日中時間帯は1時間あたり新快速と普通の1本（普通は当駅で京都方面に折り返し）が停車する。朝夕の新快速が設定されない時間帯は普通列車が増発され、上りは1時間あたり1 - 3本、下りは1時間あたり1 - 2本が運行されている。上り初発列車は、当駅始発5時00分、下り最終列車は、当駅着が1時10分前。2004年10月16日から2006年3月17日まではJR宝塚線に直通する塚口（高槻駅からも各駅停車となる普通列車）行きが設定されていた。下り列車は北陸本線直通の福井行きと米原行きが朝に1本ずつ設定されているほかは、新快速の設定がない時間帯を中心に京都からの永原行きと近江塩津行きの普通列車が運転されている。朝晩のみ特急「サンダーバード」の一部の列車が停車し、新快速が設定されない時間帯の長距離利用客の利便を図っている。また、一部列車は西日本ジェイアールバス若江線と連絡している。2019年3月改正時点では福井・金沢方面の列車は7号、41号、45号、47号の4本、大阪方面の列車は2号、4号、36号の3本が停車する。
湖西線内で2駅のみの直営駅の一つ（堅田駅の被管理駅）である。駅構内にはみどりの窓口・有人改札口・交通系iCカード専用簡易型自動改札機・屋内待合室・化粧室・発車標などが設置されている。12両対応の島式ホーム2面4線を持ち、さらに外側に上下待避線を有する高架駅になっている。構内の南側には留置線が設けられ、線内運用の電車の夜間留置に使用されている。多雪地帯のため留置線に短い屋根があり、積雪からパンタグラフを保護している。湖西線計画時には当駅で貨物営業を行う予定があった。貨物側線用地は保線基地として活用されている。駅開業時から駅弁の販売を行っていた（時刻表の「弁」マークによる）。現在はホーム上に売店は無い（飲み物の自動販売機あり）。駅構内改札口前には鰻（うなぎ）のお弁当や魚介類の加工品などを取り扱う「西友（にしとも）」がある。2004年7月4日にホームと改札階とを結ぶウォークスルータイプのエレベーターが設置され、これと同時にトイレ・待合室が改装された。
湖西線開通前の1969年まで付近を走っていた江若鉄道にも、同名の駅が存在した（同鉄道の終点であった）。詳細は近江今津駅 (江若鉄道)を参照。
当駅は湖西地方の高島市の中心駅・主要駅で、かつて所在地付近を走っていた江若鉄道が当駅近くを終点としており、駅周辺は開業前から湖西地域の鉄道の拠点であった。現在の湖西線においても拠点駅として機能しており、多くの列車が当駅で折り返すほか、優等列車である特急も一部停車する。高島市内では最も多い乗降客を誇る駅である。駅前からは若狭・小浜方面へのバスが発着し、また駅に近い今津港には琵琶湖の観光船も発着している。
KBS京都テレビでは初となる朝の生ワイド番組である。放送時間は毎週月曜日 - 金曜日 7:00 - 8:00。京都府内のニュースと天気予報、女性向けの情報などを中心に伝えていたが、番組はわずか9か月で終了した。
2012年8月13日、JBCは「元JBC職員と共謀しJBCと競合する新団体設立を図るなどボクシング界の秩序を乱す行為に及んだ」としてC2にマッチメーカーライセンスの無期限停止処分を決定。C2は世界戦を手掛けるなど国際的に活動していたマッチメーカーである。同月26日、C2は記者会見を開き、「聴聞の機会も与えられず、捏造された事実で一方的に処分された」と主張。また、C2は「試合で負傷した選手の手当てをすぐにしなかった」「計量で実際と違う体重が記録されている」などの理由で専務理事であるB3らの更迭などを求め、コミッショナーのB1に要望書を提出し、協会加盟ジムに賛同を募り、「50人が集まれば次の行動を起こしたい。日本プロボクシング協会が暫定的にJBCの役割を務めてもいい。」と提案していたが、C2が賛同者を募ると翌日にはJBCが協会加盟各ジムに宛て「『一国一コミッション』の現行体制を破壊しボクシング界の秩序を乱す［C2］氏の行為に惑わされることなく、JPBA［協会］とJBCが共存共栄するようご協力賜りますようお願い申し上げます」と通達。C2は11月に日本スポーツ仲裁機構に処分取消を申し立てたもののJBCが応じなかったため、12月7日にJBCを相手どって地位確認と慰謝料の支払いを求め、東京地方裁判所に提訴したが、2014年4月18日に和解し、同月28日にライセンスを再交付された。
相次ぐ外国船の来航や、列強の近代的軍装に刺激された幕府の幕政改革・軍制改革に伴い、ペリーの第2回次来航があった嘉永7年5月（1854年、安政元年）に、男谷信友（精一郎）の提案により阿部正弘が安政の改革の一環として、現在の浜離宮の南側に大筒4挺ほどの操練場を作った。正式には、安政3年（1856年）に講武場として築地に発足。まもなく築地は軍艦操練所となり、同年4月に軍備増強の一環として幕府が創設した講武所を改組。万延2年（1861年）に現日本大学法学部図書館のある水道橋内三崎町二丁目の地に講武所を建設し武芸の講習所とし、慶応2年（1866年）11月には廃止。陸軍所に吸収されて砲術訓練所となる。明治23年（1890）には、陸軍練兵場（旧・講武所）が三菱社に払い下げられ、市街地としての三崎町の開発が行われる。劇場の三崎三座（東京座、三崎座、川上座）や神田パノラマ館ができ、日本法律学校（現・日本大学）も移転した。講武所は、弓術・砲術・槍術・剣術・柔術部門に分かれ（のちに弓術部門と柔術部門は廃止）、総裁2名、各部門に師範役が1名ずつ、そしてその下に教授方が置かれていた。総裁には、旗本の跡部良弼と土岐頼旨、教授には、幕臣の高島秋帆・下曽根信敦・男谷信友・勝海舟・榊原鍵吉・窪田清音・伊庭秀俊・大村益次郎（村田蔵六）らがなった。