enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "We", "recently", "identified", "the", "winged-helix", "transcription", "factor", "Trident", "and", "described", "its", "expression", "pattern", "in", "synchronized", "fibroblasts", "." ]

[ "we", "recently", "identified", "the", "winged-helix", "transcription", "factor", "trident", "and", "described", "its", "expression", "pattern", "in", "synchronized", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "have", "now", "studied", "Trident", "expression", "in", "cell", "lines", ",", "differentiating", "thymocytes", "and", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "peripheral", "blood", "." ]

[ "we", "have", "now", "studied", "trident", "expression", "in", "cell", "lines", ",", "differentiating", "thymocytes", "and", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "peripheral", "blood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "During", "T", "cell", "differentiation", ",", "expression", "peaked", "in", "the", "actively", "dividing", "immature", "single", "positive", "cells", "." ]

[ "during", "t", "cell", "differentiation", ",", "expression", "peaked", "in", "the", "actively", "dividing", "immature", "single", "positive", "cells", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "In", "peripheral", "blood", "lymphocytes", ",", "expression", "of", "Trident", "mRNA", "was", "absent", ",", "but", "could", "be", "induced", "upon", "stimulation", "with", "mitogens", "in", "vitro", "." ]

[ "in", "peripheral", "blood", "lymphocytes", ",", "expression", "of", "trident", "mrna", "was", "absent", ",", "but", "could", "be", "induced", "upon", "stimulation", "with", "mitogens", "in", "vitro", "." ]

[ "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "imply", "a", "function", "for", "Trident", "in", "dividing", "lymphocytes", "." ]

[ "these", "observations", "imply", "a", "function", "for", "trident", "in", "dividing", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Differential", "autoregulation", "of", "glucocorticoid", "receptor", "expression", "in", "human", "T-", "and", "B-", "cell", "lines", "." ]

[ "differential", "autoregulation", "of", "glucocorticoid", "receptor", "expression", "in", "human", "t-", "and", "b-", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regulation", "of", "glucocorticoid", "receptor", "(", "GR", ")", "expression", "by", "its", "cognate", "ligand", "was", "examined", "in", "the", "glucocorticoid-sensitive", "human", "leukemic", "T-cell", "line", "6TG1", ".", "1", "and", "in", "the", "human", "B-cell", "line", "IM-9", "." ]

[ "regulation", "of", "glucocorticoid", "receptor", "(", "gr", ")", "expression", "by", "its", "cognate", "ligand", "was", "examined", "in", "the", "glucocorticoid-sensitive", "human", "leukemic", "t-cell", "line", "6tg1", ".", "1", "and", "in", "the", "human", "b-cell", "line", "im-9", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "the", "decrease", "in", "GR", "mRNA", "seen", "in", "IM-9", "cells", "after", "treatment", "with", "1", "microM", "dexamethasone", "for", "16-18", "h", ",", "treatment", "of", "6TG1", ".", "1", "cells", "resulted", "in", "an", "8-fold", "increase", "in", "GR", "mRNA", ",", "as", "determined", "by", "Northern", "blot", "and", "RNase", "protection", "analysis", ",", "with", "a", "corresponding", "3-", "to", "4-fold", "increase", "in", "GR", "protein", "." ]

[ "in", "contrast", "to", "the", "decrease", "in", "gr", "mrna", "seen", "in", "im-9", "cells", "after", "treatment", "with", "1", "microm", "dexamethasone", "for", "16-18", "h", ",", "treatment", "of", "6tg1", ".", "1", "cells", "resulted", "in", "an", "8-fold", "increase", "in", "gr", "mrna", ",", "as", "determined", "by", "northern", "blot", "and", "rnase", "protection", "analysis", ",", "with", "a", "corresponding", "3-", "to", "4-fold", "increase", "in", "gr", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Half-maximal", "induction", "of", "GR", "mRNA", "and", "protein", "in", "6TG1", ".", "1", "cells", "was", "observed", "between", "10-100", "nM", "dexamethasone", ",", "and", "inclusion", "of", "1", "microM", "RU", "38486", "completely", "blocked", "the", "effects", "of", "100", "nM", "dexamethasone", ",", "demonstrating", "that", "positive", "autoregulation", "of", "GR", "expression", "in", "6TG1", ".", "1", "cells", "is", "a", "receptor-mediated", "response", "." ]

[ "half-maximal", "induction", "of", "gr", "mrna", "and", "protein", "in", "6tg1", ".", "1", "cells", "was", "observed", "between", "10-100", "nm", "dexamethasone", ",", "and", "inclusion", "of", "1", "microm", "ru", "38486", "completely", "blocked", "the", "effects", "of", "100", "nm", "dexamethasone", ",", "demonstrating", "that", "positive", "autoregulation", "of", "gr", "expression", "in", "6tg1", ".", "1", "cells", "is", "a", "receptor-mediated", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Positive", "autoregulation", "of", "GR", "expression", "was", "also", "observed", "in", "glucocorticoid-resistant", "CEM-C1", "cells", ",", "which", "contain", "functional", "GR", ",", "but", "whose", "growth", "is", "unaffected", "by", "glucocorticoids", "." ]

[ "positive", "autoregulation", "of", "gr", "expression", "was", "also", "observed", "in", "glucocorticoid-resistant", "cem-c1", "cells", ",", "which", "contain", "functional", "gr", ",", "but", "whose", "growth", "is", "unaffected", "by", "glucocorticoids", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "Thus", ",", "positive", "autoregulation", "is", "neither", "a", "consequence", "nor", "the", "sole", "cause", "of", "growth", "arrest", "." ]

[ "thus", ",", "positive", "autoregulation", "is", "neither", "a", "consequence", "nor", "the", "sole", "cause", "of", "growth", "arrest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "degree", "of", "negative", "autoregulation", "in", "IM-9", "cells", "and", "positive", "autoregulation", "in", "6TG1", ".", "1", "cells", "was", "unaffected", "by", "inhibition", "of", "protein", "synthesis", "with", "cycloheximide", "." ]

[ "the", "degree", "of", "negative", "autoregulation", "in", "im-9", "cells", "and", "positive", "autoregulation", "in", "6tg1", ".", "1", "cells", "was", "unaffected", "by", "inhibition", "of", "protein", "synthesis", "with", "cycloheximide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "Measurement", "of", "GR", "mRNA", "turnover", "in", "6TG1", ".", "1", "cells", "treated", "with", "actinomycin-D", "revealed", "a", "half-life", "of", "2", ".", "5", "h", ",", "which", "was", "unaffected", "by", "dexamethasone", "treatment", "." ]

