テスがロズウェルを去ってから数ヶ月たったある日、マックスは故郷の星にいる息子に危機が迫っていることを感じ取る。マックスはリズと組んで強盗をカムフラージュに宇宙船を探そうとするが失敗し逮捕されてしまう。弁護士の養父のおかげで何とか釈放されたが、故郷に帰る手は見つからない。そんな中、ある日マックスはナセドが行っていた殺人と似たような犯行を知り、まだ他に宇宙人がいるのではと思いハリウッドへと向かう。そこにいたラングリーはマックスに協力する気がなく、宇宙船を発見したが飛び立つことができず、帰ることはまたも失敗する。一方、イザベルは養父の部下である弁護士のジェシーと交際していて遂に結婚する。しかし、宇宙人とばれないかおびえる毎日であった。リズはある日マックスに治療されたためか突然超能力が目覚め、マックスたちにも負けないような力を身につける。そのことが原因でロズウェルから去るが、ロズウェルではマックスたちの存在を知り力を手にしようとする人間がいた。その人間のせいでいったんはマックスは死んだが後に復活しリズもロズウェルに戻ってくる。マックスたちの父はマックスたちを不審に思っていて独自に調べ上げ、イザベルの部屋にカメラを仕掛けイザベルが超能力を使っているところをとられ、遂に宇宙人とばれてしまう。ジェシーにもばれ動揺するが、ジェシーはその後もイザベルの夫である事を選ぶ。そんな時、軍が謎の物体を破壊したというニュースが流れ、乗っていたのはテスで軍人を大量に殺害し、ロズウェルに突然帰ってきた。マックスとの間に生まれた息子は二人の人間の遺伝子を受け継いだ普通の人間であり、キバーはテスを受け入れずまたロズウェルに逃げるしかなかった。リズはアレックスを殺された怒りのあまり超能力でテスを吹き飛ばし、カイルとジムも受け入れようとしなかった。嫌々ながらマックスたちは軍に追われているテスを助けて逃げようとするが失敗し、テスは軍の基地に乗り込んで自爆する。しかし、イザベルが超能力を使っているビデオが軍によって押収されマックスたちの正体が軍にばれる。卒業式の前日、リズは突然予知能力を身につけ自分たちが殺される映像を見る。全員ロズウェルを去る決意をし、ジェシーとジム以外は卒業式の日に全員でロズウェルを去ることとなる。
前半はマックスとエイリアンのスキンズとの闘いがメイン。FBI達との戦いから数ヶ月、マックス達の故郷を乗っ取った敵であるスキンズが登場する。マックスたちはスキンズの町に乗り込みスキンズの生命を維持できなくするが、怒ったスキンズ達がロズウェルの町に乗り込んでくる。スキンズたちに追い詰められていくマックスたちだが、テスの超能力が爆発しスキンズはほぼ全滅する。一方、リズのもとには未来から地球外の物体グラニリスの力によって2014年からマックスが現れて、「世界崩壊を防ぐためマックスと別れてテスと現在の自分を一緒にするように」と諭する。後半はリズの親友だったアレックスの死に関する謎を追っていくストーリー。ある日アレックスが事故でなくなるが、実はテスが超能力でアレックスを遠隔操作して密かに調べ物をしており、その影響でアレックスの脳はぼろぼろになっていた。そして、テスは口封じのためにアレックスを殺害したのだった。一方、マックスはリズと別れテスと付き合いだしテスは妊娠する。胎児が地球の環境では生存できないと知ったマックスたちは、グラニリスを使って故郷の星に帰ろうとするが、実はテスの策略であった。テスはキバーとナセドの契約のため、マックスたち三人をグラニリスを使って生きたまま連れて帰ろうとするが、リズによって策略がばれ、失敗したため一人で帰ることとなる。
すべてはリズが銃撃されたことから始まった。ニューメキシコ州ロズウェルの高校に通っていたリズは放課後、彼女の両親の経営する「クラッシュダウン・カフェ」でウェイトレスをしていた。その日、店内で二人連れの男が口論となりひとりの男が発砲。流れ弾が腹部に当たってリズはその場に倒れた。そこに彼女のクラスメイトのマックスが駆け寄り、傷口に手を当てると、傷はみるみるふさがって、リズは命を救われた。そしてリズはマックスから、マックスと彼の妹イザベル、彼らの友人マイケルがエイリアンだという事を聞き出した。マックスは密かにリズに恋心を抱いていたので、秘密がばれる危険を承知でリズを助けずにはいられなかったのだ。この発砲事件はFBIの捜査が及ぶところとなり、秘密を知ったリズの親友マリアとアレックスを含めた6人は協力して、FBIのエイリアンハンターや敵対する宇宙人など次々に起こる事件を切り抜けていく。
この期には、元星組トップスターの紫苑ゆう、 元花組トップ娘役の秋篠美帆、元花組トップ娘役のひびき美都、元花組男役スターの幸和希、元月組男役スターの郷真由加、 元雪組娘役スターの仁科有理、元花組娘役で、現在は宝塚歌劇団振付家の御織ゆみ乃、元花組男役で、現在は舞台女優の翼悠貴が入団。
小松左京は1970年代に入るとSFの執筆よりも社会評論の執筆比重が高まっていった。この時期に執筆されたSF作品は短編集『ゴルディアスの結び目』（1977年）のように純文学や思考実験を意識した入り組んだ作風になっていた。1970年代後半からは日本で本格的なSF映画を作るという動きにも精力的に活躍し『さよならジュピター』を残し、次世代のSF作家に大きな影響を残している。また、1980年代になって『首都消失』を連載し、日本SF大賞を受賞するなど、日本SF史に重要な事蹟を残している。しかしながら、この時期には初期（1960年代以前）の小松作品を特徴づける壮大で思弁的な世界観を持つSF作品は生み出されなかった。『虚無回廊』はこういったブランクを越えた「小松的」なファン待望の、（結果として）最後となる長編小説であった。作中に登場する遠藤秀夫（HE）と彼が作った人工実存（HE2）の関係は父と子になぞらえられており、東浩紀はHEが人間実在(Human Existence)の略の意味も含まれるのではないかと推測し、「子が父を捨て、故郷には戻らないと宣言する物語」としている。また、小松の『果しなき流れの果に』との類似性を指摘し、反復であり、乗り越えであると推測している。瀬名秀明は本作の2大テーマを「一般自然言語は存在するか?」「宇宙の向こう側はどうなっているのか?」であるとし、この2大テーマをぎりぎりまで書き切ったと評している。また、瀬名は『虚無回廊』を元にして短編「ミシェル」を執筆している。瀬名は「ミシェル」で宇宙論の部分を書かずにいたが、高島雄哉の短編「ランドスケープと夏の定理」を、その部分を埋めてもらった気分と評し、「ランドスケープと夏の定理」が執筆された2014年を「『虚無回廊』が完結した年」だと評している。謎の超巨大宇宙構造物「SS」を舞台に、探査のため人類が送り込んだ人工知性が多くの異星知性体と邂逅し、共に「SS」の謎と真理を追究する姿を描く。代表作『果しなき流れの果に』の流れを汲みつつ、「宇宙」「生命」「知性」「文明」「進化」「愛」と多くのテーマを内包した、小松SFの総決算というべき大作である。