兵庫県城崎郡城崎町（現・豊岡市）生まれ。第五高等学校、京都帝国大学経済学部卒業。日本信託銀行入行後、阪神急行電鉄（現:阪急阪神ホールディングス）に移り、1946年12月、京阪神急行電鉄（1943年に阪神急行電鉄が京阪電気鉄道と合併して改称）社長に就任。社長在任中の1949年12月に京阪電気鉄道を分離再発足させている。1951年、電力界の再編成が行われ関西電力が発足すると、初代社長に就任した。同時に阪急時代の後輩である芦原義重が常務に就任している。太田垣は、戦後の電力不足事情をいち早く見抜き、大規模な水力発電所の建設に踏み切った。岐阜県の丸山水力発電所である。当時としては最大規模であった。関西電力がスタートした当時の資本金は17億円だったが、スタートしたばかりの時に、資本金の10倍もの資金を投じて大水力発電所の建設に着手したのである。終戦後の復興が目覚しい1950年代になり、関西地域の電力事情が逼迫する状況を目の当たりにした太田垣が、その打開策として手がけたのが世紀の難工事といわれた「黒部ダム」の建設である。建設に当たっては太田垣は「経営者が十割の自信をもって取りかかる事業、そんなものは仕事のうちには入らない。七割成功の見通しがあったら勇断をもって実行する。それでなければ本当の事業はやれるもんじゃない。黒部は是非とも開発しなけりゃならん山だ」と言って決断したのは有名な話である。「黒部ダム」建設計画でも後輩の芦原義重が太田垣を技術の最高責任者として補佐していた。こうした一連の難工事の経緯は石原裕次郎＆三船敏郎主演映画『黒部の太陽』（監督：熊井啓）で全国に知られるようになる。関西電力は電力業界で、経営内容において業界一を誇ったが、その基盤を確立させたのが「黒部ダム」だった。その成功をはじめとして、新しいエネルギーである原子力に着目、日本で初めて原子力発電所である「美浜発電所」（福井県美浜町）に着手するなど、常に先端技術を経営に生かした。1959年、太田垣は、関西電力社長のポストを芦原に譲り、また関経連会長のポストも太田垣から阿部孝次郎（元東洋紡績会長）を経て、1966年には芦原に引き継がれている。1964年、財団法人サンケイスカラシップの発起人として小林中、大河内一男、高村象平、水野成夫、鹿内信隆、沢村義夫等と共に名を連ねている。関西経営者協会会長、近畿圏整備審議会会長、関西経済連合会会長、電気事業連合会会長、産業計画会議（松永安左エ門主催）委員などを歴任した。また日本体育協会に請われて協会財務委員長に就任し、1964年東京オリンピック開催資金調達の総責任者を務めるなど多方面で手腕を発揮した。また、かつて京阪神急行電鉄の社長を務めた縁で、京阪電気鉄道と近畿日本鉄道（近鉄）の間で奈良電気鉄道の株式争奪戦が生じた際には両社の仲介に入り、太田垣の斡旋により最終的に近鉄が京阪の出資分を買い取って合併する形で決着させた。1964年3月16日、自ら建設を決断した黒部ダムの完成の翌年に脳軟化症により逝去。70歳没。
1990年に発足した「N1耐久シリーズ」が前身。当時はFIAの定めるグループN規定に準拠したJAF制定「N1」規定に属する車で争うシリーズとして開催されており、参加するドライバーもアマチュアとプロの中間レベルのドライバーがメインだった。しかし、1994年に全日本ツーリングカー選手権がグループA車両による耐久レース（JTC）からTuring car ClassⅡ（2,000cc 自然吸気エンジンの4ドア車両　後にグループSTに改名）車両によるスプリントレース（JTCC）に移行した以降、JTCに参戦していたトップドライバーやチームがN1耐久に参戦するようになり、レースのレベルが大きく上昇し始めた。1995年に、耐久レースという過酷な状況に多くの市販車が対応できるよう、ウィークポイントをカバーする改造（オイルクーラーの追加等）を認めたことから「N1を超えるN1」という意味でシリーズの名称を「スーパーN1耐久」と改称。1998年に「市場の活力をレースに取り込もう」という発想から、市販エアロパーツの装着を可能にする等、自動車アフターマーケットとの連動を主眼とするレギュレーション改正を行った結果、便宜上「N2」規定へ移行したためシリーズ名称から「N1」の文字を外し、現在の「スーパー耐久」に再度改称した。2002年には、レースに参加するチーム（エントラント）で構成される「N1リーグ」とレースプロモーター、サーキットで構成される「スーパー耐久協会」との対立が表面化。一部のスポーツ新聞では「内紛」のタイトルで対立の表面化が報じられたが、その後両者の話し合いによって、新たなシリーズ統括組織として「スーパー耐久リーグ（STL）」が発足。それまでは主催者側のみで構成されていた連合組織に、この時からエントラント側（N1リーグ）の代表者が加わることになった。2005年にはSTLの内部機構改革に伴い、組織名称を「スーパー耐久機構（STO）」と改めた。また同年、チーム（エントラント）団体である「N1リーグ」の代表者選出方法をチームからの推薦に変更、新たな代表者が選出され、新体制となった。その翌年である2006年からは新体制の組織名称をN1リーグから「スーパー耐久エントラントリーグ（STEL）」に改め、アマチュアリズムに徹したエントラント支援組織とした組織骨子の原点回帰を行った。なお、あくまでもSTOはシリーズの統括組織、STELはエントラントの支援組織である。2000年代後半に入ると海外進出を念頭に置いた動きが目立ちはじめ、2007年9月には韓国の太白レーシングパークからの招待を受ける形で、12チームが同サーキットで行われる韓国チームとの特別戦に参加した。そして2010年にはノンタイトル戦（Special Stage）という形で、初の海外戦をマレーシア・セパンサーキットで行う予定だったが、諸般の事情により中止となった。2011年も「Asia Round」として、韓国・中国で3戦を行う予定が組まれていたが、東北地方太平洋沖地震の影響によりレース日程が大幅に変更され、最終的に福島第一原子力発電所事故の影響も受けた結果全戦が中止となっている（詳細は後述）。この年より、ヨコハマタイヤのワンメイクとなった。2012年は新たな試みとして、ST-GT3クラスについてのみ第4戦を選択制とした。同クラスのエントラントは、岡山国際サーキットでの通常のシリーズ戦以外に、その1週間後にセパンサーキットで行われる12時間耐久レースでもシリーズポイントを獲得できるとされた。2013年はインジェ・スピーディウム（韓国）でシリーズ戦が開催された（大鵬湾国際サーキット（台湾）については、現地オーガナイザーとの交渉が不調に終わり中止）。2012年第5戦ではスーパー耐久初の死亡事故（OSAMU選手）が発生したため、これを踏まえ、2013年からはHANSを着用するレギュレーションが採用された。2018年からタイヤ供給元がピレリに変更され、シリーズ名も「ピレリ・スーパー耐久シリーズ」となった。2019年からは新たにアジア地域をターゲットとした「スーパー耐久アジア」を発足させる。スーパー耐久のアドバイザーでもあるアレックス・ユーン、マーチー・リーの2人が中心となり、香港に事務局を置き、アジアのエントラントに対するレギュレーションや参戦方法などの案内を行うほか、将来的には日本国外でのスーパー耐久のレース開催も予定している。