[ "measurement", "of", "gr", "mrna", "turnover", "in", "6tg1", ".", "1", "cells", "treated", "with", "actinomycin-d", "revealed", "a", "half-life", "of", "2", ".", "5", "h", ",", "which", "was", "unaffected", "by", "dexamethasone", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O" ]

[ "A", "similar", "half-life", "was", "determined", "in", "IM-9", "cells", "and", "was", "also", "unaffected", "by", "steroid", "treatment", "." ]

[ "a", "similar", "half-life", "was", "determined", "in", "im-9", "cells", "and", "was", "also", "unaffected", "by", "steroid", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "These", "results", "are", "consistent", "with", "the", "interpretation", "that", "glucocorticoid", "-mediated", "autoregulation", "of", "GR", "expression", "is", "a", "tissue-specific", "primary", "transcriptional", "response", "." ]

[ "these", "results", "are", "consistent", "with", "the", "interpretation", "that", "glucocorticoid", "-mediated", "autoregulation", "of", "gr", "expression", "is", "a", "tissue-specific", "primary", "transcriptional", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Sp", "family", "members", "preferentially", "interact", "with", "the", "promoter", "proximal", "repeat", "within", "the", "HTLV-I", "enhancer", "." ]

[ "sp", "family", "members", "preferentially", "interact", "with", "the", "promoter", "proximal", "repeat", "within", "the", "htlv-i", "enhancer", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Human", "T", "cell", "lymphotropic", "virus", "type", "I", "(", "HTLV-I", ")", "encodes", "the", "transactivator", "protein", ",", "Tax", ",", "which", "facilitates", "viral", "transcription", "from", "three", "21", "bp", "repeated", "elements", "within", "the", "U3", "region", "of", "the", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", "." ]

[ "human", "t", "cell", "lymphotropic", "virus", "type", "i", "(", "htlv-i", ")", "encodes", "the", "transactivator", "protein", ",", "tax", ",", "which", "facilitates", "viral", "transcription", "from", "three", "21", "bp", "repeated", "elements", "within", "the", "u3", "region", "of", "the", "long", "terminal", "repeat", "(", "ltr", ")", "." ]

[ "B-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Examination", "of", "the", "basal", "factors", "interacting", "with", "the", "21", "bp", "repeat", "elements", "through", "electrophoretic", "mobility", "shift", "(", "EMS", ")", "analyses", "has", "demonstrated", "the", "formation", "of", "DNA-protein", "complexes", "common", "to", "each", "of", "the", "21", "bp", "repeats", "(", "C1-C3", ")", "as", "well", "as", "three", "DNA-protein", "complexes", "specific", "to", "the", "promoter", "proximal", "(", "pp", ")", "repeat", "(", "U1", "(", "U1A/U1B", ")", "and", "U2", ";", "1-4", ")", "." ]

[ "examination", "of", "the", "basal", "factors", "interacting", "with", "the", "21", "bp", "repeat", "elements", "through", "electrophoretic", "mobility", "shift", "(", "ems", ")", "analyses", "has", "demonstrated", "the", "formation", "of", "dna-protein", "complexes", "common", "to", "each", "of", "the", "21", "bp", "repeats", "(", "c1-c3", ")", "as", "well", "as", "three", "dna-protein", "complexes", "specific", "to", "the", "promoter", "proximal", "(", "pp", ")", "repeat", "(", "u1", "(", "u1a/u1b", ")", "and", "u2", ";", "1-4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "studies", "have", "indicated", "that", "the", "individual", "repeats", "are", "not", "identical", "with", "respect", "to", "the", "cellular", "factors", "with", "which", "they", "interact", "." ]

[ "these", "studies", "have", "indicated", "that", "the", "individual", "repeats", "are", "not", "identical", "with", "respect", "to", "the", "cellular", "factors", "with", "which", "they", "interact", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "EMS", "analyses", "utilizing", "a", "series", "of", "mutated", "pp", "repeat", "elements", "demonstrate", "that", "the", "nucleotide", "sequence", "requirements", "for", "U1", "(", "U1A/U1B", ")", "and", "U2", "formation", "are", "separable", "from", "those", "required", "for", "C1-C3", "formation", "." ]

[ "ems", "analyses", "utilizing", "a", "series", "of", "mutated", "pp", "repeat", "elements", "demonstrate", "that", "the", "nucleotide", "sequence", "requirements", "for", "u1", "(", "u1a/u1b", ")", "and", "u2", "formation", "are", "separable", "from", "those", "required", "for", "c1-c3", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Competition", "EMS", "analyses", "utilizing", "Sp1", "and", "CREB", "binding", "site", "oligonucleotides", "demonstrate", "that", "Sp", "family", "members", "are", "critical", "components", "of", "U1", "(", "U1A/U1B", ")", "and", "U2", "and", "that", "ATF/CREB", "family", "members", "are", "critical", "components", "of", "C1-C3", "." ]

[ "competition", "ems", "analyses", "utilizing", "sp1", "and", "creb", "binding", "site", "oligonucleotides", "demonstrate", "that", "sp", "family", "members", "are", "critical", "components", "of", "u1", "(", "u1a/u1b", ")", "and", "u2", "and", "that", "atf/creb", "family", "members", "are", "critical", "components", "of", "c1-c3", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "EMS", "supershift", "analyses", "have", "demonstrated", "that", "Sp1", "is", "involved", "in", "U1A", "formation", "while", "Sp3", "is", "involved", "in", "U1B", "and", "U2", "formation", "." ]

[ "ems", "supershift", "analyses", "have", "demonstrated", "that", "sp1", "is", "involved", "in", "u1a", "formation", "while", "sp3", "is", "involved", "in", "u1b", "and", "u2", "formation", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "EMS", "analyses", "performed", "with", "nuclear", "extracts", "from", "Tax", "-expressing", "Jurkat", "cells", "and", "HTLV-I", "-transformed", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "demonstrate", "that", "Tax", "prevents", "the", "formation", "of", "U1", "(", "U1A/U1B", ")", "and", "U2", "DNA-protein", "complexes", "." ]

[ "ems", "analyses", "performed", "with", "nuclear", "extracts", "from", "tax", "-expressing", "jurkat", "cells", "and", "htlv-i", "-transformed", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "demonstrate", "that", "tax", "prevents", "the", "formation", "of", "u1", "(", "u1a/u1b", ")", "and", "u2", "dna-protein", "complexes", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "Therefore", ",", "Tax", "appears", "to", "inhibit", "the", "interaction", "of", "Sp", "family", "members", "with", "the", "pp", "repeat", "." ]

