Theo kế hoạch, hoạt động của Trung tâm lưu ký chứng khoán sẽ được thực hiện tại các nơi: Trụ sở chính đặt tại Ủy bán chứng khoán tại địa chỉ 164 Trần Quang Khải - Hà Nội; Phòng giao dịch nghiệp vụ đặt tại sàn tầng 1 Trung tâm giao dịch chứng khoán Hà Nội và Chi nhánh Trung tâm lưu ký tại TP.HCM đặt ở số 1 Nam Kỳ Khởi Nghĩa.