1960年代から1970年代の東京湾沿岸部の埋め立ての際、埋め立て土砂を海底から採取したために、流れの悪い浚渫窪地ができた。ここに貧酸素水塊と栄養塩が溜まり、嫌気性細菌により大量の硫化水素が発生する。このことが青潮の発生源の一つとなっている。現在の東京湾では約1億立方メートルの浚渫窪地が存在する。
東京湾（江戸湾）は多種・大量な魚介類を産し、かつては世界最大の人口を誇った大都市・江戸の人々の胃袋を満たしてきた（「江戸前」も参照）。明治時代以降、沿岸や流入河川の流域では都市化・工業化が進み、埋立地拡大に伴う干潟など自然海岸や浅瀬の減少、水質悪化が深刻になった。特に1970年代に環境汚染はピークを迎え、海の生き物は激減、一時は「死の海」とまで呼ばれる状態にあった。その後、環境保全の取り組みが進み、様々な生き物が戻り、豊かな生態系を取り戻しつつある。水質の改善も進んでいる。2015年に、135年ぶりに再確認されたムギワラエビのように希少な固有種も見られる。一方、夏場には常態的に貧酸素水塊が発生するなど、まだ取り組むべき課題はある。水質改善により、東京湾には多くの種類の生き物が戻ってきたが、個体数はそこまで増えていないと考えられている。実際に東京湾の漁獲量は、2000年に入っても環境汚染のピークだった1960年代・1970年代から増えておらず、横ばいが続いている。
外湾部では陸から離れた沖の海底は急激に深くなっており、水深500m以上に達する東京湾海底谷が認められる。海底谷は相模トラフに合流する。この海底谷には河川を通じて東京湾に流れ込んだ有機物が沈殿しており、栄養が豊富な深海という特異な環境が東京（江戸）の都市化とともに形成されてきた。そのためメガマウスやミツクリザメなど世界的に希少な深海魚が捕獲されることがある。
現在の「東京湾」という呼称は、明治維新後江戸が東京と改称され、複数の令制国に囲まれた湾であることから、湾岸における最大の都市名から命名された。地形図では「東京湾」、海図では「東京海湾」の表記であったが、最近になって「東京湾」に統一されたものである。なお、近世の東京湾を指すとされる「江戸湾」という語は近年になって造られた語（造語）であり、明治時代以前にあった言葉ではない。江戸時代には江戸前や江戸前海などの呼び名があった。江戸前とは漁場を示す言葉であり、主に佃沖の漁場を指した。江戸前海とは房総沖などと並ぶある範囲を持った海域のことで、品川沖から葛西沖あたりまでを包括していた。しかし、湾全体は単に（武蔵相模上総下総の）内海、あるいは裏海のように呼ばれていた。その後の幕末や明治初期の記録文献類に登場する現在の東京湾に相当する湾の名称もほとんどが「内海」となっているが、「内海」という言葉は江戸時代以前に北東の下総常陸国境付近に存在していた「香取海」に対しても用いられるので、昨今では区別のため、古代以前の東京湾のことを「古東京湾」や「奥東京湾」、中世から近世までの湾を「江戸湾」「江戸内海」などと呼称することが多い。
専門分野としては、果樹園芸学、蔬菜園芸学、花卉園芸学、園芸利用学、造園学があり、花、野菜、果物を中心にさまざまな植物を扱い、植物学、生物学、自然科学などと深く関連する。日本では、園芸学会の会員として研究発表を行い、園芸学全般またはいずれかの分野での学術的な著書や論文を著述した経歴のある人物をいう。一方、園芸について知識や栽培経験が豊富で、栽培技術の指導や著作または品種育成などで著名であるが、学術的な立場にない人は園芸学者ではなく、園芸家または園芸研究家と呼ばれる。
川内村の大地は、東部山地と西部山地の一部を作っている変成岩類とその他の地域に見られる深成岩類、それらを部分的におおう未固結堆積物で構成される。変成岩類には、黒雲母片岩（白と黒の縞模様があって、黒雲母・石英・斜長石などからできている）および緑閃石・緑泥石片岩（緑閃石・緑泥石・石英・斜長石などからできている）で、もとになった岩石は、古生代の石炭紀～二畳紀あるいはより古い時代に堆積した中性～塩基性の凝灰岩～凝灰質砂岩とみられている。深成岩類には、広く分布しているいろいろな種類の花崗岩・閃緑岩類そしてかんらん岩類がある。花崗岩類には片状構造を持つ古期花崗閃緑岩類とよばれるものと新期花崗岩類とされるものがあり、前者には高塚山・万太郎山などに分布する花崗閃緑岩（角閃石・斜長石・正長石・石英から構成される）がある。後者は鬼太郎山から毛戸付近を通る破砕帯の東側に見られる新期花崗閃緑岩（角閃石・黒雲母・石英・正長石・斜長石と少量の燐灰石・ジルコン・磁鉄鉱・褐簾石から構成される）・糠馬喰山・檜山・大平などに分布する灰色黒雲母花崗岩（黒雲母・斜長石・正長石・石英から構成される）・淡紅色黒雲母花崗岩（黒雲母・斜長石・淡紅色の正長石・石英から構成される）などに分類される。閃緑岩類とかんらん岩類は小規模な分布をしている。この地域の花崗岩類および深成岩類は地価深所まで風化作用が及んでいる場所が多く急斜面などで崩壊などを起こすことがある。これらの深成岩類を貫いて輝緑岩・花崗閃緑ひん岩・石英斑岩・流紋岩・半花崗岩などがみられる。未固結の堆積物には深成岩類をおおう粘土・砂・段丘礫・崖錐・火山灰などがある。