Trong quân đội, công tác phòng chống dịch cúm A (H5N1) đã được triển khai tích cực ngay từ cuối năm 2003 và Bộ trưởng Bộ Quốc phòng cũng đã ban hành Chỉ thị số 07/CT-QP ngày 30/01/2004 về phòng chống bệnh dịch này trong quân đội, tuy nhiên sự chuyển biến về nhận thức ở không ít đơn vị còn chậm, việc thực hiện còn bộc lộ nhiều hạn chế, hàng trăm gia cầm chăn nuôi đã chết do nhiễm bệnh, có 7 người bị mắc bệnh, trong đó 2 người đã tử vong.