陵（みささぎ）は、宮内庁により京都府京都市伏見区深草本寺山町にある九條陵（九条陵、くじょうのみささぎ）に治定されている。宮内庁上の形式は円丘。上記とは別に、京都府京都市東山区本町にある宮内庁の東山本町陵墓参考地（ひがしやまほんまちりょうぼさんこうち）では、仲恭天皇が被葬候補者に想定されている。皇居では、皇霊殿（宮中三殿の1つ）において他の歴代天皇・皇族とともに天皇の霊が祀られている。また若宮八幡宮社（京都府京都市東山区）では、左相殿に祀られる（東山本町陵墓参考地の場所にかつて存在した塚本社からの移祀）。
即位後わずか78日で廃され、即位式も大嘗祭も行われなかったため諡号・追号がされず、九条廃帝（くじょうはいてい）、承久の廃帝（じょうきゅうのはいてい）、半帝、後廃帝と呼ばれていた。明治3年（1870年）5月、明治政府（太政官）は、大友皇子、淡路廃帝、九条廃帝に天皇号の追諡を行うことにして、神祇官および大学に追諡の撰定を命じた。九条廃帝は4歳で登極、在位78日で廃位、以後17歳で亡くなるまで生家の九条邸で隠棲されていたため、諡号撰定の根拠にすべき事績は全くなかった。神祇官でも苦心の結果、天皇が第三子であったことから「仲」の字を、また諡は本来敬を表すものであるということから「恭」の字を選び、両者で「仲恭」の諡号を撰定するに至った。政府はこれに対して弾正台などの意見も聞き、7月20日に「仲恭」と決定し、同年7月23日に神祇官で祭典執行、祝詞をして奉諡を行った。翌日、『太政官日誌』（明治3年第28号）で、弘文天皇（大友皇子）、淳仁天皇（淡路廃帝）とともに仲恭天皇の諡号が布告された。
ロングショーは1942年6月16日にワシントン州シアトルのシアトル・タコマ造船所で起工する。1943年6月4日にE・リチャーズ夫人によって命名、進水し、1943年12月4日に艦長D・T・バートウェル中佐の指揮下就役した。西海岸沖での整調に続いてロングショーは1944年2月18日にサンフランシスコを出航、真珠湾を経由してマーシャル諸島に向かい、3月4日にクェゼリン環礁に到着した。第5艦隊に配属されたロングショーは3月15日にマジュロに向けて出航、その後ウォッジェ環礁、マロエラップ環礁沖での偵察巡航を21日まで続けた。翌22日にマジュロを出航し、3月30日と4月1日にパラオ、ヤップ島、ウルシー環礁、ウォレアイ環礁へ攻撃を行う高速空母任務部隊（第38/58任務部隊）への補給グループに対する護衛を行い、6日にマジュロに帰還した。その6日後に出航、マヌス島を経由してホーランジアへ向かい、空母艦載機と共に任務部隊の護衛を務め、マッカーサー将軍の上陸部隊支援のためニューギニアの海岸を攻撃した。ロングショーは5月9日に真珠湾に帰還し、小修理および訓練に従事した。5月30日にマリアナ諸島に向けて出航、北部攻撃部隊の護衛を務め、6月15日にサイパン島沖に到着した。続く2ヶ月間、エニウェトク環礁への短期間の航海を除いてロングショーは同地にとどまり、護衛空母の支援および飛行士救助の救難艦任務に従事した。8月22日にエニウェトク環礁に向けて出航、29日には第38.3任務群の空母援護を担当、フィリピンへの踏み石となるパラオ、ミンダナオ島、ルソン島を攻撃する部隊を支援した。9月9日、任務群の僚艦と共にロングショーはミンダナオ島沖で日本の輸送船団を攻撃した。ロングショーは3隻の小艦艇を破壊した。その後もフィリピン攻撃の空母部隊を支援し、10月2日にウルシー環礁に移動した。ロングショーは10月6日に第38.3任務群と共に出航し、フィリピン侵攻に先立って行われた空襲を支援した。空母から発進した艦載機部隊は10月10日から13日にかけて沖縄、ルソン島、台湾の地上基地を攻撃した。ロングショーは12日に台湾での戦闘において日本の雷撃機を1機撃墜している。空母部隊はレイテ島侵攻支援のための作戦活動を継続し、10月24日の夜までフィリピンの飛行場を攻撃した。一連の空襲でアメリカ軍の艦載機部隊は日本軍の残存航空戦力を壊滅させた。ロングショーはウルシー環礁を拠点として年末まで第38.3任務群と共に活動し、沖縄、台湾、ルソン島を攻撃する空母部隊の護衛を務め、1月末まで同任務に従事した。1945年1月9日から10日にかけての深夜にロングショーは空部部隊と共にバシー海峡を通過、南シナ海に入った。続く10日間、任務部隊は仏領インドシナ、台湾、香港、海南島の日本軍基地を攻撃した。バリンタン海峡を通過し、その後1月22日に空母部隊は沖縄を再び攻撃、26日にウルシー環礁に帰還した。2月10日、ロングショーは夜戦部隊指示チームを乗艦させ空母部隊と共にウルシー環礁を出航、2月17日と18日に行われた東京への空襲では夜戦部隊の指示およびレーダーピケット艦任務に従事した。2月の残りは硫黄島に夜間攻撃を行う第58.5任務群の護衛を担当した。3月12日にウルシー環礁に帰還、その後21日に沖縄に向けて出航し空母部隊を護衛した。3月25日に到着しロングショーは上陸部隊支援のための艦砲射撃を行った。4月から5月にかけて同任務を継続し、ロングショーの乗組員は大いに貢献した。日本軍の特攻機による攻撃は激しく続いたが、ロングショーはその能力を最大限に発揮して艦砲射撃による支援を行った。