Mourinho cũng đã liên tục chỉ trích công tác trọng tài của UEFA, sau quyết định công nhận bàn thắng của Liverpool trong trận bán kết lượt về (Liverpool Chelsea), dù bóng chưa qua vạch vôi. Mới đây đãkêu gọi UEFA ngừng bắn, nhưng Mourinho vẫn cứng rắn tuyên bố, sẵn sàng công kích nếu ông thấy điều gì chướng tai gai mắt: Tôi không thể kìm giữ suy nghĩ của mình.