東京のホテルでボーイとして働いている北川俊介は、降り出した雨に濡れながら号泣している小河加奈子に出会う。長距離恋愛しながら、2人の愛を育んでいたが、ある冬の日、加奈子に会いに俊介は電車に乗り込む。俊介は、加奈子に内緒だがプロポーズするつもりで指輪を持ってきている。俊介の携帯電話には、加奈子とのメッセージのやりとりが残っているが、はやくあいたいと伝えると加奈子からの返信が途絶える。加奈子から1ヶ月前に私で良いのというメッセージが、俊介に届いていた。胸騒ぎを覚える俊介に、知らない男からあの娘を買ったんだろという不審な電話を受ける。加奈子は、電車の中で、過去を知る女に出会い、その後俊介に会って話しがしたいとメッセージを送る。その頃、俊介は不審な男から、加奈子の過去の話しを聞いていたが、俊介の方から電話を切る。加奈子に別れようとメッセージを送信すると、駅から花火が見える。翌朝、俊介が駅を降り立つと、加奈子が駅のホームで待っていた。加奈子は、俊介と2人で仕合わせになりたいと、線路越しに向かいのホームにいる俊介に伝える。
多くの生命が失った大震災の悲しみにより、色を失った世界で洋服店を営む中目由衣は、黒い服ばかり売っている。由衣は生まれながらに金髪で、そのせいで子どもの頃にいじめられていた過去があり、今では黒いフードで顔を隠している。洋服店の2階にある由衣の仕事場は、色鮮やかな洋服やカラフルなデッサン画などがあり、誰にも見せない秘密の場所であり、由衣がありのままの自分らしくいられる場所であった。川縁で色とりどりの絵の具で絵を描く近江仁助に出会い、由衣のお店の2階で君は君のままで良い、真の芸術家になるなら応援すると言われる。その後、これまで創ってきた色鮮やかな洋服を店舗に出すようにする。大人たちからは見向きもされないが、色鮮やかな服を着た少女が店頭のウィンドウを観て、由衣に微笑みかける。
永遠の愛を誓っている夫婦・ロクと深雪だが、ロクは不治の病に患っている。生き残るために特効薬が完成するまでの間、冷凍保存するカプセルで永い眠りにつかなければならない。巨大なカプセルで永い眠りについているロクを、深雪は来る日も来る日も磨きながら目覚めるのを待っている。月日が流れ、目覚めるときが訪れる。巨大なカプセルから目覚めたロクの目の前には、見たことのない老女がおり、ロクは混乱してしまう。老女の話しから、その老女は年老いた深雪であった。年老いた深雪をみて、心の整理のできないロクであったが、目覚めるまでの50年の間深雪のロクへの深い愛情を知り、深雪に新たな提案をする。年老いたロクが、眠りから目覚めた深雪を優しく出迎える。
人対人のコミュニケーションが希薄になっている近未来の東京。人とのつながりに臆病になっている人への心の整体「キモチラボ」。ここは、一風変わったメンタル・クリニックで、天才メンタリストのマイスターとその助手の少年シュンが、人々の心を解きほぐしている。ある日、無表情な少女・リンがふらりとクリニックを訪れるが、マイスターは未成年であることから治療を断る。リンに一目ぼれしてしまったシュンは、彼女の笑顔を引き出そうと感情エキスの調合を自ら引き受ける。アオイがクリニックを訪れて、マイスターと一緒に出て行った後、シュンはマイスターの観ていたPCからリンがひどいいじめを受けていることを知る。その夜、リンの入院している病室に忍び込み、自ら調合した感情エキスを試すが、瞳に涙が浮かぶが笑顔は引き出せなかった。そこに、マイスターとアオイが現れる。マイスターからはアオイが恩師の娘であり、リンが孫であることが知らされ、リンが痛みを知り共有できる人を望んでいたこと、シュンが調合を間違えたが、涙を先に笑顔があることを伝える。シュンはリンが引っ越してしまいもう会えないというと、そこに笑顔でクリニックに向かうリンがいる。
1936年10月、シュルツの死やルチアーノ摘発に飽き足らないニューヨーク州特別検察官トーマス・デューイは、バカルターを公共の敵と非難し、その傘下の強請団を摘発することに成功した。一方、連邦検察及びFBIは1932年にバカルターのギャング団を取り逃がして以来ずっとバカルターを追いかけていたが、1936年11月、シャピロと共に毛皮産業の独占支配の容疑で告訴した。反トラスト法違反で2年刑の有罪となったが、1937年3月上訴して無罪となった（シャピロは有罪のまま）。その後、反トラスト法違反で再起訴された時に出廷せず、保釈金を放棄してシャピロと共に逃亡した。8月、デューイに2500ドルの懸賞金をかけられ指名手配された。11月、連邦検察は2500ドルの懸賞金をかけたが、程なく5000ドルに上げ、これに呼応するようにデューイも懸賞金を2倍にしたため、11月末までに連邦検察と州検察（デューイ）の懸賞金が合わせて1万ドルに達した。ニューヨークのヘロイン密輸団を独自に内偵していたFBNが、同年12月、バカルター含む総勢31人を麻薬取締法違反で告発した。FBNからヘロイン密輸、連邦検察から反トラスト法違反（ガーメント地区の産業支配）、ニューヨーク州マンハッタン検察からガーメント地区の組合強請や殺人、更にニューヨーク州ブルックリン検察から殺人共謀と、4つの司法捜査当局から同時に追いかけられた。公共の敵となって以来、自分を有罪にする恐れのある関係者、元関係者を次々と消していった。1939年7月までに6人が殺され2人が失踪していた。潜伏中ニューヨークを離れたとも国外脱出したとも囁かれたが、実際はブルックリンの隠れ家やアジトを転々としていた。