tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"GC",
"efficiently",
"suppressed",
"IL-5",
"synthesis",
"of",
"T-cell",
"clones",
"activated",
"via",
"either",
"T-cell",
"receptor",
"(",
"TCR",
")",
"or",
"IL-2",
"receptor",
"(",
"IL-2R",
")",
"."
] | [
"gc",
"efficiently",
"suppressed",
"il-5",
"synthesis",
"of",
"t-cell",
"clones",
"activated",
"via",
"either",
"t-cell",
"receptor",
"(",
"tcr",
")",
"or",
"il-2",
"receptor",
"(",
"il-2r",
")",
"."
] | [
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"IL-5",
"mRNA",
"upon",
"TCR",
"and",
"IL-2R",
"stimulation",
"was",
"totally",
"inhibited",
"by",
"dexamethasone",
"."
] | [
"induction",
"of",
"il-5",
"mrna",
"upon",
"tcr",
"and",
"il-2r",
"stimulation",
"was",
"totally",
"inhibited",
"by",
"dexamethasone",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"Human",
"IL-5",
"promoter/enhancer-luciferase",
"gene",
"construct",
"transfected",
"to",
"T-cell",
"clones",
"was",
"transcribed",
"on",
"either",
"TCR",
"or",
"IL-2R",
"stimulation",
"and",
"was",
"clearly",
"downregulated",
"by",
"dexamethasone",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"approximately",
"500-bp",
"human",
"IL-5",
"gene",
"segment",
"located",
"5'",
"upstream",
"of",
"the",
"coding",
"region",
"contains",
"activation-inducible",
"enhancer",
"elements",
"responsible",
"for",
"the",
"regulation",
"by",
"GC",
"."
] | [
"human",
"il-5",
"promoter/enhancer-luciferase",
"gene",
"construct",
"transfected",
"to",
"t-cell",
"clones",
"was",
"transcribed",
"on",
"either",
"tcr",
"or",
"il-2r",
"stimulation",
"and",
"was",
"clearly",
"downregulated",
"by",
"dexamethasone",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"approximately",
"500-bp",
"human",
"il-5",
"gene",
"segment",
"located",
"5'",
"upstream",
"of",
"the",
"coding",
"region",
"contains",
"activation-inducible",
"enhancer",
"elements",
"responsible",
"for",
"the",
"regulation",
"by",
"gc",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"Electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"analysis",
"suggested",
"that",
"AP-1",
"and",
"NF-kappaB",
"are",
"among",
"the",
"possible",
"targets",
"of",
"GC",
"actions",
"on",
"TCR",
"-stimulated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"analysis",
"suggested",
"that",
"ap-1",
"and",
"nf-kappab",
"are",
"among",
"the",
"possible",
"targets",
"of",
"gc",
"actions",
"on",
"tcr",
"-stimulated",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"NF-AT",
"and",
"NF-kappaB",
"were",
"not",
"significantly",
"induced",
"by",
"IL-2",
"stimulation",
"."
] | [
"nf-at",
"and",
"nf-kappab",
"were",
"not",
"significantly",
"induced",
"by",
"il-2",
"stimulation",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"showing",
"that",
"GC",
"suppressed",
"IL-5",
"production",
"by",
"human",
"CD4+",
"T",
"cells",
"activated",
"by",
"two",
"distinct",
"stimuli",
",",
"TCR",
"and",
"IL-2R",
"stimulation",
",",
"underscore",
"the",
"efficacy",
"of",
"GC",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"allergic",
"diseases",
"via",
"suppression",
"of",
"T-cell",
"IL-5",
"synthesis",
"."
] | [
"our",
"results",
"showing",
"that",
"gc",
"suppressed",
"il-5",
"production",
"by",
"human",
"cd4+",
"t",
"cells",
"activated",
"by",
"two",
"distinct",
"stimuli",
",",
"tcr",
"and",
"il-2r",
"stimulation",
",",
"underscore",
"the",
"efficacy",
"of",
"gc",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"allergic",
"diseases",
"via",
"suppression",
"of",
"t-cell",
"il-5",
"synthesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"IL-2",
"-induced",
"growth",
"of",
"CD8+",
"T",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukemia",
"cells",
"mediated",
"by",
"NF-kappaB",
"induction",
"and",
"IL-2",
"receptor",
"alpha",
"expression",
"."
] | [
"il-2",
"-induced",
"growth",
"of",
"cd8+",
"t",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukemia",
"cells",
"mediated",
"by",
"nf-kappab",
"induction",
"and",
"il-2",
"receptor",
"alpha",
"expression",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"of",
"interleukin-2",
"(",
"IL-2",
")",
"to",
"its",
"receptor",
"on",
"normal",
"T",
"cells",
"induces",
"nuclear",
"expression",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappaB",
"(",
"NF-kappaB",
")",
",",
"activation",
"of",
"the",
"IL-2",
"receptor",
"(",
"IL-2R",
")",
"alpha",
"chain",
"gene",
",",
"and",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"the",
"binding",
"of",
"interleukin-2",
"(",
"il-2",
")",
"to",
"its",
"receptor",
"on",
"normal",
"t",
"cells",
"induces",
"nuclear",
"expression",
"of",
"nuclear",
"factor",
"kappab",
"(",
"nf-kappab",
")",
",",
"activation",
"of",
"the",
"il-2",
"receptor",
"(",
"il-2r",
")",
"alpha",
"chain",
"gene",
",",
"and",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"present",
"study",
",",
"the",
"role",
"of",
"IL-2R",
"signaling",
"in",
"the",
"growth",
"of",
"CD8+",
"T",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukemia",
"(",
"T-PLL",
")",
"cells",
"has",
"been",
"investigated",
"."
] | [
"in",
"the",
"present",
"study",
",",
"the",
"role",
"of",
"il-2r",
"signaling",
"in",
"the",
"growth",
"of",
"cd8+",
"t",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukemia",
"(",
"t-pll",
")",
"cells",
"has",
"been",
"investigated",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Flow",
"cytometry",
"revealed",
"that",
"primary",
"leukemia",
"cells",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"CD8+",
"T-PLL",
"expressed",
"IL-2R",
"alpha",
"and",
"beta",
"chains",
",",
"and",
"the",
"cells",
"showed",
"a",
"proliferative",
"response",
"and",
"an",
"increase",
"in",
"IL-2Ralpha",
"expression",
"on",
"culture",
"with",
"exogeneous",
"IL-2",
"."
] | [
"flow",
"cytometry",
"revealed",
"that",
"primary",
"leukemia",
"cells",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"cd8+",
"t-pll",
"expressed",
"il-2r",
"alpha",
"and",
"beta",
"chains",
",",
"and",
"the",
"cells",
"showed",
"a",
"proliferative",
"response",
"and",
"an",
"increase",
"in",
"il-2ralpha",
"expression",
"on",
"culture",
"with",
"exogeneous",
"il-2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Northern",
"blot",
"analysis",
"failed",
"to",
"detect",
"IL-2",
"mRNA",
",",
"suggesting",
"that",
"IL-2",
"may",
"act",
"in",
"a",
"paracrine",
"manner",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"northern",
"blot",
"analysis",
"failed",
"to",
"detect",
"il-2",
"mrna",
",",
"suggesting",
"that",
"il-2",
"may",
"act",
"in",
"a",
"paracrine",
"manner",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Electrophoretic",
"mobility-shift",
"assays",
"revealed",
"that",
"recombinant",
"IL-2",
"increased",
"NF-kappaB",
"binding",
"activity",
"in",
"nuclear",
"extracts",
"of",
"the",
"leukemia",
"cells",
",",
"and",
"Northern",
"blot",
"analysis",
"showed",
"that",
"IL-2",
"increased",
"the",
"abundance",
"of",
"mRNAs",
"encoding",
"the",
"NF-kappaB",
"components",
"c-Rel",
"and",
"KBF1",
"in",
"these",
"cells",
"."
