Chế phẩm EM Bokashi C, vật liệu cần dùng gồm: khô cám gạo và mùn cưa được pha trộn theo tỷ lệ 1:1, Quy trình chế tạo tương tự như đối với cách làm EM Bokashi B. Cách sử dụng các chế phẩm EM: bổ sung EM1 hoặc EM thứ cấp vào nước uống ; bổ sung EM Bokashi B vào thức ăn ; hòa loãng EM thứ cấp với nước sạch phun vào chuồng trại để khử mùi hôi, cho EM thứ cấp trực tiếp vào nước thải để xử lý mùi hôi ; xử lý phân động vật bằng EM Bokashi C để khử mùi hôi, ngăn chặn các vi khuẩn gây bệnh phát triển, làm phân nhanh chóng hoại và trở thành phân bón hữu cơ có chất lượng.