[ "therefore", ",", "tax", "appears", "to", "inhibit", "the", "interaction", "of", "sp", "family", "members", "with", "the", "pp", "repeat", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Based", "on", "these", "observations", ",", "it", "is", "possible", "that", "the", "interaction", "of", "Sp", "and", "ATF/CREB", "family", "members", "with", "the", "pp", "repeat", "during", "basal", "and", "Tax", "-mediated", "transcription", "may", "play", "a", "critical", "role", "in", "viral", "gene", "expression", "during", "the", "initial", "stages", "of", "virus", "infection", "or", "during", "activation", "of", "a", "latent", "infection", "." ]

[ "based", "on", "these", "observations", ",", "it", "is", "possible", "that", "the", "interaction", "of", "sp", "and", "atf/creb", "family", "members", "with", "the", "pp", "repeat", "during", "basal", "and", "tax", "-mediated", "transcription", "may", "play", "a", "critical", "role", "in", "viral", "gene", "expression", "during", "the", "initial", "stages", "of", "virus", "infection", "or", "during", "activation", "of", "a", "latent", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "subunit", "p65", "mRNA", "accumulation", "in", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "human", "monocytic", "cells", "treated", "with", "sodium", "salicylate", "." ]

[ "inhibition", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "b", "subunit", "p65", "mrna", "accumulation", "in", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "human", "monocytic", "cells", "treated", "with", "sodium", "salicylate", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O" ]

[ "Lipopolysaccharide", "is", "one", "of", "the", "most", "potent", "trigger", "substances", "for", "monocytes", "and", "macrophages", "causing", "secretion", "of", "inflammatory", "mediators", "such", "as", "tumor", "necrosis", "factor", "and", "interleukin-1", "." ]

[ "lipopolysaccharide", "is", "one", "of", "the", "most", "potent", "trigger", "substances", "for", "monocytes", "and", "macrophages", "causing", "secretion", "of", "inflammatory", "mediators", "such", "as", "tumor", "necrosis", "factor", "and", "interleukin-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "nature", "of", "the", "nuclear", "factors", "involved", "in", "regulation", "of", "these", "cytokine", "genes", "is", "still", "unknown", "." ]

[ "the", "nature", "of", "the", "nuclear", "factors", "involved", "in", "regulation", "of", "these", "cytokine", "genes", "is", "still", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF-kappa", "B", ";", "heterodimer", "of", "p50", "and", "p65", ")", "proteins", "have", "been", "suggested", "to", "play", "an", "important", "role", "in", "gene", "transcription", "of", "inflammatory", "mediators", "when", "monocytes", "are", "stimulated", "with", "lipopolysaccharide", "." ]

[ "nuclear", "factor", "kappa", "b", "(", "nf-kappa", "b", ";", "heterodimer", "of", "p50", "and", "p65", ")", "proteins", "have", "been", "suggested", "to", "play", "an", "important", "role", "in", "gene", "transcription", "of", "inflammatory", "mediators", "when", "monocytes", "are", "stimulated", "with", "lipopolysaccharide", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "Nonsteroidal", "anti-inflammatory", "drugs", "such", "as", "salicylates", "have", "been", "used", "to", "treat", "symptoms", "of", "inflammation", ",", "and", "a", "new", "mechanism", "of", "drug", "action", "was", "suggested", "recently", "." ]

[ "nonsteroidal", "anti-inflammatory", "drugs", "such", "as", "salicylates", "have", "been", "used", "to", "treat", "symptoms", "of", "inflammation", ",", "and", "a", "new", "mechanism", "of", "drug", "action", "was", "suggested", "recently", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Salicylates", "have", "been", "shown", "to", "inhibit", "lipopolysaccharide", "-induced", "gene", "transcription", "via", "inhibition", "of", "NF-kappa", "B", "activation", "by", "preventing", "the", "degradation", "of", "NF-kappa", "B", "inhibitor", "\"", "I", "kappa", "B", "\"", ",", "blocking", "the", "translocation", "of", "NF-kappa", "B", "into", "the", "nuclear", "compartment", "." ]

[ "salicylates", "have", "been", "shown", "to", "inhibit", "lipopolysaccharide", "-induced", "gene", "transcription", "via", "inhibition", "of", "nf-kappa", "b", "activation", "by", "preventing", "the", "degradation", "of", "nf-kappa", "b", "inhibitor", "\"", "i", "kappa", "b", "\"", ",", "blocking", "the", "translocation", "of", "nf-kappa", "b", "into", "the", "nuclear", "compartment", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "However", ",", "the", "nature", "of", "the", "subunit", "involved", "in", "this", "mechanism", "has", "not", "been", "defined", "." ]

[ "however", ",", "the", "nature", "of", "the", "subunit", "involved", "in", "this", "mechanism", "has", "not", "been", "defined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "examine", "the", "mechanisms", "by", "which", "salicylates", "affect", "cytokine", "gene", "transcription", ",", "the", "amount", "of", "active", "and", "inactive", "NF-kappa", "B", "and", "NF-kappa", "B", "mRNA", ",", "in", "Porphyromonas", "gingivalis", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "human", "monocytic", "cells", "was", "assessed", "." ]

[ "to", "examine", "the", "mechanisms", "by", "which", "salicylates", "affect", "cytokine", "gene", "transcription", ",", "the", "amount", "of", "active", "and", "inactive", "nf-kappa", "b", "and", "nf-kappa", "b", "mrna", ",", "in", "porphyromonas", "gingivalis", "lipopolysaccharide", "-stimulated", "human", "monocytic", "cells", "was", "assessed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-protein_family_or_group", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "High", "doses", "of", "sodium", "salicylate", "suppressed", "NF-kappa", "B", "p65", "mRNA", "accumulation", ",", "resulting", "in", "suppression", "of", "total", "NF-kappa", "B", ",", "p50", "on", "tissue", "oligonucleotide", "had", "no", "effects", "on", "lipopolysaccharide", "-induced", "NF-kappa", "B", "activation", "." ]

[ "high", "doses", "of", "sodium", "salicylate", "suppressed", "nf-kappa", "b", "p65", "mrna", "accumulation", ",", "resulting", "in", "suppression", "of", "total", "nf-kappa", "b", ",", "p50", "on", "tissue", "oligonucleotide", "had", "no", "effects", "on", "lipopolysaccharide", "-induced", "nf-kappa", "b", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O" ]

[ "The", "data", "demonstrate", "that", "the", "p65", "subunit", "of", "NF-kappa", "B", "is", "inhibited", "by", "salicylate", "treatment", "and", "highlight", "the", "role", "of", "salicylate", "in", "the", "control", "of", "gene", "expression", "of", "inflammatory", "mediators", "." ]

[ "the", "data", "demonstrate", "that", "the", "p65", "subunit", "of", "nf-kappa", "b", "is", "inhibited", "by", "salicylate", "treatment", "and", "highlight", "the", "role", "of", "salicylate", "in", "the", "control", "of", "gene", "expression", "of", "inflammatory", "mediators", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Susceptibility", "to", "natural", "killer", "cells", "and", "down", "regulation", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "in", "adenovirus", "12", "transformed", "cells", "are", "regulated", "by", "different", "E1A", "domains", "." ]

