955年に父ハインリヒ1世が死去し、4歳でバイエルン大公位を継承した。973年に皇帝オットー1世が死去し、オットー2世が18歳で皇帝位に就き、ハインリヒはオットー2世の母アーデルハイトとともに政治を担った。しかし、同年末、ハインリヒの義兄（姉の夫）にあたるシュヴァーベン大公ブルヒャルト3世が死去したのち、オットー2世が異母兄リウドルフの子オットーをシュヴァーベン大公位に就けると、ハインリヒはオットー2世に対し反乱を起こした。また、ノルトガウの併合を企み、同地を領するオットー2世支持者のバーベンベルク家とみられるベルトルト・フォン・シュヴァインフルトと対立した。この結果、974年にハインリヒは逮捕されインゲルハイムに幽閉された。その後ハインリヒはインゲルハイムから脱出しバイエルンに戻ったが、976年にオットー2世はバイエルンの首都レーゲンスブルクを包囲し、ハインリヒはボヘミア公ボレスラフ2世のもとに逃れた。ハインリヒはバイエルン大公位を剥奪され、同大公位はオットー2世の甥のシュヴァーベン大公オットーに与えられたが、バイエルン領東部はオーストリア辺境伯領としてバーベンベルク家のレオポルト1世（ベルトルトの兄弟あるいは甥）に、ケルンテン地方は新たにケルンテン大公領として独立させルイトポルト家のハインリヒ（のちバイエルン公3世）に与えられた。同年、オットー2世はボヘミアを攻めたが大敗し、これをきっかけにハインリヒはケルンテン大公ハインリヒおよびアウグスブルク司教ハインリヒとともに反乱を起こした（「三ハインリヒの反乱」）。これに対し、977年にオットー2世はハインリヒを支持するボヘミア公ボレスラフ2世を再び攻め、これを屈服させた。さらにオットー2世はパッサウに逃れたハインリヒらを攻め、978年にハインリヒらは逮捕されユトレヒト司教の監視のもと幽閉された。ケルンテン大公位はザーリアー家のオットー（老公）に与えられた。983年、皇帝オットー2世が死去し、幽閉を解かれたハインリヒは3歳で即位したオットー3世にもっとも近い男系親族として、オットー3世の後見人となった。しかし翌984年の復活祭に、ハインリヒはクウェドリンブルクに自らの支持者を集め、自身を国王に選出させた。この王位簒奪にザクセン大公ベルンハルト1世やマインツ大司教ヴィリギス、シュヴァーベン大公コンラートらは反対し、また、義父ブルグント王コンラートが皇帝の母テオファヌを支持する中、985年にテオファヌが摂政となることをハインリヒも認め、その見返りとして再びバイエルン大公位が与えられた。当時バイエルン大公であったルイトポルト家のハインリヒ（もとケルンテン大公）は再びケルンテン大公位を与えられ、ケルンテン大公であったザーリアー家のオットー（老公）にはライン上流域左岸の豊かな領地と支配権が与えられた。なお、ケルンテン大公位は989年のルイトポルト家のハインリヒの死後、ハインリヒ2世に与えられた。995年、ハインリヒ2世は没し、息子ハインリヒがバイエルン公位を継承したが、ケルンテン大公位はザーリアー家のオットー（老公）に再び与えられた。息子ハインリヒは又従兄にあたるオットー3世の死後、ハインリヒ2世として王位に就いた。
このゲームは、プレイヤーが「セブン･ディスタビライザー」を使用して、7次元先に実在する世界「ラシェーラ」を俯瞰視点で観察し、且つ、ラシェーラにいる者（主人公）の意識を操る事で介入している、という設定である。そのため、シナリオの進行にはアーシェス側で得た情報を、それを知り得るはずが無いデルタが使用する、といった俯瞰視点を使ったものが重要な鍵になってくる。時間軸はデルタ編開始が「シェルノサージュ」の開始直前、イオン編開始が「シェルノサージュ」の終了直後、全体が「シェルノサージュ」の『夢セカイ』の5000年後、「アルトネリコ 世界の終わりで詩い続ける少女」よりも昔の話である。太陽「ベゼル」が寿命によって赤色巨星と化し、惑星「ラシェーラ」は滅亡の危機に瀕していた。これを解決するべくラシェーラの女帝は詩魔法の力を使い、死にかけのラシェーラを潰して得たエネルギーで他の惑星へ移住する計画を実行するもトラブルが発生し、ラシェーラはおろか詩魔法を行使する仮想生物「ジェノム」を失った上に安住の地にもたどり着けず、全てを失ったラシェーラの民は宇宙船「ソレイル」で宇宙を彷徨う事となった。その後しばらくしてソレイルの住民の一部はコールドスリープに入り、そのコールドスリープポッドがある「フェリオンの隔壁」の外にはラシェーラや詩魔法を忘れた世代の人々が瓦礫などで街を作って住み始めた。それから長い年月が経ったある時、更なる災難がソレイルの住民を襲う。突如として謎の生物「シャール」が現れ、人々を拉致し始めたのだ。詩魔法を行使するシャールに成す術無くやられる一方だった人間達だったが、そんな中でフェリオンの隔壁が開かれ、コールドスリープされていた人々が目覚めたのだった。詩魔法と、失われた技術と知識を使える彼らを住民は「古代種」と呼ぶようになり、人々はシャールへの抵抗を彼らに託した。シャールに対してソレイルの民は二つの勢力に分かれた。一つはシャールを崇めて共存する事で難を逃れようとする宗教組織「ジェノミライ教団」、もう一つは古代種に頼りシャールに徹底抗戦して過去の平穏な生活を取り戻そうとする都市国家「フェリオン」である。二つの勢力は対立していた。そんな中、古代種であるデルタとキャスティ（キャス）はフェリオンの長の天統姫であるネイからジェノミライ教団の本拠地「クオンターブ」に技師のサーリを探すよう命じられる。夢で出てきた見知らぬモノがそれを見た後で現実でも遭遇する、などの違和感に戸惑いながら、デルタは任務を遂行する。サーリを救出しクオンターブから逃げる道中でデルタとキャスの間に天然のヒトガタジェノム、プリムが生まれる。一行はネイの元に逃げ帰ることが出来たが、直後、また機械兵器がフェリオンの隔壁を襲撃する。この機械兵器は自分から奪ったシェルン（制御詩）を使ってジェノミライ教団の司教ジリリウム・リモナイト（ジル）が操っていると考えたサーリの依頼によって、一行は再び教団へ赴くが、そこでジルが「シェルノサージュ」というシェルンを使おうとしていることを知る。その場ではジルを取り逃したデルタとキャスはサーリに頼まれジルの捜索と捕縛に向かうが、ジルの計略に嵌りデルタとキャスは囚われの身となり、プリムは行方不明になった。一方、その2年後、デルタとキャスがフラスコの海で意識を取り戻したのと同じ時期に、天文皇女・イオンは『シェルノサージュ』の世界で端末を基にガーディアンロボを利用したアバター、アーシェスを組み立てる。自分が住む世界を囲む『世界の壁』を壊し、ねりこの制止を振り切って現実世界に戻ったイオンは、アーシェスや、シャールの少年タットリアの助けを借り、自分が元居た世界に戻る為に手段を選ばず、それで世界が滅んでも構わないというネロを止めるべく、デルタらかつての7人の親友の捜索を開始。同時にシャールと人間の争いを止めようと考える。