名人昇格の際、丈和は不透明な陰謀をめぐらしたため後に禍根を残す事になった。文政11年(1828年)に名人碁所願を提出し、安井知得仙知宅で家元同職会議が行われる。席上仙知は時期尚早と主張し、丈和の1月遅れで八段になっていた井上幻庵因碩との争碁を勧めるが因碩は受けず、仙知が争碁を打つことになり寺社奉行から許可を得る。しかし仙知の病気などで日程が決まらず、因碩が争碁願を提出、仙知の裁定で2、3年待って争碁を行うこととしたが、天保2年に突如丈和が名人碁所に任命される。この急な任命の理由は不明だが、林元美が丈和から八段昇段の約束を得て、出身である水戸藩の隠居「翠翁公」を通じて寺社奉行に働きかけたとの見方がある。天保6年(1835年)に浜田藩の家老で安井家門人(二段)でもあった岡田頼母が老中松平周防守に碁会を勧め、松平宅にて碁所で御止碁となっていた丈和も含めた手合を組む。因碩は丈和を名人位から引き摺り下ろそうと、弟子の赤星因徹を丈和に挑ませる。もしこの対局で赤星が勝てば、丈和に名人の資格無しとして公儀に訴え出る算段であった。赤星の実力は確かなもので、いったんは優勢に持ち込むが、丈和は有名な「丈和の三妙手」を放ち、赤星を下した。この対局中赤星は血を吐き、その後26歳で死去。ここからこの一局を「吐血の局」と呼ぶ。これにより因碩の野望は砕いたものの、林元美の八段昇段の内約を破ったことの訴えなどがあって、天保10年(1839年)に碁所を返上して引退。元丈の子である丈策に家督を譲った。
1870年5月30日、兵部大輔であった前原一誠が「大に海軍を創立すべきの議」を提出し海軍の拡張を訴えたが、新政府の財政事情では実現不可能なものであった。その後、各藩が所有していた艦艇が編入されたものの、海軍省設立の1872年時点で軍艦14隻（内装甲艦2隻）・輸送船3隻、総排水量13,832トンに過ぎなかった。海軍省は翌1873年に軍備増強計画を提出したが、陸軍の整備が優先されたため、これも実現しなかった。1873年、帝国海軍初の国産軍艦である清輝（排水量897トン）が横須賀造船所で起工され、1876年に竣工した。国内の造船所では1000トン程度の艦艇の建造がせいぜいであったため、1875年には海軍大臣川村純義の発案が採用され、イギリスに装甲艦扶桑（常備排水量3,717トン）および金剛型コルベット（常備排水量2,250トン）2隻が発注された。これら3隻は1878年に就役し、初期の帝国海軍の主力艦となった。3隻の設計から日本回航までエドワード・ジェームス・リードに一任され、建艦費用は3隻合計で312万円であったが、1875年の海軍費用352万円の9割近くに相当した。しかし、増強を続ける清国海軍が1885年に定遠級戦艦（常備排水量7,144トン、30.5 cm砲4門）2隻を就役させると、清国に対する海軍力の優越性は失われてしまった（清国はさらに新鋭艦の購入を継続していた）。他方、1883年から大型装甲艦の建造を含む帝国海軍初の長期軍拡計画が開始されていたが方針が固まらず、防護巡洋艦3隻（浪速型（常備排水量3,709トン）2隻と畝傍（常備排水量3,615トン）。畝傍は回航中に行方不明となったため、代艦として千代田（常備排水量2,439トン）を建造）が発注されたにとどまっていた。1886年にはフランスから招聘された著名な造船技師であるルイ＝エミール・ベルタンが本国で採用されていた青年学派思想（多数の小型艦で大型艦に対抗する）の採用を進言し、これが受け入れられた。ベルタンは大型装甲艦の優先順位を落とし、4000トン級の海防艦4隻および水雷艇の量産（結果的に21隻建造）を優先することとした。実際には海防艦の仕様決定に時間を要したため、小型巡洋艦高雄（常備排水量1,774トン）や通報艦八重山（常備排水量1,609トン）が先行して着工された。海防艦は32 cm砲を1門搭載した松島型防護巡洋艦（常備排水量4,278トン）として実現した。1番艦松島および2番艦厳島はフランスに発注されたが、3番艦の橋立は大型艦建造の経験のために横須賀造船所で建造された。松島型は先進的過ぎる面があったこともあり戦力化まで時間がかかり、このため4番艦はキャンセルされ、やや小型の秋津洲（常備排水量3,150トン）が建造された。ベルタンが1890年に帰国すると、イギリスに防護巡洋艦吉野（常備排水量4,216トン）が発注された。日清戦争は、これらの艦艇で戦うことになる（他に1000トン以下の砲艦4隻建造。防護巡洋艦須磨（常備排水量2,657トン）も横須賀で建造されたが、日清戦争には間に合わず）。新造艦の多くには開発されたばかりのアームストロング社製速射砲を搭載されていた。なお、松島型の性能に満足しなかった海軍は本格的装甲艦（戦艦）の保有を望んだが議会がなかなか承諾せず、明治天皇の建艦詔勅によって1893年にようやく予算が通りイギリスに富士型戦艦2隻が発注されたが、就役は1897年で日清戦争には間に合わなかった。1882年、旗艦扶桑以下11隻の軍艦で初の常設艦隊である「中艦隊」を編成、1885年には固有名称を有する「常備小艦隊」（扶桑以下8隻）に再編成され、1889年には常備艦隊（浪速以下6隻）へと改編された。日清戦争前の1894年には旧式艦や小型艦からなる「西海艦隊」（編成時名称は警備艦隊）が編成され、常備艦隊と西海艦隊を合わせた「連合艦隊」が設立された。また、艦隊の根拠地として鎮守府が設置された。まず1876年に東海鎮守府が横浜に仮設され、1884年には横須賀に移転・横須賀鎮守府となった。1889年に呉鎮守府と佐世保鎮守府、1901年には舞鶴鎮守府が設立された。鎮守府の直轄組織として造船所を主体とした軍需工場である海軍工廠がおかれた。1893年に来日したフランツ・フェルディナントによると、当時の日本海軍保有の軍艦は55隻、総トン数55,053、総馬力79,694、大砲総数439、総兵員数6915を数えた。