[ "susceptibility", "to", "natural", "killer", "cells", "and", "down", "regulation", "of", "mhc", "class", "i", "expression", "in", "adenovirus", "12", "transformed", "cells", "are", "regulated", "by", "different", "e1a", "domains", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "All", "human", "adenoviruses", "transform", "rodent", "cells", "in", "vitro", ",", "but", "only", "cells", "transformed", "by", "serotypes", "belonging", "to", "subgroups", "A", "(", "Ad12", ")", "and", "B", "(", "Ad3", ")", "are", "tumorigenic", "for", "immunocompetent", "animals", "." ]

[ "all", "human", "adenoviruses", "transform", "rodent", "cells", "in", "vitro", ",", "but", "only", "cells", "transformed", "by", "serotypes", "belonging", "to", "subgroups", "a", "(", "ad12", ")", "and", "b", "(", "ad3", ")", "are", "tumorigenic", "for", "immunocompetent", "animals", "." ]

[ "O", "O", "B-virus", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "In", "these", "cells", ",", "the", "expression", "of", "MHC-class", "I", "antigens", "is", "repressed", "and", "might", "allow", "them", "to", "escape", "from", "recognition", "by", "cytotoxic", "T", "lymphocytes", "(", "CTL", ")", "and", "to", "develop", "in", "tumor", "." ]

[ "in", "these", "cells", ",", "the", "expression", "of", "mhc-class", "i", "antigens", "is", "repressed", "and", "might", "allow", "them", "to", "escape", "from", "recognition", "by", "cytotoxic", "t", "lymphocytes", "(", "ctl", ")", "and", "to", "develop", "in", "tumor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "these", "cell", "lines", "appear", "resistant", "to", "lysis", "by", "natural", "killer", "(", "NK", ")", "cells", "." ]

[ "furthermore", ",", "these", "cell", "lines", "appear", "resistant", "to", "lysis", "by", "natural", "killer", "(", "nk", ")", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "To", "determine", "the", "E1A", "domain", "(", "s", ")", "responsible", "for", "these", "properties", "several", "cell", "lines", "were", "created", "by", "transforming", "baby", "rat", "kidney", "(", "BRK", ")", "cells", "with", "a", "set", "of", "plasmids", "expressing", "different", "Ad2/Ad12", "hybrid", "E1A", "gene", "products", "." ]

[ "to", "determine", "the", "e1a", "domain", "(", "s", ")", "responsible", "for", "these", "properties", "several", "cell", "lines", "were", "created", "by", "transforming", "baby", "rat", "kidney", "(", "brk", ")", "cells", "with", "a", "set", "of", "plasmids", "expressing", "different", "ad2/ad12", "hybrid", "e1a", "gene", "products", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "The", "MHC", "class", "1", "gene", "expression", "was", "inhibited", "in", "cells", "expressing", "the", "Ad12", "13S", "mRNA", "product", "and", "in", "cells", "transformed", "with", "Ad2/Ad12", "hybrid", "E1A", "gene", "product", "harboring", "the", "C-terminal", "part", "of", "the", "conserved", "region", "(", "CR", ")", "3", "of", "Ad12", "." ]

[ "the", "mhc", "class", "1", "gene", "expression", "was", "inhibited", "in", "cells", "expressing", "the", "ad12", "13s", "mrna", "product", "and", "in", "cells", "transformed", "with", "ad2/ad12", "hybrid", "e1a", "gene", "product", "harboring", "the", "c-terminal", "part", "of", "the", "conserved", "region", "(", "cr", ")", "3", "of", "ad12", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-virus", "O" ]

[ "Susceptibility", "of", "these", "transformed", "cell", "lines", "to", "NK", "cells", "was", "determined", "by", "cytolytic", "assays", "." ]

[ "susceptibility", "of", "these", "transformed", "cell", "lines", "to", "nk", "cells", "was", "determined", "by", "cytolytic", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "obtained", "suggest", "that", "two", "Ad12", "E1A", "domains", "are", "required", "to", "induce", "resistance", "of", "the", "cell", "lines", "to", "NK", "cells", "." ]

[ "the", "results", "obtained", "suggest", "that", "two", "ad12", "e1a", "domains", "are", "required", "to", "induce", "resistance", "of", "the", "cell", "lines", "to", "nk", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Translocation", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", ":", "a", "new", "variant", "translocation", "in", "a", "patient", "with", "non-Hodgkin's", "lymphoma", "of", "B-cell", "type", "with", "BCL6", "rearrangement", "." ]

[ "translocation", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", ":", "a", "new", "variant", "translocation", "in", "a", "patient", "with", "non-hodgkin's", "lymphoma", "of", "b-cell", "type", "with", "bcl6", "rearrangement", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "We", "report", "a", "65-year-old", "woman", "with", "non-Hodgkin's", "lymphoma", "(", "NHL", ")", "carrying", "a", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", "and", "BCL6", "rearrangement", "in", "the", "affected", "cells", "." ]

[ "we", "report", "a", "65-year-old", "woman", "with", "non-hodgkin's", "lymphoma", "(", "nhl", ")", "carrying", "a", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", "and", "bcl6", "rearrangement", "in", "the", "affected", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "She", "had", "generalized", "lymphadenopathy", "and", "the", "bone", "marrow", "was", "infiltrated", "by", "lymphoma", "cells", "at", "presentation", "." ]

[ "she", "had", "generalized", "lymphadenopathy", "and", "the", "bone", "marrow", "was", "infiltrated", "by", "lymphoma", "cells", "at", "presentation", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O" ]

[ "Histological", "diagnosis", "was", "\"", "malignant", "lymphoma", ",", "diffuse", ",", "large", "cell\"", "type", "according", "to", "an", "International", "Working", "Formulation", "." ]

[ "histological", "diagnosis", "was", "\"", "malignant", "lymphoma", ",", "diffuse", ",", "large", "cell\"", "type", "according", "to", "an", "international", "working", "formulation", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Chromosome", "analysis", "revealed", "a", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", ",", "which", "is", "a", "new", "variant", "translocation", "of", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q32", ")", "." ]

[ "chromosome", "analysis", "revealed", "a", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q11", ")", ",", "which", "is", "a", "new", "variant", "translocation", "of", "t", "(", "3", ";", "14", ")", "(", "q27", ";", "q32", ")", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Southern", "blot", "analysis", "showed", "rearrangement", "of", "BCL6", ",", "JH", ",", "and", "TCR", "beta", "but", "not", "of", "TCR", "delta", "." ]

