制吐薬の投与は小児の嘔吐の治療の一助となる。オンダンセトロンには一定の有益性があり、単回投与によって静脈内輸液や入院の必要性を低下させ、嘔吐回数を減少させる。メトクロプラミドもまた場合によっては有用である。ただし、オンダンセトロンの使用が小児の再入院率を上昇させる可能性がある。オンダンセトロンの静脈内投与が臨床的に難しい場合は経口投与も可能である。ジメンヒドリナートは嘔吐を減少させはするものの、臨床的に有意な便益性は認められない。
母乳で育てている乳児には普段通り母乳を与えることが望ましく、乳児用流動食を与えている乳児には、ORTによる水分補給後すみやかに同じ乳児用流動食を与えることが推奨されている。無乳糖または低乳糖の流動食を与える必要はない。小児には下痢が続く間も通常の食事を続けさせることが望ましいが、例外として単糖を多く含む食品は避けるようにする。 BRATダイエット (バナナ、米、アップルソース、トースト、お茶)は、栄養分が不足しており通常の食事と比べて便益性が高いわけでもないため、現在では推奨されていない。一部のプロバイオティックスは、回復までの時間と下痢の頻度をいずれも減少させる効果があることが示されている。また、抗生物質によって惹き起こされる下痢の予防と治療にも有用である。発酵乳製品(ヨーグルト等)も同じく有益である。発展途上国では亜鉛の補給が小児の下痢の治療および予防いずれにも効果的であると考えられている。
小児、成人ともに、胃腸炎の一次治療は水分補給である。経口補水液による水分補給が適しているが、意識レベルの低下がみられる場合や脱水が重度である場合、点滴静脈注射による輸液が必要となることがある。経口補水液は単糖類を含むものより複合炭水化物から作られたもの(麦や米を原料とするものなど)の方が好ましい。ソフトドリンクやフルーツジュースなどの単糖類を特に多く含む飲料は、下痢を増悪させることがあるため推奨されない。経口補水液が手に入らない場合や患者が好まない場合、これよりも効果は落ちるが純粋な水を用いることもある。必要性がある場合、小児には経鼻カテーテルを使用することもある。一方、小児の軽症胃腸炎患者に対しては、2倍希釈のリンゴジュースを用いると治療失敗が少ないとの報告がある。
胃腸炎は通常急性の自己制限疾患であり、投薬は必要としない。軽度ないし中等度の脱水には経口補水液による治療(ORT)がよく用いられる。ただし、小児にはメトクロプラミドやオンダンセトロンが治療の助けとなることがある。腹痛の治療にはブチルスコポラミンが有用である。
世界保健機関は2009年に性双方の点で、全世界的に小児へのロタウイルスワクチン投与を推奨している。市場には2種のロタウイルスワクチンが既に存在し、さらに数種が開発中である。アフリカおよびアジアではこのワクチンが小児の重度の胃腸炎を減少させており、国家予防接種プログラムを実施している国々では疾患の発症率と重症度が低下している。このワクチンはほかにも、感染循環を減少させることによってワクチン未投与の小児にも予防効果がみられる。2000年から実施されたアメリカ合衆国でのロタウイルスワクチン投与プログラムによって、下痢の症例数が実に80%も減少している。ワクチンの初回投与は生後6週から15週の間に投与することが望ましい。経口コレラワクチンは2年以上にわたって50〜60%の有効性が確認されている。
汚染されていない水を容易に利用できるようにし、習慣的に良い衛生状態を保つことが、感染や臨床的に有意な胃腸炎の発生率を減少させる上で重要である。各個人の手洗い等の実践が、途上国でも先進国でも胃腸炎の有病率を30%も減少させることがわかっている。消毒用アルコールジェルも効果的である。衛生状態の悪い地域では特に、全体的な衛生状態の改善と並んで授乳が重要な役割を果たす。母乳は感染の頻度と感染期間のいずれも減少させる。汚染された食品や飲料を避けることもまた効果的である。
1959年（昭和34年）4月、本多は岡崎市長選挙に「石原清光」の名で立候補するも落選。同年、岡崎市中町の「灯台山」と称された高燥地約2,100m²を購入。1960年（昭和35年）10月には日本私立幼稚園連合会（現・全日本私立幼稚園連合会）の代表として欧米10ヶ国を視察。スイスの幼稚園をモデルに新しい幼稚園の創設を計画し、1961年（昭和36年）に工事に着工した。巨大な岩石の累積からなる灯台山の整地作業は難航を極めたが、1962年（昭和37年）3月1日、中町1丁目8番地に早蕨幼稚園（現・第一早蕨幼稚園）を創立した。本多は幼児教育者育成を念じ短期大学創設を決意。早蕨幼稚園に隣接する土地の所有者6人と折衝し、1964年（昭和39年）7月1日、4,986m²の敷地を購入した。1965年（昭和40年）4月1日、同地に岡崎女子短期大学開学。初代学長にはお茶の水女子大学名誉教授の石川謙が就任した。1973年（昭和48年）4月1日、同地に第二早蕨幼稚園を創立。第二早蕨幼稚園は同年10月15日に洞町八王子の現在地に移転新築。2004年（平成16年）3月15日、大学グラウンド隣接地の欠町字狐ヶ入21番地に第一早蕨幼稚園の新園舎が竣工。2012年（平成24年）11月8日、岡崎女子大学の設立認可が下り、2013年（平成25年）4月1日に開学した。