昭和18年末、ニューブリテン島のココボで丸山二等兵は、今度行くところは「天国のような場所」と戦友の赤崎から聞く。彼らは出発前にピー屋に行くが、何十人も兵士が行列を作っているので目的を達せず「女郎の唄」を歌って帰って来た。そして彼らは若き田所少佐のもと、500名でバイエンに無血上陸する。丸山は古兵や上官にいびられ、また時には親切にされ、何とかバイエンでの時間を過ごして行く。だがそこは「天国のような場所」ではなく「天国に行く場所」であった。敵の攻撃で戦死する者のほかに、陣地構築中の事故で死ぬ者、伝染病で死ぬ者、ワニに食われて死ぬ者、手榴弾でとった魚を飲み込み窒息死する者･･･。やがて近辺のワランゴエ河口に連合軍が上陸、橋頭堡を築き攻撃を開始してきた。徐々に包囲してくる敵に対して、田所は中隊長の「高地にこもり持久戦をすべきだ」という意見を退け、玉砕覚悟の切り込み作戦を敢行する。その結果、田所は戦死、生き残った者は聖ジョージ岬に撤退するが、負傷した中隊長はその途中で自決する。そのころラバウル司令部ではバイエン支隊から玉砕の電信を受け、既に彼らは全員死んだものとされていた。ところが聖ジョージ岬警備隊から、バイエン支隊の生存者数十名が現在ここにいるとの知らせを受ける。この「敵前逃亡」は「ラバウル全軍の面汚し」とされ、事件処理のために木戸参謀が聖ジョージ岬に派遣されることになる。木戸の出発の前夜、バイエンの生き残りの軍医がラバウルを訪れて部下の命乞いをするが、談判決裂となり軍医は抗議の自決をした。軍医の遺骨とともに聖ジョージ岬に来た木戸はバイエン支隊将兵の尋問を行い、その結果、山岸と北崎の2人の小隊長は責任を取って自決、残りの81名は再突入を行うことになった。昭和20年6月、聖ジョージ岬に敵の有力部隊が上陸、バイエンの生き残り達は再び切り込みを敢行する。その突撃直前に木戸は「玉砕を見届け報告する冷たい義務がある」と退こうとするが流れ弾に当たり戦死。そして丸山達は「私はなんでこのような　つらいつとめをせにゃならぬ」と「女郎の唄」を歌って切り込み、全員玉砕した。隣の陣地を守っていた連隊長は、後にこの玉砕を聞いて「なぜそこまでして、あそこを守らねばならなかったのか」と述べたという。
戦地での水木はマラリアと左腕の負傷で後方に移送され、玉砕命令が出る前に部隊から離れていたが、それ以前に全滅した分遣隊から生還した際に「次は真っ先に死ね」と言われていた。それ故に、戦後のラバウルの収容所で聞かされた部隊の顛末に感情移入し、帰国後も折あるごとに情報を集め、全体の構図は松浦義教の著書『灰色の十字架』で理解したという。発表するあてもなく「ラバウル戦記」の執筆を始め、漫画家としてデビュー後も一貫して戦争体験にこだわり、断続的に戦記作品を発表する。そして、1971年に戦友とニューブリテン島を26年ぶりに訪れたことも契機となり、死んでいった戦友のことを書き残しておきたいという気持ちから本作の執筆に至った。
水木が従軍した南方戦線のニューブリテン島で下された、兵士500名への玉砕命令の顛末を描いた物語。戦記とはいえ戦闘描写が多く登場するような作品ではなく、兵隊たちの生々しい日常の姿を時にユーモアを交えて描いている。物語の終盤は史実に脚色を加えてフィクション化することで、事実を超える真実を描いたとも評されており、水木にとっては戦争体験の集大成となる思い入れの強い作品である。最初の単行本は『総員玉砕せよ!! 聖ジョージ岬・哀歌』のタイトルで、A5判箱入りのハードカバーで出版。その後もタイトルや体裁を変えて何度か出版されており、現在は講談社文庫や、水木しげる漫画大全集で読むことが出来る。国際的な評価も高く、2009年にアングレーム国際マンガフェスティバル遺産賞、2012年にアイズナー賞最優秀アジア作品賞を受賞している。翻訳は英語版『ONWARD TOWARDS OUR NOBLE DEATH』、フランス語版『OPERATION MORT』、台湾版『全員玉碎!』、ドイツ語版『AUF IN DEN HELDENTOD!』などが出版されている。
全域が日豊海岸国定公園の特別保護地区に指定されている。地黒島、沖黒島及び周辺の岩礁は、クロダイ（チヌ）、メジナ（グロ）などの磯釣りのポイントとして知られている。
ラクーンシティが混迷を窮める数時間前、母アネットの電話による指示でいち早くR.P.D.に避難していたが彼女がR.P.D.に到着した頃には、R.P.D.はブライアン・アイアンズ署長の凶行により、警察署としての機能は完全に潰えていた。アネットの電話の指示で身を隠す場所を探している最中、R.P.D.に避難してきたクレア・レッドフィールドとレオン・S・ケネディに保護され、危険地帯と化したR.P.D.およびラクーンシティから共に脱出するように説得を受け、それに応じる。しかし、その脱出の中で離れ離れになったときに気を失い、その際にG生物化した父ウィリアムにより胚を体内に植えつけられてしまう。程なく意識を取り戻すが徐々に衰弱の様相を呈していった（レオン表→クレア裏の順にプレイするとこの設定は反映されない）。彼女の危機をクレアから聞いたアネットは、クレアにワクチンの精製法を託すと、クレアは脱出の際に訪れた施設でワクチンを精製し、これを投与することで最悪の事態を免れるとクレアとレオンと共にラクーンシティからの脱出を果たし、兄を探すクレアを見送ると負傷したレオンと共にアメリカ政府へ保護されることとなった。しかし、実状は、アンブレラ研究員を両親に持ち、埋め込まれた『G』の存在から、監視下に置くと言う名目のもと、軟禁状態となる。リメイク版の『RE:2』では、『2』同様クレアに保護されるが、R.P.Dの地下駐車場で狂人と化したアイアンズにより拉致され、彼が院長を兼務する孤児院へと連れて来られる。隙を見て逃げ出し、アイアンズの顔に剥製作成用の劇薬を浴びせ、逃走を図ろうとするが、危うくアイアンズに捕まりそうになる。しかし、彼は怪物と化した父ウィリアムに殺害され、結果として難を逃れる。その後、アイアンズに電話でペンダントを持ってくるよう呼び出されたクレアと孤児院の地下で再会し、エレベーターで脱出しようとするが、タイラントとバーキンGの襲撃に巻き込まれてエレベーターを落とされ、再びクレアとは離れ離れになる。クレアによって下水道の施設内で保護されるが、この時すでにG-ウィルスに感染しており、ひどく衰弱した状態であった。研究所に連れて来られた後、母アネットによりクレアが持ってきた抗ウィルス剤を投与されて回復するが、アネットはバーキンGとの応戦で負った傷が致命傷となり、今まで一人ぼっちにさせ続けたことを詫びて死亡してしまう（『2』と異なり、どちらの順序で進めても同じ展開になる）。母親を目の前で失うという辛い出来事を経験するが、危機を救ってくれたクレアに感謝し、ラクーンシティー脱出後はレオンを含めた三人で朝日の中を歩いていくシーンで幕を閉じる。『3』のエピローグで描かれたその後によると、レオンの申し出によりクレアと別れることになった。