[ "southern", "blot", "analysis", "showed", "rearrangement", "of", "bcl6", ",", "jh", ",", "and", "tcr", "beta", "but", "not", "of", "tcr", "delta", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Cosmid", "probe", "of", "BCL6", "hybridized", "to", "14q11", "and", "3q27", "by", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "." ]

[ "cosmid", "probe", "of", "bcl6", "hybridized", "to", "14q11", "and", "3q27", "by", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "fish", ")", "." ]

[ "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O" ]

[ "Although", "the", "band", "14q11", "is", "a", "locus", "of", "T-cell", "receptor", "alpha-", "and", "delta-", "chains", "(", "TCR", "alpha/delta", ")", ",", "lymphoma", "cells", "expressed", "B-cell", ",", "IgGk", "phenotype", "." ]

[ "although", "the", "band", "14q11", "is", "a", "locus", "of", "t-cell", "receptor", "alpha-", "and", "delta-", "chains", "(", "tcr", "alpha/delta", ")", ",", "lymphoma", "cells", "expressed", "b-cell", ",", "iggk", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "findings", "suggest", "that", "a", "novel", "proto-oncogene", "in", "the", "vicinity", "of", "TCR", "alpha/delta", "is", "involved", "in", "this", "translocation", "." ]

[ "the", "findings", "suggest", "that", "a", "novel", "proto-oncogene", "in", "the", "vicinity", "of", "tcr", "alpha/delta", "is", "involved", "in", "this", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "The", "oestrogen", "receptor", "codon", "10", "polymorphism", "detected", "in", "breast", "cancer", "is", "also", "present", "in", "non-malignant", "cells", "." ]

[ "the", "oestrogen", "receptor", "codon", "10", "polymorphism", "detected", "in", "breast", "cancer", "is", "also", "present", "in", "non-malignant", "cells", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "effect", "of", "oestrogens", "on", "oestrogen", "-receptive", "organs", "and", "cells", "is", "mediated", "via", "intracellular", "receptors", "(", "ERalpha", "and", "ERbeta", ")", "." ]

[ "the", "effect", "of", "oestrogens", "on", "oestrogen", "-receptive", "organs", "and", "cells", "is", "mediated", "via", "intracellular", "receptors", "(", "eralpha", "and", "erbeta", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Oestrogen", "receptor", "gene", "polymorphisms", "in", "the", "region", "encoding", "the", "N-terminal", "portion", "of", "the", "protein", "are", "reportedly", "associated", "with", "pathological", "conditions", "including", "breast", "cancer", ",", "hypertension", ",", "spontaneous", "abortion", "and", "coronary", "heart", "disease", "." ]

[ "oestrogen", "receptor", "gene", "polymorphisms", "in", "the", "region", "encoding", "the", "n-terminal", "portion", "of", "the", "protein", "are", "reportedly", "associated", "with", "pathological", "conditions", "including", "breast", "cancer", ",", "hypertension", ",", "spontaneous", "abortion", "and", "coronary", "heart", "disease", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "A", "silent", "mutation", "in", "codon", "10", "of", "exon", "1", ",", "detected", "in", "ER-negative", "and", "ER-positive", "human", "breast", "cancer", "cell", "lines", ",", "in", "breast", "tumors", "and", "blood", "DNA", "from", "breast", "cancer", "patients", ",", "has", "been", "recognized", "as", "a", "polymorphic", "site", "." ]

[ "a", "silent", "mutation", "in", "codon", "10", "of", "exon", "1", ",", "detected", "in", "er-negative", "and", "er-positive", "human", "breast", "cancer", "cell", "lines", ",", "in", "breast", "tumors", "and", "blood", "dna", "from", "breast", "cancer", "patients", ",", "has", "been", "recognized", "as", "a", "polymorphic", "site", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "In", "this", "study", "we", "examined", ",", "by", "denaturing", "gradient-gel", "electrophoresis", "and", "DNA", "sequence", "analysis", ",", "the", "possible", "presence", "of", "a", "codon", "10", "polymorphic", "site", "in", "normal", "oestrogen", "target", "organs", "and", "cells", "such", "as", "the", "uterus", "(", "myometrium", "and", "endometrium", ")", ",", "in", "the", "placenta", "and", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "in", "a", "benign", "uterus", "tumour", "(", "leiomyoma", ")", "." ]

[ "in", "this", "study", "we", "examined", ",", "by", "denaturing", "gradient-gel", "electrophoresis", "and", "dna", "sequence", "analysis", ",", "the", "possible", "presence", "of", "a", "codon", "10", "polymorphic", "site", "in", "normal", "oestrogen", "target", "organs", "and", "cells", "such", "as", "the", "uterus", "(", "myometrium", "and", "endometrium", ")", ",", "in", "the", "placenta", "and", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "in", "a", "benign", "uterus", "tumour", "(", "leiomyoma", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-tissue", "O", "B-tissue", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "B-tissue", "O", "O" ]

[ "We", "have", "detected", "ER", "codon", "10", "polymorphism", "in", "these", "samples", "and", "have", "compared", "them", "to", "those", "observed", "in", "breast", "cancer", "samples", "." ]

[ "we", "have", "detected", "er", "codon", "10", "polymorphism", "in", "these", "samples", "and", "have", "compared", "them", "to", "those", "observed", "in", "breast", "cancer", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O" ]

[ "All", "tissues", "and", "cells", "studied", "were", "homozygous", "for", "the", "wild-type", "gene", ",", "and", "were", "heterozygous", "as", "well", "as", "homozygous", "for", "the", "codon-10-variant", "type", "." ]

[ "all", "tissues", "and", "cells", "studied", "were", "homozygous", "for", "the", "wild-type", "gene", ",", "and", "were", "heterozygous", "as", "well", "as", "homozygous", "for", "the", "codon-10-variant", "type", "." ]

[ "O", "B-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "the", "presence", "of", "the", "codon-10-variant", "type", "is", "not", "a", "characteristic", "of", "breast", "cancer", "." ]

[ "these", "results", "indicate", "that", "the", "presence", "of", "the", "codon-10-variant", "type", "is", "not", "a", "characteristic", "of", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Out", "current", "findings", "suggest", "that", "further", "investigations", "are", "warranted", "to", "elucidate", "the", "possible", "linkage", "of", "ER", "codon", "10", "polymorphism", "to", "physiological", "and", "pathological", "conditions", "." ]

[ "out", "current", "findings", "suggest", "that", "further", "investigations", "are", "warranted", "to", "elucidate", "the", "possible", "linkage", "of", "er", "codon", "10", "polymorphism", "to", "physiological", "and", "pathological", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Protein", "kinase", "C-zeta", "mediates", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "human", "immunodeficiency", "virus", "-infected", "monocytes", "." ]

