明治4年の神社規則は当時の実状によって社格の上下を定めたものであったため、式内社や国史見在社の中には社格を与えられないもの（無格社）もあり、それらの廃絶を憂慮した教部省（神祇官の後身）において本書の編纂が発起された。明治7年4月10日上級官である太政官に、式内社と国史見在社を主対象とする本書を編纂し、収載の神社は春秋2季に宮中の神殿（当時は賢所に合祭されていた）にて遙祭し、その社地は官幣社に準じて保存する、という内容の本書編纂の伺いをたて、同月17日に改めて太政官へ、各府県に対し管内神社の調査を命じる太政官からの御達状の案文を上申した。太政官においては、府県の事務を煩わすことが危惧され、5月5日にその是非を内務省へ打診したところ、案の定地方事務煩雑を理由とする反対意見が上申されたため（同月14日）、教部省に対して、本書編纂は許可するものの、神殿での遥祭と社地保存の可否は本書完成を待つこと、また府県に対する調査命令は太政官からではなく教部省布達とすること、と指令した（同月22日）。そこで6月に教部省から府県に対して、管内式内社と国史見在社を遺漏無く調査し、同年9月末日までに報告するよう布達を下した。ちなみに調査の内容は、1鎮座地、2社名、3祭神、4由緒（社家の家系を含む）、5勧請の年月、6例祭日、7社殿の建坪、8境内地の面積（旧境内地を含む）、9旧社領、10氏子戸数、11管轄庁からの距離、の11項目であった。また省内においては、社寺課と考証課の2課を中心に編纂掛を設けたが、明治2-4年の神社調査よりも更に詳細な調査を求めるものであったため、期限を過ぎてもなかなか報告が集まらず、再三の督促を命じても、そのたびに猶予を願う府県が出る始末であった。明治9年8月になっても尚難航していたが、翌年1月には教部省が廃止されることになったため、遺漏を残しつつも同年12月に一応の完成を見たのが本書である。
明治元年（1868年）、神仏分離の一環として、全国神社に対しその由緒を管轄する領主へ届け出るよう通達し、次いで同2年6月10日府藩県に命じて、式内社及び各府藩県において崇敬厚い大社の由緒や社伝等を調査録上させたが、なかなか進捗しないために、翌明治3年2月29日、暫定処置として各府藩県の官幣神社の分を同年9月までに神祇官へ提出するよう改めて命じ、それらを纏めて『式社崇敬社調書』が編纂された。更に同年閏10月28日、神社規則制定の必要から府藩県に管内神社のより詳細な調査を命じ（『大小神社取調書』として結実）、それを基に同4年5月、官国幣社以下の社格が規定された。（詳しくは近代社格制度を参照）
1890年に、ビーンは、鉄道開発者で投機家のジェイ・グールドが特別列車でラングトリーを通過する予定だという知らせをうけとった。ビーンは、危険信号をつかって列車を停めるため旗を振った。橋が落ちたと思って、列車機関士は、列車を停めた。ビーンはそれから、グールドとその娘を来賓としてサルーンに案内した。グールドらは2時間ほどサルーンにとどまったが、グールドが列車衝突事故で死亡したという誤報が寄せられた結果、ニューヨーク株式取引所で短期的な恐慌がおきた。1896年にビーンは、リオ・グランデ川の島のうえで、ボクシング世界チャンピオン試合ボブ・フィッシモンズ対ピーター・マーハー(Peter Maher)を主催したが、これはボクシング試合がテキサス、メキシコ両州で違法であったからである。試合は、わずか1分35秒でフィッツシモンズが勝ったが、その後のスポーツ記事は合衆国じゅうにビーンの名声をひろめた。晩年に、ビーンズは、測量技師で土木工学者W・D・トウィッケル(W. D. Twichell)に会った。はじめテキサス州アマリロを、のちにテキサス州オースティンを本拠として、トウィッケルは、テキサス254郡のうち165を測量した。老いるにつれて、ビーンは、自分の利益の大部分を地域の貧民をたすけるのについやし、つねに地元の校舎には冬ばに無料の薪（まき）があるように手配した。ロイ・ビーンは、サンアントニオでひとしきりの痛飲ののち1903年3月16日にベッドでやすらかに死亡した。彼と息子サム・ビーン(Sam Bean)（1874年 - 1907年）は、デル・リオのホワイトヘッド・メモリアル・ミュージアム(Whitehead Memorial Museum)に埋葬されている。1965年に、テキサス州の南北戦争100周年記念の一環として、ロイ・ビーンを顕彰する公式のテキサス・ヒストリカル・マーカー(Texas Historical Marker)がテキサス州デル・リオのミュージアムの敷地内に建てられた。
初登場は夢の超人タッグ編「パートナー決定!!の巻」。キン肉マンとタッグチーム「マッスル・ブラザーズ」を組み、同じデザインの黒いマスクとタンクトップとパンタロンで身を包み彼の相棒を務めた謎の覆面超人。その正体はキン肉マンの師・プリンス・カメハメ。悪魔六騎士の生き残りアシュラマン、サンシャインの陰謀によりパートナーの見つからないキン肉マンを救うため、宇宙超人タッグ・トーナメントに参戦した。しかし、大会中にテリーマンの身代わりとなり死亡。カメハメは死ぬ間際に失格処分となっていたテリーマンにグレートマスクを託す。以降テリーマンが2代目グレートとしてキン肉マンと共に戦う。これはカメハメとテリーマンの間で決められた事であって、テリーマンはパートナーであったキン肉マンにも真相を告げず、公には初代と同一人物のグレートとして正体が判明するまで活動し、戦った。『キン肉マンII世 究極の超人タッグ編』では、孤児院「がきんちょハウス」の少年カオスが、宇宙超人タッグ・トーナメント決勝戦を観戦していた際に、偶然手に入れたグレートマスクをキン肉マンことキン肉スグルの息子・キン肉万太郎との協議で勝手ににかぶり、カメハメやテリーマンの許可も無く3代目のグレートIII（-スリー）を名乗る。万太郎とタッグチーム「マッスルブラザーズ・ヌーボー」を組み、時間超人のライトニング、サンダーの陰謀により歴史改変が起き、仕切り直しとなった宇宙超人タッグ・トーナメントに参戦した。しかし、大会中にマスクやコスチュームは破れ、カオスの正体が判明。カオスはその後も判明した姿で本名のカオス・アヴェニールとして公式試合を戦い続けるが、ネプチューンマンを助けるために死亡。破れたグレートマスクは「がきんちょハウス」のシスターが密かに回収して裁縫にて修復されていたが、カオスの死後にキン肉マンが持ち去り、復活を遂げていたケビンマスクに託す。以降ケビンが4代目グレートとして万太郎と共に戦う。これはキン肉マンとロビンマスクがカオスの死後に決めたことであって、ケビンはパートナーであった万太郎にも真相を告げず、公にはカオスと同一人物のグレートIIIとして正体が判明するまで活動し、戦った。ゆでたまごの嶋田隆司によると、キン肉マングレートを登場させたのは「スグルとは別タイプのキン肉マンを出したい」「眉のあるキン肉マンを見たかった」と言う理由からであり、ファイトスタイルも対照的な打撃系になっている」。また「最初からマシンガンズだと順当すぎるので、読者をやきもきさせたくて」「最初からテリーマンと組むのは面白くなかった」という理由もあり、テリーマンと入れ替わるのは最初から予定していたと語っている