enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "Age-related", "decreases", "in", "IL-2", "production", "by", "human", "T", "cells", "are", "associated", "with", "impaired", "activation", "of", "nuclear", "transcriptional", "factors", "AP-1", "and", "NF-AT", "." ]

[ "age-related", "decreases", "in", "il-2", "production", "by", "human", "t", "cells", "are", "associated", "with", "impaired", "activation", "of", "nuclear", "transcriptional", "factors", "ap-1", "and", "nf-at", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Although", "transcriptional", "factors", "AP-1", "and", "nuclear", "factor", "of", "activated", "T", "cells", "(", "NF-AT", ")", "are", "important", "for", "the", "normal", "induction", "of", "IL-2", ",", "it", "is", "unknown", "if", "the", "age-related", "decline", "in", "IL-2", "production", "by", "activated", "human", "T", "cells", "may", "be", "associated", "with", "aberrancies", "in", "transcriptional", "regulatory", "proteins", "." ]

[ "although", "transcriptional", "factors", "ap-1", "and", "nuclear", "factor", "of", "activated", "t", "cells", "(", "nf-at", ")", "are", "important", "for", "the", "normal", "induction", "of", "il-2", ",", "it", "is", "unknown", "if", "the", "age-related", "decline", "in", "il-2", "production", "by", "activated", "human", "t", "cells", "may", "be", "associated", "with", "aberrancies", "in", "transcriptional", "regulatory", "proteins", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "In", "the", "current", "studies", ",", "IL-2", "production", "by", "T", "cells", "from", "elderly", "(", "mean", "78", "years", ")", "and", "young", "(", "mean", "37", "years", ")", "humans", "was", "measured", "in", "cultures", "stimulated", "with", "PHA", ",", "PHA", "plus", "PMA", ",", "crosslinked", "anti-CD3", "mAB", "OKT3", "plus", "PMA", ",", "or", "PMA", "plus", "ionomycin", "." ]

[ "in", "the", "current", "studies", ",", "il-2", "production", "by", "t", "cells", "from", "elderly", "(", "mean", "78", "years", ")", "and", "young", "(", "mean", "37", "years", ")", "humans", "was", "measured", "in", "cultures", "stimulated", "with", "pha", ",", "pha", "plus", "pma", ",", "crosslinked", "anti-cd3", "mab", "okt3", "plus", "pma", ",", "or", "pma", "plus", "ionomycin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "Substantial", "decreases", "of", "IL-2", "production", "were", "observed", "for", "cell", "cultures", "from", "7", "of", "12", "elderly", "individuals", "in", "response", "to", "the", "different", "stimuli", ",", "whereas", "the", "levels", "of", "IL-2", "produced", "by", "stimulated", "T", "cells", "from", "other", "elderly", "individuals", "were", "equivalent", "to", "those", "observed", "for", "stimulated", "T", "cells", "of", "young", "subjects", "." ]

[ "substantial", "decreases", "of", "il-2", "production", "were", "observed", "for", "cell", "cultures", "from", "7", "of", "12", "elderly", "individuals", "in", "response", "to", "the", "different", "stimuli", ",", "whereas", "the", "levels", "of", "il-2", "produced", "by", "stimulated", "t", "cells", "from", "other", "elderly", "individuals", "were", "equivalent", "to", "those", "observed", "for", "stimulated", "t", "cells", "of", "young", "subjects", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "Analyses", "of", "nuclear", "extracts", "by", "electrophoretic", "DNA", "mobility", "shift", "assays", "showed", "that", "decreased", "IL-2", "production", "by", "stimulated", "T", "cells", "of", "elderly", "individuals", "was", "closely", "associated", "with", "impairments", "in", "the", "activation", "of", "both", "AP-1", "and", "NF-AT", "." ]

[ "analyses", "of", "nuclear", "extracts", "by", "electrophoretic", "dna", "mobility", "shift", "assays", "showed", "that", "decreased", "il-2", "production", "by", "stimulated", "t", "cells", "of", "elderly", "individuals", "was", "closely", "associated", "with", "impairments", "in", "the", "activation", "of", "both", "ap-1", "and", "nf-at", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "By", "contrast", ",", "T", "cells", "from", "elderly", "subjects", "with", "normal", "levels", "of", "IL-2", "production", "exhibited", "normal", "activation", "of", "AP-1", "and", "NF-AT", "." ]

[ "by", "contrast", ",", "t", "cells", "from", "elderly", "subjects", "with", "normal", "levels", "of", "il-2", "production", "exhibited", "normal", "activation", "of", "ap-1", "and", "nf-at", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "results", "of", "competition", "experiments", "analyzing", "the", "normal", "components", "of", "NF-AT", "showed", "that", "the", "age-related", "reductions", "in", "stimulus-dependent", "NF-AT", "complexes", "corresponded", "to", "the", "slow", "migrating", "complexes", "that", "were", "composed", "of", "c-Fos/c-Jun", "AP-1", "." ]

[ "in", "addition", ",", "the", "results", "of", "competition", "experiments", "analyzing", "the", "normal", "components", "of", "nf-at", "showed", "that", "the", "age-related", "reductions", "in", "stimulus-dependent", "nf-at", "complexes", "corresponded", "to", "the", "slow", "migrating", "complexes", "that", "were", "composed", "of", "c-fos/c-jun", "ap-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "resting", "and", "stimulated", "levels", "of", "NF", "kappa", "B", "were", "reduced", "in", "T", "cells", "from", "certain", "elderly", "individuals", ";", "however", ",", "alterations", "of", "NF", "kappa", "B", "did", "not", "correlate", "with", "changes", "in", "IL-2", "expression", "." ]

[ "the", "resting", "and", "stimulated", "levels", "of", "nf", "kappa", "b", "were", "reduced", "in", "t", "cells", "from", "certain", "elderly", "individuals", ";", "however", ",", "alterations", "of", "nf", "kappa", "b", "did", "not", "correlate", "with", "changes", "in", "il-2", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "these", "results", "show", "that", "age-related", "impairments", "in", "the", "activation", "of", "AP-1", "and", "NF-AT", "are", "closely", "associated", "with", "decreased", "expression", "of", "IL-2", "and", "further", "suggest", "that", "aberrancies", "in", "the", "signaling", "pathways", "important", "for", "the", "induction", "of", "transcriptionally", "active", "c-Fos/c-Jun", "AP-1", "may", "contribute", "to", "the", "impaired", "activation", "of", "NF-AT", "." ]

[ "thus", ",", "these", "results", "show", "that", "age-related", "impairments", "in", "the", "activation", "of", "ap-1", "and", "nf-at", "are", "closely", "associated", "with", "decreased", "expression", "of", "il-2", "and", "further", "suggest", "that", "aberrancies", "in", "the", "signaling", "pathways", "important", "for", "the", "induction", "of", "transcriptionally", "active", "c-fos/c-jun", "ap-1", "may", "contribute", "to", "the", "impaired", "activation", "of", "nf-at", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O" ]

