Năm 1995, ông đã trở thành một trong số những trọng tài được tín nhiệm của Tây Ban Nha, và chỉ 4 năm sau, Mejuto đã được phong cấp trọng tài FIFA. Kể từ đó, ông thăng tiến không ngừng trong sự nghiệp cầm còi.