] | [
"electrophoretic",
"mobility-shift",
"assays",
"revealed",
"that",
"recombinant",
"il-2",
"increased",
"nf-kappab",
"binding",
"activity",
"in",
"nuclear",
"extracts",
"of",
"the",
"leukemia",
"cells",
",",
"and",
"northern",
"blot",
"analysis",
"showed",
"that",
"il-2",
"increased",
"the",
"abundance",
"of",
"mrnas",
"encoding",
"the",
"nf-kappab",
"components",
"c-rel",
"and",
"kbf1",
"in",
"these",
"cells",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-2",
"binding",
"analysis",
"demonstrated",
"that",
"IL-2",
"markedly",
"increased",
"the",
"number",
"of",
"low",
"affinity",
"IL-2Rs",
"on",
"the",
"leukemia",
"cells",
",",
"without",
"an",
"effect",
"on",
"the",
"number",
"of",
"high-affinity",
"IL-2Rs",
"."
] | [
"il-2",
"binding",
"analysis",
"demonstrated",
"that",
"il-2",
"markedly",
"increased",
"the",
"number",
"of",
"low",
"affinity",
"il-2rs",
"on",
"the",
"leukemia",
"cells",
",",
"without",
"an",
"effect",
"on",
"the",
"number",
"of",
"high-affinity",
"il-2rs",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"show",
"that",
"IL-2",
"is",
"capable",
"of",
"inducing",
"the",
"nuclear",
"expression",
"of",
"NF-kappaB",
"in",
"primary",
"CD8+",
"T-PLL",
"cells",
",",
"and",
"that",
"this",
"effect",
"is",
"mediated",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"at",
"a",
"pretranslational",
"level"
] | [
"these",
"results",
"show",
"that",
"il-2",
"is",
"capable",
"of",
"inducing",
"the",
"nuclear",
"expression",
"of",
"nf-kappab",
"in",
"primary",
"cd8+",
"t-pll",
"cells",
",",
"and",
"that",
"this",
"effect",
"is",
"mediated",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"at",
"a",
"pretranslational",
"level"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name"
] |
[
"Association",
"between",
"expression",
"of",
"intercellular",
"adhesion",
"molecule-1",
"and",
"integration",
"of",
"human",
"T-cell-leukemia",
"virus",
"type",
"1",
"in",
"adult",
"T-cell",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"association",
"between",
"expression",
"of",
"intercellular",
"adhesion",
"molecule-1",
"and",
"integration",
"of",
"human",
"t-cell-leukemia",
"virus",
"type",
"1",
"in",
"adult",
"t-cell",
"leukemia",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"known",
"that",
"the",
"expression",
"levels",
"of",
"intercellular",
"adhesion",
"molecule-1",
"(",
"ICAM-1",
")",
"in",
"adult",
"T",
"cell",
"leukemia",
"(",
"ATL",
")",
"cells",
"are",
"high",
",",
"whereas",
"those",
"in",
"T-lymphoid",
"cells",
"are",
"not",
"."
] | [
"it",
"is",
"known",
"that",
"the",
"expression",
"levels",
"of",
"intercellular",
"adhesion",
"molecule-1",
"(",
"icam-1",
")",
"in",
"adult",
"t",
"cell",
"leukemia",
"(",
"atl",
")",
"cells",
"are",
"high",
",",
"whereas",
"those",
"in",
"t-lymphoid",
"cells",
"are",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"order",
"to",
"investigate",
"the",
"factors",
"that",
"influence",
"the",
"induction",
"of",
"ICAM-1",
"molecules",
",",
"Northern",
"blot",
"analysis",
"to",
"measure",
"the",
"expression",
"level",
"of",
"ICAM-1",
"mRNAs",
"and",
"Southern",
"blot",
"hybridization",
"to",
"analyze",
"the",
"integration",
"of",
"human",
"T-cell-leukemia",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HTLV-1",
")",
"provirus",
"were",
"done",
"."
] | [
"in",
"order",
"to",
"investigate",
"the",
"factors",
"that",
"influence",
"the",
"induction",
"of",
"icam-1",
"molecules",
",",
"northern",
"blot",
"analysis",
"to",
"measure",
"the",
"expression",
"level",
"of",
"icam-1",
"mrnas",
"and",
"southern",
"blot",
"hybridization",
"to",
"analyze",
"the",
"integration",
"of",
"human",
"t-cell-leukemia",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"htlv-1",
")",
"provirus",
"were",
"done",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"levels",
"of",
"ICAM-1",
"mRNA",
"expression",
"of",
"ATL",
"cells",
"were",
"generally",
"higher",
"than",
"those",
"of",
"T-lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"the",
"levels",
"of",
"icam-1",
"mrna",
"expression",
"of",
"atl",
"cells",
"were",
"generally",
"higher",
"than",
"those",
"of",
"t-lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"However",
",",
"ILT-mat",
"cells",
"and",
"ATL16T",
"(",
"-",
")",
"cells",
",",
"although",
"they",
"were",
"ATL",
"cells",
",",
"showed",
"rather",
"low",
"surface",
"ICAM-1",
"expression",
"and",
"ICAM-1",
"mRNA",
"expression",
"."
] | [
"however",
",",
"ilt-mat",
"cells",
"and",
"atl16t",
"(",
"-",
")",
"cells",
",",
"although",
"they",
"were",
"atl",
"cells",
",",
"showed",
"rather",
"low",
"surface",
"icam-1",
"expression",
"and",
"icam-1",
"mrna",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Southern",
"blot",
"hybridization",
"showed",
"that",
"only",
"two",
"and",
"four",
"bands",
"were",
"found",
"in",
"ILT-mat",
"and",
"ATL16T",
"(",
"-",
")",
"cells",
",",
"respectively",
",",
"whereas",
">",
"10",
"bands",
"were",
"detected",
"in",
"other",
"ATL",
"cells",
"."
] | [
"southern",
"blot",
"hybridization",
"showed",
"that",
"only",
"two",
"and",
"four",
"bands",
"were",
"found",
"in",
"ilt-mat",
"and",
"atl16t",
"(",
"-",
")",
"cells",
",",
"respectively",
",",
"whereas",
">",
"10",
"bands",
"were",
"detected",
"in",
"other",
"atl",
"cells",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"monoclonal",
"integration",
"of",
"HTLV-1",
"provirus",
"to",
"the",
"genome",
"of",
"T",
"cell",
",",
"especially",
"the",
"number",
"of",
"integration",
"sites",
",",
"is",
"one",
"of",
"the",
"factors",
"for",
"induction",
"of",
"ICAM-1",
"molecules",
"."
] | [
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"monoclonal",
"integration",
"of",
"htlv-1",
"provirus",
"to",
"the",
"genome",
"of",
"t",
"cell",
",",
"especially",
"the",
"number",
"of",
"integration",
"sites",
",",
"is",
"one",
"of",
"the",
"factors",
"for",
"induction",
"of",
"icam-1",
"molecules",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"central",
"role",
"for",
"a",
"single",
"c-Myb",
"binding",
"site",
"in",
"a",
"thymic",
"locus",
"control",
"region",
"."
] | [
"a",
"central",
"role",
"for",
"a",
"single",
"c-myb",
"binding",
"site",
"in",
"a",
"thymic",
"locus",
"control",
"region",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Locus",
"control",
"regions",
"(",
"LCRs",
")",
"are",
"powerful",
"assemblies",
"of",
"cis",
"elements",
"that",
"organize",
"the",
"actions",
"of",
"cell-type-specific",
"trans-acting",
"factors",
"."