[ "Latent", "membrane", "protein", "1", "of", "Epstein-Barr", "virus", "interacts", "with", "JAK3", "and", "activates", "STAT", "proteins", "." ]

[ "latent", "membrane", "protein", "1", "of", "epstein-barr", "virus", "interacts", "with", "jak3", "and", "activates", "stat", "proteins", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Latent", "membrane", "protein", "1", "(", "LMP1", ")", "acts", "like", "a", "permanently", "activated", "receptor", "of", "the", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "-receptor", "superfamily", "and", "is", "absolutely", "required", "for", "B", "cell", "immortalization", "by", "Epstein-Barr", "virus", "." ]

[ "latent", "membrane", "protein", "1", "(", "lmp1", ")", "acts", "like", "a", "permanently", "activated", "receptor", "of", "the", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "tnf", ")", "-receptor", "superfamily", "and", "is", "absolutely", "required", "for", "b", "cell", "immortalization", "by", "epstein-barr", "virus", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-virus", "I-virus", "O" ]

[ "Molecular", "and", "biochemical", "approaches", "demonstrated", "that", "LMP1", "usurps", "cellular", "signaling", "pathways", "resulting", "in", "the", "induction", "of", "NF-kappaB", "and", "AP-1", "via", "two", "C-terminal", "activating", "regions", "." ]

[ "molecular", "and", "biochemical", "approaches", "demonstrated", "that", "lmp1", "usurps", "cellular", "signaling", "pathways", "resulting", "in", "the", "induction", "of", "nf-kappab", "and", "ap-1", "via", "two", "c-terminal", "activating", "regions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "here", "that", "a", "third", "region", "encompassing", "a", "proline", "rich", "sequence", "within", "the", "33", "bp", "repetitive", "stretch", "of", "LMP1", "'s", "C-terminus", "is", "required", "for", "the", "activation", "of", "Janus", "kinase", "3", "(", "JAK3", ")", "." ]

[ "we", "demonstrate", "here", "that", "a", "third", "region", "encompassing", "a", "proline", "rich", "sequence", "within", "the", "33", "bp", "repetitive", "stretch", "of", "lmp1", "'s", "c-terminus", "is", "required", "for", "the", "activation", "of", "janus", "kinase", "3", "(", "jak3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "The", "interaction", "of", "LMP1", "and", "JAK3", "leads", "to", "the", "enhanced", "tyrosine", "auto/transphosphorylation", "of", "JAK3", "within", "minutes", "after", "crosslinking", "of", "a", "conditional", "NGF-R", ":", "LMP1", "chimera", "and", "is", "a", "prerequisite", "for", "the", "activation", "of", "STAT", "transcription", "factors", "." ]

[ "the", "interaction", "of", "lmp1", "and", "jak3", "leads", "to", "the", "enhanced", "tyrosine", "auto/transphosphorylation", "of", "jak3", "within", "minutes", "after", "crosslinking", "of", "a", "conditional", "ngf-r", ":", "lmp1", "chimera", "and", "is", "a", "prerequisite", "for", "the", "activation", "of", "stat", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "These", "results", "reveal", "a", "novel", "activating", "region", "in", "the", "LMP1", "C-terminus", "and", "identify", "the", "JAK", "/STAT", "pathway", "as", "a", "target", "of", "this", "viral", "integral", "membrane", "protein", "in", "B", "cells", "." ]

[ "these", "results", "reveal", "a", "novel", "activating", "region", "in", "the", "lmp1", "c-terminus", "and", "identify", "the", "jak", "/stat", "pathway", "as", "a", "target", "of", "this", "viral", "integral", "membrane", "protein", "in", "b", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "state", "of", "maturation", "of", "monocytes", "into", "macrophages", "determines", "the", "effects", "of", "IL-4", "and", "IL-13", "on", "HIV", "replication", "." ]

[ "the", "state", "of", "maturation", "of", "monocytes", "into", "macrophages", "determines", "the", "effects", "of", "il-4", "and", "il-13", "on", "hiv", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "molecular", "mechanisms", "of", "the", "effects", "of", "IL-4", "and", "IL-13", "on", "HIV", "infection", "in", "human", "monocytes", "as", "they", "matured", "into", "monocyte-derived", "macrophages", "over", "7", "days", "were", "investigated", "using", "HIV-1", "(", "BaL", ")", ",", "and", "low", "passage", "clinical", "strains", "." ]

[ "the", "molecular", "mechanisms", "of", "the", "effects", "of", "il-4", "and", "il-13", "on", "hiv", "infection", "in", "human", "monocytes", "as", "they", "matured", "into", "monocyte-derived", "macrophages", "over", "7", "days", "were", "investigated", "using", "hiv-1", "(", "bal", ")", ",", "and", "low", "passage", "clinical", "strains", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-4", "and", "IL-13", "up-regulated", "the", "expression", "of", "both", "genomic", "and", "spliced", "HIV", "mRNA", "in", "monocytes", "cultured", "on", "Teflon", ",", "as", "determined", "by", "Northern", "analysis", "and", "p24", "Ag", "assay", "." ]

[ "il-4", "and", "il-13", "up-regulated", "the", "expression", "of", "both", "genomic", "and", "spliced", "hiv", "mrna", "in", "monocytes", "cultured", "on", "teflon", ",", "as", "determined", "by", "northern", "analysis", "and", "p24", "ag", "assay", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-inorganic", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Using", "a", "nuclear", "run-on", "assay", ",", "IL-4", "stimulation", "was", "shown", "to", "enhance", "transcription", "by", "two-", "to", "threefold", "." ]

[ "using", "a", "nuclear", "run-on", "assay", ",", "il-4", "stimulation", "was", "shown", "to", "enhance", "transcription", "by", "two-", "to", "threefold", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-4", "stimulated", "nuclear", "factor-kappaB", "nuclear", "translocation", "and", "binding", "before", "enhancement", "of", "HIV", "RNA", "expression", "." ]

[ "il-4", "stimulated", "nuclear", "factor-kappab", "nuclear", "translocation", "and", "binding", "before", "enhancement", "of", "hiv", "rna", "expression", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Conversely", ",", "IL-4", "and", "IL-13", "markedly", "and", "significantly", "inhibited", "HIV", "replication", "at", "the", "transcriptional", "level", "in", "monocyte-derived", "macrophages", ",", "and", "this", "occurred", "whether", "these", "cytokines", "were", "added", "before", "or", "after", "HIV", "infection", "." ]

