{{위키데이터 속성 추적}}
'''저분자 단백질'''(低分子蛋白質, {{llang|en|small protein}})은 [[단백질]]의 다양한 [[단백질 접힘]] 클래스(일반적으로 <100 [[아미노산]] 길이) 중의 하나이다.<ref>{{저널 인용|제목=The PDB is a covering set of small protein structures|저널=Journal of Molecular Biology|날짜=December 2003|권=334|호=4|쪽=793–802|doi=10.1016/j.jmb.2003.10.027|pmid=14636603}}</ref><ref>{{저널 인용|제목=Small proteins: untapped area of potential biological importance|저널=Frontiers in Genetics|날짜=December 2013|권=4|쪽=286|doi=10.3389/fgene.2013.00286|pmc=3864261|pmid=24379829}}</ref><ref>{{저널 인용|제목=Small proteins can no longer be ignored|저널=Annual Review of Biochemistry|날짜=2014-06-02|권=83|호=1|쪽=753–77|doi=10.1146/annurev-biochem-070611-102400|pmc=4166647|pmid=24606146}}</ref> 이들의 [[단백질의 3차 구조|3차 구조]]는 일반적으로 [[이황화물|이황화가교]]<ref>{{저널 인용|제목=Structural classification of small, disulfide-rich protein domains|저널=Journal of Molecular Biology|날짜=May 2006|권=359|호=1|쪽=215–37|doi=10.1016/j.jmb.2006.03.017|pmid=16618491}}</ref>, [[리간드 (생화학)|금속 리간드]]<ref name=":0">{{저널 인용|제목=Zinc fingers and other metal-binding domains. Elements for interactions between macromolecules|저널=The Journal of Biological Chemistry|성=Berg|이름=J. M.|url=https://www.jbc.org/article/S0021-9258(19)39172-0/pdf|날짜=April 1990|권=265|호=12|쪽=6513–6|doi=10.1016/S0021-9258(19)39172-0|pmid=2108957|보존url=https://web.archive.org/web/20220508064711/https://www.jbc.org/article/S0021-9258%2819%2939172-0/pdf|보존날짜=8 May 2022|url-status=live}}</ref>, [[헴]]과 같은 [[보조 인자]]에 의해 유지된다. 일부 저분자 단백질은 특정 [[효소]]와의 직접적인 상호작용을 통해 중요한 조절 기능을 수행하므로 [[미생물]]의 [[생명공학기술|생명공학]] 응용을 위한 흥미로운 도구이기도 하다.<ref>{{저널 인용|제목=Small but smart: On the diverse role of small proteins in the regulation of cyanobacterial metabolism|저널=Life|날짜=2020|권=10|호=12|쪽=322|doi=10.3390/life10120322|pmc=7760959|pmid=33271798}}</ref>

== 저분자 단백질의 식별 ==
저분자 단백질의 크기는 오랫동안 식별 및 특성화를 제한했다. 그러나 과학 기술이 발전함에 따라 이를 식별하는 방법이 많이 개발되었다.

더 큰 [[오픈 리딩 프레임]]의 경우 계산 식별은 중단되지 않는 긴 암호화 잠재력에만 기반한다. 저분자 단백질에 대한 계산 검색은 리보솜 결합 부위의 존재 및 아미노산 보존과 같은 여러 매개변수를 사용한다.<ref>{{저널 인용|제목=The automatic annotation of bacterial genomes|저널=Briefings in Bioinformatics|성=Richardson|이름=E. J.|성2=Watson|이름2=M.|url=https://doi.org/10.1093/bib/bbs007|날짜=2012-03-09|권=14|호=1|쪽=1–12|doi=10.1093/bib/bbs007|issn=1467-5463|pmc=3548604|pmid=22408191}}</ref> 사용 가능한 RNA 시퀀싱 또는 질량 분석 데이터 세트도 전산 예측에 통합된다.<ref>{{저널 인용|제목=Large-Scale Analyses of Human Microbiomes Reveal Thousands of Small, Novel Genes|저널=Cell|성=Sberro|이름=Hila|성2=Fremin|이름2=Brayon J.|날짜=2019-08-22|권=178|호=5|쪽=1245–1259.e14|언어=English|doi=10.1016/j.cell.2019.07.016|issn=0092-8674|pmc=6764417|pmid=31402174|성3=Zlitni|이름3=Soumaya|성4=Edfors|이름4=Fredrik|성5=Greenfield|이름5=Nicholas|성6=Snyder|이름6=Michael P.|성7=Pavlopoulos|이름7=Georgios A.|성8=Kyrpides|이름8=Nikos C.|성9=Bhatt|이름9=Ami S.}}</ref><ref>{{저널 인용|제목=Unraveling the hidden universe of small proteins in bacterial genomes|저널=Molecular Systems Biology|성=Miravet‐Verde|이름=Samuel|성2=Ferrar|이름2=Tony|연도=2019|권=15|호=2|쪽=e8290|언어=en|doi=10.15252/msb.20188290|issn=1744-4292|pmc=6385055|pmid=30796087|성3=Espadas‐García|이름3=Guadalupe|성4=Mazzolini|이름4=Rocco|성5=Gharrab|이름5=Anas|성6=Sabido|이름6=Eduard|성7=Serrano|이름7=Luis|성8=Lluch‐Senar|이름8=Maria}}</ref>

저분자 단백질의 식별에 광범위하게 사용되는 방법은 리보솜 프로파일링(Ribo-seq 또는 리보솜 footprint)이다. 리보솜 프로파일링은 차세대 시퀀싱을 사용하며 리보솜에 의해 보호되는 [[전령 RNA]] 서열만 대상으로 한다. 전령 RNA에 대한 리보솜의 결합은 전사체가 활발히 번역되고 있음을 시사하여 매우 작은 ORF도 식별할 수 있다.<ref>{{저널 인용|제목=The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments|저널=Nature Protocols|성=Ingolia|이름=Nicholas T.|성2=Brar|이름2=Gloria A.|연도=2012|권=7|호=8|쪽=1534–1550|언어=en|doi=10.1038/nprot.2012.086|issn=1750-2799|pmc=3535016|pmid=22836135|성3=Rouskin|이름3=Silvia|성4=McGeachy|이름4=Anna M.|성5=Weissman|이름5=Jonathan S.}}</ref>

[[질량 분석법]]은 지금까지 저분자 단백질을 식별하는 가장 좋은 방법이지만 그 크기가 다시 장벽이 될 수 있다. 그러나 감지 및 데이터 품질을 개선하기 위해 몇 가지 조정을 수행할 수 있다.<ref>{{저널 인용|제목=A Practical Guide to Small Protein Discovery and Characterization Using Mass Spectrometry|저널=Journal of Bacteriology|성=Ahrens|이름=Christian H.|성2=Wade|이름2=Joseph T.|날짜=2022-01-18|편집자-성=Henkin|편집자-이름=Tina M.|권=204|호=1|쪽=e00353–21|언어=en|doi=10.1128/jb.00353-21|issn=0021-9193|pmc=8765459|pmid=34748388|성3=Champion|이름3=Matthew M.|성4=Langer|이름4=Julian D.}}</ref>

== 같이 보기 ==
* [[시스테인 풍부 단백질]]
* [[천연 변성 단백질]]
* [[금속 결합 단백질]]
* [[마이크로펩타이드]]

== 각주 ==
{{각주}}

[[분류:단백질]]