] | [
"locus",
"control",
"regions",
"(",
"lcrs",
")",
"are",
"powerful",
"assemblies",
"of",
"cis",
"elements",
"that",
"organize",
"the",
"actions",
"of",
"cell-type-specific",
"trans-acting",
"factors",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"A",
"2",
".",
"3-kb",
"LCR",
"in",
"the",
"human",
"adenosine",
"deaminase",
"(",
"ADA",
")",
"gene",
"first",
"intron",
",",
"which",
"controls",
"expression",
"in",
"thymocytes",
",",
"is",
"composed",
"of",
"a",
"200-bp",
"enhancer",
"domain",
"and",
"extended",
"flanking",
"sequences",
"that",
"facilitate",
"activation",
"from",
"within",
"chromatin",
"."
] | [
"a",
"2",
".",
"3-kb",
"lcr",
"in",
"the",
"human",
"adenosine",
"deaminase",
"(",
"ada",
")",
"gene",
"first",
"intron",
",",
"which",
"controls",
"expression",
"in",
"thymocytes",
",",
"is",
"composed",
"of",
"a",
"200-bp",
"enhancer",
"domain",
"and",
"extended",
"flanking",
"sequences",
"that",
"facilitate",
"activation",
"from",
"within",
"chromatin",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Prior",
"analyses",
"have",
"demonstrated",
"that",
"the",
"enhancer",
"contains",
"a",
"28-bp",
"core",
"region",
"and",
"local",
"adjacent",
"augmentative",
"cis",
"elements",
"."
] | [
"prior",
"analyses",
"have",
"demonstrated",
"that",
"the",
"enhancer",
"contains",
"a",
"28-bp",
"core",
"region",
"and",
"local",
"adjacent",
"augmentative",
"cis",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"now",
"show",
"that",
"the",
"core",
"contains",
"a",
"single",
"critical",
"c-Myb",
"binding",
"site",
"."
] | [
"we",
"now",
"show",
"that",
"the",
"core",
"contains",
"a",
"single",
"critical",
"c-myb",
"binding",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"both",
"transiently",
"cotransfected",
"human",
"cells",
"and",
"stable",
"chromatin-integrated",
"yeast",
"cells",
",",
"c-Myb",
"strongly",
"transactivated",
"reporter",
"constructs",
"that",
"contained",
"polymerized",
"core",
"sequences",
"."
] | [
"in",
"both",
"transiently",
"cotransfected",
"human",
"cells",
"and",
"stable",
"chromatin-integrated",
"yeast",
"cells",
",",
"c-myb",
"strongly",
"transactivated",
"reporter",
"constructs",
"that",
"contained",
"polymerized",
"core",
"sequences",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"c-Myb",
"protein",
"was",
"strongly",
"evident",
"in",
"T",
"lymphoblasts",
"in",
"which",
"the",
"enhancer",
"was",
"active",
"and",
"was",
"localized",
"within",
"discrete",
"nuclear",
"structures",
"."
] | [
"c-myb",
"protein",
"was",
"strongly",
"evident",
"in",
"t",
"lymphoblasts",
"in",
"which",
"the",
"enhancer",
"was",
"active",
"and",
"was",
"localized",
"within",
"discrete",
"nuclear",
"structures",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O"
] |
[
"Fetal",
"murine",
"thymus",
"exhibited",
"a",
"striking",
"concordance",
"of",
"endogenous",
"c-myb",
"expression",
"with",
"that",
"of",
"mouse",
"ADA",
"and",
"human",
"ADA",
"LCR",
"-directed",
"transgene",
"expression",
"."
] | [
"fetal",
"murine",
"thymus",
"exhibited",
"a",
"striking",
"concordance",
"of",
"endogenous",
"c-myb",
"expression",
"with",
"that",
"of",
"mouse",
"ada",
"and",
"human",
"ada",
"lcr",
"-directed",
"transgene",
"expression",
"."
] | [
"B-body_part",
"I-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Point",
"mutation",
"of",
"the",
"c-Myb",
"site",
"within",
"the",
"intact",
"2",
".",
"3-kb",
"LCR",
"severely",
"attenuated",
"enhancer",
"activity",
"in",
"transfections",
"and",
"LCR",
"activity",
"in",
"transgenic",
"thymocytes",
"."
] | [
"point",
"mutation",
"of",
"the",
"c-myb",
"site",
"within",
"the",
"intact",
"2",
".",
"3-kb",
"lcr",
"severely",
"attenuated",
"enhancer",
"activity",
"in",
"transfections",
"and",
"lcr",
"activity",
"in",
"transgenic",
"thymocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Within",
"the",
"context",
"of",
"a",
"complex",
"enhancer",
"and",
"LCR",
",",
"c-Myb",
"can",
"act",
"as",
"an",
"organizer",
"of",
"thymocyte-specific",
"gene",
"expression",
"via",
"a",
"single",
"binding",
"site",
"."
] | [
"within",
"the",
"context",
"of",
"a",
"complex",
"enhancer",
"and",
"lcr",
",",
"c-myb",
"can",
"act",
"as",
"an",
"organizer",
"of",
"thymocyte-specific",
"gene",
"expression",
"via",
"a",
"single",
"binding",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Calcineurin",
"and",
"the",
"biological",
"effect",
"of",
"cyclosporine",
"and",
"tacrolimus",
"."
] | [
"calcineurin",
"and",
"the",
"biological",
"effect",
"of",
"cyclosporine",
"and",
"tacrolimus",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"The",
"mechanism",
"of",
"the",
"immunosuppressive",
"effect",
"of",
"CyA",
"and",
"FK",
"506",
"can",
"be",
"monitored",
"in",
"vivo",
"in",
"humans",
"."
] | [
"the",
"mechanism",
"of",
"the",
"immunosuppressive",
"effect",
"of",
"cya",
"and",
"fk",
"506",
"can",
"be",
"monitored",
"in",
"vivo",
"in",
"humans",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O"
] |
[
"The",
"picture",
"emerging",
"is",
"of",
"a",
"close",
"relationship",
"between",
"drug",
"concentrations",
"and",
"CN",
"inhibition",
"."
] | [
"the",
"picture",
"emerging",
"is",
"of",
"a",
"close",
"relationship",
"between",
"drug",
"concentrations",
"and",
"cn",
"inhibition",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"But",
"many",
"puzzles",
"of",
"the",
"drugs",
"remain",
"."
] | [
"but",
"many",
"puzzles",
"of",
"the",
"drugs",
"remain",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"What",
"is",
"the",
"role",
"of",
"CyA",
"in",
"the",
"activation",
"of",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
"(",
"TGF-beta",
")",
",",
"particularly",
"in",
"relationship",
"to",
"nephrotoxicity",
"and",
"fibrogenesis",
"?"
] | [
"what",
"is",
"the",
"role",
"of",
"cya",
"in",
"the",
"activation",
"of",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
"(",
"tgf-beta",
")",
",",
"particularly",
"in",
"relationship",
"to",
"nephrotoxicity",
"and",
"fibrogenesis",
"?"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"How",
"important",
"are",
"the",
"anti-inflammatory",
"(",
"non",
"T",
")",
"effects",
"of",
"CyA",
",",
"and",
"which",
"cells",
"do",
"they",
"operate",
"in?"
] | [
"how",
"important",
"are",
"the",
"anti-inflammatory",
"(",
"non",
"t",
")",
"effects",
"of",
"cya",
",",
"and",
"which",
"cells",
"do",
"they",
"operate",
"in?"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Are",
"there",
"effects",
"of",
"CyA",
"and",
"FK",
"506",
"all",
"attributable",
"to",
"CN",
"inhibition",
",",
"and",
"how",
"much",
"of",
"them",
"are",
"mediated",
"through",
"the",
"NFATC",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"?"
] | [
"are",
"there",
"effects",
"of",
"cya",
"and",
"fk",
"506",
"all",
"attributable",
"to",
"cn",
"inhibition",
",",
"and",
"how",
"much",
"of",
"them",
"are",
"mediated",
"through",
"the",
"nfatc",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"?"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"it",
"would",
"be",
"useful",
"to",
"know",
"what",
"the",
"inhibitory",
"effects",
"of",
"CyA",
"are",
"on",
"tolerance",
"and",
"negative",
"regulatory",
"events",
"."
