Tuy nhiên không phải lúc nào FreeFile cũng có thể đóng tại tất cả những gì mà ta muốn, nhất là những file cực kỳ quan trọng do Windows hoặc Internet Explorer đang chiếm giữ và việc đóng lại hay cố đấm xóa đi những file này sẽ đồng nghĩa với việc tàn sát luôn cả Windows hoặc Internet Explorer.