Trong quá trình hoạt động, nếu HĐQT vi phạm nghiêm trọng quy chế này và pháp luật thì Bộ trưởng GD-ĐT quyết định không công nhận, đồng thời lập HĐQT lâm thời và cử chủ tịch HĐQT lâm thời trong số các cổ đông để tiếp tục quản lý, điều hành các hoạt động của trường.