{{위키데이터 속성 추적}}
[[파일:Pre-mRNA-1ysv-tubes.png|섬네일|오른쪽|220px|pre-mRNA의 헤어핀 루프. [[핵염기]](녹색)와 리보스-인산 골격(파란색)이 강조 표시되어 있다. 이것은 자체적으로 다시 접히는 RNA의 단일 가닥이다.]]
'''RNA 추출'''({{llang|en|RNA extraction}})은 생물학적 샘플로부터 [[RNA]]를 정제하는 것이다. 이 과정은 RNA를 빠르게 분해할 수 있는 [[세포]]와 [[조직 (생물학)|조직]]에 [[리보뉴클레이스]]가 존재하기 때문에 복잡하다.<ref>{{서적 인용|title=Circadian Rhythms|author=Peirson SN, Butler JN|year=2007|series=Methods in Molecular Biology|volume=362|pages=[https://archive.org/details/circadianrhythms00rosa/page/315 315–27]|chapter=RNA extraction from mammalian tissues|doi=10.1007/978-1-59745-257-1_22|isbn=978-1-58829-417-3|pmid=17417019|journal=Methods Mol. Biol.|chapter-url-access=registration|chapter-url=https://archive.org/details/circadianrhythms00rosa/page/315}}</ref> 샘플에서 RNA를 분리하기 위해 [[분자생물학]]에서 여러 가지 방법이 사용되며 가장 일반적인 방법은 [[산 구아니디늄 싸이오사이아네이트-페놀-클로로포름 추출]]이다.<ref>{{저널 인용|author=Chomczynski P, Sacchi N |title=The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on |journal=Nat Protoc |volume=1 |issue=2 |pages=581–5 |year=2006 |pmid=17406285 |doi=10.1038/nprot.2006.83|s2cid=28653075 }}</ref><ref>{{저널 인용|author=Bird IM |title=Extraction of RNA from cells and tissue |journal=Methods Mol. Med. |volume=108 |pages=139–48 |year=2005 |doi=10.1385/1-59259-850-1:139 |pmid=16028681|isbn=1-59259-850-1 }}</ref> 여과지 기반의 용해 및 용출 방법은 높은 처리량을 특징으로 한다.<ref>{{웹 인용 |url=http://fortiusbio.com/RNA_Extraction_Card_8.html |제목=FortiusBio High Throughput RNA Extraction Filter Paper Card |확인날짜=2022-12-14 |archive-date=2016-05-06 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160506211327/http://fortiusbio.com/RNA_Extraction_Card_8.html |url-status= }}</ref>

일반적으로 막자사발과 절굿공이(또는 조직 분쇄기로 알려진 특수 강철 장치)를 사용하는 액체 질소에서 RNA 추출은 리보뉴클레이스 활성을 방해하는 데에도 유용하다.