[ "conversely", ",", "il-4", "and", "il-13", "markedly", "and", "significantly", "inhibited", "hiv", "replication", "at", "the", "transcriptional", "level", "in", "monocyte-derived", "macrophages", ",", "and", "this", "occurred", "whether", "these", "cytokines", "were", "added", "before", "or", "after", "hiv", "infection", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "reversal", "from", "stimulation", "to", "inhibition", "occurred", "after", "3", "to", "5", "days", "of", "adherence", "to", "plastic", "." ]

[ "the", "reversal", "from", "stimulation", "to", "inhibition", "occurred", "after", "3", "to", "5", "days", "of", "adherence", "to", "plastic", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-4", "had", "no", "significant", "effect", "on", "HIV", "reverse", "transcription", "." ]

[ "il-4", "had", "no", "significant", "effect", "on", "hiv", "reverse", "transcription", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "effect", "of", "both", "cytokines", "on", "the", "monocyte", "maturation/differentiation", "(", "CD11b", ",", "CD13", ",", "and", "CD26", ")", "and", "other", "macrophage", "markers", "(", "CD14", "and", "CD68", ")", "was", "examined", "." ]

[ "the", "effect", "of", "both", "cytokines", "on", "the", "monocyte", "maturation/differentiation", "(", "cd11b", ",", "cd13", ",", "and", "cd26", ")", "and", "other", "macrophage", "markers", "(", "cd14", "and", "cd68", ")", "was", "examined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-4", "enhanced", "CD11b", ",", "but", "inhibited", "CD26", "expression", "and", "delayed", "CD13", "loss", "." ]

[ "il-4", "enhanced", "cd11b", ",", "but", "inhibited", "cd26", "expression", "and", "delayed", "cd13", "loss", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "IL-13", "had", "similar", "effects", "on", "CD11b", "and", "CD13", ",", "but", "no", "effect", "on", "CD26", "." ]

[ "il-13", "had", "similar", "effects", "on", "cd11b", "and", "cd13", ",", "but", "no", "effect", "on", "cd26", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Hence", ",", "these", "cytokines", "do", "not", "simply", "enhance", "monocyte", "differentiation", ",", "but", "have", "complex", "and", "slightly", "divergent", "effects", "that", "impact", "on", "HIV", "replication", "probably", "through", "cell", "signaling", "pathways", "and", "nuclear", "factor-kappaB", "translocation", "." ]

[ "hence", ",", "these", "cytokines", "do", "not", "simply", "enhance", "monocyte", "differentiation", ",", "but", "have", "complex", "and", "slightly", "divergent", "effects", "that", "impact", "on", "hiv", "replication", "probably", "through", "cell", "signaling", "pathways", "and", "nuclear", "factor-kappab", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O" ]

[ "Binding", "of", "YY1", "and", "Oct1", "to", "a", "novel", "element", "that", "downregulates", "expression", "of", "IL-5", "in", "human", "T", "cells", "." ]

[ "binding", "of", "yy1", "and", "oct1", "to", "a", "novel", "element", "that", "downregulates", "expression", "of", "il-5", "in", "human", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "BACKGROUND", ":", "IL-5", "controls", "development", "of", "eosinophilia", "and", "has", "been", "shown", "to", "be", "involved", "in", "the", "pathogenesis", "of", "allergic", "diseases", "." ]

[ "background", ":", "il-5", "controls", "development", "of", "eosinophilia", "and", "has", "been", "shown", "to", "be", "involved", "in", "the", "pathogenesis", "of", "allergic", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "both", "atopic", "and", "nonatopic", "asthma", ",", "elevated", "IL-5", "has", "been", "detected", "in", "peripheral", "blood", "and", "the", "airways", "." ]

[ "in", "both", "atopic", "and", "nonatopic", "asthma", ",", "elevated", "il-5", "has", "been", "detected", "in", "peripheral", "blood", "and", "the", "airways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "B-body_part", "O" ]

[ "IL-5", "is", "produced", "mainly", "by", "activated", "T", "cells", ",", "and", "its", "expression", "is", "regulated", "at", "the", "transcriptional", "level", "." ]

[ "il-5", "is", "produced", "mainly", "by", "activated", "t", "cells", ",", "and", "its", "expression", "is", "regulated", "at", "the", "transcriptional", "level", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "OBJECTIVE", ":", "This", "study", "focuses", "on", "the", "functional", "analysis", "of", "the", "human", "IL-5", "(", "hIL-5", ")", "promoter", "and", "characterization", "of", "cis", "-regulatory", "elements", "and", "transcription", "factors", "involved", "in", "the", "suppression", "of", "IL-5", "transcription", "in", "T", "cells", "." ]

[ "objective", ":", "this", "study", "focuses", "on", "the", "functional", "analysis", "of", "the", "human", "il-5", "(", "hil-5", ")", "promoter", "and", "characterization", "of", "cis", "-regulatory", "elements", "and", "transcription", "factors", "involved", "in", "the", "suppression", "of", "il-5", "transcription", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "METHODS", ":", "Methods", "used", "in", "this", "study", "include", "DNase", "I", "footprint", "assays", ",", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "and", "functional", "analysis", "by", "mammalian", "cell", "transfection", "involving", "deletion", "analysis", "and", "site-directed", "mutagenesis", "." ]

[ "methods", ":", "methods", "used", "in", "this", "study", "include", "dnase", "i", "footprint", "assays", ",", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "and", "functional", "analysis", "by", "mammalian", "cell", "transfection", "involving", "deletion", "analysis", "and", "site-directed", "mutagenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "RESULTS", ":", "We", "identified", "5", "protein", "binding", "regions", "(", "BRs", ")", "located", "within", "the", "proximal", "hIL-5", "promoter", "." ]

[ "results", ":", "we", "identified", "5", "protein", "binding", "regions", "(", "brs", ")", "located", "within", "the", "proximal", "hil-5", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Functional", "analysis", "indicates", "that", "the", "BRs", "are", "involved", "in", "control", "of", "hIL-5", "promoter", "activity", "." ]

[ "functional", "analysis", "indicates", "that", "the", "brs", "are", "involved", "in", "control", "of", "hil-5", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Two", "of", "these", "regions", ",", "BR3", "and", "BR4", "located", "at", "positions", "-102", "to", "-73", ",", "have", "not", "previously", "been", "described", "as", "regulators", "of", "IL-5", "expression", "in", "T", "cells", "." ]

[ "two", "of", "these", "regions", ",", "br3", "and", "br4", "located", "at", "positions", "-102", "to", "-73", ",", "have", "not", "previously", "been", "described", "as", "regulators", "of", "il-5", "expression", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "show", "that", "the", "BR3", "sequence", "contains", "a", "novel", "negative", "regulatory", "element", "located", "at", "positions", "-90", "to", "-79", "of", "the", "hIL-5", "promoter", ",", "which", "binds", "Oct1", ",", "octamer-like", ",", "and", "YY1", "nuclear", "factors", "." ]