] | [
"finally",
",",
"it",
"would",
"be",
"useful",
"to",
"know",
"what",
"the",
"inhibitory",
"effects",
"of",
"cya",
"are",
"on",
"tolerance",
"and",
"negative",
"regulatory",
"events",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"A",
"novel",
"T-cell",
"trans-activator",
"that",
"recognizes",
"a",
"phorbol",
"ester-inducible",
"element",
"of",
"the",
"interleukin-2",
"promoter",
"."
] | [
"a",
"novel",
"t-cell",
"trans-activator",
"that",
"recognizes",
"a",
"phorbol",
"ester-inducible",
"element",
"of",
"the",
"interleukin-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"interleukin",
"2",
"(",
"IL-2",
")",
"gene",
"promoter",
"is",
"recognized",
"by",
"several",
"cell-type-specific",
"and",
"ubiquitous",
"transcriptional",
"regulators",
"that",
"integrate",
"information",
"transmitted",
"by",
"various",
"signaling",
"systems",
"leading",
"to",
"IL-2",
"production",
"and",
"T-cell",
"activation",
"."
] | [
"the",
"interleukin",
"2",
"(",
"il-2",
")",
"gene",
"promoter",
"is",
"recognized",
"by",
"several",
"cell-type-specific",
"and",
"ubiquitous",
"transcriptional",
"regulators",
"that",
"integrate",
"information",
"transmitted",
"by",
"various",
"signaling",
"systems",
"leading",
"to",
"il-2",
"production",
"and",
"t-cell",
"activation",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"a",
"combination",
"of",
"transfection",
",",
"protein-DNA",
"binding",
",",
"and",
"in",
"vitro",
"transcription",
"methods",
",",
"we",
"have",
"discovered",
"the",
"novel",
"T-cell-specific",
"transcriptional",
"activator",
"TCF-1",
"(",
"for",
"T-Cell",
"Factor-1",
")",
",",
"which",
"recognizes",
"a",
"T-cell-specific",
"response",
"element",
"(",
"TCE",
")",
"located",
"within",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"."
] | [
"using",
"a",
"combination",
"of",
"transfection",
",",
"protein-dna",
"binding",
",",
"and",
"in",
"vitro",
"transcription",
"methods",
",",
"we",
"have",
"discovered",
"the",
"novel",
"t-cell-specific",
"transcriptional",
"activator",
"tcf-1",
"(",
"for",
"t-cell",
"factor-1",
")",
",",
"which",
"recognizes",
"a",
"t-cell-specific",
"response",
"element",
"(",
"tce",
")",
"located",
"within",
"the",
"il-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"the",
"TCE",
"is",
"similar",
"in",
"sequence",
"to",
"a",
"consensus",
"NF",
"kappa",
"B",
"site",
",",
"several",
"criteria",
"indicate",
"that",
"TCF-1",
"is",
"distinct",
"from",
"NF",
"kappa",
"B",
"."
] | [
"although",
"the",
"tce",
"is",
"similar",
"in",
"sequence",
"to",
"a",
"consensus",
"nf",
"kappa",
"b",
"site",
",",
"several",
"criteria",
"indicate",
"that",
"tcf-1",
"is",
"distinct",
"from",
"nf",
"kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"However",
",",
"like",
"NF",
"kappa",
"B",
",",
"TCF-1",
"activity",
"is",
"induced",
"by",
"phorbol",
"esters",
"and",
"other",
"T-cell",
"activators",
"."
] | [
"however",
",",
"like",
"nf",
"kappa",
"b",
",",
"tcf-1",
"activity",
"is",
"induced",
"by",
"phorbol",
"esters",
"and",
"other",
"t-cell",
"activators",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Binding",
"characteristics",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"in",
"multiple",
"sclerosis",
"."
] | [
"binding",
"characteristics",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"in",
"multiple",
"sclerosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Although",
"the",
"exact",
"etiology",
"of",
"multiple",
"sclerosis",
"(",
"MS",
")",
"remains",
"unresolved",
",",
"immune",
"reactions",
"are",
"believed",
"to",
"be",
"the",
"central",
"pathogenic",
"mechanisms",
"."
] | [
"although",
"the",
"exact",
"etiology",
"of",
"multiple",
"sclerosis",
"(",
"ms",
")",
"remains",
"unresolved",
",",
"immune",
"reactions",
"are",
"believed",
"to",
"be",
"the",
"central",
"pathogenic",
"mechanisms",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Endogenous",
"and",
"therapeutic",
"steroid",
"hormones",
"affect",
"the",
"immune",
"system",
",",
"and",
"inflammatory",
"diseases",
"are",
"associated",
"with",
"activation",
"of",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"axis",
",",
"providing",
"evidence",
"of",
"an",
"immune-endocrine",
"interplay",
"."
] | [
"endogenous",
"and",
"therapeutic",
"steroid",
"hormones",
"affect",
"the",
"immune",
"system",
",",
"and",
"inflammatory",
"diseases",
"are",
"associated",
"with",
"activation",
"of",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"axis",
",",
"providing",
"evidence",
"of",
"an",
"immune-endocrine",
"interplay",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Function",
"tests",
"in",
"MS",
"have",
"revealed",
"dysregulation",
"of",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"system",
"in",
"a",
"substantial",
"proportion",
"of",
"patients",
"."
] | [
"function",
"tests",
"in",
"ms",
"have",
"revealed",
"dysregulation",
"of",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"system",
"in",
"a",
"substantial",
"proportion",
"of",
"patients",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O"
] |
[
"We",
"characterized",
"glucocorticoid",
"receptor",
"(",
"GR",
")",
"binding",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"from",
"39",
"MS",
"patients",
"and",
"14",
"age-",
"and",
"sex-matched",
"controls",
"with",
"respect",
"to",
"dissociation",
"constant",
"and",
"binding",
"capacity",
",",
"using",
"a",
"whole-cell",
"binding",
"assay",
"with",
"[",
"3H",
"]",
"dexamethasone",
"as",
"the",
"ligand",
"."
] | [
"we",
"characterized",
"glucocorticoid",
"receptor",
"(",
"gr",
")",
"binding",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"from",
"39",
"ms",
"patients",
"and",
"14",
"age-",
"and",
"sex-matched",
"controls",
"with",
"respect",
"to",
"dissociation",
"constant",
"and",
"binding",
"capacity",
",",
"using",
"a",
"whole-cell",
"binding",
"assay",
"with",
"[",
"3h",
"]",
"dexamethasone",
"as",
"the",
"ligand",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"GR",
"binding",
"parameters",
"did",
"not",
"differ",
"significantly",
"between",
"patients",
"(",
"Kd",
"8",
".",
"98",
"+/-",
"1",
".",
"07",
"nM",
",",
"Bmax",
"183",
"+/-",
"29",
".",
"8",
"fmol/mg",
")",
"and",
"controls",
"(",
"Kd",
"9",
".",
"36",
"+/-",
"1",
".",
"17",
"nM",
",",
"Bmax",
"158",
"+/-",
"16",
"fmol/mg",
")",
"."
] | [
"gr",
"binding",
"parameters",
"did",
"not",
"differ",
"significantly",
"between",
"patients",
"(",
"kd",
"8",
".",
"98",
"+/-",
"1",
".",
"07",
"nm",
",",
"bmax",
"183",
"+/-",
"29",
".",
"8",
"fmol/mg",
")",
"and",
"controls",
"(",
"kd",
"9",
".",
"36",
"+/-",
"1",
".",
"17",
"nm",
",",
"bmax",
"158",
"+/-",
"16",
"fmol/mg",
")",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"effect",
"of",
"age",
",",
"sex",
",",
"course",
",",
"duration",
"or",
"severity",
"of",
"disease",
",",
"or",
"prior",
"steroid",
"treatments",
"was",
"detected",
"."
