本種の属するイトグモ属には世界で100種以上が記載されている。本種の判別は雌雄ともに交接器によらねばならない。種内には様々な変異が見られ、種の範囲については議論となるかもしれない点があることも指摘されている。日本の場合、本科の種は本種のみである。むしろユウレイグモ科やヤマシログモ科に類似のものがある。イトグモ属はかつてヤマシログモ科に所属させたことがあり、丸っこい身体に細長い歩脚を持つことや眼の配列など似た特徴が多い。ヤマシログモ科のものにも家屋内に見られるものがあるが、斑紋があり、また頭胸部が大きく盛り上がる点で本種と見分けられる。ユウレイグモ科のシモングモ Spermophora senoculata も本種と同様な場所で見られるが、こちらは体長2-2.5mmとかなり小さい。その他のユウレイグモ類はもっと腹部が細長いものが多い。正確には眼の配列など見れば判別は容易で、ユウレイグモ科のクモは眼が左右に3個ずつ集まっている。
2010年には、故障で開幕に出遅れながらも、シーズン途中から一軍公式戦で救援投手として活躍。9月4日の対福岡ソフトバンクホークス戦（スカイマークスタジアム）では、4点リードから同点に追い付かれた直後の5回表2死満塁の場面で登板すると、多村仁志を3球で三振に討ち取った。さらに、その裏に大引啓次が決勝打を放った結果、一軍での初勝利を挙げた。一軍公式戦全体では、24試合の登板で、防御率1.25、WHIP0.69、右打者からの被打率.151を記録。2011年には、5月上旬にシーズン初の出場選手登録。しかし、右肘痛を発症したため、一軍公式戦での防御率0.00ながら2試合に登板しただけで登録を抹消された。後半戦から一軍に復帰。7月27日の対北海道日本ハムファイターズ戦（帯広の森野球場）では、3回裏2死から1回1/3を投げたが、ボビー・スケールズに満塁本塁打を浴びるなど自己ワーストの7失点を喫した。一軍公式戦通算では、オール救援で23試合に登板。前年とほぼ同数の投球回数を記録する一方で、被安打が前年から倍増したり、防御率が7.15に達した。2012年には、オープン戦で右肘痛を発症した影響で、実戦復帰は8月のウエスタン・リーグ公式戦にまで持ち越された。9月5日の対千葉ロッテマリーンズ戦では、同期入団で一軍初先発の前田祐二に続いて、6回表の途中からシーズン初の一軍公式戦登板。1死1塁のピンチを併殺で切り抜けた結果、前田に一軍初勝利をもたらした。9月11日の対埼玉西武ライオンズ戦では、1点ビハインドの8回裏からの登板で無失点に抑えると、9回表に味方打線が逆転。その結果、2010年9月26日の対ロッテ戦以来、716日振りに一軍公式戦で勝利を挙げた。シーズン通算では、一軍公式戦12試合の登板ながら、防御率1.80を記録した。2013年には、プロ入り後初の開幕一軍登録。3月29日にロッテとの開幕戦（QVCマリンフィールド）へ登板したが、2失点を喫して敗戦投手になった。さらに、翌30日の同カードでは1アウトも取れずに降板したため、開幕戦からわずか2試合で登録を抹消された。4月後半に一軍へ復帰してからは好調を維持。5月には、12試合の登板で自責点を0にとどめた。連投が続いた6月・7月にやや調子を落としたが、シーズン終了まで一軍の救援陣に定着。その結果、一軍公式戦で59試合に登板するとともに、11ホールドを記録した。2014年には、先発投手や他の救援投手が試合の中盤（主に6・7回）で走者を出した局面を中心に、一軍公式戦で自己最多の62試合に登板。一軍監督の森脇浩司から「切り札」と称されるほどの信頼を背景に、佐藤達也・馬原孝浩・平野佳寿と共に「勝利の方程式」へ組み込まれると、チームのレギュラーシーズン2位・クライマックスシリーズ進出に貢献した。レギュラーシーズンでは、34登板試合連続無失点（パシフィック・リーグのシーズン公式戦タイ記録）を達成したほか、通算で0点台の防御率を記録した。2015年には、春季キャンプの序盤で右肩を痛めたため、一軍公式戦へのシーズン初登板は6月20日の対埼玉西武ライオンズ戦（ほっともっとフィールド神戸）まで持ち越された。この試合で2失点を喫すると、2試合目の登板であった27日の対ロッテ戦（QVCマリンフィールド）では、1アウトも取れずに3点を失って降板。以降も一軍公式戦6試合に登板したが、7月29日に出場選手登録を抹消されると、8月11日に右肩の関節唇修復手術を受けた。全治に5ヶ月を要する手術だったため、球団では手術の前に、翌2016年の年俸に対してNPBの野球協約で定められた制限を超える減額率を適用することを比嘉に通告。実際にシーズン中の実戦復帰へ至らなかったことや、一軍公式戦で未勝利に終わったことなどから、シーズン終了後の契約交渉では推定年俸1,500万円（4,500万円減）に出来高分を加えた条件で契約を更改した。2016年には、6月12日にシーズン初の出場選手登録。6月17日の対広島東洋カープ戦（MAZDA Zoom-Zoom スタジアム広島）では、同点で迎えた延長12回の裏に、7番手投手として登板した。しかし、打者2人から1アウトを取れないまま、鈴木誠也の2点本塁打でサヨナラ負けを喫した。その一方で、8月10日の対ソフトバンク戦でも、同点の7回表から救援で登板。1イニングを無失点に抑えると、7回裏にチームが勝ち越したため、一軍公式戦では2014年9月7日の対北海道日本ハムファイターズ戦（いずれも京セラドーム大阪）以来自身2年（703日）振りの勝利を挙げた。2017年は8試合に登板、1敗・1ホールド、防御率3.24だった。