[ "we", "show", "that", "the", "br3", "sequence", "contains", "a", "novel", "negative", "regulatory", "element", "located", "at", "positions", "-90", "to", "-79", "of", "the", "hil-5", "promoter", ",", "which", "binds", "oct1", ",", "octamer-like", ",", "and", "yy1", "nuclear", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Substitution", "mutations", ",", "which", "abolished", "binding", "of", "these", "proteins", "to", "the", "BR3", "sequence", ",", "significantly", "increased", "hIL-5", "promoter", "activity", "in", "activated", "T", "cells", "." ]

[ "substitution", "mutations", ",", "which", "abolished", "binding", "of", "these", "proteins", "to", "the", "br3", "sequence", ",", "significantly", "increased", "hil-5", "promoter", "activity", "in", "activated", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "CONCLUSION", ":", "We", "suggest", "that", "Oct1", ",", "YY1", ",", "and", "octamer-like", "factors", "binding", "to", "the", "-90/-79", "sequence", "within", "the", "proximal", "IL-5", "promoter", "are", "involved", "in", "suppression", "of", "IL-5", "transcription", "in", "T", "cells", "." ]

[ "conclusion", ":", "we", "suggest", "that", "oct1", ",", "yy1", ",", "and", "octamer-like", "factors", "binding", "to", "the", "-90/-79", "sequence", "within", "the", "proximal", "il-5", "promoter", "are", "involved", "in", "suppression", "of", "il-5", "transcription", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Expression", "of", "PILOT", ",", "a", "putative", "transcription", "factor", ",", "requires", "two", "signals", "and", "is", "cyclosporin", "A", "sensitive", "in", "T", "cells", "." ]

[ "expression", "of", "pilot", ",", "a", "putative", "transcription", "factor", ",", "requires", "two", "signals", "and", "is", "cyclosporin", "a", "sensitive", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Few", "known", "genes", "(", "IL-2", ",", "members", "of", "the", "IL-8", "family", ",", "interferon-gamma", ")", "are", "induced", "in", "T", "cells", "only", "through", "the", "combined", "effect", "of", "phorbol", "myristic", "acetate", "(", "PMA", ")", "and", "a", "Ca", "(", "2+", ")", "-ionophore", ",", "and", "expression", "of", "only", "these", "genes", "can", "be", "fully", "suppressed", "by", "Cyclosporin", "A", "(", "CyA", ")", "." ]

[ "few", "known", "genes", "(", "il-2", ",", "members", "of", "the", "il-8", "family", ",", "interferon-gamma", ")", "are", "induced", "in", "t", "cells", "only", "through", "the", "combined", "effect", "of", "phorbol", "myristic", "acetate", "(", "pma", ")", "and", "a", "ca", "(", "2+", ")", "-ionophore", ",", "and", "expression", "of", "only", "these", "genes", "can", "be", "fully", "suppressed", "by", "cyclosporin", "a", "(", "cya", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O" ]

[ "We", "have", "identified", "a", "putative", "transcription", "factor", ",", "designated", "PILOT", ",", "with", "an", "identical", "dual", "signal", "requirement", "for", "expression", "." ]

[ "we", "have", "identified", "a", "putative", "transcription", "factor", ",", "designated", "pilot", ",", "with", "an", "identical", "dual", "signal", "requirement", "for", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Induction", "of", "the", "PILOT", "gene", "is", "detectable", "in", "human", "T", "cells", "20", "min", "following", "activation", "in", "the", "presence", "of", "cycloheximide", "and", "is", "fully", "suppressed", "by", "CyA", "." ]

[ "induction", "of", "the", "pilot", "gene", "is", "detectable", "in", "human", "t", "cells", "20", "min", "following", "activation", "in", "the", "presence", "of", "cycloheximide", "and", "is", "fully", "suppressed", "by", "cya", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "The", "PILOT", "protein", "has", "a", "calculated", "M", "(", "r", ")", "of", "42", ".", "6", "kDa", "and", "contains", "three", "zinc", "fingers", "of", "the", "C2H2-type", "at", "the", "carboxyl-terminus", "which", "are", "highly", "homologous", "to", "the", "zinc", "finger", "regions", "of", "the", "transcription", "factors", "EGR1", ",", "EGR2", ",", "and", "pAT", "133", "." ]

[ "the", "pilot", "protein", "has", "a", "calculated", "m", "(", "r", ")", "of", "42", ".", "6", "kda", "and", "contains", "three", "zinc", "fingers", "of", "the", "c2h2-type", "at", "the", "carboxyl-terminus", "which", "are", "highly", "homologous", "to", "the", "zinc", "finger", "regions", "of", "the", "transcription", "factors", "egr1", ",", "egr2", ",", "and", "pat", "133", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_substructure", "I-protein_substructure", "O", "O", "B-protein_substructure", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "T", "cells", ",", "in", "fibroblasts", "PILOT", "gene", "expression", "requires", "only", "one", "signal", "(", "PMA", ")", "and", "is", "not", "affected", "by", "CyA", "." ]

[ "in", "contrast", "to", "t", "cells", ",", "in", "fibroblasts", "pilot", "gene", "expression", "requires", "only", "one", "signal", "(", "pma", ")", "and", "is", "not", "affected", "by", "cya", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O" ]

[ "This", "observation", "directly", "demonstrates", "the", "existence", "of", "a", "Ca2+", "signal-dependent", "regulatory", "element", "obligatory", "for", "expression", "of", "some", "genes", "in", "T", "cells", "but", "not", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "this", "observation", "directly", "demonstrates", "the", "existence", "of", "a", "ca2+", "signal-dependent", "regulatory", "element", "obligatory", "for", "expression", "of", "some", "genes", "in", "t", "cells", "but", "not", "in", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "This", "differential", "expression", "model", "will", "be", "valuable", "in", "the", "dissection", "of", "the", "dual", "signal", "pathway", "in", "T", "cells", "and", "the", "effects", "of", "CyA", "upon", "it", "." ]

[ "this", "differential", "expression", "model", "will", "be", "valuable", "in", "the", "dissection", "of", "the", "dual", "signal", "pathway", "in", "t", "cells", "and", "the", "effects", "of", "cya", "upon", "it", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O" ]

[ "The", "MHC", "class", "II", "transactivator", "(", "CIITA", ")", "requires", "conserved", "leucine", "charged", "domains", "for", "interactions", "with", "the", "conserved", "W", "box", "promoter", "element", "." ]

[ "the", "mhc", "class", "ii", "transactivator", "(", "ciita", ")", "requires", "conserved", "leucine", "charged", "domains", "for", "interactions", "with", "the", "conserved", "w", "box", "promoter", "element", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "class", "II", "transactivator", "CIITA", "is", "required", "for", "transcriptional", "activation", "of", "the", "major", "histocompatibility", "complex", "(", "MHC", ")", "class", "II", "genes", "." ]

