Khi đó, quyền hạn và trách nhiệm của Chính phủ, của các bộ ngành T.Ư chỉ là vạch chiến lược, phương hướng, chủ trương phát triển; quy hoạch, kế hoạch dài hạn hằng năm; đảm bảo điều kiện tài chính để phát triển ngành ĐH... Đại diện chủ sở hữu ở các trường ĐH công lập là các hội đồng trường.