Bất cập lớn hơn là khi có hai giấy chứng nhận, chủ sở hữu cũng có thể thực hiện quyền của từng loại giấy như thế chấp nhà, thế chấp đất ở hai ngân hàng khác nhau... sẽ nảy sinh tranh chấp phức tạp.