河口部のネマンデルタでは、川が複雑に分岐し、たくさんのポルダーと湿地帯を形成している。デルタ地帯の中にあるルスネ島は、大きさはわずか5平方キロであるがリトアニアで最大の島である。人口は2,500人で、15世紀以来の定住の歴史を持つ。ネマンデルタはラムサール条約による国際的な野生生物保護の対象地域となっている。1992年に一帯の239.50平方キロの地区がネムナスデルタ地域公園に指定された。ネマンデルタは野鳥の生息地としても知られている。生息する野鳥の種類は200種で、うち40種はリトアニアの絶滅危惧種に指定されている。またこの地は通過する渡り鳥にとっても重要な休息地である。数百種の渡り鳥がここを通過し、その中にはオジロワシ、カオジロガン、ツル、ハマシギ、ハシボソヨシキリなどの希少種も含まれている。1929年に鳥類の研究施設がヴェンテ岬に設立され、以降の研究によって渡り鳥は遠くイラン、エジプト、南アフリカからも飛来することが明らかになっている。
流域に位置する大都市としては、ベラルーシのフロドナ（グロドノ）、リトアニアのアリートゥスとカウナス、ロシア連邦カリーニングラード州のソヴィェツクがある。カウナスの上流には1959年にカウナスダムと発電所が建設された。ダム湖の面積は63.5平方キロ、長さは93キロ、深さは平均22メートルで、リトアニア国内では最大の湖となっている。
1998年にセントルイス・ラムズと契約、NFLヨーロッパのアムステルダム・アドミラルズに派遣された彼はタッチダウンパス、パス獲得ヤードでリーグトップとなった。この時彼のバックアップにジェイク・デロウム(後にカロライナ・パンサーズでプロボウル選出)がいた。トニー・バンクス、スティーブ・ボノに次ぐ第3QBと評価されており彼の出番はほとんどなかった。シーズン終了後、バンクス、ボノが解雇されラムズはトレント・グリーンを獲得し先発QBに指名、ワーナーは第2QBとなった。プレシーズンゲームでグリーンが故障し先発の座が転がり込んだ。開幕から3試合連続で3TDパスを成功させ4試合目で13シーズンで12回地区優勝を果たし、ラムズとの直近の18試合で17勝をあげているサンフランシスコ・フォーティナイナーズとの対戦を迎えた。この試合で最初の3回のシリーズを全てTDで終えて最終的には5TDパスを成功し42-20で勝利、チームは開幕から4連勝を果たした。開幕前注目を浴びていなかった彼はスポーツ・イラストレイテッドの10月18日号でカバーを飾り、"Who IS this guy" とキャプションがついた。RBのマーシャル・フォーク、WRのアイザック・ブルース、トリー・ホルト、アズ＝ザヒル・ハキム、リッキー・プロールのサポートもあり、彼はパス成功率65.1%で4353ヤードを獲得、41タッチダウンパスを決めてMVPに選ばれた。ラムズの攻撃陣はThe Greatest Show on Turfと呼ばれ1999年から2001年まで3年連続で500得点以上をあげた。これはNFL記録であった。プレーオフでもチームは勝ち上がり、第34回スーパーボウルで彼はスーパーボウル記録となる414ヤードのパス獲得を記録、残り2分ほどでアイザック・ブルースへの73ヤードの勝ち越しTDパスを決めた。スーパーボウルMVPとシーズンMVPの同時受賞はバート・スター、テリー・ブラッドショー、ジョー・モンタナ、エミット・スミス、スティーブ・ヤングに次いで6人目であった。2000年は開幕から6試合連続で300ヤード以上のパスを投げた。これはスティーブ・ヤングに次いで史上2人目の快挙であった。また6試合では合計19タッチダウンパスを投げていた。シーズン中盤に右腕の負傷でグリーンに先発の座を一時譲ったがこの年、ワーナーとグリーンは2人合わせて5,232ヤードを獲得、ダン・マリーノが作った1シーズンのパス獲得ヤード記録（5,084ヤード）を上回った。一方被インターセプト率は前年の2.6%から5.2%と増加した。またディフェンスが弱かったためチームは前年のような活躍を見せられずワイルドカードプレーオフでニューオーリンズ・セインツに敗れた。オフシーズンにチームの先発守備選手11人のうち9人が解雇され、QBのトレント・グリーンもカンザスシティ・チーフスにトレードされた。2001年、彼は自己ベストの68.7%のパスを成功させてリーグトップの4830ヤード（ダン・マリーノ、ドリュー・ブリーズに次いでNFL歴代3位）を投げて36タッチダウンパスを投げたが被インターセプトも22回と自己最多となった。チームは開幕から6連勝しリーグトップの14勝2敗でシーズンを終えて第36回スーパーボウルに出場を果たした。2年ぶりのシーズンMVPにも選出され、前年選出されたマーシャル・フォークも含めてラムズの選手が3年連続受賞となった。スーパーボウルでは365ヤードを獲得し1タッチダウンパス、1タッチダウンランをあげたがニューイングランド・ペイトリオッツのビル・ベリチックコーチのゲームプランにはまりインターセプト2回を与え3-17と2タッチダウン差のリードを許した。その後猛反撃を見せて自身のQBスニークによる1ヤードのタッチダウンラン、リッキー・プロールへの26ヤードのTDパスで第4Q終盤には同点に追いついたがアダム・ビナティエリの決勝FGが試合終了と同時に決まり17-20で敗れた。ペイトリオッツはこの年も含めて4年で3回のスーパーボウルを制覇した。2002年には開幕から3試合で1TDパス、7被インターセプトと絶不調でチームは3連敗した。4試合目のダラス・カウボーイズ戦では右手の指を骨折し、シーズン終盤に復帰し2試合に出場したがいずれの試合も落とし右腕の骨折により故障者リスト入りした。それまでのQBレイティングは103.4であったがこの年はわずか67.4で終えた。2003年の先発QBには早々に指名されたがニューヨーク・ジャイアンツとの開幕戦では6回のファンブルをしてしまい翌週からは前年彼の故障していた間好成績をあげていたマーク・バルジャーが先発QBとなった。