14世紀後半には、中国～東南アジア～インド～中東を繋ぐ航路上で海上交易を行っていたイスラム商人の影響でフィリピン諸島にもイスラム教が広まる。1433年にはネグロス島の首長カランチアオが刑法を制定したとされているが、疑わしいと考える人もいる。15世紀後半にはマラッカ王国を中心とした貿易が盛んになった。インドのマラバール、コロマンデル、グジャラートやジャワと共に、ルソンからも多数の商人がマラッカを訪れて貿易した。16世紀のスペインが到来する直前、ルソン島はブルネイの影響にある都市が多く存在した。その首長の何人かはブルネイのスルタンの娘を妻としていた。最大都市マニラには6000人規模の集落があり、その他にも南西部沿岸に都市があった。主な交易品は、輸出品として金、蜜蝋、蜂蜜、蘇木であった。輸入品としては陶磁器、織物、金属製品、日用雑貨などだった。輸入された鉄製品は新たに鋳物として作り直された。陶磁器は宋胡禄など中国や東南アジア各地のものが確認されている。また、フィリピンにはバランガイと呼ばれる数十戸を単位とする集落が数多くあった。バランガイの語は船を意味するマレー語に由来しており、元はマレーからの同一の漂流集団と見られている。バランガイは相互に交易も行っていたが、特定の国家に支配されているものではなかった。
監督を務めた8年間で4度のリーグ優勝、すべての年でAクラス入りを果たしたという実績がある。監督就任時の2004年に「この1年は補強を凍結し、個々の選手の能力を10%底上げして日本一を獲る」と宣言し（なお、戦略的な意味では表ローテとなるドミンゴ・グスマンを獲得している）、リーグ優勝を果たした。FA権に対して「FAは選手が勝ち取った権利」だと、容認的なスタンスを取っており、在任期間中に野口茂樹、福留孝介、川上憲伸、中村紀洋と4人の選手がFA権を行使して移籍していった。2004年監督就任1年目の開幕戦から数試合は、勝ち試合のゲームセット時にベンチで喜びを露にしていたが、徐々に試合中は無表情となり、一切感情を露わにしないことでも知られていたが、2011年11月の監督退任後には「イニング毎に必ずベンチ立つでしょ? 裏行って、表情変えているから。監督室帰って、例えばお茶飲んだり、水飲んだり、一人でボソボソ文句いいながら、『あの馬鹿野郎、あんなところで、あの球打ちやがって』とか独り言を言ったり。そこで頭切り替えて、ベンチ行って座っていると。この繰り返しですよ」と明かした。マスコミに対しては、試合後のコメントも他の監督に比べ短く、落合の試合後のコメントを毎回掲載する東京中日スポーツの「オレ流語録」コーナー掲載のコメントはほとんど一行のみである。現役時代にチーム事情を敵にばらす記者がいることを知り、自分のチーム事情が漏れるのを警戒しているからであるとされている。上記の事情から、マスコミや、球団内からは「ファンサービスが足りない」と批判を受けていた。こうした批判に対し、落合は「勝てばファンはついてくる」と口にしている。2007年11月1日、日本ハムとの日本選手権シリーズ第5戦で球団として53年ぶりの日本一を成し遂げた。その一方で8回表まで完全試合投球を続けていた先発の山井大介を9回表に岩瀬仁紀へ交代させた采配には、賛否両論が巻き起こった（2007年日本シリーズにおける完全試合目前の継投を参照）。2007年11月13日、中日球団からは初となる、正力松太郎賞を選考委員会の満場一致で受賞した。その際、座長であった川上哲治は「強い信念と、選手の上手い育て方。自分の野球観を持って強いチームを作った。立派な功績」とコメントした岡田彰布は落合と2008年オフに会話した折、これからはウッズ・和田など他球団の強力な主軸をマネーゲームで取る野球ではなく、選手を育成して勝利するという強い執念を感じたという。2009 ワールド・ベースボール・クラシックにおいて、12球団で中日だけが自軍の選手を誰も派遣しなかったことで、落合に対し様々な批判が寄せられた。落合は、行くも行かないも選手の自由としながらも、自著「采配」で、「選手とは球団と契約している個人事業主であり、契約書に明記されていない仕事をする場合には本人の意思が第一に尊重されるべきなのだ」「（メダルを逃した北京オリンピックに出場した岩瀬が）帰国すると、球団には電話がひっきりなしにかかってきた。中には彼の命の危険さえ感じる物騒なものもあった。…」と記している。2010年は打率、得点でリーグ5位、2011年には両部門でリーグ最下位の成績ながら、球団史上初の連覇を達成した。2011年5月7日、11敗目を喫した際に「あと50回負けられる」という旨の発言をし、結果その年の中日の61敗目がちょうどそのシーズンの優勝ラインとなった。投手起用に関しては、自身が野手だったことから、信用を置いているコーチの森繁和に任せて一切口出ししなかったという。これについて落合は「（下手に口を出すと）大抵それで失敗する」と発言している。攻撃面ではサインはほとんどなく、基本は選手のやりやすいようにやらせていたという。甘い球や狙い球ならどんどん打っていけ、という考え方で、「狙いがあるなら、全員が初球打ちで3球でチェンジになっても構わない」とも言っていたとされる。2011年シーズンをもって監督を退任したが、これに関しては、落合に勝たれては困ると思っていた球団幹部が存在し、さらに同年9月の巨人戦で負けた際、その幹部にガッツポーズをされたことを明かしている。また、翌2012年のファンクラブ会報誌（1月臨時号）には「高木守道新監督のファンサービスぶりはすでに前任者をはるかに凌駕している」「前任の監督は『勝てばファンはついてくる』といい、勝つこと以外でのファンサービスには熱心ではなかった」などといった露骨な落合批判の文が掲載された。