[ "protein", "kinase", "c-zeta", "mediates", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "human", "immunodeficiency", "virus", "-infected", "monocytes", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecular", "mechanisms", "regulating", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "persistence", "in", "a", "major", "cell", "reservoir", "such", "as", "the", "macrophage", "remain", "unknown", "." ]

[ "the", "molecular", "mechanisms", "regulating", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "hiv", ")", "persistence", "in", "a", "major", "cell", "reservoir", "such", "as", "the", "macrophage", "remain", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O" ]

[ "NF-kappa", "B", "is", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "the", "HIV", "long", "terminal", "repeat", "and", "is", "selectively", "activated", "following", "HIV", "infection", "of", "human", "macrophages", "." ]

[ "nf-kappa", "b", "is", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "the", "hiv", "long", "terminal", "repeat", "and", "is", "selectively", "activated", "following", "hiv", "infection", "of", "human", "macrophages", "." ]

[ "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Although", "little", "information", "as", "to", "what", "signal", "transduction", "pathways", "mediate", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "monocytes-macrophages", "is", "available", ",", "our", "previous", "work", "indicated", "that", "classical", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "isoenzymes", "were", "not", "involved", "in", "the", "HIV", "-mediated", "NF-kappa", "B", "activation", "." ]

[ "although", "little", "information", "as", "to", "what", "signal", "transduction", "pathways", "mediate", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "monocytes-macrophages", "is", "available", ",", "our", "previous", "work", "indicated", "that", "classical", "protein", "kinase", "c", "(", "pkc", ")", "isoenzymes", "were", "not", "involved", "in", "the", "hiv", "-mediated", "nf-kappa", "b", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "have", "focused", "on", "atypical", "PKC", "isoenzymes", "." ]

[ "in", "this", "study", ",", "we", "have", "focused", "on", "atypical", "pkc", "isoenzymes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "PKC-zeta", "belongs", "to", "this", "family", "and", "is", "known", "to", "be", "an", "important", "step", "in", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "other", "cell", "systems", "." ]

[ "pkc-zeta", "belongs", "to", "this", "family", "and", "is", "known", "to", "be", "an", "important", "step", "in", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "other", "cell", "systems", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunoblotting", "experiments", "with", "U937", "cells", "demonstrate", "that", "PKC-zeta", "is", "present", "in", "these", "cells", ",", "and", "its", "expression", "can", "be", "downmodulated", "by", "antisense", "oligonucleotides", "(", "AO", ")", "." ]

[ "immunoblotting", "experiments", "with", "u937", "cells", "demonstrate", "that", "pkc-zeta", "is", "present", "in", "these", "cells", ",", "and", "its", "expression", "can", "be", "downmodulated", "by", "antisense", "oligonucleotides", "(", "ao", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "B-polynucleotide", "O", "O" ]

[ "The", "HIV", "-mediated", "NF-kappa", "B", "activation", "is", "selectively", "reduced", "by", "AO", "to", "PKC-zeta", "." ]

[ "the", "hiv", "-mediated", "nf-kappa", "b", "activation", "is", "selectively", "reduced", "by", "ao", "to", "pkc-zeta", "." ]

[ "O", "B-virus", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "cotransfection", "of", "a", "negative", "dominant", "molecule", "of", "PKC-zeta", "(", "PKC-zeta", "mut", ")", "with", "NF-kappa", "B", "-dependent", "reporter", "genes", "selectively", "inhibits", "the", "HIV", "-but", "not", "phorbol", "myristate", "acetate-", "or", "lipopolysaccharide-", "mediated", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "." ]

[ "in", "addition", ",", "cotransfection", "of", "a", "negative", "dominant", "molecule", "of", "pkc-zeta", "(", "pkc-zeta", "mut", ")", "with", "nf-kappa", "b", "-dependent", "reporter", "genes", "selectively", "inhibits", "the", "hiv", "-but", "not", "phorbol", "myristate", "acetate-", "or", "lipopolysaccharide-", "mediated", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "That", "PKC-zeta", "is", "specific", "in", "regulating", "NF-kappa", "B", "is", "concluded", "from", "the", "inability", "of", "PKC-zeta", "(", "mut", ")", "to", "interfere", "with", "the", "basal", "or", "phorbol", "myristate", "acetate", "-inducible", "CREB", "-or", "AP1", "-dependent", "transcriptional", "activity", "." ]

[ "that", "pkc-zeta", "is", "specific", "in", "regulating", "nf-kappa", "b", "is", "concluded", "from", "the", "inability", "of", "pkc-zeta", "(", "mut", ")", "to", "interfere", "with", "the", "basal", "or", "phorbol", "myristate", "acetate", "-inducible", "creb", "-or", "ap1", "-dependent", "transcriptional", "activity", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Lastly", ",", "we", "demonstrate", "a", "selective", "inhibition", "of", "p24", "production", "by", "HIV", "-infected", "human", "macrophages", "when", "treated", "with", "AO", "to", "PKC-zeta", "." ]

[ "lastly", ",", "we", "demonstrate", "a", "selective", "inhibition", "of", "p24", "production", "by", "hiv", "-infected", "human", "macrophages", "when", "treated", "with", "ao", "to", "pkc-zeta", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-virus", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Altogether", ",", "these", "results", "suggest", "that", "atypical", "PKC", "isoenzymes", ",", "including", "PKC-zeta", ",", "participate", "in", "the", "signal", "transduction", "pathways", "by", "which", "HIV", "infection", "results", "in", "the", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "in", "human", "monocytic", "cells", "and", "macrophages", "." ]

[ "altogether", ",", "these", "results", "suggest", "that", "atypical", "pkc", "isoenzymes", ",", "including", "pkc-zeta", ",", "participate", "in", "the", "signal", "transduction", "pathways", "by", "which", "hiv", "infection", "results", "in", "the", "activation", "of", "nf-kappa", "b", "in", "human", "monocytic", "cells", "and", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Interferons", "up-regulate", "STAT1", ",", "STAT2", ",", "and", "IRF", "family", "transcription", "factor", "gene", "expression", "in", "human", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "macrophages", "." ]

[ "interferons", "up-regulate", "stat1", ",", "stat2", ",", "and", "irf", "family", "transcription", "factor", "gene", "expression", "in", "human", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "macrophages", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "IFN", "signaling", "is", "mediated", "by", "binding", "of", "IFNs", "to", "their", "receptors", "and", "subsequent", "activation", "of", "Janus", "tyrosine", "kinase", "(", "JAK", ")", "-", "STAT", "signaling", "pathway", "." ]

