『Vフォー・ヴェンデッタ』における近未来のイギリスは、ヨーロッパ大陸における局地的な核戦争の結果、独裁者が政権を得て国の支配権を掌握した全体主義国家になっている。その姿はマスメディアは政府にコントロールされ、街では秘密警察が反体制言動に目を光らせ、マイノリティや同性愛者がすべて強制収容所へ送られてしまうなどナチス・ドイツのようなファシズム国家を連想させる。また、政府がテクノロジーを駆使して国民の統治を行っている点はジョージ・オーウェルが『1984年』で描いたソ連を連想させる社会主義国家に類似していることが指摘されている。このように様々な全体主義の特徴を集約した最悪の体制が描かれている。なお、監視カメラは現在と違い、この作品が発表された頃のイギリスではさほど一般的ではなかった。ストーリーの冒頭では、国民たちは既に体制に従順になっており、マイノリティたちが全員処刑されたことによって強制収容所も閉鎖されている。しかしテロリストおよびアナーキストである謎の人物"V"がガイ・フォークスの仮面をかぶって出現する。彼はその非凡な技能を駆使して、演劇的かつ暴力的に体制を崩壊させようとするのだった。主人公の"V"は徹底的に謎めいた存在として描かれており、彼の正体や過去は殆ど明らかにされない。彼が超人的な肉体と精神の持ち主で、かつて強制収容所に入れられていたこと、そこで人体実験を受けたらしいことなどが話中で示唆されるものの、いずれも彼の正体を明確にするようなものではない。またストーリーの大半は"V"によってではなく、彼の保護を受ける少女イヴィーや、彼を追う刑事、腐敗した政権内の官僚たちの視点を通じて語られていく。また"V"の破壊的な活動は、必ずしも「正義」と見なされるものではない。この作品の中心的なテーマは、「崇高な目的（国の管轄であれ、個人の自由であれ）のためなら、非道な行為も正当化されるのか？」というものであり、"V"自身も単純なスーパーヒーローなどではなく、「正統なアナーキズムの推進者」および「無秩序としてのアナーキズムの推進者」そして「ステレオタイプのテロリスト」といった要素が混在したキャラクターになっている。ストーリーではアルファベットの「V」および数字の「5」（ローマ数字では「V」）が象徴的に使用されている。例えばトマス・ピンチョンの小説『V.』が登場したり、強制収容所で"V"が入れられていたのが5号室であったり。また各章のタイトルは全て「V」から始まる言葉になっている。
12月30日、チャーは最初の哨戒で南シナ海に向かった。1945年1月29日、チャーはインドシナ半島沿岸から1マイルと離れていない海上に堂々と錨を下ろしながらゴムボートを出して、海岸に倒れている2人の味方パイロットの救助任務を実行した。この後、チャーはジャワ海とロンボク海峡を通過中に、攻撃を受けて損傷したオランダの潜水艦ズヴァードヴィッシュ (HNLMS Zwaardvisch, P322) と会合し同艦を護衛した。3月3日、チャーは63日間の行動を終えてフリーマントルに帰投した。3月27日、チャーは2回目の哨戒でガビラン (USS Gabilan, SS-252)、ベスゴ (USS Besugo, SS-321) とウルフパックを組んでフローレス海、ジャワ海および南シナ海方面に向かった。チャーには機雷敷設の任務も与えられていた。4月4日、チャーとガビランの元にイギリスの潜水艦スパーク (HMS Spark, P236) の情報によって、軽巡洋艦五十鈴がこの近海にいることを知った。その時、ベスゴが五十鈴、水雷艇雉、掃海艇2隻からなる艦隊を発見、ベスゴから五十鈴を攻撃するには位置関係が遠すぎたため、五十鈴の始末はチャーとガビランに委ねられ、チャーとガビランは浮上したのち4日間に渡って、10海里から13海里の距離を保ちつつ五十鈴らに対する追跡を開始した。4月6日、ガビランは陸岸ギリギリに航行中の五十鈴を発見し戦闘配備についたが、その最中に五十鈴が魚雷が確実に当たる範囲から離れていったので、この時は攻撃を諦めた。ベスゴは500メートルを切る至近距離から五十鈴に対して魚雷を9本発射したが、五十鈴ではなく第12号掃海艇に命中し、これを撃沈した。五十鈴は同日の夜にスンバワ島のビマに入港し、翌朝五十鈴は出港した。チャーがレーダーで五十鈴の出港を知り、ガビランに連絡した。ガビランは6本の魚雷を発射したが、この時一門の魚雷発射管が故障したので、5本が五十鈴に向けて疾走していった。6時15分、そのうちの1本が右舷艦橋と一番煙突の間に命中した。この後、チャーが3本の魚雷を命中させて五十鈴を撃沈した。五十鈴は潜水艦の魚雷による犠牲となった最後の日本海軍軽巡洋艦であり、艦体を折って沈んで行く五十鈴の最期はチャーでもガビランでもなく、スパークによって確認された。チャーもガビランも、爆雷攻撃を避けるために深深度潜航していたからである。4月10日、チャーは沿岸貨物船を浮上砲戦で撃沈し、4月14日と4月15日には2日間にわたってマレー半島東岸プーロ島沖に機雷を敷設した。チャーは南シナ海を北上し、4月20日に一旦スービック湾に入り補給を行った後、4月24日に再出撃して台湾沖で救助任務に就いた。5月21日、チャーは51日間の行動を終えてスービック湾に帰投した。6月14日、チャーは3回目の哨戒でタイランド湾方面に向かった。この頃には目標らしい目標もほとんどなかった。7月14日、チャーがガソリン輸送潜水艦伊351を発見し、チャーは僚艦とともに巧みに伊351を追い詰め最終的にはブルーフィッシュ (USS Bluefish, SS-222) が伊351を撃沈した。7月26日、チャーは42日間の行動を終えてフリーマントルに帰投した。