1965年（昭和40年）4月1日、市立川岡中学校、市立円座中学校、市立檀紙中学校を統合し開校した。この3中学校は9年前の1956年（昭和31年）9月30日に高松市に合併した旧川岡村、旧円座村、旧檀紙村の旧村立中学校で、3村の高松市への合併を機に統合が検討された。
サブタイトル「Hostile Territory（敵地）」の通り、メインイベントではミドル級王者アンデウソン・シウバが、地元出身の挑戦者リッチ・フランクリンとの防衛戦に勝利し、世界ミドル級王座を防衛した。また、前ヘビー級王者ティム・シルビアはセミファイナルでキャリア8戦全勝のブランドン・ヴェラに判定勝ち。本大会より参戦したADCC 2007 88kg未満級王者デミアン・マイアは、ライアン・ジェンセンに一本勝ちを収めUFC白星デビューを果たした。
推古天皇御代2年（594年）勅により、大三島東海岸側に大山祇神社の元となる遠土宮（おんどのみや）が祀られる。のち国司越智玉澄は、大宝元年（701年）大三島の西海岸側に大きな社殿を造営し遷座しようと始めるが、社殿が完成し遷座の儀が行われたのは養老3年（719年）である。また、海を渡るため風雨の時祭祀が欠けることを憂い、文武天皇の勅を奉じて大宝3年（703年）大山積明神を当地（伊予国越智郡日吉村）に勧請し社殿を造営し始め、同時に、大山祇神社の法楽所として大三島に24坊を建立、その1つが南光坊である。当地の宮は、本宮より早い和銅5年（712年）に完成し、「日本総鎮守三島の地御前」として奉祀され別宮と称した。その後、正治年間（1199年 - 1201年）大三島の24の僧坊のうち、南光坊を含む8坊（中之坊・大善坊・乗蔵坊・通蔵坊・宝蔵坊・西光坊・円光坊・南光坊）が別宮の別当寺大積山光明寺の塔頭として移された。 弘法大師は弘仁年間（810年 - 824年）四国巡錫の時、別宮に参拝して坊で御法楽をあげられたとされる。天正年間（1573年 - 1592年）に伊予の全土を襲った長宗我部元親の四国平定の際、その軍勢により八坊すべて焼き払われることとなった。慶長5年（1600年）藤堂高虎が今治藩主に任ぜられると八坊のうち南光坊のみを再興。今治藩の祈祷所に定め祭典料を賜わせられ、薬師堂を再建した。また、四国八十八箇所の札所となっていた別宮の別当寺として納経を行い「日本總鎮守　大山積大明神　別當南光坊」と記帳するようになっていた。江戸時代には今治藩主久松家からも尊信を受け祈祷所として定め別当職を持続し、広大な寺域を誇った。文化年間（1804年 - 1818年）戊辰の年、讃岐の金毘羅大権現を勧請し金毘羅堂が造られる。江戸幕府製作の『寺院本末帳』には伊予国の欄に「仁和寺末 南光坊 末寺一宇 安養寺」とあり御室仁和寺を本寺とする中本寺（田舎本寺）として栄え、仁和寺から「院家」の称を賜るなど高い格式を有している。明治初頭、神仏分離令にしたがう形で、大山積明神の本地仏として別宮の本殿に奉安してあった本地大通智勝如来（だいつうちしょうにょらい）および二脇士と十六王子が南光坊の薬師堂に移され、55番札所の本尊は、「大山積大明神」から大通智勝如来となり、当寺は別宮から札所を受け継ぎ分離独立した。また、本式は遍路なれば大三島へ渡るとされていたが、その必要が無くなった。明治27年（1894年）頃山号を「大積山」から「別宮山」と改称している。大正5年（1916年）には時の住職・天野快道和尚により現存の大師堂が建造される。長州大工の建築技術が結集した建造物で、その文化的評価は高い。第二次世界大戦では激しい空襲（今治空襲）に晒され、昭和20年（1945年）8月、金毘羅堂と大師堂以外の本堂・本尊・庫裡什物等伽藍の多くを焼失した。昭和53年（1978年）、かつて当寺住職だった天野快道大僧正が京都醍醐寺の座主に就いていた縁もあり、真言宗御室派から真言宗醍醐派に転派し、総本山醍醐寺の末寺となった。戦後の復興は難渋したが昭和56年（1981年）に本堂再建。平成3年（1991年）薬師堂再建、平成10年（1998年）山門鐘楼堂完成、平成14年（2002年）四天王像を安置した。平成22年（2010年）大師堂を改修。平成25年（2013年）真言宗醍醐派から離脱。同年11月25日、歴史上長く密接な本末関係を有していた仁和寺を総本山とする真言宗御室派に再び加入し、その末寺に復した。空襲により本堂と共に焼失した後、本堂再建時に以前の約2倍の大きさで造られた本尊大通智勝如来坐像は両脇仏とともに秘仏であったが、平成26年（2014年）11月9日から16日まで開帳された。また、南光坊の本来の本尊不動明王立像も同時に焼失していたが、持仏堂の再建時に元の姿に近い形で造られている。