] | [
"no",
"effect",
"of",
"age",
",",
"sex",
",",
"course",
",",
"duration",
"or",
"severity",
"of",
"disease",
",",
"or",
"prior",
"steroid",
"treatments",
"was",
"detected",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"GR",
"binding",
"parameters",
"were",
"analyzed",
"in",
"relation",
"to",
"the",
"results",
"of",
"the",
"combined",
"dexamethasone",
"-CRH",
"test",
",",
"which",
"reflects",
"corticosteroid",
"receptor",
"function",
"at",
"the",
"hypothalamus",
",",
"in",
"30",
"patients",
"and",
"9",
"controls",
"."
] | [
"gr",
"binding",
"parameters",
"were",
"analyzed",
"in",
"relation",
"to",
"the",
"results",
"of",
"the",
"combined",
"dexamethasone",
"-crh",
"test",
",",
"which",
"reflects",
"corticosteroid",
"receptor",
"function",
"at",
"the",
"hypothalamus",
",",
"in",
"30",
"patients",
"and",
"9",
"controls",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"controls",
"showed",
"a",
"moderate",
"correlation",
"between",
"binding",
"affinity",
"of",
"the",
"GR",
"in",
"lymphocytes",
"and",
"regulatory",
"function",
"at",
"the",
"hypothalamic",
"level",
",",
"the",
"patients",
"did",
"not",
"."
] | [
"while",
"controls",
"showed",
"a",
"moderate",
"correlation",
"between",
"binding",
"affinity",
"of",
"the",
"gr",
"in",
"lymphocytes",
"and",
"regulatory",
"function",
"at",
"the",
"hypothalamic",
"level",
",",
"the",
"patients",
"did",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"physiological",
"relationship",
"between",
"binding",
"and",
"function",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"is",
"disturbed",
"in",
"MS",
"."
] | [
"these",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"physiological",
"relationship",
"between",
"binding",
"and",
"function",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"is",
"disturbed",
"in",
"ms",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Does",
"thyroidectomy",
",",
"radioactive",
"iodine",
"therapy",
",",
"or",
"antithyroid",
"drug",
"treatment",
"alter",
"reactivity",
"of",
"patients'",
"T",
"cells",
"to",
"epitopes",
"of",
"thyrotropin",
"receptor",
"in",
"autoimmune",
"thyroid",
"diseases",
"?"
] | [
"does",
"thyroidectomy",
",",
"radioactive",
"iodine",
"therapy",
",",
"or",
"antithyroid",
"drug",
"treatment",
"alter",
"reactivity",
"of",
"patients'",
"t",
"cells",
"to",
"epitopes",
"of",
"thyrotropin",
"receptor",
"in",
"autoimmune",
"thyroid",
"diseases",
"?"
] | [
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"treatment",
"on",
"thyroid",
"antibody",
"production",
"and",
"T",
"cell",
"reactivity",
"to",
"thyroid",
"antigens",
"was",
"studied",
"in",
"15",
"patients",
"with",
"Graves'",
"disease",
"(",
"GD",
")",
"before",
"and",
"after",
"thyroidectomy",
",",
"19",
"patients",
"with",
"GD",
"before",
"and",
"after",
"radioactive",
"iodine",
"(",
"RAI",
")",
"therapy",
",",
"and",
"9",
"patients",
"maintained",
"euthyroid",
"on",
"antithyroid",
"drugs",
"(",
"ATD",
")",
"."
] | [
"the",
"effect",
"of",
"treatment",
"on",
"thyroid",
"antibody",
"production",
"and",
"t",
"cell",
"reactivity",
"to",
"thyroid",
"antigens",
"was",
"studied",
"in",
"15",
"patients",
"with",
"graves'",
"disease",
"(",
"gd",
")",
"before",
"and",
"after",
"thyroidectomy",
",",
"19",
"patients",
"with",
"gd",
"before",
"and",
"after",
"radioactive",
"iodine",
"(",
"rai",
")",
"therapy",
",",
"and",
"9",
"patients",
"maintained",
"euthyroid",
"on",
"antithyroid",
"drugs",
"(",
"atd",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"Twenty",
"subjects",
"matched",
"for",
"age",
"and",
"sex",
"without",
"known",
"thyroid",
"disease",
"served",
"as",
"controls",
"."
] | [
"twenty",
"subjects",
"matched",
"for",
"age",
"and",
"sex",
"without",
"known",
"thyroid",
"disease",
"served",
"as",
"controls",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"GD",
"patients",
",",
"the",
"responses",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"(",
"PBMC",
")",
"and",
"TSH",
"receptor",
"(",
"TSHR",
")",
"-specific",
"T",
"cell",
"lines",
"to",
"recombinant",
"human",
"TSHR",
"extracellular",
"domain",
",",
"thyroglobulin",
",",
"and",
"TSHR",
"peptides",
"were",
"examined",
"on",
"the",
"day",
"of",
"surgery",
"or",
"RAI",
"therapy",
"(",
"day",
"0",
")",
"and",
"also",
"6-8",
"weeks",
"and",
"3-6",
"months",
"thereafter",
"."
] | [
"in",
"gd",
"patients",
",",
"the",
"responses",
"of",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"(",
"pbmc",
")",
"and",
"tsh",
"receptor",
"(",
"tshr",
")",
"-specific",
"t",
"cell",
"lines",
"to",
"recombinant",
"human",
"tshr",
"extracellular",
"domain",
",",
"thyroglobulin",
",",
"and",
"tshr",
"peptides",
"were",
"examined",
"on",
"the",
"day",
"of",
"surgery",
"or",
"rai",
"therapy",
"(",
"day",
"0",
")",
"and",
"also",
"6-8",
"weeks",
"and",
"3-6",
"months",
"thereafter",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Reactivity",
"to",
"TSHR",
"peptides",
"before",
"surgery",
"was",
"heterogeneous",
"and",
"spanned",
"the",
"entire",
"extracellular",
"domain",
"."
] | [
"reactivity",
"to",
"tshr",
"peptides",
"before",
"surgery",
"was",
"heterogeneous",
"and",
"spanned",
"the",
"entire",
"extracellular",
"domain",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Six",
"to",
"8",
"weeks",
"after",
"subtotal",
"thyroidectomy",
",",
"the",
"number",
"of",
"patients",
"'",
"PBMC",
"responding",
"to",
"any",
"peptide",
"and",
"the",
"average",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"decreased",
"."
] | [
"six",
"to",
"8",
"weeks",
"after",
"subtotal",
"thyroidectomy",
",",
"the",
"number",
"of",
"patients",
"'",
"pbmc",
"responding",
"to",
"any",
"peptide",
"and",
"the",
"average",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"decreased",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"further",
"decrease",
"in",
"the",
"T",
"cell",
"reactivity",
"to",
"TSHR",
"peptides",
"was",
"observed",
"3-6",
"months",
"after",
"surgery",
"."
] | [
"a",
"further",
"decrease",
"in",
"the",
"t",
"cell",
"reactivity",
"to",
"tshr",
"peptides",
"was",
"observed",
"3-6",
"months",
"after",
"surgery",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"responses",
"of",
"PBMC",
"from",
"Graves'",
"patients",
"before",
"RAI",
"therapy",
"were",
"less",
"than",
"those",
"in",
"the",
"presurgical",
"group",
"."
] | [
"the",
"responses",
"of",
"pbmc",
"from",
"graves'",
"patients",
"before",
"rai",
"therapy",
"were",
"less",
"than",
"those",
"in",
"the",
"presurgical",
"group",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Six",
"to",
"8",
"weeks",
"after",
"RAI",
"therapy",
",",
"the",
"number",
"of",
"patients",
"responding",
"to",
"any",
"peptide",
"and",
"the",
"average",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"increased",
"."
