1989年（平成元年）、訪中作家団の団長として訪れた北京において天安門事件を目の当たりにし、市内の交通が途絶して北京飯店に三日間足止めになるが、東京からの救援機第1号にて帰国。直後に心筋梗塞で倒れ、集中治療室に三日間入り、心臓の三分の二が壊死、1993年「蛍」など療養とリハビリを背景とした作品を執筆、北京滞在時、および闘病の体験は『心筋梗塞の前後』として刊行されている。その後も網膜剥離の手術を受けるなどしたが、執筆意欲は衰えなかった。心筋梗塞後は軽井沢の別荘を売って、長野県北御牧村に家を買い、仕事場を移した。同じ心筋梗塞の闘病経験のある不破哲三とも、家族ぐるみで交友を持つようになり、1999年の京都市長選挙では不破の依頼で井上吉郎候補への支援文を寄せた（これらの書簡、対談等は『同じ世代を生きて』所収）。1997年（平成9年）頃から、パソコンやインターネットに強い関心を示す。長野県小諸市の仕事場にMacintoshを複数台購入し、「電脳小学校」と名づけて地元の子供たちにも開放しようとしていた。また、上京する際はPowerBookを持ち歩いていたこともある。本人もワープロソフトで執筆したり、電子メールを知人とやりとりしたりしていた。自ら描いた絵をスキャンして、その画像をインクジェットプリンタで竹紙に印刷したものを「版画」と呼んで楽しんでいたこともある。当時「たとえば早稲田大学も、これからは早稲田＜検索＞大学になるんだ」と話すなど、今でいうeラーニングにも関心があったようである。パソコンやインターネットを障害者や高齢者、地方に住む者のハンディキャップを補う道具としてとらえていたと考えられる。2001年、蘇曼殊の詩に触発されて書いた最後の長編小説『虚竹の笛 尺八私考』で親鸞賞を受賞。2004年（平成16年）9月8日肺炎の為、長野県東御市で死去。85歳没。死後、正四位に叙され、旭日重光章を授けられた。没日は直木賞受賞作『雁の寺』に因んで帰雁忌と呼ばれる。2006年（平成18年）、横瀬夜雨の伝記小説『筑波根物語』（1965年に『中央公論』に連載）刊行。
類似のBINOL-Ti(IV) 錯体を用いた不斉アリル化を行っていたTagliaviniグループは、様々なエナンチオ純粋な置換ビナフチル配位子の合成によって初期の成功に続いた。これらの置換ビナフチルで最も成功したもの（右図）は Ti(Oi-Pr)₂Cl₂錯体を用いたアルデヒドへのアリルトリブチルスズの付加においてエナンチオマー過剰率92%の生成物を与えた。Brennaグループは新しいBINOLアナログ（右図）を開発した。このアナログはかなり簡単にエナンチオマーに分割して、立体選択的ケックアリル化のための不斉補助基として使用することができ、一部の例では (R)-BINOLを用いたアリル化よりも最大4%までエナンチオマー過剰率が向上した。加えて、開発された補助基も古典的BINOLと同様にNLEを示した。Fallerのグループはキラル被毒戦略における酒石酸ジイソプロピルの使用を開発した。酒石酸ジイソプロピル、ラセミBINOL、Ti(OiPr)₄、ベンズアルデヒド、アリルトリブチルスズを使って、最大91%のエナンチオマー過剰率が得られた。吉田潤一らは均一で、容易に回収可能な触媒系として働くデンドリマービナフトール類を開発し、それらがケックのアリル化条件を用いたホモアリルアルコールの形成に適していることを明らかにした。丸岡啓二と木井敏は、エナンチオマー過剰率を向上させるためにルイス酸とアルデヒドとの間のM-O結合回転を制限することを目指して、アルデヒドのアリル化のための二点配位型Ti(IV) BINOL配位子を開発した。この二点配位型配位子は2つのチタン、BINOL、芳香族ジアミンを含み、最大99%のエナンチオマー過剰率を与えた。向上した立体選択性は2つのチタンからのカルボニルの二重活性化から来ていると提案されており、この仮説は2,6-γ-ピロン基質に関する¹³C NMRおよびIR分光学的研究によって支持されている。M-O回転が制限されているという最も説得力のある証拠はtrans-4-メトキシ-3-ブテン-2-オンのNOE NMR研究から来ている。遊離エノンおよび単座（一点配位型）Ti(IV) と錯体を作ったエノン中のメロキシビニルプロトンの放射はs-cisおよびs-trans配座を示しているのに対して、二点配位型Ti(IV) 錯体中のエノンの放射は主にs-trans配座を示している。2003年、このグループはこの二点配位型触媒を用いてアリル化戦略をケトンへと拡張した。このアリル化反応における2つの鍵となる段階は、アリル断片中のSn-C結合の切断とTi(IV) 触媒の再生を促進するためのO-Sn結合の形成である。ユ・チャンモ（유찬모）らはこれらの段階をともに促進するアルキルチオシラン促進剤を開発した。この促進剤は同時に反応速度を上昇させ、必要な触媒使用料を低減した。ベンズアルデヒドとアリルトリブチルスズのカップリングは10 mol%のBINOL-Ti(IV) 触媒を使用してホモアリルアルコールを収率91%、エナンチオマー過剰率97%で与えたが、このアルキルチオシランを添加することで、わずか5 mol%の触媒で収率80%、エナンチオマー過剰率95%が得られた。BruecknerとWeigandは1996年に、このアリル化化学の使用を複素環を含むβ置換スタンナンへと拡張した。