バスク州議会のPNV・EHビルドゥ連立政権に対して常に批判的な報道をしている。「これはナシオナリスモ(国家主義)と全然違う」。これを口実に批判報道が開始された。しかし2009年-2012年のPSE・PP野党連合はバスク的・スペイン的にも保守色が強く、バスク民族主義者らに失望を与えた。それに比べるとPNV・EH ビルドゥ連立政権は、バスク民族主義者の大部分の民意を反映したものである。 彼らにとってバスク州、特にギプスコア県におけるスペイン主義への根強い支持は不愉快であり、形成を変えるため何か対策を講じるとしている。
2012年10月のバスク州議会選で地域左派政党PNVが勝利し第一党に躍進、153議席中49議席を獲得した。そして中道右派政党・国民党(PP)が負けたのは『エル・ディアリオ・バスコ』にとってダブルショックの始まりだった。『エル・ディアリオ・バスコ』が応援するPPは、PSE-EEと並んで28議席で第三党という惨敗ぶりである。これが1つ目のショック。『エル・ディアリオ・バスコ』は敗者同士のPSE・PP左右中道の野党連合を画策、これが実現しトータル56議席。政権与党のPNVは既に新政権を樹立していたが、その発言力に歯止めをかけられるはずだった。ところが、中道左右連合は内部から崩壊してしまう。2012年の敗北でバスク州政府首相を退任した後、財政再建・公共サービス・制度的枠組み等の立て直しに失敗したPSE-EE総理パチ・ロペスは2014年9月に解任、バスクを離れPSOE中央の役職へ移動させられた。これが2つ目のショックである。編集部が仕立てたPSE・PP=中道左派・中道右派野党連合は、その後にPNVとPSEが秘密裏に合意し、新たな連合を作ってしまうまで存続した。だが保革連合の崩壊を重く見た『エル・ディアリオ・バスコ』は、やむなく「自分たちのシナリオ」ではないPNV・PSEという地域的中道左派連合政権の支持・静観を、小さな勝利（迎合・販売増）のための新たな戦略とした。
2011年のバスク州議会総選挙では『エル・ディアリオ・バスコ』の地元ギプスコア県で、左派民族主義のEHビルドゥが最多得票だった。これに対し保守本流の立場から猛烈な批判をした。2015年のバスク州議会総選挙でもビルドゥ批判の論陣を張り続けた。バスク社会党(PSE-EE)やバスク民族主義党(PNV)にも行ってきた、反リベラル・保守的論調は相変わらずである。
2002年、『エル・ディアリオ・バスコ』は高速新線バスクYの路線ルートへの意見、そしてスビエタに廃棄物焼却炉の建設とその支援が必要という報道を強い論調で行った。2017年開通のバスクYは、サン・セバスティアンからビルバオとビトリア・ガステイスへ向かう路線がある。ビルバオに向かうルートから外れた地点にウルスビルという基礎自治体(ムニシピオ)があり、その領域内にあるのが問題のスビエタという地区(バリオ)で、現在サン・セバスティアンとウルスビルが所有権を分割している。2017年に完成した路線は、『エル・ディアリオ・バスコ』の要求通りスビエタとウルスビルを通って西のビルバオに直線的に向かわず、これを迂回して南方へ伸びエスキオ-イトゥサソ駅を経由して弧を描くようにビルバオへとつながっている。スビエタでは環境に与える悪影響などから、複数回の住民投票で焼却炉建設が延期されている。建設費用が1億ユーロという試算もあり、自治体住民の税負担は重くなる見込み。構想開始から約17年が経過した2019年現在も着工されていない。
2006年の契約更改でフロントから引退とコーチ就任を要請され拒否。1月27日、新日本プロレスを退団し、フリーランスとなる。退団に際し、オファーがくればハッスルでもPRIDEでも出る覚悟であると語った。ハッスルへは8月9日、「TG」のリングネームで参戦している。フリー転向後の初参戦団体はキングスロードで、2月28日の後楽園ホール興行に登場した。ビッグマウス・ラウドに参加した時はリングネームを「マッド後藤」とし、ドッグ小原（小原道由）と「マッドドッグス」を名乗り、村上和成と手を組んだエンセン井上と抗争を繰り広げた。5月4日にはDDTプロレスリングへ長井満也のタッグパートナーとして登場。新日入門当時の同期であったポイズン澤田JULIEと闘いを繰り広げた。澤田とは後にタッグを組み、「蛇界転生」した「後藤蛇つ俊」として参戦を続けた。5月19日のZERO-ONE MAX大阪大会では、大森隆男の持つAWA世界ヘビー級王座に挑戦した。プロ23年目にして初めてのシングル王座挑戦であり、大森を流血させて追い込んだが敗れた。7月12日に藤波辰爾らが旗揚げした無我ワールド・プロレスリングへ参戦。9月15日に正式入団した。ただしこのとき、所属契約は交わしていない。以後、無我のリングを中心に活動する。9月18日、大矢剛功とのバックドロップ同士の対決をし勝利した。2007年11月、藤波が「無我にヒールは要らない」と発言したことに対する反論を11月22日付東京スポーツに掲載。11月29日、無我は「会社にとって不利益となりうる新聞記事掲載、発言、その他問題があった」として後藤との参戦を今後見送るというコメントを出したため、以後無我への参戦が消滅した。その後、後藤は愛知を中心に活動するDEPのほか、大分のFTO（ダークサイドFTO最高顧問）など、ローカル団体のリングを主戦場として上がっている。2008年には小原とともに健介オフィスへ乱入したが、抗争へ発展する前にフェードアウトしている。2010年に旗揚げされた天龍プロジェクトにも参戦している。