[ "the", "class", "ii", "transactivator", "ciita", "is", "required", "for", "transcriptional", "activation", "of", "the", "major", "histocompatibility", "complex", "(", "mhc", ")", "class", "ii", "genes", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "Aside", "from", "an", "N-terminal", "acidic", "transcriptional", "activation", "domain", ",", "little", "is", "known", "about", "how", "this", "factor", "functions", "." ]

[ "aside", "from", "an", "n-terminal", "acidic", "transcriptional", "activation", "domain", ",", "little", "is", "known", "about", "how", "this", "factor", "functions", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Extensive", "mutagenesis", "of", "CIITA", "was", "undertaken", "to", "identify", "structural", "motifs", "required", "for", "function", "." ]

[ "extensive", "mutagenesis", "of", "ciita", "was", "undertaken", "to", "identify", "structural", "motifs", "required", "for", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ability", "of", "mutants", "to", "activate", "a", "reporter", "gene", "under", "the", "control", "of", "MHC", "class", "II", "conserved", "W-X-Y", "or", "X-Y", "regulatory", "elements", "was", "determined", "." ]

[ "the", "ability", "of", "mutants", "to", "activate", "a", "reporter", "gene", "under", "the", "control", "of", "mhc", "class", "ii", "conserved", "w-x-y", "or", "x-y", "regulatory", "elements", "was", "determined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "mutants", "displayed", "differential", "activity", "between", "the", "two", "promoters", ",", "activating", "transcription", "with", "the", "W-X-Y", "but", "not", "the", "X-Y", "elements", "." ]

[ "two", "mutants", "displayed", "differential", "activity", "between", "the", "two", "promoters", ",", "activating", "transcription", "with", "the", "w-x-y", "but", "not", "the", "x-y", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "mutants", "were", "tested", "for", "their", "ability", "to", "interfere", "with", "wild-type", "CIITA", "activity", "." ]

[ "all", "mutants", "were", "tested", "for", "their", "ability", "to", "interfere", "with", "wild-type", "ciita", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Five", "CIITA", "mutant", "constructions", "were", "able", "to", "down-regulate", "wild-type", "CIITA", "activity", "." ]

[ "five", "ciita", "mutant", "constructions", "were", "able", "to", "down-regulate", "wild-type", "ciita", "activity", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Three", "of", "these", "mutants", "contained", "targeted", "disruptions", "of", "potential", "functional", "motifs", ":", "the", "acidic", "activation", "domain", ",", "a", "putative", "GTP", "-binding", "motif", "and", "two", "leucine", "charged", "domains", "(", "LCD", "motifs", ")", "." ]

[ "three", "of", "these", "mutants", "contained", "targeted", "disruptions", "of", "potential", "functional", "motifs", ":", "the", "acidic", "activation", "domain", ",", "a", "putative", "gtp", "-binding", "motif", "and", "two", "leucine", "charged", "domains", "(", "lcd", "motifs", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-nucleotide", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "The", "other", "two", "contained", "mutations", "in", "regions", "that", "do", "not", "have", "homology", "to", "described", "proteins", "." ]

[ "the", "other", "two", "contained", "mutations", "in", "regions", "that", "do", "not", "have", "homology", "to", "described", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "characterization", "of", "CIITA", "mutants", "that", "are", "able", "to", "discriminate", "between", "promoters", "with", "or", "without", "the", "W", "box", "strongly", "suggests", "that", "CIITA", "requires", "such", "interactions", "for", "function", "." ]

[ "the", "characterization", "of", "ciita", "mutants", "that", "are", "able", "to", "discriminate", "between", "promoters", "with", "or", "without", "the", "w", "box", "strongly", "suggests", "that", "ciita", "requires", "such", "interactions", "for", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "identification", "of", "LCD", "motifs", "required", "for", "CIITA", "function", "brings", "to", "light", "a", "previously", "undefined", "role", "of", "these", "motifs", "in", "CIITA", "function", "." ]

[ "the", "identification", "of", "lcd", "motifs", "required", "for", "ciita", "function", "brings", "to", "light", "a", "previously", "undefined", "role", "of", "these", "motifs", "in", "ciita", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "X", "chromosome", "inactivation", "patterns", "in", "normal", "females", "." ]

[ "x", "chromosome", "inactivation", "patterns", "in", "normal", "females", "." ]

[ "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "Since", "one", "of", "the", "two", "X", "chromosomes", "is", "randomly", "inactivated", "at", "an", "early", "stage", "of", "female", "embryonic", "development", ",", "X-linked", "markers", "have", "been", "used", "to", "study", "the", "origin", "and", "development", "of", "various", "neoplastic", "disorders", "in", "affected", "heterozygous", "women", ";", "clonality", "assays", "have", "provided", "a", "useful", "tool", "to", "the", "understanding", "of", "the", "mechanisms", "underlying", "the", "development", "of", "neoplasia", "." ]

[ "since", "one", "of", "the", "two", "x", "chromosomes", "is", "randomly", "inactivated", "at", "an", "early", "stage", "of", "female", "embryonic", "development", ",", "x-linked", "markers", "have", "been", "used", "to", "study", "the", "origin", "and", "development", "of", "various", "neoplastic", "disorders", "in", "affected", "heterozygous", "women", ";", "clonality", "assays", "have", "provided", "a", "useful", "tool", "to", "the", "understanding", "of", "the", "mechanisms", "underlying", "the", "development", "of", "neoplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Recently", ",", "a", "technique", "of", "clonal", "analysis", "has", "been", "devised", "that", "takes", "advantage", "of", "a", "highly", "polymorphic", "short", "tandem", "repeat", "within", "the", "X-linked", "human", "androgen", "receptor", "(", "AR", ")", "gene", ",", "resulting", "in", "a", "heterozygosity", "rate", "approaching", "90%", "." ]

[ "recently", ",", "a", "technique", "of", "clonal", "analysis", "has", "been", "devised", "that", "takes", "advantage", "of", "a", "highly", "polymorphic", "short", "tandem", "repeat", "within", "the", "x-linked", "human", "androgen", "receptor", "(", "ar", ")", "gene", ",", "resulting", "in", "a", "heterozygosity", "rate", "approaching", "90%", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "rapid", "expansion", "of", "the", "number", "of", "women", "now", "suitable", "for", "X", "inactivation", "analysis", "has", "however", "given", "rise", "to", "new", "controversies", ",", "one", "of", "the", "more", "troublesome", "being", "the", "possibility", "of", "a", "modification", "of", "the", "pattern", "of", "X-", "chromosome", "inactivation", "pattern", "in", "blood", "cells", "of", "elderly", "women", "." ]

