Tháng 10/1999, Mandelson trở thành Bộ trưởng của Bắc Ireland, và phụ trách hệ thống pháp luật tại đây cũng như những chính sách cải tổ ngành cảnh sát khu vực này. Ngày 23/7/2004, Mandelson được tiến cử vào vị trí Cao ủy Thương mại châu Âu của nước Anh.