[ "ifn", "signaling", "is", "mediated", "by", "binding", "of", "ifns", "to", "their", "receptors", "and", "subsequent", "activation", "of", "janus", "tyrosine", "kinase", "(", "jak", ")", "-", "stat", "signaling", "pathway", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O" ]

[ "Stimulation", "of", "cells", "with", "IFN-alpha", "leads", "to", "the", "assembly", "of", "IFN-stimulated", "gene", "factor", "3", "transcription", "factor", "complex", "formed", "by", "STAT1", ",", "STAT2", ",", "and", "p48", "protein", "." ]

[ "stimulation", "of", "cells", "with", "ifn-alpha", "leads", "to", "the", "assembly", "of", "ifn-stimulated", "gene", "factor", "3", "transcription", "factor", "complex", "formed", "by", "stat1", ",", "stat2", ",", "and", "p48", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "IFN-gamma", "signaling", "is", "mediated", "by", "homodimeric", "STAT1", "protein", "." ]

[ "ifn-gamma", "signaling", "is", "mediated", "by", "homodimeric", "stat1", "protein", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Although", "these", "signaling", "molecules", "are", "expressed", "constitutively", ",", "there", "is", "also", "evidence", "of", "transcriptional", "regulation", "by", "IFNs", "." ]

[ "although", "these", "signaling", "molecules", "are", "expressed", "constitutively", ",", "there", "is", "also", "evidence", "of", "transcriptional", "regulation", "by", "ifns", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "We", "have", "characterized", "the", "expression", "of", "STAT", "and", "IFN", "regulatory", "factor", "(", "IRF", ")", "family", "transcription", "factors", "in", "primary", "human", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "macrophages", "in", "response", "to", "IFN-alpha", "and", "IFN-gamma", "stimulation", "." ]

[ "we", "have", "characterized", "the", "expression", "of", "stat", "and", "ifn", "regulatory", "factor", "(", "irf", ")", "family", "transcription", "factors", "in", "primary", "human", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "macrophages", "in", "response", "to", "ifn-alpha", "and", "ifn-gamma", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "IFN-alpha", "and", "IFN-gamma", "rapidly", "and", "efficiently", "enhanced", "STAT1", ",", "STAT2", ",", "p48", ",", "and", "IRF-1", "gene", "expression", "." ]

[ "we", "show", "that", "ifn-alpha", "and", "ifn-gamma", "rapidly", "and", "efficiently", "enhanced", "stat1", ",", "stat2", ",", "p48", ",", "and", "irf-1", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "IFN-gamma", "induced", "IRF-1", "gene", "expression", "more", "strongly", "than", "IFN-alpha", "." ]

[ "ifn-gamma", "induced", "irf-1", "gene", "expression", "more", "strongly", "than", "ifn-alpha", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Stimulation", "experiments", "in", "the", "presence", "of", "protein", "synthesis", "inhibitor", ",", "cycloheximide", ",", "suggested", "that", "these", "genes", "were", "activated", "directly", "by", "IFNs", "." ]

[ "stimulation", "experiments", "in", "the", "presence", "of", "protein", "synthesis", "inhibitor", ",", "cycloheximide", ",", "suggested", "that", "these", "genes", "were", "activated", "directly", "by", "ifns", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "IRF-2", "gene", "was", "apparently", "only", "weakly", "responsive", "to", "IFNs", "in", "these", "cells", "." ]

[ "irf-2", "gene", "was", "apparently", "only", "weakly", "responsive", "to", "ifns", "in", "these", "cells", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "macrophages", "were", "pretreated", "with", "low", "doses", "of", "IFN-gamma", "and", "then", "stimulated", "with", "IFN-alpha", ",", "clearly", "enhanced", "formation", "of", "specific", "transcription", "factor", "complexes", "was", "detected", "." ]

[ "when", "macrophages", "were", "pretreated", "with", "low", "doses", "of", "ifn-gamma", "and", "then", "stimulated", "with", "ifn-alpha", ",", "clearly", "enhanced", "formation", "of", "specific", "transcription", "factor", "complexes", "was", "detected", "." ]

[ "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "suggests", "that", "higher", "intracellular", "levels", "of", "STAT1", ",", "STAT2", ",", "and", "p48", "protein", "may", "result", "in", "enhanced", "signal", "transduction", "for", "cytokines", "utilizing", "these", "transcription", "factors", "." ]

[ "this", "suggests", "that", "higher", "intracellular", "levels", "of", "stat1", ",", "stat2", ",", "and", "p48", "protein", "may", "result", "in", "enhanced", "signal", "transduction", "for", "cytokines", "utilizing", "these", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Tissue", "and", "cell-type", "specific", "expression", "of", "the", "tuberous", "sclerosis", "gene", ",", "TSC2", ",", "in", "human", "tissues", "." ]

[ "tissue", "and", "cell-type", "specific", "expression", "of", "the", "tuberous", "sclerosis", "gene", ",", "tsc2", ",", "in", "human", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "TSC2", "is", "a", "gene", "on", "chromosome", "16p13", ".", "3", "associated", "with", "the", "autosomal", "dominant", "neurocutaneous", "disorder", ",", "tuberous", "sclerosis", "complex", "(", "TSC", ")", "." ]

[ "tsc2", "is", "a", "gene", "on", "chromosome", "16p13", ".", "3", "associated", "with", "the", "autosomal", "dominant", "neurocutaneous", "disorder", ",", "tuberous", "sclerosis", "complex", "(", "tsc", ")", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O" ]

[ "By", "using", "a", "partial", "nucleotide", "sequence", "from", "the", "cloned", "TSC2", "and", "polymerase", "chain", "reaction", "methodology", ",", "we", "constructed", "a", "digoxigenin-labeled", "complementary", "DNA", "probe", "to", "examine", "TSC2", "gene", "expression", "in", "autopsy-", "or", "biopsy-derived", "human", "tissues", "by", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ "by", "using", "a", "partial", "nucleotide", "sequence", "from", "the", "cloned", "tsc2", "and", "polymerase", "chain", "reaction", "methodology", ",", "we", "constructed", "a", "digoxigenin-labeled", "complementary", "dna", "probe", "to", "examine", "tsc2", "gene", "expression", "in", "autopsy-", "or", "biopsy-derived", "human", "tissues", "by", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "I-DNA_N/A", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "TSC2", "messenger", "RNA", "was", "widely", "expressed", "in", "various", "cell", "types", "throughout", "the", "body", ",", "including", "epithelia", ",", "lymphocytes", ",", "and", "cells", "with", "endocrine", "functions", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "adrenal", "cortex", "and", "anterior", "pituitary", "." ]

