Qui trình KĐCL sẽ gồm ba bước: tự đánh giá của trường ĐH, đánh giá bên ngoài và thẩm định của cơ quan KĐCL giáo dục và cuối cùng quyết định công nhận trường ĐH đạt tiêu chuẩn KĐCL.