Thông thường, các ca dương tính với H5N1 có biểu hiện viêm phổi nặng, nhập viện trong tình trạng suy hô hấp nhưng nay, những bệnh nhân dương tính với virus H5N1 ít có những biểu hiện rõ ràng mà chỉ là viêm họng, viêm phế quản ... Việc này đã gây khó khăn trong việc chẩn đoán bệnh.