[ "the", "rapid", "expansion", "of", "the", "number", "of", "women", "now", "suitable", "for", "x", "inactivation", "analysis", "has", "however", "given", "rise", "to", "new", "controversies", ",", "one", "of", "the", "more", "troublesome", "being", "the", "possibility", "of", "a", "modification", "of", "the", "pattern", "of", "x-", "chromosome", "inactivation", "pattern", "in", "blood", "cells", "of", "elderly", "women", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-multi_cell", "B-multi_cell", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", "we", "analyze", "with", "the", "AR", "assay", "a", "group", "of", "166", "healthy", "females", "aged", "between", "8", "and", "94", "years", ",", "with", "no", "history", "of", "genetic", "or", "neoplastic", "familial", "disorders", "." ]

[ "in", "the", "present", "study", "we", "analyze", "with", "the", "ar", "assay", "a", "group", "of", "166", "healthy", "females", "aged", "between", "8", "and", "94", "years", ",", "with", "no", "history", "of", "genetic", "or", "neoplastic", "familial", "disorders", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "failed", "to", "find", "any", "correlation", "between", "age", "and", "X-", "chromosome", "inactivation", "pattern", "(", "r", "=", "0", ".", "17", ")", ",", "even", "subdividing", "the", "subjects", "in", "different", "age", "groups", "according", "to", "the", "criteria", "used", "by", "other", "researchers", ",", "and", "therefore", "reaffirm", "that", ",", "when", "tested", "for", "with", "well-standardized", "and", "accurate", "criteria", ",", "extremely", "unbalanced", "inactivation", "of", "the", "X", "chromosome", "is", "a", "truly", "uncommon", "phenomenon", "in", "normal", "women", "." ]

[ "we", "failed", "to", "find", "any", "correlation", "between", "age", "and", "x-", "chromosome", "inactivation", "pattern", "(", "r", "=", "0", ".", "17", ")", ",", "even", "subdividing", "the", "subjects", "in", "different", "age", "groups", "according", "to", "the", "criteria", "used", "by", "other", "researchers", ",", "and", "therefore", "reaffirm", "that", ",", "when", "tested", "for", "with", "well-standardized", "and", "accurate", "criteria", ",", "extremely", "unbalanced", "inactivation", "of", "the", "x", "chromosome", "is", "a", "truly", "uncommon", "phenomenon", "in", "normal", "women", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "B-multi_cell", "O" ]

[ "Copyright", "1998", "Academic", "Press", "." ]

[ "copyright", "1998", "academic", "press", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "a", "novel", "gene", "in", "3q21", "and", "identification", "of", "intergenic", "fusion", "transcripts", "with", "ecotropic", "viral", "insertion", "site", "I", "in", "leukemia", "." ]

[ "activation", "of", "a", "novel", "gene", "in", "3q21", "and", "identification", "of", "intergenic", "fusion", "transcripts", "with", "ecotropic", "viral", "insertion", "site", "i", "in", "leukemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "We", "have", "identified", "a", "novel", "gene", ",", "GR6", ",", "located", "within", "the", "leukemia", "breakpoint", "region", "of", "3q21", ",", "that", "is", "normally", "expressed", "in", "early", "fetal", "development", "but", "not", "in", "adult", "peripheral", "blood", "." ]

[ "we", "have", "identified", "a", "novel", "gene", ",", "gr6", ",", "located", "within", "the", "leukemia", "breakpoint", "region", "of", "3q21", ",", "that", "is", "normally", "expressed", "in", "early", "fetal", "development", "but", "not", "in", "adult", "peripheral", "blood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "GR6", "is", "activated", "in", "the", "UCSD-AML1", "cell", "line", "and", "in", "a", "leukemic", "sample", ",", "both", "of", "which", "carry", "a", "t", "(", "3", ";", "3", ")", "(", "q21", ";", "q26", ")", "." ]

[ "gr6", "is", "activated", "in", "the", "ucsd-aml1", "cell", "line", "and", "in", "a", "leukemic", "sample", ",", "both", "of", "which", "carry", "a", "t", "(", "3", ";", "3", ")", "(", "q21", ";", "q26", ")", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "In", "UCSD-AML1", ",", "we", "have", "also", "identified", "fusion", "transcripts", "between", "the", "ecotropic", "viral", "insertion", "site", "I", "(", "EVI1", ")", "gene", "in", "3q26", "and", "GR6", "and", "between", "EVI1", "and", "Ribophorin", "I", "that", "maps", "30", "kb", "telomeric", "to", "GR6", "in", "3q21", "." ]

[ "in", "ucsd-aml1", ",", "we", "have", "also", "identified", "fusion", "transcripts", "between", "the", "ecotropic", "viral", "insertion", "site", "i", "(", "evi1", ")", "gene", "in", "3q26", "and", "gr6", "and", "between", "evi1", "and", "ribophorin", "i", "that", "maps", "30", "kb", "telomeric", "to", "gr6", "in", "3q21", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA_family_or_group", "I-RNA_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "All", "fusions", "splice", "the", "5'", "ends", "of", "the", "3q21", "genes", "into", "exon", "2", "of", "the", "EVI1", "gene", ",", "an", "event", "that", "is", "similar", "to", "the", "normal", "intergenic", "splicing", "of", "MDS1-", "EVI1", "and", "to", "those", "previously", "documented", "in", "leukemias", "with", "t", "(", "3", ";", "21", ")", "and", "t", "(", "3", ";", "12", ")", ",", "in", "which", "acute", "myelogenous", "leukemia", "1-", "EVI1", "fusions", "and", "ETV6-", "EVI1", "fusions", ",", "respectively", ",", "occur", "." ]

[ "all", "fusions", "splice", "the", "5'", "ends", "of", "the", "3q21", "genes", "into", "exon", "2", "of", "the", "evi1", "gene", ",", "an", "event", "that", "is", "similar", "to", "the", "normal", "intergenic", "splicing", "of", "mds1-", "evi1", "and", "to", "those", "previously", "documented", "in", "leukemias", "with", "t", "(", "3", ";", "21", ")", "and", "t", "(", "3", ";", "12", ")", ",", "in", "which", "acute", "myelogenous", "leukemia", "1-", "evi1", "fusions", "and", "etv6-", "evi1", "fusions", ",", "respectively", ",", "occur", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Ribophorin", "I", "-EVI1", "fusion", "in", "particular", "may", "be", "a", "common", "occurrence", "in", "t", "(", "3", ";", "3", ")", "." ]

[ "the", "ribophorin", "i", "-evi1", "fusion", "in", "particular", "may", "be", "a", "common", "occurrence", "in", "t", "(", "3", ";", "3", ")", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Monoallelic", "expression", "of", "Pax5", ":", "a", "paradigm", "for", "the", "haploinsufficiency", "of", "mammalian", "Pax", "genes", "?" ]

