祭りのメインストリートは本町通り（ほんちょうどおり = 国道7号線より1本東にある、南北に延びる道）である。JR土崎駅（秋田駅の北隣の駅）で下車。土崎駅出口（西側のみ）から正面方向（西）に直進、徒歩3分で左手に土崎神明社（= 土崎地区の中心に位置）。さらに徒歩3分の直進をすれば本町通りの土崎駅入口交差点。そこから左（南）に少し歩くと、露店が多く、最もにぎやかな地点。祭り当日は交通規制があり、周辺の道路も渋滞するため、車で本町通り近辺に直接アクセスすることは困難。遠方から車で向かう場合は、遠巻きにホテルなどに駐車して、そこから徒歩・電車・バスなど。ポートタワーセリオン（タワー、道の駅あきた港）付近から徒歩で国道7号線を渡って本町通りに向かっても、10分程度である。なお、「土崎港曳山まつり総合本部」「土崎港曳山まつり実行委員会」「秋田臨港警察署」および統前町の連名で毎年配布される交通規制図では、「セリオン」の駐車場が案内されている。
土崎の曳山行事は、日本の多くの祭礼行事と同様、長らく女人禁制であった。明治時代に太政官布告により「女人禁制の禁止」が布告されたにもかかわらず、女性の参加が珍しくなくなったのは、それから100年程度経ってからである。日本の古代の神祗信仰では女性禁忌はなく、むしろ巫女など女性は高い位置に置かれていたが、仏教観に起因して方向転換したといわれる。
曳山は行程途中の各所で停まり、踊りが披露される。子供の輪踊りもある。これらの踊りのことを演芸と称する。曲目は、民謡、演歌、流行りの歌等々であり、テープやCDを用いる場合が多い。中でも「秋田音頭」は、全町内で採用されているスタンダードナンバーである。テープやCDを用いずに囃子方と歌い手で生演奏する町内もある。振り付けは全町内とも似ているが、町内ごとに工夫している部分もある。その発祥は、一説には、若い武士が柔術の型を踊りにしたものに、さらに上方の旅役者が歌舞伎の六方の表現を加えたものとされる。亀ちゃ（仁井田亀松、1856年 - 1916年）が名人として知られ、その弟でやはり名人の福ちゃ（仁井田福松）が1915年（大正4年）から土崎港に広めたとされる。古くは「男踊り」と呼ばれ、女性が男性の服装をして踊ることが多かったという。戻り曳山のときは、簡単な振り付けの土崎盆踊りが踊られ、酒が入った曳き子が自ら参加することが多い。どの町内でも囃子方が生演奏する。その太鼓は、「どんどこどっけ、どんどこどっけ、どんどこどっけ、どん」というノリの良いリズムである。4拍子の楽譜に書けば、たった3小節単位のリズムを何度も繰り返すシンプルなパターンであり、踊りも同じ繰り返しである（笛の旋律は3小節の繰り返しではなく、いくつかバリエーションがある）。
港ばやしは、戦前は家元制度・世襲で受け継がれたが、戦後は港和会（1947年結成）・娯笑会（1955年結成）・しぶき会（1956年結成）・若波会（1974年結成）から構成される「土崎港ばやし保存会」（1980年結成）、によって伝承されている。また、町内囃子の旭鳳会もお囃子をやっている西洋音楽と同様の五線譜での採譜も試みられている。音源としては、音楽CDとして1997年に発売され、2013年現在も販売されている（港和会演奏）。
祭りが終わった翌日の22日、曳山は早々に解体される。曳山を作り、曳き、解体するという一連の流れが曳山であり、解体は大切な作業とされている。各町内での神事としては、会所開きに始まって曳山に飾られた札と会所の祭壇に置かれた御幣と御札を委員長や役員の自宅に納める札納めで一連の神事を終える。7月終わりから8月初めに行われる「笠納め」（かさおさめ）と呼ばれる祭りの反省会（打ち上げ）を締めとする町内も多い。
グラム陰性菌であるため、大部分のシュードモナス属は本質的にペニシリンやその他のβ-ラクタム系抗生物質に対して耐性を持つが、ピペラシリン、イミペネム、チカルシリン、またはシプロフロキサシンに対して感受性を持つ。このため、これらの抗生物質は治療に用いられるが、その他、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシンのようなアミノグリコシド系抗生物質が治療に用いられる(アミノグリコシド系抗生物質#抗緑膿菌作用のあるもの)。P. aeruginosa(緑膿菌)は、臨床現場における日和見感染の病原体である。抗生物質に対して低感受性であるため警戒されている。この低感受性は、染色体にコードされた薬剤耐性遺伝子（例えば、 mexAB-OPRM、mexXYなど)による多剤排出ポンプ[ 英: Bacterial efflux pumps（英語版） ]、および細菌細胞のエンベロープの低透過性に起因する。多剤排出ポンプは細胞壁中の膜貫通タンパク質ポリンであり、抗生物質が効果を現す前にこれを細胞外へ排出する。P. aeruginosaが抗生物質の低感受性と抵抗性を獲得することがある。染色体の遺伝子の突然変異および、抗生物質抵抗性の決定因子の水平伝播はその原因となり、多剤耐性の発生も引き起こす。また、体細胞超変異は、慢性の感染症を引き起こす緑膿菌株の薬剤耐性獲得の原因の一つとなる。また、インテグロン中にいくつかの異なる薬剤耐性遺伝子が集まっており、薬剤耐性決定因子の獲得につながる。複数の研究は、バイオフィルムの形成または変異体の小コロニーの出現に関連する耐性表現型が緑膿菌の抗生物質処理への応答において重要である可能性を示している。