Theo các chi cục thuế, đến thời điểm thanh tra (tháng 10/2004), nhiều đơn vị còn nợ tiền sử dụng đất, như Công ty Đầu tư và xây dựng TNXP Cinco nợ hơn 60 tỷ, Công ty Xây dựng và kinh doanh nhà Phú Nhuận trên 26 tỷ, Công ty TNHH xây dựng - thương mại - kinh doanh nhà Trung Sơn hơn 10 tỷ, Công ty TNHH Him Lam trên 7 tỷ... Tổng số tiền sử dụng đất chưa nộp của các công ty hơn 140 tỷ đồng. Ngoài ra, cơ quan thuế xác định giá trị tiền sử dụng đất chưa có sự thống nhất về đơn giá và diện tích đất tính thuế.