[ "monoallelic", "expression", "of", "pax5", ":", "a", "paradigm", "for", "the", "haploinsufficiency", "of", "mammalian", "pax", "genes", "?" ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "It", "is", "generally", "assumed", "that", "most", "mammalian", "genes", "are", "transcribed", "from", "both", "alleles", "." ]

[ "it", "is", "generally", "assumed", "that", "most", "mammalian", "genes", "are", "transcribed", "from", "both", "alleles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Hence", ",", "the", "diploid", "state", "of", "the", "genome", "offers", "the", "advantage", "that", "a", "loss-of-function", "mutation", "in", "one", "allele", "can", "be", "compensated", "for", "by", "the", "remaining", "wild-type", "allele", "of", "the", "same", "gene", "." ]

[ "hence", ",", "the", "diploid", "state", "of", "the", "genome", "offers", "the", "advantage", "that", "a", "loss-of-function", "mutation", "in", "one", "allele", "can", "be", "compensated", "for", "by", "the", "remaining", "wild-type", "allele", "of", "the", "same", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Indeed", ",", "the", "vast", "majority", "of", "human", "disease", "syndromes", "and", "engineered", "mutations", "in", "the", "mouse", "genome", "are", "recessive", ",", "indicating", "that", "recessiveness", "is", "the", "'default'", "state", "." ]

[ "indeed", ",", "the", "vast", "majority", "of", "human", "disease", "syndromes", "and", "engineered", "mutations", "in", "the", "mouse", "genome", "are", "recessive", ",", "indicating", "that", "recessiveness", "is", "the", "'default'", "state", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "a", "minority", "of", "genes", "are", "semi-dominant", ",", "as", "heterozygous", "loss-of-function", "mutation", "in", "these", "genes", "leads", "to", "phenotypic", "abnormalities", "." ]

[ "however", ",", "a", "minority", "of", "genes", "are", "semi-dominant", ",", "as", "heterozygous", "loss-of-function", "mutation", "in", "these", "genes", "leads", "to", "phenotypic", "abnormalities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "This", "condition", ",", "known", "as", "haploinsufficiency", ",", "has", "been", "described", "for", "five", "of", "the", "nine", "mammalian", "Pax", "genes", ",", "which", "are", "associated", "with", "mouse", "developmental", "mutants", "and", "human", "disease", "syndromes", "." ]

[ "this", "condition", ",", "known", "as", "haploinsufficiency", ",", "has", "been", "described", "for", "five", "of", "the", "nine", "mammalian", "pax", "genes", ",", "which", "are", "associated", "with", "mouse", "developmental", "mutants", "and", "human", "disease", "syndromes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Recently", "we", "have", "reported", "that", "the", "Pax5", "gene", "is", "subject", "to", "allele", "-specific", "regulation", "during", "B", "cell", "development", "." ]

[ "recently", "we", "have", "reported", "that", "the", "pax5", "gene", "is", "subject", "to", "allele", "-specific", "regulation", "during", "b", "cell", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Pax5", "is", "predominantly", "transcribed", "from", "only", "one", "of", "its", "two", "alleles", "in", "early", "B-lymphoid", "progenitors", "and", "mature", "B", "cells", ",", "while", "it", "transiently", "switches", "to", "a", "biallelic", "mode", "of", "transcription", "in", "pre-B", "and", "immature", "B", "cells", "." ]

[ "pax5", "is", "predominantly", "transcribed", "from", "only", "one", "of", "its", "two", "alleles", "in", "early", "b-lymphoid", "progenitors", "and", "mature", "b", "cells", ",", "while", "it", "transiently", "switches", "to", "a", "biallelic", "mode", "of", "transcription", "in", "pre-b", "and", "immature", "b", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "consequence", ",", "B-lymphoid", "tissues", "are", "mosaic", "with", "regard", "to", "the", "transcribed", "allele", ",", "and", "heterozygous", "mutation", "of", "Pax5", "therefore", "results", "in", "deletion", "of", "B", "lymphocytes", "expressing", "only", "the", "mutant", "allele", "." ]

[ "as", "a", "consequence", ",", "b-lymphoid", "tissues", "are", "mosaic", "with", "regard", "to", "the", "transcribed", "allele", ",", "and", "heterozygous", "mutation", "of", "pax5", "therefore", "results", "in", "deletion", "of", "b", "lymphocytes", "expressing", "only", "the", "mutant", "allele", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "allele", "-specific", "regulation", "of", "Pax5", "raises", "the", "intriguing", "possibility", "that", "monoallelic", "expression", "may", "also", "be", "the", "mechanism", "causing", "the", "haploinsufficiency", "of", "other", "Pax", "genes", "." ]

[ "the", "allele", "-specific", "regulation", "of", "pax5", "raises", "the", "intriguing", "possibility", "that", "monoallelic", "expression", "may", "also", "be", "the", "mechanism", "causing", "the", "haploinsufficiency", "of", "other", "pax", "genes", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "In", "this", "review", ",", "we", "discuss", "different", "models", "accounting", "for", "the", "haploinsufficiency", "of", "mammalian", "Pax", "genes", ",", "provide", "further", "evidence", "in", "support", "of", "the", "allele", "-specific", "regulation", "of", "Pax5", "and", "discuss", "the", "implication", "of", "these", "findings", "in", "the", "context", "of", "the", "recent", "literature", "describing", "the", "stochastic", "and", "monoallelic", "activation", "of", "other", "hematopoietic", "genes", "." ]

[ "in", "this", "review", ",", "we", "discuss", "different", "models", "accounting", "for", "the", "haploinsufficiency", "of", "mammalian", "pax", "genes", ",", "provide", "further", "evidence", "in", "support", "of", "the", "allele", "-specific", "regulation", "of", "pax5", "and", "discuss", "the", "implication", "of", "these", "findings", "in", "the", "context", "of", "the", "recent", "literature", "describing", "the", "stochastic", "and", "monoallelic", "activation", "of", "other", "hematopoietic", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_family_or_group", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "Granulocyte-macrophage", "colony-stimulating", "factor", "stimulates", "JAK2", "signaling", "pathway", "and", "rapidly", "activates", "p93fes", ",", "STAT1", "p91", ",", "and", "STAT3", "p92", "in", "polymorphonuclear", "leukocytes", "." ]

[ "granulocyte-macrophage", "colony-stimulating", "factor", "stimulates", "jak2", "signaling", "pathway", "and", "rapidly", "activates", "p93fes", ",", "stat1", "p91", ",", "and", "stat3", "p92", "in", "polymorphonuclear", "leukocytes", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Granulocyte-macrophage", "colony-stimulating", "factor", "(", "GM-CSF", ")", ",", "supports", "proliferation", ",", "differentiation", ",", "and", "functional", "activation", "of", "hemopoietic", "cells", "by", "its", "interaction", "with", "a", "heterodimeric", "receptor", "." ]

[ "granulocyte-macrophage", "colony-stimulating", "factor", "(", "gm-csf", ")", ",", "supports", "proliferation", ",", "differentiation", ",", "and", "functional", "activation", "of", "hemopoietic", "cells", "by", "its", "interaction", "with", "a", "heterodimeric", "receptor", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "GM-CSF", "receptor", "is", "devoid", "of", "tyrosine", "kinase", "enzymatic", "activity", ",", "GM-CSF", "-induced", "peripheral", "blood", "polymorphonuclear", "leukocytes", "(", "PMN", ")", "functional", "activation", "is", "mediated", "by", "the", "phosphorylation", "of", "a", "large", "number", "of", "intracellular", "signaling", "molecules", "." ]

[ "although", "gm-csf", "receptor", "is", "devoid", "of", "tyrosine", "kinase", "enzymatic", "activity", ",", "gm-csf", "-induced", "peripheral", "blood", "polymorphonuclear", "leukocytes", "(", "pmn", ")", "functional", "activation", "is", "mediated", "by", "the", "phosphorylation", "of", "a", "large", "number", "of", "intracellular", "signaling", "molecules", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "shown", "that", "JAK2", "becomes", "tyrosine", "-phosphorylated", "in", "response", "to", "GM-CSF", "in", "PMN", "." ]

[ "we", "have", "previously", "shown", "that", "jak2", "becomes", "tyrosine", "-phosphorylated", "in", "response", "to", "gm-csf", "in", "pmn", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", "we", "demonstrate", "that", "also", "the", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "STAT", ")", "family", "members", "STAT1", "p91", "and", "STAT3", "p92", "and", "the", "product", "of", "the", "c-fps/fes", "protooncogene", "become", "tyrosine", "-phosphorylated", "upon", "GM-CSF", "stimulation", "and", "physically", "associated", "with", "both", "GM-CSF", "receptor", "beta", "common", "subunit", "and", "JAK2", "." ]

[ "in", "the", "present", "study", "we", "demonstrate", "that", "also", "the", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", "(", "stat", ")", "family", "members", "stat1", "p91", "and", "stat3", "p92", "and", "the", "product", "of", "the", "c-fps/fes", "protooncogene", "become", "tyrosine", "-phosphorylated", "upon", "gm-csf", "stimulation", "and", "physically", "associated", "with", "both", "gm-csf", "receptor", "beta", "common", "subunit", "and", "jak2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Moreover", "GM-CSF", "was", "able", "to", "induce", "JAK2", "and", "p93fes", "catalytic", "activity", "." ]

[ "moreover", "gm-csf", "was", "able", "to", "induce", "jak2", "and", "p93fes", "catalytic", "activity", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "demonstrate", "that", "the", "association", "of", "the", "GM-CSF", "receptor", "beta", "common", "subunit", "with", "JAK2", "is", "ligand-dependent", "." ]

[ "we", "also", "demonstrate", "that", "the", "association", "of", "the", "gm-csf", "receptor", "beta", "common", "subunit", "with", "jak2", "is", "ligand-dependent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", "we", "demonstrate", "that", "GM-CSF", "induces", "a", "DNA-binding", "complex", "that", "contains", "both", "p91", "and", "p92", "." ]

[ "finally", "we", "demonstrate", "that", "gm-csf", "induces", "a", "dna-binding", "complex", "that", "contains", "both", "p91", "and", "p92", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "These", "results", "identify", "a", "new", "signal", "transduction", "pathway", "activated", "by", "GM-CSF", "and", "provide", "a", "mechanism", "for", "rapid", "activation", "of", "gene", "expression", "in", "GM-CSF", "-stimulated", "PMN", "." ]

[ "these", "results", "identify", "a", "new", "signal", "transduction", "pathway", "activated", "by", "gm-csf", "and", "provide", "a", "mechanism", "for", "rapid", "activation", "of", "gene", "expression", "in", "gm-csf", "-stimulated", "pmn", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Transcription", "factors", "in", "immune-mediated", "disease", "." ]

[ "transcription", "factors", "in", "immune-mediated", "disease", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "A", "large", "amount", "of", "detailed", "information", "about", "the", "intracellular", "proteins", "regulating", "NF-kappa", "B", "activation", "and", "the", "cellular", "response", "to", "NF-kappa", "B", "activation", "has", "emerged", "recently", "." ]

[ "a", "large", "amount", "of", "detailed", "information", "about", "the", "intracellular", "proteins", "regulating", "nf-kappa", "b", "activation", "and", "the", "cellular", "response", "to", "nf-kappa", "b", "activation", "has", "emerged", "recently", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "small", "molecules", ",", "an", "antisense", "oligonucleotide", ",", "and", "gene", "therapeutic", "agents", "that", "inhibit", "NF-kappa", "b", "activation", "have", "been", "described", "." ]

[ "several", "small", "molecules", ",", "an", "antisense", "oligonucleotide", ",", "and", "gene", "therapeutic", "agents", "that", "inhibit", "nf-kappa", "b", "activation", "have", "been", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "this", ",", "there", "are", "still", "significant", "gaps", "in", "our", "understanding", "of", "this", "process", "and", "its", "consequences", "." ]

[ "despite", "this", ",", "there", "are", "still", "significant", "gaps", "in", "our", "understanding", "of", "this", "process", "and", "its", "consequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "characterization", "of", "transcription", "factors", "selectively", "regulating", "cytokine", "production", "by", "CD4+", "T", "cell", "subsets", "is", "at", "a", "very", "early", "stage", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "the", "characterization", "of", "transcription", "factors", "selectively", "regulating", "cytokine", "production", "by", "cd4+", "t", "cell", "subsets", "is", "at", "a", "very", "early", "stage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "interacting", "proteins", "have", "recently", "been", "shown", "to", "contribute", "to", "subset-restricted", "expression", "of", "the", "IL-4", "gene", "." ]

[ "three", "interacting", "proteins", "have", "recently", "been", "shown", "to", "contribute", "to", "subset-restricted", "expression", "of", "the", "il-4", "gene", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "There", "are", "other", "elements", "regulating", "IL-4", "gene", "expression", ",", "however", ",", "and", "the", "relative", "importance", "of", "these", "recently", "identified", "proteins", "has", "yet", "to", "be", "determined", "." ]

[ "there", "are", "other", "elements", "regulating", "il-4", "gene", "expression", ",", "however", ",", "and", "the", "relative", "importance", "of", "these", "recently", "identified", "proteins", "has", "yet", "to", "be", "determined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "winged-helix", "transcription", "factor", "Trident", "is", "expressed", "in", "actively", "dividing", "lymphocytes", "." ]

[ "the", "winged-helix", "transcription", "factor", "trident", "is", "expressed", "in", "actively", "dividing", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]