Nhưng bắt đầu từ năm 2006, thực hiện theo Luật Giáo dục và chỉ đạo của Bộ GD - ĐT thì không còn kỳ thi tốt nghiệp THCS mà chỉ xét tốt nghiệp căn cứ kết quả học tập ở cả 2 mặt học tập và hạnh kiểm của học sinh.