Tuy nhiên, ngay sau thành công hồi đó, ông Calisto và VFF đã có mâu thuẫn, khi Liên đoàn bất ngờ từ chối không mời HLV này dẫn dắt đội U23 thông qua fax - cách thức mà ông Calisto cho là bất lịch sự.