] | [
"six",
"to",
"8",
"weeks",
"after",
"rai",
"therapy",
",",
"the",
"number",
"of",
"patients",
"responding",
"to",
"any",
"peptide",
"and",
"the",
"average",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"increased",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"to",
"6",
"months",
"after",
"RAI",
",",
"T",
"cell",
"responses",
"to",
"TSHR",
"peptides",
"were",
"less",
"than",
"those",
"6-8",
"weeks",
"after",
"RAI",
"therapy",
",",
"but",
"still",
"higher",
"than",
"the",
"values",
"on",
"day",
"0",
"."
] | [
"three",
"to",
"6",
"months",
"after",
"rai",
",",
"t",
"cell",
"responses",
"to",
"tshr",
"peptides",
"were",
"less",
"than",
"those",
"6-8",
"weeks",
"after",
"rai",
"therapy",
",",
"but",
"still",
"higher",
"than",
"the",
"values",
"on",
"day",
"0",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Responses",
"of",
"PBMC",
"from",
"patients",
"with",
"GD",
",",
"maintained",
"euthyroid",
"on",
"ATD",
",",
"were",
"lower",
"than",
"those",
"before",
"surgery",
"or",
"RAI",
"therapy",
"."
] | [
"responses",
"of",
"pbmc",
"from",
"patients",
"with",
"gd",
",",
"maintained",
"euthyroid",
"on",
"atd",
",",
"were",
"lower",
"than",
"those",
"before",
"surgery",
"or",
"rai",
"therapy",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"reactivity",
"of",
"T",
"cell",
"lines",
"in",
"different",
"groups",
"reflected",
"a",
"pattern",
"similar",
"to",
"PBMC",
"after",
"treatment",
"."
] | [
"the",
"reactivity",
"of",
"t",
"cell",
"lines",
"in",
"different",
"groups",
"reflected",
"a",
"pattern",
"similar",
"to",
"pbmc",
"after",
"treatment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"TSHR",
"antibody",
"and",
"microsomal",
"antibody",
"levels",
"decreased",
"after",
"surgery",
",",
"but",
"increased",
"after",
"RAI",
"therapy",
"."
] | [
"tshr",
"antibody",
"and",
"microsomal",
"antibody",
"levels",
"decreased",
"after",
"surgery",
",",
"but",
"increased",
"after",
"rai",
"therapy",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"difference",
"in",
"the",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"by",
"patients",
"'",
"PBMC",
"before",
"RAI",
"and",
"surgery",
"may",
"reflect",
"the",
"effect",
"of",
"long",
"term",
"therapy",
"with",
"ATD",
"in",
"the",
"patients",
"before",
"RAI",
"vs",
".",
"the",
"shorter",
"period",
"in",
"patients",
"before",
"surgery",
"."
] | [
"the",
"difference",
"in",
"the",
"number",
"of",
"recognized",
"peptides",
"by",
"patients",
"'",
"pbmc",
"before",
"rai",
"and",
"surgery",
"may",
"reflect",
"the",
"effect",
"of",
"long",
"term",
"therapy",
"with",
"atd",
"in",
"the",
"patients",
"before",
"rai",
"vs",
".",
"the",
"shorter",
"period",
"in",
"patients",
"before",
"surgery",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"decreased",
"T",
"cell",
"reactivity",
"to",
"thyroid",
"antigens",
"after",
"thyroidectomy",
"could",
"be",
"the",
"result",
"of",
"removal",
"of",
"a",
"major",
"part",
"of",
"the",
"thyroid",
"gland",
"or",
"redistribution",
"of",
"suppressor-inducer",
"T",
"cells",
"."
] | [
"the",
"decreased",
"t",
"cell",
"reactivity",
"to",
"thyroid",
"antigens",
"after",
"thyroidectomy",
"could",
"be",
"the",
"result",
"of",
"removal",
"of",
"a",
"major",
"part",
"of",
"the",
"thyroid",
"gland",
"or",
"redistribution",
"of",
"suppressor-inducer",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"increased",
"T",
"cell",
"response",
"after",
"RAI",
"therapy",
"is",
"probably",
"epitope",
"specific",
",",
"rather",
"than",
"a",
"response",
"to",
"the",
"whole",
"TSHR",
"molecule",
"."
] | [
"the",
"increased",
"t",
"cell",
"response",
"after",
"rai",
"therapy",
"is",
"probably",
"epitope",
"specific",
",",
"rather",
"than",
"a",
"response",
"to",
"the",
"whole",
"tshr",
"molecule",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Synchronous",
"recognition",
"of",
"peptides",
"158-176",
"and",
"248-263",
"is",
"important",
"for",
"the",
"development",
"of",
"GD",
",",
"and",
"the",
"loss",
"of",
"recognition",
"of",
"one",
"of",
"these",
"epitopes",
"may",
"be",
"an",
"early",
"sign",
"of",
"immune",
"remission",
"and",
"a",
"predictor",
"of",
"euthyroidism",
"."
] | [
"synchronous",
"recognition",
"of",
"peptides",
"158-176",
"and",
"248-263",
"is",
"important",
"for",
"the",
"development",
"of",
"gd",
",",
"and",
"the",
"loss",
"of",
"recognition",
"of",
"one",
"of",
"these",
"epitopes",
"may",
"be",
"an",
"early",
"sign",
"of",
"immune",
"remission",
"and",
"a",
"predictor",
"of",
"euthyroidism",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"B-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Relief",
"of",
"cyclin",
"A",
"gene",
"transcriptional",
"inhibition",
"during",
"activation",
"of",
"human",
"primary",
"T",
"lymphocytes",
"via",
"CD2",
"and",
"CD28",
"adhesion",
"molecules",
"."
] | [
"relief",
"of",
"cyclin",
"a",
"gene",
"transcriptional",
"inhibition",
"during",
"activation",
"of",
"human",
"primary",
"t",
"lymphocytes",
"via",
"cd2",
"and",
"cd28",
"adhesion",
"molecules",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Cyclin",
"A",
"transcription",
"is",
"cell",
"cycle",
"regulated",
"and",
"induced",
"by",
"cell",
"proliferative",
"signals",
"."
] | [
"cyclin",
"a",
"transcription",
"is",
"cell",
"cycle",
"regulated",
"and",
"induced",
"by",
"cell",
"proliferative",
"signals",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"To",
"understand",
"the",
"mechanisms",
"underlined",
"in",
"this",
"regulation",
"in",
"normal",
"human",
"cells",
",",
"we",
"have",
"analysed",
"in",
"vivo",
"protein-DNA",
"interactions",
"at",
"the",
"Cyclin",
"A",
"locus",
"in",
"primary",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"to",
"understand",
"the",
"mechanisms",
"underlined",
"in",
"this",
"regulation",
"in",
"normal",
"human",
"cells",
",",
"we",
"have",
"analysed",
"in",
"vivo",
"protein-dna",
"interactions",
"at",
"the",
"cyclin",
"a",
"locus",
"in",
"primary",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"of",
"purified",
"T",
"lymphocytes",
"by",
"a",
"combination",
"of",
"monoclonal",
"antibodies",
"directed",
"at",
"CD2",
"and",
"CD28",
"adhesion",
"molecules",
"gives",
"rise",
"to",
"a",
"long",
"lasting",
"proliferation",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"accessory",
"cells",
"."
] | [
"stimulation",
"of",
"purified",
"t",
"lymphocytes",
"by",
"a",
"combination",
"of",
"monoclonal",
"antibodies",
"directed",
"at",
"cd2",
"and",
"cd28",
"adhesion",
"molecules",
"gives",
"rise",
"to",
"a",
"long",
"lasting",
"proliferation",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"accessory",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Cyclin",
"A",
"was",
"observed",
"after",
"4",
"days",
"of",
"costimulation",
"with",
"anti",
"CD2",
"+",
"CD28",
"whereas",
"stimulation",
"by",
"anti",
"CD2",
"or",
"anti",
"CD28",
"alone",
"was",
"not",
"effective",
"."
