アサリも、諫早湾近傍で漁獲高が減少している。長崎県や国は、アサリの「へい死」の原因を赤潮と貧酸素水塊であるとしているが、堤防に近い程漁獲量が減少していることより、漁業関係者の中には水門から排出される調整池の水が原因ではないかと疑う声もある。2007年8月には諫早湾の小長井漁協の養殖アサリの70％に該当する1200トンがへい死したことが報告されているが、当時の総理の福田康夫は、水門から調節池の水が排出される以前よりアサリのへい死が認められていることを指摘した。有明海全体のアサリの生産量は、1989年から2007年までの期間で変化は認められなかった。
タイラギについては工事開始時期に諫早湾周辺で漁獲高が激減した。ただし、諫早湾周辺で減少が始まったのは工事に着手される以前の1970年代後半からであった。1979年・80年には9000トン前後の水揚げあったが、その後著しい不漁となり、以後もその状態が続いている。また近隣海域である八代海区でもかつて2000トン以上が水揚げされていたものが干拓工事の開始以前より殆ど収穫できない状態が続いていることが報告され、不漁が今に始まったことではなく、また他地区でも同じことが以前より観察され、その原因も不明であることが指摘された。ナルトビエイによる食害も影響も示唆されているが、農林水産省九州農政局が学識経験者を招聘して諫早湾漁場調査委員会結成して行った調査・検討でも原因は特定されていない。
環境モニタリングでは、潮受堤防の締切り後に諫早湾内の魚卵や仔稚魚の出現数が減少した結果は見られなかった。また、10種類の魚類について生態・生息分布・漁獲量の推移等を個別に調査・検討されたが、潮受堤防の締切り後に漁獲資源量が減少した事実も無かった。もともと有明海では、1987年頃より漁獲高は減少傾向にあったが、干拓事業の開始された時期に漁獲高が更に急激に減少した事実は調査の結果確認されなかった。
環境省での調査や、NPO法人有明海再生機構、西海区水産研究所、農水省統計などによる有明海の環境調査では、「有明海のうち、諫早湾及びその近傍部を除く海域については、本事業と環境変化の関係を認めることができない」という調査結果が出された 。また、農水省も「諫早湾干拓事業による水質変化は、諫早湾に限られていた。」と発表した。
2015年3月24日には佐賀地裁は間接強制決定が奏功せず国が支払う制裁金額が不適当として、漁業者側に支払う間接強制の制裁金を日額90万円（1人当たり日額2万円）に増額することを決定した。これに対して税務署は「民事の制裁金は課税対象である」として、納税するように指導した。漁業者代表は、納得できないが一時的に納税することにする。納税の是非を巡っては司法の場で争うとした。2019年9月現在で、2014年7月から漁業者に計12億3030万円が支払われている。。漁民1人当たり年間730万円の額であるが原則弁護団が管理している。このため、制裁金を受け取れない一方で、年収増による医療費や介護保険料の減額措置が受けられなくなったという不満が漁業者側に強い。制裁金は農水省が漁協に支払っており、年間3億2850万円を概算要求で毎年政府に予算化要求している。
2014年4月に漁業者（開門派） の申し立てにより佐賀地裁は開門に向けた制裁金（間接強制）を命令した。また2014年6月に営農者（閉門派）の申し立てにより長崎地裁も開門時の制裁金を命令した。その結果、開門しなければ漁業者に1日45万円（福岡高裁判決）と、開門すれば営農者に1日49万円（長崎地裁仮処分）という2つの制裁金（間接強制）が確定した。国は抗告したが2015年1月の福岡高裁はいずれの決定を支持した。国は許可抗告を行ったが、2015年1月、最高裁判所はいずれの制裁金も有効として棄却し、開門の有無に関わらず制裁金支払いが必要となる状態が確定した。決定では「審理すべき立場にない」として開門の是非には踏み込まず、「民事訴訟では当事者の主張により審理で判断が分かれることが制度上あり得る」とし、「国が開門について相反する義務を負うことになっても、根拠となる司法判断がある以上、間接強制を決定できる」とした。
ラテン語の「volatus」が語源だという説がある。これは「volare」（飛ぶ）の過去分詞である。その後、フランス語の「volee」（飛行）となり、英語の「volley」（一斉射撃）になったという。そこから前述の、現在での用法として派生したらしい。発音上はボリーの方が近いという。サッカーのキック・シュートにおいて、ボレーキック・ボレーシュートがある。オーバーヘッドキック（英語圏ではBicycle Kick）・オーバーヘッドシュートもその範疇と考えられる。ノートラップでそのままボレーシュートを打つことを、ダイレクトボレーと表現することもある。テニスでもボレーという言葉が使われる（対してワンバウンド後に打つ行為はグラウンドストロークと呼ばれる）。類似競技のピックルボールでは、サーブアンドボレー（サーブ側が相手からの直後のリターンをボレーで応戦すること）は禁止されている。バレーボール（Volleyball）のVolleyでもある。この競技ではルール上、空中でパス回しされるため、アタック行為を含めてすべてがボレーであるといえる。セッターによるボールのセットを経ず、チャンスボールなどを相手陣地へ直接打ち返すことは、ダイレクトアタック（ダイレクトスパイク）と呼ばれる。ボレーとバレーは英語では同一の表記、発音であるが、日本語ではバレーボールのことをボレーボールとする事や、ボレーのことをバレーとするのは間違えとみなされる。