Những nội dung chính được hai bên đưa ra đàm phán ở phiên đầu tiên dự kiến sẽ tập trung vào lĩnh vực công nghiệp, dịch vụ và nông nghiệp. Kim ngạch xuất nhập khẩu VN - Nhật Bản trong năm 2005 đạt 8,16 tỷ USD, trong đó VN xuất sang Nhật hơn 4,5 tỷ USD, xuất siêu hơn 900 triệu USD.