1999年（平成11年）1月、日本電信電話は再編成後の組織づくりのため、「持株会社移行本部」、「東日本会社移行本部」、「西日本会社移行本部」、「長距離国際会社移行本部」の4移行本部に改組した。1999年（平成11年）7月1日、地域会社として東日本電信電話株式会社（NTT東日本）、西日本電信電話株式会社（NTT西日本）、長距離会社としてエヌ・ティ・ティ・コミュニケーションズ株式会社（NTTコミュニケーションズ）が設立された。日本電信電話は、既に分社化されたNTTデータ（1988年(昭和63年)設立）とNTTドコモ（1992年(平成4年)設立）等をグループ会社とする持株会社となった。現在NTTという呼称は、NTT東日本、NTT西日本、NTTコミュニケーションズを抱合する固定通信事業（固定電話やブロードバンドサービス等、分割前の日本電信電話自身が行っていた電気通信事業）を指すことが多い。「日本電信電話株式会社等に関する法律」（NTT法）第3条により、「会社及び地域会社は、それぞれその事業を営むに当たつては、常に経営が適正かつ効率的に行われるように配意し、国民生活に不可欠な電話の役務のあまねく日本全国における適切、公平かつ安定的な提供の確保に寄与するとともに、今後の社会経済の進展に果たすべき電気通信の役割の重要性にかんがみ、電気通信技術に関する研究の推進及びその成果の普及を通じて我が国の電気通信の創意ある向上発展に寄与し、もつて公共の福祉の増進に資するよう努めなければならない」とされているが、具体的且つ個別・直接的な義務は負っていない。ただし、電気通信事業法第7条および同施行規則第14条・第40条により、NTT東日本とNTT西日本は基礎的電気通信役務（固定電話・公衆電話・緊急通報、いわゆるユニバーサルサービス）を離島を含めた全ての市町村を対象に提供する義務を負っている。NTT法第2条第4項により、県境を越える通信サービスを開始する場合は総務省の認可が必要であったが、2011年（平成23年）の同法改正により事前届出制に変更された。現在も、基礎研究を手掛ける研究部門は分割されず持株会社内部に残っている。持株会社の事務部門は基本的には子会社からの出向という形を取っているが、研究職は持株会社が独自に採用している。また、独自に研究セクションを設けた子会社もある。再編成にあたって、「日本電信電話株式会社法」による規制の有無と業態によりグループ会社を第1類 - 第4類に分類し、事業・サービスの整理・統合を進めている。なお、第1分類は規制会社でNTT東日本、NTT西日本が、第2分類は競争会社でNTTコミュニケーションズ、NTTデータ、NTTドコモ、第3分類は経営資源活用会社でNTTコムウェア、NTTファシリティーズ等が、第4分類は新事業開拓会社でNTTファイナンス、NTT都市開発等が該当する。
サノスは後に地球のユニバーサル・ライブラリーの知識を含んだロボットを抜き取る任務のため、ヴィランたちを集めてチームを結成し、ギーターを現場指揮官に任命した。サノスはギャラクタスの失敗作であるタイラントとの戦いの際に、ロボットからの情報を利用した。異次元に閉じ込められた際にサノスはカイ・ザーの弟のパーニバル・プランダー、さらにはハルクの助けを得て脱出を試みたが、どちらも失敗した。その後解放されたサノスは宇宙の全生命を滅ぼせるタリズマンを入手するためにマンゴグと手を組んでソーと争い、この戦いの最中にサノスは惑星リジェル3に莫大な被害を与えた。次にサノスはソーとジーニス・ベルを利用して死神ウォーカーに対抗し、ミストレス・デスに言い寄ろうとするが拒否される。それからサノスは自ら創造した新しい神の種族の主神になる計画を練る。しかしながらサノスはアベンジャーズの元メンバーのマンティスと彼女の息子のクォイに反対される。サノスはミストレス・デスと共にサノスのデスへの愛が原因で深宇宙を異常を起こす「腐敗」を破壊した後にこの計画を破棄した。またサノスは遺伝学を研究し、宇宙中のヒーローとヴィランのクローンを作り上げて自分のDNAを組み合わせた。サノスは後に計画を断念するが、プロフェッサーX、アイアンマン、グラディエーター、ドクター・ストレンジ、ギャラクタスのクローンが生存していた。さらに6人目としてサノスのクローンも存在しており、ソーとカイ・ザーと遭遇した。本物のサノスはアダム・ウォーロック、ガモラ、ピップ・ザ・トロル、スパイダーマン、キャプテン・マーベル、ドクター・ストレンジの協力により残りのクローンを倒した。アクエンアテンと呼ばれる古代エジプトのファラオがコズミック・パワーの源を利用し、現代の地球を掌握（この過程で地球のヒーローの多くを抹殺）すると、サノスはタイムトラベルして彼を倒す計画を実行する。アクエンアテンを倒したサノスはパワーを使って宇宙を元に戻す。アクエンテンを倒したことによりハートオブユニバースの力を手に入れたサノスは全多元宇宙の全存在を消去するが、それを免れていたアダム・ウォーロックとの対話後に再び元に戻した。サノスはリジェル3を破壊した償いをすることを決め、ギャラクタスによってそれが消費される前にリジェリアンたちの避難を手伝うことに同意する。この過程でサノスはギャラクタスがインフィニティ・ジェムを集めて自身の永久的な空腹を終わらせようとしていることを知る。サノスは後に、ギャラクタスの餓えはハンガーと呼ばれる宇宙の驚異によって操作されたものであることを知る。サノスの反対にも関わらずギャラクタスはハンガーを解放し、その意思が明らかになると2人はチームを組んで倒した。キルン刑務所に向かう途中、サノスはデスと会い、彼女は初めて彼と会話を交わした。デスは求愛するには死以外のものを捧げねばならないと主張する。クリンでサノスは収監されていたスター・ロードとシャイアの戦士グラディエーター、記憶を失っていたビヨンダーと遭遇した。サノスはビヨンダーと戦って心をシャットダウンさせ、死なないまま意識不明状態でいるように仕向けた。さらにサノスは生まれ変わりを防ぐために、このまま永久に生命維持してビヨンダーを保存するようにキルンの職員に告げた。サノスは刑務所から解放されたカオスマイトのスクリートと共にキルンを出発した。その後サノスは元ヘラルド・オブ・ギャラクタスのフォールン・ワンと遭遇する。サノスはフォールンを破り、精神コントロールによって支配下に置いた。