ビーストはアオイという名のサルの役で登場している。アオイは616のビーストに比べて若く、よりサルっぽい姿をしているが、青い毛皮はそのままである。勉強家で知性的なビーストと違い、アオイは陽気で悪戯好きである。裏をかかれた後、アオイはヒトメ（サイクロップス）の仲間になった。彼は巨大で強い形態に変化する能力を披露していた。
ニューエクスカリバーはプロフェッサーXがシャドウキングに取り憑かれた別次元のX-メンであるシャドウXの一員のビーストの邪悪なカウンターパートと交戦した。彼らはM-デイの結果としてアース616に送り込まれた。
白百合中学サッカー部でゴールキーパーを務める熊谷五郎は、恵まれた体格とセンスを持ちながら、勝利とは無縁のまま最後の公式戦を終える。幼馴染でマネージャーの伊藤渚はそんな状況を歯がゆく思い、最後の練習試合の相手探しを買って出るが、札付きという評判の南波中学と決まる。試合はストライカーの薬丸秀樹、ウイングの佐藤真悟を擁する南波に幾度となくゴール前に迫られるものの、五郎の果敢なプレーにより無失点に抑え、白百合がかろうじて勝利を収める。高校受験を控えた五郎と渚は、文武両道を掲げるサッカーの名門、横浜南高校（通称・ヨコナン）への入学を目指すが、受験日当日に渚が交通事故に遭い、五郎も病院まで付き添ったために試験を受けることができずに終わる。二人は二次募集でヨコナンの向かいにある私立川崎高校（川高）へ入学することになるが、そこには中学最後の練習試合で意気投合した薬丸、シンゴの姿もあった。五郎、薬丸、シンゴ、渚は同校のサッカー部に入部。元ヨコナンのレギュラーでキャプテンの織田和仁の下、「打倒ヨコナン」を目標に掲げインターハイ予選に出場する。川高イレブンは島原誠を擁する瀬谷二高、黒崎亨を擁する茅ヶ崎商工を下し、決勝進出を果たすと相手は茅野鷹志、日比野慶彦らを擁するヨコナンとなる。試合は川高がヨコナンを相手に健闘するも、織田が古傷の膝を痛めて退場、五郎が茅野の強烈なシュートにより負傷するアクシデントもあり2-3のスコアで敗れる。敗退後、織田の復帰の目途が立たない中、南米帰りのキーパー・日比野勝彦の加入により、五郎はフィールドプレーヤーへの転向を決意。高校選手権予選決勝では織田も合流してヨコナンにリベンジを果たし、全国大会出場を決める。高校選手権ではキャプテンの織田を欠きながら準々決勝進出を果たすと相手は優勝候補筆頭の静岡一高（静一）となる。試合は暮林哲郎、明智紀之らを擁する静一を相手に粘り強い攻防を続けるも一歩およばず、1-2のスコアで敗退。「静一へのリベンジ」が川高イレブンの新たな目標となる。新年度となりキャプテンとなった五郎の下で活動を始めた川高イレブンは天才スイーパーの島本守、素人ながら頑張り屋の阿部弘志らを加え、新たなスタートを切る。そんな中、五郎、薬丸、シンゴ、勝彦、島本は、ヨコナンの茅野や県下のライバルたちとともに神奈川選抜に選ばれ、国体に出場。準決勝で暮林らを擁する静岡選抜に勝利し、決勝では蘇我はじめを擁する鹿児島選抜のパワーの前に苦戦するも1-0で破り優勝を果たす。高校選手権予選決勝では2年連続で川高対ヨコナンの対戦となるが、茅野の挑戦を退けて2大会連続で全国大会出場を決める。高校選手権では、勝彦の兄・辰彦から五郎にドイツへの留学話が持ちかけられ、チーム内に動揺が走る中、準決勝で鹿児島学院を退け、決勝では因縁の静一との対戦となる。暮林、明智らにオランダ帰りの沢村健人を加えた静一を相手にのびのびと戦った川高イレブンは終了間際に薬丸が決勝点を決め、前年度のリベンジと大会初優勝を果たす。優勝という結果を手にし、笑顔で五郎を送り出そうとする薬丸とシンゴだったが、当の五郎は「来年もみんな一緒に国立に来たい」と留学の誘いを断ってしまい、周囲を唖然とさせるのだった。全国優勝で意気揚々とする川高イレブンは五郎をはじめとした主力メンバーに新入生の八木維らを加え、新たなスタートを切る。そんな中、2年間の公式戦出場停止処分を受けていた蕪双高校の松浦猛、西崎裕二が現れ一触即発の状況となるなど波乱のスタートとなる。インターハイでは3回戦で川高対蕪双のカードが実現するも、連勝続きで驕りのあった川高イレブンは蕪双の技術とパワーの前に敗れ去る。この敗戦を糧に夏合宿で体力づくりに取り組むと、高校選手権予選決勝では三度目のヨコナンとの対戦となる。一方、ヨコナンは最後の選手権出場にかける慶彦の下で堅守速攻型のチームへと変貌し、反則も厭わない荒々しさで追い詰めるも、川高が相手の守備を打ち崩して3年連続で全国大会出場を決める。迎えた高校選手権では準決勝で的場圭一らを擁する新興の成京高校を破り、決勝は川高対蕪双という因縁のカードとなる。試合は五郎と松浦という両エースの一騎討ちを軸に一進一退の攻防を繰り広げるも、怪我を押して出場を続ける五郎が決勝点を決め4-3のスコアで川高がリベンジを果たすとともに大会連覇を成し遂げる。高校卒業を前に、五郎はドイツへ留学、薬丸とシンゴは実業団、勝彦と渚は大学への進学を決め、後輩たちは新キャプテンの島本の下で活動を始めるなど、それぞれの道を歩むことになる。卒業式後、五郎がゴールポストに別れを告げグラウンドを去っていく場面で物語を終える。