== 리보뉴클레이스 오염 ==
분자생물학 실험에서 RNA 추출은 RNA 샘플을 분해하는 광범위하게 존재하고 견고한 [[리보뉴클레이스]](RNase)의 존재로 인해 매우 복잡하다. 특정 리보뉴클레이스는 매우 견고할 수 있으며 [[디옥시리보뉴클레이스]](DNase)를 중화하는 것과 비교하였을 때 불활성화하는 것이 어렵다. 방출되는 리보뉴클레이스 외에도 환경에 존재하는 여러 리보뉴클레이스가 있다. 리보뉴클레이스는 다양한 [[생물체]]에서 많은 세포외 기능을 갖도록 진화해 왔다.<ref>{{저널 인용| doi = 10.1099/mic.0.023218-0| title = A type II secreted RNase of Legionella pneumophila facilitates optimal intracellular infection of Hartmannella vermiformis| year = 2009| last1 = Rossier | first1 = O.| last2 = Dao | first2 = J.| last3 = Cianciotto | first3 = N. P.| journal = Microbiology| volume = 155| issue = 3| pages = 882–890 | pmid=19246759 | pmc=2662391}}</ref><ref>{{저널 인용| doi = 10.1016/j.tibs.2010.02.002| title = T2 Family ribonucleases: Ancient enzymes with diverse roles| year = 2010| last1 = Luhtala | first1 = N. | last2 = Parker | first2 = R. | journal = Trends in Biochemical Sciences| volume = 35| issue = 5| pages = 253–259 | pmid=20189811 | pmc=2888479}}</ref><ref>{{저널 인용| doi = 10.1007/s11030-006-9028-2| title = The RNase a superfamily: Generation of diversity and innate host defense| year = 2006| last1 = Dyer | first1 = K. D. | last2 = Rosenberg | first2 = H. F. | journal = Molecular Diversity| volume = 10| issue = 4| pages = 585–597| url = https://zenodo.org/record/1232824 | pmid = 16969722| s2cid = 20922592}}</ref> 예를 들어 [[리보뉴클레이스 A]] 슈퍼패밀리의 구성원인 리보뉴클레이스 7은 사람의 피부에서 분비되며 강력한 항병원체 방어 작용을 한다.<ref>{{저널 인용| doi = 10.1074/jbc.M207587200| title = RNase 7, a Novel Innate Immune Defense Antimicrobial Protein of Healthy Human Skin| year = 2002| last1 = Harder | first1 = J.| journal = Journal of Biological Chemistry| volume = 277| issue = 48| pages = 46779–46784| pmid=12244054| doi-access = free}}</ref><ref>{{저널 인용| doi = 10.1371/journal.pone.0006424| title = RNase 7 Contributes to the Cutaneous Defense against Enterococcus faecium| year = 2009| last1 = Köten | first1 = B. | last2 = Simanski | first2 = M. | last3 = Gläser | first3 = R. | last4 = Podschun | first4 = R. | last5 = Schröder | first5 = J. M. | last6 = Harder | first6 = J. R. | journal = PLOS ONE| volume = 4| issue = 7| pages = e6424 | pmid=19641608 | pmc=2712763| bibcode = 2009PLoSO...4.6424K| doi-access = free}}</ref> 이러한 분비된 리보뉴클레이스의 경우, 리보뉴클레이스의 외적 기능에 효소 활성이 필요하지 않을 수도 있다. 예를 들어 면역 리보뉴클레이스는 세균의 세포막을 불안정하게 만드는 역할을 한다.<ref>{{저널 인용| doi = 10.1074/jbc.M607321200| title = The Flexible and Clustered Lysine Residues of Human Ribonuclease 7 Are Critical for Membrane Permeability and Antimicrobial Activity| year = 2006| last1 = Huang | first1 = Y. -C. | last2 = Lin | first2 = Y. -M. | last3 = Chang | first3 = T. -W. | last4 = Wu | first4 = S. -J. | last5 = Lee | first5 = Y. -S. | last6 = Chang | first6 = M. D. -T. | last7 = Chen | first7 = C.| last8 = Wu | first8 = S. -H. | last9 = Liao | first9 = Y. -D. | journal = Journal of Biological Chemistry| volume = 282| issue = 7| pages = 4626–4633 | pmid=17150966
| doi-access = free }}</ref><ref>{{저널 인용| doi = 10.1189/jlb.1107725| title = RNase a ribonucleases and host defense: An evolving story| year = 2008| last1 = Rosenberg | first1 = H. F.| journal = Journal of Leukocyte Biology| volume = 83| issue = 5| pages = 1079–87| pmid=18211964| pmc=2692241}}</ref>

이에 대응하기 위해 RNA 추출에 사용되는 장비는 일반적으로 철저하게 세척되고 일반 실험실 장비와 분리되어 보관되며 리보뉴클레이스를 파괴하는 다양한 화학 물질들로 처리된다. 같은 이유로 실험자들도 맨살이 실험 장비에 닿지 않도록 각별히 주의한다.

== 같이 보기 ==
* [[RNA]]
* [[스핀 컬럼 기반 핵산 정제]]
* [[DNA 추출]]
* [[에탄올 침전]]
* [[페놀-클로로포름 추출]]

== 각주 ==
{{각주}}

== 외부 링크 ==
* [https://www.nature.com/articles/s41598-020-58586-3 Two-phase wash to solve the ubiquitous contaminant-carryover problem in commercial nucleic-acid extraction kits]; by Erik Jue, Daan Witters & Rustem F. Ismagilov; Nature, Scientific reports, 2020.

{{분자생물학}}

[[분류:분자생물학]]
[[분류:생화학적 분리 과정]]
[[분류:유전학 기술]]