[ "tsc2", "messenger", "rna", "was", "widely", "expressed", "in", "various", "cell", "types", "throughout", "the", "body", ",", "including", "epithelia", ",", "lymphocytes", ",", "and", "cells", "with", "endocrine", "functions", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "adrenal", "cortex", "and", "anterior", "pituitary", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "It", "was", "prominently", "and", "selectively", "(", "within", "the", "central", "nervous", "system", ")", "expressed", "in", "pyramidal", "cells", "of", "the", "cerebral", "cortex", "and", "other", "motor", "neurons", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "in", "spinal", "cord", "and", "brainstem", "nuclei", "." ]

[ "it", "was", "prominently", "and", "selectively", "(", "within", "the", "central", "nervous", "system", ")", "expressed", "in", "pyramidal", "cells", "of", "the", "cerebral", "cortex", "and", "other", "motor", "neurons", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "in", "spinal", "cord", "and", "brainstem", "nuclei", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "Visceral", "TSC2", "expression", "was", "comparable", "in", "autopsy", "tissues", "from", "patients", "with", "and", "without", "TSC", ";", "TSC2", "messenger", "RNA", "expression", "was", "most", "prominent", "in", "cells", "with", "a", "rapid", "mitotic", "rate", "and", "turnover", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "epithelia", "and", "lymphocytes", ",", "with", "central", "nervous", "system", "pyramidal", "cells", "and", "other", "neurons", "being", "an", "obvious", "exception", ",", "and/or", "in", "cells", "with", "important", "secretory/transport", "functions", "." ]

[ "visceral", "tsc2", "expression", "was", "comparable", "in", "autopsy", "tissues", "from", "patients", "with", "and", "without", "tsc", ";", "tsc2", "messenger", "rna", "expression", "was", "most", "prominent", "in", "cells", "with", "a", "rapid", "mitotic", "rate", "and", "turnover", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "epithelia", "and", "lymphocytes", ",", "with", "central", "nervous", "system", "pyramidal", "cells", "and", "other", "neurons", "being", "an", "obvious", "exception", ",", "and/or", "in", "cells", "with", "important", "secretory/transport", "functions", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "widespread", "expression", "of", "the", "TSC2", "gene", "supports", "the", "view", "that", "it", "encodes", "a", "protein", "vital", "to", "cell", "growth", "and", "metabolism", "or", "one", "that", "functions", "as", "a", "tumor/growth", "suppressor", "." ]

[ "this", "widespread", "expression", "of", "the", "tsc2", "gene", "supports", "the", "view", "that", "it", "encodes", "a", "protein", "vital", "to", "cell", "growth", "and", "metabolism", "or", "one", "that", "functions", "as", "a", "tumor/growth", "suppressor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Steel", "factor", "affects", "SCL", "expression", "during", "normal", "erythroid", "differentiation", "." ]

[ "steel", "factor", "affects", "scl", "expression", "during", "normal", "erythroid", "differentiation", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Steel", "factor", "is", "one", "of", "the", "growth", "factors", "that", "controls", "the", "proliferation", "and", "differentiation", "of", "hematopoietic", "cells", "and", "SCL", ",", "also", "known", "as", "Tcl-5", "or", "Tal-1", ",", "is", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "erythropoiesis", "." ]

[ "steel", "factor", "is", "one", "of", "the", "growth", "factors", "that", "controls", "the", "proliferation", "and", "differentiation", "of", "hematopoietic", "cells", "and", "scl", ",", "also", "known", "as", "tcl-5", "or", "tal-1", ",", "is", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "erythropoiesis", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "we", "studied", "the", "role", "of", "SCL", "in", "the", "proliferation", "of", "human", "peripheral", "blood", "burst-forming", "unit-erythroid", "(", "BFU-E", ")", "and", "the", "effects", "of", "Steel", "factor", "on", "SCL", "expression", "in", "proliferating", "erythroid", "cells", "." ]

[ "in", "this", "report", ",", "we", "studied", "the", "role", "of", "scl", "in", "the", "proliferation", "of", "human", "peripheral", "blood", "burst-forming", "unit-erythroid", "(", "bfu-e", ")", "and", "the", "effects", "of", "steel", "factor", "on", "scl", "expression", "in", "proliferating", "erythroid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "BFU-E", "-derived", "colonies", "increase", "progressively", "in", "size", ",", "as", "determined", "by", "cell", "number", ",", "from", "day", "7", "to", "day", "14", "of", "culture", ",", "with", "the", "greatest", "increase", "in", "colony", "size", "(", "10-fold", "expansion", ")", "occurring", "between", "day", "7", "and", "day", "10", "." ]

[ "bfu-e", "-derived", "colonies", "increase", "progressively", "in", "size", ",", "as", "determined", "by", "cell", "number", ",", "from", "day", "7", "to", "day", "14", "of", "culture", ",", "with", "the", "greatest", "increase", "in", "colony", "size", "(", "10-fold", "expansion", ")", "occurring", "between", "day", "7", "and", "day", "10", "." ]

[ "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "SCL", "protein", "levels", "in", "BFU-E", "-derived", "cells", "were", "highest", "in", "day", "7", "cells", "and", "decreased", "progressively", "from", "day", "7", "to", "day", "14", "of", "culture", ",", "suggesting", "an", "association", "of", "SCL", "with", "erythroid", "proliferation", "." ]

[ "scl", "protein", "levels", "in", "bfu-e", "-derived", "cells", "were", "highest", "in", "day", "7", "cells", "and", "decreased", "progressively", "from", "day", "7", "to", "day", "14", "of", "culture", ",", "suggesting", "an", "association", "of", "scl", "with", "erythroid", "proliferation", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "SCL", "mRNA", "levels", "did", "not", "decrease", "significantly", "between", "day", "7", "and", "day", "14", "cells", ",", "suggesting", "that", "posttranscriptional", "mechanisms", "are", "largely", "responsible", "for", "the", "decrease", "in", "SCL", "protein", "observed", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "scl", "mrna", "levels", "did", "not", "decrease", "significantly", "between", "day", "7", "and", "day", "14", "cells", ",", "suggesting", "that", "posttranscriptional", "mechanisms", "are", "largely", "responsible", "for", "the", "decrease", "in", "scl", "protein", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "The", "role", "of", "SCL", "in", "Steel", "factor", "-induced", "erythroid", "proliferation", "was", "then", "examined", "." ]

[ "the", "role", "of", "scl", "in", "steel", "factor", "-induced", "erythroid", "proliferation", "was", "then", "examined", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "BFU-E", "-derived", "colonies", "cultured", "with", "Steel", "factor", ",", "colony", "size", "was", "significantly", "increased", "compared", "to", "control", "." ]

[ "in", "bfu-e", "-derived", "colonies", "cultured", "with", "steel", "factor", ",", "colony", "size", "was", "significantly", "increased", "compared", "to", "control", "." ]

[ "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]