2003年12月5日、東京高裁で控訴審初公判が開かれ、S・Kの弁護側は一審判決の事実誤認を主張した。控訴審でも出所後の山崎が証人出廷したが、検察や弁護人への批判、裁判制度への疑問を呈したほかは、曖昧な証言に終始した。また、山崎は以前からKの無罪を証言しているが、その具体的根拠は述べていない。2005年2月14日、控訴審第16回公判では、KがB・C事件の死体損壊について、一部関与を初めて認めた。同年7月11日、東京高裁は元夫婦の控訴を棄却。両名とも上告したが、2009年6月5日、最高裁は上告を棄却。これによりS・Kの死刑が確定した。
物的証拠が極めて乏しい事件である上、S・K元夫婦が互いに罪をなすり付け合い、S・K・検察が三者三様の主張をした結果、公判は長期化した。また、捜査段階で全面自供し、事件解明に協力した山崎が、検察との密約を供述した上、S・Kの公判で証言拒否の態度を示すなど、波瀾の展開となった。
1995年1月から2月にかけ、埼玉県警と群馬県警の合同捜査本部は山崎の自供を元に、熊谷市と片品村を中心に広く捜索を行った。捜索箇所は群馬県片品村・川場村・白沢村（現:沼田市）・利根村（同）、埼玉県熊谷市・江南町・川越市・新座市などに及ぶ。片品の山林からは骨片・歯片・お守り・腕時計などが、塗川からは骨片・携帯電話の基板・家や車の鍵・義歯など（いずれも焼け残ったもの）が発見され、小さいながらも重要な物証となった。骨片は高温で焼かれていたためDNA鑑定が不能で、身元確認の手掛かりになったのはその他の遺留品であった。多数の捜査員が川に浸かり、川底の砂利を採取してふるいにかけ、数ミリ～数センチの遺留品を捜し出す懸命の捜査が功を奏した。河川の捜索にあたっては、事情に詳しい群馬県警捜査員から「金属などは意外と水に流れず、現場にとどまっている」との助言があったという。事実、事件発生から1年半～2年近く経過していたにも関わらず、物証が遺棄現場の川底から発見された。
一連の事件で特筆されるのは、Sが「ボディを透明にする」と呼んだ残虐な遺体の処理方法である。被害者4人の遺体は山崎方の風呂場で解体された。骨・皮・肉・内臓に分けられた上、肉などは数センチ四方に切断。骨はドラム缶で衣服や所持品と共に、灰になるまで焼却され、それらは全て山林や川に遺棄された。Sは、遺体を埋めても骨は残ることから、焼却してしまうことを考案。しかし、遺体をそのまま焼くと異臭が発生するため、解体して骨のみを焼却したという。燃え残りが出ないよう、1本ずつじっくり焼く念の入りようであった。このことについて山崎は、Sが『面白い・楽しい』と供述したと話している。
カナンデイグア市はセネカ族インディアンの集落カナンデイグアがあった場所である。今日ウェスト・アベニュー墓地があるウェスト・アベニューにあった。1669年、探検家のロベール＝カブリエ・ド・ラ・サールやルネ・ド・ブレアン・ド・ガリネーがこの地域を訪れており、その時に近くのブリストルの町で、セネカ族に燃える泉と呼ばれたものを観察した。そのような泉は、天然ガスを逃がすことで生じる炎を支える水が出て来る場所で起きており、カナンデイグア地域で幾つかが見られた。セネカ族の集落は23戸のロングハウスで構成されていたが、1779年9月10日のサリバン遠征で破壊された。市の公立高校であるカナンデイグア・アカデミーは1791年に設立された。1794年11月11日、この町でカナンデイグア条約が締結された。この条約はアメリカ合衆国とイロコイ連邦の6部族との間に平和と友好関係を構築することを期待して結ばれたものであり、今日でも連邦政府によって認知されている。1815年、現在のカナンデイグア市がカナンデイグア町から分離してカナンデイグア村となり、1913年には市になった。1807年から1808年、ジェニーバの小麦粉商人ジェシー・ホーリーがエリー運河建設の初期かつ主要な提唱者となり、カナンデイグア債務者刑務所で20か月を過ごした。この期間に運河を建設する考えについて14件の随筆を出版し、大いに影響を与えることになった。イリノイ州選出のアメリカ合衆国上院議員で、1860年には民主党大統領候補になったスティーブン・ダグラスが、1830年から1833年1月までの3年間、カナンデイグア・アカデミーの生徒として過ごした。1873年、女性の権利活動家スーザン・B・アンソニーが、投票に関してカナンデイグア市にあるオンタリオ郡裁判所で裁判に掛けられた。アンソニーは有罪となり罰金100ドルを言い渡されたが、払わなかった。1945年、カナンデイグア・ワイン社をマービン・サンズが設立した。この会社は1980年代から1990年代に買収によって急速に拡大した。他の会社と合併してコンステレーション・ブランズを結成し、世界最大級のワインと蒸留酒の販売元になった。2006年、カナンデイグア・ワイン社が、コンステレーション・ワインズ, U.S., Inc.の子会社センテラ・ワイン社にブランドを変えた.。2006年3月14日、大統領ジョージ・W・ブッシュがカナンデイグアを訪れて、カナンデイグア・アカデミーと、シニアのための介護付き生活施設フェリスヒルズで演説した。この訪問の目的は高齢者のためのメディケア・パートDについて話すためだった。