] | [
"cyclin",
"a",
"was",
"observed",
"after",
"4",
"days",
"of",
"costimulation",
"with",
"anti",
"cd2",
"+",
"cd28",
"whereas",
"stimulation",
"by",
"anti",
"cd2",
"or",
"anti",
"cd28",
"alone",
"was",
"not",
"effective",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vivo",
"genomic",
"DMS",
"footprinting",
"revealed",
"upstream",
"of",
"the",
"major",
"transcription",
"initiation",
"sites",
",",
"the",
"presence",
"of",
"at",
"least",
"three",
"protein",
"binding",
"sites",
",",
"two",
"of",
"which",
"were",
"constitutively",
"occupied",
"."
] | [
"in",
"vivo",
"genomic",
"dms",
"footprinting",
"revealed",
"upstream",
"of",
"the",
"major",
"transcription",
"initiation",
"sites",
",",
"the",
"presence",
"of",
"at",
"least",
"three",
"protein",
"binding",
"sites",
",",
"two",
"of",
"which",
"were",
"constitutively",
"occupied",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"They",
"bind",
"in",
"vitro",
"respectively",
"ATF-1",
"and",
"NF-Y",
"proteins",
"."
] | [
"they",
"bind",
"in",
"vitro",
"respectively",
"atf-1",
"and",
"nf-y",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"third",
"site",
"was",
"occupied",
"in",
"quiescent",
"cells",
"or",
"in",
"cells",
"stimulated",
"by",
"anti",
"CD2",
"or",
"anti",
"CD28",
"alone",
"."
] | [
"the",
"third",
"site",
"was",
"occupied",
"in",
"quiescent",
"cells",
"or",
"in",
"cells",
"stimulated",
"by",
"anti",
"cd2",
"or",
"anti",
"cd28",
"alone",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mitogenic",
"combination",
"of",
"anti",
"CD2",
"+",
"anti",
"CD28",
"released",
"the",
"footprint",
"as",
"cells",
"were",
"committed",
"to",
"proliferation",
"."
] | [
"the",
"mitogenic",
"combination",
"of",
"anti",
"cd2",
"+",
"anti",
"cd28",
"released",
"the",
"footprint",
"as",
"cells",
"were",
"committed",
"to",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Consistent",
"with",
"theses",
"results",
",",
"nuclear",
"extracts",
"prepared",
"from",
"quiescent",
"cells",
"formed",
"a",
"specific",
"complex",
"with",
"this",
"element",
",",
"whereas",
"extracts",
"prepared",
"from",
"cells",
"treated",
"with",
"anti",
"CD2",
"+",
"anti",
"CD28",
"failed",
"to",
"do",
"so",
"after",
"cells",
"entered",
"a",
"proliferative",
"state",
"."
] | [
"consistent",
"with",
"theses",
"results",
",",
"nuclear",
"extracts",
"prepared",
"from",
"quiescent",
"cells",
"formed",
"a",
"specific",
"complex",
"with",
"this",
"element",
",",
"whereas",
"extracts",
"prepared",
"from",
"cells",
"treated",
"with",
"anti",
"cd2",
"+",
"anti",
"cd28",
"failed",
"to",
"do",
"so",
"after",
"cells",
"entered",
"a",
"proliferative",
"state",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"AP-1",
"site",
"at",
"-150",
"bp",
",",
"but",
"not",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"site",
",",
"is",
"likely",
"to",
"represent",
"the",
"major",
"target",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"in",
"the",
"interleukin",
"2",
"promoter",
"."
] | [
"the",
"ap-1",
"site",
"at",
"-150",
"bp",
",",
"but",
"not",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"site",
",",
"is",
"likely",
"to",
"represent",
"the",
"major",
"target",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
"in",
"the",
"interleukin",
"2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"of",
"T",
"cells",
"with",
"antigen",
"results",
"in",
"activation",
"of",
"several",
"kinases",
",",
"including",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
",",
"that",
"may",
"mediate",
"the",
"later",
"induction",
"of",
"activation-related",
"genes",
"."
] | [
"stimulation",
"of",
"t",
"cells",
"with",
"antigen",
"results",
"in",
"activation",
"of",
"several",
"kinases",
",",
"including",
"protein",
"kinase",
"c",
"(",
"pkc",
")",
",",
"that",
"may",
"mediate",
"the",
"later",
"induction",
"of",
"activation-related",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"examined",
"the",
"potential",
"role",
"of",
"PKC",
"in",
"induction",
"of",
"the",
"interleukin",
"2",
"(",
"IL-2",
")",
"gene",
"in",
"T",
"cells",
"stimulated",
"through",
"the",
"T",
"cell",
"receptor/CD3",
"complex",
"."
] | [
"we",
"have",
"examined",
"the",
"potential",
"role",
"of",
"pkc",
"in",
"induction",
"of",
"the",
"interleukin",
"2",
"(",
"il-2",
")",
"gene",
"in",
"t",
"cells",
"stimulated",
"through",
"the",
"t",
"cell",
"receptor/cd3",
"complex",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"prolonged",
"treatment",
"of",
"the",
"untransformed",
"T",
"cell",
"clone",
"Ar-5",
"with",
"phorbol",
"esters",
"results",
"in",
"downmodulation",
"of",
"the",
"alpha",
"and",
"beta",
"isozymes",
"of",
"PKC",
",",
"and",
"abrogates",
"induction",
"of",
"IL-2",
"mRNA",
"and",
"protein",
"."
] | [
"we",
"have",
"previously",
"shown",
"that",
"prolonged",
"treatment",
"of",
"the",
"untransformed",
"t",
"cell",
"clone",
"ar-5",
"with",
"phorbol",
"esters",
"results",
"in",
"downmodulation",
"of",
"the",
"alpha",
"and",
"beta",
"isozymes",
"of",
"pkc",
",",
"and",
"abrogates",
"induction",
"of",
"il-2",
"mrna",
"and",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"show",
"that",
"phorbol",
"ester",
"treatment",
"also",
"abolishes",
"induction",
"of",
"chloramphenicol",
"acetyltransferase",
"activity",
"in",
"Ar-5",
"cells",
"transfected",
"with",
"a",
"plasmid",
"containing",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"linked",
"to",
"this",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"here",
"we",
"show",
"that",
"phorbol",
"ester",
"treatment",
"also",
"abolishes",
"induction",
"of",
"chloramphenicol",
"acetyltransferase",
"activity",
"in",
"ar-5",
"cells",
"transfected",
"with",
"a",
"plasmid",
"containing",
"the",
"il-2",
"promoter",
"linked",
"to",
"this",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"The",
"IL-2",
"promoter",
"contains",
"binding",
"sites",
"for",
"nuclear",
"factors",
"including",
"NFAT-1",
",",
"Oct",
",",
"NF-kappa",
"B",
",",
"and",
"AP-1",
",",
"which",
"are",
"all",
"potentially",
"sensitive",
"to",
"activation",
"of",
"PKC",
"."
