13日は長野駅 - 富山駅間を運休し、富山駅 - 金沢駅間は「つるぎ」を運行し、東京駅 - 長野駅間は20時半以降に運転再開し臨時列車4本が運行された。ただし避難指示が出ている上田駅は閉鎖となった。北陸新幹線の切符をもつ旅客はサンダーバード号としらさぎ号、および東海道新幹線に乗車する際の運賃が免除された。14日は長野駅 - 糸魚川駅間を運休し、富山駅 - 金沢駅間は「つるぎ」、糸魚川駅 - 金沢駅間は「臨時はくたか」を運行し、東京 - 長野駅間は午前6時台から午後11時台まで、おおむね1時間に1本程度の「あさま」の運転がされた。北陸新幹線の切符をもつ旅客は13日と同様に他経路乗車時の運賃の支払いが免除された。15日以降は運休区間が長野駅 - 上越妙高駅間に縮小し、「臨時はくたか」が一部金沢駅から上越妙高駅まで運行された。13・14日発表の経路に加え、少なくとも10時より北陸新幹線、高山本線（特急ひだ）、東海道新幹線利用時、少なくとも12時より北陸新幹線、えちごトキめき鉄道・信越本線（特急しらゆき）、上越新幹線利用時に北陸新幹線の切符をもつ旅客は他経路乗車時の運賃の支払いが免除された。10月18日、JR東日本は東京駅 - 金沢駅間の直通列車を通常の約9割、北陸新幹線全体では約8割程度を確保して25日に全線で運行再開すると発表した。10月23日、運行再開後の暫定ダイヤを発表し、東京駅-金沢駅間では通常48本に対して46本、東京駅-長野駅間では通常34本に対して23本、金沢駅-富山駅間では通常36本に対して35本と、合計では通常118本に対して104本での運行となった。
石川県白山市が金沢駅 - 小松駅間に新駅「白山駅」（仮称）を誘致する運動を行っていた。当初、白山総合車両所に新幹線乗降場を設置する案が提起されていたが、その後北陸本線加賀笠間駅周辺に新駅を設置する構想となっていた。「北陸新幹線（仮称）白山駅建設期成同盟会」を地元自治体・経済団体で構成していたものの、2017年4月15日、「白山駅」設置を断念。同年5月に同盟会解散を決定した。
1975年から国鉄において、P波から地震の規模や位置を推定するアルゴリズム（早期検知アルゴリズム）の研究が行われ、世界初のP波警報システムである「ユレダス (Urgent Earthquake Dtetection and Alarm System)」の開発が進められた。ユレダスは1992年に東海道新幹線で導入が開始され、1998年には北陸新幹線 高崎 - 長野間においても導入された。ユレダス導入によってP波およびS波の2種類の警報判定が可能になり、S波到達より早く新幹線の停止信号を送ることが可能になった。その後、最新の観測技術や高速ネットワークに対応し、早期探知アルゴリズムを改良した「早期地震防災システム」が開発された。2004年に発生した新潟県中越地震による上越新幹線脱線事故をうけて、新幹線車両が地震などにより脱線した場合でも、車両がレールから大きく逸脱することを防止する「車両逸脱防止L型ガイド」を開発し、2008年度上期までにすべての新幹線車両に設置を完了した。さらにレールの転倒や大幅な移動を防ぎ、L型車両ガイドが有効に機能するよう、スラブ軌道用やバラスト軌道用などの「レール転倒防止装置」を開発し、敷設工事が進められている。
北陸新幹線の経由する上信越・北陸地方は日本でも有数の豪雪地帯であり、冬季においても安定輸送を維持するための対策が施されている。JR東日本管内ではスプリンクラーによる散水消雪方式が採用されている。飯山エリアでは、東北新幹線で実績があり、厳冬期に早期散水が可能となるよう予め送水本管内に温水を循環させておく「循環方式」を採用している。一方、上越エリアでは、上越新幹線で実績があり、散水終了後に送水本管内の水抜きを行うことで凍結を防止する「水抜き方式」を採用している。また、新規導入設備としてトンネル緩衝口端部より5m幅で散水するトンネル雪庇散水や、下り線側の保守用斜路への散水消雪設備が導入された。JR西日本管内では、沿線に水源にを確保できる場合はスプリンクラーによる散水消雪を採用し、困難な場合には高架橋の軌道下の路盤コンクリートを高くし、線路の両脇に雪を貯める貯雪方式を採用している。比較的降雪量の多い区間では、高架橋内の降雪を減らすための雪覆いを設けた半雪覆式貯雪型高架橋が採用されている。貯雪可能な量を超える積雪が予想される糸魚川 - 富山間の黒部地区では、夜間にローターリー除雪車で雪を高架下に投下できる側方開床式貯雪型高架橋が採用されている。しかし、道路などがあり高架下への投雪が困難な区間では、高架橋を拡幅して貯雪量を増やした閉床式貯雪型高架橋（拡幅型）、拡幅も困難な場合は高架橋のケーブルダクト上に加温した不凍液を循環させる温水パネルを設置して融雪するなど、周辺環境に合わせた対策を行っている。また、トンネル間の短い明かり区間にはスノーシェルターを設けることで高架橋への積雪を防止している。金沢駅〜飯山駅では雪害対策のためホーム全体が屋根で覆われている。
セントミリンに示されたハンデキャップは8ストーン6ポンド（約53.6キロ）だった。アーチャーはセントミリンに乗るために無理な減量を行った。3日間絶食して下剤を飲み続け、蒸し風呂に入り続けた。アーチャーは体調を落とし、精神的にも追い詰められていた。結局、体調不良のアーチャーが乗ったセントミリンはアタマ差で2着に敗れた。結果的に、ケンブリッジシャーハンデは、アーチャーが唯一勝てなかった重賞となった。11月4日に騎乗したロスチャイルドプレート競走後に、アーチャーは体調不良を訴えた。不調を圧して次に組まれていたキャッスルプレートにも出場したが惨敗を喫し、これが最後の騎乗となった。翌5日にはニューマーケットの自邸に戻ると、腸チフスと診た医師の命によって療養することになった。病状は更に悪化し、高熱と悪寒に苛まれベッドから起き上がる事もままならない状態となった。11月8日には、アーチャーは幾分回復したように見えた。アーチャーの病室には、看護士と姉コールマン夫人が看病に当たっていた。アーチャーは看護士に休憩を勧め部屋から出し、コールマン夫人に換気のため半開きになった窓を閉めるように言った。彼女が窓を閉めようとアーチャーから目を離している間にアーチャーは床に立ち上がり、「Are they coming?（奴ら、来たか?）」と呟いた。コールマン夫人がアーチャーに目を戻すと、アーチャーは拳銃を握っていた。その頃、押し込み強盗が近隣を荒らしていたのである。コールマン夫人は、アーチャーから拳銃を取り上げようとして、アーチャーともみあいになった。錯乱したアーチャーは自分の頭部に拳銃を押し当て、引き金を引いた。銃弾は脊髄と後頭部を破壊し、アーチャーは死んだ。29歳であった。ファルマス卿に見放され、家族を失った孤独と、異常なまでの勝利への執着と無理な減量が、アーチャーの心身をむしばんで死に至らしめたと考えられている。アーチャーが残した遺産は60000ポンドだった。。この時の拳銃は、ニューマーケットの競馬博物館に展示されている。