Tốc độ hệ thống được đo bằng phép trắc nghiệm toán học Linpack, nhưng các nhà tổ chức Top 500 thừa nhận đây vẫn chưa phải một phương pháp hoàn thiện. Blue Gene được bán với giá khoảng 2 triệu USD mỗi giá (rack) chứa 1.024 thiết bị xử lý, nhưng IMB cũng cho thuê truy cập tới Blue Gene và những siêu máy tính khác cho những ai không muốn mua toàn bộ hệ thống. Ngoài ra, Big Blue cũng ra mắt một hệ thống rất mạnh nhưng ít được biết đến khác là ASC Purple, tốc độ 100 teraflop.