陵（みささぎ）の名は菅原伏見東陵（すがわらのふしみのひがしのみささぎ）。宮内庁により奈良県奈良市尼辻西町にある遺跡名「宝来山古墳」に治定されている。墳丘長227メートルの前方後円墳である。宮内庁上の形式は前方後円。『古事記』には「御陵は菅原の御立野（みたちの）の中にあり」、『日本書紀』には「菅原伏見陵（すがわらのふしみのみささぎ）」、『続日本紀』には「櫛見山陵」とある。『延喜式』諸陵寮では「菅原伏見東陵（すがわらのふしみのひがしのみささぎ）」として兆域は東西2町・南北2町、陵戸2烟、守戸1烟で遠陵としている。現在の宝来山古墳の濠の中、南東に田道間守の墓とされる小島がある。この位置は、かつての濠の堤上に相当し、濠を貯水のため拡張して、島状になったと推測される。しかし、戸田忠至等による文久の修陵図では、この墓らしきものは描かれていない。また皇居では、皇霊殿（宮中三殿の1つ）において他の歴代天皇・皇族とともに天皇の霊が祀られている。
宮（皇居）の名称は、『日本書紀』では纒向珠城宮（まきむくのたまきのみや）、『古事記』では師木玉垣宮（しきのたまかきのみや）。伝承地は奈良県桜井市穴師周辺。なお京都府久世郡久御山町市田の地には宮城跡とされる地域があり、その地には垂仁天皇と和気清麻呂を祭った珠城神社（久世郡久御山町大字市田小字珠城2-1）がある。
即位25年、武渟川別・彦国葺・大鹿嶋・物部十千根・大伴武日の五大夫を集めて先帝の偉業を称えて神を祀ることを誓った。同年、天照大神の祭祀を日葉酢媛が生んだ皇女の倭姫命に託した。宇陀、近江、美濃と周った倭姫命は最終的に伊勢に落ち着き伊勢神宮を建立した（元伊勢伝承）。即位27年、初めて屯倉（天皇の直轄地）を作った。また諸神社に武器を献納し神地・神戸を定めた。即位35年、子の五十瓊敷入彦命に河内国の高石池や茅渟（ちぬ）池を始め諸国に多くの池溝を開かせて農業を盛んにした。即位39年、五十瓊敷入彦命が千本の剣を作り石上神宮に納めたことをきっかけに同神宮の神宝を掌らせる。即位88年、天日槍の曾孫の清彦に但馬の神宝を献上させた。現在、その神宝は出石神社で祭られている。即位99年、崩御。『住吉大社神代記』には、在位53年で辛未年に崩御したとある。この干支は『書紀』の庚午年没と1年異なるが『古事記』では崇神天皇没の戊寅年の53年後が辛未のため一致している。
1651年、ウスターシャーで同名の弁護士ジョン・サマーズの息子として生まれた。ウォルソールのグラマースクール、オックスフォード大学のトリニティ・カレッジを出てミドル・テンプルで法律を勉強、1676年に弁護士に就職した。政治家ではなかったがホイッグ党と親密になり王位排除法案を支援、1688年にイングランド王ジェームズ2世の信仰自由宣言に反対して投獄された7人の主教裁判では弁護に努め注目された。同年に名誉革命が起こりジェームズ2世が逃亡、新たに即位したウィリアム3世・メアリー2世夫妻に忠誠を誓い、翌1689年に法案作成委員会に属して権利章典の起草に尽力した。また、ジェームズ2世が退位してウィリアム3世・メアリー2世が即位したとする下院の宣言を掲げ革命の正当性を主張、反対する上院を納得させて両者の即位に貢献した。これらの功績が認められ、法務次長職を与えられ政界に進出、1692年に法務総裁に昇進、翌1693年には国璽尚書に任命された。そしてホイッグ党中心の政権（ジャントー）が誕生するとその一員に選ばれ、1695年からウィリアム3世不在のイングランド国政を任されるメンバーの1人にまでなった。同年の銀貨改鋳問題ではジョン・ロックやアイザック・ニュートン、同じジャントーのハリファックス伯チャールズ・モンタギューらと共に取り組み、1697年にウィリアム3世から男爵に叙せられ大法官に転任した。また、1698年から1703年まで王立協会の会長も務めた。しかし、トーリー党が議会で勢力を伸ばすと批判にさらされ、私掠船船長キャプテン・キッドへの出資及びキッドの海賊化に対する責任追及、スペイン領土相続問題に絡みウィリアム3世とフランスの極秘交渉に協力していたことを非難され1700年に大法官を罷免、翌1701年に弾劾裁判を受けた（裁判は中止、罪に問われずに終わる）。1702年にウィリアム3世が亡くなりアンが即位すると政権から遠ざけられたが、1706年にスコットランドとイングランドの合同交渉委員に選ばれ批准にこぎつけ、1708年に枢密院議長として与党に復帰、アンの信頼を得て相談役として政治に携わった。1710年、トーリー党のロバート・ハーレーとヘンリー・シンジョンらに政権を奪われると枢密院議長を辞任して再度下野、1714年にアンが死去、遠縁のジョージ1世が即位してハーレーらが失脚すると無任所大臣に選ばれ、2年後の1716年に65歳で亡くなった。独身で子供が無いためサマーズ男爵位は1代で消滅したが、姉妹メアリーはチャールズ・コックスと結婚、1784年に2人の孫である大甥のチャールズ・コックスが新設の形でサマーズ男爵に叙せられた。