Trung tâm có nhiệm vụ đào tạo, huấn luyện và cấp chứng chỉ cho thuyền viên VN để có đủ khả năng chuyên môn phù hợp với yêu cầu của công ước quốc tế về hàng hải; tuyển dụng những thành viên có năng lực phù hợp, tốt nghiệp từ các trường hàng hải để tái đào tạo nhằm đáp ứng tiêu chuẩn nhu cầu xuất khẩu thuyền viên; tìm kiếm, giới thiệu những vị trí thích hợp tại các công ty tàu biển trong và ngoài nước cho các thuyền viên đã tham gia huấn luyện và đạt chứng chỉ chuyên môn hàng hải..