行った。なお、番組のエンディングで森永が次番組『高橋美佳子の の〜ぷらんでいこう♪』のパーソナリティーである高橋美佳子に向けてブーケトスをし、リピート放送分を含めた2週連続で次番組の冒頭で高橋が見事にキャッチすると言う、同一曜日の番組同士の連携技を見せた。なお森永と高橋は、かつて同じ事務所（アイムエンタープライズ）に所属していて（森永が所属を離れる2007年6月30日まで）、『の〜ぷらんでいこう♪』のスタッフはバロン（アウトローラジオの現在のディレクター）と高橋（アウトローラジオ3代目プロデューサー）である。ところが、この初回放送前の2010年4月15日生放送の『豊崎愛生のおかえりらじお』で豊崎が森永宛のメッセージを収録したことをネタバレしてしまった。これは、収録時にディレクターのバロンが豊崎に放送日を伝えていなかった上に、森永が『おかえりらじお』放送直前にお礼のメールをしたことにより、豊崎に「メッセージ収録分の放送は終了した」と勘違いさせてしまった事が原因である。だがこの企画はバロン曰く「番組始まって1、2を争うほど気合入れて準備した企画」だったらしく、ちゃんこもバロンもネタバレされたことについて、寛大な気持ちで「宣伝になった」と思っている。この件に関して、第71回（2010年5月3日初回放送）放送分でちゃんこが事情説明。森永はちゃんこに「甘いよ!」と一喝した上で、「アウトローの縦社会を教えるため、豊崎を次回のゲストに呼べ」と命令した。またリスナーからは「豊崎のネタバレ込みでの企画で、何かオチがあるのではないか」と思われていた。第72回（2010年5月18日初回放送）では、予告通り豊崎がゲスト出演。折り菓子やスイーツ、自身のCDを持って森永に直接謝罪した。森永も別に怒っているわけではなく、終始和気藹々とした雰囲気で、いつも通りのゲスト回が繰り広げられた。