Mặc dù quy chế tuyển sinh quy định việc chấm thi phải đảm bảo quy trình hai vòng độc lập nhưng trong kỳ thi năm 2005, tại thời điểm thanh tra đã phát hiện hiện tượng cán bộ chấm thi lần 1 và lần 2 ngồi lẫn trong cùng một phòng (ĐH Huế, ĐH Đà Nẵng); chấm lần 2 nhưng không có bút tích trên bài làm của thí sinh; nhiều người vừa chấm lần 1, vừa chấm lần 2 cho cùng một túi bài thi.