] | [
"the",
"il-2",
"promoter",
"contains",
"binding",
"sites",
"for",
"nuclear",
"factors",
"including",
"nfat-1",
",",
"oct",
",",
"nf-kappa",
"b",
",",
"and",
"ap-1",
",",
"which",
"are",
"all",
"potentially",
"sensitive",
"to",
"activation",
"of",
"pkc",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"induction",
"of",
"a",
"trimer",
"of",
"the",
"NFAT",
"and",
"Oct",
"sites",
"is",
"not",
"sensitive",
"to",
"phorbol",
"ester",
"treatment",
",",
"and",
"that",
"mutations",
"in",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"site",
"have",
"no",
"effect",
"on",
"inducibility",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"induction",
"of",
"a",
"trimer",
"of",
"the",
"nfat",
"and",
"oct",
"sites",
"is",
"not",
"sensitive",
"to",
"phorbol",
"ester",
"treatment",
",",
"and",
"that",
"mutations",
"in",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"site",
"have",
"no",
"effect",
"on",
"inducibility",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"mutations",
"in",
"the",
"AP-1",
"site",
"located",
"at",
"-150",
"bp",
"almost",
"completely",
"abrogate",
"induction",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
",",
"and",
"appearance",
"of",
"an",
"inducible",
"nuclear",
"factor",
"binding",
"to",
"this",
"site",
"is",
"sensitive",
"to",
"PKC",
"depletion",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"mutations",
"in",
"the",
"ap-1",
"site",
"located",
"at",
"-150",
"bp",
"almost",
"completely",
"abrogate",
"induction",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
",",
"and",
"appearance",
"of",
"an",
"inducible",
"nuclear",
"factor",
"binding",
"to",
"this",
"site",
"is",
"sensitive",
"to",
"pkc",
"depletion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"cotransfections",
"with",
"c-fos",
"and",
"c-jun",
"expression",
"plasmids",
"markedly",
"enhance",
"induction",
"of",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"in",
"minimally",
"stimulated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"moreover",
",",
"cotransfections",
"with",
"c-fos",
"and",
"c-jun",
"expression",
"plasmids",
"markedly",
"enhance",
"induction",
"of",
"the",
"il-2",
"promoter",
"in",
"minimally",
"stimulated",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"AP-1",
"site",
"at",
"-150",
"bp",
"represents",
"a",
"major",
",",
"if",
"not",
"the",
"only",
",",
"site",
"of",
"PKC",
"responsiveness",
"in",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"."
] | [
"our",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"ap-1",
"site",
"at",
"-150",
"bp",
"represents",
"a",
"major",
",",
"if",
"not",
"the",
"only",
",",
"site",
"of",
"pkc",
"responsiveness",
"in",
"the",
"il-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Human",
"alveolar",
"macrophages",
"are",
"markedly",
"deficient",
"in",
"REF-1",
"and",
"AP-1",
"DNA",
"binding",
"activity",
"."
] | [
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"are",
"markedly",
"deficient",
"in",
"ref-1",
"and",
"ap-1",
"dna",
"binding",
"activity",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"many",
"functions",
"of",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"are",
"altered",
"compared",
"with",
"their",
"precursor",
"cell",
",",
"the",
"blood",
"monocyte",
"(",
"monocyte",
")",
",",
"the",
"reason",
"(",
"s",
")",
"for",
"these",
"functional",
"changes",
"have",
"not",
"been",
"determined",
"."
] | [
"although",
"many",
"functions",
"of",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"are",
"altered",
"compared",
"with",
"their",
"precursor",
"cell",
",",
"the",
"blood",
"monocyte",
"(",
"monocyte",
")",
",",
"the",
"reason",
"(",
"s",
")",
"for",
"these",
"functional",
"changes",
"have",
"not",
"been",
"determined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"recently",
"reported",
"that",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"do",
"not",
"express",
"AP-1",
"DNA",
"binding",
"activity",
"(",
"Monick",
",",
"M",
".",
"M",
".",
",",
"Carter",
",",
"A",
".",
"B",
".",
",",
"Gudmundsson",
",",
"G",
".",
",",
"Geist",
",",
"L",
".",
"J",
".",
",",
"and",
"Hunninghake",
",",
"G",
".",
"W",
".",
"(",
"1998",
")",
"Am",
".",
"J",
".",
"Physiol",
".",
"275",
",",
"L389-L397",
")",
"."
] | [
"we",
"recently",
"reported",
"that",
"human",
"alveolar",
"macrophages",
"do",
"not",
"express",
"ap-1",
"dna",
"binding",
"activity",
"(",
"monick",
",",
"m",
".",
"m",
".",
",",
"carter",
",",
"a",
".",
"b",
".",
",",
"gudmundsson",
",",
"g",
".",
",",
"geist",
",",
"l",
".",
"j",
".",
",",
"and",
"hunninghake",
",",
"g",
".",
"w",
".",
"(",
"1998",
")",
"am",
".",
"j",
".",
"physiol",
".",
"275",
",",
"l389-l397",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"determine",
"why",
"alveolar",
"macrophages",
"do",
"not",
"express",
"AP-1",
"DNA",
"binding",
"activity",
",",
"we",
"first",
"showed",
"that",
"there",
"was",
"not",
"a",
"decrease",
"in",
"expression",
"of",
"the",
"FOS",
"and",
"JUN",
"proteins",
"that",
"make",
"up",
"the",
"AP-1",
"complex",
"."
] | [
"to",
"determine",
"why",
"alveolar",
"macrophages",
"do",
"not",
"express",
"ap-1",
"dna",
"binding",
"activity",
",",
"we",
"first",
"showed",
"that",
"there",
"was",
"not",
"a",
"decrease",
"in",
"expression",
"of",
"the",
"fos",
"and",
"jun",
"proteins",
"that",
"make",
"up",
"the",
"ap-1",
"complex",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"was",
",",
"however",
",",
"a",
"significant",
"difference",
"in",
"the",
"amounts",
"of",
"the",
"nuclear",
"protein",
",",
"REF-1",
"(",
"which",
"regulates",
"AP-1",
"DNA",
"binding",
"by",
"altering",
"the",
"redox",
"status",
"of",
"FOS",
"and",
"JUN",
"proteins",
")",
",",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"there",
"was",
",",
"however",
",",
"a",
"significant",
"difference",
"in",
"the",
"amounts",
"of",
"the",
"nuclear",
"protein",
",",
"ref-1",
"(",
"which",
"regulates",
"ap-1",
"dna",
"binding",
"by",
"altering",
"the",
"redox",
"status",
"of",
"fos",
"and",
"jun",
"proteins",
")",
",",
"in",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"in",
"vitro",
"differentiation",
"of",
"monocytes",
"to",
"a",
"macrophage-like",
"cell",
"resulted",
"in",
"decreased",
"amounts",
"of",
"REF-1",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"in",
"vitro",
"differentiation",
"of",
"monocytes",
"to",
"a",
"macrophage-like",
"cell",
"resulted",
"in",
"decreased",
"amounts",
"of",
"ref-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"addition",
"of",
"REF-1",
"from",
"activated",
"monocytes",
"to",
"alveolar",
"macrophage",
"nuclear",
"proteins",
"resulted",
"in",
"a",
"marked",
"increase",
"in",
"AP-1",
"DNA",
"binding",
"."
] | [
"finally",
",",
"addition",
"of",
"ref-1",
"from",
"activated",
"monocytes",
"to",
"alveolar",
"macrophage",
"nuclear",
"proteins",
"resulted",
"in",
"a",
"marked",
"increase",
"in",
"ap-1",
"dna",
"binding",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"studies",
"strongly",
"suggest",
"that",
"the",
"process",
"of",
"differentiation",
"of",
"monocytes",
"into",
"alveolar",
"macrophages",
"is",
"associated",
"with",
"a",
"loss",
"of",
"REF-1",
"and",
"AP-1",
"activity",
"."
] | [
"these",
"studies",
"strongly",
"suggest",
"that",
"the",
"process",
"of",
"differentiation",
"of",
"monocytes",
"into",
"alveolar",
"macrophages",
"is",
"associated",
"with",
"a",
"loss",
"of",
"ref-1",
"and",
"ap-1",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"observation",
"may",
"explain",
",",
"in",
"part",
",",
"some",
"of",
"the",
"functional",
"differences",
"observed",
"for",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"this",
"observation",
"may",
"explain",
",",
"in",
"part",
",",
"some",
"of",
"the",
"functional",
"differences",
"observed",
"for",
"alveolar",
"macrophages",
"compared",
"with",
"monocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |